Genome sequence data availability
for the Japanese Red List

Updated on 2026-05-08

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sorex minutissimus hawkeri　
トウキョウトガリネズミ		——————/——/—No———011206/77 (7.8%)13/535 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhinolophus perditus
ヤエヤマコキクガシラコウモリ		EN✓✓✓✓—/——/—No———021219/176 (5.1%)9/180 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eptesicus japonensis
クビワコウモリ		VU✓—✓——/——/—No———03781/29 (3.4%)44/913 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myotis gracilis
ウスリホオヒゲコウモリ		—✓————/——/—No———0337822/379 (5.8%)44/913 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myotis nattereri bombinus
ホンドノレンコウモリ		NT✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0337822/379 (5.8%)44/913 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myotis pruinosus
クロホオヒゲコウモリ		EN✓✓✓——/——/—No———0337822/379 (5.8%)44/913 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nyctalus aviator
ヤマコウモリ		NT✓✓✓✓—/—✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.78 Gbp
380		337
61.2 Mbp		13782/8 (25.0%)44/913 (4.8%)2024-05-31
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pipistrellus endoi
モリアブラコウモリ		NT✓✓✓✓—/——/—No———015786/75 (8.0%)44/913 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tadarida insignis
オヒキコウモリ		DD✓✓✓✓✓/——/—No———05162/9 (22.2%)7/154 (4.5%)—

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Coturnix japonica
ウズラ		NT✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (5)Chromosome,
Reference		928 Mbp
73		9,641
511 kbp		581172/16 (12.5%)36/208 (17.3%)2016-03-01
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anas formosa
トモエガモ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.15 Gbp
100		112
36.5 Mbp		223251/1 (100.0%)135/213 (63.4%)2024-04-22
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anser fabalis serrirostris
ヒシクイ		—✓✓✓✓—/——/—No———03632510/16 (62.5%)135/213 (63.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Branta bernicla orientalis
コクガン		—✓✓✓✓—/——/✓No———3183256/10 (60.0%)135/213 (63.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tadorna tadorna
ツクシガモ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
165		35,056
169 kbp		3103256/7 (85.7%)135/213 (63.4%)2024-12-06
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phoebastria albatrus
アホウドリ		VU✓✓✓✓✓/9✓/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.21 Gbp
44		36,840
68.7 kbp		27114/6 (66.7%)7/25 (28.0%)2020-08-22
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oceanodroma monorhis
ヒメクロウミツバメ		NT✓✓✓✓✓/——/✓No———0302/15 (13.3%)0—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gorsachius goisagi
ミゾゴイ		VU✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.19 Gbp
103		100,190
43.0 kbp		13232/4 (50.0%)14/68 (20.6%)2021-03-31
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gorsachius melanolophus
ズグロミゾゴイ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———03232/4 (50.0%)14/68 (20.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Grus japonensis
タンチョウ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Scaffold,
Reference		1.22 Gbp
100		603
19.9 Mbp		313235/7 (71.4%)10/16 (62.5%)2019-05-08
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Grus monacha
ナベヅル		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
67		95,217
38.5 kbp		113235/7 (71.4%)10/16 (62.5%)2020-04-08
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Grus vipio
マナヅル		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
54		107,175
32.9 kbp		13232/4 (50.0%)10/16 (62.5%)2020-04-08
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Charadrius alexandrinus dealbatus
シロチドリ		—✓✓✓✓—/——/—No———06285/24 (20.8%)16/85 (18.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Himantopus himantopus himantopus
セイタカシギ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———1232/6 (33.3%)3/11 (27.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limosa lapponica baueri
オオソリハシシギ		—✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.03 Gbp
71		139,617
21.3 kbp		141053/4 (75.0%)58/89 (65.2%)2017-12-15
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Numenius madagascariensis
ホウロクシギ		EN✓✓✓✓✓/—✓/✓No———081052/9 (22.2%)58/89 (65.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scolopax mira
アマミヤマシギ		VU✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.09 Gbp
55		79,353
61.2 kbp		181054/4 (100.0%)58/89 (65.2%)2019-02-15
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tringa erythropus
ツルシギ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.09 Gbp
184		43,941
198 kbp		21910511/16 (68.8%)58/89 (65.2%)2024-12-06
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tringa glareola
タカブシギ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
—		1.36 Gbp
182		91,607
149 kbp		11910511/16 (68.8%)58/89 (65.2%)2026-04-03
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tringa totanus ussuriensis
アカアシシギ		——✓✓✓—/——/—No———21910511/16 (68.8%)58/89 (65.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rostratula benghalensis benghalensis
タマシギ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———1121/1 (100.0%)2/2 (100.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Glareola maldivarum
ツバメチドリ		LC✓✓✓✓✓/——/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.19 Gbp
235		95,502
182 kbp		2472/5 (40.0%)4/11 (36.4%)2026-02-04
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Larus saundersi
ズグロカモメ		VU✓✓✓✓—/——/✓No———09894/12 (33.3%)42/105 (40.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sterna albifrons sinensis
コアジサシ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———22891/7 (14.3%)42/105 (40.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sterna bergii cristata
オオアジサシ		—✓✓✓✓—/——/—No———01891/8 (12.5%)42/105 (40.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sterna dougallii bangsi
ベニアジサシ		—✓✓✓✓—/——/✓No———04892/10 (20.0%)42/105 (40.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sterna sumatrana
エリグロアジサシ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———04892/10 (20.0%)42/105 (40.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cepphus carbo
ケイマフリ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———01171/3 (33.3%)9/23 (39.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Synthliboramphus wumizusume
カンムリウミスズメ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———01171/4 (25.0%)9/23 (39.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Butastur indicus
サシバ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
75		67,994
36.2 kbp		132173/4 (75.0%)151/276 (54.7%)2022-12-09
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haliaeetus albicilla albicilla
オジロワシ		—✓✓✓✓—/——/—No———5102176/10 (60.0%)151/276 (54.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haliaeetus pelagicus
オオワシ		VU✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
49		33,489
86.6 kbp		1102176/10 (60.0%)151/276 (54.7%)2020-08-22
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Otus elegans interpositus
ダイトウコノハズク		——✓✓✓✓/——/—No———1176516/39 (41.0%)43/188 (22.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Otus lempiji pryeri
リュウキュウオオコノハズク		—✓————/——/—No———1176516/39 (41.0%)43/188 (22.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dendrocopos leucotos owstoni
オーストンオオアカゲラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———02352/14 (14.3%)21/227 (9.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dryocopus martius martius
クマゲラ		—✓✓✓✓—/——/✓No———22351/6 (16.7%)21/227 (9.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Falco peregrinus japonensis
ハヤブサ		—✓✓✓✓—/——/—No———12697928/39 (71.8%)38/66 (57.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pericrocotus divaricatus divaricatus
サンショウクイ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0010/14 (0.0%)1/86 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phylloscopus ijimae
イイジマムシクイ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0222312/86 (14.0%)13/88 (14.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luscinia akahige tanensis
タネコマドリ		—✓————/——/—No———02771/6 (16.7%)51/303 (16.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luscinia komadori komadori
アカヒゲ		——————/——/—No———02771/6 (16.7%)51/303 (16.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zoothera dauma major
オオトラツグミ		LC—✓✓✓—/——/—No———22671/20 (5.0%)35/217 (16.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Emberiza yessoensis yessoensis
コジュリン		—✓✓✓✓—/——/—No———02814918/44 (40.9%)74/297 (24.9%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chelonia mydas mydas
アオウミガメ		———✓——/——/—No———33161/1 (100.0%)6/14 (42.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cuora flavomarginata evelynae
ヤエヤマセマルハコガメ		—✓✓✓✓—/——/✓No———0282/16 (12.5%)6/107 (5.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geoemyda japonica
リュウキュウヤマガメ		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———0080/2 (0.0%)6/107 (5.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mauremys mutica kami
ヤエヤマイシガメ		—✓✓✓✓—/——/—No———2382/20 (10.0%)6/107 (5.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Goniurosaurus kuroiwae kuroiwae
クロイワトカゲモドキ		—✓————/——/—No———0030/29 (0.0%)2/49 (4.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gekko yakuensis
ヤクヤモリ		NT✓✓✓✓—/——/—No———04184/117 (3.4%)14/1904 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemidactylus bowringii
タシロヤモリ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———03183/248 (1.2%)14/1904 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Perochirus ateles
ミナミトリシマヤモリ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———00180/2 (0.0%)14/1904 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diploderma polygonatum donan
ヨナグニキノボリトカゲ		——✓✓✓—/——/—No———00280/46 (0.0%)22/604 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diploderma polygonatum polygonatum
オキナワキノボリトカゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———00280/46 (0.0%)22/604 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Emoia atrocostata atrocostata
ミヤコトカゲ		——✓✓✓✓/——/—No———00580/38 (0.0%)32/1667 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plestiodon barbouri
バーバートカゲ		VU✓✓✓✓—/——/—No———02581/58 (1.7%)32/1667 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plestiodon kishinouyei
キシノウエトカゲ		VU✓✓✓✓—/——/—No———02581/58 (1.7%)32/1667 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plestiodon marginatus
オキナワトカゲ		NT✓✓✓✓—/——/—No———02581/58 (1.7%)32/1667 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Takydromus dorsalis
サキシマカナヘビ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———00490/24 (0.0%)26/416 (6.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zootoca vivipara
コモチカナヘビ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (5)Chromosome,
Reference		1.44 Gbp
34		731
3.45 Mbp		55491/2 (50.0%)26/416 (6.2%)2020-04-01
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calamaria pavimentata miyarai
ミヤラヒメヘビ		——✓✓✓—/——/—No———01801/18 (5.6%)63/1077 (5.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elaphe taeniura schmackeri
サキシマスジオ		——✓✓✓—/——/—No———01801/20 (5.0%)63/1077 (5.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Achalinus formosanus chigirai
ヤエヤマタカチホヘビ		——✓✓✓—/——/—No———0000/37 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Emydocephalus ijimae
イイジマウミヘビ		LC✓✓✓✓—/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.63 Gbp
82		171,534
18.5 kbp		11361/2 (50.0%)27/353 (7.6%)2019-01-09
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laticauda laticaudata
ヒロオウミヘビ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.56 Gbp
133		89,677
35.6 kbp		13362/7 (28.6%)27/353 (7.6%)2019-01-09
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laticauda semifasciata
エラブウミヘビ		NT✓✓✓✓✓/—✓/✓No———03362/7 (28.6%)27/353 (7.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sinomicrurus macclellandi iwasakii
イワサキワモンベニヘビ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/16 (0.0%)27/353 (7.6%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius bakan
ヤマグチサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius boulengeri
オオダイガハラサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius dunni
オオイタサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/✓No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius fossigenus
ヒガシヒダサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius guttatus
マホロバサンショウウオ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius ikioi
ベッコウサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius kuishiensis
イヨシマサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius nebulosus
カスミサンショウウオ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius okiensis
オキサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius oyamai
チクシブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius sematonotos
チュウゴクブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius setouchi
セトウチサンショウウオ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius stejnegeri
コガタブチサンショウウオ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius tokyoensis
トウキョウサンショウウオ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius utsunomiyaorum
ヒバサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hynobius vandenburghi
ヤマトサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Onychodactylus kinneburi
シコクハコネサンショウウオ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/15 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Andrias japonicus
オオサンショウウオ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Echinotriton andersoni
イボイモリ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00120/3 (0.0%)5/173 (2.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nidirana okinavana
ヤエヤマハラブチガエル		EN✓✓✓✓✓/—✓/—No———00290/45 (0.0%)18/781 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Odorrana amamiensis
アマミハナサキガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———00290/100 (0.0%)18/781 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Odorrana narina
ハナサキガエル		EN✓✓✓✓✓/——/—No———00290/100 (0.0%)18/781 (2.3%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lethenteron japonicum
カワヤツメ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.07 Gbp
87.8		4,710
1.60 Mbp		23242/14 (14.3%)10/484 (2.1%)2013-09-13
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lethenteron sp. N.
スナヤツメ北方種		——————/——/—No———03242/14 (14.3%)10/484 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lethenteron sp. S.
スナヤツメ南方種		——————/——/—No———03242/14 (14.3%)10/484 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Biwia zezera
ゼゼラ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00250/3 (0.0%)14/358 (3.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carassius buergeri subsp. 2
キンブナ		——————/——/—No———0161535/50 (10.0%)87/2457 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Opsariichthys uncirostris uncirostris
ハス		—✓—✓✓—/——/—No———07543/35 (8.6%)26/222 (11.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Squalidus chankaensis biwae
スゴモロコ		—✓✓✓✓—/——/—No———00250/17 (0.0%)14/358 (3.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Squalidus japonicus japonicus
デメモロコ		—✓✓✓✓—/——/—No———00250/17 (0.0%)14/358 (3.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cobitis matsubarae
ヤマトシマドジョウ		LC✓✓✓✓—/—✓/✓No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cobitis sp. BIWAE type D
トサシマドジョウ		—✓————/——/—No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cobitis striata striata
チュウガタスジシマドジョウ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Niwaella delicata
アジメドジョウ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tachysurus aurantiacus
アリアケギバチ		NT✓✓✓✓—/——/—No———09194/47 (8.5%)12/271 (4.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tachysurus tokiensis
ギバチ		LC✓✓✓—✓/—✓/—No———09194/47 (8.5%)12/271 (4.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liobagrus reinii
アカザ		LC✓✓✓✓✓/3—/—No———0111/28 (3.6%)1/55 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvelinus leucomaenis imbrius
ゴギ		—✓—✓✓—/——/✓No———010795/65 (7.7%)28/698 (4.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvelinus malma krascheninnikovi
オショロコマ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———010795/65 (7.7%)28/698 (4.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvelinus malma miyabei
ミヤベイワナ		—✓✓✓✓—/—✓/✓No———110795/65 (7.7%)28/698 (4.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pungitius tymensis
エゾトミヨ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———06212/47 (4.3%)6/60 (10.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oryzias latipes
ミナミメダカ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (36)Chromosome,
Reference		863 Mbp
68		27
36.1 Mbp		36474810/92 (10.9%)11/95 (11.6%)2007-04-26
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oryzias sakaizumii
キタノメダカ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0474810/92 (10.9%)11/95 (11.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acanthopagrus pacificus
ナンヨウチヌ		LC✓✓✓✓✓/2—/✓No———07292/29 (6.9%)17/177 (9.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cottus kazika
カマキリ（アユカケ）		LC✓—✓✓—/——/—No———00120/1 (0.0%)6/353 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Odontobutis hikimius
イシドンコ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0131/8 (12.5%)3/17 (17.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ophiocara porocephala
ホシマダラハゼ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00190/4 (0.0%)14/292 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acanthogobius hasta
ハゼクチ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00500/8 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acanthogobius insularis
ミナミアシシロハゼ		EN✓✓✓✓—/——/—No———00500/8 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acentrogobius viridipunctatus
キララハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/23 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Apocryptodon punctatus
タビラクチ		LC✓✓✓✓—/——/✓No———00500/4 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Caragobius urolepis
アサガラハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00500/1 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gymnogobius macrognathos
エドハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———01501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gymnogobius taranetzi
シンジコハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———01501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gymnogobius uchidai
チクゼンハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———01501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leucopsarion petersii
シロウオ		LC✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		783 Mbp
100		2,195
2.20 Mbp		11501/1 (100.0%)37/2671 (1.4%)2024-12-12
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luciogobius ryukyuensis
ミナミヒメミミズハゼ		NT✓✓✓✓—/——/—No———00500/43 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mugilogobius mertoni
ムジナハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———04501/32 (3.1%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Odontamblyopus lacepedii
ワラスボ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		963 Mbp
260		394
12.1 Mbp		23502/10 (20.0%)37/2671 (1.4%)2023-10-25
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pandaka lidwilli
マングローブゴマハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/6 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pandaka sp.
ゴマハゼ		—✓————/——/—No———00500/6 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parkraemeria saltator
ギンポハゼ		NT✓✓✓✓—/——/—No———00500/1 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudogobius masago
マサゴハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/55 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sicyopterus lagocephalus
ルリボウズハゼ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00500/27 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trypauchenopsis intermedia
ヒゲワラスボ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00500/6 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parioglossus palustris
ボルネオハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00500/11 (0.0%)37/2671 (1.4%)—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Coenagrion hylas
カラフトイトトンボ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0080/27 (0.0%)4/1131 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ischnura ezoin
オガサワライトトンボ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0482/111 (1.8%)4/1131 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudagrion microcephalum
アオナガイトトンボ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0080/92 (0.0%)4/1131 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stylurus annulatus
オオサカサナエ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/14 (0.0%)0/537 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stylurus nagoyanus
ナゴヤサナエ		NT✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/14 (0.0%)0/537 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stylurus oculatus
メガネサナエ		NT✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/14 (0.0%)0/537 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chlorogomphus brunneus keramensis
アサトカラスヤンマ		——✓✓✓—/——/—No———0000/37 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chlorogomphus okinawensis
オキナワミナミヤンマ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0000/37 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemicordulia mindana nipponica
ミナミトンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0030/9 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macromidia ishidai
サキシマヤマトンボ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0030/6 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Somatochlora clavata
ハネビロエゾトンボ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0332/87 (2.3%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Boninthemis insularis
シマアカネ		CR✓✓✓✓✓/——/—No———0090/1 (0.0%)6/683 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sympetrum gracile
ナニワトンボ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0492/114 (1.8%)6/683 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nocticola uenoi miyakoensis
ミヤコホラアナゴキブリ		——✓✓——/——/—No———0000/48 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trypetimorpha japonica
ハウチワウンカ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/2 (0.0%)0/54 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euterpnosia chibensis daitoensis
ダイトウヒメハルゼミ		——✓✓✓—/——/—No———0070/10 (0.0%)5/1314 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Muda kuroiwae
クロイワゼミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0070/2 (0.0%)5/1314 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Suisha coreana
チョウセンケナガニイニイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0070/2 (0.0%)5/1314 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cacopsylla boninofatsiae
ムニンヤツデキジラミ		———✓✓—/——/—No———0070/128 (0.0%)2/634 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cacopsylla maculipennis
チャマダラキジラミ		———✓✓—/——/—No———0070/128 (0.0%)2/634 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elatobium itoe
ツツジコブアブラムシ		———✓✓—/——/—No———001140/5 (0.0%)58/5244 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemipodaphis persimilis
ケヤキワタムシ		———✓✓✓/——/—No———001140/058/5244 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Unisitobion corylicola
ハシバミヒゲナガアブラムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrometra albolineata
イトアメンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/23 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Xiphovelia boninensis
ケブカオヨギカタビロアメンボ		——✓✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/253 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asclepios shiranui
シオアメンボ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/3 (0.0%)3/410 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Halobates matsumurai
シロウミアメンボ		—✓✓✓——/—✓/✓No———0050/36 (0.0%)3/410 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limnometra femorata
トゲアシアメンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/15 (0.0%)3/410 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Kirkaldyia deyrolli
タガメ		—✓✓——✓/——/✓No———0010/1 (0.0%)1/237 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aphelocheirus nawae
トゲナベブタムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heterotrephes admorsus
エグリタマミズムシ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Kitocoris hahajima
ハハジマハナカメムシ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myiophanes tipulina
ゴミアシナガサシガメ		——✓✓——/——/—No———00140/1 (0.0%)8/1743 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ptilocerus immitis
フサヒゲサシガメ		——✓✓✓—/——/—No———00140/3 (0.0%)8/1743 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Triatoma rubrofasciata
オオサシガメ		—✓✓✓✓✓/2—/✓No———06143/124 (2.4%)8/1743 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dicranocephalus medius
ブチヒゲツノヘリカメムシ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/12 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bembidion aestuarii
キバネキバナガミズギワゴミムシ		—✓—✓——/——/—No———00940/522 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bembidion sumaoi
オオキバナガミズギワゴミムシ		———✓——/——/—No———00940/522 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callytron inspecularis
ヨドシロヘリハンミョウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00940/3 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus granulatus telluris
アカガネオサムシ本州亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus maacki aquatilis
マークオサムシ本州亜種		——✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus macleayi amanoi
マックレイセアカオサムシ利尻島亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus maeander nobukii
セスジアカガネオサムシ大雪山パルサ湿原亜種		—✓—✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus maiyasanus ohkawai
マヤサンオサムシ鵜方亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus porrecticollis pacificus
アキタクロナガオサムシ富士亜種		——✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carabus uenoi
ドウキョウオサムシ		—✓✓✓——/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chlaenius spoliatus motschulskyi
ツヤキベリアオゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00940/51 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cychrus morawitzi iwatensis
セダカオサムシ岩手県亜種		——✓✓✓—/——/—No———00940/26 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cylindera gracilis
ホソハンミョウ		—✓✓✓——/1—/—No———00940/68 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Daiconotrechus iwatai
イワタメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplocheila elongata
スナハラゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00940/6 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Harpalus crates
チョウセンゴモクムシ		——✓✓——/——/—No———06943/98 (3.1%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Jujiroa ana
ジャアナヒラタゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00940/1 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Kusumia australis
コカシメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lophyridia sumatrensis niponensis
ハラビロハンミョウ		——————/——/—No———0094/56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Morion boninense
オガサワラクチキゴミムシ		——✓———/——/—No———00940/4 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Morion japonicum
クチキゴミムシ		——————/——/—No———00940/4 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paratachys gyotokuensis
ギョウトクコミズギワゴミムシ		——————/——/—No———00940/16 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pterostichus isumiensis
イスミナガゴミムシ		———✓——/——/—No———08944/302 (1.3%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trechiama paucisaeta
モニワメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———02942/2 (100.0%)56/6793 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Yamautidius anaulax
アオナミメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haliplus basinotatus
クロホシコガシラミズムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/58 (0.0%)0/85 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haliplus eximius
キイロコガシラミズムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/58 (0.0%)0/85 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haliplus sharpi
マダラコガシラミズムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/58 (0.0%)0/85 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Canthydrus politus
ムツボシツヤコツブゲンゴロウ		—✓✓—✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/134 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neohydrocoptus sp.
ムモンチビコツブゲンゴロウ		—✓————/——/—No———0000/8 (0.0%)0/134 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Copelatus nakamurai
トダセスジゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/475 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cybister chinensis
ゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0020/42 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cybister rugosus
ヒメフチトリゲンゴロウ		—✓✓✓——/1—/—No———0020/42 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cybister tripunctatus lateralis
コガタノゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/42 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dytiscus marginalis czerskii
エゾゲンゴロウモドキ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0020/28 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Graphoderus adamsii
マルガタゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/15 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hyphydrus laeviventris laeviventris
ヒメケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/30 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laccophilus lewisius
ルイスツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/69 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laccophilus nakajimai
ナカジマツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/69 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nebrioporus hostilis
コシマチビゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/51 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Prodaticus vittatus
オキナワスジゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/——/—No———0020/43 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gyrinus japonicus
ミズスマシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/77 (0.0%)0/294 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orectochilus agilis
ツマキレオナガミズスマシ		—✓✓———/——/—No———0000/14 (0.0%)0/294 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orectochilus punctipennis
コオナガミズスマシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/14 (0.0%)0/294 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrochus chubu
チュウブホソガムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/68 (1.5%)1/68 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Georissus granulosus
セスジマルドロムシ		———✓——/——/—No———0000/17 (0.0%)0/18 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrophilus bilineatus cashimirensis
コガタガムシ		——————/——/—No———00120/28 (0.0%)9/1351 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ctenistes oculatus
クシヒゲアリヅカムシ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thiasophila shinanonis
ヤマアリヤドリ		———✓✓—/——/—No———00840/1 (0.0%)60/7592 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dorcus hopei binodulosus
オオクワガタ		—✓✓———/——/—No———1382/55 (3.6%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dorcus titanus daitoensis
ダイトウヒラタクワガタ		——✓✓——/——/—No———1181/30 (3.3%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dorcus titanus hachijoensis
ハチジョウヒラタクワガタ		——————/——/—No———1181/30 (3.3%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neolucanus okinawanus
オキナワマルバネクワガタ		——✓✓✓—/——/—No———0080/74 (0.0%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neolucanus protogenetivus protogenetivus
アマミマルバネクワガタ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/74 (0.0%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platycerus viridicuprus kanadai
キュウシュウコルリクワガタ（ニシコルリクワガタ九州亜種）		—✓✓✓✓—/1—/—No———0080/60 (0.0%)7/1622 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Omorgus chinensis
オオコブスジコガネ		—✓—✓——/——/✓No———0000/30 (0.0%)0/99 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aphodius gotoi
ツヤケシマグソコガネ		———✓——/——/—No———07804/232 (1.7%)50/5288 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Copris brachypterus
マルダイコクコガネ		——✓✓——/——/—No———01801/43 (2.3%)50/5288 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Copris ochus
ダイコクコガネ		—✓✓✓—✓/——/—No———01801/43 (2.3%)50/5288 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Onthophagus gibbulus
チャバネエンマコガネ		—✓✓✓——/1—/—No———06803/313 (1.0%)50/5288 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Onthophagus yakuinsulanus
ヤクシマエンマコガネ		———✓——/——/—No———06803/313 (1.0%)50/5288 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leptelmis gracilis
ヨコミゾドロムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/8 (0.0%)1/559 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orientelmis parvula
セマルヒメドロムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/1 (0.0%)1/559 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudamophilus japonicus
ケスジドロムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/1 (0.0%)1/559 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sinonychus satoi
サトウカラヒメドロムシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/3 (0.0%)1/559 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysobothris boninensis boninensis
オガサワラムツボシタマムシ父島列島亜種		———✓——/——/—No———0080/36 (0.0%)5/803 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tamamushia virida virida
ツマベニタマムシ父島・母島列島亜種		——✓✓——/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anadastus pulchelloides
オビヒメコメツキモドキ		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/355 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ermischiella nigriceps
ズグロヒメハナノミ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Falsomordellistena formosana boninensis
ボニンヒメハナノミ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Falsomordellistena pseudalpigena
ニセミヤマヒメハナノミ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Falsomordellistena rosseoloides
ニセチャイロヒメハナノミ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Falsomordellistena watanabei
ワタナベヒメハナノミ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hoshihananomia ochrothorax
キムネキボシハナノミ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hoshihananomia trichopalpis
オガサワラキボシハナノミ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Variimorda hiromiae
ロミキンオビハナノミ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/439 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Agapanthia sakaii
ミチノクケマダラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00520/17 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Allotraeus boninensis
オガサワラトビイロカミキリ		———✓✓—/——/—No———00520/5 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Boninella satoi satoi
サトウオガサワラカミキリ父島列島亜種		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Boninella takakuwai
ケブカオガサワラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ceresium simile simile
チャイロヒメカミキリ小笠原亜種		———✓✓—/——/—No———00520/9 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diboma costata
オキナワサビカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00520/035/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macropidonia ruficollis
アカムネハナカミキリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00520/1 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mesosa hirtiventris
ケハラゴマフカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00520/18 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nortia kusuii
オガサワラムネスジウスバカミキリ		———✓✓—/——/—No———00520/1 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudiphra bicolor bicolor
フタモンアメイロカミキリ父島列島亜種		———✓✓—/——/—No———00520/1 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thyestilla gebleri
アサカミキリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00520/1 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ogasawarazo mater
ハハジマヒメカタゾウムシ		——✓✓——/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megaxyela togashii
オオナギナタハバチ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/24 (0.0%)0/107 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysis nohirai
ノヒラセイボウ		——————/——/—No———0261/219 (0.5%)4/498 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Formica yessensis
エゾアカヤマアリ		—✓—✓✓✓/——/—No———01630914/3131 (0.4%)237/25962 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polyrhachis lamellidens
トゲアリ		—✓✓✓—✓/——/✓No———013091/790 (0.1%)237/25962 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pararrhynchium oceanicum miyanoi
ツヤカバフドロバチ母島亜種		———✓✓—/——/—No———00400/7 (0.0%)26/1120 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bembix niponica
ニッポンハナダカバチ		——✓✓✓✓/——/—No———00330/40 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Isodontia boninensis
オガサワラアナバチ		———✓✓—/——/—No———0050/9 (0.0%)2/243 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lestica rufigaster
オガサワラギングチバチ		———✓✓—/——/—No———00330/7 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pison hahadzimaense
ハハジマピソン		———✓✓—/——/—No———00330/21 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stizus pulcherrimus
キアシハナダカバチモドキ		——✓✓✓—/——/—No———00330/13 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tachysphex morosus titidzimaensis
チチジマヌカダカバチ		———✓✓—/——/—No———00330/187 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylaeus boninensis
オガサワラメンハナバチ		——✓✓✓—/——/—No———04133/294 (1.0%)9/841 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylaeus ikedai
イケダメンハナバチ		———✓✓✓/——/—No———04133/294 (1.0%)9/841 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylaeus incomitatus
キムネメンハナバチ		———✓✓✓/——/—No———04133/294 (1.0%)9/841 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylaeus yasumatsui
ヤスマツメンハナバチ		———✓✓✓/——/—No———04133/294 (1.0%)9/841 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lithurgus ogasawarensis
オガサワラキホリハナバチ		——✓✓✓—/——/—No———00230/7 (0.0%)13/1596 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megachile asahinai
アサヒナハキリバチ		———✓✓✓/——/—No———012237/319 (2.2%)13/1596 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ceratina boninensis
オガサワラツヤハナバチ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———051754/388 (1.0%)119/6799 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neohapalothrix kanii
カニギンモンアミカ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/115 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deuterophlebia nipponica
ニホンアミカモドキ		——✓✓✓—/——/—No———0000/11 (0.0%)0/11 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hyperoscelis eximia insignis
キスジモモブトモリカ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hyperoscelis veternosa
クロモモブトモリカ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hilarimorpha nigra
クロオドリバエモドキ		———✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Microdon katsurai
ケンランアリノスアブ		——✓✓✓—/——/—No———021641/60 (1.7%)79/4869 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sarcophila japonica
ゴヘイニクバエ		—✓✓✓✓—/——/—No———00250/7 (0.0%)15/1549 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macroscelesia longipes yamatoensis
アシナガモモブトスカシバ		———✓✓✓/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zygaena niphona hakodatensis
ベニモンマダラ道南亜種		———✓✓—/——/—No———0233012/97 (12.4%)16/436 (3.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ochlodes subhyalinus asahinai
アサヒナキマダラセセリ		——————/——/—No———024901/25 (4.0%)411/3582 (11.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parnara bada
ヒメイチモンジセセリ		—✓✓✓—✓/1—/—No———014901/16 (6.2%)411/3582 (11.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luehdorfia japonica
ギフチョウ		NT✓✓✓✓✓/1—/✓Yes (1)Contig,
Reference		507 Mbp
1.69		569,973
1.33 kbp		132622/5 (40.0%)203/616 (33.0%)2021-05-03
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anthocharis cardamines hayashii
クモマツマキチョウ八ヶ岳・南アルプス亜種		—✓————/——/—No———24982/17 (11.8%)45/954 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Coreana raphaelis yamamotoi
チョウセンアカシジミ		——————/——/—No———001130/1 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonica onoi onoi
カシワアカシジミ（キタアカシジミ）名義タイプ亜種, 北海道・東北地方亜種		—✓✓———/1—/—No———001130/5 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Panchala ganesa loomisi
ルーミスシジミ		—✓————/——/—No———001130/72 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phengaris teleius hosonoi
ゴマシジミ中部高地帯亜種		——————/——/—No———051132/11 (18.2%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plebejus subsolanus yarigadakeanus
アサマシジミ本州高地亜種		——————/——/—No———091134/66 (6.1%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zizeeria karsandra
ハマヤマトシジミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———001130/2 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Argyronome laodice japonica
ウラギンスジヒョウモン		—✓—✓✓—/——/—No———0108255/38 (13.2%)238/5597 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Brenthis daphne rabdia
ヒョウモンチョウ本州中部亜種		——✓✓✓—/——/—No———168253/4 (75.0%)238/5597 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lasiommata deidamia kampuzana
ツマジロウラジャノメ四国亜種		——✓———/——/—No———008250/3 (0.0%)238/5597 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limenitis populi jezoensis
オオイチモンジ		—✓✓✓✓✓/——/—No———278254/34 (11.8%)238/5597 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ypthima multistriata niphonica
ウラナミジャノメ日本本土亜種		—✓✓✓—✓/1—/—No———008250/50 (0.0%)238/5597 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Amraica kimurai
サキシマオオエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———004080/5 (0.0%)205/12191 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Archiearis notha okanoi
クロフカバシャク		———✓——/——/—No———004080/3 (0.0%)205/12191 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypoxystis pulcheraria
アキヨシトガリエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———004080/2 (0.0%)205/12191 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastropacha quercifolia
ヒロバカレハ		—✓✓✓—✓/——/—No———00220/7 (0.0%)14/611 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemaris radians
スキバホウジャク		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———04402/16 (12.5%)23/1433 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laelia miyanoi
ミヤノスゲドクガ		——✓—✓—/——/—No———021701/13 (7.7%)83/8876 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Capsula aerata
ガマヨトウ		——————/——/—No———005510/3 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Capsula sparganii
キスジウスキヨトウ		—✓—✓—✓/——/—Yes (2)Chromosome,
Reference		677 Mbp
31		134
11.4 Mbp		225511/3 (33.3%)247/7092 (3.5%)2023-03-10
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chasmina takakuwai
オガサワラシロガ		——✓———/——/—No———005510/8 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chilodes pacificus
ヌマベウスキヨトウ		——————/——/—No———005510/1 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Doerriesa coenosa
キュウシュウスジヨトウ		——✓———/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Doerriesa striata
エゾスジヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eulocastra sasakii
シラユキコヤガ		——✓———/——/—No———001700/6 (0.0%)83/8876 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nonagria puengeleri
オオチャバネヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———005510/1 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plusilla rosalia
ギンモンアカヨトウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———005510/1 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Protodeltote wiscotti
マガリスジコヤガ		——————/——/—No———025511/3 (33.3%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudohermonassa velata
エゾクシヒゲモンヤガ		——✓———/——/—No———005510/3 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Xylomoia fusei
イチモジヒメヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———005510/7 (0.0%)247/7092 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Xylomoia graminea
クシロモクメヨトウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———005510/7 (0.0%)247/7092 (3.5%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rimula cumingii
セムシマドアキガイ		—✓—✓✓—/——/—No———0010/32 (0.0%)1/211 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sukashitrochus carinatus
スカシエビス		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ogasawarana microtheca
コガラヨシワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ogasawarana ogasawarana
オガサワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neritilia mimotoi
ツバサコハクカノコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Georissa shikokuensis
ベニゴマオカタニシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/65 (1.5%)1/66 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neritodryas cornea
オカイシマキ		——✓✓✓—/——/—No———0030/1 (0.0%)3/200 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Septaria cumingiana
カミングフネアマガイ		——✓✓✓—/——/—No———0030/5 (0.0%)3/200 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Smaragdia sp.
ウミヒメカノコ		——————/——/—No———0030/3 (0.0%)3/200 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phenacolepas crenulata
ユキスズメ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Awalycaeus abei
アツブタムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus itonis shiotai
ヤサガタイトウムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/21 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus laevis
ベニムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus oshimanus
オオシマムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus sadoensis
サドムシオイ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus satsumanus laevicervix
ヌメクビムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamalycaeus tsushimanus
ツシマムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cipangocharax akioi
コウツムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cipangocharax kiuchii
トウゲンムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cipangocharax okamurai
オカムラムシオイ		DD—✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cyclophorus turgidus angulatus
リュウキュウヤマタニシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/58 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia inouei
イノウエヤマトガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia katorii
トウカイヤマトガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia shigetai
モジャモジャヤマトガイ		DD—✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia sp.
ヨナグニヤマトガイ		—————✓/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia tokunoshimana okinoerabuensis
オキノエラブヤマトガイ		———✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonia tokunoshimana tokunoshimana
トクノシマヤマトガイ		———✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/270 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arinia japonica
シリブトゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina kumejimana
クメジマゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina luchuana
リュウキュウゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina lyrata lyrata
クニガミゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina lyrata tokunoshimana
トクノシマゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina oshimae
オオシマゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina septentrionalis
エゾゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina turris chineni
イトカケゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina ultima
ツシマゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplommatina yonakunijimana
ヨナグニゴマガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/57 (0.0%)0/162 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pupinella oshimae tokunoshimana
トクノシマアズキガイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cipangopaludina chinensis laeta
マルタニシ		—✓—✓—✓/1—/—No———1242/19 (10.5%)3/279 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Batillaria zonalis
イボウミニナ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———0111/8 (12.5%)1/8 (12.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cerithium coralium
コゲツノブエ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/43 (0.0%)0/96 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Semisulcospira fuscata
クロカワニナ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pirenella asiatica
ヤエヤマヘナタリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/49 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pirenella pupiformis
カワアイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/49 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Terebralia sulcata
マドモチウミニナ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———0000/3 (0.0%)0/49 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Finella pupoides
サナギモツボ		——✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stenomelania sp. B
タケノコカワニナ		——————/——/—No———0010/19 (0.0%)1/124 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Naticarius concinnus
フロガイダマシ		—✓—✓✓✓/1—/—No———0232/9 (22.2%)3/86 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Naticarius onca
アラゴマフダマ		—✓✓✓✓—/——/—No———0232/9 (22.2%)3/86 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polinices mellosus
ロウイロトミガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0030/16 (0.0%)3/86 (3.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Akiyoshia kobayashii
コバヤシミジンツボ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/985 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Akiyoshia uenoi
アキヨシミジンツボ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/985 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Moria nipponica
ホラアナミジンニナ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/203 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assiminea sp. E
ムツカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assiminea sp. F
マンゴクウラカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assiminea sp. G
マツシマカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assiminea sp. H
マツカワウラカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assiminea sp. I
オオシンデンカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assimineidae gen. C & sp.
コーヒーイロカワザンショウ		——————/——/—No———0000/80 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Assimineidae gen. D & sp.
カハタレカワザンショウ		——————/——/—No———0000/80 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cavernacmella minima
キビオカチグサ		——✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cavernacmella yamamotonis
ヤマモトゴマオカチグサ		DD✓✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ditropisena sp. A
ミニカドカド		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ditropisena sp. B
エレガントカドカド		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ditropisena sp. C
デリケートカドカド		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ovassiminea sp.
ウラウチコダマカワザンショウ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudomphala miyazakii
アズキカワザンショウ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0000/6 (0.0%)0/80 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bithynia inabai
イナバマメタニシ		——✓✓✓—/——/—No———0221/16 (6.2%)1/42 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gabbia kiusiuensis
ヒメマルマメタニシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/7 (0.0%)1/42 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clenchiella iriomotensis
ヤイマカチドキシタダミ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hyala delicata
ゴマツボモドキ（シリオレミジンニナ）		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/20 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liroceratia sulcata
ミジンゴマツボ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pellamora sp.
ウチノミツボ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/20 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Wakauraia sakaguchii
ワカウラツボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/20 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Blanfordia bensoni
オカマメタニシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/129 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oncomelania minima
ナタネミズツボ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———0111/2 (50.0%)1/129 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pomatiopsidae gen. ooyagii
シモキタシブキツボ		——————/——/—No———0111/129 (0.8%)1/129 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rissoina costulata
スジウネリチョウジガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/1 (0.0%)0/8 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stosicia annulata
ゴマツボ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/1 (0.0%)0/8 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stenothyra japonica
ミズゴマツボ		——✓✓✓—/——/—No———0000/19 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stenothyra recondita
エゾミズゴマツボ（カラフトミズゴマツボ）		——✓✓✓—/——/—No———0000/19 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Circulus duplicatus
アラウズマキ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudoliotia asteriscus
ヒメシラギク（シラギクマガイ）		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sigaretornus sp. A
イソマイマイ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sigaretornus sp. B
ガタチンナン		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Teinostoma lucidum
ウミコハクガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Truncatella sp. A
アマミクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Truncatella sp. F
カイグンボウクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acrilla acuminata
ウネナシイトカケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/1 (0.0%)1/60 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypermastus lacteus
ヒモイカリナマコツマミガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mucronalia exilis
ヤセフタオビツマミガイ		——✓✓✓—/——/—No———0020/5 (0.0%)1/81 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Engina menkeana
ナガゴマフホラダマシ（ゴマフホラダマシ）		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/48 (0.0%)3/862 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Reticunassa praematurata
オマセムシロ		—✓✓✓✓—/——/—No———0131/180 (0.6%)3/403 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nassarius arcularia
オリイレヨフバイ		—✓✓✓✓✓/4—/—No———0131/180 (0.6%)3/403 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Babylonia kirana
ウスイロバイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0241/18 (5.6%)3/862 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vexillum balteolatum
ミノムシガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/74 (0.0%)0/144 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vexillum rufomaculatum
チビツクシ（ムラクモツクシ）		——————/——/—No———0000/74 (0.0%)0/144 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ceratostoma rorifluum
ハネナシヨウラク		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00130/4 (0.0%)8/979 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Conus boeticus
ツヤイモ		LC✓✓✓✓✓/3—/—No———0776/427 (1.4%)6/612 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Conus fulmen
ベッコウイモ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0776/427 (1.4%)6/612 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Duplicaria evoluta
イワカワトクサ		——✓✓✓—/——/—No———0000/21 (0.0%)0/345 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trigonostoma scalariformis
オリイレボラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/7 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cypraea luchuana
リュウキュウダカラ		——————/——/—No———0111/3 (33.3%)1/249 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ebala sp.
イリエゴウナ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cincinna japonica
ニホンミズシタダミ		DD——✓——/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melanochlamys ezoensis
エゾキセワタ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/17 (0.0%)0/97 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melanochlamys fukudai
ヤミヨキセワタ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/17 (0.0%)0/97 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acteocina decoratoides
コメツブツララ		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/28 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cylichnatys yamakawai
カミスジカイコガイダマシ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lactiforis takii
ウミマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/3 (0.0%)0/18 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Brachystomia umboniocola
イボキサゴナカセクチキレモドキ		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/76 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Syrnola tenuisculpta
ヌノメホソクチキレ		———✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Radix onychia
オウミガイ		—✓—✓✓—/——/—No———0161/253 (0.4%)4/427 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gyraulus soritai
ミズコハクガイ		—✓—✓✓✓/——/—No———00210/17 (0.0%)8/688 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Helicorbis cantori
クルマヒラマキガイ（レンズヒラマキガイ）		LC✓✓✓✓—/——/—No———00210/3 (0.0%)8/688 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aiteng mysticus
ヒミツナメクジ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/6 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Auriculastra duplicata
ナラビオカミミガイ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0010/4 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Blauneria leonardi
サカマキオカミミガイ		———✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ellobium chinense
オカミミガイ		DD✓✓✓✓✓/1✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		949 Mbp
125		83,461
21.3 kbp		1111/9 (11.1%)1/165 (0.6%)2023-11-20
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laemodonta siamensis
クリイロコミミガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Laemodonta sp. B
コベソコミミガイ（マルコミミガイ）		——————/——/—No———0010/12 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampus nucleolus
ウルシヌリハマシイノミ		———✓✓—/——/—No———0010/22 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampus ovuloides
デンジハマシイノミ		—✓—✓✓—/——/—No———0010/22 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampus sculptus
ニワタズミハマシイノミ		——✓✓✓—/——/—No———0010/22 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampus sincaporensis
キヌカツギハマシイノミ		LC✓✓✓✓—/—✓/✓No———0010/22 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampus sp.
オウトウハマシイノミ		—✓————/——/—No———0010/22 (0.0%)1/165 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Onchidium sp.
ドロアワモチ		—✓————/——/—No———0060/13 (0.0%)5/137 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paraonchidium fungiforme
キボシアワモチ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paraonchidium keiense
ヒメキボシアワモチ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neosuccinea kofui
コウフオカモノアラガイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/2 (0.0%)0/186 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elasmias kitaiwojimanum
イオウジマノミガイ		VU—✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/55 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lamellidea biplicata
トウガタノミガイ		VU—✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lamellidea ogasawarana
オガサワラノミガイ		VU—✓✓✓✓/3—/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tornatellides boeningi
ノミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/55 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Enteroplax yaeyamaensis
ヤエヤマクチミゾガイ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eostrobilops nipponica nipponica
マツシマクチミゾガイ		———✓——/——/—No———0000/1 (0.0%)0/4 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bensonella plicidens
クチマガリスナガイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ptychalaea dedecora
エリマキガイ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/116 (0.0%)0/161 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vertigo ovata ovata
ナタネキバサナギガイ		——————/——/—No———0000/116 (0.0%)0/161 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vertigo japonica
ヤマトキバサナギガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/116 (0.0%)0/161 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luchuena fulva
ウスチャイロキセルモドキ		———✓✓—/——/—No———0000/00/87 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luchuena minatoi
ダンジョキセルモドキ		———✓✓—/——/—No———0000/00/87 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luchuena nesiotica
チャイロキセルモドキ		———✓✓—/——/—No———0000/00/87 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa dalli
デールギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa decussata
ハブタエギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa gracilispira
ホソヒメギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa ignobilis
アベギセル		———✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa iijimakuniakii
ツバクロイワギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa iyoensis
イヨギセル		——✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa kanjiookuboi
オクシリギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa kawamotoi
カワモトギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa kubinaga
クビナガギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa kurozuensis
クロズギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa kyotoensis
キョウトギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa mitsukurii
ミツクリギセル		———✓✓✓/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa miyazakii
ミヤザキギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa nankaidoensis yanoi
ショウドシマギセル		———✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa pachyspira
シリブトギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa pilsbryi
カギヒダギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa puellaris
ウブギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Megalophaedusa yagurai
ヤグラギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Solitariphaedusa miyoshii
ミヨシギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa callistochila
キンチャクギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa caloptyx caloptyx
イトカケノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa caloptyx subtilis
ヤクスギイトカケノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa kamoharai
カモハラギセル		——————/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa mima mima
ザレギセル		———✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa mima tokunoshimana
トクノシマギセル		———✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa nishinoshimana
ニシノシマギセル		—✓—✓✓✓/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa oshimae degenerata
クサレギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa tabukii
タブキギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa tryoni
トライオンギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereophaedusa ultima
ヒメナミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tauphaedusa senkakuensis
センカクコギセル		———✓✓—/——/—No———0010/5 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tosaphaedusa cincticollis
ナカムラギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/5 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx cladoptyx
エダヒダノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx entospira
ウチマキノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx exodonta
ソトバウチマキノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx exulans
ホソウチマキノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx hedleyi
チビノミギセル		———✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx munus
ツムガタノミギセル		———✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx noviluna
ミカヅキノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx oxypomatia
カドシタノミギセル		——————/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zaptyx takarai
タカラノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sinoennea densecostata
コメツブダワラ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sinoennea miyakojimana
ミヤコダワラ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bekkochlamys masakii
マサキベッコウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/186 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bekkochlamys subrejecta
ツシマベッコウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/186 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Helicarionidae gen. & sp.
ベッコウマイマイ科の１種		——————/——/—No———0000/186 (0.0%)0/186 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japanochlamys crenata
コンゴウクリイロベッコウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/17 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lamprocystis hahajimana hahajimana
ハハジマヒメベッコウ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/14 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Luchuconulus edgariana
スミスヒメベッコウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/49 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochlamys sp.
ヨナグニベッコウ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/17 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochlamys subelimata
トクノシマベッコウ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/17 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Otesiopsis japonica
レンズガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Otesiopsis kanmuriyamensis
カンムリレンズガイ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Takemasaia eikoae
エイコベッコウ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deroceras sp.
クロツノナメクジ		—✓———✓/——/—No———0222/263 (0.8%)2/267 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista calcicola
イシマキシロマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista cavitectum
タシママイマイ		———✓——/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista eumenes pergranosa
アラハダシロマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista fausta
サチマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista friedeliana vestita
オオシマフリイデルマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista hachijoensis
ツバキカドマイマイ		——✓—✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista kiusiuensis tokunovaga
トクノシマケマイマイ		—✓—✓——/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista lepidophora scutifera
カドマルウロコケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/24 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista mayasana
マヤサンマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista minima
マメヒロベソマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista nunobikiensis
ヌノビキケマイマイ		—✓—✓——/——/—No———0050/24 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista omiensis
オウミケマイマイ		——✓✓——/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista proba goniosomoides
ミヤマオオベソマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista scepasma
イトマンケマイマイ		———✓—✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista squarrosa squarrosa
マルテンスオオベソマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista squarrosa tokunoshimana
トクノシマオオベソマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista takarai
タカラホソマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra awaensis occidentalis
イワミマイマイ		—✓—✓—✓/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra grata echigoensis
エチゴマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra grata emurai
エムラマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra grata grata
オオタキマイマイ		—✓—✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra grata tobisimae
トビシママイマイ		———✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra latispira latispira
ハクサンマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra scaevola scaevola
ミヤマヒダリマキマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euhadra yakushimana
ヤクシママイマイ		———✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lepidopisum conospira
カタマメマイマイ		——————/——/—No———0050/05/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nesiohelix irrediviva
エラブマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/7 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nesiohelix solida
アツマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/7 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paraegista apoiensis
アポイマイマイ		DD✓✓✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paraegista takahidei
タカヒデマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/12 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aegista hiroshifukudai
チョウシュウシロマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Moellendorffia eucharistus
ケハダシワクチマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neochloritis tomiyamai
ハジメテビロウドマイマイ		———✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis bracteata tsukubaensis
ツクバビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis fragosa
オオウスビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis hirasei
ヒラマキビロウドマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis perpunctata
ヒメビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis silvatica
カワリダネビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis takedai
ミニビロウドマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nipponochloritis tosana
トサビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma adelinae
クマドリヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma atrata
ヤンバルマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma cardiostoma
ココロマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma eucosmia erabuana
オキノエラブヤマタカマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma eucosmia eucosmia
オキナワヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma fausta
ヤセアナナシマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma mercatoria euterpe
クンチャンマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma moellendorffiana thaanumi
ミノブマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma omoro
オモロヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma oshimae daemonorum
キカイオオシママイマイ		—✓—✓—✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma perversa
リュウキュウヒダリマキマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma rugosa
チリメンマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma selasia
ツヤマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma sp.
シズオカマイマイ		—✓———✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma sp. B
トナキマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma textilis
オオツヤマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma tokunoshimana
トクノシマヤマタカマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Satsuma tsurugisanica
ツルギサンマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Yakuchloritis albolabris
クチジロビロウドマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Yakuchloritis hoshiyamai
ホシヤマビロウドマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Solemya japonica
アサヒキヌタレガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0131/20 (5.0%)2/58 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Jolya arata
ヌバタママクラ		——✓✓✓—/——/—No———00220/1 (0.0%)12/485 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anadara crebricostata
メオトサルボオ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0252/31 (6.5%)4/164 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anadara globosa
クマサルボオ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0252/31 (6.5%)4/164 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tegillarca granosa
ハイガイ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		915 Mbp
10		3,631
463 kbp		2251/3 (33.3%)4/164 (2.4%)2020-06-29
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tucetona auriflua
ウチワガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/22 (4.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anomiostrea coralliophila
サンゴガキ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)17/339 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Magallana ariakensis
スミノエガキ		—✓✓✓✓—/—✓/—Yes (3)Chromosome,
Reference		663 Mbp
108		522
5.93 Mbp		318367/19 (36.8%)17/339 (5.0%)2021-10-15
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Magallana bilineata
ミナミマガキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Contig,
Reference		551 Mbp
55		93
13.4 Mbp		118367/19 (36.8%)17/339 (5.0%)2025-08-11
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pinna atropurpurea
スエヒロガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0362/13 (15.4%)5/73 (6.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cristaria clessini
メンカラスガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/8 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Inversidens brandtii
オバエボシガイ		DD✓✓✓✓✓/——/—No———00100/2 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Inversiunio reinianus
オトコタテボシガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/6 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Inversiunio yanagawensis
ニセマツカサガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/6 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lanceolaria oxyrhyncha
ササノハガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/9 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Obovalis omiensis
カタハガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/1 (0.0%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sinanodonta calipygos
マルドブガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———01101/46 (2.2%)10/895 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cadakia punctata
クチベニツキガイ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Codakia paytenorum
ウラキツキガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———01281/6 (16.7%)15/196 (7.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbria soverbii
カゴガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fragum carinatum
ヒシガイ		—✓—✓—✓/——/—No———06323/15 (20.0%)16/232 (6.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vasticardium rubicundum compunctum
イレズミザルガイ		——————/——/—No———00320/14 (0.0%)16/232 (6.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gari lessoni
ウスムラサキアシガイ		——✓✓✓—/——/—No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Psammotaea inflata
ミナトマスオ		——————/——/—No———0040/1 (0.0%)3/34 (8.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hiatula adamsii
ムラサキガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/6 (0.0%)3/34 (8.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Montrouzieria clathrata
コバコガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cadella crebrimaculata
ホシヤマナミノコザラ		——✓✓✓—/——/—No———0070/3 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cadella sp.
リュウキュウクサビザラ		——————/——/—No———0070/3 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cyclotellina remies
モチヅキザラ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macalia bruguieri
アマサギガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scissulina dispar
チガイザクラ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Serratina perplexa
ヒワズウネイチョウ		—✓✓✓✓—/——/✓No———0070/4 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Iridona iridescens
テリザクラ		—✓✓✓✓—/—✓/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dallitellina rostrata
トンガリベニガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Quadrans gargadia
オオトゲウネガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tellinides timorensis
ヘラサギガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Corbicula leana
マシジミ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0333/489 (0.6%)3/511 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Corbicula sandai
セタシジミ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0333/489 (0.6%)3/511 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geloina expansa
リュウキュウヒルギシジミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0030/12 (0.0%)3/511 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geloina fissidens
タイワンヒルギシジミ		——————/——/—No———0030/12 (0.0%)3/511 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geloina yaeyamensis
ヤエヤマヒルギシジミ		——————/——/—No———0030/12 (0.0%)3/511 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Glauconome angulata
ハナグモリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/8 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anatinella nicobarica
チトセノハナガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Coelomactra antiquata
アリソガイ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		807 Mbp
50		220
17.4 Mbp		23132/19 (10.5%)8/50 (16.0%)2025-01-28
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mactra grandis
リュウキュウアリソガイ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———03132/19 (10.5%)8/50 (16.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mactra pulchella
トウカイタママキ		——✓✓✓—/——/—No———03132/19 (10.5%)8/50 (16.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mactrotoma depressa
ヒナミルクイ		——✓✓✓—/——/—No———00130/1 (0.0%)8/50 (16.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tresus keenae
ミルクイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00130/3 (0.0%)8/50 (16.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dosinia aspera
ツキカガミ		——✓✓✓—/——/—No———01351/24 (4.2%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dosinia troscheli
ヤタノカガミ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———01351/24 (4.2%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Meretrix lusoria
ハマグリ		—✓✓✓✓✓/13✓/✓No———010355/25 (20.0%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pitar citrinus
ユウカゲハマグリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00350/9 (0.0%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pitar sulfureus
イオウハマグリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00350/9 (0.0%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tapes literatus
リュウキュウアサリ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00350/7 (0.0%)19/287 (6.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Barrimysia cumingii
アケボノガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/41 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Barrimysia siphonosomae
ホシムシアケボノガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/41 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Borniopsis tsurumaru
ツルマルケボリガイ		——✓✓✓—/——/—No———0020/4 (0.0%)1/68 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Byssobornia adamsi
セワケガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/4 (0.0%)1/68 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Divariscintilla toyohiwakensis
ニッポンヨーヨーシジミ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/8 (0.0%)1/59 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ephippodonta gigas
オオツヤウロコガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/4 (0.0%)1/59 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tellimya fujitaniana
フジタニコハクノツユ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/41 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salpocola philippinensis
フィリピンハナビラガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/1 (0.0%)1/68 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Barnea japonica
ウミタケ		——✓✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/36 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cryptomya busoensis
ヒメマスオ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Distugonia decurtata
オフクマスオ		——————/——/—No———00000—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Exolaternula sp.
オヤイヅオキナガイ		——————/——/—No———0010/1 (0.0%)1/25 (4.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Agriodesma navicula
オビクイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thracia concinna
シナヤカスエモノガイ		——✓✓✓—/——/—No———0221/8 (12.5%)1/9 (11.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Solen kikuchii
チゴマテ		——✓✓✓—/——/—No———0221/19 (5.3%)1/19 (5.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Solen sp.
ホソバラフマテ		—✓———✓/——/—No———0221/19 (5.3%)1/19 (5.3%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phagocata albata
ソウヤイドウズムシ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/43 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phagocata suginoi
ホクリクホソウズムシ		———✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/43 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phagocata tenella
ヒダカホソウズムシ		———✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/43 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus aomorensis
アオモリザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus cirratus
カムリザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus ezoensis
エゾザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus homodontus
ホソザリガニミミズ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus inukaii
イヌカイザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus iwakiensis
イワキザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus makinoi
ヒメザリガニミミズ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus megalodentatus
オオアゴザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus nipponicus
ニッポンザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus sapporensis
ザリガニミミズ		—✓—✓✓✓/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirrodrilus uchidai
ウチダザリガニミミズ		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/40 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parabeloniscus shimojanai
クメコシビロザトウムシ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/26 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aculepeira matsudae
マツダタカネオニグモ		—✓✓✓✓—/——/—No———00210/17 (0.0%)14/912 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Argyroneta aquatica
ミズグモ		—✓✓✓✓✓/12✓/✓No———0000/1 (0.0%)0/467 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heptathela kimurai sensu lato
キムラグモ（広義）		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0020/29 (0.0%)2/50 (4.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lycosa ishikariana
イソコモリグモ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0131/44 (2.3%)2/646 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nesticus uenoi
フジホラヒメグモ		—✓—✓——/——/—No———0000/3 (0.0%)0/196 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ryuthela nishihirai sensu lato
オキナワキムラグモ（広義）		—✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		3.11 Gbp
39		2,521
12.9 Mbp		1121/18 (5.6%)2/50 (4.0%)2024-04-17
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Amamiku amamensis
アマミミナミサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Antecaridina lauensis
ドウクツヌマエビ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0030/4 (0.0%)3/593 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Austruca lactea
ハクセンシオマネキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/13 (0.0%)0/145 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Birgus latro
ヤシガニ		VU✓✓✓✓✓/2✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.96 Gbp
51		914,468
5.29 kbp		1121/1 (100.0%)2/20 (10.0%)2021-05-18
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cambaroides japonicus
ニホンザリガニ		DD✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0050/5 (0.0%)2/698 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Candidiopotamon kumejimense
クメジマミナミサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Candidiopotamon tokashikense
トカシキミナミサワガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chiromantes magnus
オガサワラクロベンケイガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/6 (0.0%)0/282 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chiromantes ryukyuanum
リュウキュウアカテガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/282 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Coenobita perlatus
サキシマオカヤドカリ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0121/18 (5.6%)2/20 (10.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocheir ogasawaraensis
オガサワラモクズガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0551/6 (16.7%)1/133 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geothelphusa amagui
ケラマサワガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/72 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geothelphusa aramotoi
アラモトサワガニ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/72 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geothelphusa grandiovata
オキナワオオサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geothelphusa iheya
イヘヤオオサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geothelphusa kumejima
クメジマオオサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/536 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macrobrachium miyakoense
ウリガーテナガエビ		DD✓✓✓✓✓/——/—No———0793/287 (1.0%)4/1070 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Macrobrachium placidulum
ネッタイテナガエビ		LC✓✓✓✓✓/6—/—No———0793/287 (1.0%)4/1070 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neocaridina ishigakiensis
イシガキヌマエビ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0131/34 (2.9%)3/593 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Palaemon ogasawaraensis
オガサワラコテナガエビ		—✓—✓✓—/——/—No———0291/128 (0.8%)4/1070 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tubuca arcuata
シオマネキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/22 (0.0%)0/145 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Spirobolus sp.
ヤエヤママルヤスデ		—✓————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/22 (0.0%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lycopodium casuarinoides
ヒモヅル		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/1 (0.0%)3/332 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phlegmariurus cryptomerinus
スギラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/189 (0.0%)3/332 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Isoetes pseudojaponica
ミズニラモドキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0222/206 (1.0%)2/206 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Isoetes sinensis
シナミズニラ		CR✓✓✓✓—/3—/—No———0222/206 (1.0%)2/206 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Selaginella aristata
コケカタヒバ		—✓✓✓✓—/——/—No———0333/398 (0.8%)3/411 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Selaginella limbata
アマミクラマゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0333/398 (0.8%)3/411 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Selaginella moellendorffii
イヌカタヒバ		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		212 Mbp
7		5,152
120 kbp		1333/398 (0.8%)3/411 (0.7%)2010-07-06
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Selaginella sibirica
エゾノヒモカズラ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0333/398 (0.8%)3/411 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Equisetum pratense
ヤチスギナ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0000/36 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Equisetum scirpoides
ヒメドクサ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0000/36 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Equisetum sylvaticum
フサスギナ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0000/36 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Botrychium lunaria
ヒメハナワラビ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/66 (0.0%)0/143 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ophioglossum parvum
チャボハナヤスリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/50 (0.0%)0/143 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Abrodictyum boninense
ハハジマホラゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/21 (0.0%)0/454 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Didymoglossum motleyi
マメゴケシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/39 (0.0%)0/454 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vandenboschia miuraensis
ミウラハイホラゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/136 (0.0%)0/454 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vandenboschia oshimensis
リュウキュウオオハイホラゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/454 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplopterygium laevissimum
カネコシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/13 (0.0%)0/116 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plagiogyria koidzumii
リュウキュウキジノオ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/19 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lindsaea cambodgensis
ヒメホングウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/155 (0.0%)0/204 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Adiantum ogasawarense
イワホウライシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0252/235 (0.9%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Antrophyum obovatum
タキミシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/37 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cheilanthes chusana
エビガラシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/52 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Haplopteris anguste-elongata
ヒメシシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/55 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pteris kidoi
キドイノモトソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pteris natiensis
ヤワラハチジョウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pteris perplexa
カワリバアマクサシダ		——✓✓✓—/——/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pteris satsumana
サツマハチジョウシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pteris yakuinsularis
ヤクシマハチジョウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Microlepia obtusiloba var. obtusiloba
コウシュンシダ		—✓————/——/—No———0000/44 (0.0%)0/174 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Microlepia speluncae
オオイシカグマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/44 (0.0%)0/174 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium coenobiale
クロガネシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium micantifrons
ナンカイシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium polyodon
ムニンシダ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium pseudowilfordii
オクタマシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium shimurae
テンリュウヌリトラノオ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asplenium tenerum
オトメシダ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hymenasplenium excisum
ラハオシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/58 (0.0%)0/516 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Woodwardia harlandii
オオギミシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/15 (0.0%)2/196 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Athyrium atkinsonii
テバコワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Athyrium eremicola
ヘイケイヌワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Athyrium nakanoi
ヒメホウビシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Athyrium palustre
サカバサトメシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deparia coreana
コウライイヌワラビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deparia longipes
ウスバシケシダ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplazium longicarpum
シマクジャク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplazium taiwanense
ニセシロヤマシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thelypteris castanea
タイワンハシゴシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/114 (0.0%)0/653 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thelypteris flexilis
トサノミゾシダモドキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/114 (0.0%)0/653 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arachniodes cavaleriei
ヤクシマカナワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arachniodes hekiana
シビカナワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arachniodes yasu-inouei var. yasu-inouei
ハガクレカナワラビ		——————/——/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ctenitis iriomotensis
コミダケシダ		VU✓✓✓✓—/1—/—No———0040/68 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dryopteris laeta
イワカゲワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dryopteris nodosa
タイワンヒメワラビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dryopteris protobissetiana
モトイタチシダ		—✓—✓✓—/——/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elaphoglossum tosaense
ヒロハアツイタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/320 (0.3%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elaphoglossum yoshinagae
アツイタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/320 (0.3%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polystichum rigens
オニイノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polystichum scariosum
コモチイノデ		—✓✓✓✓—/——/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lomariopsis boninensis
ツルキジノオ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/67 (0.0%)0/73 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Davallia repens
キクシノブ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/65 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Goniophlebium someyae
ミョウギシダ		——✓✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leptochilus hemionitideus
タイワンクリハラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/101 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Loxogramme boninensis
ムニンサジラン		——✓✓✓—/——/—No———0000/25 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oreogrammitis tuyamae
ナガバコウラボシ		——✓✓✓—/——/—No———0000/74 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Picea maximowiczii
ヒメバラモミ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———08395/55 (9.1%)18/332 (5.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudotsuga japonica
トガサワラ		EN✓✓✓✓—/1—/—No———01391/5 (20.0%)18/332 (5.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Juniperus communis var. montana
リシリビャクシン		—✓✓✓✓—/——/—No———04134/81 (4.9%)12/212 (5.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Juniperus taxifolia var. taxifolia
シマムロ		——✓✓✓—/——/—No———04134/81 (4.9%)12/212 (5.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euryale ferox
オニバス		LC✓✓✓✓—/3—/✓No———0050/2 (0.0%)4/157 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nuphar pumila var. ozeensis
オゼコウホネ		———✓——/——/—No———0151/22 (4.5%)4/157 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nuphar pumila var. pumila
ネムロコウホネ		——✓✓——/——/—No———0151/22 (4.5%)4/157 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nymphaea tetragona var. erythrostigmatica
エゾベニヒツジグサ		——————/——/—No———0352/116 (1.7%)4/157 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chloranthus fortunei
キビヒトリシズカ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0121/17 (5.9%)2/77 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Peperomia boninsimensis
シマゴショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/398 (0.0%)5/1145 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aristolochia contorta
マルバウマノスズクサ		—✓✓✓✓—/2—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		211 Mbp
183		224
2.32 Mbp		1443/246 (1.2%)3/284 (1.1%)2022-03-04
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aristolochia zollingeriana
コウシュンウマノスズクサ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0443/246 (1.2%)3/284 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum crassum
ナンゴクアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum fauriei var. fauriei
ミチノクサイシン		—✓—✓——/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum fauriei var. nakaianum
ミヤマアオイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum fudsinoi
フジノカンアオイ		VU✓✓✓✓—/3—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum kiusianum var. kiusianum
ツクシアオイ		——————/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum kumageanum var. kumageanum
クワイバカンアオイ		—✓————/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum muramatsui var. muramatsui
アマギカンアオイ		———✓——/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum nipponicum var. nankaiense
ナンカイアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum sakawanum var. sakawanum
サカワサイシン		—✓—✓——/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum simile
トクノシマカンアオイ		VU✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum takaoi var. austrokiiensis
キナンカンアオイ		————✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum tamaense
タマノカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asarum yakusimense
オニカンアオイ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cryptocarya chinensis
シナクスモドキ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00210/169 (0.0%)11/1631 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lindera communis var. okinawensis
オキナワコウバシ		———✓✓—/——/—No———01211/51 (2.0%)11/1631 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Amorphophallus kiusianus
ヤマコンニャク		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/189 (1.6%)15/1831 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arisaema nambae
タカハシテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Symplocarpus nabekuraensis
ナベクラザゼンソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00310/6 (0.0%)15/1831 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Caldesia parnassiifolia
マルバオモダカ		——————/——/—No———0020/2 (0.0%)1/145 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Blyxa aubertii
マルミスブタ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0040/3 (0.0%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Blyxa echinosperma
スブタ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0040/3 (0.0%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Halophila decipiens
トゲウミヒルモ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0141/52 (1.9%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Najas minor
トリゲモ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0040/30 (0.0%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Najas yezoensis
イトイバラモ		———✓✓—/——/—No———0040/30 (0.0%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vallisneria natans var. higoensis
ヒラモ		—✓—✓✓—/——/—No———0040/65 (0.0%)3/220 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Triglochin palustris
ホソバノシバナ		LC✓✓✓✓—/6—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		437 Mbp
32		301
4.41 Mbp		2442/24 (8.3%)2/29 (6.9%)2024-07-05
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zostera asiatica
オオアマモ		NT✓✓✓✓—/2—/—No———0262/22 (9.1%)4/28 (14.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zostera caulescens
タチアマモ		NT✓✓✓✓—/2—/—No———0262/22 (9.1%)4/28 (14.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potamogeton alpinus
ホソバヒルムシロ		LC✓✓✓✓—/7—/—No———019219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potamogeton cristatus
コバノヒルムシロ		—✓✓✓✓—/3—/—No———019219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potamogeton pusillus
ツツイトモ		LC✓✓✓✓—/6—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		284 Mbp
63		267
12.9 Mbp		219219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)2025-07-24
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potamogeton x nitens
ササエビモ		—✓————/1—/—No———019219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zannichellia palustris
イトクズモ		LC✓✓✓✓—/7—/—No———00210/12 (0.0%)10/200 (5.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Japonolirion osense
オゼソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/1 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Burmannia nepalensis
キリシマシャクジョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/36 (0.0%)0/71 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dioscorea izuensis
イズドコロ		—✓—✓✓—/——/—No———016177/353 (2.0%)8/358 (2.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sciaphila ramosa
スズフリホンゴウソウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sciaphila secundiflora
ウエマツソウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anticlea sibirica
リシリソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0020/6 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chionographis hisauchiana subsp. hisauchiana
アズマシライトソウ		———✓——/——/—No———0121/4 (25.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chionographis hisauchiana subsp. kurohimensis
クロヒメシライトソウ		———✓✓—/——/—No———0121/4 (25.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chionographis japonica var. yakusimensis
ヤクシマシライトソウ		———✓✓—/——/—No———1121/4 (25.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chionographis koidzumiana var. koidzumiana
チャボシライトソウ		———✓——/——/—No———0121/4 (25.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heloniopsis kawanoi
コショウジョウバカマ		VU✓✓✓✓—/2—/—No———0020/7 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heloniopsis leucantha
オオシロショウジョウバカマ		VU✓✓✓✓—/2—/—No———0020/7 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trillium smallii var. smallii
コジマエンレイソウ		——————/——/—No———0020/53 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trillium x hagae
シラオイエンレイソウ		——————/——/—No———0020/53 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veratrum stamineum var. micranthum
ミカワバイケイソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———0020/36 (0.0%)2/204 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Smilax amamiana
アマミヒメカカラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/201 (0.5%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Smilax fui
トカラサンキライ		—✓—✓✓—/1—/—No———0111/201 (0.5%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Amana erythronioides
ヒロハノアマナ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0090/21 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fritillaria ayakoana
イズモコバイモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0090/142 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fritillaria japonica
ミノコバイモ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0090/142 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fritillaria muraiana
アワコバイモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0090/142 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gagea vaginata
エゾヒメアマナ		——✓✓✓—/——/—No———0090/174 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lilium callosum var. callosum
ノヒメユリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lilium maculatum var. bukosanense
ミヤマスカシユリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lilium speciosum var. clivorum
タキユリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lilium speciosum var. speciosum
カノコユリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tricyrtis flava
キバナノホトトギス		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/35 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tricyrtis formosana
タイワンホトトギス		—✓✓✓✓—/2—/—No———0090/35 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tricyrtis macrantha
ジョウロウホトトギス		—✓✓✓✓—/1—/—No———0090/35 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tricyrtis macranthopsis
キイジョウロウホトトギス		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/35 (0.0%)9/782 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bulbophyllum boninense
オガサワラシコウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/717 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe alismifolia
ダルマエビネ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe hattorii
アサヒエビネ		——✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe lyroglossa
レンギョウエビネ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe masuca
オナガエビネ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe nipponica
キンセイラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe puberula var. puberula
ナツエビネ		———✓——/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe sieboldii
キエビネ		—✓—✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe tricarinata
サルメンエビネ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calanthe triplicata
ツルラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calypso bulbosa var. bulbosa
ヒメホテイラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cephalanthera longifolia
クゲヌマラン		—✓✓✓✓—/5—/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chamaegastrodia sikokiana
ヒメノヤガラ		——————/——/—No———00360/8 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cheirostylis liukiuensis
アカバシュスラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/25 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Conchidium japonicum
オサラン		———✓✓—/——/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Corymborkis veratrifolia
バイケイラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cremastra unguiculata
トケンラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cymbidium macrorhizon
マヤラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cymbidium nagifolium
ナギラン		—✓—✓✓—/——/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cypripedium japonicum var. japonicum
クマガイソウ		——————/——/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cypripedium macranthos var. speciosum
アツモリソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cypripedium yatabeanum
キバナノアツモリソウ		NT✓✓✓✓—/1—/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dendrobium tosaense
キバナノセッコク		—✓—✓✓—/——/—Yes (1)Chromosome,
Reference		1.23 Gbp
100		2,779
1.46 Mbp		17367/535 (1.3%)25/12039 (0.2%)2021-08-10
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Epipactis papillosa var. sayekiana
ハマカキラン		———✓✓—/——/—No———00360/38 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eulophia zollingeri
イモネヤガラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrochilus japonicus
カシノキラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/63 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrochilus matsuran
マツラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/63 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrochilus toramanus
モミラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/63 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrodia flexistyloides
ヌカヅキヤツシロラン		———✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrodia javanica
コンジキヤガラ		—✓✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrodia nipponica
ハルザキヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrodia nipponicoides
ヤンバルヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gastrodia takeshimensis
タケシマヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Goodyera rubicunda
ナンバンキンギンソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/1 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Goodyera viridiflora
シマシュスラン		—✓✓✓✓—/5—/—No———00360/2 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Habenaria yezoensis var. yezoensis
ヒメミズトンボ		——————/——/—No———00360/331 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemipilia chidori
ヒナチドリ		———✓✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemipilia gracilis
ヒナラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemipilia kinoshitae
コアニチドリ		——✓✓✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hemipilia lepida
オキナワチドリ		——✓✓✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Herminium lanceum
ムカゴソウ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00360/53 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lecanorchis nigricans var. nigricans
クロムヨウラン		————✓—/——/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liparis auriculata
ギボウシラン		—✓—✓✓—/3—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liparis bootanensis
チケイラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liparis formosana var. hachijoensis
シマササバラン		——————/——/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liparis fujisanensis
フガクスズムシソウ		—✓—✓✓—/——/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Liparis odorata
ササバラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neottia acuminata
ヒメムヨウラン		LC✓✓✓✓—/2—/—No———00360/42 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neottia papilligera
サカネラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/42 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pelatantheria scolopendrifolia
ムカデラン		—✓✓✓✓—/4—/—No———00360/6 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phaius flavus
ガンゼキラン		—✓—✓✓—/3—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phaius tankervilleae
カクチョウラン		—✓—✓✓—/——/—No———00360/22 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platanthera chorisiana var. chorisiana
タカネトンボ		————✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platanthera convallariifolia
シロウマチドリ		—✓✓✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platanthera fuscescens
ヒロハトンボソウ		—✓✓✓✓—/4—/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platanthera mandarinorum subsp. mandarinorum var. oreades
ヤマサギソウ		——————/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Platanthera tipuloides subsp. linearifolia
ナガバトンボソウ		———✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhomboda yakusimensis
ヤクシマアカシュスラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/12 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Spathoglottis plicata
コウトウシラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/18 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereosandra javanica
イリオモテムヨウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stigmatodactylus sikokianus
コオロギラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/11 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tainia laxiflora
ヒメトケンラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/12 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zeuxine boninensis
ムニンキヌラン		———✓✓—/——/—No———00360/16 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Iris rossii
エヒメアヤメ		—✓✓✓✓—/3—/—No———07465/311 (1.6%)43/1568 (2.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Allium inutile
ステゴビル		—✓✓✓✓—/2—/—No———08104/694 (0.6%)6/1591 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Allium kiiense
キイイトラッキョウ		———✓✓—/——/—No———08104/694 (0.6%)6/1591 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Allium schoenoprasum var. idzuense
イズアサツキ		—✓—✓✓—/——/—No———08104/694 (0.6%)6/1591 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asparagus kiusianus
ハマタマボウキ		EN✓✓✓✓—/——/—Yes (4)Scaffold,
Reference		1.62 Gbp
44		178,116
16.6 kbp		47214/272 (1.5%)17/2537 (0.7%)2022-02-09
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hosta kikutii var. scabrinervia
ザラツキギボウシ		—✓—✓✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hosta longipedicellata
カムロギボウシ		—✓——✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hosta samukazemontana
サムカゼギボウシ		—✓——✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hosta takiminazukiflora subsp. takiminazukiflora
タキミナズキギボウシ		—✓——✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hosta tsushimensis var. tibae
ナガサキギボウシ		—✓✓✓✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clinostigma savoryanum
ノヤシ		DD✓✓✓✓—/3—/—No———00490/4 (0.0%)12/2370 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pollia secundiflora
サルゾコミョウガ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/10 (0.0%)0/322 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Streptolirion lineare
アオイカズラ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/322 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sparganium angustifolium
ホソバウキミクリ		LC✓✓✓✓—/7—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		487 Mbp
90		20
33.2 Mbp		15103/47 (6.4%)7/77 (9.1%)2025-11-15
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sparganium eurycarpum subsp. coreanum
オオミクリ		—✓✓✓✓—/——/—No———05103/47 (6.4%)7/77 (9.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sparganium gramineum
ウキミクリ		—✓✓✓✓—/3—/—No———05103/47 (6.4%)7/77 (9.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sparganium subglobosum
ヒメミクリ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———05103/47 (6.4%)7/77 (9.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon atroides
クロイヌノヒゲモドキ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon japonicum
ヤマトホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon kusiroense
クシロホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon nepalense
ゴマシオホシクサ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon nudicuspe
シラタマホシクサ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon pallescens
シロエゾホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon sachalinense
カラフトホシクサ		——✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriocaulon takae
アズマホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Juncus castaneus
クロコウガイゼキショウ		—✓✓✓✓—/4—/—No———012164/192 (2.1%)6/315 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Juncus covillei
セキショウイ		—✓✓✓✓—/3—/—No———012164/192 (2.1%)6/315 (1.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Actinoscirpus grossus
オオサンカクイ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00810/1 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex angustealata
ホザキマスクサ		————✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex apoiensis
アポイタヌキラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex argyi
ワンドスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex buxbaumii
タルマイスゲ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex capricornis
ジョウロウスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex cinerascens
ヌマアゼスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex conica var. scabrocaudata
トカラカンスゲ		———✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex eleusinoides
ヒメアゼスゲ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex filipes var. kuzakaiensis
オクタマツリスゲ		—✓—✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex formosensis
タイワンスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex hashimotoi
サヤマスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex kagoshimensis
セトウチスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex laxa
イトナルコスゲ		DD✓✓✓✓—/4—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex livida
ムセンスゲ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex loliacea
アカンスゲ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex meyeriana
ヌマクロボスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex nachiana
キシュウナキリスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex odontostoma
ミヤマイワスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex omurae
スルガスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex paupercula
ダケスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex phaeodon
ハシナガカンスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex poculisquama
アカネスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex polyschoena
シロホンモンジスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex quadriflora
アカスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex remotiuscula
イトヒキスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex rostrata
カラフトカサスゲ		LC✓✓✓✓—/6—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		381 Mbp
72		119
6.59 Mbp		2458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)2024-05-21
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex schmidtii
シュミットスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex scita var. scabrinervia
シコタンスゲ		—✓—✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex siroumensis
タカネナルコ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex subumbellata var. subumbellata
ミヤケスゲ		————✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex taihokuensis
タイホクスゲ		—✓—✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex tashiroana
ノスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex tenuiformis
オノエスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex tokarensis
フサカンスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex toyoshimae
セキモンスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex tsuishikarensis
ホロムイクグ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex tumidula
イワヤスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carex vanheurckii
ヌイオスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cyperus distans
ホウキガヤツリ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cyperus exaltatus var. iwasakii
カンエンガヤツリ		———✓✓—/——/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cyperus ohwii
ツクシオオガヤツリ		——✓✓✓—/——/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplacrum caricinum
カガシラ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00810/5 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eleocharis acicularis var. acicularis
チシママツバイ		——✓✓✓—/2—/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eleocharis equisetiformis
スジヌマハリイ		———✓✓—/——/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eleocharis margaritacea
シロミノハリイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eleocharis parvinux
コツブヌマハリイ		——✓✓✓—/——/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eleocharis parvula
チャボイ		—✓✓✓✓—/4—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		1.15 Gbp
28		2,783
1.49 Mbp		25813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)2025-11-15
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbristylis dichotoma subsp. podocarpa
ツクシテンツキ		——✓✓✓—/——/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbristylis fusca
オノエテンツキ		—✓✓✓✓—/——/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbristylis longispica var. boninensis
ムニンテンツキ		—✓—✓✓—/1—/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbristylis pierotii
ノハラテンツキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fimbristylis stauntonii var. tonensis
トネテンツキ		———✓✓—/——/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhynchospora boninensis
シマイガクサ		——✓✓✓—/——/—No———03813/195 (1.5%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Schoenoplectiella gemmifera
ハタベカンガレイ		—✓—✓✓—/——/—No———00810/41 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Schoenoplectiella mucronata var. mucronata
ヒメカンガレイ		—✓————/——/—No———00810/41 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scirpus maximowiczii
タカネクロスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———02811/36 (2.8%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scleria mikawana
ミカワシンジュガヤ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00810/156 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scleria sumatrensis
クロミノシンジュガヤ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———00810/156 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Agrostis hideoi
ユキクラヌカボ		——✓✓✓—/——/—No———0412933/109 (2.8%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anthoxanthum odoratum subsp. nipponicum
ミヤマハルガヤ		—✓——✓—/——/—No———0012930/43 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aristida boninensis
マツバシバ		——✓✓✓—/——/—No———0112931/136 (0.7%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aristida takeoi
オオマツバシバ		——✓✓✓—/——/—No———0112931/136 (0.7%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calamagrostis masamunei
ヤクシマノガリヤス		———✓✓—/——/—No———0012930/101 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calamagrostis nana subsp. hayachinensis
ザラツキヒナガリヤス		———✓✓—/——/—No———0012930/101 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chikusichloa aquatica
ツクシガヤ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0012930/2 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chikusichloa brachyanthera
イリオモテガヤ		——————/——/—No———0012930/2 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elymus humidus
ミズタカモジ		—✓—✓✓—/——/—No———0112931/158 (0.6%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elymus tsukushiensis var. tsukushiensis
オニカモジ		———✓——/——/—No———0112931/10 (10.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eriachne armittii
イゼナガヤ		—✓—✓——/——/—No———0012930/33 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eulalia speciosa
ウンヌケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0012930/9 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Festuca ovina var. chiisanensis
チイサンウシノケグサ		————✓—/——/—No———0312933/368 (0.8%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Festuca takedana
タカネソモソモ		———✓✓—/——/—No———0312933/368 (0.8%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Garnotia acutigluma
アオシバ		—✓✓✓✓—/——/—No———0012930/14 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heteropogon contortus
アカヒゲガヤ		—✓✓✓✓—/8—/—No———0012930/6 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Poa acroleuca var. ryukyuensis
オキナワミゾイチゴツナギ		———✓✓—/——/—No———0712936/375 (1.6%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Poa glauca var. glauca
タカネタチイチゴツナギ		——✓✓——/——/—No———0712936/375 (1.6%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trisetum koidzumianum
ミヤマカニツリ		———✓✓—/——/—No———0012930/23 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trisetum spicatum subsp. alascanum
リシリカニツリ		———✓——/——/—No———0012930/34 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Urochloa villosa
ビロードキビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0412933/61 (4.9%)211/9005 (2.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Corydalis kushiroensis
チドリケマン		—✓✓✓✓—/——/—No———02212/325 (0.6%)16/680 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Epimedium diphyllum subsp. kitamuranum
サイコクイカリソウ		———✓✓—/——/—No———0070/81 (0.0%)4/473 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Epimedium koreanum var. coelestre
クモイイカリソウ		———✓✓—/——/—No———0070/81 (0.0%)4/473 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum gassanense
ガッサントリカブト		—✓—✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum jaluense subsp. iwatekense
センウズモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum mashikense
マシケレイジンソウ		———✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum nipponicum subsp. micranthum
キタザワブシ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum nipponicum subsp. nipponicum var. septemcarpum
ミョウコウトリカブト		—✓—✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum okuyamae var. wagaense
ワガトリカブト		———✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconitum zigzag subsp. zigzag
タカネトリカブト		————✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Adonis shikokuensis
シコクフクジュソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———02301/34 (2.9%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anemone amurensis
ウラホロイチゲ		—✓—✓✓—/1—/—No———00300/104 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callianthemum hondoense
キタダケソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/15 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clematis fusca var. fusca
クロバナハンショウヅル		——————/——/—No———00300/245 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clematis terniflora var. boninensis
ムニンセンニンソウ		—✓—✓✓—/2—/—No———00300/245 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dichocarpum pterigionocaudatum
キバナサバノオ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/29 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Halerpestes kawakamii
ヒメキンポウゲ		——✓✓✓—/——/—No———00300/9 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ranunculus chinensis
コキツネノボタン		—✓✓✓✓—/——/—No———06304/444 (0.9%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ranunculus ternatus var. ternatus
ヒキノカサ		———✓——/——/—No———06304/444 (0.9%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum aquilegiifolium var. daisenense
ダイセンカラマツ		———✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum baicalense
ハルカラマツ		—✓✓✓✓—/3—/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum foetidum var. apoiense
アポイカラマツ		—✓—✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum foetidum var. glabrescens
チャボカラマツ		———✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum integrilobum
ナガバカラマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum microspermum
コゴメカラマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum minus var. yamamotoi
イシヅチカラマツ		—✓—✓✓—/——/—No———27303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum sekimotoanum
イワカラマツ		—✓—✓✓—/——/—No———27303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum simplex var. brevipes
ノカラマツ		—✓—✓✓—/2—/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Thalictrum tuberiferum var. yakusimense
ヤクシマカラマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Meliosma arnottiana subsp. oldhamii var. hachijoensis
サクノキ		———✓✓—/——/—No———0000/75 (0.0%)0/103 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Buxus liukiuensis
オキナワツゲ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0231/107 (0.9%)2/142 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Paeonia obovata
ベニバナヤマシャクヤク		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/69 (1.4%)1/69 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ribes triste
トカチスグリ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0994/145 (2.8%)4/145 (2.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mitella nuda
マルバチャルメルソウ		—✓✓✓✓—/8—/—No———0090/5 (0.0%)8/835 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Peltoboykinia watanabei
ワタナベソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/2 (0.0%)8/835 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saxifraga sendaica
センダイソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0493/503 (0.6%)8/835 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saxifraga sendaica f. laciniata
モミジバセンダイソウ		————✓—/——/—No———0493/503 (0.6%)8/835 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylotelephium cauticola
ヒダカミセバヤ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00230/26 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hylotelephium ussuriense var. tsugaruense
ツガルミセバヤ		—✓✓✓✓—/——/—No———00230/26 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Meterostachys sikokianus
チャボツメレンゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00230/1 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orostachys malacophylla var. boehmeri
コモチレンゲ		———✓✓—/——/—No———00230/18 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orostachys malacophylla var. iwarenge
イワレンゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00230/18 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orostachys malacophylla var. malacophylla
ゲンカイイワレンゲ		—✓—✓——/——/—No———00230/18 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Phedimus sikokianus
ヒメキリンソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00230/27 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sedum mukojimense
ムコジママンネングサ		—✓✓✓✓—/——/—No———03232/269 (0.7%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sedum polytrichoides subsp. polytrichoides
ウンゼンマンネングサ		—✓——✓—/1—/—No———03232/269 (0.7%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sedum tosaense
ヤハズマンネングサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———03232/269 (0.7%)19/1332 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myriophyllum oguraense
オグラノフサモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0664/75 (5.3%)4/147 (2.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Astragalus frigidus subsp. parviflorus
リシリオウギ		———✓✓—/——/—No———074563/1674 (0.2%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cajanus scarabaeoides
ビロードヒメクズ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———054562/19 (10.5%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dalbergia candenatensis
ヒルギカズラ		LC✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		498 Mbp
151		52
44.1 Mbp		154564/246 (1.6%)196/16547 (1.2%)2024-10-08
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Glycine koidzumii
ミヤコジマツルマメ		——✓✓✓—/——/—No———0524565/51 (9.8%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lespedeza maximowiczii
チョウセンキハギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———014561/66 (1.5%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lespedeza melanantha
クロバナキハギ		—✓✓✓✓—/——/—No———014561/66 (1.5%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oxytropis campestris subsp. rishiriensis
リシリゲンゲ		——✓✓✓—/——/—No———014561/293 (0.3%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oxytropis retusa
ヒダカミヤマノエンドウ		—✓✓✓✓—/——/—No———014561/293 (0.3%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sophora tomentosa
イソフジ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———024561/64 (1.6%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vigna adenantha
コチョウインゲン		LC✓✓✓✓—/3—/—No———004560/2 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Agrimonia coreana
チョウセンキンミズヒキ		—✓✓✓✓—/——/—No———004670/18 (0.0%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aruncus dioicus var. subrotundus
アポイヤマブキショウマ		——————/——/—No———004670/6 (0.0%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Filipendula tsuguwoi
シコクシモツケソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———024671/22 (4.5%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potentilla discolor
ツチグリ		—✓✓✓✓—/3—/—No———064673/391 (0.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potentilla fruticosa var. rigida
キンロバイ		———✓✓—/——/—No———114671/6 (16.7%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potentilla miyabei
メアカンキンバイ		—✓—✓✓—/——/—No———064673/391 (0.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potentilla niponica
ヒロハノカワラサイコ		—✓✓✓✓—/——/—No———064673/391 (0.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Potentilla nivea var. camtschatica
ウラジロキンバイ		—✓——✓—/——/—No———064673/391 (0.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pyrus ussuriensis var. hondoensis
アオナシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0214679/76 (11.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rubus lambertianus
シマバライチゴ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0164678/764 (1.0%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rubus swinhoei
タイワンウラジロイチゴ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0164678/764 (1.0%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sanguisorba obtusa
ナンブトウウチソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———004670/24 (0.0%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Spiraea media var. sericea
エゾシモツケ		—✓——✓—/4—/—No———024672/110 (1.8%)141/3948 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Elaeagnus epitricha
クマヤマグミ		—✓✓✓✓—/2—/—No———03103/80 (3.8%)8/95 (8.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Colubrina asiatica
ヤエヤマハマナツメ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00270/30 (0.0%)11/939 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parietaria micrantha var. coreana
タチゲヒカゲミズ		———✓✓—/——/—No———02141/22 (4.5%)4/1124 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pellionia brevifolia
アラゲサンショウソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00140/17 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pellionia yosiei
ナガバサンショウソウ		———✓✓—/——/—No———00140/17 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pilea swinglei
ソハヤキミズ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00140/257 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Quercus hondae
ハナガガシ		VU✓✓✓✓—/3—/—No———0598641/600 (6.8%)54/963 (5.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Betula chichibuensis
チチブミネバリ		CR✓✓✓✓—/3—/—No———04322/87 (2.3%)14/219 (6.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Betula ovalifolia
ヤチカンバ		LC✓—✓✓—/——/—No———04322/87 (2.3%)14/219 (6.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Begonia fenicis
コウトウシュウカイドウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111211/1070 (1.0%)12/1071 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euonymus austroliukiuensis
リュウキュウツルマサキ		———✓✓—/——/—No———0241/96 (1.0%)2/760 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euonymus chibae
ヒゼンマユミ		——✓✓✓—/——/—No———0241/96 (1.0%)2/760 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euonymus yakushimensis
アオツリバナ		—✓—✓✓—/1—/—No———0241/96 (1.0%)2/760 (0.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oxalis obtriangulata
オオヤマカタバミ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0553/453 (0.7%)3/477 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphorbia octoradiata
ハギクソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———0249417/1341 (1.3%)48/3769 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphorbia watanabei subsp. watanabei
フジタイゲキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0249417/1341 (1.3%)48/3769 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Excoecaria formosana var. daitoinsularis
ダイトウセイシボク		——✓✓✓—/——/—No———02942/19 (10.5%)48/3769 (1.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Drypetes integerrima
ハツバキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/63 (0.0%)0/68 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salix nakamurana subsp. kurilensis
ヒダカミネヤナギ		—✓✓✓✓—/——/—No———0459518/489 (3.7%)44/926 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salix rupifraga
コマイワヤナギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0459518/489 (3.7%)44/926 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scolopia oldhamii
トゲイヌツゲ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00950/15 (0.0%)44/926 (4.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola alliariifolia
ジンヨウキスミレ		—✓✓✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola grayi
イソスミレ		—✓✓✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola kitamiana
シレトコスミレ		——✓✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola patrinii var. angustifolia
ホソバシロスミレ		———✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola raddeana
タチスミレ		—✓✓✓✓—/2—/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viola yubariana
シソバキスミレ		—✓—✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrobryum floribundum
ウスカワゴロモ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/41 (0.0%)0/420 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrobryum japonicum
カワゴロモ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0000/41 (0.0%)0/420 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypericum sampsonii
ツキヌキオトギリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———014147/372 (1.9%)7/448 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypericum yezoense
エゾオトギリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———014147/372 (1.9%)7/448 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypericum yojiroanum
ダイセツヒナオトギリ		——✓✓✓—/——/—No———014147/372 (1.9%)7/448 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geranium soboliferum var. kiusianum
ツクシフウロ		—✓—✓✓—/——/—No———0153911/186 (5.9%)31/532 (5.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rotala elatinomorpha
ヒメキカシグサ		———✓✓—/——/—No———00250/27 (0.0%)11/425 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trapa incisa
ヒメビシ		LC✓✓✓✓—/—✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		473 Mbp
43.2		262
13.8 Mbp		24253/25 (12.0%)11/425 (2.6%)2023-05-24
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Circaea canadensis subsp. quadrisulcata
エゾミズタマソウ		—✓——✓—/——/—No———00100/10 (0.0%)7/478 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Epilobium hirsutum
オオアカバナ		LC✓✓✓✓—/7—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		336 Mbp
58		1,096
633 kbp		24102/113 (1.8%)7/478 (1.5%)2025-02-21
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Epilobium platystigmatosum
トダイアカバナ		——✓✓✓—/——/—No———04102/113 (1.8%)7/478 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ludwigia adscendens
ケミズキンバイ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———01101/67 (1.5%)7/478 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ludwigia peploides subsp. stipulacea
ミズキンバイ		——✓✓✓—/——/—No———01101/67 (1.5%)7/478 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bredia okinawensis
コバノミヤマノボタン		—✓✓✓✓—/1—/—No———0060/9 (0.0%)5/3654 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melastoma candidum var. alessandrense
イオウノボタン		—✓—✓✓—/——/—No———2564/61 (6.6%)5/3654 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acer itoanum
クスノハカエデ		———✓✓—/——/—No———010335/170 (2.9%)14/1242 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acer miyabei
クロビイタヤ		VU✓✓✓✓—/5—/—No———010335/170 (2.9%)14/1242 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acer pycnanthum
ハナノキ		VU✓✓✓✓—/4—/—No———010335/170 (2.9%)14/1242 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melicope nishimurae
ムニンゴシュユ		—✓✓✓✓—/4—/—No———001180/147 (0.0%)40/1569 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zanthoxylum yakumontanum
ヤクシマカラスザンショウ		—✓—✓✓—/3—/—No———051183/218 (1.4%)40/1569 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Daphne koreana
チョウセンナニワズ		—✓✓✓✓—/——/—No———0181/57 (1.8%)7/578 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Daphnimorpha kudoi
シャクナンガンピ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0080/2 (0.0%)7/578 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplomorpha albiflora
ミヤマガンピ		———✓✓—/——/—No———0080/4 (0.0%)7/578 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diplomorpha pauciflora var. pauciflora
サクラガンピ		—✓————/——/—No———0080/4 (0.0%)7/578 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arabidopsis kamchatica subsp. kawasakiana
タチスズシロソウ		—✓—✓✓—/——/—No———24218018/27 (29.6%)127/3552 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arabis flagellosa var. kawachiensis
カワチスズシロソウ		———✓✓—/——/—No———0138018/102 (7.8%)127/3552 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arabis tanakana
クモイナズナ		———✓✓—/——/—No———0138018/102 (7.8%)127/3552 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Draba sakuraii var. nipponica
クモマナズナ		—✓——✓—/——/—No———048012/379 (0.5%)127/3552 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rorippa globosa
ミギワガラシ		—✓✓✓✓—/——/—No———018011/67 (1.5%)127/3552 (3.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Balanophora nipponica
ミヤマツチトリモチ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/28 (3.6%)1/48 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Balanophora subcupularis
アマクサツチトリモチ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/28 (3.6%)1/48 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limonium wrightii var. arbusculum
イソマツ		——————/——/—No———0232/296 (0.7%)3/634 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limonium wrightii var. wrightii
キバナイソマツ		——✓✓——/——/—No———0232/296 (0.7%)3/634 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aconogonon ajanense
ヒメイワタデ		—✓—✓✓—/——/—No———04472/138 (1.4%)26/1004 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Persicaria taquetii
ヌカボタデ		—✓✓✓✓—/2—/—No———08475/87 (5.7%)26/1004 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rumex gmelinii
カラフトノダイオウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———011477/130 (5.4%)26/1004 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rumex longifolius
ノダイオウ		—✓✓✓✓—/6—/—No———011477/130 (5.4%)26/1004 (2.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Drosera anglica
ナガバノモウセンゴケ		—✓✓✓——/6—/—No———0574/92 (4.3%)5/94 (5.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Drosera toyoakensis
ナガバノイシモチソウ		——————/——/—No———0574/92 (4.3%)5/94 (5.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arenaria katoana var. katoana
カトウハコベ		——————/——/—No———02411/104 (1.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Arenaria merckioides var. chokaiensis
チョウカイフスマ		——————/——/—No———02411/104 (1.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cerastium akiyoshiense
アキヨシミミナグサ		———✓✓—/——/—No———00410/121 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cerastium arvense subsp. strictum var. mitsumorense
ミツモリミミナグサ		——————/——/—No———00410/121 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cerastium pauciflorum var. amurense
タガソデソウ		———✓✓—/——/—No———00410/121 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cerastium rubescens var. koreanum
タカネミミナグサ		———✓✓—/——/—No———00410/121 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Moehringia trinervia
タチハコベ		—✓✓✓✓—/4—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.24 Gbp
35		454
10.5 Mbp		22411/29 (3.4%)26/2164 (1.2%)2024-06-03
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudostellaria heterantha var. linearifolia
ヒナワチガイソウ		———✓✓—/——/—No———01411/22 (4.5%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudostellaria japonica
ナンブワチガイソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01411/22 (4.5%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudostellaria sylvatica
クシロワチガイソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———01411/22 (4.5%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene aomorensis
アオモリマンテマ		———✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene foliosa var. foliosa
エゾマンテマ		——————/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene kiusiana
オグラセンノウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene sieboldii
マツモトセンノウ		—✓—✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene wilfordii
エンビセンノウ		—✓✓✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Silene yanoei
テバコマンテマ		——✓✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stellaria bungeana
オオハコベ		—✓✓✓✓—/——/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stellaria hibinoi
ツカモトハコベ		—✓✓✓✓—/——/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stellaria ruscifolia
シコタンハコベ		—✓✓✓✓—/——/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salicornia perennans
アッケシソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———034212/180 (1.1%)41/1955 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Suaeda japonica
シチメンソウ		—✓✓✓——/2—/—No———034213/103 (2.9%)41/1955 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Suaeda malacosperma
ヒロハマツナ		—✓✓✓✓—/2—/—No———034213/103 (2.9%)41/1955 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Montia fontana
ヌマハコベ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0040/16 (0.0%)3/292 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Portulaca okinawensis var. amamiensis
アマミマツバボタン		—✓——✓—/——/—No———0111/87 (1.1%)1/88 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Portulaca okinawensis var. okinawensis
オキナワマツバボタン		—✓————/——/—No———0111/87 (1.1%)1/88 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Portulaca psammotropha
マルバケヅメクサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0111/87 (1.1%)1/88 (1.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cardiandra moellendorffii
オオクサアジサイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0661/136 (0.7%)1/263 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deutzia uniflora
ウメウツギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0060/75 (0.0%)1/263 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Deutzia zentaroana
ブンゴウツギ		—✓✓✓✓—/——/—No———0060/75 (0.0%)1/263 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hydrangea minamitanii
ヒュウガアジサイ		—✓—✓✓—/——/—No———0661/136 (0.7%)1/263 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Kirengeshoma palmata
キレンゲショウマ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———0060/3 (0.0%)1/263 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polemonium caeruleum subsp. laxiflorum var. paludosum
クシロハナシノブ		———✓✓—/——/—No———0020/30 (0.0%)1/420 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polemonium caeruleum subsp. yezoense var. nipponicum
ミヤマハナシノブ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/30 (0.0%)1/420 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Polemonium caeruleum subsp. yezoense var. yezoense
エゾハナシノブ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/30 (0.0%)1/420 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eurya emarginata var. minutissima
マメヒサカキ		—✓——✓—/——/—No———0010/76 (0.0%)1/233 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lysimachia barystachys
ノジトラノオ		—✓✓✓✓—/1—/—No———05333/175 (1.7%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lysimachia leucantha
サワトラノオ		—✓✓✓✓—/——/—No———05333/175 (1.7%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lysimachia ohsumiensis
ヘツカコナスビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———05333/175 (1.7%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myrsine maximowiczii
シマタイミンタチバナ		—✓—✓✓—/3—/—No———01331/92 (1.1%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula cuneifolia var. heterodonta
ミチノクコザクラ		——✓✓✓—/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula hidakana
ヒダカイワザクラ		—✓✓✓✓—/2—/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula modesta subsp. modesta var. matsumurae
レブンコザクラ		——————/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula reinii var. kitadakensis
クモイコザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula reinii var. reinii
コイワザクラ		——✓✓——/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula sorachiana
ソラチコザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Primula takedana
テシオコザクラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Symplocos sonoharae
ミヤマシロバイ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/213 (0.5%)1/214 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Styrax japonicus var. tomentosa
オオバケエゴノキ		——————/——/—No———0000/91 (0.0%)0/125 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bryanthus gmelinii
チシマツガザクラ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00690/2 (0.0%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pyrola faurieana
カラフトイチヤクソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00690/32 (0.0%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron dauricum var. dauricum
エゾムラサキツツジ		—✓————/3—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron goyozanense
ゴヨウザンヨウラク		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron japonoheptamerum var. kyomaruense
キョウマルシャクナゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron komiyamae
アシタカツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron kroniae
ヨウラクツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron lapponicum subsp. parvifolium
サカイツツジ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron makinoi
ホソバシャクナゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron mayebarae
ナンゴクミツバツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron nudipes var. kirishimense
キリシマミツバツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron osuzuyamense
ウラジロミツバツツジ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron sanctum var. lasiogynum
シブカワツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron sanctum var. sanctum
ジングウツツジ		—✓————/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron scabrum
ケラマツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron tsusiophyllum
ハコネコメツツジ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron yakuinsulare
ヤクシマヤマツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhododendron yakumontanum
ヤクシマミツバツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vaccinium boninense
ムニンシャシャンボ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0216912/234 (5.1%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vaccinium microcarpum
ヒメツルコケモモ		—✓✓✓✓✓/6—/—No———0216912/234 (5.1%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vaccinium yakushimense
アクシバモドキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0216912/234 (5.1%)44/3062 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Galium boreale var. kamtschaticum
エゾキヌタソウ		———✓✓—/——/—No———211578/270 (3.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Galium manshuricum
エゾムグラ		—✓—✓✓—/——/—No———011578/270 (3.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Galium niewerthii
ヤブムグラ		———✓✓—/——/—No———011578/270 (3.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Galium pogonanthum var. yakumontanum
ヤクシマヤマムグラ		—✓—✓✓—/——/—No———011578/270 (3.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Galium tokyoense
ハナムグラ		—✓✓✓✓—/——/—No———011578/270 (3.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gardenia boninensis
オガサワラクチナシ		—✓✓✓✓—/3—/—No———04571/69 (1.4%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gynochthodes boninensis
ハハジマハナガサノキ		—✓✓✓✓—/——/—No———07571/44 (2.3%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leptopetalum mexicanum
マルバシマザクラ		—✓—✓✓—/——/—No———00570/7 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Morinda citrifolia
ヤエヤマアオキ		LC✓✓✓✓—/8—/—No———00570/35 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Psychotria homalosperma
オガサワラボチョウジ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00570/522 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scleromitrion verticillatum
ヒロハケニオイグサ		—✓✓✓✓—/——/—No———00570/18 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Serissa japonica
ハクチョウゲ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00570/2 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tarenna subsessilis
シマギョクシンカ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00570/57 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gentiana jamesii
リシリリンドウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———04104/284 (1.4%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gentiana nipponica var. robusta
イイデリンドウ		————✓—/——/—No———04104/284 (1.4%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gentiana satsunanensis
リュウキュウコケリンドウ		———✓✓—/——/—No———04104/284 (1.4%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gentiana takushii
ミヤココケリンドウ		——✓✓✓—/——/—No———04104/284 (1.4%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pterygocalyx volubilis
ホソバツルリンドウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00100/1 (0.0%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Swertia makinoana
シマアケボノソウ		———✓✓—/——/—No———00100/102 (0.0%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Swertia noguchiana
ソナレセンブリ		——✓✓✓—/——/—No———00100/102 (0.0%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Swertia swertopsis
シノノメソウ		——✓✓✓—/——/—No———00100/102 (0.0%)8/1169 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gardneria multiflora
チトセカズラ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0000/4 (0.0%)0/255 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Geniostoma glabrum
オガサワラモクレイシ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/11 (0.0%)0/255 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mitrasacme indica
ヒメナエ		———✓✓—/——/—No———0000/19 (0.0%)0/255 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Apocynum venetum var. basikurumon
バシクルモン		——✓✓✓—/——/—No———23282/8 (25.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vincetoxicum amplexicaule
ロクオンソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vincetoxicum calcareum
イシダテクサタチバナ		—✓—✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vincetoxicum hoyoense
ホウヨカモメヅル		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vincetoxicum katoi
クサナギオゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Vincetoxicum yamanakae
ヤマワキオゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trigonotis radicans var. radicans
ケルリソウ		—✓—✓——/——/—No———00170/37 (0.0%)11/1394 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lycianthes boninensis
ムニンホオズキ		——✓✓✓—/——/—No———004160/58 (0.0%)107/2563 (4.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Physaliastrum chamaesarachoides
ヤマホオズキ		—✓—✓✓—/1—/—No———004160/2 (0.0%)107/2563 (4.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Physaliastrum japonicum
アオホオズキ		—✓✓✓✓—/——/—No———034161/21 (4.8%)107/2563 (4.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chionanthus retusus
ヒトツバタゴ		—✓✓✓✓—/2—/✓No———00800/51 (0.0%)44/608 (7.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lysionotus pauciflorus
シシンラン		—✓✓✓✓—/4—/—No———00100/36 (0.0%)10/2525 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Opithandra primuloides
イワギリソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———02102/132 (1.5%)10/2525 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Titanotrichum oldhamii
マツムラソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00100/1 (0.0%)10/2525 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callitriche hermaphroditica
チシマミズハコベ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———02591/49 (2.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gratiola fluviatilis
カミガモソウ		——✓✓✓—/——/—No———00590/18 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gratiola japonica
オオアブノメ		—✓✓✓✓—/——/—No———00590/18 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hippuris tetraphylla
ヒロハスギナモ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———02591/4 (25.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limnophila trichophylla
コキクモ		—✓✓✓✓—/——/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Limosella aquatica
キタミソウ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0080/12 (0.0%)4/1044 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica ogurae
サンイントラノオ		———✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica onoei
グンバイヅル		—✓✓✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica ornata
トウテイラン		—✓✓✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica ovata subsp. kiusiana var. kitadakemontana
キタダケトラノオ		——————/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica ovata subsp. kiusiana var. kiusiana
ツクシトラノオ		——————/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica schmidtiana subsp. senanensis var. yezoalpina
エゾミヤマクワガタ		———✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica sieboldiana
ハマトラノオ		—✓✓✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica stelleri var. longistyla
エゾヒメクワガタ		—✓—✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronica subsessilis
ルリトラノオ		——✓✓✓—/——/—No———016599/399 (2.3%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronicastrum japonicum var. australe
ナンゴククガイソウ		———✓✓—/——/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronicastrum sibiricum var. zuccarinii
ツクシクガイソウ		—✓—✓✓—/——/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Veronicastrum tagawae
キノクニスズカケ		—✓✓✓✓—/——/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bontia bontioides
ハマジンチョウ		———✓✓—/——/—No———0080/1 (0.0%)4/1044 (0.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ajuga ciliata var. villosior
カイジンドウ		——✓✓✓—/——/—No———051242/43 (4.7%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ajuga incisa
ヒイラギソウ		——✓✓✓—/——/—No———051242/43 (4.7%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ajuga shikotanensis
ツルカコソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———051242/43 (4.7%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callicarpa kochiana
ビロードムラサキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callicarpa oshimensis var. okinawensis
オキナワヤブムラサキ		—✓✓✓✓—/——/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callicarpa shikokiana
トサムラサキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Caryopteris incana
ダンギク		—✓✓✓✓—/3—/—No———021241/10 (10.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dracocephalum argunense
ムシャリンドウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———011241/73 (1.4%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leonurus macranthus
キセワタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———011241/6 (16.7%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Matsumurella tuberifera
ヒメキセワタ		—✓✓✓✓—/——/—No———001240/5 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Meehania montis-koyae
オチフジ		—✓✓✓✓—/1—/—No———001240/9 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mosla chinensis
ホソバヤマジソ		—✓✓✓✓—/3—/—No———001240/14 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pogostemon yatabeanus
ミズトラノオ		—✓✓✓✓—/1—/—No———021241/50 (2.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvia isensis
シマジタムラソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0151248/731 (1.1%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvia koyamae
シナノアキギリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0151248/731 (1.1%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Salvia omerocalyx var. omerocalyx
タジマタムラソウ		——————/——/—No———0151248/731 (1.1%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scutellaria guilielmii
コナミキ		—✓————/——/—No———061244/293 (1.4%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scutellaria kuromidakensis
ヤクシマシソバタツナミ		——✓✓✓—/——/—No———061244/293 (1.4%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scutellaria yezoensis
エゾナミキ		—✓✓✓✓—/——/—No———061244/293 (1.4%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Suzukia luchuensis
ヤエヤマスズコウジュ		—✓✓✓✓—/——/—No———001240/2 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphrasia hachijoensis
ハチジョウコゴメグサ		———✓✓—/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphrasia insignis subsp. iinumae
イブキコゴメグサ		—✓————/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphrasia insignis subsp. insignis var. nummularia
マルバコゴメグサ		———✓✓—/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Euphrasia kisoalpina
コケコゴメグサ		——✓✓✓—/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampyrum laxum var. arcuatum
タカネママコナ		——✓✓✓—/——/—No———02591/20 (5.0%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Melampyrum setaceum
ホソバママコナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———02591/20 (5.0%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orobanche coerulescens
ハマウツボ		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		3.65 Gbp
97		2,775
8.30 Mbp		16594/89 (4.5%)50/1451 (3.4%)2023-11-07
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pedicularis ochiaiana
ヤクシマシオガマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00590/427 (0.0%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pedicularis resupinata subsp. oppositifolia var. microphylla
ミカワシオガマ		—✓✓✓——/——/—No———00590/427 (0.0%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pedicularis schistostegia
ネムロシオガマ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00590/427 (0.0%)50/1451 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pinguicula ramosa
コウシンソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0262/108 (1.9%)6/352 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Utricularia aurea
ノタヌキモ		LC✓✓✓✓—/1—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		180 Mbp
292		59
6.39 Mbp		1363/213 (1.4%)6/352 (1.7%)2026-03-25
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Utricularia dimorphantha
フサタヌキモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0363/213 (1.4%)6/352 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Utricularia ochroleuca
ヤチコタヌキモ		LC✓—✓——/5—/—No———0363/213 (1.4%)6/352 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Avicennia marina
ヒルギダマシ		LC✓✓✓✓—/9—/✓Yes (5)Chromosome,
Reference		457 Mbp
248		331
3.01 Mbp		55121/10 (10.0%)7/1959 (0.4%)2020-03-09
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Adenophora maximowicziana
ヒナシャジン		—✓✓✓✓—/——/—No———01161/69 (1.4%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Adenophora nikoensis var. teramotoi
シライワシャジン		———✓✓—/——/—No———01161/69 (1.4%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Adenophora uryuensis
シラトリシャジン		—✓✓✓✓—/——/—No———01161/69 (1.4%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Codonopsis javanica subsp. japonica
ツルギキョウ		—✓——✓—/1—/—No———02162/45 (4.4%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Codonopsis ussuriensis
バアソブ		—✓✓✓✓—/4—/—No———02162/45 (4.4%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lobelia boninensis
オオハマギキョウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———05163/204 (1.5%)12/1607 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nymphoides coreana
ヒメシロアサザ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0221/40 (2.5%)1/63 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Achillea alpina subsp. japonica
キタノコギリソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———022271/85 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ainsliaea fragrans
マルバテイショウソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/41 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ainsliaea oblonga
ナガバハグマ		—✓—✓✓—/1—/—No———002270/41 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anaphalis sinica var. pernivea
トダイハハコ		——✓✓✓—/——/—No———002270/85 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Anaphalis sinica var. viscosissima
クリヤマハハコ		———✓✓—/——/—No———002270/85 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Artemisia congesta
オニオトコヨモギ		——✓✓✓—/——/—No———0132276/508 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Artemisia glomerata
ハハコヨモギ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0132276/508 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Artemisia gmelinii
イワヨモギ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0132276/508 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Artemisia rubripes
ヤブヨモギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0132276/508 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Artemisia tanacetifolia
シコタンヨモギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0132276/508 (1.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster hispidus var. leptocladus
ヤナギノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster koshikiensis
コシキギク		—✓✓———/1—/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster maackii
ヒゴシオン		—✓✓✓✓—/2—/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster miyagii
オキナワギク		VU✓✓✓✓—/——/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster sohayakiensis
ホソバノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aster tataricus
シオン		—✓✓✓✓—/4—/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bidens cernua
ヤナギタウコギ		LC✓✓✓✓—/8—/—No———042272/128 (1.6%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Carpesium faberi
コバナガンクビソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/23 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysanthemum arcticum subsp. yezoense
チシマコハマギク		——✓✓✓—/——/—No———002270/1 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysanthemum pallasianum
オオイワインチン		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/29 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysanthemum weyrichii
ピレオギク		—✓—✓✓—/——/—No———042273/47 (6.4%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chrysanthemum zawadskii subsp. naktongense var. dissectum
イワギク		——————/——/—No———042273/47 (6.4%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirsium dipsacolepis var. calcicola
アキヨシアザミ		————✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirsium homolepis
オゼヌマアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirsium horiianum
オガアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirsium nipponicum var. sadoense
サドアザミ		———✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cirsium tashiroi var. hidaense
ヒダアザミ		———✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Crepidiastrum chelidoniifolium
クサノオウバノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/4 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Crepidiastrum yoshinoi
イワヤクシソウ		——✓✓✓—/——/—No———002270/14 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Crepis gymnopus
エゾタカネニガナ		———✓✓—/——/—No———022271/115 (0.9%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Echinops setifer
ヒゴタイ		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/151 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Erigeron acris var. linearifolius
ホソバムカシヨモギ		————✓—/——/—No———042273/190 (1.6%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eupatorium lindleyanum var. yasushii
ハマサワヒヨドリ		———✓✓—/——/—No———002270/49 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eupatorium yakushimense
ヤクシマヒヨドリ		———✓✓—/——/—No———002270/49 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Glossocardia bidens
セリバノセンダングサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/3 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Inula linariifolia
ホソバオグルマ		—✓✓✓✓—/——/—No———042272/57 (3.5%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ixeridium laevigatum
ヤナギニガナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/12 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ixeris chinensis subsp. strigosa
タカサゴソウ		——✓✓✓—/——/—No———002270/8 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ixeris longirostra
ツルワダン		——✓✓——/——/—No———002270/8 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leontopodium fauriei var. angustifolium
ホソバヒナウスユキソウ		——✓✓✓—/——/—No———012271/48 (2.1%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leontopodium japonicum var. perniveum
カワラウスユキソウ		——✓✓✓—/——/—No———012271/48 (2.1%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leontopodium miyabeanum
オオヒラウスユキソウ		——————/——/—No———012271/48 (2.1%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ligularia sibirica
アソタカラコウ		—✓✓✓✓—/5—/—No———002270/100 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Parasenecio ogamontanus
オガコウモリ		———✓✓—/——/—No———002270/55 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea acuminata var. sachalinensis
カラフトアザミ		——✓✓——/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea chionophylla
ユキバヒゴタイ		—✓✓✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea fauriei
フォーリーアザミ		—✓—✓✓—/2—/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea franchetii
ミヤマキタアザミ		—✓—✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea inaensis
イナトウヒレン		——✓✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea japonica
ヒナヒゴタイ		—✓✓✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea kudoana
ヒダカトウヒレン		———✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea nipponica subsp. nipponica var. yoshinagae
トサトウヒレン		——————/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Saussurea pulchella
ヒメヒゴタイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Solenogyne mikadoi
コケタンポポ		VU✓—✓✓—/1—/—No———002270/5 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Syneilesis akagii
ヒュウガヤブレガサ		———✓✓—/——/—No———002270/4 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tanacetum vulgare var. boreale
エゾヨモギギク		—✓——✓—/——/—Yes (2)Chromosome,
Reference		4.61 Gbp
28		4,751
3.65 Mbp		252273/83 (3.6%)130/17025 (0.8%)2024-09-21
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Taraxacum kiushianum
ツクシタンポポ		———✓✓—/——/—No———012271/480 (0.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tephroseris flammea subsp. glabrifolia
コウリンカ		—✓—✓✓—/——/—No———002270/34 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Xanthium strumarium subsp. sibiricum
オナモミ		————✓—/——/—No———012271/16 (6.2%)130/17025 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viburnum brachyandrum
シマガマズミ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0131/178 (0.6%)2/210 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viburnum japonicum var. boninsimense
トキワガマズミ		———✓✓—/——/—No———0131/178 (0.6%)2/210 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Viburnum tashiroi
オオシマガマズミ		VU✓✓✓✓—/3—/—No———0131/178 (0.6%)2/210 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera alpigena subsp. glehnii
エゾヒョウタンボク		—✓——✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera cerasina
ウスバヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera chamissoi
チシマヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/2—/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera chrysantha var. crassipes
ネムロブシダマ		—✓—✓✓—/2—/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera demissa var. borealis
キタカミヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera maackii
ハナヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/6—/—Yes (1)Scaffold,
—		793 Mbp
110		233,951
10.6 kbp		15183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)2022-05-20
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera maximowiczii var. sachalinensis
ベニバナヒョウタンボク		—✓——✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lonicera vidalii
オニヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/1—/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scabiosa japonica var. lasiophylla
ソナレマツムシソウ		—✓————/——/—No———01181/36 (2.8%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Triosteum sinuatum
ツキヌキソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00180/10 (0.0%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zabelia integrifolia
イワツクバネウツギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00180/12 (0.0%)12/696 (1.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pittosporum beecheyi
ハハジマトベラ		—✓—✓✓—/3—/—No———0111/112 (0.9%)1/138 (0.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fatsia oligocarpella
ムニンヤツデ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00170/3 (0.0%)14/1000 (1.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica furcijuga
ヒュウガトウキ		—✓—✓✓—/1—/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica japonica var. boninensis
ムニンハマウド		————✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica shikokiana
イヌトウキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica stenoloba
ホソバトウキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica tenuisecta
カワゼンゴ		———✓✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica ubatakensis var. ubatakensis
オオウバタケニンジン		——————/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Angelica yakusimensis
ヤクシマノダケ		—✓—✓✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bupleurum stenophyllum var. stenophyllum
ミシマサイコ		——————/——/—No———00430/105 (0.0%)27/3222 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pterygopleurum neurophyllum
シムラニンジン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00430/1 (0.0%)27/3222 (0.8%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chromophyton vischeri
ヒカリモ		—✓✓———/——/—No———0000/4 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chara braunii
シャジクモ		—✓✓✓——/1—/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.75 Gbp
50		208,426
11.8 kbp		1111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)2018-07-13
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chara globularis var. globularis
カタシャジクモ		——————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nitella axilliformis
ミルフラスコモ		—✓—✓——/2—/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nitella flexilis var. flexilis
ヒメフラスコモ		—✓————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nitella gracilens
キヌフラスコモ		—✓✓✓——/2—/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nitella hyalina
オトメフラスコモ		—✓✓✓—✓/5✓/✓No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Nitella pseudoflabellata var. pseudoflabellata
ホンフサフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Caulerpa parvifolia
ヒナイワズタ		—✓✓✓——/——/—No———0222/95 (2.1%)2/97 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Caulerpa scalpelliformis var. scalpelliformis
クロキズタ		—✓————/1—/—No———0222/95 (2.1%)2/97 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cymopolia vanbosseae
ウスガサネ		—✓✓✓——/——/—No———0000/2 (0.0%)0/15 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acetabularia ryukyuensis
カサノリ		—✓✓✓——/——/—No———0661/15 (6.7%)1/23 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bangia atropurpurea
タニウシケノリ		—✓✓✓—✓/3✓/✓No———0080/39 (0.0%)6/364 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pyropia katadae var. katadae
ソメワケアマノリ		——————/——/—No———0583/143 (2.1%)6/364 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Schimmelmannia benzaiteniana
ナガオバネ		—✓————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Symphyocladiella dendroidea
セトウチハネグサ		—✓✓✓—✓/1✓/✓No———0070/11 (0.0%)7/859 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Gelidium hirsutum
ヤタベグサ		—✓————/——/—No———0000/133 (0.0%)0/169 (0.0%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dendroceros tubercularis
オガサワラキブリツノゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/19 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Asterella cruciata
オオサイハイゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0131/32 (3.1%)2/59 (3.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clevea pusilla
チチブゼニゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Targionia hypophylla
ハマグリゼニゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Apotreubia nana
ヒメトロイブゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/2 (0.0%)1/10 (10.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fossombronia myrioides
イリオモテウロコゼニゴケ		—✓—✓——/——/—No———0111/45 (2.2%)1/48 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Moerckia blytii
チヂレヤハズゴケ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Scapania ornithopoides
ムカシヒシャクゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0565/71 (7.0%)6/104 (5.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acrobolbus knightii
ケハネゴケモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/25 (4.0%)1/48 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Eocalypogeia quelpaertensis
サイシュウホラゴケモドキ		———✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/45 (2.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bazzania ovistipula
カネマルムチゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0363/41 (7.3%)6/195 (3.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tricholepidozia neesii
イリオモテスギバゴケ（テララゴケ）		—✓—✓✓—/——/—No———0161/12 (8.3%)6/195 (3.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Zoopsis liukiuensis
ミジンコゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0060/7 (0.0%)6/195 (3.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Heteroscyphus aselliformis
アマノウロコゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/26 (0.0%)0/113 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Mastigophora diclados
オオサワラゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/2 (50.0%)1/3 (33.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Frullania gaudichaudii
キヤスデゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0111/192 (0.5%)1/192 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Frullania sackawana
サカワヤスデゴケ		———✓✓—/——/—No———0111/192 (0.5%)1/192 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Frullania trichodes
サガリヤスデゴケ		———✓✓—/——/—No———0111/192 (0.5%)1/192 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neohattoria herzogii
ハットリヤスデゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/1 (0.0%)0/4 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cololejeunea inflata
オオシマヨウジョウゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/84 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cololejeunea schmidtii
ヤマトケクサリゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/84 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cololejeunea subfloccosa
カギヨウジョウゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/84 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Colura inuii
イヌイムシトリゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/31 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Colura meijeri
ボウズムシトリゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/31 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Colura tenuicornis
ナガバムシトリゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0010/31 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lejeunea otiana
オチクサリゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/152 (0.0%)1/716 (0.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Radula campanigera subsp. obiensis
オビケビラゴケ		————✓—/——/—No———0020/4 (0.0%)1/210 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Radula chinensis
ミミケビラゴケ		———✓✓—/——/—No———0221/206 (0.5%)1/210 (0.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oedipodium griffithianum
イシヅチゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		269 Mbp
72		1,298
334 kbp		1111/1 (100.0%)1/1 (100.0%)2026-01-26
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diphyscium chiapense subsp. unipapillosum
ミギワイクビゴケ		————✓—/——/—No———0111/11 (9.1%)1/14 (7.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Diphyscium kashmirense
カシミールクマノゴケ		———✓✓—/——/—No———0111/11 (9.1%)1/14 (7.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Encalypta streptocarpa
シナノセンボンゴケ（セイタカヤリカツギ）		—✓✓✓✓—/4—/—No———0331/16 (6.2%)1/17 (5.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Timmia norvegica
ラクヨウクサスギゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/6 (16.7%)1/6 (16.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Seligeria pusilla
コキヌシッポゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0020/14 (0.0%)2/29 (6.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leucobryum glaucum
シロシラガゴケ		—✓✓✓✓—/6—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		437 Mbp
71		2,919
226 kbp		1373/40 (7.5%)7/156 (4.5%)2025-07-28
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leucobryum javense
ジャバシラガゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0373/40 (7.5%)7/156 (4.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Calymperes boninense
オガサワラカタシロゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0000/16 (0.0%)0/163 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Exostratum blumii
シラガゴケモドキ		—✓✓———/——/—No———0000/1 (0.0%)0/163 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leucophanes angustifolium
ニセハブタエゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/8 (0.0%)0/163 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fissidens geppii
ジョウレンホウオウゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0666/131 (4.6%)6/131 (4.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Fissidens javanicus
ジャバホウオウゴケ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Chromosome,
Reference		391 Mbp
89		33
26.8 Mbp		1666/131 (4.6%)6/131 (4.6%)2025-05-01
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhachithecium nipponicum
キブネゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Rhachithecium perpusillum
マゴメゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Molendoa hornschuchiana
ナガバハリイシバイゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00130/4 (0.0%)13/632 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Tortula hoppeana
ハリエゾネジレゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00130/36 (0.0%)13/632 (2.1%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plagiobryum japonicum
ヒョウタンハリガネゴケ		———✓✓—/——/—No———0050/7 (0.0%)5/173 (2.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lewinskya iwatsukii
イボタチヒダゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———04164/54 (7.4%)14/296 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Orthotrichum anomalum
ヤマタチヒダゴケ		—✓✓✓✓—/5—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		277 Mbp
67		86
8.25 Mbp		25163/67 (4.5%)14/296 (4.7%)2025-05-01
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ulota perbreviseta
イブキキンモウゴケ		———✓✓—/——/—No———02162/36 (5.6%)14/296 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ulota yakushimensis
ヤクシマキンモウゴケ		———✓✓—/——/—No———02162/36 (5.6%)14/296 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Hypnodendron vitiense
キダチゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/5 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Garovaglia elegans
カクレゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/11 (0.0%)1/35 (2.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Dendrocyathophorum decolyi
キダチクジャクゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0020/1 (0.0%)2/30 (6.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Distichophyllum osterwaldii
フチナシツガゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0111/43 (2.3%)1/102 (1.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Callicostella papillata
サオヒメゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Bryonorrisia acutifolia
トガリバギボウシゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/16 (6.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Habrodon perpusillus
カマバコモチゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Helodium paludosum
ヌマシノブゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/4 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leucodon coreensis
コマイタチゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/19 (0.0%)1/26 (3.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aerobryidium laosiense
トサノタスキゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/67 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aerobryopsis parisii
ヒカゲノカズラモドキ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/4 (25.0%)1/67 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Meteoriopsis reclinata
タカサゴハイヒモゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/2 (0.0%)1/67 (1.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Ctenidium molluscum
ヤワラクシノハゴケ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0000/14 (0.0%)0/23 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Oedicladium fragile
カタナワゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/23 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Forsstroemia noguchii
シライワスズゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/17 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myurella julacea
カイガラゴケ		—✓✓✓✓—/3✓/✓No———0040/3 (0.0%)4/86 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Myurella tenerrima
トガリカイガラゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0040/3 (0.0%)4/86 (4.7%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Aptychella robusta
オオタマコモチイトゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/20 (0.0%)0/130 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Papillidiopsis macrosticta
ハシボソゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/103 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Stereodontopsis pseudorevoluta
フトハイゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0030/1 (0.0%)3/55 (5.5%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trichosteleum lutschianum
リュウキュウホソエゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/11 (0.0%)0/103 (0.0%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cetraria odontella
トゲエイランタイモドキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———001140/25 (0.0%)78/1831 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Usnocetraria kurokawae
クロカワアワビゴケ		———✓✓—/——/—No———011141/1 (100.0%)78/1831 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Toninia tristis subsp. fujikawae
フジカワゴケ		——————/——/—No———00190/17 (0.0%)19/645 (2.9%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Chorioactis geaster
キリノミタケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/1 (0.0%)0/14 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lysurus sphaerocephalus
コナガエノアカカゴタケ		——✓—✓—/——/—No———0040/9 (0.0%)3/150 (2.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Favolus pseudobetulius
カンバタケモドキ		——————/——/—No———00900/37 (0.0%)54/1949 (2.8%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Plectropomus laevis
コクハンアラ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———03501/9 (11.1%)34/503 (6.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acanthopagrus chinshira
オキナワキチヌ		NT✓✓✓✓✓/——/—No———07292/29 (6.9%)17/177 (9.6%)—

Corals
サンゴ類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Acropora pruinosa
エダミドリイシ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0516927/410 (6.6%)38/550 (6.9%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Porites okinawensis
オキナワハマサンゴ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———016168/430 (1.9%)8/496 (1.6%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Leptoseris amitoriensis
アミトリセンベイサンゴ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0171/61 (1.6%)4/170 (2.4%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Trachyphyllia geoffroyi
ヒユサンゴ		LC✓✓✓✓✓/1—/✓No———00150/1 (0.0%)8/185 (4.3%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Catalaphyllia jardinei
オオナガレハナサンゴ		LC✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Chromosome,
Reference		651 Mbp
78.86		70,828
20.6 kbp		1151/1 (100.0%)4/133 (3.0%)2022-06-07

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Alpheus fujitai
フジタアシボソテッポウエビ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/373 (0.0%)0/1019 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Upogebia sakaii
コブシアナジャコ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/29 (0.0%)0/45 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Lissoporcellana flagellicola
ムチヤギカクレカニダマシ		——✓✓✓—/——/—No———0020/2 (0.0%)2/256 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Neoliomera cerasinus
クラヤミヒラオウギガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/6 (0.0%)1/626 (0.2%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Clistocoeloma sinense
ウモレベンケイガニ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0000/3 (0.0%)0/282 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pseudopinnixa carinata
ウモレマメガニ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)1/133 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Sestrostoma balssi
オオヒメアカイソガニ		———✓✓—/——/—No———0050/2 (0.0%)1/133 (0.8%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Cleistostoma dilatatum
アリアケガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pinnixa balanoglossana
ギボシマメガニ		———✓✓—/——/—No———0000/30 (0.0%)0/173 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pinnotheres bidentatus
フタハピンノ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/173 (0.0%)—
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Pinnotheres cyclinus
マルピンノ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/173 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧Ⅱ類（VU）		Branchiostoma japonicum
ヒガシナメクジウオ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———021225/20 (25.0%)6/28 (21.4%)—