Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists

Updated on 2024-10-01

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Sorex minutissimus hawkeri　
トウキョウトガリネズミ		—————No———09135/70 (7.1%)8/532 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhinolophus perditus
ヤエヤマコキクガシラコウモリ		EN✓✓✓✓No———011115/167 (3.0%)5/171 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Eptesicus japonensis
クビワコウモリ		VU✓✓✓—No———05482/43 (4.7%)29/892 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis gracilis
ウスリホオヒゲコウモリ		—✓———No———0174812/375 (3.2%)29/892 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis nattereri bombinus
ホンドノレンコウモリ		NT✓✓✓✓No———0174812/375 (3.2%)29/892 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis pruinosus
クロホオヒゲコウモリ		EN✓✓✓—No———0174812/375 (3.2%)29/892 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nyctalus aviator
ヤマコウモリ		NT✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.78 Gbp
380.0x		337
61.2 Mbp		13482/8 (25.0%)29/892 (3.3%)2024-05-31
VU
絶滅危惧II類		Pipistrellus endoi
モリアブラコウモリ		NT✓✓✓✓No———08484/77 (5.2%)29/892 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Tadarida insignis
オヒキコウモリ		DD✓✓✓✓No———03101/8 (12.5%)4/145 (2.8%)—

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Coturnix japonica
ウズラ		NT✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		928 Mbp
73.0x		9,641
511 kbp		22841/15 (6.7%)28/203 (13.8%)2016-03-01
VU
絶滅危惧II類		Anas formosa
トモエガモ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.24 Gbp
60.0x		565,536
8.73 kbp		111111/1 (100.0%)59/199 (29.6%)2024-04-22
VU
絶滅危惧II類		Anser fabalis serrirostris
ヒシクイ		—✓✓✓✓No———0141114/15 (26.7%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Branta bernicla orientalis
コクガン		—✓✓✓✓No———021112/9 (22.2%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tadorna tadorna
ツクシガモ		LC✓✓✓✓No———001110/6 (0.0%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Phoebastria albatrus
アホウドリ		VU✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.21 Gbp
44.0x		36,840
68.7 kbp		2574/6 (66.7%)6/27 (22.2%)2020-08-22
VU
絶滅危惧II類		Oceanodroma monorhis
ヒメクロウミツバメ		NT✓✓✓✓No———0202/16 (12.5%)0—
VU
絶滅危惧II類		Gorsachius goisagi
ミゾゴイ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.19 Gbp
103.0x		100,190
43.0 kbp		1372/4 (50.0%)6/66 (9.1%)2021-03-31
VU
絶滅危惧II類		Gorsachius melanolophus
ズグロミゾゴイ		LC✓✓✓✓No———0372/4 (50.0%)6/66 (9.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Grus japonensis
タンチョウ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.19 Gbp
55.0x		57,394
78.4 kbp		19145/9 (55.6%)7/16 (43.8%)2019-05-08
VU
絶滅危惧II類		Grus monacha
ナベヅル		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
67.0x		95,217
38.5 kbp		19145/9 (55.6%)7/16 (43.8%)2020-04-08
VU
絶滅危惧II類		Grus vipio
マナヅル		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
54.0x		107,175
32.9 kbp		11141/4 (25.0%)7/16 (43.8%)2020-04-08
VU
絶滅危惧II類		Charadrius alexandrinus dealbatus
シロチドリ		—✓✓✓✓No———0393/58 (5.2%)8/84 (9.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Himantopus himantopus himantopus
セイタカシギ		LC✓✓✓✓No———2231/3 (33.3%)2/8 (25.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Limosa lapponica baueri
オオソリハシシギ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.03 Gbp
71.0x		139,617
21.3 kbp		11341/4 (25.0%)30/87 (34.5%)2017-12-15
VU
絶滅危惧II類		Numenius madagascariensis
ホウロクシギ		EN✓✓✓✓No———03342/9 (22.2%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Scolopax mira
アマミヤマシギ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.09 Gbp
55.0x		79,353
61.2 kbp		14344/4 (100.0%)30/87 (34.5%)2019-02-15
VU
絶滅危惧II類		Tringa erythropus
ツルシギ		LC✓✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Tringa glareola
タカブシギ		LC✓✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Tringa totanus ussuriensis
アカアシシギ		——✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Rostratula benghalensis benghalensis
タマシギ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.10 Gbp
67.0x		33,928
78.7 kbp		1121/1 (100.0%)2/2 (100.0%)2020-07-10
VU
絶滅危惧II類		Glareola maldivarum
ツバメチドリ		LC✓✓✓✓No———0121/5 (20.0%)2/11 (18.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Larus saundersi
ズグロカモメ		VU✓✓✓✓No———04172/12 (16.7%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna albifrons sinensis
コアジサシ		—✓✓✓✓No———00170/7 (0.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna bergii cristata
オオアジサシ		——✓✓✓No———00170/8 (0.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna dougallii bangsi
ベニアジサシ		—✓✓✓✓No———02171/10 (10.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna sumatrana
エリグロアジサシ		LC✓✓✓✓No———02171/10 (10.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Cepphus carbo
ケイマフリ		LC✓✓✓✓No———01111/3 (33.3%)6/23 (26.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Synthliboramphus wumizusume
カンムリウミスズメ		VU✓✓✓✓No———00110/4 (0.0%)6/23 (26.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Butastur indicus
サシバ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
75.0x		67,994
36.2 kbp		131633/4 (75.0%)134/274 (48.9%)2022-12-09
VU
絶滅危惧II類		Haliaeetus albicilla albicilla
オジロワシ		—✓✓✓✓No———5101636/10 (60.0%)134/274 (48.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliaeetus pelagicus
オオワシ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
49.0x		33,489
86.6 kbp		1101636/10 (60.0%)134/274 (48.9%)2020-08-22
VU
絶滅危惧II類		Otus elegans interpositus
ダイトウコノハズク		——✓✓✓No———1142914/38 (36.8%)26/183 (14.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Otus lempiji pryeri
リュウキュウオオコノハズク		—✓———No———1142914/38 (36.8%)26/183 (14.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Dendrocopos leucotos owstoni
オーストンオオアカゲラ		—✓✓✓✓No———01121/13 (7.7%)8/222 (3.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Dryocopus martius martius
クマゲラ		—✓✓✓✓No———00120/6 (0.0%)8/222 (3.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Falco peregrinus japonensis
ハヤブサ		—✓✓✓✓No———9556526/39 (66.7%)36/67 (53.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Pericrocotus divaricatus divaricatus
サンショウクイ		LC✓✓✓✓No———0010/14 (0.0%)1/86 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Phylloscopus ijimae
イイジマムシクイ		VU✓✓✓✓No———0895/86 (5.8%)6/88 (6.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Luscinia akahige tanensis
タネコマドリ		—✓———No———00240/6 (0.0%)23/291 (7.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Luscinia komadori komadori
アカヒゲ		—————No———00240/6 (0.0%)23/291 (7.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Zoothera dauma major
オオトラツグミ		NT—✓✓✓No———00190/19 (0.0%)14/216 (6.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Emberiza yessoensis yessoensis
コジュリン		—✓✓✓✓No———03462/44 (4.5%)39/288 (13.5%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Chelonia mydas mydas
アオウミガメ		———✓—No———3351/1 (100.0%)3/14 (21.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cuora flavomarginata evelynae
ヤエヤマセマルハコガメ		—✓✓✓✓No———0252/16 (12.5%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Geoemyda japonica
リュウキュウヤマガメ		EN✓✓✓✓No———0050/2 (0.0%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Mauremys mutica kami
ヤエヤマイシガメ		—✓✓✓✓No———2352/20 (10.0%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Goniurosaurus kuroiwae kuroiwae
クロイワトカゲモドキ		—✓———No———0010/27 (0.0%)1/47 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Gekko yakuensis
ヤクヤモリ		NT✓✓✓✓No———0252/91 (2.2%)5/1730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemidactylus bowringii
タシロヤモリ		LC✓✓✓✓No———0050/226 (0.0%)5/1730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Perochirus ateles
ミナミトリシマヤモリ		VU✓✓✓✓No———0050/2 (0.0%)5/1730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Diploderma polygonatum donan
ヨナグニキノボリトカゲ		——✓✓✓No———00100/45 (0.0%)9/576 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Diploderma polygonatum polygonatum
オキナワキノボリトカゲ		——✓✓✓No———00100/45 (0.0%)9/576 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Emoia atrocostata atrocostata
ミヤコトカゲ		——✓✓✓No———0080/36 (0.0%)6/1536 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon barbouri
バーバートカゲ		VU✓✓✓✓No———0281/50 (2.0%)6/1536 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon kishinouyei
キシノウエトカゲ		VU✓✓✓✓No———0281/50 (2.0%)6/1536 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon marginatus
オキナワトカゲ		NT✓✓✓✓No———0281/50 (2.0%)6/1536 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Takydromus dorsalis
サキシマカナヘビ		EN✓✓✓✓No———00360/24 (0.0%)19/404 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Zootoca vivipara
コモチカナヘビ		LC✓✓✓✓Yes (3)Chromosome,
Reference		1.44 Gbp
34.0x		731
3.45 Mbp		33361/2 (50.0%)19/404 (4.7%)2020-04-01
VU
絶滅危惧II類		Calamaria pavimentata miyarai
ミヤラヒメヘビ		——✓✓✓No———01361/18 (5.6%)25/1007 (2.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaphe taeniura schmackeri
サキシマスジオ		——✓✓✓No———00360/20 (0.0%)25/1007 (2.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Achalinus formosanus chigirai
ヤエヤマタカチホヘビ		——✓✓✓No———0000/34 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Emydocephalus ijimae
イイジマウミヘビ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.63 Gbp
82.0x		171,534
18.5 kbp		11111/2 (50.0%)9/56 (16.1%)2019-01-09
VU
絶滅危惧II類		Laticauda laticaudata
ヒロオウミヘビ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.56 Gbp
133.0x		89,677
35.6 kbp		13122/7 (28.6%)8/280 (2.9%)2019-01-09
VU
絶滅危惧II類		Laticauda semifasciata
エラブウミヘビ		NT✓✓✓✓No———03122/7 (28.6%)8/280 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinomicrurus macclellandi iwasakii
イワサキワモンベニヘビ		—✓✓✓✓No———00120/14 (0.0%)8/280 (2.9%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Hynobius bakan
ヤマグチサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius boulengeri
オオダイガハラサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius dunni
オオイタサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius fossigenus
ヒガシヒダサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius guttatus
マホロバサンショウウオ		NT✓✓✓—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius ikioi
ベッコウサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius kuishiensis
イヨシマサンショウウオ		VU✓✓✓—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius nebulosus
カスミサンショウウオ		LC✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius okiensis
オキサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius oyamai
チクシブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius sematonotos
チュウゴクブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius setouchi
セトウチサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius stejnegeri
コガタブチサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius tokyoensis
トウキョウサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius utsunomiyaorum
ヒバサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius vandenburghi
ヤマトサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Onychodactylus kinneburi
シコクハコネサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/132 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Andrias japonicus
オオサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Echinotriton andersoni
イボイモリ		VU✓✓✓✓No———0070/3 (0.0%)5/162 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Nidirana okinavana
ヤエヤマハラブチガエル		EN✓✓✓✓No———00180/34 (0.0%)10/706 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Odorrana amamiensis
アマミハナサキガエル		EN✓✓✓✓No———00180/97 (0.0%)10/706 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Odorrana narina
ハナサキガエル		EN✓✓✓✓No———00180/97 (0.0%)10/706 (1.4%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron japonicum
カワヤツメ		LC✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.07 Gbp
87.8x		4,710
1.60 Mbp		23162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)2013-09-13
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron sp. N.
スナヤツメ北方種		—————No———03162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron sp. S.
スナヤツメ南方種		—————No———03162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Biwia zezera
ゼゼラ		LC✓✓✓✓No———00150/3 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Carassius buergeri subsp. 2
キンブナ		—————No———012793/46 (6.5%)51/2339 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Opsariichthys uncirostris uncirostris
ハス		—✓—✓✓No———03341/32 (3.1%)18/205 (8.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Squalidus chankaensis biwae
スゴモロコ		—✓✓✓✓No———00150/17 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Squalidus japonicus japonicus
デメモロコ		—✓✓✓✓No———00150/17 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis matsubarae
ヤマトシマドジョウ		LC✓✓✓✓No———02112/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis sp. BIWAE type D
トサシマドジョウ		—✓———No———02112/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis striata striata
チュウガタスジシマドジョウ		—✓—✓✓No———02112/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Niwaella delicata
アジメドジョウ		LC✓✓✓✓No———00110/9 (0.0%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysurus aurantiacus
アリアケギバチ		NT✓✓✓—No———06123/34 (8.8%)8/254 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysurus tokiensis
ギバチ		LC✓✓✓—No———06123/34 (8.8%)8/254 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Liobagrus reinii
アカザ		LC✓✓✓✓No———0111/24 (4.2%)1/51 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus leucomaenis imbrius
ゴギ		—✓—✓✓No———05594/59 (6.8%)22/678 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus malma krascheninnikovi
オショロコマ		—✓✓✓✓No———05594/59 (6.8%)22/678 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus malma miyabei
ミヤベイワナ		—✓—✓✓No———05594/59 (6.8%)22/678 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Pungitius tymensis
エゾトミヨ		DD✓✓✓✓No———05141/45 (2.2%)4/57 (7.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oryzias latipes
ミナミメダカ		LC✓✓✓✓Yes (33)Chromosome,
Reference		734 Mbp
1.0x		515
2.53 Mbp		3342438/89 (9.0%)9/92 (9.8%)2007-04-26
VU
絶滅危惧II類		Oryzias sakaizumii
キタノメダカ		LC✓✓✓✓No———042438/89 (9.0%)9/92 (9.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthopagrus pacificus
ナンヨウチヌ		LC✓✓✓✓No———05162/26 (7.7%)9/164 (5.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Cottus kazika
カマキリ（アユカケ）		LC✓—✓✓No———0392/157 (1.3%)6/352 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Odontobutis hikimius
イシドンコ		NT✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)2/18 (11.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophiocara porocephala
ホシマダラハゼ		LC✓✓✓✓No———00150/4 (0.0%)12/282 (4.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthogobius hasta
ハゼクチ		LC✓✓✓✓No———00300/7 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthogobius insularis
ミナミアシシロハゼ		EN✓✓✓✓No———00300/7 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acentrogobius viridipunctatus
キララハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/21 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Apocryptodon punctatus
タビラクチ		LC✓✓✓✓No———00300/4 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Caragobius urolepis
アサガラハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius macrognathos
エドハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius taranetzi
シンジコハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius uchidai
チクゼンハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Leucopsarion petersii
シロウオ		—✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Luciogobius ryukyuensis
ミナミヒメミミズハゼ		NT✓✓✓✓No———00300/42 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Mugilogobius mertoni
ムジナハゼ		LC✓✓✓✓No———03301/32 (3.1%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Odontamblyopus lacepedii
ワラスボ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		963 Mbp
260.0x		394
12.1 Mbp		23302/9 (22.2%)20/2517 (0.8%)2023-10-25
VU
絶滅危惧II類		Pandaka lidwilli
マングローブゴマハゼ		—✓✓✓✓No———00300/5 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Pandaka sp.
ゴマハゼ		—————No———00300/5 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Parkraemeria saltator
ギンポハゼ		NT✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudogobius masago
マサゴハゼ		—✓✓✓✓No———00300/55 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sicyopterus lagocephalus
ルリボウズハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/26 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Trypauchenopsis intermedia
ヒゲワラスボ		LC✓✓✓✓No———00300/5 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Parioglossus palustris
ボルネオハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2517 (0.8%)—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Coenagrion hylas
カラフトイトトンボ		LC✓✓✓✓No———0090/27 (0.0%)4/883 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ischnura ezoin
オガサワライトトンボ		EN✓✓✓✓No———0592/99 (2.0%)4/883 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudagrion microcephalum
アオナガイトトンボ		LC✓✓✓✓No———0090/55 (0.0%)4/883 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus annulatus
オオサカサナエ		LC✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/485 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus nagoyanus
ナゴヤサナエ		NT✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/485 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus oculatus
メガネサナエ		NT✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/485 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlorogomphus brunneus keramensis
アサトカラスヤンマ		CR—✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/31 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlorogomphus okinawensis
オキナワミナミヤンマ		EN✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/31 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemicordulia mindana nipponica
ミナミトンボ		EN✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Macromidia ishidai
サキシマヤマトンボ		LC✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Somatochlora clavata
ハネビロエゾトンボ		—✓✓✓✓No———0000/80 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Boninthemis insularis
シマアカネ		CR✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)5/628 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sympetrum gracile
ナニワトンボ		VU✓✓✓✓No———0472/110 (1.8%)5/628 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Nocticola uenoi miyakoensis
ミヤコホラアナゴキブリ		——✓✓—No———0000/42 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Trypetimorpha japonica
ハウチワウンカ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Euterpnosia chibensis daitoensis
ダイトウヒメハルゼミ		——✓✓✓No———0040/8 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Muda kuroiwae
クロイワゼミ		—✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suisha coreana
チョウセンケナガニイニイ		—✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cacopsylla boninofatsiae
ムニンヤツデキジラミ		———✓✓No———0060/118 (0.0%)2/580 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cacopsylla maculipennis
チャマダラキジラミ		———✓✓No———0060/118 (0.0%)2/580 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Elatobium itoe
ツツジコブアブラムシ		———✓✓No———00680/4 (0.0%)36/5088 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemipodaphis persimilis
ケヤキワタムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Unisitobion corylicola
ハシバミヒゲナガアブラムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Hydrometra albolineata
イトアメンボ		——✓✓✓No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Xiphovelia boninensis
ケブカオヨギカタビロアメンボ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Asclepios shiranui
シオアメンボ		—✓—✓✓No———0030/3 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Halobates matsumurai
シロウミアメンボ		—✓✓✓—No———0030/36 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Limnometra femorata
トゲアシアメンボ		—✓✓✓✓No———0030/14 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Kirkaldyia deyrolli
タガメ		—✓✓——No———0010/1 (0.0%)1/232 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aphelocheirus nawae
トゲナベブタムシ		—✓✓✓—No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Heterotrephes admorsus
エグリタマミズムシ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Kitocoris hahajima
ハハジマハナカメムシ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Myiophanes tipulina
ゴミアシナガサシガメ		——✓✓—No———0080/1 (0.0%)6/1670 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ptilocerus immitis
フサヒゲサシガメ		———✓✓No———0080/3 (0.0%)6/1670 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Triatoma rubrofasciata
オオサシガメ		—✓✓✓✓No———0483/130 (2.3%)6/1670 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Dicranocephalus medius
ブチヒゲツノヘリカメムシ		—✓✓✓✓No———0000/11 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembidion aestuarii
キバネキバナガミズギワゴミムシ		—✓—✓—No———02342/507 (0.4%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembidion sumaoi
オオキバナガミズギワゴミムシ		———✓—No———02342/507 (0.4%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Callytron inspecularis
ヨドシロヘリハンミョウ		—✓✓✓✓No———00340/3 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus granulatus telluris
アカガネオサムシ本州亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maacki aquatilis
マークオサムシ本州亜種		——✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus macleayi amanoi
マックレイセアカオサムシ利尻島亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maeander nobukii
セスジアカガネオサムシ大雪山パルサ湿原亜種		—✓—✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maiyasanus ohkawai
マヤサンオサムシ鵜方亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus porrecticollis pacificus
アキタクロナガオサムシ富士亜種		——✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus uenoi
ドウキョウオサムシ		—✓✓✓—No———02341/430 (0.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlaenius spoliatus motschulskyi
ツヤキベリアオゴミムシ		———✓✓No———00340/46 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cychrus morawitzi iwatensis
セダカオサムシ岩手県亜種		——✓✓✓No———00340/26 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cylindera gracilis
ホソハンミョウ		—✓✓✓—No———00340/67 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Daiconotrechus iwatai
イワタメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Diplocheila elongata
スナハラゴミムシ		——✓✓—No———00340/6 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Harpalus crates
チョウセンゴモクムシ		——✓✓—No———04342/93 (2.2%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Jujiroa ana
ジャアナヒラタゴミムシ		———✓✓No———00340/1 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Kusumia australis
コカシメクラチビゴミムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lophyridia sumatrensis niponensis
ハラビロハンミョウ		—————No———0034/20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Morion boninense
オガサワラクチキゴミムシ		—————No———00340/3 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Morion japonicum
クチキゴミムシ		—————No———00340/3 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paratachys gyotokuensis
ギョウトクコミズギワゴミムシ		—————No———00340/15 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pterostichus isumiensis
イスミナガゴミムシ		———✓—No———04342/289 (0.7%)20/6394 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Trechiama paucisaeta
モニワメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Yamautidius anaulax
アオナミメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus basinotatus
クロホシコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus eximius
キイロコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus sharpi
マダラコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Canthydrus politus
ムツボシツヤコツブゲンゴロウ		——✓—✓No———0000/12 (0.0%)0/123 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neohydrocoptus sp.
ムモンチビコツブゲンゴロウ		—✓———No———0000/7 (0.0%)0/123 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Copelatus nakamurai
トダセスジゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/468 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister chinensis
ゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister rugosus
ヒメフチトリゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister tripunctatus lateralis
コガタノゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Dytiscus marginalis czerskii
エゾゲンゴロウモドキ		—✓✓✓✓No———0020/29 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Graphoderus adamsii
マルガタゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/13 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyphydrus laeviventris laeviventris
ヒメケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/28 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Laccophilus lewisius
ルイスツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/60 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Laccophilus nakajimai
ナカジマツブゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/60 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Nebrioporus hostilis
コシマチビゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/49 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Prodaticus vittatus
オキナワスジゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/44 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gyrinus japonicus
ミズスマシ		—✓✓✓—No———0000/73 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Orectochilus agilis
ツマキレオナガミズスマシ		—✓✓——No———0000/15 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Orectochilus punctipennis
コオナガミズスマシ		—✓✓✓—No———0000/15 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrochus chubu
チュウブホソガムシ		—✓✓✓✓No———0111/36 (2.8%)1/36 (2.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Georissus granulosus
セスジマルドロムシ		———✓—No———0000/12 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrophilus bilineatus cashimirensis
コガタガムシ		—————No———0060/26 (0.0%)6/1280 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ctenistes oculatus
クシヒゲアリヅカムシ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Thiasophila shinanonis
ヤマアリヤドリ		———✓✓No———00660/1 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus hopei binodulosus
オオクワガタ		—✓✓——No———1352/23 (8.7%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus titanus daitoensis
ダイトウヒラタクワガタ		——✓✓—No———1151/11 (9.1%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus titanus hachijoensis
ハチジョウヒラタクワガタ		—————No———1151/11 (9.1%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neolucanus okinawanus
オキナワマルバネクワガタ		——✓✓✓No———0050/24 (0.0%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neolucanus protogenetivus protogenetivus
アマミマルバネクワガタ		—✓✓✓✓No———0050/24 (0.0%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Platycerus viridicuprus kanadai
キュウシュウコルリクワガタ（ニシコルリクワガタ九州亜種）		—✓✓✓✓No———0050/48 (0.0%)4/382 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Omorgus chinensis
オオコブスジコガネ		—✓—✓—No———0000/29 (0.0%)0/96 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aphodius gotoi
ツヤケシマグソコガネ		———✓—No———07584/195 (2.1%)39/4672 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Copris brachypterus
マルダイコクコガネ		———✓—No———01581/30 (3.3%)39/4672 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Copris ochus
ダイコクコガネ		—✓✓✓—No———01581/30 (3.3%)39/4672 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Onthophagus gibbulus
チャバネエンマコガネ		—✓✓✓—No———04582/265 (0.8%)39/4672 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Onthophagus yakuinsulanus
ヤクシマエンマコガネ		———✓—No———04582/265 (0.8%)39/4672 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Leptelmis gracilis
ヨコミゾドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Orientelmis parvula
セマルヒメドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudamophilus japonicus
ケスジドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinonychus satoi
サトウカラヒメドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysobothris boninensis boninensis
オガサワラムツボシタマムシ父島列島亜種		———✓—No———0060/34 (0.0%)4/628 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tamamushia virida virida
ツマベニタマムシ父島・母島列島亜種		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Anadastus pulchelloides
オビヒメコメツキモドキ		—————No———0000/3 (0.0%)0/320 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ermischiella nigriceps
ズグロヒメハナノミ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena formosana boninensis
ボニンヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena pseudalpigena
ニセミヤマヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena rosseoloides
ニセチャイロヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena watanabei
ワタナベヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hoshihananomia ochrothorax
キムネキボシハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hoshihananomia trichopalpis
オガサワラキボシハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Variimorda hiromiae
ロミキンオビハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Agapanthia sakaii
ミチノクケマダラカミキリ		———✓✓No———00260/14 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Allotraeus boninensis
オガサワラトビイロカミキリ		———✓✓No———00260/5 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Boninella satoi satoi
サトウオガサワラカミキリ父島列島亜種		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Boninella takakuwai
ケブカオガサワラカミキリ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ceresium simile simile
チャイロヒメカミキリ小笠原亜種		———✓✓No———00260/9 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Diboma costata
オキナワサビカミキリ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Macropidonia ruficollis
アカムネハナカミキリ		—✓—✓✓No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Mesosa hirtiventris
ケハラゴマフカミキリ		——✓✓✓No———00260/17 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Nortia kusuii
オガサワラムネスジウスバカミキリ		———✓✓No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudiphra bicolor bicolor
フタモンアメイロカミキリ父島列島亜種		———✓✓No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Thyestilla gebleri
アサカミキリ		—✓✓✓✓No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarazo mater
ハハジマヒメカタゾウムシ		——✓✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Megaxyela togashii
オオナギナタハバチ		—✓✓✓—No———0000/24 (0.0%)0/107 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysis nohirai
ノヒラセイボウ		—————No———0020/214 (0.0%)1/485 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Formica yessensis
エゾアカヤマアリ		—✓—✓✓No———041204/3057 (0.1%)90/16980 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Polyrhachis lamellidens
トゲアリ		—✓✓✓✓No———001200/366 (0.0%)90/16980 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pararrhynchium oceanicum miyanoi
ツヤカバフドロバチ母島亜種		———✓✓No———00290/6 (0.0%)19/1063 (1.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembix niponica
ニッポンハナダカバチ		——✓✓✓No———00190/40 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Isodontia boninensis
オガサワラアナバチ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/237 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lestica rufigaster
オガサワラギングチバチ		———✓✓No———00190/6 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Pison hahadzimaense
ハハジマピソン		———✓✓No———00190/20 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Stizus pulcherrimus
キアシハナダカバチモドキ		——✓✓✓No———00190/12 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysphex morosus titidzimaensis
チチジマヌカダカバチ		———✓✓No———00190/187 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus boninensis
オガサワラメンハナバチ		——✓✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus ikedai
イケダメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus incomitatus
キムネメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus yasumatsui
ヤスマツメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Lithurgus ogasawarensis
オガサワラキホリハナバチ		——✓✓✓No———00180/8 (0.0%)10/1119 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Megachile asahinai
アサヒナハキリバチ		———✓✓No———09185/294 (1.7%)10/1119 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ceratina boninensis
オガサワラツヤハナバチ		—✓✓✓✓No———041193/300 (1.0%)81/3614 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Neohapalothrix kanii
カニギンモンアミカ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Deuterophlebia nipponica
ニホンアミカモドキ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyperoscelis eximia insignis
キスジモモブトモリカ		—————No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyperoscelis veternosa
クロモモブトモリカ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hilarimorpha nigra
クロオドリバエモドキ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Microdon katsurai
ケンランアリノスアブ		———✓✓No———021321/62 (1.6%)65/4649 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Sarcophila japonica
ゴヘイニクバエ		———✓✓No———00180/6 (0.0%)11/1501 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Macroscelesia longipes yamatoensis
アシナガモモブトスカシバ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Zygaena niphona hakodatensis
ベニモンマダラ道南亜種		———✓✓No———0894/97 (4.1%)5/422 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Ochlodes subhyalinus asahinai
アサヒナキマダラセセリ		—————No———024561/23 (4.3%)399/2855 (14.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Parnara bada
ヒメイチモンジセセリ		—✓✓✓—No———014561/11 (9.1%)399/2855 (14.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Luehdorfia japonica
ギフチョウ		NT✓✓✓✓Yes (1)Contig,
Reference		507 Mbp
1.7x		569,973
1.33 kbp		131092/5 (40.0%)76/557 (13.6%)2021-05-03
VU
絶滅危惧II類		Anthocharis cardamines hayashii
クモマツマキチョウ八ヶ岳・南アルプス亜種		—✓———No———22611/17 (5.9%)28/904 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Coreana raphaelis yamamotoi
チョウセンアカシジミ		—————No———00520/1 (0.0%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonica onoi onoi
カシワアカシジミ（キタアカシジミ）名義タイプ亜種, 北海道・東北地方亜種		—✓✓——No———00520/5 (0.0%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Panchala ganesa loomisi
ルーミスシジミ		—✓———No———00520/69 (0.0%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Phengaris teleius hosonoi
ゴマシジミ中部高地帯亜種		—————No———03522/11 (18.2%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Plebejus subsolanus yarigadakeanus
アサマシジミ本州高地亜種		—————No———06524/65 (6.2%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zizeeria karsandra
ハマヤマトシジミ		—✓✓✓✓No———00520/2 (0.0%)27/2641 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Argyronome laodice japonica
ウラギンスジヒョウモン		—✓—✓✓No———036182/38 (5.3%)153/5201 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Brenthis daphne rabdia
ヒョウモンチョウ本州中部亜種		——✓✓✓No———136183/4 (75.0%)153/5201 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Lasiommata deidamia kampuzana
ツマジロウラジャノメ四国亜種		——✓——No———066183/9 (33.3%)153/5201 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Limenitis populi jezoensis
オオイチモンジ		—✓✓✓✓No———036182/33 (6.1%)153/5201 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ypthima multistriata niphonica
ウラナミジャノメ日本本土亜種		—✓✓✓—No———006180/49 (0.0%)153/5201 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Amraica kimurai
サキシマオオエダシャク		——✓✓✓No———002050/5 (0.0%)103/11789 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Archiearis notha okanoi
クロフカバシャク		———✓—No———002050/3 (0.0%)103/11789 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypoxystis pulcheraria
アキヨシトガリエダシャク		——✓✓✓No———002050/2 (0.0%)103/11789 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastropacha quercifolia
ヒロバカレハ		—✓✓✓—No———0090/7 (0.0%)6/589 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemaris radians
スキバホウジャク		—✓✓✓✓No———02251/16 (6.2%)15/1404 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Laelia miyanoi
ミヤノスゲドクガ		——✓——No———00770/13 (0.0%)37/8291 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Capsula aerata
ガマヨトウ		—————No———003220/4 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Capsula sparganii
キスジウスキヨトウ		—✓—✓—No———003220/4 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chasmina takakuwai
オガサワラシロガ		——✓——No———003220/8 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chilodes pacificus
ヌマベウスキヨトウ		—————No———003220/1 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Doerriesa coenosa
キュウシュウスジヨトウ		——✓——No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Doerriesa striata
エゾスジヨトウ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Eulocastra sasakii
シラユキコヤガ		——✓——No———003220/6 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Nonagria puengeleri
オオチャバネヨトウ		——✓✓✓No———003220/1 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Plusilla rosalia
ギンモンアカヨトウ		—✓✓✓✓No———003220/1 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Protodeltote wiscotti
マガリスジコヤガ		——✓——No———023221/3 (33.3%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudohermonassa velata
エゾクシヒゲモンヤガ		——✓——No———003220/4 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Xylomoia fusei
イチモジヒメヨトウ		——✓✓✓No———003220/7 (0.0%)154/7125 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Xylomoia graminea
クシロモクメヨトウ		—✓✓✓✓No———003220/7 (0.0%)154/7125 (2.2%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Rimula cumingii
セムシマドアキガイ		—✓—✓✓No———0010/32 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sukashitrochus carinatus
スカシエビス		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarana microtheca
コガラヨシワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarana ogasawarana
オガサワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Neritilia mimotoi
ツバサコハクカノコ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Georissa shikokuensis
ベニゴマオカタニシ		—✓✓✓✓No———0000/61 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neritodryas cornea
オカイシマキ		——✓✓✓No———0010/1 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Septaria cumingiana
カミングフネアマガイ		——✓✓✓No———0010/5 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Smaragdia sp.
ウミヒメカノコ		—————No———0010/3 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Phenacolepas crenulata
ユキスズメ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Awalycaeus abei
アツブタムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus itonis shiotai
ヤサガタイトウムシオイ		———✓✓No———0000/8 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus laevis
ベニムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus oshimanus
オオシマムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus sadoensis
サドムシオイ		—————No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus satsumanus laevicervix
ヌメクビムシオイ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus tsushimanus
ツシマムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax akioi
コウツムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax kiuchii
トウゲンムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax okamurai
オカムラムシオイ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cyclophorus turgidus angulatus
リュウキュウヤマタニシ		—✓✓✓✓No———0000/58 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia inouei
イノウエヤマトガイ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia katorii
トウカイヤマトガイ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia shigetai
モジャモジャヤマトガイ		DD—✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia sp.
ヨナグニヤマトガイ		—————No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia tokunoshimana okinoerabuensis
オキノエラブヤマトガイ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia tokunoshimana tokunoshimana
トクノシマヤマトガイ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Arinia japonica
シリブトゴマガイ		——✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina kumejimana
クメジマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina luchuana
リュウキュウゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina lyrata lyrata
クニガミゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina lyrata tokunoshimana
トクノシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina oshimae
オオシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina septentrionalis
エゾゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina turris chineni
イトカケゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina ultima
ツシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina yonakunijimana
ヨナグニゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pupinella oshimae tokunoshimana
トクノシマアズキガイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cipangopaludina chinensis laeta
マルタニシ		—✓—✓—No———0010/16 (0.0%)1/267 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Batillaria zonalis
イボウミニナ		—✓✓✓✓No———0111/8 (12.5%)1/8 (12.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerithium coralium
コゲツノブエ		LC✓✓✓✓No———0000/42 (0.0%)0/93 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Semisulcospira fuscata
クロカワニナ		—✓—✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pirenella asiatica
ヤエヤマヘナタリ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pirenella pupiformis
カワアイ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Terebralia sulcata
マドモチウミニナ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Finella pupoides
サナギモツボ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenomelania sp. B
タケノコカワニナ		—————No———0010/20 (0.0%)1/120 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Naticarius concinnus
フロガイダマシ		—✓—✓✓No———0000/8 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Naticarius onca
アラゴマフダマ		——✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Polinices mellosus
ロウイロトミガイ		—✓✓✓✓No———0000/11 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Akiyoshia kobayashii
コバヤシミジンツボ		VU✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Akiyoshia uenoi
アキヨシミジンツボ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Moria nipponica
ホラアナミジンニナ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/178 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. E
ムツカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. F
マンゴクウラカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. G
マツシマカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. H
マツカワウラカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. I
オオシンデンカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assimineidae gen. C & sp.
コーヒーイロカワザンショウ		—————No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assimineidae gen. D & sp.
カハタレカワザンショウ		—————No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cavernacmella minima
キビオカチグサ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cavernacmella yamamotonis
ヤマモトゴマオカチグサ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. A
ミニカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. B
エレガントカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. C
デリケートカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ovassiminea sp.
ウラウチコダマカワザンショウ		—————No———0000/2 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudomphala miyazakii
アズキカワザンショウ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bithynia inabai
イナバマメタニシ		——✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/32 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gabbia kiusiuensis
ヒメマルマメタニシ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/32 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clenchiella iriomotensis
ヤイマカチドキシタダミ		—✓—✓✓No———0000/4 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyala delicata
ゴマツボモドキ（シリオレミジンニナ）		—————No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Liroceratia sulcata
ミジンゴマツボ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Pellamora sp.
ウチノミツボ		—————No———0000/2 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Wakauraia sakaguchii
ワカウラツボ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Blanfordia bensoni
オカマメタニシ		—✓✓✓✓No———0010/3 (0.0%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Oncomelania minima
ナタネミズツボ		—✓✓✓✓No———0111/3 (33.3%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pomatiopsidae gen. ooyagii
シモキタシブキツボ		—————No———0111/89 (1.1%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rissoina costulata
スジウネリチョウジガイ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stosicia annulata
ゴマツボ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenothyra japonica
ミズゴマツボ		——✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenothyra recondita
エゾミズゴマツボ（カラフトミズゴマツボ）		——✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Circulus duplicatus
アラウズマキ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Pseudoliotia asteriscus
ヒメシラギク（シラギクマガイ）		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sigaretornus sp. A
イソマイマイ		—————No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sigaretornus sp. B
ガタチンナン		—————No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Teinostoma lucidum
ウミコハクガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Truncatella sp. A
アマミクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Truncatella sp. F
カイグンボウクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acrilla acuminata
ウネナシイトカケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/56 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypermastus lacteus
ヒモイカリナマコツマミガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Mucronalia exilis
ヤセフタオビツマミガイ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/56 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Engina menkeana
ナガゴマフホラダマシ（ゴマフホラダマシ）		——✓✓✓No———0030/10 (0.0%)2/352 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Reticunassa praematurata
オマセムシロ		—✓✓✓✓No———0010/178 (0.0%)1/349 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nassarius arcularia
オリイレヨフバイ		—✓✓✓✓No———0010/178 (0.0%)1/349 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Babylonia kirana
ウスイロバイ		——✓✓✓No———0231/8 (12.5%)2/352 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Vexillum balteolatum
ミノムシガイ		——✓✓✓No———0000/64 (0.0%)0/125 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vexillum rufomaculatum
チビツクシ（ムラクモツクシ）		—————No———0000/64 (0.0%)0/125 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ceratostoma rorifluum
ハネナシヨウラク		—✓✓✓✓No———0060/4 (0.0%)6/966 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Conus boeticus
ツヤイモ		LC✓✓✓✓No———0555/418 (1.2%)5/587 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Conus fulmen
ベッコウイモ		LC✓✓✓✓No———0555/418 (1.2%)5/587 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Duplicaria evoluta
イワカワトクサ		——✓✓✓No———0000/24 (0.0%)0/343 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Trigonostoma scalariformis
オリイレボラ		—✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/59 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cypraea luchuana
リュウキュウダカラ		—————No———0000/3 (0.0%)0/237 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ebala sp.
イリエゴウナ		—————No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cincinna japonica
ニホンミズシタダミ		DD——✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Melanochlamys ezoensis
エゾキセワタ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/91 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Melanochlamys fukudai
ヤミヨキセワタ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/91 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acteocina decoratoides
コメツブツララ		—————No———0000/5 (0.0%)0/23 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cylichnatys yamakawai
カミスジカイコガイダマシ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lactiforis takii
ウミマイマイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/17 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Brachystomia umboniocola
イボキサゴナカセクチキレモドキ		—————No———0000/6 (0.0%)0/70 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Syrnola tenuisculpta
ヌノメホソクチキレ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Radix onychia
オウミガイ		—✓—✓✓No———0161/250 (0.4%)4/415 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gyraulus soritai
ミズコハクガイ		—✓—✓✓No———00200/204 (0.0%)7/665 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Helicorbis cantori
クルマヒラマキガイ（レンズヒラマキガイ）		LC—✓✓✓No———00200/2 (0.0%)7/665 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Aiteng mysticus
ヒミツナメクジ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Auriculastra duplicata
ナラビオカミミガイ		—✓—✓✓No———0010/2 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Blauneria leonardi
サカマキオカミミガイ		———✓✓No———0010/2 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Ellobium chinense
オカミミガイ		DD✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		949 Mbp
125.0x		83,461
21.3 kbp		1111/8 (12.5%)1/146 (0.7%)2023-11-20
VU
絶滅危惧II類		Laemodonta siamensis
クリイロコミミガイ		——✓✓✓No———0010/10 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Laemodonta sp. B
コベソコミミガイ（マルコミミガイ）		—————No———0010/10 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus nucleolus
ウルシヌリハマシイノミ		———✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus ovuloides
デンジハマシイノミ		—✓—✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sculptus
ニワタズミハマシイノミ		——✓✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sincaporensis
キヌカツギハマシイノミ		LC✓✓✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sp.
オウトウハマシイノミ		—————No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Onchidium sp.
ドロアワモチ		—✓———No———0060/13 (0.0%)5/131 (3.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraonchidium fungiforme
キボシアワモチ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Paraonchidium keiense
ヒメキボシアワモチ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Neosuccinea kofui
コウフオカモノアラガイ		—✓—✓✓No———0000/2 (0.0%)0/177 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Elasmias kitaiwojimanum
イオウジマノミガイ		VU—✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/53 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lamellidea biplicata
トウガタノミガイ		VU—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lamellidea ogasawarana
オガサワラノミガイ		VU—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Tornatellides boeningi
ノミガイ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/53 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Enteroplax yaeyamaensis
ヤエヤマクチミゾガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Eostrobilops nipponica nipponica
マツシマクチミゾガイ		———✓—No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bensonella plicidens
クチマガリスナガイ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ptychalaea dedecora
エリマキガイ		VU✓✓✓✓No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vertigo ovata ovata
ナタネキバサナギガイ		—————No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vertigo japonica
ヤマトキバサナギガイ		—✓✓✓✓No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena fulva
ウスチャイロキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena minatoi
ダンジョキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena nesiotica
チャイロキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa dalli
デールギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa decussata
ハブタエギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa gracilispira
ホソヒメギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa ignobilis
アベギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa iijimakuniakii
ツバクロイワギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa iyoensis
イヨギセル		——✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kanjiookuboi
オクシリギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kawamotoi
カワモトギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kubinaga
クビナガギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kurozuensis
クロズギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kyotoensis
キョウトギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa mitsukurii
ミツクリギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa miyazakii
ミヤザキギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa nankaidoensis yanoi
ショウドシマギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa pachyspira
シリブトギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa pilsbryi
カギヒダギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa puellaris
ウブギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa yagurai
ヤグラギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Solitariphaedusa miyoshii
ミヨシギセル		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa callistochila
キンチャクギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa caloptyx caloptyx
イトカケノミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa caloptyx subtilis
ヤクスギイトカケノミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa kamoharai
カモハラギセル		—————No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa mima mima
ザレギセル		———✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa mima tokunoshimana
トクノシマギセル		———✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa nishinoshimana
ニシノシマギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa oshimae degenerata
クサレギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa tabukii
タブキギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa tryoni
トライオンギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa ultima
ヒメナミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tauphaedusa senkakuensis
センカクコギセル		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tosaphaedusa cincticollis
ナカムラギセル		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx cladoptyx
エダヒダノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx entospira
ウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx exodonta
ソトバウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx exulans
ホソウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx hedleyi
チビノミギセル		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx munus
ツムガタノミギセル		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx noviluna
ミカヅキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx oxypomatia
カドシタノミギセル		—————No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx takarai
タカラノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinoennea densecostata
コメツブダワラ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinoennea miyakojimana
ミヤコダワラ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bekkochlamys masakii
マサキベッコウ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bekkochlamys subrejecta
ツシマベッコウ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Helicarionidae gen. & sp.
ベッコウマイマイ科の１種		—————No———0000/171 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japanochlamys crenata
コンゴウクリイロベッコウ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lamprocystis hahajimana hahajimana
ハハジマヒメベッコウ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Luchuconulus edgariana
スミスヒメベッコウ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochlamys sp.
ヨナグニベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochlamys subelimata
トクノシマベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Otesiopsis japonica
レンズガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Otesiopsis kanmuriyamensis
カンムリレンズガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Takemasaia eikoae
エイコベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Deroceras sp.
クロツノナメクジ		—✓———No———0000/258 (0.0%)0/262 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista calcicola
イシマキシロマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista cavitectum
タシママイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista eumenes pergranosa
アラハダシロマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista fausta
サチマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista friedeliana vestita
オオシマフリイデルマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista hachijoensis
ツバキカドマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista kiusiuensis tokunovaga
トクノシマケマイマイ		—✓—✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista lepidophora scutifera
カドマルウロコケマイマイ		———✓—No———0040/17 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista mayasana
マヤサンマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista minima
マメヒロベソマイマイ		——✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista nunobikiensis
ヌノビキケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista omiensis
オウミケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista proba goniosomoides
ミヤマオオベソマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista scepasma
イトマンケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista squarrosa squarrosa
マルテンスオオベソマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista squarrosa tokunoshimana
トクノシマオオベソマイマイ		—✓—✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista takarai
タカラホソマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra awaensis occidentalis
イワミマイマイ		—✓—✓—No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata echigoensis
エチゴマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata emurai
エムラマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata grata
オオタキマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata tobisimae
トビシママイマイ		———✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra latispira latispira
ハクサンマイマイ		—✓✓✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra scaevola scaevola
ミヤマヒダリマキマイマイ		—✓✓✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra yakushimana
ヤクシママイマイ		———✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lepidopisum conospira
カタマメマイマイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nesiohelix irrediviva
エラブマイマイ		——✓✓✓No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nesiohelix solida
アツマイマイ		———✓✓No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraegista apoiensis
アポイマイマイ		DD✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraegista takahidei
タカヒデマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista hiroshifukudai
チョウシュウシロマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Moellendorffia eucharistus
ケハダシワクチマイマイ		——✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Neochloritis tomiyamai
ハジメテビロウドマイマイ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis bracteata tsukubaensis
ツクバビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis fragosa
オオウスビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis hirasei
ヒラマキビロウドマイマイ		———✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis perpunctata
ヒメビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis silvatica
カワリダネビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis takedai
ミニビロウドマイマイ		———✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis tosana
トサビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma adelinae
クマドリヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma atrata
ヤンバルマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma cardiostoma
ココロマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma eucosmia erabuana
オキノエラブヤマタカマイマイ		——✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma eucosmia eucosmia
オキナワヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma fausta
ヤセアナナシマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma mercatoria euterpe
クンチャンマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma moellendorffiana thaanumi
ミノブマイマイ		——✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma omoro
オモロヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma oshimae daemonorum
キカイオオシママイマイ		—✓—✓—No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma perversa
リュウキュウヒダリマキマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma rugosa
チリメンマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma selasia
ツヤマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma sp.
シズオカマイマイ		—✓———No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma sp. B
トナキマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma textilis
オオツヤマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma tokunoshimana
トクノシマヤマタカマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma tsurugisanica
ツルギサンマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Yakuchloritis albolabris
クチジロビロウドマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Yakuchloritis hoshiyamai
ホシヤマビロウドマイマイ		——✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Solemya japonica
アサヒキヌタレガイ		—✓✓✓✓No———0000/19 (0.0%)0/55 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Jolya arata
ヌバタママクラ		——✓✓✓No———00380/1 (0.0%)18/1539 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Anadara crebricostata
メオトサルボオ		—✓✓✓✓No———0141/29 (3.4%)3/133 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Anadara globosa
クマサルボオ		—✓✓✓✓No———0141/29 (3.4%)3/133 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Tegillarca granosa
ハイガイ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		915 Mbp
10.0x		3,631
463 kbp		2241/3 (33.3%)3/133 (2.3%)2020-06-29
VU
絶滅危惧II類		Tucetona auriflua
ウチワガイ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/21 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anomiostrea coralliophila
サンゴガキ		DD✓✓✓✓No———00280/1 (0.0%)15/326 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Magallana ariakensis
スミノエガキ		——✓✓✓No———010283/9 (33.3%)15/326 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Magallana bilineata
ミナミマガキ		—✓✓✓✓No———010283/9 (33.3%)15/326 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinna atropurpurea
スエヒロガイ		—✓✓✓✓No———0121/13 (7.7%)2/70 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cristaria clessini
メンカラスガイ		—✓✓✓✓No———0070/5 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversidens brandtii
オバエボシガイ		DD✓✓✓✓No———0070/2 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversiunio reinianus
オトコタテボシガイ		—✓✓✓✓No———0070/6 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversiunio yanagawensis
ニセマツカサガイ		—✓✓✓✓No———0070/6 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lanceolaria oxyrhyncha
ササノハガイ		—✓✓✓✓No———0070/9 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Obovalis omiensis
カタハガイ		—✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinanodonta calipygos
マルドブガイ		—✓✓✓✓No———0070/44 (0.0%)7/857 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Cadakia punctata
クチベニツキガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Codakia paytenorum
ウラキツキガイ		—✓✓✓✓No———00140/6 (0.0%)7/189 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbria soverbii
カゴガイ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Fragum carinatum
ヒシガイ		—✓—✓—No———06213/12 (25.0%)10/212 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Vasticardium rubicundum compunctum
イレズミザルガイ		—————No———00210/14 (0.0%)10/212 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Gari lessoni
ウスムラサキアシガイ		——✓✓✓No———0231/11 (9.1%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Psammotaea inflata
ミナトマスオ		—————No———0030/1 (0.0%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Hiatula adamsii
ムラサキガイ		—✓✓✓✓No———0030/6 (0.0%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Montrouzieria clathrata
コバコガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cadella crebrimaculata
ホシヤマナミノコザラ		——✓✓✓No———0030/3 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cadella sp.
リュウキュウクサビザラ		—————No———0030/3 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cyclotellina remies
モチヅキザラ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Macalia bruguieri
アマサギガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Scissulina dispar
チガイザクラ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Serratina perplexa
ヒワズウネイチョウ		——✓✓✓No———0030/2 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Iridona iridescens
テリザクラ		—✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Dallitellina rostrata
トンガリベニガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Quadrans gargadia
オオトゲウネガイ		—✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tellinides timorensis
ヘラサギガイ		—✓✓✓✓No———0030/2 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Corbicula leana
マシジミ		LC✓✓✓✓No———0222/483 (0.4%)2/501 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Corbicula sandai
セタシジミ		DD✓✓✓✓No———0222/483 (0.4%)2/501 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina expansa
リュウキュウヒルギシジミ		—✓✓✓✓No———0020/10 (0.0%)2/501 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina fissidens
タイワンヒルギシジミ		—————No———0020/10 (0.0%)2/501 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina yaeyamensis
ヤエヤマヒルギシジミ		—————No———0020/10 (0.0%)2/501 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Glauconome angulata
ハナグモリ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anatinella nicobarica
チトセノハナガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Coelomactra antiquata
アリソガイ		—✓✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactra grandis
リュウキュウアリソガイ		—✓✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactra pulchella
トウカイタママキ		——✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactrotoma depressa
ヒナミルクイ		——✓✓✓No———00100/1 (0.0%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Tresus keenae
ミルクイ		—✓✓✓✓No———00100/3 (0.0%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Dosinia aspera
ツキカガミ		——✓✓✓No———00120/24 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Dosinia troscheli
ヤタノカガミ		—✓✓✓✓No———00120/24 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Meretrix lusoria
ハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/23 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pitar citrinus
ユウカゲハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/8 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pitar sulfureus
イオウハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/8 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Tapes literatus
リュウキュウアサリ		—✓✓✓✓No———00120/7 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Barrimysia cumingii
アケボノガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Barrimysia siphonosomae
ホシムシアケボノガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Borniopsis tsurumaru
ツルマルケボリガイ		——✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Byssobornia adamsi
セワケガイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Divariscintilla toyohiwakensis
ニッポンヨーヨーシジミ		—✓✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ephippodonta gigas
オオツヤウロコガイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tellimya fujitaniana
フジタニコハクノツユ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Salpocola philippinensis
フィリピンハナビラガイ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Barnea japonica
ウミタケ		——✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/35 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cryptomya busoensis
ヒメマスオ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Distugonia decurtata
オフクマスオ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Exolaternula sp.
オヤイヅオキナガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Agriodesma navicula
オビクイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/10 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thracia concinna
シナヤカスエモノガイ		——✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Solen kikuchii
チゴマテ		——✓✓✓No———0111/16 (6.2%)1/16 (6.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Solen sp.
ホソバラフマテ		—————No———0111/16 (6.2%)1/16 (6.2%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Phagocata albata
ソウヤイドウズムシ		—✓—✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Phagocata suginoi
ホクリクホソウズムシ		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Phagocata tenella
ヒダカホソウズムシ		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus aomorensis
アオモリザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus cirratus
カムリザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus ezoensis
エゾザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus homodontus
ホソザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus inukaii
イヌカイザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus iwakiensis
イワキザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus makinoi
ヒメザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus megalodentatus
オオアゴザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus nipponicus
ニッポンザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus sapporensis
ザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus uchidai
ウチダザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Parabeloniscus shimojanai
クメコシビロザトウムシ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/25 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aculepeira matsudae
マツダタカネオニグモ		—✓✓✓✓No———00130/17 (0.0%)9/868 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Argyroneta aquatica
ミズグモ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/410 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Heptathela kimurai sensu lato
キムラグモ（広義）		—✓✓✓✓No———0010/29 (0.0%)1/50 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lycosa ishikariana
イソコモリグモ		—✓✓✓✓No———0020/44 (0.0%)1/584 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Nesticus uenoi
フジホラヒメグモ		———✓✓No———0000/70 (0.0%)0/195 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ryuthela nishihirai sensu lato
オキナワキムラグモ（広義）		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		3.11 Gbp
39.0x		2,521
12.9 Mbp		1111/18 (5.6%)1/50 (2.0%)2024-04-17
VU
絶滅危惧II類		Amamiku amamensis
アマミミナミサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Antecaridina lauensis
ドウクツヌマエビ		—✓✓✓✓No———0030/4 (0.0%)3/507 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Austruca lactea
ハクセンシオマネキ		—✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/120 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Birgus latro
ヤシガニ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.96 Gbp
51.0x		914,468
5.29 kbp		1121/1 (100.0%)2/16 (12.5%)2021-05-18
VU
絶滅危惧II類		Cambaroides japonicus
ニホンザリガニ		DD✓✓✓✓No———0040/5 (0.0%)2/600 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Candidiopotamon kumejimense
クメジマミナミサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Candidiopotamon tokashikense
トカシキミナミサワガニ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chiromantes magnus
オガサワラクロベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/273 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chiromantes ryukyuanum
リュウキュウアカテガニ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Coenobita perlatus
サキシマオカヤドカリ		—✓✓✓✓No———0121/14 (7.1%)2/16 (12.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocheir ogasawaraensis
オガサワラモクズガニ		—✓✓✓✓No———0551/5 (20.0%)1/116 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa amagui
ケラマサワガニ		—✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa aramotoi
アラモトサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa grandiovata
オキナワオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa iheya
イヘヤオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa kumejima
クメジマオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/498 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Macrobrachium miyakoense
ウリガーテナガエビ		DD✓✓✓✓No———0462/266 (0.8%)3/1019 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Macrobrachium placidulum
ネッタイテナガエビ		LC✓✓✓✓No———0462/266 (0.8%)3/1019 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Neocaridina ishigakiensis
イシガキヌマエビ		LC✓✓✓✓No———0131/30 (3.3%)3/507 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Palaemon ogasawaraensis
オガサワラコテナガエビ		—✓—✓✓No———0261/108 (0.9%)3/1019 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Tubuca arcuata
シオマネキ		—✓✓✓✓No———0000/20 (0.0%)0/120 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Spirobolus sp.
ヤエヤママルヤスデ		—✓———No———0000/8 (0.0%)0/23 (0.0%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Salicornia europaea
アッケシソウ		—✓✓✓✓No———023651/177 (0.6%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suaeda japonica
シチメンソウ		—✓✓✓—No———013651/102 (1.0%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suaeda malacosperma
ヒロハマツナ		—✓✓✓✓No———013651/102 (1.0%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix hukaoana
ユビソヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/855 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix nakamurana subsp. kurilensis
ヒダカミネヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/855 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix rupifraga
コマイワヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/855 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Quercus hondae
ハナガガシ		VU✓✓✓✓No———0355122/580 (3.8%)32/908 (3.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ficus nishimurae
オオトキワイヌビワ		—✓✓✓✓No———08206/784 (0.8%)13/1208 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Boehmeria formosana
タイワントリアシ		—✓✓✓✓No———04101/71 (1.4%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Elatostema densiflorum
トキホコリ		———✓✓No———00100/206 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Parietaria micrantha var. coreana
タチゲヒカゲミズ		———✓✓No———02101/22 (4.5%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pellionia yosiei
ナガバサンショウソウ		———✓✓No———00100/13 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pilea swinglei
ソハヤキミズ		—✓✓✓✓No———00100/255 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Balanophora nipponica
ミヤマツチトリモチ		——✓✓✓No———0111/25 (4.0%)1/43 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconogonon ajanense
ヒメイワタデ		—✓✓✓✓No———04232/141 (1.4%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria erectominor var. erectominor
ヒメタデ		———✓—No———03232/85 (2.4%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria foliosa var. nikaii
サイコクヌカボ		———✓✓No———03232/85 (2.4%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria foliosa var. paludicola
ヤナギヌカボ		———✓✓No———03232/85 (2.4%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria taquetii
ヌカボタデ		—✓✓✓✓No———03232/85 (2.4%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex dentatus subsp. nipponicus
コギシギシ		———✓✓No———01231/118 (0.8%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex gmelinii
カラフトノダイオウ		—✓✓✓✓No———01231/118 (0.8%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex longifolius
ノダイオウ		—✓✓✓✓No———01231/118 (0.8%)12/973 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Montia fontana
ヌマハコベ		LC✓✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/286 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Portulaca okinawensis
オキナワマツバボタン		VU✓✓✓✓No———0111/84 (1.2%)1/85 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Arenaria katoana
カトウハコベ		—✓✓✓✓No———02281/110 (0.9%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Arenaria merckioides var. chokaiensis
チョウカイフスマ		—————No———02281/110 (0.9%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium arvense var. ovatum
ミツモリミミナグサ		———✓✓No———00280/115 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium pauciflorum var. amurense
タガソデソウ		———✓✓No———00280/115 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium rubescens var. koreanum
タカネミミナグサ		———✓✓No———00280/115 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Moehringia trinervia
タチハコベ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.24 Gbp
35.0x		454
10.5 Mbp		22281/28 (3.6%)20/2064 (1.0%)2024-06-03
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria heterantha var. linearifolia
ヒナワチガイソウ		———✓✓No———00280/22 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria japonica
ナンブワチガイソウ		—✓✓✓✓No———00280/22 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria sylvatica
クシロワチガイソウ		—✓✓✓✓No———00280/22 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene aomorensis
アオモリマンテマ		———✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene foliosa
エゾマンテマ		—✓✓✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene kiusiana
オグラセンノウ		—✓✓✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene sieboldii
マツモトセンノウ		—✓—✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene wilfordii
エンビセンノウ		—✓✓✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene yanoei
テバコマンテマ		———✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria bungeana
オオハコベ		—✓✓✓✓No———00280/163 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria filicaulis
イトハコベ		—✓✓✓✓No———00280/163 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria ruscifolia
シコタンハコベ		—✓✓✓✓No———00280/163 (0.0%)20/2064 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cassytha pubescens
ケスナヅル		—✓✓✓✓No———00160/11 (0.0%)7/1495 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Cryptocarya chinensis
シナクスモドキ		LC✓✓✓✓No———00160/129 (0.0%)7/1495 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Lindera communis var. okinawensis
オキナワコウバシ		———✓✓No———00160/47 (0.0%)7/1495 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum gassanense
ガッサントリカブト		—✓—✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum jaluense subsp. iwatekense
センウズモドキ		—✓✓✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum mashikense
マシケレイジンソウ		———✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum nipponicum subsp. micranthum
キタザワブシ		—✓✓✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum nipponicum subsp. nipponicum var. septemcarpum
ミョウコウトリカブト		—✓—✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum okuyamae var. wagaense
ワガトリカブト		———✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum zigzag
タカネトリカブト		—✓✓✓✓No———00120/224 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Adonis shikokuensis
シコクフクジュソウ		—✓✓✓✓No———02121/22 (4.5%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anemone amurensis
ウラホロイチゲ		—✓—✓✓No———00120/135 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anemone dichotoma
フタマタイチゲ		———✓✓No———00120/135 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Callianthemum hondoense
キタダケソウ		—✓✓✓✓No———00120/15 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Clematis fusca
クロバナハンショウヅル		—✓✓✓✓No———00120/204 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Clematis terniflora var. boninensis
ムニンセンニンソウ		—✓—✓✓No———00120/204 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Dichocarpum pterigionocaudatum
キバナサバノオ		—✓—✓✓No———00120/28 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Halerpestes kawakamii
ヒメキンポウゲ		——✓✓✓No———00120/9 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pulsatilla cernua
オキナグサ		—✓✓✓✓No———00120/31 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ranunculus chinensis
コキツネノボタン		—✓✓✓✓No———00120/432 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ranunculus ternatus var. ternatus
ヒキノカサ		———✓—No———00120/432 (0.0%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum aquilegiifolium var. daisenense
ダイセンカラマツ		———✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum baicalense
ハルカラマツ		—✓✓✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum foetidum var. apoiense
アポイカラマツ		———✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum foetidum var. glabrescens
チャボカラマツ		———✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum integrilobum
ナガバカラマツ		—✓✓✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum microspermum
コゴメカラマツ		—✓✓✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum sekimotoanum
イワカラマツ		—✓—✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum simplex var. brevipes
ノカラマツ		—✓—✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum tuberiferum var. yakusimense
ヤクシマカラマツ		—✓✓✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum watanabei
タマカラマツ		—✓✓✓✓No———03121/139 (0.7%)7/1877 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Agrimonia coreana
チョウセンキンミズヒキ		—✓✓✓✓No———002020/17 (0.0%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Alchemilla japonica
ハゴロモグサ		—✓✓✓✓No———002020/256 (0.0%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Aruncus dioicus var. subrotundus
アポイヤマブキショウマ		—————No———002020/5 (0.0%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Crataegus jozana
エゾサンザシ		———✓✓No———022021/244 (0.4%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Filipendula tsuguwoi
シコクシモツケソウ		—✓—✓✓No———022021/21 (4.8%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Osteomeles anthyllidifolia var. subrotunda
テンノウメ		——✓✓✓No———002020/5 (0.0%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla discolor
ツチグリ		—✓✓✓✓No———022021/380 (0.3%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla fruticosa var. rigida
キンロバイ		———✓✓No———112021/6 (16.7%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla miyabei
メアカンキンバイ		—✓—✓✓No———022021/380 (0.3%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla niponica
ヒロハノカワラサイコ		—✓✓✓✓No———022021/380 (0.3%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla nivea
ウラジロキンバイ		—✓✓✓✓No———022021/380 (0.3%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pyrus ussuriensis var. hondoensis
アオナシ		—✓✓✓✓No———0122025/67 (7.5%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rosa hirtula
サンショウバラ		—✓✓✓✓No———0112027/279 (2.5%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rubus lambertianus
シマバライチゴ		—✓✓✓✓No———082025/748 (0.7%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rubus pungens var. oldhamii
サナギイチゴ		—✓✓✓✓No———082025/748 (0.7%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Spiraea sericea
エゾシモツケ		———✓✓No———012021/108 (0.9%)78/3788 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Epimedium diphyllum subsp. kitamuranum
サイコクイカリソウ		———✓✓No———0030/82 (0.0%)2/460 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Epimedium koreanum var. coelestre
クモイイカリソウ		———✓✓No———0030/82 (0.0%)2/460 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Euryale ferox
オニバス		LC✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar oguraensis
オグラコウホネ		—✓✓✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar pumila var. ozeensis
オゼコウホネ		———✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar pumila var. pumila
ネムロコウホネ		——✓✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar subintegerrima
ヒメコウホネ		—✓✓✓✓No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nymphaea tetragona var. erythrostigmatica
エゾベニヒツジグサ		—————No———0342/114 (1.8%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Peperomia boninsimensis
シマゴショウ		—✓✓✓✓No———0020/382 (0.0%)2/1079 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chloranthus fortunei
キビヒトリシズカ		—✓✓✓✓No———0111/16 (6.2%)1/74 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aristolochia contorta
マルバウマノスズクサ		—✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Reference		211 Mbp
183.0x		224
2.32 Mbp		1443/228 (1.3%)3/264 (1.1%)2022-03-04
VU
絶滅危惧II類		Aristolochia zollingeriana
コウシュンウマノスズクサ		—✓✓✓✓No———0443/228 (1.3%)3/264 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum crassum
ナンゴクアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. austrokiiensis (in schedule)
キナンカンアオイ		—————No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. fauriei
ミチノクサイシン		—✓—✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. nakaianum
ミヤマアオイ		—✓—✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fudsinoi
フジノカンアオイ		VU✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum hexalobum var. perfectum
キンチャクアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kiusianum var. kiusianum
ツクシアオイ		—————No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kiusianum var. tubulosum
アケボノアオイ		———✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kumageanum var. kumageanum
クワイバカンアオイ		—✓———No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kurosawae
イワタカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum muramatsui var. muramatsui
アマギカンアオイ		———✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum nipponicum var. nankaiense
ナンカイアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum sakawanum var. sakawanum
サカワサイシン		—✓—✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum simile
トクノシマカンアオイ		VU✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum tamaense
タマノカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum unzen
ウンゼンカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum yakusimense
オニカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Paeonia obovata
ベニバナヤマシャクヤク		—✓✓✓✓No———0111/66 (1.5%)1/66 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Eurya minutissima
マメヒサカキ		———✓✓No———0010/72 (0.0%)1/225 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum ascyron var. longistylum
コウライトモエソウ		—✓—✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum yezoense
エゾオトギリ		—✓✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum yojiroanum
ダイセツヒナオトギリ		——✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Drosera anglica
ナガバノモウセンゴケ		—✓✓✓—No———0343/88 (3.4%)4/90 (4.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Drosera indica
ナガバノイシモチソウ		LC✓✓✓✓No———0343/88 (3.4%)4/90 (4.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Corydalis kushiroensis
チドリケマン		——✓✓✓No———00130/228 (0.0%)9/569 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arabis flagellosa var. kawachiensis
カワチスズシロソウ		———✓✓No———094965/104 (4.8%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Arabis tanakana
クモイナズナ		———✓✓No———094965/104 (4.8%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardamine kiusiana
タカチホガラシ		—✓—✓✓No———084966/217 (2.8%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardamine schinziana
エゾノジャニンジン		——✓✓✓No———084966/217 (2.8%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cochlearia oblongifolia
トモシリソウ		—✓—✓✓No———034963/21 (14.3%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Draba nipponica
クモマナズナ		—✓—✓✓No———044962/326 (0.6%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rorippa globosa
ミギワガラシ		—✓✓✓✓No———004960/67 (0.0%)106/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium cauticola f. cauticola
ヒダカミセバヤ		—————No———0090/25 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium pallescens
ムラサキベンケイソウ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium sieboldii var. ettyuense
エッチュウミセバヤ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium ussuriense var. tsugaruense
ツガルミセバヤ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Meterostachys sikokianus
チャボツメレンゲ		—✓✓✓✓No———0090/1 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. boehmeri
コモチレンゲ		———✓✓No———0090/20 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. iwarenge
イワレンゲ		—✓✓✓✓No———0090/20 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. malacophylla
ゲンカイイワレンゲ		—✓—✓—No———0090/20 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum hakonense
マツノハマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum polytrichoides
ウンゼンマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum tosaense
ヤハズマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Astilbe rubra
オオチダケサシ		—✓✓✓✓No———0010/30 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardiandra moellendorffii
オオクサアジサイ		—✓✓✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Kirengeshoma palmata
キレンゲショウマ		EN✓✓✓✓No———0060/3 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Mitella nuda
マルバチャルメルソウ		—✓✓✓✓No———0010/5 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Peltoboykinia watanabei
ワタナベソウ		—✓✓✓✓No———0010/2 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Saxifraga acerifolia
エチゼンダイモンジソウ		—✓✓✓✓No———0111/503 (0.2%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Deutzia uniflora
ウメウツギ		—✓✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Deutzia zentaroana
ブンゴウツギ		—✓✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrangea liukiuensis
リュウキュウコンテリギ		—✓✓✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrangea serrata var. minamitanii
ヒュウガアジサイ		—✓—✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ribes triste
トカチスグリ		—✓✓✓✓No———0000/137 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pittosporum beecheyi
ハハジマトベラ		—✓—✓✓No———0111/111 (0.9%)1/137 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Astragalus frigidus subsp. parviflorus
リシリオウギ		———✓✓No———052953/1584 (0.2%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Glycine koidzumii
ミヤコジマツルマメ		——✓✓✓No———0292954/50 (8.0%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza maximowiczii
チョウセンキハギ		—✓✓✓✓No———012951/64 (1.6%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza melanantha
クロバナキハギ		—✓✓✓✓No———012951/64 (1.6%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza tomentosa
イヌハギ		—✓✓✓✓No———012951/64 (1.6%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Oxytropis retusa
ヒダカミヤマノエンドウ		—✓✓✓✓No———012951/262 (0.4%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Vigna adenantha
コチョウインゲン		LC✓✓✓✓No———002950/2 (0.0%)134/16039 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrobryum floribundum
ウスカワゴロモ		—✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/388 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrobryum japonicum
カワゴロモ		LC✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/388 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oxalis obtriangulata
オオヤマカタバミ		—✓✓✓✓No———0111/426 (0.2%)1/449 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Geranium shikokianum var. kaimontanum
カイフウロ		—✓✓——No———08297/184 (3.8%)27/529 (5.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Geranium soboliferum var. kiusianum
ツクシフウロ		—✓—✓✓No———08297/184 (3.8%)27/529 (5.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamaesyce sparrmannii
ボロジノニシキソウ		———✓—No———0474/42/3645 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Drypetes integerrima
ハツバキ		—✓✓✓✓No———0000/61 (0.0%)0/66 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphorbia watanabei subsp. watanabei
フジタイゲキ		—✓✓✓✓No———0187412/1294 (0.9%)42/3645 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Excoecaria formosana var. daitoinsularis
ダイトウセイシボク		——✓✓✓No———02742/13 (15.4%)42/3645 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Melicope nishimurae
ムニンゴシュユ		—✓✓✓✓No———00740/145 (0.0%)32/1482 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Zanthoxylum yakumontanum
ヤクシマカラスザンショウ		—✓—✓✓No———04743/163 (1.8%)32/1482 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer miyabei var. miyabei
クロビイタヤ		——✓✓—No———07184/170 (2.4%)11/1115 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer oblongum subsp. itoanum
クスノハカエデ		—✓—✓✓No———07184/170 (2.4%)11/1115 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer pycnanthum
ハナノキ		VU✓✓✓✓No———07184/170 (2.4%)11/1115 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Meliosma arnottiana subsp. oldhamii var. hachijoensis
サクノキ		———✓✓No———0000/74 (0.0%)0/100 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ilex matanoana
ムニンイヌツゲ		—✓✓✓✓No———0553/342 (0.9%)3/346 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Euonymus boninensis
ヒメマサキ		—✓✓✓✓No