Genome sequence data availability
for the Japanese Red List
Updated on 2025-11-06
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| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Pteropus loochoensis オキナワオオコウモリ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 4/59 (6.8%) | 13/186 (7.0%) | — |
| EX 絶滅 | Rhinolophus pumilus miyakonis ミヤココキクガシラコウモリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 19 | 8/171 (4.7%) | 8/175 (4.6%) | — |
| EX 絶滅 | Pipistrellus sturdeei オガサワラアブラコウモリ | EX | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 58 | 6/74 (8.1%) | 32/894 (3.6%) | — |
| EX 絶滅 | Canis lupus hattai エゾオオカミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 34 | 35 | 58 | 2/28 (7.1%) | 12/66 (18.2%) | — |
| EX 絶滅 | Canis lupus hodophilax ニホンオオカミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 34 | 35 | 58 | 2/28 (7.1%) | 12/66 (18.2%) | — |
| EX 絶滅 | Lutra lutra nippon ニホンカワウソ（本州以南亜種） | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 73 | 1/4 (25.0%) | 23/73 (31.5%) | — |
| EX 絶滅 | Lutra lutra whiteleyi ニホンカワウソ（北海道亜種） | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 73 | 1/4 (25.0%) | 23/73 (31.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mogera uchidai センカクモグラ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/10 (0.0%) | 8/107 (7.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pteropus dasymallus daitoensis ダイトウオオコウモリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 4/59 (6.8%) | 13/186 (7.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pteropus dasymallus dasymallus エラブオオコウモリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 4/59 (6.8%) | 13/186 (7.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Myotis formosus クロアカコウモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Myotis yanbarensis ヤンバルホオヒゲコウモリ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Apodemus agrarius セスジネズミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 2.61 Gbp 70 | 242 35.2 Mbp | 1 | 6 | 154 | 3/36 (8.3%) | 38/1186 (3.2%) | 2024-04-12 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tokudaia muenninki オキナワトゲネズミ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (3) | Scaffold, Reference | 3.67 Gbp 100 | 53 138 Mbp | 3 | 6 | 154 | 3/3 (100.0%) | 38/1186 (3.2%) | 2023-09-08 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Prionailurus bengalensis euptilurus ツシマヤマネコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, — | 2.42 Gbp 100 | 319,281 20.4 kbp | 3 | 7 | 67 | 3/5 (60.0%) | 22/58 (37.9%) | 2020-09-15 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Prionailurus bengalensis iriomotensis イリオモテヤマネコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.38 Gbp 87 | 194,533 27.8 kbp | 1 | 7 | 67 | 3/5 (60.0%) | 22/58 (37.9%) | 2021-03-31 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Enhydra lutris ラッコ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (4) | Scaffold, Reference | 2.46 Gbp 110 | 29,591 245 kbp | 4 | 4 | 73 | 1/1 (100.0%) | 23/73 (31.5%) | 2017-09-11 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Zalophus japonicus ニホンアシカ | EX | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 13 | 1/3 (33.3%) | 5/16 (31.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dugong dugon ジュゴン | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (5) | Chromosome, Reference | 3.16 Gbp 32 | 294 57.6 Mbp | 5 | 5 | 6 | 1/1 (100.0%) | 2/2 (100.0%) | 2020-08-31 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crocidura orii オリイジネズミ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 18 | 2/289 (0.7%) | 11/523 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Mogera etigo エチゴモグラ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/10 (0.0%) | 8/107 (7.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteropus pselaphon オガサワラオオコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.93 Gbp 119 | 16,738 395 kbp | 1 | 5 | 17 | 4/59 (6.8%) | 13/186 (7.0%) | 2020-08-23 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhinolophus cornutus orii オリイコキクガシラコウモリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 19 | 8/171 (4.7%) | 8/175 (4.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhinolophus pumilus pumilus オキナワコキクガシラコウモリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 19 | 8/171 (4.7%) | 8/175 (4.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Murina ryukyuana リュウキュウテングコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 58 | 1/74 (1.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nyctalus furvus コヤマコウモリ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 58 | 2/7 (28.6%) | 32/894 (3.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Miniopterus fuscus リュウキュウユビナガコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 3/73 (4.1%) | 3/73 (4.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Diplothrix legata ケナガネズミ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 154 | 0/1 (0.0%) | 38/1186 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tokudaia osimensis アマミトゲネズミ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.44 Gbp 170 | 111,287 52.4 kbp | 1 | 6 | 154 | 3/3 (100.0%) | 38/1186 (3.2%) | 2022-11-01 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tokudaia tokunoshimensis トクノシマトゲネズミ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 2.48 Gbp 135 | 569 13.6 Mbp | 2 | 6 | 154 | 3/3 (100.0%) | 38/1186 (3.2%) | 2023-09-08 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pentalagus furnessi アマミノクロウサギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/1 (0.0%) | 11/140 (7.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Mustela sibirica シベリアイタチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.51 Gbp 31 | 695,250 37.9 kbp | 1 | 40 | 73 | 8/18 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | 2025-02-28 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sorex minutissimus hawkeri トウキョウトガリネズミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 18 | 6/76 (7.9%) | 11/523 (2.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Rhinolophus perditus ヤエヤマコキクガシラコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 19 | 8/171 (4.7%) | 8/175 (4.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Eptesicus japonensis クビワコウモリ | VU | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 58 | 1/29 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Myotis gracilis ウスリホオヒゲコウモリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Myotis nattereri bombinus ホンドノレンコウモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Myotis pruinosus クロホオヒゲコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nyctalus aviator ヤマコウモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 1.78 Gbp 380 | 337 61.2 Mbp | 1 | 3 | 58 | 2/7 (28.6%) | 32/894 (3.6%) | 2024-05-31 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pipistrellus endoi モリアブラコウモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 58 | 6/74 (8.1%) | 32/894 (3.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tadarida insignis オヒキコウモリ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 1/8 (12.5%) | 5/148 (3.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Crocidura shantungensis コジネズミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 18 | 2/289 (0.7%) | 11/523 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Crocidura watasei ワタセジネズミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 18 | 2/289 (0.7%) | 11/523 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sorex hosonoi アズミトガリネズミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 18 | 6/76 (7.9%) | 11/523 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sorex shinto shikokensis シコクトガリネズミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 18 | 6/76 (7.9%) | 11/523 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euroscaptor mizura ミズラモグラ | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/1 (0.0%) | 8/107 (7.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mogera tokudae サドモグラ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/10 (0.0%) | 8/107 (7.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Myodes rex montanus ミヤマムクゲネズミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 94 | 0/3 (0.0%) | 47/1128 (4.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Myodes rex rex リシリムクゲネズミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 94 | 0/3 (0.0%) | 47/1128 (4.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ochotona hyperborea yesoensis エゾナキウサギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 7 | 3/68 (4.4%) | 3/69 (4.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lepus brachyurus lyoni サドノウサギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 23 | 8/98 (8.2%) | 11/140 (7.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Martes melampus tsuensis ツシマテン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 73 | 4/9 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Martes zibellina brachyura エゾクロテン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 9 | 73 | 4/9 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mustela erminea nippon ホンドオコジョ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 4 | 40 | 73 | 8/18 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mustela erminea orientalis エゾオコジョ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 4 | 40 | 73 | 8/18 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mustela nivalis namiyei ニホンイイズナ（本州亜種） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 5 | 40 | 73 | 8/18 (44.4%) | 23/73 (31.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phoca vitulina ゼニガタアザラシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.36 Gbp 45 | 21,601 284 kbp | 1 | 1 | 18 | 1/4 (25.0%) | 12/20 (60.0%) | 2019-02-11 |
| NT 準絶滅危惧 | Eumetopias jubatus トド | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (3) | Scaffold, Reference | 2.42 Gbp 34.65 | 24,746 242 kbp | 3 | 3 | 13 | 1/1 (100.0%) | 5/16 (31.2%) | 2019-01-15 |
| DD 情報不足 | Hypsugo alaschanicus オオアブラコウモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 58 | 0/23 (0.0%) | 32/894 (3.6%) | — |
| DD 情報不足 | Murina tenebrosa クチバテングコウモリ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 58 | 1/74 (1.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| DD 情報不足 | Vespertilio murinus ヒメヒナコウモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 1.96 Gbp 44 | 456 48.7 Mbp | 2 | 2 | 58 | 1/2 (50.0%) | 32/894 (3.6%) | 2025-04-09 |
| DD 情報不足 | Tadarida latouchei スミイロオヒキコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 1/8 (12.5%) | 5/148 (3.4%) | — |
| DD 情報不足 | Tamias sibiricus lineatus エゾシマリス | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 43 | 1/18 (5.6%) | 21/315 (6.7%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Chimarrogale platycephala 九州地方のカワネズミ | LC | ✓ | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 18 | 0/6 (0.0%) | 11/523 (2.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Hipposideros turpis 波照間島のカグラコウモリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 12 | 4/125 (3.2%) | 6/143 (4.2%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Barbastella leucomelas 四国のチチブコウモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 58 | 0/7 (0.0%) | 32/894 (3.6%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Myotis ikonnikovi hosonoi 紀伊半島のシナノホオヒゲコウモリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 21 | 58 | 13/377 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Plecotus sacrimontis 近畿地方以西のウサギコウモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 58 | 1/29 (3.4%) | 32/894 (3.6%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Macaca fuscata fuscata 北奥羽・北上山系のホンドザル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (2) | Contig, Reference | 2.93 Gbp 42 | 90,905 94.9 kbp | 2 | 52 | 160 | 15/31 (48.4%) | 87/199 (43.7%) | 2018-04-04 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Sciurus lis 九州地方のニホンリス | LC | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 7 | 43 | 3/17 (17.6%) | 21/315 (6.7%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Ursus arctos yesoensis 石狩西部のエゾヒグマ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 11 | 17 | 4/13 (30.8%) | 7/20 (35.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Ursus thibetanus japonicus 西中国地域のツキノワグマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, — | 2.21 Gbp 87 | 127,776 39.8 kbp | 2 | 11 | 17 | 4/13 (30.8%) | 7/20 (35.0%) | 2020-08-23 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cervus nippon 馬毛島のニホンジカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | Yes (4) | Chromosome, Reference | 2.78 Gbp 37 | 51 89.6 Mbp | 4 | 11 | 63 | 5/7 (71.4%) | 23/172 (13.4%) | 2023-12-07 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Sus scrofa riukiuanus 徳之島のリュウキュウイノシシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 47 | 48 | 51 | 2/16 (12.5%) | 4/27 (14.8%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Capricornis crispus 九州地方のカモシカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 464 | 1/12 (8.3%) | 75/244 (30.7%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Tadorna cristata カンムリツクシガモ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.38 Gbp 60 | 2,040,001 345 bp | 1 | 5 | 211 | 4/7 (57.1%) | 116/213 (54.5%) | 2025-03-29 |
| EX 絶滅 | Columba jouyi リュウキュウカラスバト | EX | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 25 | 39 | 4/38 (10.5%) | 11/354 (3.1%) | — |
| EX 絶滅 | Columba versicolor オガサワラカラスバト | EX | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 25 | 39 | 4/38 (10.5%) | 11/354 (3.1%) | — |
| EX 絶滅 | Nycticorax caledonicus crassirostris ハシブトゴイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 12 | 1/2 (50.0%) | 9/68 (13.2%) | — |
| EX 絶滅 | Porzana cinerea brevipes マミジロクイナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/1 (0.0%) | 15/145 (10.3%) | — |
| EX 絶滅 | Buteo buteo oshiroi ダイトウノスリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 21 | 179 | 16/29 (55.2%) | 145/274 (52.9%) | — |
| EX 絶滅 | Todiramphus miyakoensis ミヤコショウビン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 28 | 4/30 (13.3%) | 27/114 (23.7%) | — |
| EX 絶滅 | Dryocopus javensis richardsi キタタキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 16 | 1/6 (16.7%) | 11/226 (4.9%) | — |
| EX 絶滅 | Falco peregrinus furuitii シマハヤブサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 12 | 60 | 70 | 27/39 (69.2%) | 37/66 (56.1%) | — |
| EX 絶滅 | Poecile varius orii ダイトウヤマガラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/5 (0.0%) | 9/83 (10.8%) | — |
| EX 絶滅 | Apalopteron familiare familiare メグロ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/1 (0.0%) | 7/129 (5.4%) | — |
| EX 絶滅 | Troglodytes troglodytes orii ダイトウミソサザイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/17 (0.0%) | 7/121 (5.8%) | — |
| EX 絶滅 | Cichlopasser terrestris オガサワラガビチョウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Luscinia komadori subrufus ウスアカヒゲ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 35 | 1/6 (16.7%) | 33/299 (11.0%) | — |
| EX 絶滅 | Chaunoproctus ferreorostris オガサワラマシコ | EX | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 95 | 0/1 (0.0%) | 53/291 (18.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Anser caerulescens caerulescens ハクガン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Branta hutchinsii leucopareia シジュウカラガン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 11 | 211 | 6/10 (60.0%) | 116/213 (54.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Columba janthina nitens アカガシラカラスバト | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.08 Gbp 60 | 32,051 110 kbp | 1 | 25 | 39 | 4/38 (10.5%) | 11/354 (3.1%) | 2020-08-22 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Puffinus bryani オガサワラヒメミズナギドリ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 2/32 (6.2%) | 6/113 (5.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oceanodroma castro クロコシジロウミツバメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 0 | 2/16 (12.5%) | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ciconia boyciana コウノトリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Chromosome, Reference | 1.24 Gbp 81 | 429 35.8 Mbp | 3 | 12 | 17 | 7/8 (87.5%) | 12/66 (18.2%) | 2019-05-08 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phalacrocorax urile チシマウガラス | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 6/21 (28.6%) | 6/43 (14.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ixobrychus eurhythmus オオヨシゴイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/9 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/10 (0.0%) | 9/68 (13.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nipponia nippon トキ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Scaffold, Reference | 1.22 Gbp 105 | 130,029 29.1 kbp | 3 | 3 | 12 | 1/1 (100.0%) | 8/30 (26.7%) | 2014-06-16 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gallirallus okinawae ヤンバルクイナ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | —/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 100 | 440 20.7 Mbp | 2 | 4 | 23 | 3/10 (30.0%) | 15/145 (10.3%) | 2019-05-11 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eurynorhynchus pygmeus ヘラシギ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 38 | 44,335 189 kbp | 1 | 20 | 56 | 14/24 (58.3%) | 44/89 (49.4%) | 2018-10-30 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tringa guttifer カラフトアオアシシギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 56 | 5/16 (31.2%) | 44/89 (49.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Fratercula cirrhata エトピリカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.11 Gbp 85 | 111,227 19.7 kbp | 1 | 4 | 12 | 2/3 (66.7%) | 7/23 (30.4%) | 2020-08-22 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Synthliboramphus antiquus ウミスズメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/4 (0.0%) | 7/23 (30.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Uria aalge inornata ウミガラス | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, — | 1.04 Gbp 74 | 104,657 19.4 kbp | 2 | 3 | 12 | 2/2 (100.0%) | 7/23 (30.4%) | 2020-08-22 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Spilornis cheela perplexus カンムリワシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 179 | 1/13 (7.7%) | 145/274 (52.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aegolius funereus magnus キンメフクロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 53 | 1/4 (25.0%) | 38/186 (20.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bubo bubo ワシミミズク | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.26 Gbp 104 | 133,317 37.1 kbp | 1 | 10 | 53 | 4/18 (22.2%) | 38/186 (20.4%) | 2020-02-04 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ketupa blakistoni blakistoni シマフクロウ | — | — | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 10 | 53 | 4/18 (22.2%) | 38/186 (20.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Picoides tridactylus inouyei ミユビゲラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 16 | 1/5 (20.0%) | 11/226 (4.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sapheopipo noguchii ノグチゲラ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.13 Gbp 74 | 179,014 18.5 kbp | 1 | 1 | 16 | 1/14 (7.1%) | 11/226 (4.9%) | 2019-02-16 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lanius tigrinus チゴモズ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 4/30 (13.3%) | 4/34 (11.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chloris sinica kittlitzi オガサワラカワラヒワ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 95 | 0/5 (0.0%) | 53/291 (18.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Emberiza aureola ornata シマアオジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 8 | 95 | 7/44 (15.9%) | 53/291 (18.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lagopus muta japonica ライチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, — | 1.00 Gbp 71 | 72,306 56.2 kbp | 3 | 4 | 94 | 2/6 (33.3%) | 31/206 (15.0%) | 2019-02-15 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Anser erythropus カリガネ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (3) | Chromosome, Reference | 1.34 Gbp 61 | 1,845 2.38 Mbp | 3 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | 2025-05-03 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phaethon rubricauda rothschildi アカオネッタイチョウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 2/3 (66.7%) | 2/3 (66.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chalcophaps indica yamashinai キンバト | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/3 (0.0%) | 11/354 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Columba janthina stejnegeri ヨナグニカラスバト | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 25 | 39 | 4/38 (10.5%) | 11/354 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Streptopelia decaocto decaocto シラコバト | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 2 | 4 | 39 | 2/15 (13.3%) | 11/354 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phoebastria immutabilis コアホウドリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/9 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.21 Gbp 55 | 24,439 107 kbp | 1 | 5 | 8 | 4/6 (66.7%) | 7/27 (25.9%) | 2024-01-11 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Puffinus lherminieri bannermani セグロミズナギドリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 2/32 (6.2%) | 6/113 (5.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sula sula rubripes アカアシカツオドリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 1 | 7 | 14 | 5/6 (83.3%) | 9/11 (81.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phalacrocorax pelagicus pelagicus ヒメウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 1 | 9 | 9 | 6/21 (28.6%) | 6/43 (14.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Botaurus stellaris stellaris サンカノゴイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 2 | 12 | 2/4 (50.0%) | 9/68 (13.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platalea minor クロツラヘラサギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.24 Gbp 19 | 1,460 8.68 Mbp | 1 | 3 | 12 | 2/6 (33.3%) | 8/30 (26.7%) | 2024-04-05 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Coturnicops exquisitus シマクイナ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/3 (0.0%) | 15/145 (10.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rallina eurizonoides sepiaria オオクイナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/3 (0.0%) | 15/145 (10.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Numenius minutus コシャクシギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 56 | 2/9 (22.2%) | 44/89 (49.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Accipiter gularis iwasakii リュウキュウツミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 2 | 24 | 179 | 22/43 (51.2%) | 145/274 (52.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aquila chrysaetos japonica イヌワシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (2) | Scaffold, — | 1.19 Gbp 100 | 348 16.9 Mbp | 8 | 15 | 179 | 8/12 (66.7%) | 145/274 (52.9%) | 2020-04-03 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Buteo buteo toyoshimai オガサワラノスリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 21 | 179 | 16/29 (55.2%) | 145/274 (52.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Circus spilonotus spilonotus チュウヒ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 10 | 179 | 9/17 (52.9%) | 145/274 (52.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nisaetus nipalensis orientalis クマタカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 5 | 179 | 4/11 (36.4%) | 145/274 (52.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eurystomus orientalis calonyx ブッポウソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 2/4 (50.0%) | 4/12 (33.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pitta nympha ヤイロチョウ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/15 (6.7%) | 1/47 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lanius cristatus superciliosus アカモズ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 4/30 (13.3%) | 4/34 (11.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Poecile varius namiyei ナミエヤマガラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/5 (0.0%) | 9/83 (10.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Poecile varius owstoni オーストンヤマガラ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/5 (0.0%) | 9/83 (10.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Apalopteron familiare hahasima ハハジマメグロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/1 (0.0%) | 7/129 (5.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Locustella pleskei ウチヤマセンニュウ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/4 (25.0%) | 2/62 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Locustella pryeri pryeri オオセッカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/22 (4.5%) | 2/62 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Troglodytes troglodytes mosukei モスケミソサザイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/17 (0.0%) | 7/121 (5.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Luscinia komadori namiyei ホントウアカヒゲ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 35 | 1/6 (16.7%) | 33/299 (11.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Turdus celaenops アカコッコ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 10 | 34 | 7/86 (8.1%) | 23/216 (10.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Coturnix japonica ウズラ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 928 Mbp 73 | 9,641 511 kbp | 2 | 4 | 94 | 2/15 (13.3%) | 31/206 (15.0%) | 2016-03-01 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anas formosa トモエガモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.24 Gbp 60 | 565,536 8.73 kbp | 1 | 1 | 211 | 1/1 (100.0%) | 116/213 (54.5%) | 2024-04-22 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anser fabalis serrirostris ヒシクイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Branta bernicla orientalis コクガン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 1 | 11 | 211 | 6/10 (60.0%) | 116/213 (54.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tadorna tadorna ツクシガモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 195 | 34,957 169 kbp | 2 | 5 | 211 | 4/7 (57.1%) | 116/213 (54.5%) | 2024-12-06 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phoebastria albatrus アホウドリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/9 | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 1.21 Gbp 44 | 36,840 68.7 kbp | 2 | 5 | 8 | 4/6 (66.7%) | 7/27 (25.9%) | 2020-08-22 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Oceanodroma monorhis ヒメクロウミツバメ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 0 | 2/16 (12.5%) | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gorsachius goisagi ミゾゴイ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.19 Gbp 103 | 100,190 43.0 kbp | 1 | 3 | 12 | 2/4 (50.0%) | 9/68 (13.2%) | 2021-03-31 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gorsachius melanolophus ズグロミゾゴイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/4 (50.0%) | 9/68 (13.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Grus japonensis タンチョウ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Scaffold, Reference | 1.22 Gbp 100 | 603 19.9 Mbp | 3 | 12 | 18 | 5/7 (71.4%) | 8/16 (50.0%) | 2019-05-08 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Grus monacha ナベヅル | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 67 | 95,217 38.5 kbp | 1 | 12 | 18 | 5/7 (71.4%) | 8/16 (50.0%) | 2020-04-08 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Grus vipio マナヅル | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 54 | 107,175 32.9 kbp | 1 | 1 | 18 | 1/4 (25.0%) | 8/16 (50.0%) | 2020-04-08 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Charadrius alexandrinus dealbatus シロチドリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 18 | 2/24 (8.3%) | 11/85 (12.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Himantopus himantopus himantopus セイタカシギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 2 | 2 | 3 | 1/3 (33.3%) | 2/8 (25.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Limosa lapponica baueri オオソリハシシギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.03 Gbp 71 | 139,617 21.3 kbp | 1 | 1 | 56 | 1/4 (25.0%) | 44/89 (49.4%) | 2017-12-15 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Numenius madagascariensis ホウロクシギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 56 | 2/9 (22.2%) | 44/89 (49.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Scolopax mira アマミヤマシギ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.09 Gbp 55 | 79,353 61.2 kbp | 1 | 5 | 56 | 4/4 (100.0%) | 44/89 (49.4%) | 2019-02-15 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tringa erythropus ツルシギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.09 Gbp 199 | 43,935 198 kbp | 1 | 5 | 56 | 5/16 (31.2%) | 44/89 (49.4%) | 2024-12-06 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tringa glareola タカブシギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 56 | 5/16 (31.2%) | 44/89 (49.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tringa totanus ussuriensis アカアシシギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 56 | 5/16 (31.2%) | 44/89 (49.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Rostratula benghalensis benghalensis タマシギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.10 Gbp 67 | 33,928 78.7 kbp | 1 | 1 | 2 | 1/1 (100.0%) | 2/2 (100.0%) | 2020-07-10 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Glareola maldivarum ツバメチドリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/5 (20.0%) | 3/11 (27.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Larus saundersi ズグロカモメ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 41 | 3/12 (25.0%) | 25/105 (23.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sterna albifrons sinensis コアジサシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 1 | 1 | 41 | 1/7 (14.3%) | 25/105 (23.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sterna bergii cristata オオアジサシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/8 (0.0%) | 25/105 (23.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sterna dougallii bangsi ベニアジサシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 41 | 1/10 (10.0%) | 25/105 (23.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sterna sumatrana エリグロアジサシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 41 | 1/10 (10.0%) | 25/105 (23.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cepphus carbo ケイマフリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 12 | 1/3 (33.3%) | 7/23 (30.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Synthliboramphus wumizusume カンムリウミスズメ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/4 (0.0%) | 7/23 (30.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Butastur indicus サシバ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 75 | 67,994 36.2 kbp | 1 | 3 | 179 | 3/4 (75.0%) | 145/274 (52.9%) | 2022-12-09 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Haliaeetus albicilla albicilla オジロワシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 5 | 10 | 179 | 6/10 (60.0%) | 145/274 (52.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Haliaeetus pelagicus オオワシ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.18 Gbp 49 | 33,489 86.6 kbp | 1 | 10 | 179 | 6/10 (60.0%) | 145/274 (52.9%) | 2020-08-22 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Otus elegans interpositus ダイトウコノハズク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 15 | 53 | 14/38 (36.8%) | 38/186 (20.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Otus lempiji pryeri リュウキュウオオコノハズク | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 15 | 53 | 14/38 (36.8%) | 38/186 (20.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dendrocopos leucotos owstoni オーストンオオアカゲラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 16 | 1/14 (7.1%) | 11/226 (4.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dryocopus martius martius クマゲラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 1 | 1 | 16 | 1/6 (16.7%) | 11/226 (4.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Falco peregrinus japonensis ハヤブサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 12 | 60 | 70 | 27/39 (69.2%) | 37/66 (56.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pericrocotus divaricatus divaricatus サンショウクイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/14 (0.0%) | 1/86 (1.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phylloscopus ijimae イイジマムシクイ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 12 | 7/86 (8.1%) | 8/88 (9.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luscinia akahige tanensis タネコマドリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 35 | 1/6 (16.7%) | 33/299 (11.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luscinia komadori komadori アカヒゲ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 35 | 1/6 (16.7%) | 33/299 (11.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zoothera dauma major オオトラツグミ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 34 | 0/20 (0.0%) | 23/216 (10.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Emberiza yessoensis yessoensis コジュリン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 95 | 7/44 (15.9%) | 53/291 (18.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Syrmaticus soemmerringii ijimae コシジロヤマドリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 94 | 2/5 (40.0%) | 31/206 (15.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Syrmaticus soemmerringii soemmerringii アカヤマドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 94 | 2/5 (40.0%) | 31/206 (15.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anser albifrons albifrons マガン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anser fabalis middendorffii オオヒシクイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Columba janthina janthina カラスバト | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 25 | 39 | 4/38 (10.5%) | 11/354 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oceanodroma matsudairae クロウミツバメ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 0 | 2/16 (12.5%) | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oceanodroma tristrami オーストンウミツバメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 0 | 2/16 (12.5%) | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Egretta eulophotes カラシラサギ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 12 | 1/12 (8.3%) | 9/68 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Egretta intermedia intermedia チュウサギ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 12 | 1/12 (8.3%) | 9/68 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ixobrychus sinensis sinensis ヨシゴイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/10 (0.0%) | 9/68 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Porzana fusca erythrothorax ヒクイナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 23 | 2/9 (22.2%) | 15/145 (10.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Caprimulgus indicus jotaka ヨタカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 6 | 1/30 (3.3%) | 4/74 (5.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Calidris alpina ハマシギ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.27 Gbp 48 | 98,812 98.5 kbp | 1 | 20 | 56 | 14/24 (58.3%) | 44/89 (49.4%) | 2023-11-14 |
| NT 準絶滅危惧 | Gallinago hardwickii オオジシギ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.14 Gbp 105 | 119,495 25.4 kbp | 1 | 11 | 56 | 11/13 (84.6%) | 44/89 (49.4%) | 2022-11-10 |
| NT 準絶滅危惧 | Larus schistisagus オオセグロカモメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 22 | 41 | 11/29 (37.9%) | 25/105 (23.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pandion haliaetus haliaetus ミサゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 2 | 1/2 (50.0%) | 1/2 (50.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Accipiter gentilis fujiyamae オオタカ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 5 | 6 | 179 | 2/3 (66.7%) | 145/274 (52.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Accipiter nisus nisosimilis ハイタカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 24 | 179 | 22/43 (51.2%) | 145/274 (52.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pernis ptilorhynchus orientalis ハチクマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 179 | 2/5 (40.0%) | 145/274 (52.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Poecile varius olivaceus オリイヤマガラ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 17 | 0/5 (0.0%) | 9/83 (10.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Locustella lanceolata マキノセンニュウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.19 Gbp 215 | 97,266 134 kbp | 1 | 1 | 2 | 1/22 (4.5%) | 2/62 (3.2%) | 2024-12-06 |
| NT 準絶滅危惧 | Emberiza sulphurata ノジコ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 8 | 95 | 7/44 (15.9%) | 53/291 (18.2%) | — |
| DD 情報不足 | Tetrastes bonasia vicinitas エゾライチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 94 | 0/2 (0.0%) | 31/206 (15.0%) | — |
| DD 情報不足 | Aix galericulata オシドリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 1.08 Gbp 230 | 34,019 77.4 kbp | 2 | 5 | 211 | 2/3 (66.7%) | 116/213 (54.5%) | 2022-08-16 |
| DD 情報不足 | Anser cygnoides サカツラガン | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (7) | Chromosome, Reference | 1.22 Gbp 70 | 116 39.7 Mbp | 7 | 25 | 211 | 10/16 (62.5%) | 116/213 (54.5%) | 2015-04-08 |
| DD 情報不足 | Aythya baeri アカハジロ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 1.14 Gbp 162.11 | 227 29.1 Mbp | 1 | 16 | 211 | 10/12 (83.3%) | 116/213 (54.5%) | 2022-11-27 |
| DD 情報不足 | Tadorna ferruginea アカツクシガモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 211 | 4/7 (57.1%) | 116/213 (54.5%) | — |
| DD 情報不足 | Pterodroma hypoleuca シロハラミズナギドリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/37 (0.0%) | 6/113 (5.3%) | — |
| DD 情報不足 | Platalea leucorodia leucorodia ヘラサギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 3 | 12 | 2/6 (33.3%) | 8/30 (26.7%) | — |
| DD 情報不足 | Threskiornis melanocephalus クロトキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 12 | 1/4 (25.0%) | 8/30 (26.7%) | — |
| DD 情報不足 | Grus grus lilfordi クロヅル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 12 | 18 | 5/7 (71.4%) | 8/16 (50.0%) | — |
| DD 情報不足 | Vanellus cinereus ケリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 18 | 1/11 (9.1%) | 11/85 (12.9%) | — |
| DD 情報不足 | Calidris ptilocnemis quarta チシマシギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 20 | 56 | 14/24 (58.3%) | 44/89 (49.4%) | — |
| DD 情報不足 | Limnodromus semipalmatus シベリアオオハシシギ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 56 | 1/4 (25.0%) | 44/89 (49.4%) | — |
| DD 情報不足 | Brachyramphus perdix マダラウミスズメ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/3 (0.0%) | 7/23 (30.4%) | — |
| DD 情報不足 | Cettia diphone restricta ダイトウウグイス | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/15 (6.7%) | 1/19 (5.3%) | — |
| DD 情報不足 | Phylloscopus examinandus オオムシクイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 11 | 12 | 7/86 (8.1%) | 8/88 (9.1%) | — |
| DD 情報不足 | Ficedula narcissina owstoni リュウキュウキビタキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 35 | 4/34 (11.8%) | 33/299 (11.0%) | — |
| DD 情報不足 | Zoothera dauma iriomotensis コトラツグミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 34 | 0/20 (0.0%) | 23/216 (10.6%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Histrionicus histrionicu 東北地方以北のシノリガモ繁殖個体群 | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 211 | 0/1 (0.0%) | 116/213 (54.5%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Podiceps cristatus cristatus 青森県のカンムリカイツブリ繁殖個体群 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 3 | 4 | 3/6 (50.0%) | 4/17 (23.5%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Goniurosaurus kuroiwae orientalis マダラトカゲモドキ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Goniurosaurus kuroiwae toyamai イヘヤトカゲモドキ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Goniurosaurus kuroiwae yamashinae クメトカゲモドキ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Takydromus toyamai ミヤコカナヘビ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 48 | 0/24 (0.0%) | 25/409 (6.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Opisthotropis kikuzatoi キクザトサワヘビ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 75 | 0/22 (0.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Caretta caretta アカウミガメ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | —/✓ | Yes (4) | Chromosome, Reference | 2.22 Gbp 55 | 97 124 Mbp | 4 | 4 | 16 | 1/1 (100.0%) | 6/14 (42.9%) | 2022-06-07 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eretmochelys imbricata タイマイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Chromosome, Reference | 2.30 Gbp 81 | 303 82.0 Mbp | 3 | 3 | 16 | 1/1 (100.0%) | 6/14 (42.9%) | 2023-05-15 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Goniurosaurus kuroiwae sengokui ケラマトカゲモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Goniurosaurus splendens オビトカゲモドキ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Plestiodon takarai センカクトカゲ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calamaria pfefferi ミヤコヒメヘビ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 75 | 1/18 (5.6%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaphe carinata carinata シュウダ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 75 | 1/20 (5.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaphe carinata yonaguniensis ヨナグニシュウダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 75 | 1/20 (5.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hebius concelarus ミヤコヒバァ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 75 | 0/42 (0.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chelonia mydas mydas アオウミガメ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 3 | 16 | 1/1 (100.0%) | 6/14 (42.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cuora flavomarginata evelynae ヤエヤマセマルハコガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 2/16 (12.5%) | 6/107 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geoemyda japonica リュウキュウヤマガメ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 6/107 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mauremys mutica kami ヤエヤマイシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 3 | 8 | 2/20 (10.0%) | 6/107 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Goniurosaurus kuroiwae kuroiwae クロイワトカゲモドキ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 2/48 (4.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gekko yakuensis ヤクヤモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 13 | 3/98 (3.1%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hemidactylus bowringii タシロヤモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 13 | 3/235 (1.3%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Perochirus ateles ミナミトリシマヤモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/2 (0.0%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diploderma polygonatum donan ヨナグニキノボリトカゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/46 (0.0%) | 17/588 (2.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diploderma polygonatum polygonatum オキナワキノボリトカゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/46 (0.0%) | 17/588 (2.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Emoia atrocostata atrocostata ミヤコトカゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/36 (0.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Plestiodon barbouri バーバートカゲ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Plestiodon kishinouyei キシノウエトカゲ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Plestiodon marginatus オキナワトカゲ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Takydromus dorsalis サキシマカナヘビ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 48 | 0/24 (0.0%) | 25/409 (6.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zootoca vivipara コモチカナヘビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (5) | Chromosome, Reference | 1.44 Gbp 34 | 731 3.45 Mbp | 5 | 5 | 48 | 1/2 (50.0%) | 25/409 (6.1%) | 2020-04-01 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Calamaria pavimentata miyarai ミヤラヒメヘビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 75 | 1/18 (5.6%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Elaphe taeniura schmackeri サキシマスジオ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 75 | 1/20 (5.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Achalinus formosanus chigirai ヤエヤマタカチホヘビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/36 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Emydocephalus ijimae イイジマウミヘビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.63 Gbp 82 | 171,534 18.5 kbp | 1 | 1 | 34 | 1/2 (50.0%) | 26/346 (7.5%) | 2019-01-09 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laticauda laticaudata ヒロオウミヘビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.56 Gbp 133 | 89,677 35.6 kbp | 1 | 3 | 34 | 2/7 (28.6%) | 26/346 (7.5%) | 2019-01-09 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laticauda semifasciata エラブウミヘビ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 34 | 2/7 (28.6%) | 26/346 (7.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sinomicrurus macclellandi iwasakii イワサキワモンベニヘビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 34 | 0/15 (0.0%) | 26/346 (7.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mauremys japonica ニホンイシガメ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 8 | 2/20 (10.0%) | 6/107 (5.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gekko shibatai タカラヤモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 13 | 3/98 (3.1%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gekko sp. 1 オキナワヤモリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 13 | 3/98 (3.1%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gekko tawaensis タワヤモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 13 | 3/98 (3.1%) | 11/1829 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diploderma polygonatum ishigakiense サキシマキノボリトカゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/46 (0.0%) | 17/588 (2.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cryptoblepharus nigropunctatus オガサワラトカゲ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 19 | 1/52 (1.9%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Plestiodon oshimensis オオシマトカゲ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Plestiodon stimpsonii イシガキトカゲ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Takydromus amurensis アムールカナヘビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 48 | 0/24 (0.0%) | 25/409 (6.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclophiops herminae サキシマアオヘビ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 75 | 0/0 | 59/1047 (5.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Dinodon rufozonatum rufozonatum アカマダラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 75 | 2/71 (2.8%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lycodon ruhstrati multifasciatus サキシマバイカダ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 75 | 2/71 (2.8%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pareas iwasakii イワサキセダカヘビ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/40 (2.5%) | 1/47 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Achalinus werneri アマミタカチホヘビ | NT | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/36 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sinomicrurus japonicus boettgeri ハイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 34 | 0/15 (0.0%) | 26/346 (7.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sinomicrurus japonicus japonicus ヒャン | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 34 | 0/15 (0.0%) | 26/346 (7.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Protobothrops tokarensis トカラハブ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 49 | 2/17 (11.8%) | 37/416 (8.9%) | — |
| DD 情報不足 | Pelodiscus sinensis ニホンスッポン | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (7) | Chromosome, Reference | 2.24 Gbp 40 | 322 108 Mbp | 7 | 7 | 14 | 1/20 (5.0%) | 6/52 (11.5%) | 2012-07-24 |
| DD 情報不足 | Plestiodon kuchinoshimensis クチノシマトカゲ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Hebius vibakari danjoensis ダンジョヒバカリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 75 | 0/42 (0.0%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Lepidodactylus lugubris 大東諸島のオガサワラヤモリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 3.52 Gbp 5408.29 | 311,579 20.6 kbp | 1 | 2 | 13 | 2/34 (5.9%) | 11/1829 (0.6%) | 2025-09-03 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Ateuchosaurus pellopleurus 三島のヘリグロヒメトカゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/2 (0.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Plestiodon latiscutatus 三宅島、八丈島、青ヶ島のオカダトカゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 19 | 1/50 (2.0%) | 16/1594 (1.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Takydromus smaragdinus 沖永良部島、徳之島のアオカナヘビ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 48 | 0/24 (0.0%) | 25/409 (6.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Dinodon rufozonatum walli 宮古諸島のサキシママダラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 75 | 2/71 (2.8%) | 59/1047 (5.6%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hynobius abei アベサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hynobius amakusaensis アマクササンショウウオ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hynobius mikawaensis ミカワサンショウウオ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hynobius tosashimizuensis トサシミズサンショウウオ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Onychodactylus tsukubaensis ツクバハコネサンショウウオ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius abuensis アブサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius akiensis アキサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius hidamontanus ハクバサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius iwami イワミサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius katoi アカイシサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius naevius ブチサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius osumiensis オオスミサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius setoi サンインサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius shinichisatoi ソボサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius takedai ホクリクサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hynobius tsurugiensis ツルギサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Salamandrella keyserlingii キタサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Babina holsti ホルストガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/3 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Babina subaspera オットンガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/3 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Glandirana susurra サドガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 24 | 1/6 (16.7%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Odorrana ishikawae オキナワイシカワガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Odorrana splendida アマミイシカワガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Odorrana utsunomiyaorum コガタハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pelophylax porosus brevipodus ナゴヤダルマガエル | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/118 (0.8%) | 15/745 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Limnonectes namiyei ナミエガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/182 (0.0%) | 3/893 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius bakan ヤマグチサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius boulengeri オオダイガハラサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius dunni オオイタサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius fossigenus ヒガシヒダサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius guttatus マホロバサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius ikioi ベッコウサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius kuishiensis イヨシマサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius nebulosus カスミサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius okiensis オキサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius oyamai チクシブチサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius sematonotos チュウゴクブチサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius setouchi セトウチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius stejnegeri コガタブチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius tokyoensis トウキョウサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius utsunomiyaorum ヒバサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hynobius vandenburghi ヤマトサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Onychodactylus kinneburi シコクハコネサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Andrias japonicus オオサンショウウオ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Echinotriton andersoni イボイモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/3 (0.0%) | 5/170 (2.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nidirana okinavana ヤエヤマハラブチガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/34 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Odorrana amamiensis アマミハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Odorrana narina ハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius hirosei イシヅチサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius kimurae ヒダサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius lichenatus トウホクサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius nigrescens クロサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hynobius tsuensis ツシマサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onychodactylus fuscus タダミハコネサンショウウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onychodactylus intermedius バンダイハコネサンショウウオ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cynops ensicauda シリケンイモリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/6 (0.0%) | 5/170 (2.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cynops pyrrhogaster アカハライモリ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/6 (0.0%) | 5/170 (2.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bufo gargarizans miyakonis ミヤコヒキガエル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 3 | 17 | 2/35 (5.7%) | 13/866 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Odorrana supranarina オオハナサキガエル | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/98 (0.0%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pelophylax nigromaculatus トノサマガエル | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/118 (0.8%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pelophylax porosus porosus トウキョウダルマガエル | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/118 (0.8%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana kobai アマミアカガエル | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tagoi okiensis オキタゴガエル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tagoi yakushimensis ヤクシマタゴガエル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana tsushimensis ツシマアカガエル | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana uenoi チョウセンヤマアカガエル | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rana ulma リュウキュウアカガエル | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 24 | 4/90 (4.4%) | 15/745 (2.0%) | — |
| DD 情報不足 | Hynobius retardatus エゾサンショウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/88 (0.0%) | 0/132 (0.0%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Acipenser medirostris チョウザメ | EN | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 10 | 12 | 5/38 (13.2%) | 7/60 (11.7%) | — |
| EX 絶滅 | Gnathopogon elongatus suwae スワモロコ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/13 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| EX 絶滅 | Pungitius kaibarae ミナミトミヨ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| EW 野生絶滅 | Oncorhynchus kawamurae クニマス | EW | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 27 | 75 | 9/47 (19.1%) | 28/685 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Echidna rhodochilus ナミダカワウツボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 3/201 (1.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Uropterygius concolor コゲウツボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/18 (0.0%) | 3/201 (1.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acheilognathus cyanostigma イチモンジタナゴ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acheilognathus longipinnis イタセンパラ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 814 Mbp 65 | 73,939 20.7 kbp | 1 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | 2024-05-30 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acheilognathus tabira jordani ミナミアカヒレタビラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acheilognathus tabira nakamurae セボシタビラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acheilognathus typus ゼニタナゴ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aphyocypris chinensis ヒナモロコ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/9 (0.0%) | 24/213 (11.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carassius sp. フナ属の１種（琉球列島） | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 16 | 112 | 5/49 (10.2%) | 66/2412 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gnathopogon caerulescens ホンモロコ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/13 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ischikauia steenackeri ワタカ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/1 (0.0%) | 24/213 (11.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pseudorasbora pugnax ウシモツゴ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 22 | 2/7 (28.6%) | 13/349 (3.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pseudorasbora pumila シナイモツゴ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 22 | 2/7 (28.6%) | 13/349 (3.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhodeus atremius suigensis スイゲンゼニタナゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/50 (4.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhodeus ocellatus kurumeus ニッポンバラタナゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 1 | 2 | 3 | 2/50 (4.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sarcocheilichthys biwaensis アブラヒガイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/15 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tanakia tanago ミヤコタナゴ | EN | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/10 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/1 (0.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cobitis minamorii minamorii サンヨウコガタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cobitis minamorii yodoensis ヨドコガタスジシマドジョウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cobitis striata hakataensis ハカタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cobitis takenoi タンゴスジシマドジョウ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Parabotia curtus アユモドキ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/8 (0.0%) | 6/66 (9.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Plecoglossus altivelis ryukyuensis リュウキュウアユ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 4 | 4 | 4 | 1/1 (100.0%) | 1/1 (100.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Neosalanx reganius アリアケヒメシラウオ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 17 | 5/30 (16.7%) | 14/56 (25.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Salanx ariakensis アリアケシラウオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 522 Mbp 24 | 366,279 3.18 kbp | 1 | 3 | 17 | 3/5 (60.0%) | 14/56 (25.0%) | 2025-06-26 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oncorhynchus nerka ベニザケ（ヒメマス） | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 2.65 Gbp 23 | 15,727 2.84 Mbp | 2 | 27 | 75 | 9/47 (19.1%) | 28/685 (4.1%) | 2019-06-07 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Monopterus sp. タウナギ属の１種（琉球列島） | — | — | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/9 (11.1%) | 1/73 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gasterosteus aculeatus subsp. 2 ハリヨ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 10 | 11 | 20 | 2/9 (22.2%) | 6/58 (10.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pungitius sp. 3 トミヨ属雄物型 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pungitius sp. 4 ムサシトミヨ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Microphis argulus ホシイッセンヨウジ | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 50 | 0/3 (0.0%) | 31/607 (5.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Microphis jagorii ヒメテングヨウジ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 50 | 1/3 (33.3%) | 31/607 (5.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Microphis retzii タニヨウジ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 50 | 0/14 (0.0%) | 31/607 (5.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cestraeus plicatilis カワボラ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/3 (0.0%) | 6/365 (1.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tetraroge barbata アゴヒゲオコゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/28 (3.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tetraroge nigra ヒゲソリオコゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/28 (3.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Yarica hyalosoma カガミテンジクダイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.03 Gbp 135 | 168,358 10.6 kbp | 1 | 4 | 26 | 4/121 (3.3%) | 24/599 (4.0%) | 2024-03-19 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lutjanus goldiei ウラウチフエダイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 21 | 11/122 (9.0%) | 16/333 (4.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sillago parvisquamis アオギス | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/110 (0.9%) | 2/119 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Toxotes jaculatrix テッポウウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 622 Mbp 60 | 194 15.6 Mbp | 2 | 5 | 5 | 3/7 (42.9%) | 3/7 (42.9%) | 2021-04-15 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mesopristes argenteus ニセシマイサキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/3 (0.0%) | 7/58 (12.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mesopristes cancellatus ヨコシマイサキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/3 (0.0%) | 7/58 (12.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mesopristes iravi シミズシマイサキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/3 (0.0%) | 7/58 (12.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Enneapterygius cheni ウラウチヘビギンポ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/103 (0.0%) | 2/262 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Omobranchus ferox カワギンポ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 11 | 1/45 (2.2%) | 8/478 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Omox biporos ヒルギギンポ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhyacichthys aspro ツバサハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 595 Mbp 28 | 3,182 1.67 Mbp | 1 | 1 | 1 | 1/2 (50.0%) | 1/3 (33.3%) | 2024-11-08 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Butis amboinensis ヤエヤマノコギリハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/12 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bathygobius sp. カワクモハゼ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/34 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callogobius sp. ミスジハゼ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/23 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cristatogobius aurimaculatus ヒメトサカハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/3 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cristatogobius nonatoae クロトサカハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/3 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eviota ocellifer ウラウチイソハゼ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/195 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glossogobius aureus コンジキハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/77 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glossogobius bicirrhosus アゴヒゲハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/77 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gymnogobius isaza イサザ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gymnogobius nakamurae コシノハゼ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gymnogobius sp. 2 ホクリクジュズカケハゼ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lentipes armatus ヨロイボウズハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/14 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Luciogobius albus ドウクツミミズハゼ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oxyurichthys takagi シマサルハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/22 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhinogobius sp. BB アオバラヨシノボリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Scartelaos histophorus トカゲハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 695 Mbp 72 | 209,353 8.81 kbp | 1 | 1 | 41 | 1/8 (12.5%) | 29/2604 (1.1%) | 2014-12-02 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sicyopus zosterophorus アカボウズハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/9 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Smilosicyopus leprurus カエルハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/6 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stiphodon alcedo ヒスイボウズハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stiphodon atropurpureus コンテリボウズハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stiphodon imperiorientis ハヤセボウズハゼ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Parioglossus interruptus ヒメサツキハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Parioglossus taeniatus コマチハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Macropodus opercularis タイワンキンギョ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/8 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 483 Mbp 150 | 151 19.2 Mbp | 2 | 2 | 8 | 1/8 (12.5%) | 3/169 (1.8%) | 2023-05-15 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Anguilla japonica ニホンウナギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (9) | Chromosome, Reference | 1.03 Gbp 234 | 811 21.5 Mbp | 9 | 20 | 20 | 8/22 (36.4%) | 8/22 (36.4%) | 2014-03-18 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nematalosa japonica ドロクイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 73 | 1/10 (10.0%) | 23/452 (5.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Coilia nasus エツ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 852 Mbp 43 | 149 26.6 Mbp | 2 | 6 | 12 | 3/13 (23.1%) | 9/248 (3.6%) | 2019-08-16 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Abbottina rivularis ツチフキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/5 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acheilognathus melanogaster タナゴ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acheilognathus tabira erythropterus アカヒレタビラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acheilognathus tabira tabira シロヒレタビラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acheilognathus tabira tohokuensis キタノアカヒレタビラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/49 (2.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Biwia yodoensis ヨドゼゼラ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/3 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carassius buergeri grandoculis ニゴロブナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 6 | 16 | 112 | 5/49 (10.2%) | 66/2412 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carassius cuvieri ゲンゴロウブナ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 1.60 Gbp 29 | 1,018 9.29 Mbp | 1 | 16 | 112 | 5/49 (10.2%) | 66/2412 (2.7%) | 2025-04-05 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hemigrammocypris neglectus カワバタモロコ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/1 (0.0%) | 24/213 (11.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhodeus atremius atremius カゼトゲタナゴ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/50 (4.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tribolodon nakamurai ウケクチウグイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 85 | 1/8 (12.5%) | 44/1264 (3.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis kaibarai アリアケスジシマドジョウ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis magnostriata オオガタスジシマドジョウ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis minamorii oumiensis ビワコガタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis minamorii saninensis サンインコガタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis minamorii tokaiensis トウカイコガタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis sakahoko オオヨドシマドジョウ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis shikokuensis ヒナイシドジョウ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis striata fuchigamii オンガスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cobitis takatsuensis イシドジョウ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lefua costata nikkonis エゾホトケドジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/15 (0.0%) | 16/1086 (1.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lefua echigonia ホトケドジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/15 (0.0%) | 16/1086 (1.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lefua tokaiensis トウカイナガレホトケドジョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/15 (0.0%) | 16/1086 (1.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lefua torrentis ナガレホトケドジョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/15 (0.0%) | 16/1086 (1.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tachysurus ichikawai ネコギギ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 14 | 3/47 (6.4%) | 10/266 (3.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hucho perryi イトウ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 75 | 0/1 (0.0%) | 28/685 (4.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hippichthys heptagonus アミメカワヨウジ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 50 | 0/12 (0.0%) | 31/607 (5.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crenimugil heterocheilos ナガレフウライボラ | LC | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/54 (0.0%) | 6/365 (1.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lates japonicus アカメ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 838 Mbp 56 | 18,353 286 kbp | 2 | 7 | 7 | 2/19 (10.5%) | 2/40 (5.0%) | 2023-06-29 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Coreoperca kawamebari オヤニラミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 13 | 1/4 (25.0%) | 7/18 (38.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sillaginops macrolepis アトクギス | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 2/119 (1.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Kuhlia munda トゲナガユゴイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/13 (7.7%) | 1/13 (7.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cottus reinii カジカ小卵型 | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 2/154 (1.3%) | 6/353 (1.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cottus sp. カジカ中卵型 | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 2/154 (1.3%) | 6/353 (1.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trachidermus fasciatus ヤマノカミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/1 (0.0%) | 6/353 (1.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Bostrychus sinensis ジャノメハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Chromosome, Reference | 886 Mbp 447.8 | 348 28.3 Mbp | 3 | 3 | 19 | 1/4 (25.0%) | 14/291 (4.8%) | 2021-06-03 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Giuris sp. 1 タメトモハゼ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/56 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Giuris sp. 2 ゴシキタメトモハゼ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/56 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hypseleotris cyprinoides タナゴモドキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 6 | 19 | 5/53 (9.4%) | 14/291 (4.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Boleophthalmus pectinirostris ムツゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 941 Mbp 100 | 3,222 835 kbp | 2 | 2 | 41 | 1/17 (5.9%) | 29/2604 (1.1%) | 2014-12-02 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cristatogobius lophius トサカハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/3 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gymnogobius cylindricus キセルハゼ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gymnogobius scrobiculatus クボハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gymnogobius sp. 1 ムサシノジュズカケハゼ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Mugilogobius cavifrons ホホグロハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 41 | 1/32 (3.1%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhinogobius ogasawaraensis オガサワラヨシノボリ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhinogobius sp. YB キバラヨシノボリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schismatogobius ampluvinculus シマエソハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/12 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schismatogobius roxasi エソハゼ | EN | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/12 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Taenioides cirratus チワラスボ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 41 | 1/23 (4.3%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Parioglossus rainfordi コビトハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lethenteron japonicum カワヤツメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Scaffold, Reference | 1.07 Gbp 87.8 | 4,710 1.60 Mbp | 2 | 3 | 23 | 2/14 (14.3%) | 9/481 (1.9%) | 2013-09-13 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lethenteron sp. N. スナヤツメ北方種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 23 | 2/14 (14.3%) | 9/481 (1.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lethenteron sp. S. スナヤツメ南方種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 23 | 2/14 (14.3%) | 9/481 (1.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Biwia zezera ゼゼラ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/3 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carassius buergeri subsp. 2 キンブナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 16 | 112 | 5/49 (10.2%) | 66/2412 (2.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Opsariichthys uncirostris uncirostris ハス | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 47 | 1/35 (2.9%) | 24/213 (11.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Squalidus chankaensis biwae スゴモロコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/17 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Squalidus japonicus japonicus デメモロコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/17 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cobitis matsubarae ヤマトシマドジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cobitis sp. BIWAE type D トサシマドジョウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cobitis striata striata チュウガタスジシマドジョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Niwaella delicata アジメドジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 3/245 (1.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tachysurus aurantiacus アリアケギバチ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 14 | 3/47 (6.4%) | 10/266 (3.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tachysurus tokiensis ギバチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 14 | 3/47 (6.4%) | 10/266 (3.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Liobagrus reinii アカザ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/26 (3.8%) | 1/53 (1.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Salvelinus leucomaenis imbrius ゴギ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 7 | 75 | 5/61 (8.2%) | 28/685 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Salvelinus malma krascheninnikovi オショロコマ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 7 | 75 | 5/61 (8.2%) | 28/685 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Salvelinus malma miyabei ミヤベイワナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 1 | 7 | 75 | 5/61 (8.2%) | 28/685 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pungitius tymensis エゾトミヨ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Oryzias latipes ミナミメダカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (34) | Chromosome, Reference | 734 Mbp 0.99 | 515 2.53 Mbp | 34 | 45 | 46 | 10/92 (10.9%) | 11/95 (11.6%) | 2007-04-26 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Oryzias sakaizumii キタノメダカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 45 | 46 | 10/92 (10.9%) | 11/95 (11.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acanthopagrus pacificus ナンヨウチヌ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 22 | 2/28 (7.1%) | 13/174 (7.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cottus kazika カマキリ（アユカケ） | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/1 (0.0%) | 6/353 (1.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Odontobutis hikimius イシドンコ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/8 (0.0%) | 2/17 (11.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ophiocara porocephala ホシマダラハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/4 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acanthogobius hasta ハゼクチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/8 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acanthogobius insularis ミナミアシシロハゼ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/8 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acentrogobius viridipunctatus キララハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/23 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Apocryptodon punctatus タビラクチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/4 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Caragobius urolepis アサガラハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/1 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gymnogobius macrognathos エドハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gymnogobius taranetzi シンジコハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gymnogobius uchidai チクゼンハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Leucopsarion petersii シロウオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/1 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luciogobius ryukyuensis ミナミヒメミミズハゼ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mugilogobius mertoni ムジナハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 41 | 1/32 (3.1%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Odontamblyopus lacepedii ワラスボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 963 Mbp 260 | 394 12.1 Mbp | 2 | 3 | 41 | 2/10 (20.0%) | 29/2604 (1.1%) | 2023-10-25 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pandaka lidwilli マングローブゴマハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/5 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pandaka sp. ゴマハゼ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/5 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Parkraemeria saltator ギンポハゼ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/1 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudogobius masago マサゴハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/55 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sicyopterus lagocephalus ルリボウズハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/27 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Trypauchenopsis intermedia ヒゲワラスボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/6 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Parioglossus palustris ボルネオハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lethenteron kessleri シベリアヤツメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 23 | 2/14 (14.3%) | 9/481 (1.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phoxinus perenurus sachalinensis ヤチウグイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 85 | 1/6 (16.7%) | 44/1264 (3.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sarcocheilichthys variegatus variegatus カワヒガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/15 (0.0%) | 13/349 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tanakia lanceolata ヤリタナゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/7 (0.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tanakia limbata アブラボテ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/7 (0.0%) | 3/111 (2.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Misgurnus anguillicaudatus ドジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (7) | Chromosome, Reference | 1.12 Gbp 30 | 170 41.5 Mbp | 7 | 8 | 12 | 2/48 (4.2%) | 6/463 (1.3%) | 2024-01-25 |
| NT 準絶滅危惧 | Silurus lithophilus イワトコナマズ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 8 | 11 | 5/18 (27.8%) | 7/75 (9.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hypomesus olidus イシカリワカサギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 11 | 2/6 (33.3%) | 6/14 (42.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oncorhynchus masou ishikawae サツキマス（アマゴ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, — | 2.42 Gbp 18 | 70,318 128 kbp | 4 | 27 | 75 | 9/47 (19.1%) | 28/685 (4.1%) | 2023-09-10 |
| NT 準絶滅危惧 | Oncorhynchus masou masou サクラマス（ヤマメ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (3) | Chromosome, Reference | 2.66 Gbp 33 | 21,300 2.47 Mbp | 4 | 27 | 75 | 9/47 (19.1%) | 28/685 (4.1%) | 2024-03-01 |
| NT 準絶滅危惧 | Oncorhynchus sp. ビワマス | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 27 | 75 | 9/47 (19.1%) | 28/685 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pungitius sp. 2 トミヨ属汽水型 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hyporhamphus intermedius クルメサヨリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 883 Mbp 32.87 | 887 3.98 Mbp | 1 | 3 | 4 | 2/50 (4.0%) | 3/79 (3.8%) | 2025-05-08 |
| NT 準絶滅危惧 | Zenarchopterus dunckeri コモチサヨリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/20 (5.0%) | 1/89 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cottus pollux カジカ大卵型 | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 2/154 (1.3%) | 6/353 (1.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acentrogobius audax ニセツムギハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/5 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acentrogobius caninus ホクロハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/23 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acentrogobius suluensis ホホグロスジハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/23 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Amblygobius linki ワカケサラサハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/15 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bunaka gyrinoides オウギハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/2 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eugnathogobius mindora カブキハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/10 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eutaeniichthys gilli ヒモハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/1 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Glossogobius circumspectus スダレウロハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/77 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gymnogobius castaneus ジュズカケハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luciogobius fluvialis ナガレミミズハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luciogobius fonticola ユウスイミミズハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luciogobius pallidus イドミミズハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Periophthalmus modestus トビハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 854 Mbp 95 | 4,142 576 kbp | 1 | 6 | 41 | 3/20 (15.0%) | 29/2604 (1.1%) | 2021-08-13 |
| NT 準絶滅危惧 | Rhinogobius telma トウカイヨシノボリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rhinogobius tyoni シマヒレヨシノボリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Silhouettea dotui シラヌイハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/6 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Silhouettea sp. ニセシラヌイハゼ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/6 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tridentiger barbatus ショウキハゼ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/9 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tridentiger nudicervicus シロチチブ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/9 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gobitrichinotus radiocularis ナミノコハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Anguilla bicolor pacifica ニューギニアウナギ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 1.09 Gbp 92 | 404 16.9 Mbp | 1 | 20 | 20 | 8/22 (36.4%) | 8/22 (36.4%) | 2024-06-14 |
| DD 情報不足 | Carassius buergeri subsp. 1 ナガブナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 16 | 112 | 5/49 (10.2%) | 66/2412 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Phoxinus lagowskii yamamotis ヤマナカハヤ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 3 | 85 | 1/6 (16.7%) | 44/1264 (3.5%) | — |
| DD 情報不足 | Misgurnus sp. (Clade A) キタドジョウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 12 | 2/48 (4.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| DD 情報不足 | Misgurnus sp. IR シノビドジョウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 12 | 2/48 (4.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| DD 情報不足 | Misgurnus sp. OK ヒョウモンドジョウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 12 | 2/48 (4.2%) | 6/463 (1.3%) | — |
| DD 情報不足 | Salvelinus leucomaenis pluvius ニッコウイワナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 7 | 75 | 5/61 (8.2%) | 28/685 (4.1%) | — |
| DD 情報不足 | Chelon subviridis アンピンボラ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/136 (0.7%) | 6/365 (1.6%) | — |
| DD 情報不足 | Ellochelon vaigiensis オニボラ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 647 Mbp 60 | 137,715 24.2 kbp | 1 | 1 | 9 | 1/5 (20.0%) | 6/365 (1.6%) | 2024-08-08 |
| DD 情報不足 | Moolgarda engeli モンナシボラ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/57 (0.0%) | 6/365 (1.6%) | — |
| DD 情報不足 | Moolgarda pedaraki カマヒレボラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/10 (0.0%) | 6/365 (1.6%) | — |
| DD 情報不足 | Atherinomorus duodecimalis ネッタイイソイワシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.23 Gbp 60 | 1,011,320 3.27 kbp | 1 | 3 | 16 | 3/33 (9.1%) | 14/121 (11.6%) | 2025-05-26 |
| DD 情報不足 | Hypoatherina temminckii ミナミギンイソイワシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.22 Gbp 60 | 739,793 3.90 kbp | 1 | 1 | 16 | 1/17 (5.9%) | 14/121 (11.6%) | 2025-06-22 |
| DD 情報不足 | Ambassis interrupta ナンヨウタカサゴイシモチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 7 | 4/46 (8.7%) | 5/71 (7.0%) | — |
| DD 情報不足 | Ambassis macracanthus ハナダカタカサゴイシモチ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 7 | 4/46 (8.7%) | 5/71 (7.0%) | — |
| DD 情報不足 | Epinephelus bontoides シラヌイハタ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 19 | 45 | 12/135 (8.9%) | 30/496 (6.0%) | — |
| DD 情報不足 | Fibramia lateralis ワキイシモチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.16 Gbp 60 | 464,460 4.68 kbp | 1 | 1 | 26 | 1/3 (33.3%) | 24/599 (4.0%) | 2024-08-15 |
| DD 情報不足 | Pseudamia amblyuroptera ヒルギヌメリテンジクダイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 26 | 1/6 (16.7%) | 24/599 (4.0%) | — |
| DD 情報不足 | Plectorhinchus albovittatus ダイダイコショウダイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/31 (3.2%) | 4/189 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Omobranchus elongatus ゴマクモギンポ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 11 | 1/45 (2.2%) | 8/478 (1.7%) | — |
| DD 情報不足 | Pseudocalliurichthys ikedai ナリタイトヒキヌメリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 10 | 0/1 (0.0%) | 5/135 (3.7%) | — |
| DD 情報不足 | Belobranchus belobranchus エリトゲハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/3 (0.0%) | 14/291 (4.8%) | — |
| DD 情報不足 | Glossogobius sp. フタゴハゼ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/77 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Gymnogobius mororanus ヘビハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Luciogobius dormitoris ネムリミミズハゼ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/41 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Mugilogobius fuscus フタホシハゼ | LC | — | ✓ | — | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 41 | 1/32 (3.1%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Pseudogobius gastrospilos コクチスナゴハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/55 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Redigobius balteatus タスキヒナハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/10 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Rhinogobius biwaensis ビワヨシノボリ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 41 | 2/137 (1.5%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Sicyopus auxilimentus ヒノコロモボウズハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/9 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Stenogobius ophthalmoporus ドウケハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/12 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Stiphodon multisquamus トラフボウズハゼ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Stiphodon niraikanaiensis ニライカナイボウズハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Stiphodon surrufus カキイロヒメボウズハゼ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/29 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Kraemeria tongaensis トンガスナハゼ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/3 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Parioglossus caeruleolineatus クジャクハゼ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Parioglossus lineatus マイコハゼ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/11 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Entosphenus tridentatus 栃木県のミツバヤツメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 928 Mbp 43 | 204,728 19.6 kbp | 2 | 2 | 23 | 1/8 (12.5%) | 9/481 (1.9%) | 2020-10-05 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Clupea pallasii 本州の太平洋側湖沼系群のニシン | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (2) | Contig, Reference | 852 Mbp 46.19 | 1,379 1.70 Mbp | 2 | 36 | 73 | 2/4 (50.0%) | 23/452 (5.1%) | 2025-07-02 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cyprinus carpio 琵琶湖のコイ在来型 | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/13 | ✓/✓ | Yes (13) | Chromosome, Reference | 1.68 Gbp 184.8 | 19,837 1.56 Mbp | 13 | 13 | 112 | 1/16 (6.2%) | 66/2412 (2.7%) | 2014-11-03 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Tribolodon brandtii brandtii 本州のジュウサンウグイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 85 | 1/8 (12.5%) | 44/1264 (3.5%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Tribolodon sachalinensis 東北地方のエゾウグイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 85 | 1/8 (12.5%) | 44/1264 (3.5%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Spirinchus lanceolatus 襟裳岬以西のシシャモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 11 | 1/3 (33.3%) | 6/14 (42.9%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Salvelinus leucomaenis japonicus 紀伊半島のヤマトイワナ（キリクチ） | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 7 | 75 | 5/61 (8.2%) | 28/685 (4.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Gasterosteus aculeatus subsp. 1 福島県以南の太平洋系陸封型イトヨ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 10 | 11 | 20 | 2/9 (22.2%) | 6/58 (10.3%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Gasterosteus nipponicus 本州のニホンイトヨ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 600 Mbp 17.8 | 3,718 545 kbp | 1 | 11 | 20 | 2/9 (22.2%) | 6/58 (10.3%) | 2020-07-29 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Pungitius sp. 1 本州のトミヨ属淡水型 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 2/46 (4.3%) | 6/58 (10.3%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Lateolabrax japonicus 有明海のスズキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/9 (11.1%) | 1/9 (11.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cottus hangiongensis 東北・北陸地方のカンキョウカジカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 2/154 (1.3%) | 6/353 (1.7%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cottus nozawae 東北地方のハナカジカ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 2/154 (1.3%) | 6/353 (1.7%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Gymnogobius petschiliensis 北海道南部・東北地方のスミウキゴリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 41 | 0/25 (0.0%) | 29/2604 (1.1%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Takifugu alboplumbeus 沖縄島のクサフグ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 18 | 4/43 (9.3%) | 10/204 (4.9%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Ishikawatrechus intermedius カドタメクラチビゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Rakantrechus elegans コゾノメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Prodaticus satoi スジゲンゴロウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/43 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Macroplea japana キイロネクイハムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 124 | 0/6 (0.0%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Erythromma humerale アカメイトトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/4 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Indolestes boninensis オガサワラアオイトトンボ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hemicordulia ogasawarensis オガサワラトンボ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/212 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Libellula angelina ベッコウトンボ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/21 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Orthetrum poecilops ミヤジマトンボ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 9 | 1/35 (2.9%) | 6/680 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Celes akitanus アカハネバッタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/3 (0.0%) | 9/1920 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ogasawaracris gloriosus マボロシオオバッタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oxya ogasawarensis オガサワライナゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/19 (0.0%) | 9/1920 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platypleura albivannata イシガキニイニイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/64 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplonychus rusticus タイワンコオイムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/12 (0.0%) | 1/235 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lethocerus indicus タイワンタガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 427 Mbp 60 | 502 5.90 Mbp | 1 | 1 | 1 | 1/16 (6.2%) | 1/235 (0.4%) | 2021-09-01 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Laccotrephes grossus タイワンタイコウチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/11 (0.0%) | 2/55 (3.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aphelocheirus kawamurae カワムラナベブタムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carabus arrowianus kirimurai ミカワオサムシ御浜町亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chlaenius praefectus アオヘリアオゴミムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cylindera bonina オガサワラハンミョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/67 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oodes virens オオヒラタトックリゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/5 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pterostichus yokohamae ヨコハマナガゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 60 | 3/290 (1.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Copelatus parallelus コセスジゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/471 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cybister lewisianus マルコガタノゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cybister limbatus フチトリゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dytiscus sharpi シャープゲンゴロウモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hydaticus thermonectoides マダラシマゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/33 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hyphydrus orientalis ニセコケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhantaticus congestus マダラゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gyrinus ryukyuensis リュウキュウヒメミズスマシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Quedius kiuchii リュウノイワヤツヤムネハネカクシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 74 | 1/291 (0.3%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Neolucanus insulicola donan ヨナグニマルバネクワガタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oryctes hisamatsui ヒサマツサイカブト | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 2/14 (14.3%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chrysobothris boninensis suzukii オガサワラムツボシタマムシ母島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/35 (0.0%) | 5/729 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tamamushia virida fujitai ツマベニタマムシ聟島亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Luciola owadai クメジマボタル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 8/669 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glipa asahinai キンモンオビハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glipa kurosawai クロサワオビハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glipa ogasawarensis オガサワラオビハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hoshihananomia katoi boninensis ニセキボシハナノミ小笠原亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hoshihananomia kusuii クスイキボシハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Agapanthia japonica フサヒゲルリカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/16 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Boninella anoplos ケズネオガサワラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Boninella hirsuta アラゲオガサワラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Boninella igai ヒメオガサワラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Boninella satoi masatakai サトウオガサワラカミキリ母島亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bonipogonius fujitai ヒゲシロアラゲカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phytoecia coeruleomicans アオキクスイカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/18 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Xylotrechus takakuwai ミイロトラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/60 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Donacia frontalis アオノネクイハムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 124 | 1/61 (1.6%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ogasawarazo daitoensis ダイトウスジヒメカタゾウムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ogasawarazo rugosicephalus hahajimaensis ヒメカタゾウムシ母島亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Orussus boninensis オガサワラヤドリキバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/7 (14.3%) | 1/12 (8.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chrysis boninensis オガサワラセイボウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 1/217 (0.5%) | 2/490 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aphaenogaster gamagumayaa ガマアシナガアリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 285 | 9/287 (3.1%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pison tosawai チチジマピソン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/21 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Anopheles yatsushiroensis ヤツシロハマダラカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 117 | 170 | 47/1149 (4.1%) | 69/3809 (1.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Simulium yonakuniense ヨナクニウォレスブユ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1869 (0.0%) | 0/2216 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carterocephalus palaemon akaishianus タカネキマダラセセリ赤石山脈亜種 | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 5 | 487 | 3/15 (20.0%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pyrgus malvae unomasahiroi ヒメチャマダラセセリ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 20 | 487 | 10/39 (25.6%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pieris canidia kaolicola タイワンモンシロチョウ対馬・朝鮮半島亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 16 | 90 | 6/57 (10.5%) | 41/923 (4.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Antigius butleri kurinodakensis ウスイロオナガシジミ鹿児島県栗野岳亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/2 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Celastrina ogasawaraensis オガサワラシジミ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 104 | 1/21 (4.8%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Everes lacturnus lacturnus タイワンツバメシジミ名義タイプ亜種, 琉球亜種 | — | — | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 104 | 4/16 (25.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Japonica onoi mizobei カシワアカシジミ（キタアカシジミ）冠高原亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/5 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phengaris teleius kazamoto ゴマシジミ関東・中部亜種 | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 104 | 2/11 (18.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pithecops fulgens tsushimanus ツシマウラボシシジミ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/4 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Plebejus subsolanus iburiensis アサマシジミ北海道亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 104 | 4/65 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Shijimia moorei moorei ゴイシツバメシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Shijimiaeoides divinus barine オオルリシジミ本州亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Coenonympha oedippus annulifer ヒメヒカゲ長野県・群馬県亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 11 | 783 | 6/41 (14.6%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Fabriciana nerippe オオウラギンヒョウモン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 783 | 1/10 (10.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Melitaea protomedia ウスイロヒョウモンモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 28 | 783 | 13/150 (8.7%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Melitaea scotosia ヒョウモンモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 28 | 783 | 13/150 (8.7%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oeneis norna sugitanii タカネヒカゲ八ヶ岳亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 783 | 2/32 (6.2%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sebastosema bubonaria カバシタムクゲエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oxytrypia orbiculosa ミヨタトラヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sideridis incommoda アサギリヨトウ（キシダムラサキヨトウ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/19 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sinocharis korbae ノシメコヤガ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Mortonagrion hirosei ヒヌマイトトンボ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/10 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Paracercion plagiosum オオセスジイトトンボ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/9 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Copera tokyoensis オオモノサシトンボ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 1/178 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lestes japonicus コバネアオイトトンボ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/59 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhinocypha ogasawarensis ハナダカトンボ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/9 (11.1%) | 1/53 (1.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Anaciaeschna jaspidea トビイロヤンマ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/4 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhyothemis severini ハネナガチョウトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/8 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sympetrum flaveolum flaveolum エゾアカネ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 9 | 2/114 (1.8%) | 6/680 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sympetrum maculatum マダラナニワトンボ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 9 | 2/114 (1.8%) | 6/680 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sympetrum uniforme オオキトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 9 | 2/114 (1.8%) | 6/680 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Zyxomma obtusum コフキオオメトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/3 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Galloisiana notabilis イシイムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/27 (0.0%) | 0/171 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ilyocoris cimicoides exclamationis コバンムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/260 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Abroscelis anchoralis イカリモンハンミョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Awatrechus hygrobius リュウノメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Bembidion nakamurai サツマキバナガミズギワゴミムシ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/512 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carabus kolbei hanatanii アイヌキンオサムシ利尻島亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chaetodera laetescripta カワラハンミョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/3 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chaetotrechiama procerus ケバネメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chlaenius ikedai オガサワラアオゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cicindela lewisi ルイスハンミョウ | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/312 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Colpodes laetus オガサワラモリヒラタゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/10 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Colpodes yamaguchii ハハジマモリヒラタゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/10 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Drypta fulveola キイロホソゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/3 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaphrus punctatus コハンミョウモドキ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/15 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaphrus sugai ワタラセハンミョウモドキ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/15 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eochlaenius suvorovi チビアオゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Haplochlaenius insularis アマミスジアオゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nebria livida angulata キベリマルクビゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 3/199 (1.5%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nebria pulcherrima フタモンマルクビゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 3/199 (1.5%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pterostichus plesiomorphs アマミナガゴミムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 60 | 3/290 (1.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rakantrechus lallum ツヅラセメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rakantrechus mirabilis ウスケメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stygiotrechus kadanus タカモリメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stygiotrechus kitayamai キタヤマメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Suzuka masuzoi マスゾウメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trechiama abcuma アブクマナガチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/2 (50.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trechiama morii カダメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/2 (50.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trechiama nakaoi ナカオメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/2 (50.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trechiama oopterus スリカミメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/2 (50.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Haliplus kamiyai カミヤコガシラミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Neohydrocoptus bivittis キボシチビコツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phreatodytes elongatus ギフムカシゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phreatodytes latiusculus カガミムカシゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phreatodytes sublimbatus トサムカシゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acilius kishii ヤシャゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/14 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydaticus pacificus conspersus オオイチモンジシマゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/33 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Laccophilus vagelineatus キタノツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/64 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Morimotoa gigantea オオメクラゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Morimotoa morimotoi トサメクラゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gyrinus curtus コミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gyrinus gestroi ヒメミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydrochus aequalis ホソガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/38 (2.6%) | 1/38 (2.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Helophorus auriculatus セスジガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/51 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Laccobius bedeli シジミガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 1/36 (2.8%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Liparocephalus tokunagai オオズウミハネカクシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/3 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Neolucanus protogenetivus hamaii ウケジママルバネクワガタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cheirotonus jambar ヤンバルテナガコガネ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 71 | 0/3 (0.0%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Graphelmis shirahatai アヤスジミゾドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/12 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Optioservus hagai ハガマルヒメドロムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/8 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Zaitzevia rufa アカツヤドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/16 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lucidina okadai コクロオバボタル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/7 (0.0%) | 8/669 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhagophthalmus ohbai イリオモテボタル | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/11 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/9 (11.1%) | 1/31 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tomoxia relicta オガサワラモンハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Variimorda inomatai オガサワラキンオビハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Variimorda maiae shoui マイキンオビハナノミ母島亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Boninella karubei ムコジマオガサワラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chlorophorus kusamai ムコジマトラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/44 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chlorophorus masatakai ムコジマキイロトラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/44 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Peblephaeus nobuoi ノブオフトカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/3 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pseudiphra bicolor nigripennis フタモンアメイロカミキリ母島列島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stenygrinum quadrinotatum ヨツボシカミキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Simulium satsumense サツマツノマユブユ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1869 (0.0%) | 0/2216 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Symmerus akikoae ヒメケヅメカ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 7 | 1/34 (2.9%) | 6/6780 (0.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydrotaea glabricula イソメマトイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 41 | 4/65 (6.2%) | 20/5708 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sarcophaga yonahaensis ヨナハニクバエ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 19 | 8/481 (1.7%) | 12/1538 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Scalarignathia montis ミスジコスカシバ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aeromachus inachus inachus ホシチャバネセセリ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 487 | 1/11 (9.1%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hesperia florinda florinda アカセセリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 487 | 2/29 (6.9%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Parnara ogasawarensis オガサワラセセリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 487 | 1/11 (9.1%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pyrgus maculatus maculatus チャマダラセセリ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 20 | 487 | 10/39 (25.6%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aporia hippia japonica ミヤマシロチョウ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 90 | 1/42 (2.4%) | 41/923 (4.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eurema laeta betheseba ツマグロキチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 90 | 3/48 (6.2%) | 41/923 (4.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gonepteryx maxima maxima ヤマキチョウ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 90 | 2/12 (16.7%) | 41/923 (4.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Leptidea amurensis ヒメシロチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 90 | 3/11 (27.3%) | 41/923 (4.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Everes lacturnus kawaii タイワンツバメシジミ日本本土亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 104 | 4/16 (25.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Niphanda fusca クロシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/3 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phengaris teleius daisensis ゴマシジミ中国地方・九州亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 104 | 2/11 (18.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Plebejus argyrognomon praeterinsularis ミヤマシジミ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 104 | 4/65 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Plebejus subsolanus yaginus アサマシジミ本州亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 104 | 4/65 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Shijimiaeoides divinus asonis オオルリシジミ九州亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Zizina emelina シルビアシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/3 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Coenonympha oedippus arothius ヒメヒカゲ本州中部・近畿・中国地方亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 11 | 783 | 6/41 (14.6%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lethe marginalis クロヒカゲモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/42 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Melitaea ambigua niphona コヒョウモンモドキ | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 28 | 783 | 13/150 (8.7%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Brabira kasaii チャホシホソバナミシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/1 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Epirrhoe hastulata echigoensis ヒトスジシロナミシャク本州亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 320 | 2/15 (13.3%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Heterophleps endoi サキシマウスクモナミシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/5 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Isturgia arenacearia ソトオビエダシャク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 320 | 1/22 (4.5%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chersotis deplanata ヒメカクモンヤガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/14 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Condica illustrata ヘリグロヒメヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/55 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cymatophoropsis trimaculata ミツモンケンモン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/3 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dasypolia fani オガサワラヒゲヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/6 (16.7%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lacanobia aliena オイワケクロヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 8 | 448 | 4/24 (16.7%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Leucapamea hikosana クロコシロヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Paraphyllophila confusa ミスズコヤガ | — | — | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Staurophora celsia コンゴウミドリヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Coenagrion hylas カラフトイトトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/27 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ischnura ezoin オガサワライトトンボ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 9 | 2/111 (1.8%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudagrion microcephalum アオナガイトトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/87 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stylurus annulatus オオサカサナエ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stylurus nagoyanus ナゴヤサナエ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stylurus oculatus メガネサナエ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chlorogomphus brunneus keramensis アサトカラスヤンマ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/31 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chlorogomphus okinawensis オキナワミナミヤンマ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/31 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hemicordulia mindana nipponica ミナミトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/212 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macromidia ishidai サキシマヤマトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/212 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Somatochlora clavata ハネビロエゾトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/87 (0.0%) | 0/212 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Boninthemis insularis シマアカネ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/1 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sympetrum gracile ナニワトンボ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 9 | 2/114 (1.8%) | 6/680 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nocticola uenoi miyakoensis ミヤコホラアナゴキブリ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/46 (0.0%) | 0/78 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Trypetimorpha japonica ハウチワウンカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/52 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euterpnosia chibensis daitoensis ダイトウヒメハルゼミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/10 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Muda kuroiwae クロイワゼミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Suisha coreana チョウセンケナガニイニイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cacopsylla boninofatsiae ムニンヤツデキジラミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/119 (0.0%) | 2/592 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cacopsylla maculipennis チャマダラキジラミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/119 (0.0%) | 2/592 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Elatobium itoe ツツジコブアブラムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 85 | 0/5 (0.0%) | 45/5163 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hemipodaphis persimilis ケヤキワタムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Unisitobion corylicola ハシバミヒゲナガアブラムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hydrometra albolineata イトアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Xiphovelia boninensis ケブカオヨギカタビロアメンボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Asclepios shiranui シオアメンボ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Halobates matsumurai シロウミアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/36 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Limnometra femorata トゲアシアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/14 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Kirkaldyia deyrolli タガメ | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/235 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aphelocheirus nawae トゲナベブタムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Heterotrephes admorsus エグリタマミズムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Kitocoris hahajima ハハジマハナカメムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Myiophanes tipulina ゴミアシナガサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/1 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ptilocerus immitis フサヒゲサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/3 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Triatoma rubrofasciata オオサシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 6 | 11 | 3/123 (2.4%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dicranocephalus medius ブチヒゲツノヘリカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/12 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bembidion aestuarii キバネキバナガミズギワゴミムシ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/512 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bembidion sumaoi オオキバナガミズギワゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/512 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Callytron inspecularis ヨドシロヘリハンミョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/3 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus granulatus telluris アカガネオサムシ本州亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus maacki aquatilis マークオサムシ本州亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus macleayi amanoi マックレイセアカオサムシ利尻島亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus maeander nobukii セスジアカガネオサムシ大雪山パルサ湿原亜種 | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus maiyasanus ohkawai マヤサンオサムシ鵜方亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus porrecticollis pacificus アキタクロナガオサムシ富士亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Carabus uenoi ドウキョウオサムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chlaenius spoliatus motschulskyi ツヤキベリアオゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cychrus morawitzi iwatensis セダカオサムシ岩手県亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/26 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cylindera gracilis ホソハンミョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/67 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Daiconotrechus iwatai イワタメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplocheila elongata スナハラゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/6 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Harpalus crates チョウセンゴモクムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 60 | 3/93 (3.2%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Jujiroa ana ジャアナヒラタゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Kusumia australis コカシメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lophyridia sumatrensis niponensis ハラビロハンミョウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | / | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Morion boninense オガサワラクチキゴミムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/4 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Morion japonicum クチキゴミムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/4 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Paratachys gyotokuensis ギョウトクコミズギワゴミムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/16 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pterostichus isumiensis イスミナガゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 60 | 3/290 (1.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Trechiama paucisaeta モニワメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/2 (50.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Yamautidius anaulax アオナミメクラチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Haliplus basinotatus クロホシコガシラミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Haliplus eximius キイロコガシラミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Haliplus sharpi マダラコガシラミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Canthydrus politus ムツボシツヤコツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neohydrocoptus sp. ムモンチビコツブゲンゴロウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Copelatus nakamurai トダセスジゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/471 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cybister chinensis ゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cybister rugosus ヒメフチトリゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cybister tripunctatus lateralis コガタノゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dytiscus marginalis czerskii エゾゲンゴロウモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Graphoderus adamsii マルガタゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/15 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hyphydrus laeviventris laeviventris ヒメケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laccophilus lewisius ルイスツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/64 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laccophilus nakajimai ナカジマツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/64 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nebrioporus hostilis コシマチビゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/51 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Prodaticus vittatus オキナワスジゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/43 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gyrinus japonicus ミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Orectochilus agilis ツマキレオナガミズスマシ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Orectochilus punctipennis コオナガミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hydrochus chubu チュウブホソガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/38 (2.6%) | 1/38 (2.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Georissus granulosus セスジマルドロムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/18 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hydrophilus bilineatus cashimirensis コガタガムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/26 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ctenistes oculatus クシヒゲアリヅカムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Thiasophila shinanonis ヤマアリヤドリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/1 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dorcus hopei binodulosus オオクワガタ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 3 | 7 | 2/23 (8.7%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dorcus titanus daitoensis ダイトウヒラタクワガタ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 7 | 1/11 (9.1%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dorcus titanus hachijoensis ハチジョウヒラタクワガタ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 7 | 1/11 (9.1%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neolucanus okinawanus オキナワマルバネクワガタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neolucanus protogenetivus protogenetivus アマミマルバネクワガタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Platycerus viridicuprus kanadai キュウシュウコルリクワガタ（ニシコルリクワガタ九州亜種） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/48 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Omorgus chinensis オオコブスジコガネ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/30 (0.0%) | 0/99 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aphodius gotoi ツヤケシマグソコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Copris brachypterus マルダイコクコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 71 | 1/41 (2.4%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Copris ochus ダイコクコガネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 71 | 1/41 (2.4%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Onthophagus gibbulus チャバネエンマコガネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 71 | 2/307 (0.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Onthophagus yakuinsulanus ヤクシマエンマコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 71 | 2/307 (0.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Leptelmis gracilis ヨコミゾドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/8 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Orientelmis parvula セマルヒメドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudamophilus japonicus ケスジドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sinonychus satoi サトウカラヒメドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chrysobothris boninensis boninensis オガサワラムツボシタマムシ父島列島亜種 | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/35 (0.0%) | 5/729 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tamamushia virida virida ツマベニタマムシ父島・母島列島亜種 | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anadastus pulchelloides オビヒメコメツキモドキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/333 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ermischiella nigriceps ズグロヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Falsomordellistena formosana boninensis ボニンヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Falsomordellistena pseudalpigena ニセミヤマヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Falsomordellistena rosseoloides ニセチャイロヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Falsomordellistena watanabei ワタナベヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hoshihananomia ochrothorax キムネキボシハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hoshihananomia trichopalpis オガサワラキボシハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Variimorda hiromiae ロミキンオビハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Agapanthia sakaii ミチノクケマダラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/16 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Allotraeus boninensis オガサワラトビイロカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/5 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Boninella satoi satoi サトウオガサワラカミキリ父島列島亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Boninella takakuwai ケブカオガサワラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ceresium simile simile チャイロヒメカミキリ小笠原亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/9 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diboma costata オキナワサビカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macropidonia ruficollis アカムネハナカミキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mesosa hirtiventris ケハラゴマフカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/17 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nortia kusuii オガサワラムネスジウスバカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudiphra bicolor bicolor フタモンアメイロカミキリ父島列島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Thyestilla gebleri アサカミキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ogasawarazo mater ハハジマヒメカタゾウムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megaxyela togashii オオナギナタハバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/24 (0.0%) | 0/107 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chrysis nohirai ノヒラセイボウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 1/217 (0.5%) | 2/490 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Formica yessensis エゾアカヤマアリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 285 | 10/3061 (0.3%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Polyrhachis lamellidens トゲアリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/418 (0.2%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pararrhynchium oceanicum miyanoi ツヤカバフドロバチ母島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/7 (0.0%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bembix niponica ニッポンハナダカバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/40 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Isodontia boninensis オガサワラアナバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/9 (0.0%) | 1/238 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lestica rufigaster オガサワラギングチバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/6 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pison hahadzimaense ハハジマピソン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/21 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stizus pulcherrimus キアシハナダカバチモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/13 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tachysphex morosus titidzimaensis チチジマヌカダカバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/187 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hylaeus boninensis オガサワラメンハナバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 11 | 3/289 (1.0%) | 8/782 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hylaeus ikedai イケダメンハナバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 11 | 3/289 (1.0%) | 8/782 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hylaeus incomitatus キムネメンハナバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 11 | 3/289 (1.0%) | 8/782 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hylaeus yasumatsui ヤスマツメンハナバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 11 | 3/289 (1.0%) | 8/782 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lithurgus ogasawarensis オガサワラキホリハナバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/7 (0.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megachile asahinai アサヒナハキリバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 22 | 6/307 (2.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ceratina boninensis オガサワラツヤハナバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 160 | 3/388 (0.8%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neohapalothrix kanii カニギンモンアミカ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Deuterophlebia nipponica ニホンアミカモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/10 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hyperoscelis eximia insignis キスジモモブトモリカ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/3 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hyperoscelis veternosa クロモモブトモリカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/3 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hilarimorpha nigra クロオドリバエモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Microdon katsurai ケンランアリノスアブ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 150 | 1/60 (1.7%) | 73/4719 (1.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sarcophila japonica ゴヘイニクバエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/7 (0.0%) | 12/1538 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macroscelesia longipes yamatoensis アシナガモモブトスカシバ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zygaena niphona hakodatensis ベニモンマダラ道南亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 23 | 9/97 (9.3%) | 12/432 (2.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ochlodes subhyalinus asahinai アサヒナキマダラセセリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 487 | 1/23 (4.3%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Parnara bada ヒメイチモンジセセリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 487 | 1/11 (9.1%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luehdorfia japonica ギフチョウ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | Yes (1) | Contig, Reference | 507 Mbp 1.69 | 569,973 1.33 kbp | 1 | 3 | 118 | 2/5 (40.0%) | 81/612 (13.2%) | 2021-05-03 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anthocharis cardamines hayashii クモマツマキチョウ八ヶ岳・南アルプス亜種 | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 4 | 90 | 2/17 (11.8%) | 41/923 (4.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Coreana raphaelis yamamotoi チョウセンアカシジミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonica onoi onoi カシワアカシジミ（キタアカシジミ）名義タイプ亜種, 北海道・東北地方亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/5 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Panchala ganesa loomisi ルーミスシジミ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/69 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phengaris teleius hosonoi ゴマシジミ中部高地帯亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 104 | 2/11 (18.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Plebejus subsolanus yarigadakeanus アサマシジミ本州高地亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 104 | 4/65 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zizeeria karsandra ハマヤマトシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/2 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Argyronome laodice japonica ウラギンスジヒョウモン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 783 | 4/38 (10.5%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Brenthis daphne rabdia ヒョウモンチョウ本州中部亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 4 | 783 | 3/4 (75.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lasiommata deidamia kampuzana ツマジロウラジャノメ四国亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/3 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Limenitis populi jezoensis オオイチモンジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 7 | 783 | 4/33 (12.1%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ypthima multistriata niphonica ウラナミジャノメ日本本土亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/49 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Amraica kimurai サキシマオオエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/5 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Archiearis notha okanoi クロフカバシャク | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/3 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hypoxystis pulcheraria アキヨシトガリエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/2 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gastropacha quercifolia ヒロバカレハ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/7 (0.0%) | 13/593 (2.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hemaris radians スキバホウジャク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 29 | 1/16 (6.2%) | 17/1406 (1.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laelia miyanoi ミヤノスゲドクガ | — | — | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/13 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Capsula aerata ガマヨトウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/3 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Capsula sparganii キスジウスキヨトウ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | Yes (2) | Chromosome, Reference | 677 Mbp 31 | 134 11.4 Mbp | 2 | 2 | 448 | 1/3 (33.3%) | 216/7007 (3.1%) | 2023-03-10 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chasmina takakuwai オガサワラシロガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/8 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chilodes pacificus ヌマベウスキヨトウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Doerriesa coenosa キュウシュウスジヨトウ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Doerriesa striata エゾスジヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Eulocastra sasakii シラユキコヤガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/6 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nonagria puengeleri オオチャバネヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Plusilla rosalia ギンモンアカヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Protodeltote wiscotti マガリスジコヤガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/3 (33.3%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudohermonassa velata エゾクシヒゲモンヤガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/3 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Xylomoia fusei イチモジヒメヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/7 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Xylomoia graminea クシロモクメヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/7 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oligoneuriella rhenana ヒトリガカゲロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/47 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chiusanophlebia asahinai リュウキュウトビイロカゲロウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ephoron eophilum アカツキシロカゲロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/21 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ephoron limnobium ビワコシロカゲロウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/21 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Agriocnemis pygmaea ヒメイトトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/26 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ceriagrion nipponicum ベニイトトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 9 | 1/31 (3.2%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ischnura aurora aurora キバライトトンボ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 9 | 2/111 (1.8%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mortonagrion selenion モートンイトトンボ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/10 (0.0%) | 4/1103 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platycnemis foliacea sasakii グンバイトンボ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/9 (11.1%) | 1/178 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Calopteryx japonica アオハダトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 6 | 1/57 (1.8%) | 4/182 (2.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Asiagomphus amamiensis amamiensis アマミサナエ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Asiagomphus amamiensis okinawanus オキナワサナエ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Asiagomphus pryeri キイロサナエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Asiagomphus yayeyamensis ヤエヤマサナエ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trigomphus citimus tabei タベサナエ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trigomphus interruptus フタスジサナエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trigomphus ogumai オグマサナエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/533 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chlorogomphus iriomotensis イリオモテミナミヤンマ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/31 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aeschna mixta soneharai マダラヤンマ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/73 (1.4%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aeschna subarctica subarctica イイジマルリボシヤンマ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/73 (1.4%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aeschnophlebia anisoptera ネアカヨシヤンマ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/2 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aeschnophlebia longistigma アオヤンマ | LC | ✓ | — | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/2 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Planaeschna ishigakiana ishigakiana イシガキヤンマ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/17 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Planaeschna ishigakiana nagaminei アマミヤンマ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/17 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sarasaeschna kunigamiensis オキナワサラサヤンマ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/4 (0.0%) | 2/259 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macromia daimoji キイロヤマトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/39 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macromia kubokaiya オキナワコヤマトンボ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/39 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macromia urania ヒナヤマトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/39 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplacodes bipunctatus ベニヒメトンボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/6 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leucorrhinia intermedia ijimai エゾカオジロトンボ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/55 (0.0%) | 6/680 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Orthetrum internum タイワンシオヤトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 9 | 1/35 (2.9%) | 6/680 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Perlodes frisonanus フライソンアミメカワゲラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/13 (0.0%) | 1/316 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Miniperla japonica コカワゲラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Velarifictorus politus ムニンツヅレサセコオロギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/17 (0.0%) | 8/763 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gampsocleis ryukyuensis オキナワキリギリス | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/8 (0.0%) | 2/1418 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tanna ishigakiana イシガキヒグラシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/8 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hiraphora longiceps オガサワラハナダカアワフキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Batracomorphus ogasawarensis オガサワラアオズキンヨコバイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/39 (0.0%) | 13/12197 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Glossocratus fukuroki フクロクヨコバイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/5 (0.0%) | 13/12197 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psammotettix kurilensis スナヨコバイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/154 (0.0%) | 13/12197 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Celtisaspis japonica エノキカイガラキジラミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 1/298 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xiphovelia japonica オヨギカタビロアメンボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gerris babai ババアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/43 (4.7%) | 3/350 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Limnogonus nitidus ツヤセスジアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/19 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Limnoporus esakii エサキアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/7 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neogerris boninensis オガサワラアメンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/9 (0.0%) | 3/350 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hermatobates weddi サンゴアメンボ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/4 (25.0%) | 1/4 (25.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macrosaldula shikokuana オモゴミズギワカメムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/196 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Micracanthia boninana オガサワラミズギワカメムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/196 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Micracanthia hasegawai ヒメミズギワカメムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/196 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Appasus japonicus コオイムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/235 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laccotrephes maculatus エサキタイコウチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/11 (0.0%) | 2/55 (3.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ranatra longipes マダラアシミズカマキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/27 (3.7%) | 2/55 (3.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cymatia apparens ミゾナシミズムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/4 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hesperocorixa distanti hokkensis ホッケミズムシ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/21 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hesperocorixa kolthoffi オオミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/21 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hesperocorixa mandshurica ナガミズムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/21 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xenocorisa vittipennis ミヤケミズムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Notonecta montandoni オキナワマツモムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/31 (0.0%) | 0/110 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lygocorias boninensis オガサワラチャイロカスミカメ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Miyamotoa rubicunda ミヤモトベニカスミカメ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudoloxops miyamotoi クヌギヒイロカスミカメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/27 (0.0%) | 13/3413 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudophylus flavipes リンゴクロカスミカメ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/2 (0.0%) | 13/3413 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stenonabis extremus ツマグロマキバサシガメ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/282 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Elatophilus nipponensis ヒラタハナカメムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/3 (0.0%) | 5/205 (2.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Kitocoris omura オオムラハナカメムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lyctocoris beneficus ズイムシハナカメムシ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/9 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xylocoris hiurai クロアシブトハナカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/7 (0.0%) | 5/205 (2.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acanthaspis cincticrus ハリサシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/26 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Caunus noctulus アシボソトビイロサシガメ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/1 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Coranus spiniscutis ハイイロイボサシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/18 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Elongicoris takarai タカラサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gardena boninensis ムニンアシナガサシガメ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/10 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gardena melinarthrum オオアシナガサシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/10 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Polytoxus vagans トゲナガユミアシサシガメ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/4 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sphedanolestes albipilosus ヒメシマサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/24 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aradus herculeanus オオカバヒラタカメムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/33 (6.1%) | 2/358 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Glochocoris infantulus ケシヒラタカメムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mezira tremulae ヤセオオヒラタカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/13 (0.0%) | 2/358 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clerada apicicornis ミナミナガカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 2/399 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Peritrechus femoralis ハマベナガカメムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/7 (0.0%) | 2/399 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Poeantius lineatus アシナガナガカメムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 2/399 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Scolopostethus odoriko オドリコナガカメムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/7 (0.0%) | 2/399 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Canthophorus niveimarginatus シロヘリツチカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/130 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Brachymna tenuis ヒラタトガリカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 12/808 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Dalpada cinctipes ツシマキボシカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/12 (0.0%) | 12/808 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Plautia cyanoviridis ルリカメムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 12/808 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rhynchocoris humeralis ミカントゲカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 12/808 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bembidion tsutsuii ツツイキバナガミズギワゴミムシ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/512 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bembidion umi ウミミズギワゴミムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/512 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Callytron yuasai okinawensis オキナワシロヘリハンミョウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/3 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Callytron yuasai yuasai シロヘリハンミョウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/3 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Carabus arboreus ohminensis コクロナガオサムシ大峰山脈亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Carabus tuberculosus セアカオサムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 60 | 4/455 (0.9%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ceratoderus venustus クロオビヒゲブトオサムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/2 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chlaenius deliciolus ヒトツメアオゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chlaenius sulcicollis クマガイクロアオゴミムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cicindela gemmata aino アイヌハンミョウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/312 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplocheila macromandibularis フトキバスナハラゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/6 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oodes echigonus エチゴトックリゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/5 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oodes vicarius オオトックリゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/5 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Perileptus morimotoi ウミホソチビゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/7 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Peronomerus auripilis イグチケブカゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pogonus itoshimaensis ドウイロハマベゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/11 (9.1%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pogonus japonicus ハマベゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 60 | 1/11 (9.1%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Scarites sulcatus オオヒョウタンゴミムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/17 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thalassoduvalius masidai kurosai ナンカイイソチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thalassoduvalius masidai masidai イソチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thalassoduvalius masidai pacificus イズイソチビゴミムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Haliplus kotoshonis コウトウコガシラミズムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Agabus affinis オクエゾクロマメゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/138 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Allopachria bimaculata フタキボシケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cybister brevis クロゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Graphoderus zonatus カラフトマルガタゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/15 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydaticus conspersus sakishimanus リュウキュウオオイチモンジシマゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/33 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus acuminatus コマルケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus bonvouloiri オオマルケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus pumilus チビマルケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus seminarius アマミマルケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus subtilis マルケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrovatus yagii ヤギマルケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hyphydrus japonicus ケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hyphydrus laeviventris tsugaru アラメケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ilybius apicalis キベリクロヒメゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/81 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japanolaccophilus nipponensis キボシツブゲンゴロウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laccophilus kobensis コウベツブゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/64 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laccophilus sharpi シャープツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/64 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leiodytes frontalis マルチビゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/17 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platambus fimbriatus キベリマメゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/20 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Prodaticus bowringii シマゲンゴロウ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/43 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Dineutus australis ツマキレオオミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/62 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Dineutus mellyi mellyi タイワンオオミズスマシ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/62 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Dineutus orientalis オオミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/62 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Orectochilus villosus エゾコオナガミズスマシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydraena iheya イヘヤダルマガムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/254 (0.0%) | 0/822 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydraena yonaguniensis ヨナグニダルマガムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/254 (0.0%) | 0/822 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ochthebius amami アマミセスジダルマガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/279 (0.0%) | 0/822 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrochus japonicus ヤマトホソガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/38 (2.6%) | 1/38 (2.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Enochrus subsignatus マルヒラタガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/64 (1.6%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Helochares nipponicus スジヒラタガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/90 (1.1%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Horelophopsis hanseni クロシオガムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/1 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrochara libera エゾコガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/17 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrophilus acuminatus ガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/26 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hydrophilus dauricus エゾガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/26 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laccobius inopinus ミユキシジミガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 1/36 (2.8%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nicrophorus japonicus ヤマトモンシデムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 8 | 3/61 (4.9%) | 5/139 (3.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lucanus gamunus ミクラミヤマクワガタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 7 | 1/82 (1.2%) | 6/433 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neolucanus insulicola insulicola ヤエヤママルバネクワガタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Prismognathus dauricus キンオニクワガタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/7 (0.0%) | 6/433 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trox mitis マルコブスジコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/35 (0.0%) | 0/99 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aphodius kiuchii ダイセツマグソコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aphodius languidulus キバネマグソコガネ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aphodius sturmi ヒメキイロマグソコガネ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aphodius variabilis クロモンマグソコガネ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onthophagus japonicus ヤマトエンマコガネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 71 | 2/307 (0.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Onthophagus ocellatopunctatus アラメエンマコガネ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 71 | 2/307 (0.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Osmoderma opicum オオチャイロハナムグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 71 | 1/13 (7.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponeubria yoshitomii ヒゲナガヒラタドロムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Kurosawaia yanoi ツヤヒメマルタマムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Campsosternus nobuoi ノブオオオアオコメツキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 38 | 0/14 (0.0%) | 20/1699 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyrocoelia miyako ミヤコマドボタル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/33 (3.0%) | 8/669 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Variimorda ihai boninensis ヨツモンハナノミ小笠原亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/435 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Blaps japonensis ヤマトオサムシダマシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 45 | 1/73 (1.4%) | 21/2445 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acalolepta boninensis オガサワラビロウドカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/20 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acalolepta degener ヒメビロウドカミキリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/20 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ceresium signaticolle クロモンヒメカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/9 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chlorophorus boninensis オガサワラトラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/44 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chlorophorus kobayashii オガサワラキイロトラカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/44 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Merionoeda tosawai オガサワラモモブトコバネカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/4 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mesosa rufa オガサワラゴマフカミキリ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/17 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nobuosciades lanata ケズネケシカミキリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Plagionotus pulcher コトラカミキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/6 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psephactus scabripennis chichijimensis オガサワラコバネカミキリ父島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psephactus scabripennis scabripennis オガサワラコバネカミキリ母島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pterolophia kubokii ススキサビカミキリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/25 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ropalopus signaticollis クロヒラタカミキリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/6 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xylotrechus ogasawarensis オガサワライカリモントラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/60 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chrysolina virgata オオルリハムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 124 | 4/84 (4.8%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Donacia hirtihumeralis アカガネネクイハムシ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 124 | 1/61 (1.6%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Donacia japana キンイロネクイハムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 124 | 1/61 (1.6%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyrrhalta nigromarginata クロヘリウスチャハムシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 124 | 0/15 (0.0%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ogasawarazo lineatus スジヒメカタゾウムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ogasawarazo rugosicephalus rugosicephalus ヒメカタゾウムシ父島列島亜種 | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neocolochelyna itoi イトウハバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/1 (0.0%) | 15/4363 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Selandria konoi コウノハバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/2 (50.0%) | 15/4363 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euurobracon yokahamae ウマノオバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/4 (0.0%) | 40/24918 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pristaulacus boninensis オガサワラセダカヤセバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/31 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gasteruption ogasawarensis オガサワラコンボウヤセバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/166 (0.6%) | 1/189 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Proconura yamamotoi ヤマモトアシブトコバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/6 (0.0%) | 3/546 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Elampus musashinus ムサシトゲセイボウ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/9 (0.0%) | 2/490 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Omalus grandis オオツヤセイボウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/16 (0.0%) | 2/490 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Liacos melanogaster ナガセクロツチバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/109 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Amblyopone fulvida ケシノコギリハリアリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 285 | 0/13 (0.0%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anochetus shohki ヒメアギトアリ | — | — | ✓ | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/137 (0.7%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aphaenogaster edentula トゲナシアシナガアリ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 285 | 9/287 (3.1%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lasius orientalis テラニシケアリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 285 | 8/534 (1.5%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leptanilla tanakai ヤクシマムカシアリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/65 (1.5%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Probolomyrmex longinodus ホソハナナガアリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/15 (6.7%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anoplius viaticus ムツボシベッコウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 1/29 (3.4%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Machaerothrix tsushimensis キマダラズアカベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/2 (0.0%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parabatozonus hakodadi フタモンベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euodynerus convergens チチジマドロバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/43 (0.0%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pararrhynchium tsunekii アマミカバフドロバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/7 (0.0%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stenodynerus ogasawaraensis オガサワラチビドロバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/20 (0.0%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ammophila atripes japonica フジジガバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/65 (1.5%) | 1/238 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bembecinus anthracinus ogasawaraensis オガサワラスナハキバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/23 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bembix formosana タイワンハナダカバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/40 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ceratocrabro shimoyamai シモヤマギングチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cerceris amamiensis tokunosimana トクノシマツチスガリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/58 (5.2%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cerceris pedetes マエダテツチスガリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/58 (5.2%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cerceris tomiyamai エラブツチスガリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/58 (5.2%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ectemnius furuichii ササキリギングチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/32 (9.4%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gorytes ishigakiensis ババアワフキバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/14 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Harpactus tumidus japonensis カワラアワフキバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/22 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Larra amplipennis アカオビケラトリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/7 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Liris subtessellatus ogasawarae オガサワラコオロギバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/34 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psen boninensis オガサワラヨコバイバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/3 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psenulus ogasawaranus オガサワラマエダテバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/30 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sphex inusitatus fukuianus フクイアナバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/39 (0.0%) | 1/238 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trypoxylon chichidzimaense チチジマジガバチモドキ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 24 | 2/71 (2.8%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Heriades fulvohispida オガサワラコハキリバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 22 | 0/14 (0.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megachile xanthothrix キバラハキリバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 22 | 6/307 (2.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bombus florilegus ノサップマルハナバチ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 71 | 160 | 49/444 (11.0%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bombus ignitus クロマルハナバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | —/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 243 Mbp 100 | 4,026 714 kbp | 1 | 71 | 160 | 49/444 (11.0%) | 103/3793 (2.7%) | 2020-10-02 |
| NT 準絶滅危惧 | Xylocopa ogasawarensis オガサワラクマバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 160 | 4/216 (1.9%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neohapalothrix manshukuensis シロウズギンモンアミカ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anopheles saperoi オオハマハマダラカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 117 | 170 | 47/1149 (4.1%) | 69/3809 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trichothaumalea japonica ケバネユスリカバエ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/80 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ragas circinata トビグチオドリバエ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/1 (0.0%) | 4/4156 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rhamphomyia mirabilis ハマナスクシオオドリバエ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 1/1579 (0.1%) | 4/4156 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Symballophthalmus speciosus フタテンアシホソハシリバエ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 2/4092 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diostracus nakanishii タカネキアシナガレアシナガバエ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 16 | 0/9 (0.0%) | 9/9843 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thalassophorus spinipennis トゲバネイソネジレオバエ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Himalopsyche japonica オオナガレトビケラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 547 Mbp 250 | 850 2.15 Mbp | 1 | 6 | 11 | 5/21 (23.8%) | 9/376 (2.4%) | 2023-02-08 |
| NT 準絶滅危惧 | Macrostemum okinawanum オキナワホシシマトビケラ （オキナワオオシマトビケラ） | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/37 (0.0%) | 6/1950 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ganonema inouei クチキトビケラ（クロアシエダトビケラ） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/147 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Georgium japonicum ビワアシエダトビケラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Setodes turbatus ギンボシツツトビケラ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/42 (0.0%) | 6/954 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Setodes ujiensis ウジヒメセトトビケラ（ウジセトトビケラ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/42 (0.0%) | 6/954 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Goera ogasawaraensis オガサワラニンギョウトビケラ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/39 (0.0%) | 0/61 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phragmataecia castaneae ハイイロボクトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 591 Mbp 53 | 217 6.05 Mbp | 2 | 2 | 7 | 1/1 (100.0%) | 4/335 (1.2%) | 2024-10-25 |
| NT 準絶滅危惧 | Balataea octomaculata ヤホシホソマダラ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eterusia watanabei ツシマキモンチラシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/6 (0.0%) | 12/432 (2.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rhagades pruni ルリハダホソクロバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 1.08 Gbp 26 | 818 3.03 Mbp | 2 | 2 | 23 | 1/5 (20.0%) | 12/432 (2.8%) | 2024-09-29 |
| NT 準絶滅危惧 | Zygaena niphona niphona ベニモンマダラ本土亜種 | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 23 | 9/97 (9.3%) | 12/432 (2.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chilo pulveratus ゴマフツトガ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 152 | 1/57 (1.8%) | 72/4297 (1.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chrysoteuchia moriokensis モリオカツトガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 152 | 1/7 (14.3%) | 72/4297 (1.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Paracymoriza vagalis カワゴケミズメイガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 152 | 0/4 (0.0%) | 72/4297 (1.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parapoynx ussuriensis ムナカタミズメイガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 152 | 1/26 (3.8%) | 72/4297 (1.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Carterocephalus palaemon satakei タカネキマダラセセリ飛騨山脈亜種 | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 5 | 487 | 3/15 (20.0%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leptalina unicolor ギンイチモンジセセリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 487 | 0/1 (0.0%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thymelicus leoninus hamadakohi スジグロチャバネセセリ愛媛亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 487 | 3/8 (37.5%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thymelicus leoninus leoninus スジグロチャバネセセリ名義タイプ亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 487 | 3/8 (37.5%) | 410/3444 (11.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luehdorfia puziloi inexpecta ヒメギフチョウ本州亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 118 | 2/5 (40.0%) | 81/612 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luehdorfia puziloi yessoensis ヒメギフチョウ北海道亜種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 118 | 2/5 (40.0%) | 81/612 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parnassius eversmanni daisetsuzanus ウスバキチョウ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 118 | 7/58 (12.1%) | 81/612 (13.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anthocharis cardamines isshikii クモマツマキチョウ北アルプス・戸隠亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 4 | 90 | 2/17 (11.8%) | 41/923 (4.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Colias palaeno aias ミヤマモンキチョウ浅間連山亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 23 | 90 | 10/101 (9.9%) | 41/923 (4.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Colias palaeno sugitanii ミヤマモンキチョウ北アルプス亜種 | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 23 | 90 | 10/101 (9.9%) | 41/923 (4.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Artipe eryx okinawana イワカワシジミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fixsenia iyonis iyonis ベニモンカラスシジミ名義タイプ亜種, 四国亜種 | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 104 | 3/48 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fixsenia iyonis kibiensis ベニモンカラスシジミ中国地方亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 104 | 3/48 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fixsenia iyonis surugaensis ベニモンカラスシジミ中部地方亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 104 | 3/48 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Glaucopsyche lycormas カバイロシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 104 | 2/10 (20.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phengaris arionides takamukui オオゴマシジミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 104 | 2/11 (18.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phengaris teleius ogumae ゴマシジミ北海道・東北亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 104 | 2/11 (18.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pithecops corvus ryukyuensis リュウキュウウラボシシジミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/4 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Plebejus argus micrargus ヒメシジミ本州・九州亜種 | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 6 | 104 | 4/65 (6.2%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Spindasis takanonis キマダラルリツバメ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/10 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/25 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tongeia fischeri caudalis クロツバメシジミ九州沿岸・朝鮮半島亜種 | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/7 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tongeia fischeri japonica クロツバメシジミ東日本亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/7 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tongeia fischeri shojii クロツバメシジミ中国地方・四国・九州内陸亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/7 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Vacciniina optilete daisetsuzana カラフトルリシジミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 104 | 1/9 (11.1%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Brenthis daphne iwatensis ヒョウモンチョウ北海道・本州北部亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 4 | 783 | 3/4 (75.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clossiana freija asahidakeana アサヒヒョウモン | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 22 | 783 | 11/50 (22.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clossiana iphigenia カラフトヒョウモン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 22 | 783 | 11/50 (22.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Coenonympha hero neoperseis シロオビヒメヒカゲ北海道西部亜種 | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 783 | 6/41 (14.6%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Erebia ligea rishirizana クモマベニヒカゲ北海道亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 4 | 53 | 783 | 27/113 (23.9%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Erebia ligea takanonis クモマベニヒカゲ本州亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 4 | 53 | 783 | 27/113 (23.9%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Erebia neriene niphonica ベニヒカゲ本州亜種 | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 53 | 783 | 27/113 (23.9%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hestina assimilis shirakii アカボシゴマダラ奄美亜種 | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 783 | 1/7 (14.3%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Kallima inachus eucerca コノハチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/5 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Kirinia fentoni キマダラモドキ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/2 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lethe europa pavida シロオビヒカゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/42 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oeneis melissa daisetsuzana ダイセツタカネヒカゲ | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 783 | 2/32 (6.2%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oeneis norna asamana タカネヒカゲ飛騨山脈亜種 | — | ✓ | ✓ | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 783 | 2/32 (6.2%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Polyura eudamippus weismanni フタオチョウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/132 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sasakia charonda charonda オオムラサキ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/2 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ypthima masakii マサキウラナミジャノメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/49 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ypthima riukiuana リュウキュウウラナミジャノメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/49 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ypthima yayeyamana ヤエヤマウラナミジャノメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 783 | 0/49 (0.0%) | 223/5419 (4.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Apochima excavata クワトゲエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/1 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Boninnadagara crinomorpha マルバエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eupithecia extensaria シロマダラカバナミシャク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 32 | 320 | 16/556 (2.9%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gymnoscelis boninensis オガサワラチビナミシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 320 | 1/18 (5.6%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gymnoscelis melaninfra ウラグロチビナミシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 320 | 1/18 (5.6%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gymnoscelis montgomeryi ウラジロチビナミシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 320 | 1/18 (5.6%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pelagodes ogasawarensis チビサザナミシロアオシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 320 | 0/7 (0.0%) | 159/11844 (1.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudonadagara hepatica カギバエダシャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Warreniplema fumicosta islandica アトキフタオ小笠原亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/133 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Actias gnoma オナガミズアオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 14 | 2/33 (6.1%) | 11/1947 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Attacus atlas ヨナグニサン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 14 | 0/15 (0.0%) | 11/1947 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Loepa sakaei ハグルマヤママユ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 14 | 0/41 (0.0%) | 11/1947 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Deilephila askoldensis ヒメスズメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 29 | 2/4 (50.0%) | 17/1406 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Polyptychus chinensis ハガタスズメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 29 | 0/32 (0.0%) | 17/1406 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ptilodon kuwayamae クワヤマエグリシャチホコ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 40 | 2/9 (22.2%) | 21/1822 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ramesa tosta カバイロシャチホコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 40 | 0/3 (0.0%) | 21/1822 (1.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Calliteara virginea ウスジロドクガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 135 | 1/23 (4.3%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Kidokuga torasan トラサンドクガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/2 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laelia coenosa スゲドクガ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/13 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laelia kunigamiensis クニガミスゲドクガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/13 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aloa lactinea マエアカヒトリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/5 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Amata flava aritai ツマキカノコ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/66 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eilema degenerella シロホソバ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/31 (12.9%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eilema fuscodorsalis ヤネホソバ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/31 (12.9%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Grammia quenseli daisetsuzana ダイセツヒトリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 135 | 1/52 (1.9%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nikaea matsumurai トラガモドキ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rhyparia purpurata ゴマベニシタヒトリ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 135 | 1/6 (16.7%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Meganola mikabo ミカボコブガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 12 | 2/150 (1.3%) | 6/680 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nola umetsui チョウカイシロコブガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 12 | 1/142 (0.7%) | 6/680 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acronicta carbonaria ウスズミケンモン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 448 | 5/129 (3.9%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acronicta digna クビグロケンモン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 448 | 5/129 (3.9%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acronicta lutea ウスジロケンモン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 448 | 5/129 (3.9%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Adisura atkinsoni アカヘリヤガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/43 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Agrotis desertorum ハマヤガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 448 | 5/134 (3.7%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Amphipyra okinawensis クロシマカラスヨトウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 448 | 2/19 (10.5%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anarta melanopa コイズミヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/23 (4.3%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Callopistria ogasawaraensis ムニンツマキリヨトウ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/25 (4.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Catocala actaea コシロシタバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/268 (1.5%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Catocala ella ミヤマキシタバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/268 (1.5%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Catocala koreana アズミキシタバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/268 (1.5%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Catocala nagioides ヒメシロシタバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/268 (1.5%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cidariplura signata カギモンハナオイアツバ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Coranarta carbonaria ダイセツキシタヨトウ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/3 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cucullia argentea アオモンギンセダカモクメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/58 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cucullia fraudatrix ホシヒメセダカモクメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/58 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cucullia jankowskii ギンモンセダカモクメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/58 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cucullia mandschuriae ダイセンセダカモクメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/58 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eupsilia contracta ウスミミモンキリガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/14 (7.1%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eupsilia hidakaensis ヒダカミツボシキリガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 448 | 1/14 (7.1%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hadena compta シロオビヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 687 Mbp 60 | 238 7.47 Mbp | 2 | 4 | 448 | 2/29 (6.9%) | 216/7007 (3.1%) | 2025-03-13 |
| NT 準絶滅危惧 | Helicoverpa sugii クロタバコガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 17 | 448 | 4/81 (4.9%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Heliothis bivittata ギンスジアカヤガ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 448 | 3/19 (15.8%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hypena claripennis キシタアツバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/6 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jodia sericea ミスジキリガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/1 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sarbanissa yunnana ツリフネソウトラガ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/4 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sideridis kitti フジシロミャクヨトウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/19 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Speiredonia inocellata ホラズミクチバ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 135 | 0/3 (0.0%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sympistis funebris kurodakeana クロダケタカネヨトウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 448 | 0/74 (0.0%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Virgo confusa ニセトガリヨトウ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xestia descripta アサマウスモンヤガ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 448 | 7/104 (6.7%) | 216/7007 (3.1%) | — |
| DD 情報不足 | Amphinemura kawaii カワイオナシカワゲラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/55 (1.8%) | 6/344 (1.7%) | — |
| DD 情報不足 | Nocticola uenoi kikaiensis キカイホラアナゴキブリ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/46 (0.0%) | 0/78 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Symploce miyakoensis ミヤコモリゴキブリ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/36 (0.0%) | 4/240 (1.7%) | — |
| DD 情報不足 | Symploce okinoerabuensis エラブモリゴキブリ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/36 (0.0%) | 4/240 (1.7%) | — |
| DD 情報不足 | Mantis religiosa ウスバカマキリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 3.68 Gbp 48 | 5,789 1.41 Mbp | 1 | 1 | 6 | 1/4 (25.0%) | 3/322 (0.9%) | 2023-08-17 |
| DD 情報不足 | Parasongella japonica オチバコオロギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Taiwanemobius ryukyuensis リュウキュウハマコオロギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Conocephalus halophilus イズササキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/39 (0.0%) | 2/1418 (0.1%) | — |
| DD 情報不足 | Boninoxya anijimensis アニジマイナゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Austrohancockia amamiensis アマミヒラタヒシバッタ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/5 (0.0%) | 4/185 (2.2%) | — |
| DD 情報不足 | Megacrania tsudai adan ヤエヤマツダナナフシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 3/278 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Galloisiana chujoi チュウジョウムシ（メギシマガロアムシ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/27 (0.0%) | 0/171 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Tinocallis insularis ムクロジヒゲマダラアブラムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 85 | 0/13 (0.0%) | 45/5163 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Hypselosoma hirashimai アマミオオメノミカメムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/367 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Hypselosoma matsumurae オオメノミカメムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/367 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Arctocorisa kurilensis チシマミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/4 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Glaenocorisa cavifrons オオメミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 2/238 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Physatocheila distinguenda コリヤナギグンバイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/368 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Ectomocoris elegans ヤエヤマサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/20 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Empicoris brachystigma フタオビマダラカモドキサシガメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/20 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Haematoloecha rufithorax ツシマアカサシガメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/4 (0.0%) | 6/1699 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Aradus betulae カバヒラタカメムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/33 (6.1%) | 2/358 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Sialis yamatoensis ヤマトセンブリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/41 (4.9%) | 2/56 (3.6%) | — |
| DD 情報不足 | Orientispa shirozui ツシマカマキリモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/81 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Chlaenius pericallus オオサカアオゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Chlaenius prostenus クビナガキベリアオゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/50 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Harpalomimetes orbicollis タナカツヤハネゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Lachnoderma asperum アリスアトキリゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Odacantha hagai ハガクビナガゴミムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 60 | 0/1 (0.0%) | 37/6513 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Tinoderus singularis クビナガヨツボシゴミムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Haliplus japonicus クビボソコガシラミズムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/57 (0.0%) | 0/84 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Notomicrus tenellus ホソコツブゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/39 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Phreatodytes haibaraensis ハイバラムカシゲンゴロウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Phreatodytes relictus ムカシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/127 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Allopachria flavomaculata キボシケシゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Copelatus minutissimus チビセスジゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/471 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Dimitshydrus typhlops メクラケシゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Hydroglyphus flammulatus アンピンチビゲンゴロウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/23 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Hydroglyphus kifunei キオビチビゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/23 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Leiodytes miyamotoi ホソマルチビゲンゴロウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/17 (0.0%) | 1/3015 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Morimotoa phreatica phreatica メクラゲンゴロウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Gyrinus niponicus ニッポンミズスマシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Orectochilus teranishii テラニシオナガミズスマシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/288 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Ochthebius danjo シオダマリセスジダルマガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/279 (0.0%) | 0/822 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Ochthebius nipponicus ニッポンセスジダルマガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/279 (0.0%) | 0/822 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Hydrochus laferi キタホソガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/38 (2.6%) | 1/38 (2.6%) | — |
| DD 情報不足 | Hydrochara affinis コガムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/17 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| DD 情報不足 | Pelthydrus okinawanus オキナワマルチビガムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/7 (0.0%) | 7/1310 (0.5%) | — |
| DD 情報不足 | Adinopsis nippon ヤチハネカクシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 74 | 1/4 (25.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Apharinodes papageno オオウロコアリヅカムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/2 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Bledius salsus オオツノハネカクシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/56 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Deinopsis minor ヒメヌレチハネカクシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 74 | 1/4 (25.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Deinopsis modesta ヌレチハネカクシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 74 | 1/4 (25.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Gymnusa miyashitai トマムハネカクシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 74 | 1/6 (16.7%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Halorhadinus aequalis クロイソハネカクシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/2 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Halorhadinus inaequalis ワカサイソハネカクシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/2 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Halorhadinus sawadai ウマヅライソハネカクシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/2 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Liparocephalus litoralis ホテイウミハネカクシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/3 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Pselaphus lewisi ルイスアリヅカムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 74 | 0/2 (0.0%) | 55/7284 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Trox kyotensis キョウトチビコブスジコガネ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/35 (0.0%) | 0/99 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Aphodius brachysomus セマルオオマグソコガネ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 71 | 4/232 (1.7%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Copris tripartitus ヒメダイコクコガネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 71 | 1/41 (2.4%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Mimela sakishimana サキシマチビコガネ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 71 | 0/9 (0.0%) | 44/5001 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Mozartius testaceus ダルママグソコガネ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Poecilophilides rusticola アカマダラハナムグリ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Trypoxyius dichotomus takarai オキナワカブトムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Dryopomorphus amami アマミハバビロドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/8 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Urumaelmis uenoi tokarana トカラツヤドロムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 1/554 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Agrilus boninensis オガサワラナガタマムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 7 | 4/237 (1.7%) | 5/729 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Agrilus suzukii シラフオガサワラナガタマムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 7 | 4/237 (1.7%) | 5/729 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Laius asahinai イソジョウカイモドキ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 2/466 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Ermischiella hahajimana ハハジマヒメハナノミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Derosphaerus foveolatus アラメゴミムシダマシ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 45 | 0/3 (0.0%) | 21/2445 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Amamiclytus nobuoi ケズネチビトラカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Boninoleiops kitajimai キタジマモモブトカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Obrium cantharinum shimomurai アカオニアメイロカミキリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/8 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Olenecamptus fukutomii オガサワラオオシロカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/8 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Ostedes inermis densepunctata アマミハリムネモモブトカミキリ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/1 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Parastrangalis ishigakiensis ヤエヤマクロスジホソハナカミキリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/3 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Rondibilis femorata シロスジトゲバカミキリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 39 | 0/5 (0.0%) | 27/3187 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Donacia akiyamai セラネクイハムシ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 124 | 1/61 (1.6%) | 68/6915 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Baryrhynchus yaeyamensis ヤエヤマミツギリゾウムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/2 (0.0%) | 1/151 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Cyphagogus iwatensis チャバネホソミツギリゾウムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Xyelecia japonica チャイロナギナタハバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Chrysolyda leucocephala シロズヒラタハバチ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/183 (0.5%) | — |
| DD 情報不足 | Agenocimbex jucunda ホシアシブトハバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/184 (0.5%) | — |
| DD 情報不足 | Nipponorhynchus bimaculatus ヒダクチナガハバチ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/2 (0.0%) | 15/4363 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Nipponorhynchus mirabilis クチナガハバチ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/2 (0.0%) | 15/4363 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Siobla metallica ルリコシアカハバチ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/55 (0.0%) | 15/4363 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Stiricorsia tosensis トサヤドリキバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Agriotypus gracilis ミズバチ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 110 | 0/6 (0.0%) | 75/24832 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Philoctetes monticola ミヤマツヤセイボウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/13 (0.0%) | 2/490 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Stilbum cyanurum pacificum オオセイボウ本土亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 2/490 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Trichrysis sudai スダセイボウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/6 (0.0%) | 2/490 (0.4%) | — |
| DD 情報不足 | Caenosclerogibba japonica シロアリモドキヤドリバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/35 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Camponotus amamianus ツヤミカドオオアリ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 285 | 9/1184 (0.8%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Camponotus nipponensis ケブカツヤオオアリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 285 | 9/1184 (0.8%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Formica fukaii ツノアカヤマアリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 285 | 10/3061 (0.3%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Lasius hikosanus ミヤマアメイロケアリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 285 | 8/534 (1.5%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Leptanilla oceanica オガサワラムカシアリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/65 (1.5%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Ponera swezeyi オガサワラハリアリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 285 | 0/111 (0.0%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Probolomyrmex okinawensis ハナナガアリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 285 | 1/15 (6.7%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Temnothorax haira オガサワラムネボソアリ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 285 | 9/261 (3.4%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Temnothorax santra シワムネボソアリ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 18 | 285 | 9/261 (3.4%) | 223/18684 (1.2%) | — |
| DD 情報不足 | Anoplius eous アケボノベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 1/29 (3.4%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Cryptocheilus sugiharai スギハラベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/27 (3.7%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Dipogon ogasawarensis オガサワラヒゲベッコウ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/23 (0.0%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Paracyphononyx alienus アオスジベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/3 (0.0%) | 3/1001 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Dolichovespula adulterina montivaga ヤドリホオナガスズメバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 36 | 3/33 (9.1%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Dolichovespula media sugare キオビホオナガスズメバチ本州亜種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 4 | 36 | 3/33 (9.1%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Dolichovespula saxonica nipponica ニッポンホオナガスズメバチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 4 | 36 | 3/33 (9.1%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Polistes japonicus japonicus ヤマトアシナガバチ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 36 | 7/154 (4.5%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Symmorphus captivus オオハムシドロバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 36 | 1/17 (5.9%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Vespa crabro flavofasciata モンスズメバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 8 | 36 | 3/29 (10.3%) | 23/1102 (2.1%) | — |
| DD 情報不足 | Argogorytes nipponis ニッポンアワフキバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/3 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bembecinus hungaricus japonicus ヤマトスナハキバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/23 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Crossocerus heydeni nipponis ガロアギングチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/73 (1.4%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Crossocerus pusillus タイセツギングチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 24 | 1/73 (1.4%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Ectemnius martjanowii アギトギングチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/32 (9.4%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Passaloecus koreanus カラトイスカバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/78 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pison argentatum hanedai ハネダピソン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/21 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pison koreense コウライピソン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/21 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pison oakleyi boninense オガサワラピソン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 24 | 0/21 (0.0%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Spadicocrabro nitobei ニトベギングチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Towada flavitarsus キユビギングチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Trypoxylon ambiguum フクイジガバチモドキ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 24 | 2/71 (2.8%) | 14/1464 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Andrena yasumatsui ヤスマツヒメハナバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 37 | 43 | 20/732 (2.7%) | 24/1030 (2.3%) | — |
| DD 情報不足 | Megachile lagopoda furukawai フルカワフトハキリバチ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 11 | 22 | 6/307 (2.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Megachile pseudomonticola クズハキリバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 22 | 6/307 (2.0%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Osmia orientalis マイマイツツハナバチ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 22 | 3/203 (1.5%) | 12/1138 (1.1%) | — |
| DD 情報不足 | Bombus consobrinus wittenburgi ナガマルハナバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 71 | 160 | 49/444 (11.0%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Bombus ussurensis ウスリーマルハナバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 71 | 160 | 49/444 (11.0%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Thyreus decorus ルリモンハナバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 160 | 0/29 (0.0%) | 103/3793 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Neopanorpa subreticulata イシガキシリアゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/84 (0.0%) | 2/246 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Panorpa amamiensis アマミシリアゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/90 (2.2%) | 2/246 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Panorpa globulifera シコクミスジシリアゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/90 (2.2%) | 2/246 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Panorpa hiurai ヒウラシリアゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 4 | 2/90 (2.2%) | 2/246 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Bittacus sinensis ホシガガンボモドキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/19 (0.0%) | 0/27 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Nymphomyia alba カスミハネカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Nymphomyia rohdendorfi キョクトウハネカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Protoplasa alexanderi アルプスニセヒメガガンボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Protoplasa esakii エサキニセヒメガガンボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pachyneura fasciata モイワエゾカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/2 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Axymyia japonica ヤマトクチキカ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/6 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Haruka elegans ハマダラハルカ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Coenomyia basalis ネグロクサアブ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 1/70 (1.4%) | — |
| DD 情報不足 | Odontosabula decora キンシマクサアブ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Odontosabula fulvipilosa ヒメシマクサアブ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Odontosabula gloriosa シマクサアブ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Glutops itoi イトウタマユラアブ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/14 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Lucilia chini カエルキンバエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 37 | 3/218 (1.4%) | 17/779 (2.2%) | — |
| DD 情報不足 | Neopithecops zalmora zalmora ヒメウラボシシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 104 | 0/1 (0.0%) | 54/2717 (2.0%) | — |
| DD 情報不足 | Catocala naganoi mahoroba マホロバキシタバ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 135 | 4/268 (1.5%) | 66/8600 (0.8%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Mnais pruinosa 房総半島のシロバネカワトンボ（f. edai）を含むアサヒナカワトンボ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/13 (0.0%) | 4/182 (2.2%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Nipponosemia terminalis 宮古島のツマグロゼミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/1240 (0.2%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Ogasawarana chichijimana チチジマヤマキサゴ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Ogasawarana habei ソロバンダマヤマキサゴ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Ogasawarana rex アカビシヤマキサゴ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Assiminea sp. D リュウキュウカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea diplomphalus latispira ヒラクボエンザガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea eutheca コシタカエンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea goniobasis ソコカドエンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea hypolia ツヤエンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea major オオエンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea nesiotica liobasis ハタイエンザガイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea planulata biconcava ナカクボエンザガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea planulata planulata ヒラマキエンザガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea profundispira コダマエンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasea sinuosa エンザガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hirasiella clara エンザガイモドキ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Lamprocystis hahajimana pachychilus アツクチハハジマヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/14 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Trochochlamys ogasawarana オガサワラキビ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Vitrinula chichijimana チチジマレンズガイ | EX | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EX 絶滅 | Vitrinula hahajimana ハハジマレンズガイ | EX | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ogasawarana obtusa ミガキヤマキサゴ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chamalycaeus okinawaensis オキナワムシオイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chamalycaeus sp. イリオモテムシオイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nobuea sp. ゴトウノブエガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pirenella cancellata ヌノメヘナタリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angustassiminea sp. A ヘドクリイロカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angustassiminea sp. B ティンダハナタクリイロカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angustassiminea sp. C ウフアガリクリイロカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cavernacmella sp. A ナラオゴマオカチグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cavernacmella sp. B コシキゴマオカチグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cavernacmella sp. C ウフアガリゴマオカチグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Paludinellassiminea daitoensis ダイトウオカチグサ (ダイトウヘソカド) | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Paludinellassiminea miyakoinsularis ミヤコオカチグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Paludinellassiminea sp. A タマグスクオカチグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Paludinellassiminea sp. B ドナンオカチグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Parafossarulus manchouricus japonicus マメタニシ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/38 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gammatricula shini ヨナグニカタヤマガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/5 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Truncatella oagariensis オカクビキレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Truncatella sp. B アソブイトクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Truncatella sp. C カガヨイクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Truncatella sp. D キザハシクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Truncatella sp. E ロウタキクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Marginellidae gen. &. sp. オカトリノコガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/59 (0.0%) | 0/59 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mathilda sinensis タクミニナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Camptoceras hirasei カワネジガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/1 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ferrissia nipponica カワコザラ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/221 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Succinea sp. ダイトウオカモノアラガイ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/93 (0.0%) | 0/185 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Luchuena sp. クメジマキセルモドキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Megalophaedusa fukudainadai ナルトギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stereophaedusa sp. (Sm) ナタマメギセル（小型） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stereophaedusa striatella ミヤコオキナワギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Zaptyx daitojimana ダイトウノミギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cipangocharax ananensis アナンムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nesiohelix omphalina bipyramidalis オオアガリマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nesiohelix omphalina omphalina ヘソアキアツマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sinohyriopsis schlegelii イケチョウガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/4 (25.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Apolymetis meyeri チリメンジュロウジン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyclina sp. ダテオキシジミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 21 | 1/1 (100.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Borniopsis sp． ヨコヅナケボリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Awalycaeus yanoshokoae サルダアツブタムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platyrhaphe hirasei hirasei ヒラセアツブタガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Diplommatina nishii ハンミガキゴマガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cantharus cecillei オガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 2/356 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gyrineum natator ウネボラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/8 (0.0%) | 1/54 (1.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gyraulus sp. ヒメヒラマキミズマイマイ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/212 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Luchuena luchuana リュウキュウキセルモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Luchuena reticulata キカイキセルモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stereophaedusa azumai アズマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stereophaedusa caudata トクネニヤダマシギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stereophaedusa sp. (NL) ナタマメギセル（北部大型） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stereophaedusa sp. (SL) ナタマメギセル（南部大型） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Bekkochlamys sp. オキナワテラマチベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Euconulidae gen. & sp. ヨナグニシロベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/43 (0.0%) | 0/43 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Meghimatium sp. ダンジョナメクジ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/17 (5.9%) | 1/38 (2.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chosenelix sp. ツシマウスカワマイマイモドキ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/2 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Moellendorffia tokunoensis トクノシマケハダシワクチマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nipponochloritis obscura トクノシマビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Satsuma akiratadai アキラマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Satsuma caliginosa picta ヨナクニマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Satsuma largillierti シラユキヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Satsuma sp. A サンエンマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Mesocibota bistrigata ヒメエガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Margaritifera laevis カワシンジュガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/8 (12.5%) | 1/19 (5.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Margaritifera togakushiensis コガタカワシンジュガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/8 (12.5%) | 1/19 (5.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cristaria plicata カラスガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/7 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lanceolaria kihirai キュウシュウササノハガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/9 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sinanodonta tumens オグラヌマガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/45 (2.2%) | 8/887 (0.9%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Lunella ogasawarana オガサワラスガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/23 (0.0%) | 1/155 (0.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana arata マキスジヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana capsula ハハジマヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana comes ナカノシマヤマキサゴ | DD | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana discrepans アニジマヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana hirasei ヒラセヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana metamorpha ハゲヨシワラヤマキサゴ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana nitida スベスベヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana optima カドオガサワラヤマキサゴ | DD | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ogasawarana yoshiwarana ヨシワラヤマキサゴ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Awalycaeus akiratadai タダアツブタムシオイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus itonis itonis イトウムシオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus kurodatokubeii クロダアツクチムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus miyazakii ミヤザキムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus nakashimai ditacaeus ヒョットコイトウムシオイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus nakashimai nakashimai クビレイトウムシオイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus nishii タカチホムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus purus ヒメムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus shiibaensis シイバムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus takahashii オナガラムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus tokunoshimanus principialis オオムシオイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus tokunoshimanus tokunoshimanus トクノシマムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Chamalycaeus yanoshigehumii ヤノムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cipangocharax biexcisus クチキレムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cipangocharax placeonovitas クビナガムシオイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cyathopoma nishinoi イトマキミジンヤマタニシ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nobuea kurodai ニッポンノブエガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Diplommatina pudica ベニゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cerithium torresi ホソコオロギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/43 (0.0%) | 0/95 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Semisulcospira nakasekoae ナカセコカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cerithidea tonkiniana シマヘナタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cerithideopsis largillierti クロヘナタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenomelania boninensis オガサワラカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenomelania costellaris アマミカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenomelania sp. A ムチカワニナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenomelania juncea ヨシカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenomelania uniformis スグカワニナ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tarebia sp. カリントウカワニナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Laguncula pulchella サキグロタマツメタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/1 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Paratectonatica tigrina ゴマフダマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/1 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Akiyoshia nanatsugamaensis ナナツガマミジンツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Moria kubotai ナナツガマホラアナミジンニナ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/181 (0.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Allepithema nagayamai ナガヤマヤマツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Assimineidae gen. B kyushuensis オオクリイロカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/69 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cavernacmella kuzuuensis ホラアナゴマオカチグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Conacmella vagans キバオカチグサ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ditropisena sp. D ドームカドカド | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Coliracemata katurana カトゥラプシキシタダミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ceratia nagashima ナガシマツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pseudonoba yendoi イリエツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Fukuia integra ヤママメタニシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Fukuia multistriata フクイシブキツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Oncomelania nosophora ミヤイリガイ（カタヤマガイ） | VU | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/2 (50.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stenothyra thermaecola オンセンゴマツボ（オンセンミズゴマツボ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Macromphalus tornatilis ハツカネズミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mitrella martensi マルテンスマツムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/36 (0.0%) | 0/188 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reticunassa hiradoensis ウネムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/29 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reticunassa sp. A アツミムシロ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/29 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reticunassa sp. B シンサクムシロ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/29 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nassarius variciferus ウネハナムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nassarius succinctus ヒロオビヨフバイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cincinna kizakikoensis キザキコミズシタダミ | CR | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tomura himeshima ヒメシマイシン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tomura yashima ヤシマイシン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Amathina tricarinata イソチドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Leucotina dianae マキモノガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pyramidellidae gen. A. & sp. B オキナワヌカルミクチキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/74 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Radix hamadai ハマダモノアラガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 6 | 1/251 (0.4%) | 4/420 (1.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Culmenella prashadi ヒダリマキモノアラガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/2 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Smeagolidae gen. & sp. A キタギシマゴクリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Smeagolidae gen. & sp. B ヒエンハマゴクリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Smeagolidae gen. & sp. C タナゴジマゴクリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cassidula nigrobrunnea ヒメシイノミミミガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cassidula plecotrematoides japonica シイノミミミガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cassidula schmackeriana ヘゴノメミミガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cylindrotis quadrasi ナズミガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ellobium pallidum コハクオカミミガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/9 (11.1%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Laemodonta bella カドバリコミミガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Melampus cristatus アツクチハマシイノミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pythia cecillei オキヒラシイノミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Platevindex sp. C ヤベガワモチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/19 (0.0%) | 5/135 (3.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Platevindex sp. A センベイアワモチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/19 (0.0%) | 5/135 (3.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninosuccinea ogasawarae オガサワラオカモノアラガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninosuccinea punctulispira テンスジオカモノアラガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pupilla cryptodon サナギガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/21 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Gastrocopta chichijimana チチジマスナガイ | EX | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hypselostoma insularum ラッパガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Vertigo hachijoensis ハチジョウキバサナギガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Vertigo hirasei キバサナギガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninena callistoderma ハハジマキセルモドキ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninena hiraseana chichijimana チチジマキセルモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninena hiraseana hiraseana ヒラセキセルモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Boninena ogasawarae オガサワラキセルモドキ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Luchuena eucharistus ニシキキセルモドキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Luchuena hachijoensis ハチジョウキセルモドキ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mirus gracilispira ヤセキセルモドキ | — | — | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa aenea シンチュウギセル（エイネギセル） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa albela ケショウギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa aratorum タビトギセル（アラトラギセル） | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa ikenoi ホウライジギセル | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa ishikawai イシカワギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa masatokandai masatokandai オオイタシロギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa masatokandai shiroi ヒメシロギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa spelaeonis カザアナギセル | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Megalophaedusa toshiyukii ナンピギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia ashizuriensis トカラコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia echo コダマコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia elegans ニシキコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia euholostoma ハナコギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia holotrema マルクチコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia hungerfordiana カスガコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia masaoi アズママルクチコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia monelasmus エゾコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia nakadai ナカダコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Reinia variegata ヒロクチコギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa affinis シコクタケノコギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa costifera タイシャクギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa elongata タケノコギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa hemileuca hemileuca ハンジロギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa hemileuca takii タキギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa higomonticola ヒゴコンボウギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa hiraseana トクサギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa ijimae イイジマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa inclyta リュウキュウギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Stereophaedusa neniopsis ネニヤダマシギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tosaphaedusa akiratadai シロハダギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zaptyx dolichoptyx カズマキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zaptyx hyperaptyx トクノシマツムガタノミギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zaptyx inversiluna サカヅキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zaptyx longiplicata イトヒキツムガタノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zaptyx purissima ゾウゲツヤノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Sinoennea yonakunijimana ヨナクニダワラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Plectopylis hirasei イトカケマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Zonitoides apertus ヒラコハクガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea acuta acuta ヒメカドエンザガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea acuta acutissima カドエンザガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea chichijimana チチジマエンザガイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea diplomphalus diplomphalus マルクボエンザガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea insignis クチヒダエンザガイ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea nesiotica nesiotica ナカタエンザガイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hirasea operculina ヘタナリエンザガイ | EN | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nipponochlamys kumensis クメジマベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nipponochlamys lineolata マキスジベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nipponochlamys takahashii タカハシベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Parakaliella austeniana オオステンキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Parakaliella kikaigashimae キカイキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Sitalina sp. オオカサネシタラ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Vitrinula chaunax オガサワラレンズガイ（オガサワラベッコウ） | EX | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista inexpectata オモイガケナマイマイ | DD | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista intonsa モリサキオオベソマイマイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista kandai カンダマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/2 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista lepidophora lepidophora ウロコケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista marginata ヘリトリケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista nitens ミドリマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista optima ケショウマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista stenomphala イソムラマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista tadai イトヒキオオベソマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aegista turrita トウガタホソマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Euhadra murayamai ムラヤママイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Euhadra nachicola ナチマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Euhadra sadoensis サドマイマイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Euhadra scaevola mikawa ミカワマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina anijimana アニジマカタマイマイ | DD | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina aureola コガネカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina chichijimana チチジマカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina exoptata ヒシカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina hahajimana ヒメカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina hayatoi フタオビカタマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina hirasei アナカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.31 Gbp 80 | 2,603,910 575 bp | 1 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | 2024-07-03 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina kaguya オトメカタマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina mandarina カタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina polita アケボノカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina ponderosa ヌノメカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina suenoae キノボリカタマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.35 Gbp 80 | 2,795,304 535 bp | 1 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | 2024-07-03 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina tomiyamai コハクアナカタマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.36 Gbp 60 | 2,617,546 616 bp | 1 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | 2024-07-03 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mandarina trifasciata ミスジカタマイマイ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 3/15 (20.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nipponochloritis okiensis オキビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma amanoi アマノヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma hemihelva ウラキヤマタカマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma iheyaensis イヘヤヤマタカマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma jacobii ヤコビマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma kanamarui カナマルマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma kumejimaensis クメジママイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma lepidophora ウロコマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma moellendorffiana moellendorffiana メルレンドルフマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma nakayamai ナカヤママイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma sadamii サダミマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma sakishimana サキシマヒシマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma shigetai アマミヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma sororcula ウラジロヤマタカマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Satsuma wiegmanniana ヒラコベソマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Modiolatus hanleyi ハンレイヒバリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/1 (0.0%) | 21/1505 (1.4%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Anadara troscheli ヒメアカガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/30 (6.7%) | 4/141 (2.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Estellacar galactodes ササゲミミエガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Trisidos kiyonoi ビョウブガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/3 (0.0%) | 4/141 (2.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ostrea denselamellosa イタボガキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 636 Mbp 210.77 | 154 14.0 Mbp | 1 | 8 | 32 | 3/64 (4.7%) | 16/336 (4.8%) | 2022-08-15 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Decatopecten sp. リュウキュウキンチャク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/3 (0.0%) | 7/159 (4.4%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Volachlamys hirasei ヤミノニシキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/2 (0.0%) | 7/159 (4.4%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pegophysema bialata イセシラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/2 (0.0%) | 11/189 (5.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Lunulicardia hemicardium ハートガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 27 | 0/4 (0.0%) | 14/212 (6.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hiatula boeddinghausi フジナミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/6 (0.0%) | 3/34 (8.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Leptomya adunca ナノハナガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Semele cordiformis フルイガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/14 (0.0%) | 2/31 (6.5%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Azorinus scheepmakeri オオズングリアゲマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 1/3 (33.3%) | 2/15 (13.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Strigilla tomlini オガタザクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Salmacoma nobilis モモイロサギガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Limecola petalum タカホコシラトリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Serratina diaphana イチョウシラトリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tellinella virgata ニッコウガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mactra sp. A ナガタママキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/19 (10.5%) | 7/49 (14.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Mactra sp. B オトメタママキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/19 (10.5%) | 7/49 (14.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Meropesta sinojaponica チリメンユキガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/1 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Raeta pellicula ヤチヨノハナガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/2 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aphrodora kurodai ウスハマグリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Circe scripta タイワンシラオガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/8 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Dosinia biscocta アツカガミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/24 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Dosinia corrugata ウラカガミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/24 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Meretrix sp. トゥドゥマリハマグリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 21 | 4/25 (16.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Pitar limatulus マダライオウハマグリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Arthritica japonica ガンヅキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Borniopsis ariakensis アリアケケボリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Devonia semperi ヒナノズキン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Fronsella ohshimai ハナビラガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Galeommella utinomii オウギウロコガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Nipponomysella tanabensis タナベヤドリガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Peregrinamor gastrochaenans シマノハテマゴコロガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Platomysia rugata オキナノエガオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Sagamiscintilla thalassemicola ミドリユムシヤドリガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/17 (5.9%) | 1/56 (1.8%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Basterotia gouldi イソカゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/8 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Aspidopholas yoshimurai イシゴロモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/36 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Potamocorbula amurensis ヌマコダキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/73 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Laternula impura コオキナガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/18 (5.6%) | 1/18 (5.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Sinonovacula constricta アゲマキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/11 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 1.22 Gbp 561 | 2,450 977 kbp | 2 | 2 | 4 | 1/2 (50.0%) | 2/15 (13.3%) | 2019-08-08 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Solen soleneae ジャングサマテ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Rimula cumingii セムシマドアキガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/32 (0.0%) | 1/207 (0.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sukashitrochus carinatus スカシエビス | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ogasawarana microtheca コガラヨシワラヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ogasawarana ogasawarana オガサワラヤマキサゴ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neritilia mimotoi ツバサコハクカノコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Georissa shikokuensis ベニゴマオカタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/64 (1.6%) | 1/65 (1.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neritodryas cornea オカイシマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/1 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Septaria cumingiana カミングフネアマガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Smaragdia sp. ウミヒメカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phenacolepas crenulata ユキスズメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/50 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Awalycaeus abei アツブタムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus itonis shiotai ヤサガタイトウムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus laevis ベニムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus oshimanus オオシマムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus sadoensis サドムシオイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus satsumanus laevicervix ヌメクビムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chamalycaeus tsushimanus ツシマムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cipangocharax akioi コウツムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cipangocharax kiuchii トウゲンムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cipangocharax okamurai オカムラムシオイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cyclophorus turgidus angulatus リュウキュウヤマタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia inouei イノウエヤマトガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia katorii トウカイヤマトガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia shigetai モジャモジャヤマトガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia sp. ヨナグニヤマトガイ | — | — | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia tokunoshimana okinoerabuensis オキノエラブヤマトガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japonia tokunoshimana tokunoshimana トクノシマヤマトガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Arinia japonica シリブトゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina kumejimana クメジマゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina luchuana リュウキュウゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina lyrata lyrata クニガミゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina lyrata tokunoshimana トクノシマゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina oshimae オオシマゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina septentrionalis エゾゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina turris chineni イトカケゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina ultima ツシマゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Diplommatina yonakunijimana ヨナグニゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pupinella oshimae tokunoshimana トクノシマアズキガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/15 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cipangopaludina chinensis laeta マルタニシ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 3 | 1/16 (6.2%) | 2/267 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Batillaria zonalis イボウミニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/8 (12.5%) | 1/8 (12.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cerithium coralium コゲツノブエ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/43 (0.0%) | 0/95 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Semisulcospira fuscata クロカワニナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pirenella asiatica ヤエヤマヘナタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pirenella pupiformis カワアイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Terebralia sulcata マドモチウミニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Finella pupoides サナギモツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/3 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stenomelania sp. B タケノコカワニナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/19 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Naticarius concinnus フロガイダマシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/8 (25.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Naticarius onca アラゴマフダマ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/8 (25.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Polinices mellosus ロウイロトミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/14 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Akiyoshia kobayashii コバヤシミジンツボ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Akiyoshia uenoi アキヨシミジンツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Moria nipponica ホラアナミジンニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/181 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assiminea sp. E ムツカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assiminea sp. F マンゴクウラカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assiminea sp. G マツシマカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assiminea sp. H マツカワウラカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assiminea sp. I オオシンデンカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assimineidae gen. C & sp. コーヒーイロカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/69 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Assimineidae gen. D & sp. カハタレカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/69 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cavernacmella minima キビオカチグサ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cavernacmella yamamotonis ヤマモトゴマオカチグサ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ditropisena sp. A ミニカドカド | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ditropisena sp. B エレガントカドカド | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ditropisena sp. C デリケートカドカド | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ovassiminea sp. ウラウチコダマカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudomphala miyazakii アズキカワザンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bithynia inabai イナバマメタニシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/38 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gabbia kiusiuensis ヒメマルマメタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/38 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Clenchiella iriomotensis ヤイマカチドキシタダミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/9 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hyala delicata ゴマツボモドキ（シリオレミジンニナ） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Liroceratia sulcata ミジンゴマツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pellamora sp. ウチノミツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Wakauraia sakaguchii ワカウラツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Blanfordia bensoni オカマメタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Oncomelania minima ナタネミズツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/2 (50.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pomatiopsidae gen. ooyagii シモキタシブキツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/112 (0.9%) | 1/112 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Rissoina costulata スジウネリチョウジガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/8 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stosicia annulata ゴマツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/8 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stenothyra japonica ミズゴマツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stenothyra recondita エゾミズゴマツボ（カラフトミズゴマツボ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Circulus duplicatus アラウズマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pseudoliotia asteriscus ヒメシラギク（シラギクマガイ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sigaretornus sp. A イソマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sigaretornus sp. B ガタチンナン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Teinostoma lucidum ウミコハクガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Truncatella sp. A アマミクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Truncatella sp. F カイグンボウクビキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acrilla acuminata ウネナシイトカケ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/58 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hypermastus lacteus ヒモイカリナマコツマミガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mucronalia exilis ヤセフタオビツマミガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/77 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Engina menkeana ナガゴマフホラダマシ（ゴマフホラダマシ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/11 (0.0%) | 2/356 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Reticunassa praematurata オマセムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nassarius arcularia オリイレヨフバイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Babylonia kirana ウスイロバイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 1/13 (7.7%) | 2/356 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Vexillum balteolatum ミノムシガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/140 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Vexillum rufomaculatum チビツクシ（ムラクモツクシ） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/140 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ceratostoma rorifluum ハネナシヨウラク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/4 (0.0%) | 8/970 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Conus boeticus ツヤイモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 6/416 (1.4%) | 6/589 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Conus fulmen ベッコウイモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 6/416 (1.4%) | 6/589 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Duplicaria evoluta イワカワトクサ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/338 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Trigonostoma scalariformis オリイレボラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/60 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cypraea luchuana リュウキュウダカラ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/246 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ebala sp. イリエゴウナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/2 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cincinna japonica ニホンミズシタダミ | DD | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melanochlamys ezoensis エゾキセワタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melanochlamys fukudai ヤミヨキセワタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Acteocina decoratoides コメツブツララ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/24 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cylichnatys yamakawai カミスジカイコガイダマシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lactiforis takii ウミマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Brachystomia umboniocola イボキサゴナカセクチキレモドキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Syrnola tenuisculpta ヌノメホソクチキレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Radix onychia オウミガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 6 | 1/251 (0.4%) | 4/420 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gyraulus soritai ミズコハクガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/17 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Helicorbis cantori クルマヒラマキガイ（レンズヒラマキガイ） | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/3 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aiteng mysticus ヒミツナメクジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/6 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Auriculastra duplicata ナラビオカミミガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Blauneria leonardi サカマキオカミミガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ellobium chinense オカミミガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 949 Mbp 125 | 83,461 21.3 kbp | 1 | 1 | 1 | 1/9 (11.1%) | 1/153 (0.7%) | 2023-11-20 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laemodonta siamensis クリイロコミミガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Laemodonta sp. B コベソコミミガイ（マルコミミガイ） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melampus nucleolus ウルシヌリハマシイノミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melampus ovuloides デンジハマシイノミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melampus sculptus ニワタズミハマシイノミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melampus sincaporensis キヌカツギハマシイノミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Melampus sp. オウトウハマシイノミ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Onchidium sp. ドロアワモチ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/13 (0.0%) | 5/135 (3.7%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Paraonchidium fungiforme キボシアワモチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Paraonchidium keiense ヒメキボシアワモチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neosuccinea kofui コウフオカモノアラガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/185 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Elasmias kitaiwojimanum イオウジマノミガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lamellidea biplicata トウガタノミガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lamellidea ogasawarana オガサワラノミガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tornatellides boeningi ノミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Enteroplax yaeyamaensis ヤエヤマクチミゾガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Eostrobilops nipponica nipponica マツシマクチミゾガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bensonella plicidens クチマガリスナガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ptychalaea dedecora エリマキガイ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Vertigo ovata ovata ナタネキバサナギガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Vertigo japonica ヤマトキバサナギガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luchuena fulva ウスチャイロキセルモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luchuena minatoi ダンジョキセルモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luchuena nesiotica チャイロキセルモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa dalli デールギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa decussata ハブタエギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa gracilispira ホソヒメギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa ignobilis アベギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa iijimakuniakii ツバクロイワギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa iyoensis イヨギセル | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa kanjiookuboi オクシリギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa kawamotoi カワモトギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa kubinaga クビナガギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa kurozuensis クロズギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa kyotoensis キョウトギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa mitsukurii ミツクリギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa miyazakii ミヤザキギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa nankaidoensis yanoi ショウドシマギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa pachyspira シリブトギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa pilsbryi カギヒダギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa puellaris ウブギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Megalophaedusa yagurai ヤグラギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Solitariphaedusa miyoshii ミヨシギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa callistochila キンチャクギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa caloptyx caloptyx イトカケノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa caloptyx subtilis ヤクスギイトカケノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa kamoharai カモハラギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa mima mima ザレギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa mima tokunoshimana トクノシマギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa nishinoshimana ニシノシマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa oshimae degenerata クサレギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa tabukii タブキギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa tryoni トライオンギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Stereophaedusa ultima ヒメナミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tauphaedusa senkakuensis センカクコギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/5 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tosaphaedusa cincticollis ナカムラギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/5 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx cladoptyx エダヒダノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx entospira ウチマキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx exodonta ソトバウチマキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx exulans ホソウチマキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx hedleyi チビノミギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx munus ツムガタノミギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx noviluna ミカヅキノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx oxypomatia カドシタノミギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Zaptyx takarai タカラノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sinoennea densecostata コメツブダワラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sinoennea miyakojimana ミヤコダワラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bekkochlamys masakii マサキベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Bekkochlamys subrejecta ツシマベッコウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Helicarionidae gen. & sp. ベッコウマイマイ科の１種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/170 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Japanochlamys crenata コンゴウクリイロベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lamprocystis hahajimana hahajimana ハハジマヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/14 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Luchuconulus edgariana スミスヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochlamys sp. ヨナグニベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochlamys subelimata トクノシマベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Otesiopsis japonica レンズガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Otesiopsis kanmuriyamensis カンムリレンズガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Takemasaia eikoae エイコベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Deroceras sp. クロツノナメクジ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 2/259 (0.8%) | 2/263 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista calcicola イシマキシロマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista cavitectum タシママイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista eumenes pergranosa アラハダシロマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista fausta サチマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista friedeliana vestita オオシマフリイデルマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista hachijoensis ツバキカドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista kiusiuensis tokunovaga トクノシマケマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista lepidophora scutifera カドマルウロコケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista mayasana マヤサンマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista minima マメヒロベソマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista nunobikiensis ヌノビキケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista omiensis オウミケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista proba goniosomoides ミヤマオオベソマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista scepasma イトマンケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista squarrosa squarrosa マルテンスオオベソマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista squarrosa tokunoshimana トクノシマオオベソマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista takarai タカラホソマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra awaensis occidentalis イワミマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra grata echigoensis エチゴマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra grata emurai エムラマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra grata grata オオタキマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra grata tobisimae トビシママイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra latispira latispira ハクサンマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra scaevola scaevola ミヤマヒダリマキマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Euhadra yakushimana ヤクシママイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lepidopisum conospira カタマメマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nesiohelix irrediviva エラブマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nesiohelix solida アツマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/7 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Paraegista apoiensis アポイマイマイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Paraegista takahidei タカヒデマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/12 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aegista hiroshifukudai チョウシュウシロマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Moellendorffia eucharistus ケハダシワクチマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neochloritis tomiyamai ハジメテビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis bracteata tsukubaensis ツクバビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis fragosa オオウスビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis hirasei ヒラマキビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis perpunctata ヒメビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis silvatica カワリダネビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis takedai ミニビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nipponochloritis tosana トサビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma adelinae クマドリヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma atrata ヤンバルマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma cardiostoma ココロマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma eucosmia erabuana オキノエラブヤマタカマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma eucosmia eucosmia オキナワヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma fausta ヤセアナナシマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma mercatoria euterpe クンチャンマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma moellendorffiana thaanumi ミノブマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma omoro オモロヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma oshimae daemonorum キカイオオシママイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma perversa リュウキュウヒダリマキマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma rugosa チリメンマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma selasia ツヤマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma sp. シズオカマイマイ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma sp. B トナキマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma textilis オオツヤマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma tokunoshimana トクノシマヤマタカマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Satsuma tsurugisanica ツルギサンマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Yakuchloritis albolabris クチジロビロウドマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Yakuchloritis hoshiyamai ホシヤマビロウドマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Solemya japonica アサヒキヌタレガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/19 (5.3%) | 1/57 (1.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Jolya arata ヌバタママクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/1 (0.0%) | 21/1505 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anadara crebricostata メオトサルボオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/30 (6.7%) | 4/141 (2.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anadara globosa クマサルボオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/30 (6.7%) | 4/141 (2.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tegillarca granosa ハイガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 915 Mbp 10 | 3,631 463 kbp | 2 | 2 | 5 | 1/3 (33.3%) | 4/141 (2.8%) | 2020-06-29 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tucetona auriflua ウチワガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/22 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anomiostrea coralliophila サンゴガキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 32 | 0/1 (0.0%) | 16/336 (4.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Magallana ariakensis スミノエガキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/— | Yes (3) | Chromosome, Reference | 663 Mbp 108 | 522 5.93 Mbp | 3 | 17 | 32 | 6/13 (46.2%) | 16/336 (4.8%) | 2021-10-15 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Magallana bilineata ミナミマガキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Contig, Reference | 551 Mbp 55 | 93 13.4 Mbp | 1 | 17 | 32 | 6/13 (46.2%) | 16/336 (4.8%) | 2025-08-11 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pinna atropurpurea スエヒロガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/13 (7.7%) | 3/72 (4.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cristaria clessini メンカラスガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/7 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Inversidens brandtii オバエボシガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Inversiunio reinianus オトコタテボシガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/6 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Inversiunio yanagawensis ニセマツカサガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/6 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lanceolaria oxyrhyncha ササノハガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/9 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Obovalis omiensis カタハガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/1 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Sinanodonta calipygos マルドブガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 8 | 1/45 (2.2%) | 8/887 (0.9%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cadakia punctata クチベニツキガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Codakia paytenorum ウラキツキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/6 (0.0%) | 11/189 (5.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Fimbria soverbii カゴガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Fragum carinatum ヒシガイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 27 | 3/12 (25.0%) | 14/212 (6.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Vasticardium rubicundum compunctum イレズミザルガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 27 | 0/14 (0.0%) | 14/212 (6.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Gari lessoni ウスムラサキアシガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Psammotaea inflata ミナトマスオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/34 (8.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Hiatula adamsii ムラサキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/6 (0.0%) | 3/34 (8.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Montrouzieria clathrata コバコガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cadella crebrimaculata ホシヤマナミノコザラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cadella sp. リュウキュウクサビザラ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cyclotellina remies モチヅキザラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macalia bruguieri アマサギガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Scissulina dispar チガイザクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Serratina perplexa ヒワズウネイチョウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Iridona iridescens テリザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dallitellina rostrata トンガリベニガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Quadrans gargadia オオトゲウネガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tellinides timorensis ヘラサギガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Corbicula leana マシジミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/489 (0.6%) | 3/511 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Corbicula sandai セタシジミ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/489 (0.6%) | 3/511 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geloina expansa リュウキュウヒルギシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/12 (0.0%) | 3/511 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geloina fissidens タイワンヒルギシジミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/12 (0.0%) | 3/511 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geloina yaeyamensis ヤエヤマヒルギシジミ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/12 (0.0%) | 3/511 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Glauconome angulata ハナグモリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/8 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Anatinella nicobarica チトセノハナガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Coelomactra antiquata アリソガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 807 Mbp 50 | 220 17.4 Mbp | 2 | 3 | 12 | 2/19 (10.5%) | 7/49 (14.3%) | 2025-01-28 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mactra grandis リュウキュウアリソガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/19 (10.5%) | 7/49 (14.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mactra pulchella トウカイタママキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/19 (10.5%) | 7/49 (14.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Mactrotoma depressa ヒナミルクイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/1 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tresus keenae ミルクイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/3 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dosinia aspera ツキカガミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/24 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Dosinia troscheli ヤタノカガミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/24 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Meretrix lusoria ハマグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/13 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 4 | 21 | 4/25 (16.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pitar citrinus ユウカゲハマグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Pitar sulfureus イオウハマグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tapes literatus リュウキュウアサリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/7 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Barrimysia cumingii アケボノガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Barrimysia siphonosomae ホシムシアケボノガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Borniopsis tsurumaru ツルマルケボリガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Byssobornia adamsi セワケガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Divariscintilla toyohiwakensis ニッポンヨーヨーシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/8 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ephippodonta gigas オオツヤウロコガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tellimya fujitaniana フジタニコハクノツユ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Salpocola philippinensis フィリピンハナビラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Barnea japonica ウミタケ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/36 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cryptomya busoensis ヒメマスオ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Distugonia decurtata オフクマスオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Exolaternula sp. オヤイヅオキナガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Agriodesma navicula オビクイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/10 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Thracia concinna シナヤカスエモノガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/8 (12.5%) | 1/9 (11.1%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Solen kikuchii チゴマテ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Solen sp. ホソバラフマテ | — | ✓ | — | — | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Patelloida conulus ツボミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/34 (0.0%) | 8/186 (4.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macroschisma cuspidatum ヤジリスカシガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/207 (0.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Umbonium moniliferum イボキサゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/5 (0.0%) | 4/268 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Umbonium suturale タイワンキサゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/5 (0.0%) | 4/268 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritilia rubida コハクカノコ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritilia vulgaris ツブコハクカノコ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Georissa hukudai フクダゴマオカタニシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/64 (1.6%) | 1/65 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Georissa japonica ゴマオカタニシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/64 (1.6%) | 1/65 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Georissa luchuana リュウキュウゴマオカタニシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/64 (1.6%) | 1/65 (1.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clithon pauluccianus レモンカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/14 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clithon sp. ヒメカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/14 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clithon squarrosus ウロコイシマキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/14 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neripteron auriculata コウモリカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neripteron sp. A ヒロクチカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neripteron sp. B フリソデカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neripteron spiralis キジビキカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neripteron subauriculata ツバサカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nerita planospira ヒラマキアマオブネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/61 (1.6%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina asperulata アラハダカノコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina petiti アカグチカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina siquijorensis ニセヒロクチカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina sp. A クロズミアカグチカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina sp. B ウスベニツバサカノコ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/29 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neritina turrita シマカノコ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Septaria lineata ベッコウフネアマガイ | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/5 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Smaragdia rangiana クサイロカノコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Smaragdia souverbiana キンランカノコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 2/198 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phenacolepas pulchella ミヤコドリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/50 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phenacolepas sp. ヒナユキスズメ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/50 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Phenacolepas tenuisculpta タオヤメユキスズメ（ヌノメミヤコドリ） | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/50 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chamalycaeus expanstoma クチビラキムシオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chamalycaeus satsumanus satsumanus サツマムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chamalycaeus satsumanus tanegashimae タネガシマムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chamalycaeus tadai タダムシオイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chamalycaeus vinctus クビマキムシオイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclophorus hirasei オオヤマタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclophorus turgidus miyakoensis ミヤコヤマタニシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclophorus turgidus radians ヤエヤマヤマタニシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclotus campanulatus tanegashimanus タネガシマアツブタガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cyclotus taivanus peraffinis ヤエヤマアツブタガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonia gouldi ケハダヤマトガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonia hispida ケブカヤマトガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonia sadoensis サドヤマトガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonia striatula イトマキヤマトガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/9 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leptopoma nitidum アオミオカタニシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platyrhaphe hirasei nudus ハダカアツブタガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platyrhaphe hirasei yaeyamaensis ヤエヤマヒラセアツブタガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platyrhaphe hirasei yonakunijimanus ヨナクニアツブタガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina ampla オオコベルトゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina circumstomata マルクチゴマガイ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina danzyonarum ダンジョゴマガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina gotoensis ゴトウゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina immersidens ミヤコゴマガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina nesiotica ニヨリゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina saginata ハラブトゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina turris turris トウガタゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina ujiinsularis ウジグントウゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Diplommatina yakushimae ヤクシマゴマガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/160 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Heterogen japonica オオタニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 2/267 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Heterogen longispira ナガタニシ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 2/267 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Batillaria multiformis ウミニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/8 (12.5%) | 1/8 (12.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clypeomorus bifasciata カヤノミカニモリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/95 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira arenicola ホソマキカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira decipiens タテヒダカワニナ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira morii モリカワニナ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira multigranosa イボカワニナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira niponica ヤマトカワニナ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira reticulata カゴメカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira shiraishiensis シライシカワニナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira takeshimensis タケシマカワニナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semisulcospira kurodai クロダカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cerithidea moerchii フトヘナタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pirenella nipponica ヘナタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Terebralia palustris キバウミニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Melanoides tuberculatus ヌノメカワニナ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 971 Mbp 80 | 974,018 1.06 kbp | 1 | 1 | 1 | 1/30 (3.3%) | 1/120 (0.8%) | 2023-06-01 |
| NT 準絶滅危惧 | Sermyla riqueti ネジヒダカワニナ | LC | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tarebia granifera イボアヤカワニナ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thiara scabra pagoda トゲカワニナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/120 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lacuna carinifera モロハタマキビ（セトウチヘソカドタマキビ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/6 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Littoraria conica イロタマキビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/37 (0.0%) | 4/213 (1.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cryptonatica adamsiana アダムスタマガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eunaticina papilla ネコガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/1 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mammilla melanostmoides ヒロクチリスガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/8 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Natica buriasensis カスミコダマ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/5 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Notocochlis robillardi テンセイタマガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/4 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gennaeosinum bathyraphe オリイレシラタマ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sinum incisum ツガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sinum planulatum ツツミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 3/81 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Angustassiminea castanea クリイロカワザンショウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea estuarina ツブカワザンショウ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea parasitologica ムシヤドリカワザンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea sp. A テシオカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea sp. B イヨカワザンショウ（ヤミカワザンショウ） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea sp. C アッケシカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assiminea sp. J ヒナタムシヤドリカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assimineidae gen. A yoshidayukioi ヨシダカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/69 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Assimineidae gen. A & sp. オイランカワザンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/69 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rugapedia sp. アシヒダツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bithynia moltschanovi エゾマメタニシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/38 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Falsicingula kurilensis ナタネツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/2 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chevallieria sp. ジーコンボツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fluviocingula elegantula カワグチツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Iravadia quadrasi マンガルツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nozeba ziczac サザナミツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pellamora reflecta ニセゴマツボ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Blanfordia japonica イツマデガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Blanfordia simplex ヒメオカマメタニシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cecina manchurica クビキレガイモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fukuia kurodai ニクイロシブキツボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/112 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rissoina pura ヌノメチョウジガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Voorwindia sp. タニシツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/126 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stenothyra basiangulata オキナワミズゴマツボ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stenothyra edogawensis エドガワミズゴマツボ（ウミゴマツボ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudoliotia pulchella シラギク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Vitrinella sp. ナギツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Strombus gibbosus ネジマガキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Strombus labiatus ヒダトリガイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Strombus robustus フドロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Strombus urceus urceus オハグロガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/94 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Velutina pusio ハナヅトガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/169 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Depressiscala aurita オダマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Papyriscala clementia クレハガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Papyriscala lyra ハブタエセキモリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Papyriscala yokoyamai セキモリ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hypermastus peronellicola カシパンヤドリニナ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hypermastus tokunagai トクナガヤドリニナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hemifusus tuba テングニシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/21 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius corticatus カタムシロ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius horridus イガムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius stoliczkanus ヒメオリイレムシロ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius livescens ムシロガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius venustus キツネノムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius bellulus カニノテムシロ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius bimaculosus フタホシカニノテムシロ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius globosus コブムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius luridus マタヨフバイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nassarius olivaceus クリイロムシロ（クリイロヨフバイ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/179 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Babylonia japonica バイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 1/13 (7.7%) | 2/356 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Vexillum gruneri ハイイロミノムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/140 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Vexillum sanguisuga カノコミノムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/140 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chicoreus asianus オニサザエ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/21 (0.0%) | 8/970 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oliva mustelina マクラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/142 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Conus figulinus スジイモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 6/416 (1.4%) | 6/589 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Conus loroisii コゲスジイモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 6/416 (1.4%) | 6/589 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Etremopa gainesii チャイロフタナシシャジク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eucithara marginelloides コトツブ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/3 (0.0%) | 6/589 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudodaphnella leuckarti クリイロマンジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/346 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Turris crispa クダボラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/492 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Hastula rufopunctata シチクガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/338 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Biwakovalvata biwaensis ビワコミズシタダミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Valvata hokkaidoensis ミズシタダミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/63 (0.0%) | 0/65 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonactaeon sieboldii オオシイノミガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japonactaeon nipponensis ムラクモキジビキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pupa sulcata カヤノミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Limulatys ooformis ホソタマゴガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 1/93 (1.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Acteocina koyasensis コヤスツララ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/24 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Siphonacmea oblongata キタノカラマツガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bacteridium vittatum イトカケゴウナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Evalea suoana スオウクチキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Syrnola hanzawai アンパルクチキレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Syrnola aciculata ククリクチキレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyrgulina shigeyasui シゲヤスイトカケギリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leucotina digitalis チビマキギヌ（ササクレマキモノガイ） | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Leucotina sp. ニライカナイゴウナ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyramidella ventricosa オオシイノミクチキレ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Monotygma eximia ヒメゴウナ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tiberia dunkeri ドウンケルクチキレ（エバラクチキレ） | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Turbonilla scrobiculata ウネイトカケギリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyramidellidae gen. A. & sp. A ヌカルミクチキレ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/74 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Turbonilla teganumana エドイトカケギリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Turbonilla kuraenohamana クラエノハマイトカケギリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Radix auricularia japonica モノアラガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 6 | 1/251 (0.4%) | 4/420 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Choanomphalodes perstriatulus カドヒラマキガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Polypylis hemisphaerula ヒラマキガイモドキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/5 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Polypylis usta リュウキュウヒラマキガイモドキ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/2 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Carychium cymatoplax ナガケシガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/28 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Carychium pessimum ケシガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/28 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cassidula crassiuscula カタシイノミミミガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cassidula mustelina ウラシマミミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cassidula plecotrematoides plecotrematoides ヒゲマキシイノミミミガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cassidula vespertilionis コウモリミミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laemodonta exaratoides ウスコミミガイ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laemodonta monilifera マキスジコミミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laemodonta sp. A シュジュコミミガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laemodonta typica ヘソアキコミミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Melampus phaeostylus コメツブハマシイノミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Melampus sulculosus キヌメハマシイノミ（トリコハマシイノミ） | LC | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/21 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Microtralia sp. コデマリナギサノシタタリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pedipes jouani ヒヅメガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pythia nana ヒメヒラシイノミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pythia pachyodon クロヒラシイノミ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pythia pantherina マダラヒラシイノミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/11 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Platevindex sp. B ゴマセンベイアワモチ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/19 (0.0%) | 5/135 (3.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Granulilimax fuscicornis イボイボナメクジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/2 (0.0%) | 1/38 (2.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Oxyloma hirasei ナガオカモノアラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/52 (0.0%) | 0/185 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pacificella rucuana リュウキュウノミガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tornatellides tryoni トライオンノミガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pyramidula conica ナタネガイモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/27 (0.0%) | 0/27 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eostrobilops nipponica reikoae ナニワクチミゾガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gastrocopta armigerella armigerella スナガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gastrocopta armigerella daitojimana ダイトウジマスナガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gastrocopta boninensis ボニンスナガイ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Truncatellina insulivaga ミジンサナギガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/37 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Vertigo kushiroensis クシロキバサナギガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Luchuena oshimana オオシマキセルモドキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mirus andersonianus クリイロキセルモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mirus rugulosus ホソキセルモドキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/87 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euphaedusa aculus mesimana メシマコギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/6 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa aulacophora クロチビギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa decapitata シリオレトノサマギセル | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa dorcas オクガタギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa ducalis トノサマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa hosayaka ホソヤカギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa iotaptyx シリボソギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa kawasakii ハチノコギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa kuninoae クニノギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa martensi オオギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa mikado ミカドギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa morisakii モリサキギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa nankaidoensis nankaidoensis コシボソギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa pilsbryana ピルスブリギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa pinguis pinguis キイツムガタギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa plicilabris コスジギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa rex オオトノサマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa rhopalia ツメギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa schmackeri シマケルギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa sericina チュウゼンジギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa stenospira シロバリギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa sugimotonis misaki ミサキギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa sugimotonis sugimotonis スギモトギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa surugensis スルガギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa tanegashimae タネガシマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Megalophaedusa tosaensis トサシリボソギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Reinia arborea ムコウジマコギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/13 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa addisoni plagioptyx ハスヒダギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa hickonis mikawa ミカワギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa hooyoensis ホウヨギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa interlamellaris カタギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa jacobiella ヒメヤコビギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa koshikijimana コシキジマギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa nesiothauma ヒルグチギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa nugax コハラブトギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa okimodoki オキモドキギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa oshimae oshimae オオシマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa tosana トサギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa tripleuroptyx クロシマギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/14 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa ujiguntoensis ウジグントウギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa una ナカダチギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stereophaedusa vasta moriyai モリヤギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tauphaedusa stearnsii iriomotensis イリオモテコギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/5 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tauphaedusa stearnsii stearnsii スタアンズギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/5 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx adulta サキシマノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx asperata アラハダノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx deminuta ヨワノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx hachijoensis ハチジョウノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx kusakakiensis クサカキノミギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx nakanoshimana ナカノシマノミギセル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx polita ツヤノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx ptychocyma ハラブトノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx stimpsoni sadoensis サドギセル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx tantilla チイサギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx thaumatopoma ニセノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Zaptyx yukitai ユキタノミギセル | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sinoennea insularis ツヤダワラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/5 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Videnoida cathcartae ツヤカサマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Videnoida gouldiana タカカサマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Videnoida horiomphala オオカサマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bekkochlamys serena スカシベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bekkochlamys teramachii テラマチベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ceratochlamys hiraseana コシダカヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Danjochlamys meshimaensis メシマベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Japanochlamys awaensis アワクリイロベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Liardetia boninensis ボニンキビ | VU | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/43 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Otesiopsis kawaguchii カワグチレンズガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Otesiopsis yamamotoaizoi ダンジョレンズガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parakaliella hizenensis ヒゼンキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parakaliella pagoduloides ヒメハリマキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Parakaliella ruida スジキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sitalina insignis カサネシタラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Sitalina japonica ウメムラシタラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Takemasaia gudei グゥドベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trochochlamys labilis persubtilis ヒラオオキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trochochlamys lioconus オオタキキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trochochlamys longissima ツシマナガキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trochochlamys praealta タカキビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trochochlamys subcrenulata subcrenulata ヒメカサキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Yamatochlamys circumdata ハチジョウヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponarion carinatus オオコウラナメクジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Deroceras monticola ヤマコウラナメクジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 2/259 (0.8%) | 2/263 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista aemula hadaka ハダカケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista aemula shikokuensis シコクケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista caerulea ミズイロオオベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista carinata カドバリオトメマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista cavicollis クチマガリマイマイ | — | — | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista caviconus ヤギヅノマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista collinsoni collinsoni タシナミオトメマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista collinsoni lischkeana リシケオトメマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista conella コウニケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista conomphala ヘソカドケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista elegantissima シュリケマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista esakii エサキケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista friedeliana humerosa コシキフリイデルマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista hatakedai hatakedai ハタケダマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista hilgendorfi hilgendorfi ヒルゲンドルフマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista itoi イトウケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista kiusiuensis oshimana オオシマケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista kobensis discus ヒラコウベマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista kobensis gotoensis ゴトウコウベマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista kobensis koshikijimana コシキコウベマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista latizona クロオビオトメマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista meiacoshimensis ナガシリマルホソマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista mikuriyensis コケラマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista omma オマオオベソマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista pallens シロマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista pressa ヒラケマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista proba goniosoma カドコオオベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista tokyoensis トウキョウコオオベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista trochula ツシマケマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista tumida cavata キイオオベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Aegista tumida tumida フチマルオオベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ainohelix io アケボノマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bradybaena circulus hiroshihorii ホリマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/24 (4.2%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bradybaena phaeogramma iheyaensis イヘヤタメトモマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/24 (4.2%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra brandtii sapporo サッポロマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra decorata diminuta ナンブマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra dixoni okicola オキマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra grata gratoides ミチノクマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra latispira yagurai コウロマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra quaesita heguraensis ヘグラマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra tokarainsula tokarainsula クロマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Euhadra tokarainsula ujiensis ウジグントウマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/26 (3.8%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Moellendorffia diminuta コケハダシワクチマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis borealis キタノビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis bracteata bracteata ウロコビロウドマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis fragilis ケハダビロウドマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis kawanai カワナビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis osumiensis オオスミビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponochloritis pumila キヌビロウドマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma ammiralis ハンミガキマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma caliginosa caliginosa イッシキマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma cristata アナナシマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma danzyoensis ダンジョマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma fusca コシタカコベソマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma mercatoria iejimana イエジママイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma myomphala fukashimana フカシマコベソマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma okiensis オキシメクチマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma omphalodes サンインコベソマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma pagodula ヒメタマゴマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma papilliformis ヤマタカマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma tadai タダマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma tanegashimae タネガシママイマイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Satsuma yaeyamensis クロイワヒダリマキマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/76 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Solemya pusilla キヌタレガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/19 (5.3%) | 1/57 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Arcuatula japonica ヤマホトトギス | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 47 | 1/3 (33.3%) | 21/1505 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Modiolatus flavidus サザナミマクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 47 | 0/1 (0.0%) | 21/1505 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Modiolus modulaides コケガラス | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 47 | 1/29 (3.4%) | 21/1505 (1.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Modiolus philippinarum ホソスジヒバリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.63 Gbp 209 | 301,873 18.4 kbp | 1 | 1 | 47 | 1/29 (3.4%) | 21/1505 (1.4%) | 2017-04-05 |
| NT 準絶滅危惧 | Arenifodiens vagina イシワリマクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Magallana sikamea シカメガキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | —/— | No | — | — | — | 0 | 17 | 32 | 6/13 (46.2%) | 16/336 (4.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Atrina japonica ズベタイラギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Contig, Reference | 835 Mbp 260 | 3,391 911 kbp | 1 | 2 | 3 | 2/57 (3.5%) | 3/72 (4.2%) | 2023-02-20 |
| NT 準絶滅危惧 | Atrina lischkeana タイラギ（リシケタイラギ） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/57 (3.5%) | 3/72 (4.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pinna attenuata ハボウキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/13 (7.7%) | 3/72 (4.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mimachlamys cloacata ヒナノヒオウギの1種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 13 | 1/13 (7.7%) | 7/159 (4.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Inversiunio jokohamensis ヨコハマシジラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/6 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pronodularia japanensis マツカサガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 8/887 (0.9%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pegophysema philippiana ショウゴインツキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/2 (0.0%) | 11/189 (5.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Austriella corrugata シワツキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 11/189 (5.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fragum loochooanum オキナワヒシガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 27 | 3/12 (25.0%) | 14/212 (6.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Fragum unedo カワラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 27 | 3/12 (25.0%) | 14/212 (6.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Chion semigranosus フジノハナガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Donax faba リュウキュウナミノコ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/44 (6.8%) | 3/48 (6.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Donax kiusiuensis キュウシュウナミノコ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/44 (6.8%) | 3/48 (6.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Latona cuneata ナミノコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/44 (6.8%) | 3/48 (6.2%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gari elongata マスオガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gari maculosa アシガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gari minor ハザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gari squamosa ハスメヨシガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gari chinensis オチバ（コムラサキガイ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 4 | 2/14 (14.3%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psammotaea togata ウラジロマスオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/34 (8.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Semelangulus lacrimadugongi ザンノナミダ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Thyellisca trigonalis シロナノハナガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Solecurtus divaricatus キヌタアゲマキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 2/15 (13.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Solecurtus philippinarum ミナミキヌタアゲマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 2/15 (13.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clathrotellina carnicolor ヒラセザクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jactellina compta ミクニシボリザクラ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jactellina transcalpta ハスメザクラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Limecola contabulata サビシラトリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Praetextellina praetexta オオモモノハナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Rexithaerus sectior サギガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jitlada juvenilis トガリユウシオガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Moerella hilaris モモノハナ（エドザクラ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/5 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jitlada philippinarum リュウキュウザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jitlada culter ユウシオガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nitidotellina hokkaidoensis サクラガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/5 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nitidotellina minuta ウズザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/5 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tonganaella perna ダイミョウガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pharaonella sieboldii ベニガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pinguitellina robusta ウラキヒメザラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/5 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Serratina capsoides ヌノメイチョウシラトリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tellinella crucigera ヒノデガイの1種 | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Tellinides striatus ヒラザクラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/2 (0.0%) | 3/91 (3.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trapezium liratum ウネナシトマヤガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Trapezium sublaevigatum タガソデモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/16 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Corbicula japonica ヤマトシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.07 Gbp 59 | 3,723 617 kbp | 1 | 3 | 3 | 3/489 (0.6%) | 3/511 (0.6%) | 2024-04-29 |
| NT 準絶滅危惧 | Lutraria arcuata カモジガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/8 (25.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lutraria maxima オオトリガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 12 | 2/8 (25.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mactrotoma angulifera ワカミルガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/1 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Meropesta nicobarica ユキガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/1 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Atactodea striata イソハマグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Coecella chinensis クチバガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anomalodiscus squamosus シオヤガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Bonartemis histrio オイノカガミ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Callista erycina フジイロハマグリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/2 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Circe undatina シラオガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/8 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Clementia papyracea カミブスマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/1 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gafrarium divaricatum ケマンガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/19 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Katelysia japonica スダレハマグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/5 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pitar lineolatus ガンギハマグリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pitar pellucidus オミナエシハマグリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/9 (0.0%) | 15/283 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eufistulana grandis コヅツガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Anisodevonia ohshimai ヒノマルズキン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Galeomma ambigua コハクマメアゲマキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Galeomma rosea バライロマメアゲマキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Galeomma sp. ニッポンマメアゲマキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/4 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lepirodes layardi ミナミウロコガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Lepirodes takii ウロコガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Litigiella pacifica ユンタクシジミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Nipponomysella subtruncata スジホシムシモドキヤドリガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Paraborniola matsumotoi マツモトウロコガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Peregrinamor ohshimai マゴコロガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/7 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudopythina macrophthalmensis オサガニヤドリガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pseudopythina ochetostoma ナタマメケボリガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Pythina deshayesiana セワケハチミツガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Scintilla anomala ツマベニマメアゲマキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/17 (5.9%) | 1/56 (1.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Scintilla philippinensis ベッコウマメアゲマキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | Yes (1) | Contig, Reference | 1.65 Gbp 55 | 6,132 491 kbp | 1 | 1 | 1 | 1/17 (5.9%) | 1/56 (1.8%) | 2024-12-04 |
| NT 準絶滅危惧 | Cryptomya elliptica クシケマスオ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Mya japonica オオノガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/9 (11.1%) | 1/13 (7.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Laternula truncata ヒロクチソトオリガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/18 (5.6%) | 1/18 (5.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Solen roseomaculatus バラフマテ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Solen sloanii リュウキュウマテ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| DD 情報不足 | Semisulcospira dilatata フトマキカワニナ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Semisulcospira fluvialis ナンゴウカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Semisulcospira ourensis オオウラカワニナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Semisulcospira rugosa タテジワカワニナ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/78 (1.3%) | 1/179 (0.6%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia akka アッカミジンツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia cylindrica ホソミジンツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia kawanensis カワネミジンツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia kishiiana サガノミジンツボ | DD | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia morimotoi コウチミジンツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Akiyoshia scalaris クルイミジンツボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1003 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Dolicrossea sp. ウズツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Ceratia sp. サンビャッケンツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Tornidae gen. & sp. A トゲトゲツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Tornidae gen. & sp. B チクチクツボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Cornirostra sp. ヤマトカクメイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/1 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Xenoskenea sp. シンジュノナミダ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Cingulina sp. ヒガタヨコイトカケギリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pyramidellidae gen. B & sp. カサガタガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/74 (0.0%) | 0/74 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Galba sp. コシダカヒメモノアラガイ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/23 (0.0%) | 4/420 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Radix auricularia auricularia イグチモノアラガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 6 | 1/251 (0.4%) | 4/420 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Radix auricularia swinhoei タイワンモノアラガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 1 | 6 | 1/251 (0.4%) | 4/420 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gyraulus chinensis ヒラマキミズマイマイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/212 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gyraulus gredleri クロヒラマキガイ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/212 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gyraulus illibatus ハブタエヒラマキガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/212 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gyraulus tokyoensis トウキョウヒラマキガイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/212 (0.0%) | 7/680 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Laemodonta octanfracta イササコミミガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/10 (0.0%) | 1/153 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Lamellidea hataiana ハタイノミガイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Lamellidea monodonta ヒトハノミガイ | EX | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Lamellidea nakadai ナカダノミガイ | EX | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Vallonia patens エゾミジンマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gastrocopta ogasawarana オガサワラスナガイ | EX | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/54 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Vertigo ovata stagnalis ミズギワキバサナギガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/115 (0.0%) | 0/151 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Megalophaedusa aurantiaca moellendorffi エルベリギセル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Megalophaedusa micropeas hokkaidoensis エゾヒメギセル | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/55 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Stereophaedusa sp. (pSL) ナタマメギセル（偽南部大型） | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/39 (0.0%) | 1/635 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys danjoensis ダンジョベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys depressa コウベヒラベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys dulcis オオヒラベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys kagaensis ミドリベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys koshikijimana コシキオオヒラベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys kurodai ミヤコベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys kuroshimana クロシマベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys micrograpta ヒラベッコウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys nikkoensis ニッコウヒラベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys perfragilis ベッコウマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys sakui ヤクシマベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys septentrionalis カントウベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Bekkochlamys shikokuensis シコクベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Japanochlamys cerasina クリイロベッコウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Japanochlamys decens カズマキベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Japanochlamys hakonensis ハコネヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Japanochlamys shinanoensis エナクリイロベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Luchuconulus acuta カドヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Nipponochlamys hakusana ハクサンベッコウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Nipponochlamys hokkaidonis エゾヒメベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Nipponochlamys izushichitojimana シチトウベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Nipponochlamys semisericata キヌツヤベッコウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Ovachlamys kandai カンダベッコウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella acutanguloides トガリキビ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella affinis エゾキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella bimaris マルキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella hachijoensis ハチジョウキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella higashiyamana アワキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Parakaliella okiana オキキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys crenulata basistriata ソコスジカサキビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys fraterna オオウエキビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys goniozona ヒメオオタキキビ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys humiliconus イセキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys kiiensis キイキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys monticola イヤヤマキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys okiensis オキノクニキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys okinoshimana オキノシマキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys sororcula トサキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys subcrenulata satsumana サツマヒメカサキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys tanzawaensis タンザワキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Trochochlamys xenica サドタカキビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Aegista hatakedai kawamurai カワムラマイマイ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/17 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Aegista kobensis tsumiyamai ツミヤママイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Aegista kunimiensis ササミケマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/46 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Nipponochloritis echizenensis エチゼンビロウドマイマイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Nipponochloritis occidentalis サイコクビロウドマイマイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Nipponochloritis oscitans ビロウドマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/4 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| DD 情報不足 | Talonostrea talonata ネコノアシガキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 32 | 0/5 (0.0%) | 16/336 (4.8%) | — |
| DD 情報不足 | Hiatula petalina アシベマスオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/6 (0.0%) | 3/34 (8.8%) | — |
| DD 情報不足 | Meropesta sp. ハブタエユキガイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/1 (0.0%) | 7/49 (14.3%) | — |
| DD 情報不足 | Diplodonta sp. フタバシラガイの1種 | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/10 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Arthritica reikoae ガタヅキ（コハギガイ） | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Melliteryx puncticulata ハチミツガイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/66 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Mya uzenensis キタノオオノガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/9 (11.1%) | 1/13 (7.7%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Hemipoma hakodadiense 東北地方・佐渡島のハコダテヤマキサゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cyclophorus turgidus turgidus 伊是名島のオキナワヤマタニシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/58 (0.0%) | 0/264 (0.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Littorina brevicula 沖縄島北部のタマキビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 678 Mbp 37 | 15,448 78.9 kbp | 1 | 8 | 8 | 4/27 (14.8%) | 4/213 (1.9%) | 2024-10-24 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Reticunassa festiva 沖縄島北部のアラムシロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/29 (0.0%) | 1/348 (0.3%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Cochlicopa lubrica 八丈島・佐渡島のヤマボタルガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Columella edentula 東北地方以南のナガナタネガイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/35 (0.0%) | 0/37 (0.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Discus pauper 近畿地方以西のパツラマイマイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Retinella hammonis 東北地方以南のコハクモドキ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/47 (0.0%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Sitalina latissima 九州以北のヒラシタラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Ezohelix gainesi gainesi 東北地方以南のエゾマイマイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Bradybaena phaeogramma 伊豆諸島のタメトモマイマイ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/24 (4.2%) | 5/1514 (0.3%) | — |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Magallana gigas 宮城県以北のナガガキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/14 | ✓/✓ | Yes (8) | Chromosome, Reference | 564 Mbp 48 | 184 7.29 Mbp | 8 | 17 | 32 | 6/13 (46.2%) | 16/336 (4.8%) | 2019-08-08 |
| LP 絶滅のおそれの ある地域個体群 | Solen strictus 沖縄島北部のマテガイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/19 (5.3%) | 1/19 (5.3%) | — |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Compressalges nipponiae トキウモウダニ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Haemaphy salispentalagi クロウサギチマダニ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 73 | 5/136 (3.7%) | 33/831 (4.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pyatakovestia boninensis オガサワラホソハマトビムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/4 (0.0%) | 4/331 (1.2%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Bdellocephala annandalei ビワオオウズムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Dendrocoelopsis kishidai キョウトウズムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/53 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Dugesia izuensis イズウズムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 13 | 1/272 (0.4%) | 6/355 (1.7%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Ectoplana limuli カブトガニウズムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/1 (0.0%) | 1/10 (10.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Phagocata papillifera カントウイドウズムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/40 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cirrodrilus tsugarensis ツガルザリガニミミズ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Tachypleus tridentatus カブトガニ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | Yes (4) | Chromosome, Reference | 2.17 Gbp 50 | 7,577 1.64 Mbp | 4 | 5 | 9 | 2/4 (50.0%) | 4/9 (44.4%) | 2019-01-22 |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cordiseta nakayamai ナカヤマタマツツガムシ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Walchia pentalagi クロウサギワルヒツツガムシ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/18 (0.0%) | 2/140 (1.4%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Cybaeus itsukiensis イツキメナシナミハグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/118 (0.0%) | 0/134 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Salmincola stellatus イトウナガクビムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/10 (0.0%) | 0/72 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Gnorimosphaeroma boninense オガサワラコツブムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/24 (0.0%) | 0/377 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Hondoniscus kitakamiensis ホンドワラジムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Amamiku occulta カクレサワガニ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Geothelphusa levicervix トカシキオオサワガニ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Geothelphusa miyakoensis ミヤコサワガニ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Geothelphusa shokitai センカクサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Geothelphusa tenuimanus ヒメユリサワガニ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Paratya boninensis オガサワラヌマエビ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/19 (0.0%) | 3/530 (0.6%) | — |
| CR+EN 絶滅危惧I類 | Polyxenus shinoharai シノハラフサヤスデ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/47 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phagocata albata ソウヤイドウズムシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/40 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phagocata suginoi ホクリクホソウズムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/40 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Phagocata tenella ヒダカホソウズムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/40 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus aomorensis アオモリザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus cirratus カムリザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus ezoensis エゾザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus homodontus ホソザリガニミミズ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus inukaii イヌカイザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus iwakiensis イワキザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus makinoi ヒメザリガニミミズ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus megalodentatus オオアゴザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus nipponicus ニッポンザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus sapporensis ザリガニミミズ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cirrodrilus uchidai ウチダザリガニミミズ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/39 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Parabeloniscus shimojanai クメコシビロザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/25 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Aculepeira matsudae マツダタカネオニグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/17 (0.0%) | 13/902 (1.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Argyroneta aquatica ミズグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/12 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/466 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Heptathela kimurai sensu lato キムラグモ（広義） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/29 (0.0%) | 1/50 (2.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Lycosa ishikariana イソコモリグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/44 (0.0%) | 1/633 (0.2%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Nesticus uenoi フジホラヒメグモ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/194 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Ryuthela nishihirai sensu lato オキナワキムラグモ（広義） | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 3.11 Gbp 39 | 2,521 12.9 Mbp | 1 | 1 | 1 | 1/18 (5.6%) | 1/50 (2.0%) | 2024-04-17 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Amamiku amamensis アマミミナミサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Antecaridina lauensis ドウクツヌマエビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/4 (0.0%) | 3/530 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Austruca lactea ハクセンシオマネキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/133 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Birgus latro ヤシガニ | VU | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/2 | ✓/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 2.96 Gbp 51 | 914,468 5.29 kbp | 1 | 1 | 2 | 1/1 (100.0%) | 2/16 (12.5%) | 2021-05-18 |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Cambaroides japonicus ニホンザリガニ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/5 (0.0%) | 2/650 (0.3%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Candidiopotamon kumejimense クメジマミナミサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Candidiopotamon tokashikense トカシキミナミサワガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chiromantes magnus オガサワラクロベンケイガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/277 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Chiromantes ryukyuanum リュウキュウアカテガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/277 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Coenobita perlatus サキシマオカヤドカリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/14 (7.1%) | 2/16 (12.5%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Eriocheir ogasawaraensis オガサワラモクズガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 1/6 (16.7%) | 1/125 (0.8%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geothelphusa amagui ケラマサワガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geothelphusa aramotoi アラモトサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geothelphusa grandiovata オキナワオオサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geothelphusa iheya イヘヤオオサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Geothelphusa kumejima クメジマオオサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macrobrachium miyakoense ウリガーテナガエビ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/281 (1.1%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Macrobrachium placidulum ネッタイテナガエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/281 (1.1%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Neocaridina ishigakiensis イシガキヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/32 (3.1%) | 3/530 (0.6%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Palaemon ogasawaraensis オガサワラコテナガエビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 9 | 1/106 (0.9%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Tubuca arcuata シオマネキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/133 (0.0%) | — |
| VU 絶滅危惧Ⅱ類（VU） | Spirobolus sp. ヤエヤママルヤスデ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/7 (0.0%) | 0/22 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Stratospongilla clementis ヤワカイメン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 3/112 (2.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Drawida hattamimizu ハッタミミズ | LC | ✓ | — | ✓ | — | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/38 (0.0%) | 0/61 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Psathyropus tenuipes ヒトハリザトウムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/3 (0.0%) | 2/269 (0.7%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Antrodiaetus roretzii カネコトタテグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/41 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Calommata signata ワスレナグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/40 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Conothele fragaria キノボリトタテグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/89 (0.0%) | 0/249 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Latouchia typica キシノウエトタテグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/12 (0.0%) | 0/249 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Xysticus daisetsuzanus ダイセツカニグモ | — | — | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/151 (0.7%) | 1/723 (0.1%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Eurydice akiyamai ヒガタスナホリムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/3 (0.0%) | 1/103 (1.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jesogammarus annandalei アナンデールヨコエビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/47 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Jesogammarus naritai ナリタヨコエビ | — | ✓ | — | ✓ | — | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/20 (0.0%) | 0/47 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Paracalliope dichotomus シオカワヨコエビ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Atyoida pilipes ミナミオニヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/4 (0.0%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Candidiopotamon okinawense オキナワミナミサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Cardisoma rotundum ヘリトリオカガニ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Caridina prashadi サキシマヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/333 (0.3%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Caridina propinqua マングローブヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/333 (0.3%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Caridina rubella アシナガヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/333 (0.3%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Coenobita brevimanus オオナキオカヤドカリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 4.73 Gbp 69 | 10,080 1.76 Mbp | 1 | 1 | 2 | 1/14 (7.1%) | 2/16 (12.5%) | 2024-11-04 |
| NT 準絶滅危惧 | Coenobita violascens コムラサキオカヤドカリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/14 (7.1%) | 2/16 (12.5%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Deiratonotus japonicus カワスナガニ | — | ✓ | ✓ | — | ✓ | ✓/1 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/13 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Epigrapsus notatus ヒメオカガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gaetice ungulatus オキナワヒライソガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/3 (0.0%) | 1/125 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Gecarcoidea lalandii ムラサキオカガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/20 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa exigua ミカゲサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa marginata fulva カッショクサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa marginata marginata ムラサキサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa minei ミネイサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa obtusipes リュウキュウサワガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Geothelphusa sakamotoana サカモトサワガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Halocaridinides trigonophthalma チカヌマエビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/2 (0.0%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ilyoplax deschampsi ハラグクレチゴガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/10 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/21 (0.0%) | 0/49 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macrobrachium gracilirostre ツブテナガエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/281 (1.1%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macrobrachium latidactylus ヒラアシテナガエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/281 (1.1%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Macrobrachium shokitai ショキタテナガエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/281 (1.1%) | 4/1038 (0.4%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Metabetaeus minutus オハグロテッポウエビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/1002 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Moguai elongatum コウナガカワスナガニ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neocaridina iriomotensis イリオモテヌマエビ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 3 | 1/32 (3.1%) | 3/530 (0.6%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Neorhynchoplax yaeyamaensis ヤエヤマヤワラガニ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Paramoguai pyriforme ヨウナシカワスナガニ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ptychognathus takahashii ヨツハヒライソモドキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/27 (0.0%) | 1/125 (0.8%) | — |
| NT 準絶滅危惧 | Ryukyum yaeyamense ヤエヤマヤマガニ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/512 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Pectispongilla subspinosa ハケカイメン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Radiospongilla hozawai ホウザワカイメン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/6 (0.0%) | 3/112 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Spongilla inarmata オオツカイメン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 8 | 1/11 (9.1%) | 3/112 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Stratospongilla akanensis アカンコカイメン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 3/112 (2.7%) | — |
| DD 情報不足 | Craspedacusta iseana イセマミズクラゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/8 (12.5%) | 2/217 (0.9%) | — |
| DD 情報不足 | Ancyrobdella biwae イカリビル | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Ancyrobdella smaragdina ミドリビル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Hemiclepsis japonica イボビル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/9 (0.0%) | 2/305 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Oligobdella orientalis スクナビル | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/1 (0.0%) | 2/305 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Oligobdella tagoi タゴビル | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/2 (0.0%) | 2/305 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Ozobranchus jantseanus ヌマエラビル | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/4 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Orobdella yamaneae ヤマネクガビル | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/27 (0.0%) | 0/27 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Metagoniochernes tomiyamai テナガカニムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Acropsopilio boopis アワマメザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Himalphalangium spinulatum ゴホントゲザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/116 (2.6%) | — |
| DD 情報不足 | Hologagrella minatoi ミナトザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Leiobunum rubrum アカスベザトウムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 2/158 (1.3%) | 2/269 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Leiobunum simplum シロウマスベザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 2/158 (1.3%) | 2/269 (0.7%) | — |
| DD 情報不足 | Pygobunus okadai テングザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Sabacon distinctus フセブラシザトウムシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/30 (0.0%) | 0/36 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Verpulus boninensis ムニンザトウムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Verpulus similis ムニンセグロザトウムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Liacarus latilamellatus アシュウタマゴダニ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/40 (5.0%) | 3/160 (1.9%) | — |
| DD 情報不足 | Alopecosa hokkaidensis アシマダラコモリグモ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/42 (0.0%) | 1/633 (0.2%) | — |
| DD 情報不足 | Cladothela boninensis エダイボグモ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/297 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Desis japonica ヤマトウシオグモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/63 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Doosia japonica ドウシグモ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Filistata longibentris ハラナガカヤシマグモ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/98 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Eubranchipus uchidai キタホウネンエビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/38 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gnorimosphaeroma pulchellum ヒメコツブムシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/24 (0.0%) | 0/377 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Elamenopsis ariakensis アリアケヤワラガニ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Gopkittisak angustum マメイソガニ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/1 (0.0%) | 1/125 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Karstarma boholano ドウクツベンケイガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/277 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Lithoselatium pulchrum カスリベンケイガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/277 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Orcovita miruku ドウクツモクズガニ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| DD 情報不足 | Philyra iriomotensis イリオモテマメコブシガニ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/103 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Philyra kanekoi カネココブシガニ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/103 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Philyra taekoae アマミマメコブシガニ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/103 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Tetrias sp. イリオモテヨコナガピンノ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/170 (0.0%) | — |
| DD 情報不足 | Varuna yui タイワンオオヒライソガニ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/— | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/3 (0.0%) | 1/125 (0.8%) | — |
| DD 情報不足 | Xiphonectes brockii ツノナシイボガザミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/3 (0.0%) | 5/525 (1.0%) | — |
| DD 情報不足 | Epanerchodus acuticlivus リュウオビヤスデ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 2/86 (2.3%) | — |
| DD 情報不足 | Epanerchodus aster ホシオビヤスデ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 2/86 (2.3%) | — |
| DD 情報不足 | Cristatella mucedo アユミコケムシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/1 | —/✓ | Yes (1) | Scaffold, Reference | 574 Mbp 170 | 986 4.12 Mbp | 1 | 1 | 1 | 1/1 (100.0%) | 1/1 (100.0%) | 2020-10-23 |
| Conservation Status in the Japanese Red List | Taxon Name 分類群の和名 | Status in the IUCN Red List | Taxonomy entry | Has bacrode sequence in BOLD database: COI/other | Has complete mitochondrial genome in NCBI Organelle / NCBI Nucleotide | Genome sequenced and assembled? (number of assemblies) | Selected assembly | Number of sequenced genomes ゲノムの数 | Number of species with sequenced genomes | Earliest sequenced genome release date | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCBI | iNat | GBIF | COL | Assembly level, RefSeq category | Genome length, coverage | Number of contigs, contig N50 | Species 種 | Genus 属 | Family 科 | Genus 属 | Family 科 | |||||||
| EX 絶滅 | Phlegmariurus cunninghamioides コウヨウザンカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| EX 絶滅 | Botrychium boreale タカネハナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/66 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Ophioglossum parvifolium イオウジマハナヤスリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/50 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Hypolepis tenuifolia オオイワヒメワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/44 (0.0%) | 0/173 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Tectaria dissecta ウスバシダモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/162 (0.0%) | 0/202 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Pyrrosia angustissima ヒトツバノキシノブ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Aletris scopulorum ヒメソクシンラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/28 (0.0%) | 1/37 (2.7%) | — |
| EX 絶滅 | Burmannia coelestris ミドリシャクジョウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/36 (0.0%) | 0/71 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Thismia tuberculata キリシマタヌキノショクダイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/65 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| EX 絶滅 | Acanthephippium striatum タイワンアオイラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/4 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EX 絶滅 | Arachnis labrosa ジンヤクラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/6 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EX 絶滅 | Neottia kiusiana ツクシサカネラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/42 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EX 絶滅 | Odontochilus poilanei ツシマラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/8 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EX 絶滅 | Eriocaulon setaceum タカノホシクサ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EX 絶滅 | Cyperus diaphanus タチガヤツリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EX 絶滅 | Cyperus procerus ホクトガヤツリ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EX 絶滅 | Fimbristylis leptoclada var. takamineana チャイロテンツキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EX 絶滅 | Fimbristylis pauciflora イシガキイトテンツキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EX 絶滅 | Ranunculus gmelinii カラクサキンポウゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EX 絶滅 | Flemingia strobilifera ソロハギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/43 (2.3%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EX 絶滅 | Lespedeza hisauchii サガミメドハギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/65 (1.5%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EX 絶滅 | Rubus hatsushimae ツクシアキツルイチゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 388 | 7/753 (0.9%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EX 絶滅 | Euphrasia insignis subsp. insignis var. omiensis オオミコゴメグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 3/109 (2.8%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| EX 絶滅 | Euphrasia insignis subsp. insignis var. pubigera マツラコゴメグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 3/109 (2.8%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| EX 絶滅 | Euphrasia multifolia var. kirisimana クモイコゴメグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 3/109 (2.8%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| EX 絶滅 | Cirsium toyoshimae トヨシマアザミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| EW 野生絶滅 | Phegopteris aurita ハイミミガタシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/637 (0.0%) | — |
| EW 野生絶滅 | Arachniodes yasu-inouei var. angustipinnula コバヤシカナワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EW 野生絶滅 | Dryopteris shibipedis シビイタチシダ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EW 野生絶滅 | Magnolia pseudokobus コブシモドキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 10 | 8/282 (2.8%) | 9/289 (3.1%) | — |
| EW 野生絶滅 | Disporum uniflorum キバナホウチャクソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/19 (0.0%) | 0/296 (0.0%) | — |
| EW 野生絶滅 | Liparis bootanensis var. uchiyamae キノエササラン | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EW 野生絶滅 | Eriocaulon heleocharioides コシガヤホシクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EW 野生絶滅 | Kalanchoe spathulata var. spathulata リュウキュウベンケイ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 20 | 1/167 (0.6%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EW 野生絶滅 | Astragalus sikokianus ナルトオウギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 407 | 3/1627 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EW 野生絶滅 | Viola stoloniflora オリヅルスミレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Huperzia somae コスギトウゲシバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/68 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lycopodiella caroliniana イヌヤチスギラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/3 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lycopodium sieboldii var. christensenianum リュウキュウヒモラン | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phlegmariurus carinatus ボウカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phlegmariurus fargesii ヒモスギラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phlegmariurus salvinioides ヒメヨウラクヒバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Equisetum variegatum チシマヒメドクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/36 (0.0%) | 0/37 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Botrychium lanceolatum ミヤマハナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/66 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Botrychium triangularifolium ミドリハナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angiopteris fokiensis ヒノタニリュウビンタイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/42 (0.0%) | 0/159 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callistopteris apiifolia キクモバホラゴケ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cephalomanes atrovirens サキシマホラゴケ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/2 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Didymoglossum bimarginatum マルバコケシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/38 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hymenophyllum digitatum ユビコケシノブ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/184 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hymenophyllum pilosissimum ムクゲコケシノブ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/184 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Plagiogyria stenoptera シマヤマソテツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/19 (0.0%) | 0/19 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lindsaea ensifolia イヌイノモトソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/151 (0.0%) | 0/200 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lindsaea kawabatae シノブホングウシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/151 (0.0%) | 0/200 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontosoria minutula コビトホラシノブ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/24 (0.0%) | 0/200 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontosoria yaeyamensis ヤエヤマホラシノブ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/24 (0.0%) | 0/200 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Antrophyum formosanum シマタキミシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/37 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cheilanthes krameri イワウラジロ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/24 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Coniogramme gracilis ホソバイワガネソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/27 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Haplopteris mediosora イトシシラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/47 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Haplopteris yakushimensis オオバシシラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/47 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pteris grevilleana アシガタシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pteris kawabatae カワバタハチジョウシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Microlepia obtusiloba var. angustata ホソバコウシュンシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/44 (0.0%) | 0/173 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acystopteris tenuisecta ホウライウスヒメワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/35 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asplenium castaneoviride ヤマドリトラノオ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/454 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asplenium ensiforme ホコガタシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/454 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asplenium griffithianum フササジラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/454 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asplenium oligophlebium var. iezimaense イエジマチャセンシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/454 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hymenasplenium cardiophyllum ヒメタニワタリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/48 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hymenasplenium subnormale ウスイロホウビシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/48 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Woodsia subcordata キタダケデンダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/25 (0.0%) | 0/41 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium arisanense var. arisanense タイワンアリサンイヌワラビ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium arisanense var. kenzo-satakei シビイヌワラビ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium masamunei ヤクイヌワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium neglectum subsp. australe シイバサトメシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium opacum f. glabrescens ナンゴクシケチシダ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium reflexipinnum サカバイヌワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium silvicola タカサゴイヌワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium spinescens トゲヤマイヌワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Athyrium yakusimense ヤクシマタニイヌワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deparia formosana ジャコウシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/70 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deparia henryi コウライイヌワラビモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/70 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deparia minamitanii ヒュウガシケシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/70 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplazium kawabatae モッチョムシダ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplazium kawakamii アオイガワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplazium megaphylum ムシャシダ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplazium pinfaense フクレギシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplazium subtripinnatum ムニンミドリシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thelypteris erubescens タイヨウシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/637 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thelypteris gracilescens シマヤワラシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/637 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hypodematium fordii リュウキュウキンモウワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/28 (0.0%) | 0/31 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes cantilenae イツキカナワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes exilis f. oohorae アタシカカナワラビ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes hiugana ヒュウガカナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes quadripinnata subsp. fimbriata ヒロハナライシダ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes simulans ヒゴカナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arachniodes yaoshanensis ツルダカナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/99 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyrtomium anomophyllum クマヤブソテツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/23 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris anthracinisquama クマイワヘゴ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris dickinsii x D. polylepis エビノオオクジャク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris gymnosora x D. koidzumiana ホソバヌカイタチシダ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris hangchowensis キリシマイワヘゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris lunanensis オオミネイワヘゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris subtsushimensis アラゲミサキカグマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris tsugiwoi マルバヌカイタチシダモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris tsutsuiana ツツイイワヘゴ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dryopteris wallichiana オオヤグルマシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elaphoglossum callifolium オキナワアツイタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/257 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum grandifrons キュウシュウイノデ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum lachenense タカネシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum neolobatum ヤシャイノデ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum obae アマミデンダ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum piceopaleaceum サクラジマイノデ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polystichum shimurae シムライノデ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arthropteris palisotii ワラビツナギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/202 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tectaria fauriei コモチナナバケシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/162 (0.0%) | 0/202 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tectaria kusukusensis ナガバウスバシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/162 (0.0%) | 0/202 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aglaomorpha coronans カザリシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Drynaria roosii ハカマウラボシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/22 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Goniophlebium amamianum アマミアオネカズラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lepisorus clathratus トヨグチウラボシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/86 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lepisorus oligolepidus ウロコノキシノブ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/86 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lepisorus pyriformis オニマメヅタ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/86 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Leptochilus decurrens オキノクリハラン | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/101 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oreogrammitis nipponica ヒロハヒメウラボシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/74 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pyrrosia adnascens ヒトツバマメヅタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pyrrosia linearifolia var. heterolepis タイワンビロードシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/75 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tomophyllum sakaguchianum キレハオオクボシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/13 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nuphar subintegerrima ヒメコウホネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/22 (4.5%) | 4/156 (2.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nuphar submersa シモツケコウホネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/22 (4.5%) | 4/156 (2.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Piper postelsianum タイヨウフウトウカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 3/705 (0.4%) | 3/1110 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum caudigerum オナガサイシン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum gusk グスクカンアオイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum hexalobum var. controversum シジキカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum kinoshitae ジュロウカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum leucosepalum タニムラアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum minamitanianum オナガカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum mitoanum フクエジマカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum monodoriflorum モノドラカンアオイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum nazeanum ナゼカンアオイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum okinawense ヒナカンアオイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum pellucidum トリガミネカンアオイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum satsumense サツマアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum senkakuinsulare センカクカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asarum tabatanum アサトカンアオイ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Heterotropa muramatsui var. shimodana シモダカンアオイ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Monoon liukiuense クロボウモドキ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/33 (0.0%) | 4/2146 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Illigera luzonensis テングノハナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/15 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema aprile オドリコテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema cucullatum ホロテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema heterocephalum subsp. majus オオアマミテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema heterocephalum subsp. okinawense オキナワテンナンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema inaense イナヒロハテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema ishizuchiense イシヅチテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema kawashimae トクノシマテンナンショウ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema kuratae アマギテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema longipedunculatum var. longipedunculatum シコクヒロハテンナンショウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema minamitanii ヒュウガヒロハテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema nagiense ナギヒロハテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema ogatae ツクシテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Arisaema seppikoense セッピコテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pothos chinensis ユズノハカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/9 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhaphidophora korthalsii サキシマハブカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/46 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhaphidophora liukiuensis ヒメハブカズラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/46 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tofieldia coccinea var. kiusiana ナガエチャボゼキショウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 1/22 (4.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tofieldia yoshiiana var. hyugaensis ヒュウガハナゼキショウ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 1/22 (4.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Alisma canaliculatum var. azuminoense アズミノヘラオモダカ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/11 (9.1%) | 1/142 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Alisma canaliculatum var. harimense ホソバヘラオモダカ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/11 (9.1%) | 1/142 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sagittaria natans カラフトグワイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/44 (0.0%) | 1/142 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Blyxa alternifolia セトヤナギスブタ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/3 (0.0%) | 3/218 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Najas tenuicaulis ヒメイバラモ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/30 (0.0%) | 3/218 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Potamogeton lucens subsp. sinicus var. teganumensis ガシャモク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 11 | 11 | 6/127 (4.7%) | 6/173 (3.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Potamogeton obtusifolius イヌイトモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 11 | 6/127 (4.7%) | 6/173 (3.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Potamogeton praelongus ナガバエビモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/7 | —/— | No | — | — | — | 0 | 11 | 11 | 6/127 (4.7%) | 6/173 (3.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ruppia megacarpa ネジリカワツルモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/23 (0.0%) | 3/40 (7.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ruppia x truncatifolia ヤハズカワツルモ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/23 (0.0%) | 3/40 (7.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saionia hyodoi ヒナノボンボリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saionia shinzatoi ホシザキシャクジョウ | CR | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/3 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saionia yamashitae ヤクノヒナホシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thismia abei タヌキノショクダイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/65 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thismia kobensis コウベタヌキノショクダイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/65 (0.0%) | 0/69 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dioscorea luzonensis ルゾンヤマノイモ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 15 | 5/344 (1.5%) | 6/349 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dioscorea tabatae ユワンオニドコロ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 15 | 5/344 (1.5%) | 6/349 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dioscorea zentaroana アマミタチドコロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 15 | 5/344 (1.5%) | 6/349 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sciaphila kozushimensis コウヅシマソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sciaphila multiflora イシガキソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sciaphila sugimotoi オモトソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sciaphila tenella タカクマソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sciaphila yakushimensis ヤクシマソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pandanus daitoensis ホソミアダン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/197 (0.5%) | 1/292 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chionographis koidzumiana var. kurokamiana クロカミシライトソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/4 (25.0%) | 2/203 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lilium alexandrae ウケユリ | CR | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/153 (0.7%) | 9/760 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lilium callosum var. flaviflorum キバナスゲユリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/153 (0.7%) | 9/760 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lilium nobilissimum タモトユリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/153 (0.7%) | 9/760 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tricyrtis hirta var. masamunei サツマホトトギス | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/35 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acanthephippium pictum エンレイショウキラン | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/4 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acanthephippium sylhetense タイワンショウキラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/4 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Anoectochilus formosanus キバナシュスラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/40 (2.5%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Anoectochilus koshunensis コウシュンシュスラン | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/40 (2.5%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bulbophyllum affine クスクスラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/698 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bulbophyllum macraei var. macraei シコウラン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/698 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bulbophyllum macraei var. tanegashimense タネガシマシコウラン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/698 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe alpina キソエビネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe amamiana アマミエビネ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe davidii var. bungoana タガネラン | LC | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe densiflora タマザキエビネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe hoshii ホシツルラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calanthe mannii サクラジマエビネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cheirostylis takeoi アリサンムヨウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/20 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cremastra aphylla モイワラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/4 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crepidium boninense シマホザキラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/28 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crepidium purpureum オキナワヒメラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/28 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cryptostylis arachnites オオスズムシラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/6 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cryptostylis taiwaniana タカオオオスズムシラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/6 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium dayanum ヘツカラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium ensifolium スルガラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium kanran カンラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium koran コラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium lancifolium アキザキナギラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium sinense ホウサイラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | Yes (2) | Chromosome, Reference | 3.53 Gbp 121 | 8,496 1.11 Mbp | 2 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | 2022-01-12 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cymbidium syunitianum オオナギラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/110 (1.8%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cypripedium guttatum チョウセンキバナアツモリソウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/67 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cypripedium macranthos var. macranthos ホテイアツモリ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/67 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cypripedium shanxiense ドウトウアツモリソウ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/67 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dienia ophrydis ホザキヒメラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/6 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diploprora championii サガリラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Disperis neilgherrensis ジョウロウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/32 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eria scabrilinguis オオオサラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/42 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Erythrodes blumei ホソフデラン | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/8 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Erythrorchis altissima タカツルラン | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eulophia dentata タカサゴヤガラ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/76 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gastrodia kuroshimensis クロシマヤツシロラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gastrodia okinawensis ツツザキヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gastrodia shimizuana ナンゴクヤツシロラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Goodyera fumata ヤブミョウガラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/61 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hancockia uniflora ヒメクリソラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/1 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hemipilia graminifolia var. suzukiana アワチドリ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/20 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Herminium monorchis クシロチドリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/52 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Herminium pusillum ミスズラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/52 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hetaeria oblongifolia オオカゲロウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/10 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lecanorchis moritae アマミムヨウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lecanorchis nigricans var. yakusimensis ヤクムヨウラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lecanorchis purpurea アワムヨウラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lecanorchis tabugawaensis タブガワムヨウラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lecanorchis virella ミドリムヨウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Liparis elliptica コゴメキノエラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Liparis hostifolia シマクモキリソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Liparis krameri var. nikkoensis ヒメスズムシソウ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Liparis sootenzanensis キバナコクラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Liparis truncata クモイジガバチ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Macodes petola ナンバンカモメラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/4 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Neottia furusei カイサカネラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/42 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Neottia nidus-avis エゾサカネラン | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/42 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontochilus fissus オオハクウンラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/17 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontochilus nanlingensis ヒメシラヒゲラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/17 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontochilus tashiroi オオギミラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/17 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Odontochilus tsukusianus ツクシアリドオシラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/17 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oreorchis coreana コケイランモドキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/11 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oreorchis indica コハクラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/11 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Peristylus calcaratus ヒゲナガトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/30 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Peristylus lacertifer var. triangularis タコガタサギソウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/30 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phaius mishmensis ヒメカクラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/21 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera amabilis ヤクシマチドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera brevicalcarata subsp. yakumontana ツクシチドリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera hondoensis オオバナオオヤマサギソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. amamiana アマミトンボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. masamunei ヤクシマトンボ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera okuboi ハチジョウツレサギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera sonoharae クニガミトンボソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Platanthera stenoglossa subsp. hottae ソハヤキトンボソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ponerorchis graminifolia var. kurokamiana クロカミラン | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/51 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ponerorchis graminifolia var. nigropunctata サツマチドリ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/51 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Staurochilus luchuensis イリオモテラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/3 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thrixspermum annamense イリオモテカヤラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/52 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thrixspermum fantasticum ハガクレナガミラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/52 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thrixspermum pygmaeum アマミカヤラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/52 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Zeuxine nervosa オオキヌラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/16 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lycoris sanguinea var. koreana ムジナノカミソリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/34 (0.0%) | 5/1539 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hosta takiminazukiflora subsp. grandis セトガワギボウシ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rohdea japonica var. latifolia サツマオモト | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/17 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nypa fruticans ニッパヤシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 25 | 0/1 (0.0%) | 11/2329 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sparganium hyperboreum チシマミクリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 7 | 2/47 (4.3%) | 4/77 (5.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eriocaulon amanoanum アマノホシクサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eriocaulon echinulatum ヒュウガホシクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eriocaulon perplexum エゾイヌノヒゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eriocaulon truncatum スイシャホシクサ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Juncus potaninii エゾイトイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 16 | 4/164 (2.4%) | 6/286 (2.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Juncus yakeisidakensis ミヤマゼキショウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 16 | 4/164 (2.4%) | 6/286 (2.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex aequialta トダスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex albidibasis ザラツキシラスゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex disperma ホソスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/7 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex globularis トナカイスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex hoozanensis ホウザンスゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex kabanovii ヤリスゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex lehmannii センジョウスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex omiana var. yakushimana チャボカワズスゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex rhynchachaenium トックリスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex rotundata コヌマスゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex scita var. parvisquama ダイセンアシボソスゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Carex yasuii ムニンヒョウタンスゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyperus digitatus オオホウキガヤツリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyperus niigatensis ニイガタガヤツリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyperus nutans var. subprolixus ヒメホウキガヤツリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cyperus pedunculatus コウシュンスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eleocharis atropurpurea クロミノハリイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 76 | 3/184 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eleocharis retroflexa subsp. chaetaria カヤツリマツバイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 76 | 3/184 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eleocharis tetraquetra var. tsurumachii カドハリイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 76 | 3/184 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eriophorum scheuchzeri var. tenuifolium エゾワタスゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 76 | 2/15 (13.3%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Fimbristylis fimbristyloides トモエバテンツキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Fimbristylis kadzusana イッスンテンツキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Fimbristylis nutans ウナヅキテンツキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Isolepis crassiuscula ビャッコイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhynchospora malasica ミクリガヤ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 76 | 3/192 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Scleria biflora ホソバシンジュガヤ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/155 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Calamagrostis autumnalis subsp. autumnalis キリシマノガリヤス | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/101 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Digitaria mollicoma ビロードメヒシバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 1221 | 3/83 (3.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elymus pendulinus var. pendulinus タイシャクカモジ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1221 | 1/155 (0.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elymus sibiricus エゾムギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | Yes (1) | Chromosome, Reference | 6.90 Gbp 30.35 | 418 49.5 Mbp | 1 | 1 | 1221 | 1/155 (0.6%) | 201/8826 (2.3%) | 2024-05-20 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elymus yubaridakensis タカネエゾムギ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1221 | 1/155 (0.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Isachne lutchuensis ケナシハイチゴザサ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/18 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Isachne myosotis ヒメハイチゴザサ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/18 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ischaemum indicum ヒメカモノハシ | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/1 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mnesithea laevis var. cochinchinensis ヒメウシノシッペイ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/11 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Panicum paludosum オオヌカキビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 41 | 1221 | 4/161 (2.5%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Piptatherum kuoi イネガヤ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/35 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Poa glauca var. kitadakensis キタダケイチゴツナギ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 1221 | 6/373 (1.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sacciolepis myosuroides ハラヌメリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/13 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sorghum nitidum var. nitidum コモロコシガヤ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 27 | 1221 | 2/37 (5.4%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sporobolus hancei ヒメネズミノオ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 1221 | 2/172 (1.2%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Corydalis gigantea エゾオオケマン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 16 | 1/318 (0.3%) | 12/672 (1.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cocculus orbiculatus ホウザンツヅラフジ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/3 (0.0%) | 10/289 (3.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pericampylus formosanus ホウライツヅラフジ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/3 (0.0%) | 10/289 (3.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum iidemontanum イイデトリカブト | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum jaluense subsp. jaluense コウライブシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum japonicum subsp. maritimum var. iyariense イヤリトリカブト | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum kitadakense キタダケトリカブト | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum metajaponicum オンタケブシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aconitum senanense subsp. senanense var. isidzukae オオサワトリカブト | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callianthemum kirigishiense キリギシソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/15 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callianthemum miyabeanum ヒダカソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/15 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Clematis obvallata var. obvallata コウヤハンショウヅル | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/239 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ranunculus ternatus var. lutchuensis リュウキュウヒキノカサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ranunculus uryuensis ウリュウキンポウゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ranunculus yatsugatakensis ヤツガタケキンポウゲ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thalictrum minus var. chionophyllum ミョウギカラマツ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thalictrum uchiyamae ムラサキカラマツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Thalictrum ujiinsulare ウジカラマツ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Trollius rebunensis レブンキンバイソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/31 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Buxus microphylla subsp. sinica タイワンアサマツゲ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 1/105 (1.0%) | 2/140 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Corylopsis gotoana var. pubescens ヒゴミズキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/21 (0.0%) | 3/103 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ribes horridum クロミノハリスグリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 4/141 (2.8%) | 4/141 (2.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Asimitellaria amamiana アマミチャルメルソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/11 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Astilbe chinensis オオチダケサシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/31 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Astilbe tsushimensis ツシマアカショウマ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/31 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saxifraga bracteata キヨシソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 2/498 (0.4%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saxifraga bronchialis subsp. funstonii var. yuparensis ユウバリクモマグサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 2/498 (0.4%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saxifraga nishidae エゾノクモマグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 2/498 (0.4%) | 4/825 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hylotelephium sordidum var. oishii オオチチッパベンケイ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/26 (0.0%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sedum drymarioides ナナツガママンネングサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 20 | 2/261 (0.8%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Causonis maritima ハマヤブガラシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 303 | 0/20 (0.0%) | 40/847 (4.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Astragalus japonicus エゾモメンヅル | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 407 | 3/1627 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chamaecrista garambiensis ガランピネムチャ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/275 (0.4%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crotalaria calycina ガクタヌキマメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/466 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crotalaria montana var. angustifolia ヤエヤマタヌキマメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/466 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crotalaria uncinella エダウチタヌキマメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/466 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Entada tonkinensis モダマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/25 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euchresta formosana タイワンミヤマトベラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/4 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glycine max subsp. formosana ホソバツルマメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 41 | 49 | 407 | 4/50 (8.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Glycine tabacina ボウコツルマメ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 49 | 407 | 4/50 (8.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Intsia bijuga タシロマメ | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/7 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oxytropis megalantha レブンソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/279 (0.4%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phyllodium pulchellum ウチワツナギ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/9 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pterocarpus vidalianus ヤエヤマシタン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 407 | 2/52 (3.8%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sophora franchetiana ツクシムレスズメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 407 | 1/64 (1.6%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tadehagi triquetrum subsp. triquetrum タデハギ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/6 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Uraria picta ホソバフジボグサ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/9 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vigna vexillata var. vexillata サクヤアカササゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 35 | 407 | 9/95 (9.5%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Zornia cantoniensis スナジマメ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/54 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polygala longifolia リュウキュウヒメハギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/154 (0.6%) | 1/702 (0.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polygala polifolia シンチクヒメハギ | — | — | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/154 (0.6%) | 1/702 (0.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Malus hupehensis ツクシカイドウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/✓ | Yes (1) | Chromosome, Reference | 1.17 Gbp 42.63 | 804 10.5 Mbp | 1 | 180 | 388 | 35/96 (36.5%) | 122/3866 (3.2%) | 2025-01-27 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Padus nakatakei モロツカウワミズザクラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Photinia serratifolia オオカナメモチ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 388 | 0/44 (0.0%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rubus amamianus var. minor コバノアマミフユイチゴ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 388 | 7/753 (0.9%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rubus arcticus チシマイチゴ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 388 | 7/753 (0.9%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rubus nakaii チチジマイチゴ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 388 | 7/753 (0.9%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elaeagnus arakiana タンゴグミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 3/77 (3.9%) | 8/92 (8.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhamnus kanagusukii ヒメクロウメモドキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/120 (0.0%) | 6/928 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Celtis biondii var. insularis サキシマエノキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 32 | 0/73 (0.0%) | 4/126 (3.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ficus iidaiana オオヤマイチジク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 26 | 7/787 (0.9%) | 15/1214 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Morus boninensis オガサワラグワ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 4/31 (12.9%) | 15/1214 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elatostema oshimense アマミサンショウソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/211 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elatostema yakushimense ヒメトキホコリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/211 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Elatostema yonakuniense ヨナクニトキホコリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/211 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Procris boninensis セキモンウライソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/12 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Trichosanthes homophylla var. ishigakiensis イシガキカラスウリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 214 | 5/107 (4.7%) | 109/970 (11.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Zehneria perpusilla var. deltifrons サツマスズメウリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 214 | 1/55 (1.8%) | 109/970 (11.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euonymus oblongifolius ナガバヒゼンマユミ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 1/94 (1.1%) | 2/738 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euonymus oligospermus アンドンマユミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 4 | 1/94 (1.1%) | 2/738 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Oxalis exilis アマミカタバミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 3 | 2/438 (0.5%) | 2/462 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Claoxylon centinarium セキモンノキ | — | — | — | — | — | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 94 | 0/10 (0.0%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euphorbia liukiuensis リュウキュウタイゲキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euphorbia sieboldiana var. ohsumiensis アマミナツトウダイ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euphorbia watanabei subsp. minamitanii ヒュウガタイゲキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Margaritaria indica アカハダコバンノキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/8 (0.0%) | 3/919 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Phyllanthus oligospermus subsp. donanensis ドナンコバンノキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/18 (0.0%) | 3/919 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ryssopterys timoriensis ササキカズラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/737 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Salix nummularia エゾマメヤナギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 39 | 78 | 15/463 (3.2%) | 34/887 (3.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Viola amamiana アマミスミレ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Viola lactiflora シロコスミレ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Viola okinawensis シマジリスミレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Viola tashiroi var. tairae イシガキスミレ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Linum stelleroides マツバニンジン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 46 | 46 | 7/118 (5.9%) | 7/170 (4.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cladopus fukienensis タシロカワゴケソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/404 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cladopus japonicus カワゴケソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/14 (0.0%) | 0/404 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hydrobryum koribanum オオヨドカワゴロモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/41 (0.0%) | 0/404 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hypericum senkakuinsulare センカクオトギリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 13 | 6/368 (1.6%) | 6/439 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hypericum tosaense トサオトギリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 13 | 6/368 (1.6%) | 6/439 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Terminalia nitens テリハモモタマナ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/125 (0.8%) | 5/293 (1.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rotala hippuris ミズスギナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/22 (0.0%) | 10/414 (2.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Epilobium fastigiatoramosum エダウチアカバナ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 8 | 2/113 (1.8%) | 5/473 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Metrosideros boninensis ムニンフトモモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 83 | 1/60 (1.7%) | 65/2956 (2.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Melastoma tetramerum var. tetramerum ムニンノボタン | — | ✓ | — | — | — | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 4/60 (6.7%) | 4/3333 (0.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stachyurus macrocarpus var. macrocarpus ナガバキブシ | — | ✓ | — | — | — | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stachyurus macrocarpus var. prunifolius ハザクラキブシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/11 (0.0%) | 0/11 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhus javanica var. javanica タイワンフシノキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/7 (0.0%) | 1/119 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Acer amamiense アマミカジカエデ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 26 | 4/169 (2.4%) | 12/1230 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Citrus nippokoreana コウライタチバナ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 94 | 110 | 28/205 (13.7%) | 39/1483 (2.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tetradium taiwanense ホソバハマセンダン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 110 | 0/15 (0.0%) | 39/1483 (2.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Abelmoschus moschatus var. betulifolius センカクトロロアオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 150 | 1/12 (8.3%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Grewia rhombifolia ヒシバウオトリギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 150 | 0/110 (0.0%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tilia chinensis var. intonsa ブンゴボダイジュ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 150 | 1/41 (2.4%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tilia chugokuensis チュウゴクボダイジュ | LC | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 150 | 1/41 (2.4%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tilia mandshurica var. mandshurica マンシュウボダイジュ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 150 | 1/41 (2.4%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Triumfetta procumbens var. glaberrima ケナシハテルマカズラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 150 | 0/30 (0.0%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diplomorpha phymatoglossa オオシマガンピ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/4 (0.0%) | 7/567 (1.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Berteroella maximowiczii ハナナズナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 655 | 0/8 (0.0%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Catolobus ligulifolius ヘラハタザオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 655 | 0/2 (0.0%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dontostemon dentatus var. dentatus ハナハタザオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 655 | 0/12 (0.0%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Draba igarashii シリベシナズナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Draba nakaiana ソウウンナズナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Limonium senkakuense センカクハマサジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/294 (0.7%) | 3/631 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Limonium sinense タイワンハマサジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 3 | 2/294 (0.7%) | 3/631 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bistorta hayachinensis ナンブトラノオ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 32 | 0/20 (0.0%) | 18/987 (1.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Persicaria taitoinsularis ダイトウサクラタデ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 32 | 4/85 (4.7%) | 18/987 (1.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aldrovanda vesiculosa ムジナモ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 4/93 (4.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cerastium furcatum var. ibukiense コバノミミナグサ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/119 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Minuartia arctica var. arctica エゾタカネツメクサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/18 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sagina saginoides チシマツメクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/7 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/30 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Silene repens var. apoiensis アポイマンテマ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Silene tokachiensis トカチビランジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Silene uralensis タカネマンテマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stellaria calycantha カンチヤチハコベ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/172 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stellaria filicaulis イトハコベ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/172 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Stellaria nipponica var. yezoensis オオイワツメクサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/172 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chenopodium bryoniifolium ミドリアカザ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 36 | 386 | 13/117 (11.1%) | 28/1279 (2.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Chenopodium gracilispicum イワアカザ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 386 | 0/7 (0.0%) | 28/1279 (2.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deeringia polysperma インドヒモカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 25 | 0/5 (0.0%) | 8/631 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cornus kousa var. chinensis ヤエヤマヤマボウシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 1 | 6 | 6 | 4/79 (5.1%) | 4/104 (3.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deutzia hatusimae コミノヒメウツギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/74 (0.0%) | 1/262 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Deutzia naseana var. amanoi オキナワヒメウツギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/74 (0.0%) | 1/262 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hydrangea involucrata var. tokarensis トカラタマアジサイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 1/136 (0.7%) | 1/262 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Impatiens hypophylla var. microhypophylla エンシュウツリフネソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 7 | 4/635 (0.6%) | 4/636 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Polemonium caeruleum subsp. kiushianum ハナシノブ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/30 (0.0%) | 1/416 (0.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Barringtonia asiatica ゴバンノアシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/26 (0.0%) | 1/270 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eurya zigzag クニガミヒサカキ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/73 (0.0%) | 1/227 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lysimachia liukiuensis ヒメミヤマコナスビ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 24 | 3/171 (1.8%) | 13/1499 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Myrsine okabeana マルバタイミンタチバナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 24 | 1/88 (1.1%) | 13/1499 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Primula reinii var. rhodotricha チチブイワザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 24 | 4/378 (1.1%) | 13/1499 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Symplocos kawakamii ウチダシクロキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/210 (0.5%) | 1/211 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Shortia rotundifolia f. amamiana アマミイワウチワ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/17 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Moneses uniflora イチゲイチヤクソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 62 | 0/1 (0.0%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Monotropastrum kirishimense キリシマギンリョウソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 62 | 0/5 (0.0%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pieris koidzumiana リュウキュウアセビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 62 | 0/9 (0.0%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhododendron boninense ムニンツツジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 25 | 62 | 18/793 (2.3%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhododendron dilatatum var. satsumense ハヤトミツバツツジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 25 | 62 | 18/793 (2.3%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rhododendron eriocarpum var. tawadae センカクツツジ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 25 | 62 | 18/793 (2.3%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vaccinium amamianum ヤドリコケモモ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 62 | 11/230 (4.8%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vaccinium sieboldii ナガボナツハゼ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 19 | 62 | 11/230 (4.8%) | 40/3028 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Nothapodytes amamianus ワダツミノキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/6 (16.7%) | 1/117 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Exallage auricularia ヤエヤマハシカグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 50 | 0/8 (0.0%) | 33/6196 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Knoxia sumatrensis シソノミグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 50 | 1/5 (20.0%) | 33/6196 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ophiorrhiza yamashitae アマミアワゴケ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 50 | 2/103 (1.9%) | 33/6196 (0.5%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gentiana aquatica ヒナリンドウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 3/280 (1.1%) | 7/1134 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gardneria liukiuensis リュウキュウホウライカズラ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/254 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Gardneria shimadai タイワンチトセカズラ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/4 (0.0%) | 0/254 (0.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cynanchum boudieri アマミイケマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 28 | 1/150 (0.7%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Dischidia formosana マメヅタカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 28 | 0/31 (0.0%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ochrosia hexandra ホソバヤロード | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 28 | 0/22 (0.0%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ochrosia iwasakiana シマソケイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 28 | 0/22 (0.0%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vincetoxicum inamoenum エゾノクサタチバナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 28 | 0/139 (0.0%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vincetoxicum yonakuniense ヨナグニカモメヅル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 28 | 0/139 (0.0%) | 20/3305 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cordia aspera subsp. kanehirae トゲミノイヌチシャ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/143 (0.7%) | 1/171 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cynoglossum lanceolatum var. formosanum タイワンルリソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/39 (0.0%) | 8/1323 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ehretia philippinensis リュウキュウチシャノキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/40 (2.5%) | 1/127 (0.8%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eritrichium nipponicum var. albiflorum f. yesoense エゾルリムラサキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/19 (0.0%) | 8/1323 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hackelia deflexa イワムラサキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/14 (0.0%) | 8/1323 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Mertensia pterocarpa var. yezoensis エゾルリソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/62 (0.0%) | 8/1323 (0.6%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aniseia martinicensis ナガバアサガオ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/8 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 21 | 0/4 (0.0%) | 12/1204 (1.0%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cuscuta europaea クシロネナシカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/✓ | Yes (1) | Contig, Reference | 976 Mbp 41 | 475 17.9 Mbp | 1 | 7 | 21 | 4/193 (2.1%) | 12/1204 (1.0%) | 2022-11-27 |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Solanum miyakojimense イラブナスビ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 237 | 313 | 65/1090 (6.0%) | 97/2488 (3.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ligustrum tamakii トゲイボタ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 79 | 1/45 (2.2%) | 43/595 (7.2%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aeschynanthus acuminatus ナガミカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/64 (0.0%) | 9/2432 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lysionotus apicidens タイワンシシンラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/36 (0.0%) | 9/2432 (0.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Veronicastrum liukiuense リュウキュウスズカケ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 54 | 0/16 (0.0%) | 40/1689 (2.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Veronicastrum villosulum スズカケソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 54 | 0/16 (0.0%) | 40/1689 (2.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Torenia concolor ツルウリクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/28 (0.0%) | 3/143 (2.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ajuga boninsimae シマカコソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 91 | 2/43 (4.7%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Amethystea caerulea ルリハッカ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 91 | 0/1 (0.0%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callicarpa formosana ホウライムラサキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 91 | 1/74 (1.4%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callicarpa glabra シマムラサキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 91 | 1/74 (1.4%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Callicarpa pilosissima ホソバムラサキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 91 | 1/74 (1.4%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Coleus formosanus ケサヤバナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 91 | 0/67 (0.0%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Scutellaria kikai-insularis ヒメタツナミソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 91 | 4/278 (1.4%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Teucrium veronicoides var. brachytrichum イヌニガクサ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 91 | 1/115 (0.9%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vitex bicolor ヤエヤマハマゴウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 91 | 0/83 (0.0%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Vitex quinata オオニンジンボク | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 91 | 0/83 (0.0%) | 55/4388 (1.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euphrasia multifolia var. inaensis イナコゴメグサ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 3/109 (2.8%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Euphrasia pectinata var. obtusiserrata エゾノダッタンコゴメグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 20 | 3/109 (2.8%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pedicularis koidzumiana ベニシオガマ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/422 (0.0%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pedicularis spicata ホザキシオガマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/422 (0.0%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Rehmannia japonica センリゴマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 20 | 1/11 (9.1%) | 15/1423 (1.1%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Utricularia minutissima ヒメミミカキグサ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/213 (0.9%) | 5/352 (1.4%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Hemigraphis reptans ミヤコジマソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 11 | 0/22 (0.0%) | 6/1926 (0.3%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ilex dimorphophylla アマミヒイラギモチ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 3/343 (0.9%) | 3/346 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Ilex macrocarpa ヒロハタマミズキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 3/343 (0.9%) | 3/346 (0.9%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Adenophora hatsushimae ツクシイワシャジン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 15 | 1/67 (1.5%) | 11/1555 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Adenophora pereskiifolia var. yamadae ユウバリシャジン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 15 | 1/67 (1.5%) | 11/1555 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lobelia dopatrioides var. cantonensis タチミゾカクシ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 15 | 3/203 (1.5%) | 11/1555 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lobelia loochooensis マルバハタケムシロ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 15 | 3/203 (1.5%) | 11/1555 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Anaphalis sinica var. yakusimensis ヤクシマウスユキソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/83 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Antennaria dioica エゾノチチコグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/40 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aster ujiinsularis オオイソノギク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/158 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Aster yakushimensis ヤクシマノギク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/158 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium akimotoi シライワアザミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium apoense アポイアザミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium japonicum var. australe タカサゴアザミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium katoanum ウゼンヒメアザミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium lucens var. bracteosum ヘイケモリアザミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium magofukui イナベアザミ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium masami-saitoanum ヒュウガアザミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium nippoense ニッポウアザミ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 2/243 (0.8%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Cirsium segetum アレチアザミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/1 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crepidiastrum grandicollum コヘラナレン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/14 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Crepis hokkaidoensis フタマタタンポポ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/111 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Erigeron miyabeanus ミヤマノギク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 3/185 (1.6%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eschenbachia aegyptiaca キクバイズハハコ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/4 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lagenophora lanata コケセンボンギク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/16 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Parasenecio hastatus subsp. orientalis var. nantaicus ニッコウコウモリ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/54 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pertya yakushimensis シマコウヤボウキ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/8 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saussurea insularis シマトウヒレン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 204 | 2/371 (0.5%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saussurea mikurasimensis ミクラジマトウヒレン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 204 | 2/371 (0.5%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Saussurea nipponica subsp. savatieri var. yakusimensis ヤクシマヒゴタイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 204 | 2/371 (0.5%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Scorzonera rebunensis フタナミソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 204 | 0/42 (0.0%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Solidago yambaruensis ヤンバルアオヤギバナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 204 | 3/138 (2.2%) | 116/16466 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Abelia chinensis var. ionandra タイワンツクバネウツギ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/10 (0.0%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Diabelia serrata f. tomentosa オニツクバネウツギ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/5 (0.0%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lonicera fragrantissima ツシマヒョウタンボク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 7 | 2/175 (1.1%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lonicera japonica var. miyagusukiana ヒメスイカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 7 | 2/175 (1.1%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Lonicera uzenensis ウゼンベニバナヒョウタンボク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 7 | 2/175 (1.1%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Patrinia triloba var. kozushimensis シマキンレイカ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/13 (0.0%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Triosteum pinnatifidum ホザキツキヌキソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/10 (0.0%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Weigela florida オオベニウツギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 7 | 0/11 (0.0%) | 5/687 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Pittosporum parvifolium コバトベラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/109 (0.9%) | 1/135 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Eleitherococcus trifoliatus ミツバウコギ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angelica cryptotaeniifolia var. cryptotaeniifolia ミヤマノダケ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/109 (0.9%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angelica cryptotaeniifolia var. kyushiana ツクシミヤマノダケ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/109 (0.9%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angelica pseudoshikokiana ツクシトウキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/109 (0.9%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Angelica sinanomontana シナノノダケ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 31 | 1/109 (0.9%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Bupleurum quadriradiatum フジワラサイコ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/103 (0.0%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Heracleum lanatum subsp. akasimontanum ホソバハナウド | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 31 | 2/100 (2.0%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Peucedanum multivittatum var. linearilobum エゾノハクサンボウフウ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/67 (0.0%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Sanicula lamelligera var. wakayamensis キイウマノミツバ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/47 (4.3%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| CR 絶滅危惧ⅠＡ類（CR） | Tilingia tsusimensis ツシマノダケ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/1 (0.0%) | 21/3141 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lycopodium alpinum チシマヒカゲノカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/✓ | Yes (2) | Chromosome, Reference | 3.08 Gbp 45 | 6,242 1.14 Mbp | 2 | 3 | 3 | 2/32 (6.2%) | 2/328 (0.6%) | 2025-03-28 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phlegmariurus phlegmaria ヨウラクヒバ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phlegmariurus sieboldii ヒモラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/189 (0.0%) | 2/328 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Isoetes coreana オオバシナミズニラ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 2/205 (1.0%) | 2/205 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Botrychium microphyllum イブリハナワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/16 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Helminthostachys zeylanica ミヤコジマハナワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/1 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ophioglossum kawamurae サクラジマハナヤスリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/50 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ophioglossum pendulum コブラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/143 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crepidomanes bonincola ムニンホラゴケ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/32 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hymenophyllum mikawanum ミカワコケシノブ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/184 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vandenboschia maxima シノブホラゴケ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/139 (0.0%) | 0/453 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schizaea dichotoma カンザシワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/28 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Azolla japonica オオアカウキクサ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 10 | 7/20 (35.0%) | 7/43 (16.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Azolla pinnata subsp. asiatica アカウキクサ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 1 | 10 | 10 | 7/20 (35.0%) | 7/43 (16.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Marsilea minuta ナンゴクデンジソウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/40 (0.0%) | 0/46 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cyathea ogurae メヘゴ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/34 (0.0%) | 0/480 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lindsaea simulans ウチワホングウシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/151 (0.0%) | 0/200 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acrostichum aureum ミミモチシダ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/5 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Adiantum capillus-junonis ホウライクジャク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/235 (0.9%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Adiantum edgeworthii オトメクジャク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 5 | 2/235 (0.9%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteris formosana タイワンアマクサシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteris maclurei ヒノタニシダ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteris setulosocostulata トゲハチジョウシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteris tokioi ヒカゲアマクサシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pteris yamatensis ヒメイノモトソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/258 (0.0%) | 3/1175 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Monachosorum x arakii ヒメムカゴシダ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/6 (0.0%) | 0/173 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asplenium formosae マキノシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/454 (0.0%) | 0/504 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Athyrium nudum ホソバシケチシダ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Athyrium strigillosum コモチイヌワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Athyrium subrigescens ホウライイヌワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Athyrium tozanense シマイヌワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Athyrium viridescentipes アオグキイヌワラビ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/127 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Deparia otomasui アソシケシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/70 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Diplazium okudairae イヨクジャク | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/241 (0.0%) | 0/445 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Thelypteris uraiensis タイワンハリガネワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/8 (0.0%) | 0/637 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ctenitis microlepigera コキンモウイノデ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/68 (0.0%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dryopteris hendersonii ホウライヒメワラビ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dryopteris insularis ムニンベニシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dryopteris polita タイトウベニシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dryopteris purpurella ムラサキベニシダ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dryopteris tsushimensis ツシマミサキカグマ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/419 (0.2%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Polystichum atkinsonii センジョウデンダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Polystichum lonchitis ヒイラギデンダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/255 (0.4%) | 4/1413 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Goniophlebium formosanum タイワンアオネカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/17 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lepisorus fortunei オオクリハラン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/86 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lepisorus miyoshianus クラガリシダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/86 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Microsorum rubidum タカウラボシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/32 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Oreogrammitis dorsipila ヒメウラボシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/40 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Polypodium vulgare オオエゾデンダ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/7 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/56 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Selliguea yakuinsularis ヤクシマウラボシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/72 (0.0%) | 0/1339 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Picea koyamae ヤツガタケトウヒ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 37 | 5/55 (9.1%) | 16/328 (4.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pinus amamiana ヤクタネゴヨウ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 37 | 6/155 (3.9%) | 16/328 (4.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nuphar oguraensis var. oguraensis オグラコウホネ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 5 | 1/22 (4.5%) | 4/156 (2.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Peperomia japonica var. okinawensis オキナワスナゴショウ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 3 | 0/383 (0.0%) | 3/1110 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum celsum ミヤビカンアオイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum curvistigma カギガタアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum dilatatum スエヒロアオイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum hatsushimae ハツシマカンアオイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum kooyanum コウヤカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum kumageanum var. satakeanum ムラクモアオイ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum kurosawae イワタカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum majale コトウカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum misandrum アソサイシン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum sakawanum var. stellatum ホシザキカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum subglobosum マルミカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum trigynum サンコカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum trinacriforme カケロマカンアオイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asarum yaeyamense ヤエヤマカンアオイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/165 (0.0%) | 0/166 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cassytha pergracilis イトスナヅル | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/11 (0.0%) | 10/1586 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Machilus pseudokobu テリハコブガシ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/91 (0.0%) | 10/1586 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Neolitsea sericea var. argentea ダイトウシロダモ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/81 (0.0%) | 10/1586 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema abei ツルギテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema heterocephalum subsp. heterocephalum アマミテンナンショウ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema iyoanum subsp. nakaianum シコクテンナンショウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema longipedunculatum var. yakumontanum ヤクシマヒロハテンナンショウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema minus ハリママムシグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema nikoense subsp. australe オオミネテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema nikoense subsp. brevicollum カミコウチテンナンショウ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arisaema sachalinense カラフトヒロハテンナンショウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/150 (0.0%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lemna trisulca ヒンジモ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 26 | 1/21 (4.8%) | 12/1775 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tofieldia coccinea var. akkana アッカゼキショウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 1/22 (4.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tofieldia coccinea var. geibiensis ゲイビゼキショウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/13 (0.0%) | 1/22 (4.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Alisma rariflorum トウゴクヘラオモダカ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 2 | 1/11 (9.1%) | 1/142 (0.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Enhalus acoroides ウミショウブ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/1 (0.0%) | 3/218 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Najas ancistrocarpa ムサシモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/30 (0.0%) | 3/218 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Petrosavia sakuraii サクライソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/5 (0.0%) | 0/6 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dioscorea asclepiadea ツクシタチドコロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 14 | 15 | 5/344 (1.5%) | 6/349 (1.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sciaphila megastyla タナカソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/18 (0.0%) | 0/29 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Freycinetia williamsii ヒメツルアダン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1 | 0/37 (0.0%) | 1/292 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Chionographis hisauchiana subsp. minoensis ミノシライトソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 2 | 1/4 (25.0%) | 2/203 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trillium channellii カワユエンレイソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 2 | 0/53 (0.0%) | 2/203 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Smilax bracteata var. verruculosa アラガタオオサンキライ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/197 (0.5%) | 1/200 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Fritillaria kaiensis カイコバイモ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/140 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gagea japonica ヒメアマナ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/159 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lilium concolor ヒメユリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/153 (0.7%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lilium japonicum var. abeanum ジンリョウユリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 9 | 1/153 (0.7%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tricyrtis ishiiana var. ishiiana サガミジョウロウホトトギス | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/35 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tricyrtis ishiiana var. surugensis スルガジョウロウホトトギス | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/35 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tricyrtis perfoliata キバナノツキヌキホトトギス | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 9 | 0/35 (0.0%) | 9/760 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aphyllorchis montana タネガシマムヨウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/7 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Apostasia nipponica ヤクシマラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/16 (12.5%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arundina graminifolia ナリヤラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calanthe aristulifera キリシマエビネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calanthe formosana タイワンエビネ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calanthe izuinsularis オオキリシマエビネ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calanthe tokunoshimensis トクノシマエビネ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/78 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calypso bulbosa var. speciosa ホテイラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/1 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crepidium hahajimense ハハジマホザキラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/28 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crepidium kandae カンダヒメラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/28 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dendrobium okinawense オキナワセッコク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 31 | 7/515 (1.4%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Didymoplexis micradenia ヒメヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Didymoplexis siamensis コカゲラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ephippianthus sawadanus ハコネラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Epipogium aphyllum トラキチラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Epipogium japonicum アオキラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/2 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrochilus ciliaris マツゲカヤラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/59 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia albida ヤクシマヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia amamiana アマミヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia boninensis ムニンヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia clausa ツボミヤツシロラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia elata var. pallens シロテンマ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia foetida フユザキヤツシロラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia fontinalis トカラヤツシロラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia gracilis ナヨテンマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gastrodia uraiensis タブガワヤツシロラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 1/28 (3.6%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Geodorum densiflorum トサカメオトラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/6 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Goodyera pendula f. brachyphylla ヒロハツリシュスラン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/61 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria dentata ダイサギソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria iyoensis イヨトンボ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria linearifolia var. linearifolia オオミズトンボ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria pantlingiana リュウキュウサギソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria radiata ヤチラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Habenaria stenopetala テツオサギソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/322 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hemipilia fujisanensis フジチドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/20 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hemipilia keiskei イワチドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/20 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lecanorchis taiwaniana ムロトムヨウラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/14 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Liparis koreojaponica オオフガクスズムシソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Liparis krameri var. shichitoana ヒメジガバチソウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/142 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Luisia boninensis ムニンボウラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/20 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Neottia inagakii タンザワサカネラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/42 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Oberonia anthropophora var. arisanensis クスクスヨウラクラン | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/64 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Oberonia makinoi オオバヨウラクラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/64 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Odontochilus hatusimanus ハツシマラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/17 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Peristylus densus ムカゴトンボ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/30 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pinalia ovata var. ovata リュウキュウセッコク | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/27 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platanthera boninensis シマツレサギソウ | EN | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platanthera iinumae イイヌマムカゴ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platanthera stenoglossa subsp. iriomotensis イリオモテトンボソウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Platanthera takedae subsp. uzenensis ガッサンチドリ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 31 | 2/116 (1.7%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sedirea japonica ナゴラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 31 | 3/90 (3.3%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tropidia nipponica var. hachijoensis ハチジョウネッタイラン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/11 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tropidia nipponica var. nipponica ヤクシマネッタイラン | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/11 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tropidia somae アコウネッタイラン | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/11 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vrydagzynea nuda ミソボシラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/10 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Yoania amagiensis キバナノショウキラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/5 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Yoania flava シナノショウキラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/5 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Zeuxine affinis アオジクキヌラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/16 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Zeuxine odorata ジャコウキヌラン | NT | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 31 | 0/16 (0.0%) | 24/11707 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Iris setosa var. hondoensis キリガミネヒオウギアヤメ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 21 | 5/305 (1.6%) | 18/1507 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Iris setosa var. nasuensis ナスヒオウギアヤメ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 21 | 5/305 (1.6%) | 18/1507 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Allium togashii カンカケイニラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/661 (0.5%) | 5/1539 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Allium virgunculae var. koshikiense コシキイトラッキョウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/661 (0.5%) | 5/1539 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Allium virgunculae var. yakushimense ヤクシマイトラッキョウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 9 | 3/661 (0.5%) | 5/1539 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Asparagus oligoclonos タマボウキ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 19 | 4/269 (1.5%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hosta alata ブンゴギボウシ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hosta hypoleuca ウラジロギボウシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hosta minazukiflora ミナズキギボウシ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hosta pulchella ウバタケギボウシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hosta pycnophylla セトウチギボウシ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/47 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ophiopogon reversus ヨナグニノシラン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/51 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Polygonatum cryptanthum ウスギワニグチソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 19 | 0/69 (0.0%) | 15/1623 (0.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon mikawanum var. azumianum アズミイヌノヒゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon mikawanum var. mikawanum ミカワイヌノヒゲ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon miquelianum var. lutchuense オキナワホシクサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon miquelianum var. ozense ユキイヌノヒゲ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon omuranum オオムラホシクサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon ozense ハライヌノヒゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eriocaulon taquetii var. zyotanii イズノシマホシクサ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1 | 1/178 (0.6%) | 1/526 (0.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Juncus hizenensis ヒゼンコウガイゼキショウ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 16 | 4/164 (2.4%) | 6/286 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Juncus mertensianus エゾノミクリゼキショウ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 16 | 4/164 (2.4%) | 6/286 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Juncus tokubuchii ホロムイコウガイ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 12 | 16 | 4/164 (2.4%) | 6/286 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex aphyllopus var. impura ヒルゼンスゲ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex arisanensis アリサンタマツリスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex bigelowii オハグロスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/10 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex bohemica カヤツリスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex chichijimensis チチジマナキリスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex collifera リュウキュウヒエスゲ | CR | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex cruciata ハナビスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex fuscidula タカネシバスゲ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex genkaiensis ゲンカイモエギスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex gynocrates カンチスゲ | LC | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex laevissima ヒメミコシガヤ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex latisquamea ハタベスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex longistipes タイワンカンスゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex mackenziei ノルゲスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex melanocarpa タカネヒメスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex paxii キビノミノボロスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex peiktusani マンシュウクロカワスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex pseudocyperus クグスゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex pseudololiacea ヒロハイッポンスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex ramenskii ウシオスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex rupestris カラフトイワスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/10 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex stylosa ラウススゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex subcernua ツクシナルコ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex tsushimensis ツシマスゲ | DD | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex uda エゾハリスゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Carex vaginata サヤスゲ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/7 | —/— | No | — | — | — | 0 | 42 | 76 | 25/1666 (1.5%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cyperus rotundus var. yoshinagae トサノハマスゲ | — | ✓ | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 2 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cyperus unioloides ムギガラガヤツリ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 4/386 (1.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Eleocharis acutangula ミスミイ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 76 | 3/184 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Fimbristylis longispica var. hahajimensis ハハジマテンツキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Fimbristylis stauntonii ハタケテンツキ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Fimbristylis umbellaris ハナシテンツキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/66 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhynchospora japonica var. curvoaristata ムニンイヌノハナヒゲ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 76 | 3/192 (1.6%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schoenoplectiella mucronata var. ishizawae ロッカクイ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 76 | 0/37 (0.0%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schoenoplectus subulatus イヌフトイ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 76 | 3/21 (14.3%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schoenus calostachyus イヘヤヒゲクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 76 | 1/131 (0.8%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Scirpus karuisawensis ヒメマツカサススキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 76 | 1/36 (2.8%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Scirpus rosthornii var. kiushuensis ツクシアブラガヤ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 76 | 1/36 (2.8%) | 45/3596 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Anthoxanthum pluriflorum var. pluriflorum エゾコウボウ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/43 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arundinella hirta var. livens シロケトダシバ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/28 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calamagrostis onibitoana オニビトノガリヤス | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/101 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calamagrostis purpurea subsp. amurensis アムールイワノガリヤス | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/101 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Calamagrostis tashiroi subsp. tashiroi タシロノガリヤス | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/101 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Deschampsia cespitosa var. levis ユウバリカニツリ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/40 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Digitaria platycarpha シマギョウギシバ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 1221 | 3/83 (3.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dupontiopsis hayachinensis ナンブソモソモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/1 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elymus gmelinii var. tenuisetus イヌカモジグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 1221 | 1/155 (0.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Festuca hondoensis ヤマオオウシノケグサ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 1221 | 3/355 (0.8%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Glyceria spiculosa ヌマドジョウツナギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/32 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ischaemum ischaemoides シマカモノハシ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/26 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Poa nemoralis タチイチゴツナギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/10 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 1221 | 6/373 (1.6%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ptilagrostis alpina ヒゲナガコメススキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/12 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Schizachne purpurascens subsp. callosa フォーリーガヤ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/2 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Torreyochloa natans ホソバドジョウツナギ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/1 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tripogon longearistatus フクロダガヤ | — | ✓ | — | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/14 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trisetum spicatum subsp. molle キタダケカニツリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 1221 | 0/33 (0.0%) | 201/8826 (2.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Corydalis ochotensis ツルキケマン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 16 | 1/318 (0.3%) | 12/672 (1.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Papaver fauriei リシリヒナゲシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 8 | 16 | 6/80 (7.5%) | 12/672 (1.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aconitum ciliare ハナカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aconitum misaoanum シレトコトリカブト | — | ✓ | — | — | — | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Aconitum yamazakii ダイセツトリカブト | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/229 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Anemone sikokiana シコクイチゲ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/139 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Clematis obvallata var. shikokiana シコクハンショウヅル | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/239 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Coptis minamitaniana ヒュウガオウレン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 3/19 (15.8%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Dichocarpum numajirianum コウヤシロカネソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/29 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pulsatilla nipponica ツクモグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 26 | 0/139 (0.0%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus altaicus subsp. shinanoalpinus タカネキンポウゲ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus kadzusensis ヒメバイカモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus kitadakeanus キタダケキンポウゲ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus nipponicus var. major オオイチョウバイカモ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus pygmaeus クモマキンポウゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Ranunculus yezoensis チトセバイカモ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 26 | 4/439 (0.9%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Thalictrum filamentosum オオミヤマカラマツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Thalictrum toyamae ヒレフリカラマツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Thalictrum watanabei タマカラマツ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 26 | 2/139 (1.4%) | 15/1962 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sabia japonica アオカズラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/21 (0.0%) | 0/100 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Astilbe platyphylla モミジバショウマ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/31 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Micranthes laciniata クモマユキノシタ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/74 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Micranthes nelsoniana var. reniformis チシマイワブキ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 5 | 0/74 (0.0%) | 4/825 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Saxifraga acerifolia エチゼンダイモンジソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 5 | 2/498 (0.4%) | 4/825 (0.5%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hylotelephium pallescens ムラサキベンケイソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/26 (0.0%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hylotelephium sieboldii var. ettyuense エッチュウミセバヤ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/26 (0.0%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hylotelephium sieboldii var. sieboldii ミセバヤ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/26 (0.0%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sedum boninense ムニンタイトゴメ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 20 | 2/261 (0.8%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sedum kawaraense カワラマンネングサ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 20 | 2/261 (0.8%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sedum zentaro-tashiroi ヒメマンネングサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 20 | 2/261 (0.8%) | 16/1284 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Gonocarpus chinensis ナガバアリノトウグサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/36 (0.0%) | 3/146 (2.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vitis kiusiana クマガワブドウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 301 | 303 | 38/248 (15.3%) | 40/847 (4.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vitis shiragae シラガブドウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 301 | 303 | 38/248 (15.3%) | 40/847 (4.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tribulus terrestris ハマビシ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/8 | —/✓ | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/33 (0.0%) | 0/270 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Albizia kalkora オオバネムノキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/131 (0.8%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Albizia retusa ヤエヤマネムノキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/131 (0.8%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Astragalus schelichovii カラフトモメンヅル | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 407 | 3/1627 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Astragalus tokachiensis トカチオウギ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 407 | 3/1627 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Astragalus yamamotoi カリバオウギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 407 | 3/1627 (0.2%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hedysarum hedysaroides カラフトゲンゲ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/157 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Indigofera kirilowii チョウセンニワフジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/508 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lespedeza argyrophylla コシキジマハギ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/65 (1.5%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Oxytropis japonica var. sericea エゾオヤマノエンドウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/279 (0.4%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Oxytropis shokanbetsuensis マシケゲンゲ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 407 | 1/279 (0.4%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Uraria lagopodoides オオバフジボグサ | — | ✓ | — | ✓ | — | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 407 | 0/9 (0.0%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vigna minima var. minima ヒメツルアズキ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 35 | 407 | 9/95 (9.5%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Vigna vexillata var. tsusimensis アカササゲ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 35 | 407 | 9/95 (9.5%) | 170/16273 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cerasus sargentii var. akimotoi キリタチヤマザクラ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 62 | 388 | 21/389 (5.4%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Crataegus chlorosarca クロミサンザシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 388 | 2/251 (0.8%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Fragaria nipponica var. yakusimensis ヤクシマシロバナヘビイチゴ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 1 | 30 | 388 | 8/36 (22.2%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Malus spontanea ノカイドウ | CR | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 180 | 388 | 35/96 (36.5%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Potentilla matsumurae var. yuparensis ユウバリキンバイ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 388 | 2/389 (0.5%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Prunus hisauchiana ヤブザクラ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 62 | 388 | 21/389 (5.4%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Prunus incisa var. bukosanensis ブコウマメザクラ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 62 | 388 | 21/389 (5.4%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Prunus tamaclivorum ホシザクラ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 62 | 388 | 21/389 (5.4%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pyrus calleryana マメナシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 20 | 388 | 9/74 (12.2%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Pyrus ussuriensis var. ussuriensis ミチノクナシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 20 | 388 | 9/74 (12.2%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhodotypos scandens シロヤマブキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 388 | 0/1 (0.0%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rubus chingii ゴショイチゴ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | ✓/✓ | No | — | — | — | 0 | 14 | 388 | 7/753 (0.9%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Sanguisorba japonensis エゾノトウウチソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 388 | 0/24 (0.0%) | 122/3866 (3.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaeagnus takeshitae カツラギグミ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 3/77 (3.9%) | 8/92 (8.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaeagnus yakusimensis ヤクシマグミ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 3 | 9 | 3/77 (3.9%) | 8/92 (8.7%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rhamnus ishidae ミヤマハンモドキ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 20 | 0/120 (0.0%) | 6/928 (0.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elatostema lineolatum var. majus ホソバノキミズ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/211 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elatostema platyphyllum ランダイミズ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/211 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lecanthus peduncularis チョクザキミズ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/2 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Nanocnide pilosa トウカテンソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 12 | 0/8 (0.0%) | 4/1111 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Betula apoiensis アポイカンバ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 24 | 2/87 (2.3%) | 13/215 (6.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Trichosanthes ovigera var. boninensis ムニンカラスウリ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 214 | 5/107 (4.7%) | 109/970 (11.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Elaeocarpus multiflorus ナガバコバンモチ | LC | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 4 | 1/136 (0.7%) | 2/262 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Discocleidion ulmifolium エノキフジ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 94 | 0/2 (0.0%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Euphorbia hirta var. glaberrima テリハニシキソウ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Euphorbia pekinensis subsp. asoensis アソタイゲキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Euphorbia sparrmannii ボロジノニシキソウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 24 | 94 | 17/1299 (1.3%) | 48/3677 (1.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Phyllanthus liukiuensis ハナコミカンボク | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 4 | 0/23 (0.0%) | 3/919 (0.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Salix nakamurana subsp. yezoalpina エゾノタカネヤナギ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 39 | 78 | 15/463 (3.2%) | 34/887 (3.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Viola epipsiloides タニマスミレ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Viola sacchalinensis f. alpina アポイタチツボスミレ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Viola thibaudieri タデスミレ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Viola utchinensis オキナワスミレ | CR | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 9 | 9 | 5/413 (1.2%) | 5/650 (0.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydrobryum puncticulatum ヤクシマカワゴロモ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 0 | 0/41 (0.0%) | 0/404 (0.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hypericum ascyron subsp. ascyron var. longistylum コウライトモエソウ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 13 | 6/368 (1.6%) | 6/439 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hypericum oliganthum アゼオトギリ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/1 | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 13 | 6/368 (1.6%) | 6/439 (1.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Geranium shikokianum var. kaimontanum カイフウロ | — | ✓ | ✓ | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 37 | 10/185 (5.4%) | 30/531 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Geranium shikokianum var. yoshiianum ヤクシマフウロ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 37 | 10/185 (5.4%) | 30/531 (5.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Lumnitzera racemosa ヒルギモドキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | Yes (1) | Scaffold, Reference | 1.32 Gbp 124 | 2,239 37.2 Mbp | 1 | 2 | 5 | 2/3 (66.7%) | 5/293 (1.7%) | 2022-07-05 |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rotala rotundifolia ホザキキカシグサ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 23 | 0/22 (0.0%) | 10/414 (2.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Melastoma tetramerum var. pentapetalum ハハジマノボタン | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 4/60 (6.7%) | 4/3333 (0.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Choerospondias axillaris チャンチンモドキ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 13 | 0/1 (0.0%) | 6/578 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acer miyabei f. shibatae シバタカエデ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 26 | 4/169 (2.4%) | 12/1230 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Acer pictum subsp. taishakuense タイシャクイタヤ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 7 | 26 | 4/169 (2.4%) | 12/1230 (1.0%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Melicope grisea var. crassifolia アツバシロテツ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 110 | 0/146 (0.0%) | 39/1483 (2.6%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Tilia mandshurica var. rufovillosa ツクシボダイジュ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 1 | 150 | 1/41 (2.4%) | 73/2554 (2.9%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Daphnimorpha capitellata ツチビノキ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 8 | 0/2 (0.0%) | 7/567 (1.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arabidopsis halleri subsp. gemmifera var. umezawana リシリハタザオ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 6 | 395 | 655 | 6/27 (22.2%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardamine arakiana オオマルバコンロンソウ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 655 | 8/230 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardamine kiusiana タカチホガラシ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 655 | 8/230 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardamine pratensis ハナタネツケバナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 655 | 8/230 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardamine schinziana エゾノジャニンジン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 655 | 8/230 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardamine trifida ミヤウチソウ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 13 | 655 | 8/230 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cochlearia oblongifolia トモシリソウ | — | ✓ | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 3/21 (14.3%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba japonica ナンブイヌナズナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba kitadakensis キタダケナズナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba oiana ヤツガタケナズナ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba sachalinensis var. sachalinensis モイワナズナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba sakuraii var. sakuraii トガクシナズナ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Draba shiroumana シロウマナズナ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 2/378 (0.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Isatis tinctoria var. tinctoria ハマタイセイ | — | — | — | — | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 3 | 4 | 655 | 2/40 (5.0%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Noccaea cochleariformis タカネグンバイ | — | ✓ | ✓ | ✓ | — | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 655 | 3/86 (3.5%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Subularia aquatica ハリナズナ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/6 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 655 | 0/2 (0.0%) | 116/3500 (3.3%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Santalum boninense ムニンビャクダン | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/3 | —/— | No | — | — | — | 0 | 5 | 5 | 1/21 (4.8%) | 1/46 (2.2%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Persicaria pulchra アラゲタデ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 32 | 2/138 (1.4%) | 18/987 (1.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rumex nepalensis subsp. andreaeanus キブネダイオウ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 32 | 4/124 (3.2%) | 18/987 (1.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Rumex trisetifer ニセコガネギシギシ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/4 | —/— | No | — | — | — | 0 | 4 | 32 | 4/124 (3.2%) | 18/987 (1.8%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Arenaria katoana var. lanceolata アポイツメクサ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 2 | 36 | 1/103 (1.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Minuartia biflora ハイツメクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ✓/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/18 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Silene hidaka-alpina カムイビランジ | — | — | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Silene repens var. latifolia チシママンテマ | — | — | — | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Silene repens var. repens カラフトマンテマ | — | — | — | ✓ | — | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 10 | 36 | 7/614 (1.1%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stellaria diandra var. yakumontana ヤクシマサワハコベ | — | — | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/1 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stellaria humifusa エゾハコベ | LC | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/5 | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/172 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Stellaria pterosperma エゾイワツメクサ | — | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 36 | 0/172 (0.0%) | 23/2130 (1.1%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Cardiandra amamiohsimensis アマミクサアジサイ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/2 | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 1/136 (0.7%) | 1/262 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Deutzia yaeyamensis ヤエヤマヒメウツギ | EN | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 0 | 6 | 0/74 (0.0%) | 1/262 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydrangea acuminata subsp. yakushimensis ヤクシマルリアジサイ | — | ✓ | — | — | ✓ | —/— | —/— | No | — | — | — | 0 | 6 | 6 | 1/136 (0.7%) | 1/262 (0.4%) | — |
| EN 絶滅危惧ⅠB類（EN） | Hydrangea marunoi キモツキクサアジサイ | — | ✓</ | |||||||||||||||