Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists
Updated on 2024-09-02
This page shows only entries from the "Amphibians" Red List section. This table is also available in TSV format.
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| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||
| CR 絶滅危惧IA類 | Hynobius abei アベサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧IA類 | Hynobius amakusaensis アマクササンショウウオ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧IA類 | Hynobius mikawaensis ミカワサンショウウオ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧IA類 | Hynobius tosashimizuensis トサシミズサンショウウオ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧IA類 | Onychodactylus tsukubaensis ツクバハコネサンショウウオ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius abuensis アブサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius akiensis アキサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius hidamontanus ハクバサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius iwami イワミサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius katoi アカイシサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius naevius ブチサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius osumiensis オオスミサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius setoi サンインサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius shinichisatoi ソボサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius takedai ホクリクサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Hynobius tsurugiensis ツルギサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | — | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Salamandrella keyserlingii キタサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Babina holsti ホルストガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/3 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Babina subaspera オットンガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/3 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Glandirana susurra サドガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 17 | 1/6 (16.7%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Odorrana ishikawae オキナワイシカワガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Odorrana splendida アマミイシカワガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Odorrana utsunomiyaorum コガタハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Pelophylax porosus brevipodus ナゴヤダルマガエル | — | ✓ | ✓ | — | — | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/118 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧IB類 | Limnonectes namiyei ナミエガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/169 (0.0%) | 2/861 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius bakan ヤマグチサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius boulengeri オオダイガハラサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius dunni オオイタサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius fossigenus ヒガシヒダサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius guttatus マホロバサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | — | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius ikioi ベッコウサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius kuishiensis イヨシマサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | — | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius nebulosus カスミサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius okiensis オキサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius oyamai チクシブチサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius sematonotos チュウゴクブチサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius setouchi セトウチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius stejnegeri コガタブチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius tokyoensis トウキョウサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius utsunomiyaorum ヒバサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Hynobius vandenburghi ヤマトサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Onychodactylus kinneburi シコクハコネサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Andrias japonicus オオサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Echinotriton andersoni イボイモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/3 (0.0%) | 3/160 (1.9%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Nidirana okinavana ヤエヤマハラブチガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/34 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Odorrana amamiensis アマミハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧II類 | Odorrana narina ハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius hirosei イシヅチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius kimurae ヒダサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius lichenatus トウホクサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius nigrescens クロサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius tsuensis ツシマサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onychodactylus fuscus タダミハコネサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onychodactylus intermedius バンダイハコネサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cynops ensicauda シリケンイモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 3/160 (1.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cynops pyrrhogaster アカハライモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 3/160 (1.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bufo gargarizans miyakonis ミヤコヒキガエル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 1 | 3 | 9 | 2/33 (6.1%) | 6/824 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Odorrana supranarina オオハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/97 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pelophylax nigromaculatus トノサマガエル | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/118 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pelophylax porosus porosus トウキョウダルマガエル | — | ✓ | ✓ | — | — | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/118 (0.0%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana kobai アマミアカガエル | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tagoi okiensis オキタゴガエル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tagoi yakushimensis ヤクシマタゴガエル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tsushimensis ツシマアカガエル | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana uenoi チョウセンヤマアカガエル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana ulma リュウキュウアカガエル | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 3/87 (3.4%) | 10/703 (1.4%) | — |
| DD 情報不足 | Hynobius retardatus エゾサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/131 (0.0%) | — |