Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists

Updated on 2024-09-02

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Sorex minutissimus hawkeri　
トウキョウトガリネズミ		—————No———09135/70 (7.1%)8/530 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhinolophus perditus
ヤエヤマコキクガシラコウモリ		EN✓✓✓✓No———010104/167 (2.4%)4/171 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Eptesicus japonensis
クビワコウモリ		VU✓✓✓—No———05462/43 (4.7%)28/889 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis gracilis
ウスリホオヒゲコウモリ		—✓———No———0174612/375 (3.2%)28/889 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis nattereri bombinus
ホンドノレンコウモリ		NT✓✓✓✓No———0174612/375 (3.2%)28/889 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Myotis pruinosus
クロホオヒゲコウモリ		EN✓✓✓—No———0174612/375 (3.2%)28/889 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Nyctalus aviator
ヤマコウモリ		NT✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		1.78 Gbp
380.0x		337
61.2 Mbp		11461/8 (12.5%)28/889 (3.1%)2024-05-31
VU
絶滅危惧II類		Pipistrellus endoi
モリアブラコウモリ		NT✓✓✓✓No———08464/77 (5.2%)28/889 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tadarida insignis
オヒキコウモリ		DD✓✓✓✓No———03101/8 (12.5%)4/145 (2.8%)—

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Coturnix japonica
ウズラ		NT✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		928 Mbp
73.0x		9,641
511 kbp		22831/15 (6.7%)28/203 (13.8%)2016-03-01
VU
絶滅危惧II類		Anas formosa
トモエガモ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.24 Gbp
60.0x		565,536
8.73 kbp		111111/1 (100.0%)59/199 (29.6%)2024-04-22
VU
絶滅危惧II類		Anser fabalis serrirostris
ヒシクイ		—✓✓✓✓No———0141114/15 (26.7%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Branta bernicla orientalis
コクガン		—✓✓✓✓No———021112/9 (22.2%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tadorna tadorna
ツクシガモ		LC✓✓✓✓No———001110/6 (0.0%)59/199 (29.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Phoebastria albatrus
アホウドリ		VU✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		1.21 Gbp
44.0x		36,840
68.7 kbp		2574/6 (66.7%)6/27 (22.2%)2020-08-22
VU
絶滅危惧II類		Oceanodroma monorhis
ヒメクロウミツバメ		NT✓✓✓✓No———0202/16 (12.5%)0—
VU
絶滅危惧II類		Gorsachius goisagi
ミゾゴイ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.19 Gbp
103.0x		100,190
43.0 kbp		1372/4 (50.0%)6/66 (9.1%)2021-03-31
VU
絶滅危惧II類		Gorsachius melanolophus
ズグロミゾゴイ		LC✓✓✓✓No———0372/4 (50.0%)6/66 (9.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Grus japonensis
タンチョウ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.19 Gbp
55.0x		57,394
78.4 kbp		19145/9 (55.6%)7/16 (43.8%)2019-05-08
VU
絶滅危惧II類		Grus monacha
ナベヅル		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
67.0x		95,217
38.5 kbp		19145/9 (55.6%)7/16 (43.8%)2020-04-08
VU
絶滅危惧II類		Grus vipio
マナヅル		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
54.0x		107,175
32.9 kbp		11141/4 (25.0%)7/16 (43.8%)2020-04-08
VU
絶滅危惧II類		Charadrius alexandrinus dealbatus
シロチドリ		—✓✓✓✓No———0393/58 (5.2%)8/84 (9.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Himantopus himantopus himantopus
セイタカシギ		LC✓✓✓✓No———2231/3 (33.3%)2/8 (25.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Limosa lapponica baueri
オオソリハシシギ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.03 Gbp
71.0x		139,617
21.3 kbp		11341/4 (25.0%)30/87 (34.5%)2017-12-15
VU
絶滅危惧II類		Numenius madagascariensis
ホウロクシギ		EN✓✓✓✓No———03342/9 (22.2%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Scolopax mira
アマミヤマシギ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.09 Gbp
55.0x		79,353
61.2 kbp		14344/4 (100.0%)30/87 (34.5%)2019-02-15
VU
絶滅危惧II類		Tringa erythropus
ツルシギ		LC✓✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Tringa glareola
タカブシギ		LC✓✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Tringa totanus ussuriensis
アカアシシギ		——✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Rostratula benghalensis benghalensis
タマシギ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.10 Gbp
67.0x		33,928
78.7 kbp		1121/1 (100.0%)2/2 (100.0%)2020-07-10
VU
絶滅危惧II類		Glareola maldivarum
ツバメチドリ		LC✓✓✓✓No———0121/5 (20.0%)2/11 (18.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Larus saundersi
ズグロカモメ		VU✓✓✓✓No———04162/12 (16.7%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna albifrons sinensis
コアジサシ		—✓✓✓✓No———00160/7 (0.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna bergii cristata
オオアジサシ		——✓✓✓No———00160/8 (0.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna dougallii bangsi
ベニアジサシ		—✓✓✓✓No———02161/10 (10.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Sterna sumatrana
エリグロアジサシ		LC✓✓✓✓No———02161/10 (10.0%)10/103 (9.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Cepphus carbo
ケイマフリ		LC✓✓✓✓No———01111/3 (33.3%)6/23 (26.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Synthliboramphus wumizusume
カンムリウミスズメ		VU✓✓✓✓No———00110/4 (0.0%)6/23 (26.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Butastur indicus
サシバ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
75.0x		67,994
36.2 kbp		131633/4 (75.0%)134/274 (48.9%)2022-12-09
VU
絶滅危惧II類		Haliaeetus albicilla albicilla
オジロワシ		—✓✓✓✓No———5101636/10 (60.0%)134/274 (48.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliaeetus pelagicus
オオワシ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
49.0x		33,489
86.6 kbp		1101636/10 (60.0%)134/274 (48.9%)2020-08-22
VU
絶滅危惧II類		Otus elegans interpositus
ダイトウコノハズク		——✓✓✓No———1132813/38 (34.2%)25/183 (13.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Otus lempiji pryeri
リュウキュウオオコノハズク		—✓———No———1132813/38 (34.2%)25/183 (13.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Dendrocopos leucotos owstoni
オーストンオオアカゲラ		—✓✓✓✓No———01121/13 (7.7%)8/222 (3.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Dryocopus martius martius
クマゲラ		—✓✓✓✓No———00120/6 (0.0%)8/222 (3.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Falco peregrinus japonensis
ハヤブサ		—✓✓✓✓No———9556526/39 (66.7%)36/67 (53.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Pericrocotus divaricatus divaricatus
サンショウクイ		LC✓✓✓✓No———0010/14 (0.0%)1/86 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Phylloscopus ijimae
イイジマムシクイ		VU✓✓✓✓No———0895/86 (5.8%)6/88 (6.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Luscinia akahige tanensis
タネコマドリ		—✓———No———00240/6 (0.0%)23/291 (7.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Luscinia komadori komadori
アカヒゲ		—————No———00240/6 (0.0%)23/291 (7.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Zoothera dauma major
オオトラツグミ		NT—✓✓✓No———00180/19 (0.0%)13/216 (6.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Emberiza yessoensis yessoensis
コジュリン		—✓✓✓✓No———03452/44 (4.5%)38/288 (13.2%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Chelonia mydas mydas
アオウミガメ		———✓—No———3351/1 (100.0%)3/14 (21.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cuora flavomarginata evelynae
ヤエヤマセマルハコガメ		—✓✓✓✓No———0252/16 (12.5%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Geoemyda japonica
リュウキュウヤマガメ		EN✓✓✓✓No———0050/2 (0.0%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Mauremys mutica kami
ヤエヤマイシガメ		—✓✓✓✓No———2352/20 (10.0%)4/108 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Goniurosaurus kuroiwae kuroiwae
クロイワトカゲモドキ		—✓———No———0010/27 (0.0%)1/47 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Gekko yakuensis
ヤクヤモリ		NT✓✓✓✓No———0252/90 (2.2%)5/1728 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemidactylus bowringii
タシロヤモリ		LC✓✓✓✓No———0050/226 (0.0%)5/1728 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Perochirus ateles
ミナミトリシマヤモリ		VU✓✓✓✓No———0050/2 (0.0%)5/1728 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Diploderma polygonatum donan
ヨナグニキノボリトカゲ		——✓✓✓No———00100/45 (0.0%)9/575 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Diploderma polygonatum polygonatum
オキナワキノボリトカゲ		——✓✓✓No———00100/45 (0.0%)9/575 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Emoia atrocostata atrocostata
ミヤコトカゲ		——✓✓✓No———0070/36 (0.0%)5/1536 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon barbouri
バーバートカゲ		VU✓✓✓✓No———0271/50 (2.0%)5/1536 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon kishinouyei
キシノウエトカゲ		VU✓✓✓✓No———0271/50 (2.0%)5/1536 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Plestiodon marginatus
オキナワトカゲ		NT✓✓✓✓No———0271/50 (2.0%)5/1536 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Takydromus dorsalis
サキシマカナヘビ		EN✓✓✓✓No———00330/23 (0.0%)18/401 (4.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Zootoca vivipara
コモチカナヘビ		LC✓✓✓✓Yes (3)Chromosome,
Representative		1.44 Gbp
34.0x		731
3.45 Mbp		33331/2 (50.0%)18/401 (4.5%)2020-04-01
VU
絶滅危惧II類		Calamaria pavimentata miyarai
ミヤラヒメヘビ		——✓✓✓No———01361/17 (5.9%)25/1005 (2.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaphe taeniura schmackeri
サキシマスジオ		——✓✓✓No———00360/20 (0.0%)25/1005 (2.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Achalinus formosanus chigirai
ヤエヤマタカチホヘビ		——✓✓✓No———0000/34 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Emydocephalus ijimae
イイジマウミヘビ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.63 Gbp
82.0x		171,534
18.5 kbp		11111/2 (50.0%)9/56 (16.1%)2019-01-09
VU
絶滅危惧II類		Laticauda laticaudata
ヒロオウミヘビ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.56 Gbp
133.0x		89,677
35.6 kbp		13122/7 (28.6%)8/279 (2.9%)2019-01-09
VU
絶滅危惧II類		Laticauda semifasciata
エラブウミヘビ		NT✓✓✓✓No———03122/7 (28.6%)8/279 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinomicrurus macclellandi iwasakii
イワサキワモンベニヘビ		—✓✓✓✓No———00120/14 (0.0%)8/279 (2.9%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Hynobius bakan
ヤマグチサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius boulengeri
オオダイガハラサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius dunni
オオイタサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius fossigenus
ヒガシヒダサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius guttatus
マホロバサンショウウオ		NT✓✓✓—No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius ikioi
ベッコウサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius kuishiensis
イヨシマサンショウウオ		VU✓✓✓—No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius nebulosus
カスミサンショウウオ		LC✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius okiensis
オキサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius oyamai
チクシブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius sematonotos
チュウゴクブチサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius setouchi
セトウチサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius stejnegeri
コガタブチサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius tokyoensis
トウキョウサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius utsunomiyaorum
ヒバサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hynobius vandenburghi
ヤマトサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Onychodactylus kinneburi
シコクハコネサンショウウオ		VU✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/131 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Andrias japonicus
オオサンショウウオ		NT✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Echinotriton andersoni
イボイモリ		VU✓✓✓✓No———0050/3 (0.0%)3/160 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nidirana okinavana
ヤエヤマハラブチガエル		EN✓✓✓✓No———00170/34 (0.0%)10/703 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Odorrana amamiensis
アマミハナサキガエル		EN✓✓✓✓No———00170/97 (0.0%)10/703 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Odorrana narina
ハナサキガエル		EN✓✓✓✓No———00170/97 (0.0%)10/703 (1.4%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron japonicum
カワヤツメ		LC✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		1.07 Gbp
87.8x		4,710
1.60 Mbp		23162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)2013-09-13
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron sp. N.
スナヤツメ北方種		—————No———03162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Lethenteron sp. S.
スナヤツメ南方種		—————No———03162/10 (20.0%)8/476 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Biwia zezera
ゼゼラ		LC✓✓✓✓No———00150/3 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Carassius buergeri subsp. 2
キンブナ		—————No———012793/46 (6.5%)51/2321 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Opsariichthys uncirostris uncirostris
ハス		—✓—✓✓No———03321/32 (3.1%)16/205 (7.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Squalidus chankaensis biwae
スゴモロコ		—✓✓✓✓No———00150/17 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Squalidus japonicus japonicus
デメモロコ		—✓✓✓✓No———00150/17 (0.0%)9/349 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis matsubarae
ヤマトシマドジョウ		LC✓✓✓✓No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis sp. BIWAE type D
トサシマドジョウ		—✓———No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cobitis striata striata
チュウガタスジシマドジョウ		—✓—✓✓No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Niwaella delicata
アジメドジョウ		LC✓✓✓✓No———0060/9 (0.0%)5/454 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysurus aurantiacus
アリアケギバチ		NT✓✓✓—No———06123/35 (8.6%)8/253 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysurus tokiensis
ギバチ		LC✓✓✓—No———06123/35 (8.6%)8/253 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Liobagrus reinii
アカザ		LC✓✓✓✓No———0111/24 (4.2%)1/51 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus leucomaenis imbrius
ゴギ		—✓—✓✓No———05574/59 (6.8%)22/676 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus malma krascheninnikovi
オショロコマ		—✓✓✓✓No———05574/59 (6.8%)22/676 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvelinus malma miyabei
ミヤベイワナ		—✓—✓✓No———05574/59 (6.8%)22/676 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pungitius tymensis
エゾトミヨ		DD✓✓✓✓No———05141/45 (2.2%)4/57 (7.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oryzias latipes
ミナミメダカ		LC✓✓✓✓Yes (33)Chromosome,
Representative		734 Mbp
1.0x		515
2.53 Mbp		3342438/89 (9.0%)9/92 (9.8%)2007-04-26
VU
絶滅危惧II類		Oryzias sakaizumii
キタノメダカ		LC✓✓✓✓No———042438/89 (9.0%)9/92 (9.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthopagrus pacificus
ナンヨウチヌ		LC✓✓✓✓No———04151/26 (3.8%)8/164 (4.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cottus kazika
カマキリ（アユカケ）		LC✓—✓✓No———0392/157 (1.3%)6/352 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Odontobutis hikimius
イシドンコ		NT✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)2/18 (11.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophiocara porocephala
ホシマダラハゼ		LC✓✓✓✓No———00140/4 (0.0%)12/282 (4.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthogobius hasta
ハゼクチ		LC✓✓✓✓No———00300/7 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthogobius insularis
ミナミアシシロハゼ		EN✓✓✓✓No———00300/7 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Acentrogobius viridipunctatus
キララハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/21 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Apocryptodon punctatus
タビラクチ		LC✓✓✓✓No———00300/4 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Caragobius urolepis
アサガラハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius macrognathos
エドハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius taranetzi
シンジコハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnogobius uchidai
チクゼンハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Leucopsarion petersii
シロウオ		—✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Luciogobius ryukyuensis
ミナミヒメミミズハゼ		NT✓✓✓✓No———00300/42 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Mugilogobius mertoni
ムジナハゼ		LC✓✓✓✓No———03301/32 (3.1%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Odontamblyopus lacepedii
ワラスボ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		963 Mbp
260.0x		394
12.1 Mbp		23302/9 (22.2%)20/2511 (0.8%)2023-10-25
VU
絶滅危惧II類		Pandaka lidwilli
マングローブゴマハゼ		—✓✓✓✓No———00300/5 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Pandaka sp.
ゴマハゼ		—————No———00300/5 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Parkraemeria saltator
ギンポハゼ		NT✓✓✓✓No———00300/1 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudogobius masago
マサゴハゼ		—✓✓✓✓No———00300/55 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sicyopterus lagocephalus
ルリボウズハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/26 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Trypauchenopsis intermedia
ヒゲワラスボ		LC✓✓✓✓No———00300/5 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Parioglossus palustris
ボルネオハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2511 (0.8%)—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Coenagrion hylas
カラフトイトトンボ		LC✓✓✓✓No———0070/27 (0.0%)3/883 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Ischnura ezoin
オガサワライトトンボ		EN✓✓✓✓No———0371/99 (1.0%)3/883 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudagrion microcephalum
アオナガイトトンボ		LC✓✓✓✓No———0070/55 (0.0%)3/883 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus annulatus
オオサカサナエ		LC✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/484 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus nagoyanus
ナゴヤサナエ		NT✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/484 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stylurus oculatus
メガネサナエ		NT✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/484 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlorogomphus brunneus keramensis
アサトカラスヤンマ		CR—✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/31 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlorogomphus okinawensis
オキナワミナミヤンマ		EN✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/31 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemicordulia mindana nipponica
ミナミトンボ		EN✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Macromidia ishidai
サキシマヤマトンボ		LC✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Somatochlora clavata
ハネビロエゾトンボ		—✓✓✓✓No———0000/80 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Boninthemis insularis
シマアカネ		CR✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)5/628 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sympetrum gracile
ナニワトンボ		VU✓✓✓✓No———0472/110 (1.8%)5/628 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Nocticola uenoi miyakoensis
ミヤコホラアナゴキブリ		——✓✓—No———0000/42 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Trypetimorpha japonica
ハウチワウンカ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Euterpnosia chibensis daitoensis
ダイトウヒメハルゼミ		——✓✓✓No———0040/8 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Muda kuroiwae
クロイワゼミ		—✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suisha coreana
チョウセンケナガニイニイ		—✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cacopsylla boninofatsiae
ムニンヤツデキジラミ		———✓✓No———0060/118 (0.0%)2/580 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cacopsylla maculipennis
チャマダラキジラミ		———✓✓No———0060/118 (0.0%)2/580 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Elatobium itoe
ツツジコブアブラムシ		———✓✓No———00670/4 (0.0%)36/5085 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemipodaphis persimilis
ケヤキワタムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Unisitobion corylicola
ハシバミヒゲナガアブラムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Hydrometra albolineata
イトアメンボ		——✓✓✓No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Xiphovelia boninensis
ケブカオヨギカタビロアメンボ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Asclepios shiranui
シオアメンボ		—✓—✓✓No———0030/3 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Halobates matsumurai
シロウミアメンボ		—✓✓✓—No———0030/36 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Limnometra femorata
トゲアシアメンボ		—✓✓✓✓No———0030/14 (0.0%)2/347 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Kirkaldyia deyrolli
タガメ		—✓✓——No———0010/1 (0.0%)1/232 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aphelocheirus nawae
トゲナベブタムシ		—✓✓✓—No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Heterotrephes admorsus
エグリタマミズムシ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Kitocoris hahajima
ハハジマハナカメムシ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Myiophanes tipulina
ゴミアシナガサシガメ		——✓✓—No———0070/1 (0.0%)5/1670 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Ptilocerus immitis
フサヒゲサシガメ		———✓✓No———0070/3 (0.0%)5/1670 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Triatoma rubrofasciata
オオサシガメ		—✓✓✓✓No———0372/130 (1.5%)5/1670 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Dicranocephalus medius
ブチヒゲツノヘリカメムシ		—✓✓✓✓No———0000/11 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembidion aestuarii
キバネキバナガミズギワゴミムシ		—✓—✓—No———02342/507 (0.4%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembidion sumaoi
オオキバナガミズギワゴミムシ		———✓—No———02342/507 (0.4%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Callytron inspecularis
ヨドシロヘリハンミョウ		—✓✓✓✓No———00340/3 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus granulatus telluris
アカガネオサムシ本州亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maacki aquatilis
マークオサムシ本州亜種		——✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus macleayi amanoi
マックレイセアカオサムシ利尻島亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maeander nobukii
セスジアカガネオサムシ大雪山パルサ湿原亜種		—✓—✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus maiyasanus ohkawai
マヤサンオサムシ鵜方亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus porrecticollis pacificus
アキタクロナガオサムシ富士亜種		——✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Carabus uenoi
ドウキョウオサムシ		—✓✓✓—No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Chlaenius spoliatus motschulskyi
ツヤキベリアオゴミムシ		———✓✓No———00340/46 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cychrus morawitzi iwatensis
セダカオサムシ岩手県亜種		——✓✓✓No———00340/26 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cylindera gracilis
ホソハンミョウ		—✓✓✓—No———00340/67 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Daiconotrechus iwatai
イワタメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Diplocheila elongata
スナハラゴミムシ		——✓✓—No———00340/6 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Harpalus crates
チョウセンゴモクムシ		——✓✓—No———04342/93 (2.2%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Jujiroa ana
ジャアナヒラタゴミムシ		———✓✓No———00340/1 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Kusumia australis
コカシメクラチビゴミムシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lophyridia sumatrensis niponensis
ハラビロハンミョウ		—————No———0034/20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Morion boninense
オガサワラクチキゴミムシ		—————No———00340/3 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Morion japonicum
クチキゴミムシ		—————No———00340/3 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paratachys gyotokuensis
ギョウトクコミズギワゴミムシ		—————No———00340/15 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pterostichus isumiensis
イスミナガゴミムシ		———✓—No———04342/288 (0.7%)20/6388 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Trechiama paucisaeta
モニワメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Yamautidius anaulax
アオナミメクラチビゴミムシ		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus basinotatus
クロホシコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus eximius
キイロコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Haliplus sharpi
マダラコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Canthydrus politus
ムツボシツヤコツブゲンゴロウ		——✓—✓No———0000/12 (0.0%)0/123 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neohydrocoptus sp.
ムモンチビコツブゲンゴロウ		—✓———No———0000/7 (0.0%)0/123 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Copelatus nakamurai
トダセスジゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/468 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister chinensis
ゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister rugosus
ヒメフチトリゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cybister tripunctatus lateralis
コガタノゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Dytiscus marginalis czerskii
エゾゲンゴロウモドキ		—✓✓✓✓No———0020/29 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Graphoderus adamsii
マルガタゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/13 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyphydrus laeviventris laeviventris
ヒメケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/28 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Laccophilus lewisius
ルイスツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/60 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Laccophilus nakajimai
ナカジマツブゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/60 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Nebrioporus hostilis
コシマチビゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/49 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Prodaticus vittatus
オキナワスジゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/44 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gyrinus japonicus
ミズスマシ		—✓✓✓—No———0000/73 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Orectochilus agilis
ツマキレオナガミズスマシ		—✓✓——No———0000/15 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Orectochilus punctipennis
コオナガミズスマシ		—✓✓✓—No———0000/15 (0.0%)0/283 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrochus chubu
チュウブホソガムシ		—✓✓✓✓No———0111/36 (2.8%)1/36 (2.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Georissus granulosus
セスジマルドロムシ		———✓—No———0000/12 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrophilus bilineatus cashimirensis
コガタガムシ		—————No———0060/26 (0.0%)6/1279 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ctenistes oculatus
クシヒゲアリヅカムシ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Thiasophila shinanonis
ヤマアリヤドリ		———✓✓No———00660/1 (0.0%)49/6919 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus hopei binodulosus
オオクワガタ		—✓✓——No———1352/23 (8.7%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus titanus daitoensis
ダイトウヒラタクワガタ		——✓✓—No———1151/11 (9.1%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Dorcus titanus hachijoensis
ハチジョウヒラタクワガタ		—————No———1151/11 (9.1%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Neolucanus okinawanus
オキナワマルバネクワガタ		——✓✓✓No———0050/24 (0.0%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Neolucanus protogenetivus protogenetivus
アマミマルバネクワガタ		—✓✓✓✓No———0050/24 (0.0%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Platycerus viridicuprus kanadai
キュウシュウコルリクワガタ（ニシコルリクワガタ九州亜種）		—✓✓✓✓No———0050/48 (0.0%)4/380 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Omorgus chinensis
オオコブスジコガネ		—✓—✓—No———0000/29 (0.0%)0/96 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aphodius gotoi
ツヤケシマグソコガネ		———✓—No———07584/195 (2.1%)39/4671 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Copris brachypterus
マルダイコクコガネ		———✓—No———01581/30 (3.3%)39/4671 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Copris ochus
ダイコクコガネ		—✓✓✓—No———01581/30 (3.3%)39/4671 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Onthophagus gibbulus
チャバネエンマコガネ		—✓✓✓—No———04582/265 (0.8%)39/4671 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Onthophagus yakuinsulanus
ヤクシマエンマコガネ		———✓—No———04582/265 (0.8%)39/4671 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Leptelmis gracilis
ヨコミゾドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Orientelmis parvula
セマルヒメドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudamophilus japonicus
ケスジドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinonychus satoi
サトウカラヒメドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)1/522 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysobothris boninensis boninensis
オガサワラムツボシタマムシ父島列島亜種		———✓—No———0060/34 (0.0%)4/628 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tamamushia virida virida
ツマベニタマムシ父島・母島列島亜種		———✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Anadastus pulchelloides
オビヒメコメツキモドキ		—————No———0000/3 (0.0%)0/320 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ermischiella nigriceps
ズグロヒメハナノミ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena formosana boninensis
ボニンヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena pseudalpigena
ニセミヤマヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena rosseoloides
ニセチャイロヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Falsomordellistena watanabei
ワタナベヒメハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hoshihananomia ochrothorax
キムネキボシハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hoshihananomia trichopalpis
オガサワラキボシハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Variimorda hiromiae
ロミキンオビハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Agapanthia sakaii
ミチノクケマダラカミキリ		———✓✓No———00250/14 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Allotraeus boninensis
オガサワラトビイロカミキリ		———✓✓No———00250/5 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Boninella satoi satoi
サトウオガサワラカミキリ父島列島亜種		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Boninella takakuwai
ケブカオガサワラカミキリ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ceresium simile simile
チャイロヒメカミキリ小笠原亜種		———✓✓No———00250/9 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Diboma costata
オキナワサビカミキリ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Macropidonia ruficollis
アカムネハナカミキリ		—✓—✓✓No———00250/1 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Mesosa hirtiventris
ケハラゴマフカミキリ		——✓✓✓No———00250/17 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Nortia kusuii
オガサワラムネスジウスバカミキリ		———✓✓No———00250/1 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudiphra bicolor bicolor
フタモンアメイロカミキリ父島列島亜種		———✓✓No———00250/1 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Thyestilla gebleri
アサカミキリ		—✓✓✓✓No———00250/1 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarazo mater
ハハジマヒメカタゾウムシ		——✓✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Megaxyela togashii
オオナギナタハバチ		—✓✓✓—No———0000/24 (0.0%)0/107 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysis nohirai
ノヒラセイボウ		—————No———0020/214 (0.0%)1/485 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Formica yessensis
エゾアカヤマアリ		—✓—✓✓No———041174/3057 (0.1%)89/16964 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Polyrhachis lamellidens
トゲアリ		—✓✓✓✓No———001170/366 (0.0%)89/16964 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pararrhynchium oceanicum miyanoi
ツヤカバフドロバチ母島亜種		———✓✓No———00290/6 (0.0%)19/1046 (1.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Bembix niponica
ニッポンハナダカバチ		——✓✓✓No———00170/40 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Isodontia boninensis
オガサワラアナバチ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/237 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lestica rufigaster
オガサワラギングチバチ		———✓✓No———00170/6 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Pison hahadzimaense
ハハジマピソン		———✓✓No———00170/20 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Stizus pulcherrimus
キアシハナダカバチモドキ		——✓✓✓No———00170/12 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Tachysphex morosus titidzimaensis
チチジマヌカダカバチ		———✓✓No———00170/187 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus boninensis
オガサワラメンハナバチ		——✓✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus ikedai
イケダメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus incomitatus
キムネメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylaeus yasumatsui
ヤスマツメンハナバチ		———✓✓No———0242/280 (0.7%)4/775 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Lithurgus ogasawarensis
オガサワラキホリハナバチ		——✓✓✓No———00180/8 (0.0%)10/1119 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Megachile asahinai
アサヒナハキリバチ		———✓✓No———09185/294 (1.7%)10/1119 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ceratina boninensis
オガサワラツヤハナバチ		—✓✓✓✓No———041183/300 (1.0%)80/3601 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Neohapalothrix kanii
カニギンモンアミカ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Deuterophlebia nipponica
ニホンアミカモドキ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyperoscelis eximia insignis
キスジモモブトモリカ		—————No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyperoscelis veternosa
クロモモブトモリカ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hilarimorpha nigra
クロオドリバエモドキ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Microdon katsurai
ケンランアリノスアブ		———✓✓No———021301/62 (1.6%)64/4637 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Sarcophila japonica
ゴヘイニクバエ		———✓✓No———00180/6 (0.0%)11/1501 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Macroscelesia longipes yamatoensis
アシナガモモブトスカシバ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Zygaena niphona hakodatensis
ベニモンマダラ道南亜種		———✓✓No———0231/97 (1.0%)2/422 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ochlodes subhyalinus asahinai
アサヒナキマダラセセリ		—————No———024461/23 (4.3%)396/2855 (13.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Parnara bada
ヒメイチモンジセセリ		—✓✓✓—No———014461/11 (9.1%)396/2855 (13.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Luehdorfia japonica
ギフチョウ		NT✓✓✓✓Yes (1)Contig,
Representative		507 Mbp
1.7x		569,973
1.33 kbp		131092/5 (40.0%)76/556 (13.7%)2021-05-03
VU
絶滅危惧II類		Anthocharis cardamines hayashii
クモマツマキチョウ八ヶ岳・南アルプス亜種		—✓———No———22551/17 (5.9%)25/904 (2.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Coreana raphaelis yamamotoi
チョウセンアカシジミ		—————No———00420/1 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonica onoi onoi
カシワアカシジミ（キタアカシジミ）名義タイプ亜種, 北海道・東北地方亜種		—✓✓——No———00420/5 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Panchala ganesa loomisi
ルーミスシジミ		—✓———No———00420/69 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Phengaris teleius hosonoi
ゴマシジミ中部高地帯亜種		—————No———03422/11 (18.2%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Plebejus subsolanus yarigadakeanus
アサマシジミ本州高地亜種		—————No———06424/65 (6.2%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Zizeeria karsandra
ハマヤマトシジミ		—✓✓✓✓No———00420/2 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Argyronome laodice japonica
ウラギンスジヒョウモン		—✓—✓✓No———015791/37 (2.7%)134/5171 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Brenthis daphne rabdia
ヒョウモンチョウ本州中部亜種		——✓✓✓No———135793/4 (75.0%)134/5171 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Lasiommata deidamia kampuzana
ツマジロウラジャノメ四国亜種		——✓——No———025791/9 (11.1%)134/5171 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Limenitis populi jezoensis
オオイチモンジ		—✓✓✓✓No———035792/33 (6.1%)134/5171 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Ypthima multistriata niphonica
ウラナミジャノメ日本本土亜種		—✓✓✓—No———005790/49 (0.0%)134/5171 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Amraica kimurai
サキシマオオエダシャク		——✓✓✓No———001940/5 (0.0%)99/11778 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Archiearis notha okanoi
クロフカバシャク		———✓—No———001940/3 (0.0%)99/11778 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypoxystis pulcheraria
アキヨシトガリエダシャク		——✓✓✓No———001940/2 (0.0%)99/11778 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastropacha quercifolia
ヒロバカレハ		—✓✓✓—No———0070/7 (0.0%)5/589 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Hemaris radians
スキバホウジャク		—✓✓✓✓No———02251/16 (6.2%)15/1404 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Laelia miyanoi
ミヤノスゲドクガ		——✓——No———00750/13 (0.0%)36/8291 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Capsula aerata
ガマヨトウ		—————No———003120/4 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Capsula sparganii
キスジウスキヨトウ		—✓—✓—No———003120/4 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Chasmina takakuwai
オガサワラシロガ		——✓——No———003120/8 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Chilodes pacificus
ヌマベウスキヨトウ		—————No———003120/1 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Doerriesa coenosa
キュウシュウスジヨトウ		——✓——No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Doerriesa striata
エゾスジヨトウ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Eulocastra sasakii
シラユキコヤガ		——✓——No———003120/6 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Nonagria puengeleri
オオチャバネヨトウ		——✓✓✓No———003120/1 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Plusilla rosalia
ギンモンアカヨトウ		—✓✓✓✓No———003120/1 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Protodeltote wiscotti
マガリスジコヤガ		——✓——No———023121/3 (33.3%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudohermonassa velata
エゾクシヒゲモンヤガ		——✓——No———003120/4 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Xylomoia fusei
イチモジヒメヨトウ		——✓✓✓No———003120/7 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Xylomoia graminea
クシロモクメヨトウ		—✓✓✓✓No———003120/7 (0.0%)149/7125 (2.1%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Rimula cumingii
セムシマドアキガイ		—✓—✓✓No———0010/32 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sukashitrochus carinatus
スカシエビス		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarana microtheca
コガラヨシワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ogasawarana ogasawarana
オガサワラヤマキサゴ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Neritilia mimotoi
ツバサコハクカノコ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Georissa shikokuensis
ベニゴマオカタニシ		—✓✓✓✓No———0000/61 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neritodryas cornea
オカイシマキ		——✓✓✓No———0010/1 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Septaria cumingiana
カミングフネアマガイ		——✓✓✓No———0010/5 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Smaragdia sp.
ウミヒメカノコ		—————No———0010/3 (0.0%)1/198 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Phenacolepas crenulata
ユキスズメ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Awalycaeus abei
アツブタムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus itonis shiotai
ヤサガタイトウムシオイ		———✓✓No———0000/8 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus laevis
ベニムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus oshimanus
オオシマムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus sadoensis
サドムシオイ		—————No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus satsumanus laevicervix
ヌメクビムシオイ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamalycaeus tsushimanus
ツシマムシオイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax akioi
コウツムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax kiuchii
トウゲンムシオイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cipangocharax okamurai
オカムラムシオイ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cyclophorus turgidus angulatus
リュウキュウヤマタニシ		—✓✓✓✓No———0000/58 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia inouei
イノウエヤマトガイ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia katorii
トウカイヤマトガイ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia shigetai
モジャモジャヤマトガイ		DD—✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia sp.
ヨナグニヤマトガイ		—————No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia tokunoshimana okinoerabuensis
オキノエラブヤマトガイ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonia tokunoshimana tokunoshimana
トクノシマヤマトガイ		———✓✓No———0000/9 (0.0%)0/261 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Arinia japonica
シリブトゴマガイ		——✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina kumejimana
クメジマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina luchuana
リュウキュウゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina lyrata lyrata
クニガミゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina lyrata tokunoshimana
トクノシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina oshimae
オオシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina septentrionalis
エゾゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina turris chineni
イトカケゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina ultima
ツシマゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplommatina yonakunijimana
ヨナグニゴマガイ		———✓✓No———0000/55 (0.0%)0/160 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pupinella oshimae tokunoshimana
トクノシマアズキガイ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/13 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cipangopaludina chinensis laeta
マルタニシ		—✓—✓—No———0010/16 (0.0%)1/268 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Batillaria zonalis
イボウミニナ		—✓✓✓✓No———0111/8 (12.5%)1/8 (12.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerithium coralium
コゲツノブエ		LC✓✓✓✓No———0000/42 (0.0%)0/93 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Semisulcospira fuscata
クロカワニナ		—✓—✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pirenella asiatica
ヤエヤマヘナタリ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pirenella pupiformis
カワアイ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Terebralia sulcata
マドモチウミニナ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/48 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Finella pupoides
サナギモツボ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenomelania sp. B
タケノコカワニナ		—————No———0010/20 (0.0%)1/120 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Naticarius concinnus
フロガイダマシ		—✓—✓✓No———0000/8 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Naticarius onca
アラゴマフダマ		——✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Polinices mellosus
ロウイロトミガイ		—✓✓✓✓No———0000/11 (0.0%)0/74 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Akiyoshia kobayashii
コバヤシミジンツボ		VU✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Akiyoshia uenoi
アキヨシミジンツボ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Moria nipponica
ホラアナミジンニナ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/176 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. E
ムツカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. F
マンゴクウラカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. G
マツシマカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. H
マツカワウラカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assiminea sp. I
オオシンデンカワザンショウ		—————No———0000/24 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assimineidae gen. C & sp.
コーヒーイロカワザンショウ		—————No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Assimineidae gen. D & sp.
カハタレカワザンショウ		—————No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cavernacmella minima
キビオカチグサ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cavernacmella yamamotonis
ヤマモトゴマオカチグサ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. A
ミニカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. B
エレガントカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ditropisena sp. C
デリケートカドカド		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ovassiminea sp.
ウラウチコダマカワザンショウ		—————No———0000/2 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudomphala miyazakii
アズキカワザンショウ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/63 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bithynia inabai
イナバマメタニシ		——✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/32 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gabbia kiusiuensis
ヒメマルマメタニシ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/32 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clenchiella iriomotensis
ヤイマカチドキシタダミ		—✓—✓✓No———0000/4 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hyala delicata
ゴマツボモドキ（シリオレミジンニナ）		—————No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Liroceratia sulcata
ミジンゴマツボ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Pellamora sp.
ウチノミツボ		—————No———0000/2 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Wakauraia sakaguchii
ワカウラツボ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Blanfordia bensoni
オカマメタニシ		—✓✓✓✓No———0010/3 (0.0%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Oncomelania minima
ナタネミズツボ		—✓✓✓✓No———0111/3 (33.3%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pomatiopsidae gen. ooyagii
シモキタシブキツボ		—————No———0111/89 (1.1%)1/89 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rissoina costulata
スジウネリチョウジガイ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stosicia annulata
ゴマツボ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/7 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenothyra japonica
ミズゴマツボ		——✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenothyra recondita
エゾミズゴマツボ（カラフトミズゴマツボ）		——✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Circulus duplicatus
アラウズマキ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Pseudoliotia asteriscus
ヒメシラギク（シラギクマガイ）		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sigaretornus sp. A
イソマイマイ		—————No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sigaretornus sp. B
ガタチンナン		—————No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Teinostoma lucidum
ウミコハクガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Truncatella sp. A
アマミクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Truncatella sp. F
カイグンボウクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acrilla acuminata
ウネナシイトカケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/56 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypermastus lacteus
ヒモイカリナマコツマミガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Mucronalia exilis
ヤセフタオビツマミガイ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/56 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Engina menkeana
ナガゴマフホラダマシ（ゴマフホラダマシ）		——✓✓✓No———0020/10 (0.0%)2/350 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Reticunassa praematurata
オマセムシロ		—✓✓✓✓No———0010/178 (0.0%)1/346 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nassarius arcularia
オリイレヨフバイ		—✓✓✓✓No———0010/178 (0.0%)1/346 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Babylonia kirana
ウスイロバイ		——✓✓✓No———0121/7 (14.3%)2/350 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Vexillum balteolatum
ミノムシガイ		——✓✓✓No———0000/64 (0.0%)0/125 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vexillum rufomaculatum
チビツクシ（ムラクモツクシ）		—————No———0000/64 (0.0%)0/125 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ceratostoma rorifluum
ハネナシヨウラク		—✓✓✓✓No———0060/4 (0.0%)6/933 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Conus boeticus
ツヤイモ		LC✓✓✓✓No———0555/417 (1.2%)5/586 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Conus fulmen
ベッコウイモ		LC✓✓✓✓No———0555/417 (1.2%)5/586 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Duplicaria evoluta
イワカワトクサ		——✓✓✓No———0000/24 (0.0%)0/343 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Trigonostoma scalariformis
オリイレボラ		—✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/59 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cypraea luchuana
リュウキュウダカラ		—————No———0000/3 (0.0%)0/237 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ebala sp.
イリエゴウナ		—————No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cincinna japonica
ニホンミズシタダミ		DD——✓—No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Melanochlamys ezoensis
エゾキセワタ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/91 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Melanochlamys fukudai
ヤミヨキセワタ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/91 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acteocina decoratoides
コメツブツララ		—————No———0000/5 (0.0%)0/23 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cylichnatys yamakawai
カミスジカイコガイダマシ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lactiforis takii
ウミマイマイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/17 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Brachystomia umboniocola
イボキサゴナカセクチキレモドキ		—————No———0000/6 (0.0%)0/70 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Syrnola tenuisculpta
ヌノメホソクチキレ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Radix onychia
オウミガイ		—✓—✓✓No———0161/250 (0.4%)4/415 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gyraulus soritai
ミズコハクガイ		—✓—✓✓No———00160/204 (0.0%)6/665 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Helicorbis cantori
クルマヒラマキガイ（レンズヒラマキガイ）		LC—✓✓✓No———00160/2 (0.0%)6/665 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Aiteng mysticus
ヒミツナメクジ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Auriculastra duplicata
ナラビオカミミガイ		—✓—✓✓No———0010/2 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Blauneria leonardi
サカマキオカミミガイ		———✓✓No———0010/2 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Ellobium chinense
オカミミガイ		DD✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		949 Mbp
125.0x		83,461
21.3 kbp		1111/8 (12.5%)1/146 (0.7%)2023-11-20
VU
絶滅危惧II類		Laemodonta siamensis
クリイロコミミガイ		——✓✓✓No———0010/10 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Laemodonta sp. B
コベソコミミガイ（マルコミミガイ）		—————No———0010/10 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus nucleolus
ウルシヌリハマシイノミ		———✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus ovuloides
デンジハマシイノミ		—✓—✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sculptus
ニワタズミハマシイノミ		——✓✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sincaporensis
キヌカツギハマシイノミ		LC✓✓✓✓No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampus sp.
オウトウハマシイノミ		—————No———0010/19 (0.0%)1/146 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Onchidium sp.
ドロアワモチ		—✓———No———0060/13 (0.0%)5/131 (3.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraonchidium fungiforme
キボシアワモチ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Paraonchidium keiense
ヒメキボシアワモチ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Neosuccinea kofui
コウフオカモノアラガイ		—✓—✓✓No———0000/2 (0.0%)0/177 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Elasmias kitaiwojimanum
イオウジマノミガイ		VU—✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/53 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lamellidea biplicata
トウガタノミガイ		VU—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Lamellidea ogasawarana
オガサワラノミガイ		VU—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Tornatellides boeningi
ノミガイ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/53 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Enteroplax yaeyamaensis
ヤエヤマクチミゾガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Eostrobilops nipponica nipponica
マツシマクチミゾガイ		———✓—No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bensonella plicidens
クチマガリスナガイ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Ptychalaea dedecora
エリマキガイ		VU✓✓✓✓No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vertigo ovata ovata
ナタネキバサナギガイ		—————No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Vertigo japonica
ヤマトキバサナギガイ		—✓✓✓✓No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena fulva
ウスチャイロキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena minatoi
ダンジョキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Luchuena nesiotica
チャイロキセルモドキ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa dalli
デールギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa decussata
ハブタエギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa gracilispira
ホソヒメギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa ignobilis
アベギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa iijimakuniakii
ツバクロイワギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa iyoensis
イヨギセル		——✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kanjiookuboi
オクシリギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kawamotoi
カワモトギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kubinaga
クビナガギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kurozuensis
クロズギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa kyotoensis
キョウトギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa mitsukurii
ミツクリギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa miyazakii
ミヤザキギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa nankaidoensis yanoi
ショウドシマギセル		———✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa pachyspira
シリブトギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa pilsbryi
カギヒダギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa puellaris
ウブギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Megalophaedusa yagurai
ヤグラギセル		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Solitariphaedusa miyoshii
ミヨシギセル		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa callistochila
キンチャクギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa caloptyx caloptyx
イトカケノミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa caloptyx subtilis
ヤクスギイトカケノミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa kamoharai
カモハラギセル		—————No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa mima mima
ザレギセル		———✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa mima tokunoshimana
トクノシマギセル		———✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa nishinoshimana
ニシノシマギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa oshimae degenerata
クサレギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa tabukii
タブキギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa tryoni
トライオンギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereophaedusa ultima
ヒメナミギセル		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tauphaedusa senkakuensis
センカクコギセル		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tosaphaedusa cincticollis
ナカムラギセル		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx cladoptyx
エダヒダノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx entospira
ウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx exodonta
ソトバウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx exulans
ホソウチマキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx hedleyi
チビノミギセル		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx munus
ツムガタノミギセル		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx noviluna
ミカヅキノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx oxypomatia
カドシタノミギセル		—————No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zaptyx takarai
タカラノミギセル		—✓—✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinoennea densecostata
コメツブダワラ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinoennea miyakojimana
ミヤコダワラ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bekkochlamys masakii
マサキベッコウ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bekkochlamys subrejecta
ツシマベッコウ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Helicarionidae gen. & sp.
ベッコウマイマイ科の１種		—————No———0000/171 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Japanochlamys crenata
コンゴウクリイロベッコウ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lamprocystis hahajimana hahajimana
ハハジマヒメベッコウ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Luchuconulus edgariana
スミスヒメベッコウ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochlamys sp.
ヨナグニベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochlamys subelimata
トクノシマベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Otesiopsis japonica
レンズガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Otesiopsis kanmuriyamensis
カンムリレンズガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Takemasaia eikoae
エイコベッコウ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Deroceras sp.
クロツノナメクジ		—✓———No———0000/258 (0.0%)0/262 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista calcicola
イシマキシロマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista cavitectum
タシママイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista eumenes pergranosa
アラハダシロマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista fausta
サチマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista friedeliana vestita
オオシマフリイデルマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista hachijoensis
ツバキカドマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista kiusiuensis tokunovaga
トクノシマケマイマイ		—✓—✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista lepidophora scutifera
カドマルウロコケマイマイ		———✓—No———0040/17 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista mayasana
マヤサンマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista minima
マメヒロベソマイマイ		——✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista nunobikiensis
ヌノビキケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista omiensis
オウミケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista proba goniosomoides
ミヤマオオベソマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista scepasma
イトマンケマイマイ		———✓—No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista squarrosa squarrosa
マルテンスオオベソマイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista squarrosa tokunoshimana
トクノシマオオベソマイマイ		—✓—✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista takarai
タカラホソマイマイ		—————No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra awaensis occidentalis
イワミマイマイ		—✓—✓—No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata echigoensis
エチゴマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata emurai
エムラマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata grata
オオタキマイマイ		—✓—✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra grata tobisimae
トビシママイマイ		———✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra latispira latispira
ハクサンマイマイ		—✓✓✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra scaevola scaevola
ミヤマヒダリマキマイマイ		—✓✓✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euhadra yakushimana
ヤクシママイマイ		———✓✓No———0141/24 (4.2%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lepidopisum conospira
カタマメマイマイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nesiohelix irrediviva
エラブマイマイ		——✓✓✓No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nesiohelix solida
アツマイマイ		———✓✓No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraegista apoiensis
アポイマイマイ		DD✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Paraegista takahidei
タカヒデマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aegista hiroshifukudai
チョウシュウシロマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Moellendorffia eucharistus
ケハダシワクチマイマイ		——✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Neochloritis tomiyamai
ハジメテビロウドマイマイ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis bracteata tsukubaensis
ツクバビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis fragosa
オオウスビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis hirasei
ヒラマキビロウドマイマイ		———✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis perpunctata
ヒメビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis silvatica
カワリダネビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis takedai
ミニビロウドマイマイ		———✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Nipponochloritis tosana
トサビロウドマイマイ		—————No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma adelinae
クマドリヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma atrata
ヤンバルマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma cardiostoma
ココロマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma eucosmia erabuana
オキノエラブヤマタカマイマイ		——✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma eucosmia eucosmia
オキナワヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma fausta
ヤセアナナシマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma mercatoria euterpe
クンチャンマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma moellendorffiana thaanumi
ミノブマイマイ		——✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma omoro
オモロヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma oshimae daemonorum
キカイオオシママイマイ		—✓—✓—No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma perversa
リュウキュウヒダリマキマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma rugosa
チリメンマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma selasia
ツヤマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma sp.
シズオカマイマイ		—✓———No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma sp. B
トナキマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma textilis
オオツヤマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma tokunoshimana
トクノシマヤマタカマイマイ		—✓—✓✓No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Satsuma tsurugisanica
ツルギサンマイマイ		—————No———0040/73 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Yakuchloritis albolabris
クチジロビロウドマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Yakuchloritis hoshiyamai
ホシヤマビロウドマイマイ		——✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Solemya japonica
アサヒキヌタレガイ		—✓✓✓✓No———0000/19 (0.0%)0/55 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Jolya arata
ヌバタママクラ		——✓✓✓No———00380/1 (0.0%)18/1540 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Anadara crebricostata
メオトサルボオ		—✓✓✓✓No———0131/29 (3.4%)2/133 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Anadara globosa
クマサルボオ		—✓✓✓✓No———0131/29 (3.4%)2/133 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Tegillarca granosa
ハイガイ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		915 Mbp
10.0x		3,631
463 kbp		2231/3 (33.3%)2/133 (1.5%)2020-06-29
VU
絶滅危惧II類		Tucetona auriflua
ウチワガイ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/21 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anomiostrea coralliophila
サンゴガキ		DD—✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Magallana ariakensis
スミノエガキ		——✓✓✓No———010283/10 (30.0%)15/324 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Magallana bilineata
ミナミマガキ		—✓✓✓✓No———010283/10 (30.0%)15/324 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinna atropurpurea
スエヒロガイ		—✓✓✓✓No———0121/13 (7.7%)2/70 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cristaria clessini
メンカラスガイ		—✓✓✓✓No———0070/5 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversidens brandtii
オバエボシガイ		DD✓✓✓✓No———0070/2 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversiunio reinianus
オトコタテボシガイ		—✓✓✓✓No———0070/6 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Inversiunio yanagawensis
ニセマツカサガイ		—✓✓✓✓No———0070/6 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lanceolaria oxyrhyncha
ササノハガイ		—✓✓✓✓No———0070/9 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Obovalis omiensis
カタハガイ		—✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sinanodonta calipygos
マルドブガイ		—✓✓✓✓No———0070/44 (0.0%)7/856 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Cadakia punctata
クチベニツキガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Codakia paytenorum
ウラキツキガイ		—✓✓✓✓No———00140/6 (0.0%)7/189 (3.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbria soverbii
カゴガイ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Fragum carinatum
ヒシガイ		—✓—✓—No———06213/12 (25.0%)10/211 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Vasticardium rubicundum compunctum
イレズミザルガイ		—————No———00210/14 (0.0%)10/211 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Gari lessoni
ウスムラサキアシガイ		——✓✓✓No———0231/11 (9.1%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Psammotaea inflata
ミナトマスオ		—————No———0030/1 (0.0%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Hiatula adamsii
ムラサキガイ		—✓✓✓✓No———0030/6 (0.0%)2/28 (7.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Montrouzieria clathrata
コバコガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Cadella crebrimaculata
ホシヤマナミノコザラ		——✓✓✓No———0030/3 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cadella sp.
リュウキュウクサビザラ		—————No———0030/3 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Cyclotellina remies
モチヅキザラ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Macalia bruguieri
アマサギガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Scissulina dispar
チガイザクラ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Serratina perplexa
ヒワズウネイチョウ		——✓✓✓No———0030/2 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Iridona iridescens
テリザクラ		—✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Dallitellina rostrata
トンガリベニガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Quadrans gargadia
オオトゲウネガイ		—✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Tellinides timorensis
ヘラサギガイ		—✓✓✓✓No———0030/2 (0.0%)2/78 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Corbicula leana
マシジミ		LC✓✓✓✓No———0222/483 (0.4%)2/502 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Corbicula sandai
セタシジミ		DD✓✓✓✓No———0222/483 (0.4%)2/502 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina expansa
リュウキュウヒルギシジミ		—✓✓✓✓No———0020/10 (0.0%)2/502 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina fissidens
タイワンヒルギシジミ		—————No———0020/10 (0.0%)2/502 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Geloina yaeyamensis
ヤエヤマヒルギシジミ		—————No———0020/10 (0.0%)2/502 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Glauconome angulata
ハナグモリ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anatinella nicobarica
チトセノハナガイ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Coelomactra antiquata
アリソガイ		—✓✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactra grandis
リュウキュウアリソガイ		—✓✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactra pulchella
トウカイタママキ		——✓✓✓No———01101/19 (5.3%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Mactrotoma depressa
ヒナミルクイ		——✓✓✓No———00100/1 (0.0%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Tresus keenae
ミルクイ		—✓✓✓✓No———00100/3 (0.0%)6/49 (12.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Dosinia aspera
ツキカガミ		——✓✓✓No———00120/24 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Dosinia troscheli
ヤタノカガミ		—✓✓✓✓No———00120/24 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Meretrix lusoria
ハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/23 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pitar citrinus
ユウカゲハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/8 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pitar sulfureus
イオウハマグリ		—✓✓✓✓No———00120/8 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Tapes literatus
リュウキュウアサリ		—✓✓✓✓No———00120/7 (0.0%)8/278 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Barrimysia cumingii
アケボノガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Barrimysia siphonosomae
ホシムシアケボノガイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Borniopsis tsurumaru
ツルマルケボリガイ		——✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Byssobornia adamsi
セワケガイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Divariscintilla toyohiwakensis
ニッポンヨーヨーシジミ		—✓✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ephippodonta gigas
オオツヤウロコガイ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/50 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Tellimya fujitaniana
フジタニコハクノツユ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Salpocola philippinensis
フィリピンハナビラガイ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/65 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Barnea japonica
ウミタケ		——✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/35 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cryptomya busoensis
ヒメマスオ		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Distugonia decurtata
オフクマスオ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Exolaternula sp.
オヤイヅオキナガイ		—————No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Agriodesma navicula
オビクイ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/10 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thracia concinna
シナヤカスエモノガイ		——✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Solen kikuchii
チゴマテ		——✓✓✓No———0111/16 (6.2%)1/16 (6.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Solen sp.
ホソバラフマテ		—————No———0111/16 (6.2%)1/16 (6.2%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Phagocata albata
ソウヤイドウズムシ		—✓—✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Phagocata suginoi
ホクリクホソウズムシ		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Phagocata tenella
ヒダカホソウズムシ		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/37 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus aomorensis
アオモリザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus cirratus
カムリザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus ezoensis
エゾザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus homodontus
ホソザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus inukaii
イヌカイザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus iwakiensis
イワキザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus makinoi
ヒメザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus megalodentatus
オオアゴザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus nipponicus
ニッポンザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus sapporensis
ザリガニミミズ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirrodrilus uchidai
ウチダザリガニミミズ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Parabeloniscus shimojanai
クメコシビロザトウムシ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/25 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aculepeira matsudae
マツダタカネオニグモ		—✓✓✓✓No———00130/17 (0.0%)9/866 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Argyroneta aquatica
ミズグモ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/410 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Heptathela kimurai sensu lato
キムラグモ（広義）		—✓✓✓✓No———0010/29 (0.0%)1/50 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lycosa ishikariana
イソコモリグモ		—✓✓✓✓No———0020/44 (0.0%)1/584 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Nesticus uenoi
フジホラヒメグモ		———✓✓No———0000/70 (0.0%)0/195 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ryuthela nishihirai sensu lato
オキナワキムラグモ（広義）		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		3.11 Gbp
39.0x		2,521
12.9 Mbp		1111/18 (5.6%)1/50 (2.0%)2024-04-17
VU
絶滅危惧II類		Amamiku amamensis
アマミミナミサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Antecaridina lauensis
ドウクツヌマエビ		—✓✓✓✓No———0030/4 (0.0%)3/504 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Austruca lactea
ハクセンシオマネキ		—✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/120 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Birgus latro
ヤシガニ		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		2.96 Gbp
51.0x		914,468
5.29 kbp		1121/1 (100.0%)2/13 (15.4%)2021-05-18
VU
絶滅危惧II類		Cambaroides japonicus
ニホンザリガニ		DD✓✓✓✓No———0040/5 (0.0%)2/600 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Candidiopotamon kumejimense
クメジマミナミサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Candidiopotamon tokashikense
トカシキミナミサワガニ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chiromantes magnus
オガサワラクロベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/272 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chiromantes ryukyuanum
リュウキュウアカテガニ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/272 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Coenobita perlatus
サキシマオカヤドカリ		—✓✓✓✓No———0121/11 (9.1%)2/13 (15.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocheir ogasawaraensis
オガサワラモクズガニ		—✓✓✓✓No———0551/5 (20.0%)1/116 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa amagui
ケラマサワガニ		—✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa aramotoi
アラモトサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa grandiovata
オキナワオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa iheya
イヘヤオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geothelphusa kumejima
クメジマオオサワガニ		LC✓✓✓✓No———0000/72 (0.0%)0/496 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Macrobrachium miyakoense
ウリガーテナガエビ		DD✓✓✓✓No———0462/264 (0.8%)3/1018 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Macrobrachium placidulum
ネッタイテナガエビ		LC✓✓✓✓No———0462/264 (0.8%)3/1018 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Neocaridina ishigakiensis
イシガキヌマエビ		LC✓✓✓✓No———0131/30 (3.3%)3/504 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Palaemon ogasawaraensis
オガサワラコテナガエビ		—✓—✓✓No———0261/108 (0.9%)3/1018 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Tubuca arcuata
シオマネキ		—✓✓✓✓No———0000/20 (0.0%)0/120 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Spirobolus sp.
ヤエヤママルヤスデ		—✓———No———0000/8 (0.0%)0/23 (0.0%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Salicornia europaea
アッケシソウ		—✓✓✓✓No———023651/177 (0.6%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suaeda japonica
シチメンソウ		—✓✓✓—No———013651/102 (1.0%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Suaeda malacosperma
ヒロハマツナ		—✓✓✓✓No———013651/102 (1.0%)17/1278 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix hukaoana
ユビソヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/853 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix nakamurana subsp. kurilensis
ヒダカミネヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/853 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Salix rupifraga
コマイワヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/853 (3.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Quercus hondae
ハナガガシ		VU✓✓✓✓No———0355122/580 (3.8%)32/908 (3.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Ficus nishimurae
オオトキワイヌビワ		—✓✓✓✓No———08206/784 (0.8%)13/1208 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Boehmeria formosana
タイワントリアシ		—✓✓✓✓No———04101/71 (1.4%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Elatostema densiflorum
トキホコリ		———✓✓No———00100/206 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Parietaria micrantha var. coreana
タチゲヒカゲミズ		———✓✓No———02101/22 (4.5%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pellionia yosiei
ナガバサンショウソウ		———✓✓No———00100/13 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pilea swinglei
ソハヤキミズ		—✓✓✓✓No———00100/255 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Balanophora nipponica
ミヤマツチトリモチ		——✓✓✓No———0111/25 (4.0%)1/43 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconogonon ajanense
ヒメイワタデ		—✓✓✓✓No———04212/141 (1.4%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria erectominor var. erectominor
ヒメタデ		———✓—No———03212/87 (2.3%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria foliosa var. nikaii
サイコクヌカボ		———✓✓No———03212/87 (2.3%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria foliosa var. paludicola
ヤナギヌカボ		———✓✓No———03212/87 (2.3%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Persicaria taquetii
ヌカボタデ		—✓✓✓✓No———03212/87 (2.3%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex dentatus subsp. nipponicus
コギシギシ		———✓✓No———01211/118 (0.8%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex gmelinii
カラフトノダイオウ		—✓✓✓✓No———01211/118 (0.8%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rumex longifolius
ノダイオウ		—✓✓✓✓No———01211/118 (0.8%)11/975 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Montia fontana
ヌマハコベ		LC✓✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/286 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Portulaca okinawensis
オキナワマツバボタン		VU✓✓✓✓No———0111/84 (1.2%)1/85 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Arenaria katoana
カトウハコベ		—✓✓✓✓No———00260/110 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Arenaria merckioides var. chokaiensis
チョウカイフスマ		—————No———00260/110 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium arvense var. ovatum
ミツモリミミナグサ		———✓✓No———00260/115 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium pauciflorum var. amurense
タガソデソウ		———✓✓No———00260/115 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cerastium rubescens var. koreanum
タカネミミナグサ		———✓✓No———00260/115 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Moehringia trinervia
タチハコベ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		1.24 Gbp
35.0x		454
10.5 Mbp		22261/28 (3.6%)19/2065 (0.9%)2024-06-03
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria heterantha var. linearifolia
ヒナワチガイソウ		———✓✓No———00260/22 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria japonica
ナンブワチガイソウ		—✓✓✓✓No———00260/22 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudostellaria sylvatica
クシロワチガイソウ		—✓✓✓✓No———00260/22 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene aomorensis
アオモリマンテマ		———✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene foliosa
エゾマンテマ		—✓✓✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene kiusiana
オグラセンノウ		—✓✓✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene sieboldii
マツモトセンノウ		—✓—✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene wilfordii
エンビセンノウ		—✓✓✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Silene yanoei
テバコマンテマ		———✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria bungeana
オオハコベ		—✓✓✓✓No———00260/163 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria filicaulis
イトハコベ		—✓✓✓✓No———00260/163 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Stellaria ruscifolia
シコタンハコベ		—✓✓✓✓No———00260/163 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cassytha pubescens
ケスナヅル		—✓✓✓✓No———00160/11 (0.0%)7/1492 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Cryptocarya chinensis
シナクスモドキ		LC✓✓✓✓No———00160/129 (0.0%)7/1492 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Lindera communis var. okinawensis
オキナワコウバシ		———✓✓No———00160/47 (0.0%)7/1492 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum gassanense
ガッサントリカブト		—✓—✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum jaluense subsp. iwatekense
センウズモドキ		—✓✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum mashikense
マシケレイジンソウ		———✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum nipponicum subsp. micranthum
キタザワブシ		—✓✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum nipponicum subsp. nipponicum var. septemcarpum
ミョウコウトリカブト		—✓—✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum okuyamae var. wagaense
ワガトリカブト		———✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aconitum zigzag
タカネトリカブト		—✓✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Adonis shikokuensis
シコクフクジュソウ		—✓✓✓✓No———01111/22 (4.5%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anemone amurensis
ウラホロイチゲ		—✓—✓✓No———00110/135 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anemone dichotoma
フタマタイチゲ		———✓✓No———00110/135 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Callianthemum hondoense
キタダケソウ		—✓✓✓✓No———00110/15 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Clematis fusca
クロバナハンショウヅル		—✓✓✓✓No———00110/204 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Clematis terniflora var. boninensis
ムニンセンニンソウ		—✓—✓✓No———00110/204 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Dichocarpum pterigionocaudatum
キバナサバノオ		—✓—✓✓No———00110/26 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Halerpestes kawakamii
ヒメキンポウゲ		——✓✓✓No———00110/9 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pulsatilla cernua
オキナグサ		—✓✓✓✓No———00110/31 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ranunculus chinensis
コキツネノボタン		—✓✓✓✓No———00110/432 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ranunculus ternatus var. ternatus
ヒキノカサ		———✓—No———00110/432 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum aquilegiifolium var. daisenense
ダイセンカラマツ		———✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum baicalense
ハルカラマツ		—✓✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum foetidum var. apoiense
アポイカラマツ		———✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum foetidum var. glabrescens
チャボカラマツ		———✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum integrilobum
ナガバカラマツ		—✓✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum microspermum
コゴメカラマツ		—✓✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum sekimotoanum
イワカラマツ		—✓—✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum simplex var. brevipes
ノカラマツ		—✓—✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum tuberiferum var. yakusimense
ヤクシマカラマツ		—✓✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Thalictrum watanabei
タマカラマツ		—✓✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Agrimonia coreana
チョウセンキンミズヒキ		—✓✓✓✓No———001950/17 (0.0%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Alchemilla japonica
ハゴロモグサ		—✓✓✓✓No———001950/257 (0.0%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aruncus dioicus var. subrotundus
アポイヤマブキショウマ		—————No———001950/5 (0.0%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Crataegus jozana
エゾサンザシ		———✓✓No———021951/245 (0.4%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Filipendula tsuguwoi
シコクシモツケソウ		—✓—✓✓No———021951/21 (4.8%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Osteomeles anthyllidifolia var. subrotunda
テンノウメ		——✓✓✓No———001950/5 (0.0%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla discolor
ツチグリ		—✓✓✓✓No———041952/383 (0.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla fruticosa var. rigida
キンロバイ		———✓✓No———111951/6 (16.7%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla miyabei
メアカンキンバイ		—✓—✓✓No———041952/383 (0.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla niponica
ヒロハノカワラサイコ		—✓✓✓✓No———041952/383 (0.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potentilla nivea
ウラジロキンバイ		—✓✓✓✓No———041952/383 (0.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pyrus ussuriensis var. hondoensis
アオナシ		—✓✓✓✓No———0121955/67 (7.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Rosa hirtula
サンショウバラ		—✓✓✓✓No———0111957/276 (2.5%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Rubus lambertianus
シマバライチゴ		—✓✓✓✓No———071955/738 (0.7%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Rubus pungens var. oldhamii
サナギイチゴ		—✓✓✓✓No———071955/738 (0.7%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Spiraea sericea
エゾシモツケ		———✓✓No———011951/108 (0.9%)75/3777 (2.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Epimedium diphyllum subsp. kitamuranum
サイコクイカリソウ		———✓✓No———0030/82 (0.0%)2/460 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Epimedium koreanum var. coelestre
クモイイカリソウ		———✓✓No———0030/82 (0.0%)2/460 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Euryale ferox
オニバス		LC✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar oguraensis
オグラコウホネ		—✓✓✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar pumila var. ozeensis
オゼコウホネ		———✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar pumila var. pumila
ネムロコウホネ		——✓✓—No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nuphar subintegerrima
ヒメコウホネ		—✓✓✓✓No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Nymphaea tetragona var. erythrostigmatica
エゾベニヒツジグサ		—————No———0342/114 (1.8%)3/155 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Peperomia boninsimensis
シマゴショウ		—✓✓✓✓No———0020/382 (0.0%)2/1056 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chloranthus fortunei
キビヒトリシズカ		—✓✓✓✓No———0111/16 (6.2%)1/74 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aristolochia contorta
マルバウマノスズクサ		—✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		211 Mbp
183.0x		224
2.32 Mbp		1443/228 (1.3%)3/264 (1.1%)2022-03-04
VU
絶滅危惧II類		Aristolochia zollingeriana
コウシュンウマノスズクサ		—✓✓✓✓No———0443/228 (1.3%)3/264 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum crassum
ナンゴクアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. austrokiiensis (in schedule)
キナンカンアオイ		—————No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. fauriei
ミチノクサイシン		—✓—✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fauriei var. nakaianum
ミヤマアオイ		—✓—✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum fudsinoi
フジノカンアオイ		VU✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum hexalobum var. perfectum
キンチャクアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kiusianum var. kiusianum
ツクシアオイ		—————No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kiusianum var. tubulosum
アケボノアオイ		———✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kumageanum var. kumageanum
クワイバカンアオイ		—✓———No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum kurosawae
イワタカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum muramatsui var. muramatsui
アマギカンアオイ		———✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum nipponicum var. nankaiense
ナンカイアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum sakawanum var. sakawanum
サカワサイシン		—✓—✓—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum simile
トクノシマカンアオイ		VU✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum tamaense
タマノカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum unzen
ウンゼンカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asarum yakusimense
オニカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Paeonia obovata
ベニバナヤマシャクヤク		—✓✓✓✓No———0111/66 (1.5%)1/66 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Eurya minutissima
マメヒサカキ		———✓✓No———0010/72 (0.0%)1/225 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum ascyron var. longistylum
コウライトモエソウ		—✓—✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum yezoense
エゾオトギリ		—✓✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypericum yojiroanum
ダイセツヒナオトギリ		——✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Drosera anglica
ナガバノモウセンゴケ		—✓✓✓—No———0343/88 (3.4%)4/90 (4.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Drosera indica
ナガバノイシモチソウ		LC✓✓✓✓No———0343/88 (3.4%)4/90 (4.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Corydalis kushiroensis
チドリケマン		——✓✓✓No———00130/228 (0.0%)9/568 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arabis flagellosa var. kawachiensis
カワチスズシロソウ		———✓✓No———094845/104 (4.8%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Arabis tanakana
クモイナズナ		———✓✓No———094845/104 (4.8%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardamine kiusiana
タカチホガラシ		—✓—✓✓No———084846/217 (2.8%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardamine schinziana
エゾノジャニンジン		——✓✓✓No———084846/217 (2.8%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cochlearia oblongifolia
トモシリソウ		—✓—✓✓No———034843/21 (14.3%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Draba nipponica
クモマナズナ		—✓—✓✓No———034842/326 (0.6%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Rorippa globosa
ミギワガラシ		—✓✓✓✓No———004840/67 (0.0%)105/3391 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium cauticola f. cauticola
ヒダカミセバヤ		—————No———0090/25 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium pallescens
ムラサキベンケイソウ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium sieboldii var. ettyuense
エッチュウミセバヤ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hylotelephium ussuriense var. tsugaruense
ツガルミセバヤ		—✓✓✓✓No———0090/25 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Meterostachys sikokianus
チャボツメレンゲ		—✓✓✓✓No———0090/1 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. boehmeri
コモチレンゲ		———✓✓No———0090/20 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. iwarenge
イワレンゲ		—✓✓✓✓No———0090/20 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Orostachys malacophylla var. malacophylla
ゲンカイイワレンゲ		—✓—✓—No———0090/20 (0.0%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum hakonense
マツノハマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum polytrichoides
ウンゼンマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Sedum tosaense
ヤハズマンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1202 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Astilbe rubra
オオチダケサシ		—✓✓✓✓No———0010/30 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Cardiandra moellendorffii
オオクサアジサイ		—✓✓✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Kirengeshoma palmata
キレンゲショウマ		EN✓✓✓✓No———0060/3 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Mitella nuda
マルバチャルメルソウ		—✓✓✓✓No———0010/5 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Peltoboykinia watanabei
ワタナベソウ		—✓✓✓✓No———0010/2 (0.0%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Saxifraga acerifolia
エチゼンダイモンジソウ		—✓✓✓✓No———0111/503 (0.2%)1/829 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Deutzia uniflora
ウメウツギ		—✓✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Deutzia zentaroana
ブンゴウツギ		—✓✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrangea liukiuensis
リュウキュウコンテリギ		—✓✓✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrangea serrata var. minamitanii
ヒュウガアジサイ		—✓—✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ribes triste
トカチスグリ		—✓✓✓✓No———0000/137 (0.0%)0/137 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pittosporum beecheyi
ハハジマトベラ		—✓—✓✓No———0111/111 (0.9%)1/137 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Astragalus frigidus subsp. parviflorus
リシリオウギ		———✓✓No———052943/1579 (0.2%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Glycine koidzumii
ミヤコジマツルマメ		——✓✓✓No———0292944/50 (8.0%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza maximowiczii
チョウセンキハギ		—✓✓✓✓No———012941/64 (1.6%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza melanantha
クロバナキハギ		—✓✓✓✓No———012941/64 (1.6%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Lespedeza tomentosa
イヌハギ		—✓✓✓✓No———012941/64 (1.6%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Oxytropis retusa
ヒダカミヤマノエンドウ		—✓✓✓✓No———012941/262 (0.4%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Vigna adenantha
コチョウインゲン		LC✓✓✓✓No———002940/2 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrobryum floribundum
ウスカワゴロモ		—✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/388 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hydrobryum japonicum
カワゴロモ		LC✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/388 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oxalis obtriangulata
オオヤマカタバミ		—✓✓✓✓No———0111/426 (0.2%)1/449 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Geranium shikokianum var. kaimontanum
カイフウロ		—✓✓——No———08287/184 (3.8%)26/529 (4.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Geranium soboliferum var. kiusianum
ツクシフウロ		—✓—✓✓No———08287/184 (3.8%)26/529 (4.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamaesyce sparrmannii
ボロジノニシキソウ		———✓—No———0474/42/3644 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Drypetes integerrima
ハツバキ		—✓✓✓✓No———0000/61 (0.0%)0/66 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphorbia watanabei subsp. watanabei
フジタイゲキ		—✓✓✓✓No———0187412/1293 (0.9%)42/3644 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Excoecaria formosana var. daitoinsularis
ダイトウセイシボク		——✓✓✓No———02742/13 (15.4%)42/3644 (1.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Melicope nishimurae
ムニンゴシュユ		—✓✓✓✓No———00710/145 (0.0%)32/1478 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Zanthoxylum yakumontanum
ヤクシマカラスザンショウ		—✓—✓✓No———04713/163 (1.8%)32/1478 (2.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer miyabei var. miyabei
クロビイタヤ		——✓✓—No———07184/173 (2.3%)11/1118 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer oblongum subsp. itoanum
クスノハカエデ		—✓—✓✓No———07184/173 (2.3%)11/1118 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acer pycnanthum
ハナノキ		VU✓✓✓✓No———07184/173 (2.3%)11/1118 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Meliosma arnottiana subsp. oldhamii var. hachijoensis
サクノキ		———✓✓No———0000/74 (0.0%)0/100 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ilex matanoana
ムニンイヌツゲ		—✓✓✓✓No———0553/342 (0.9%)3/346 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Euonymus boninensis
ヒメマサキ		—✓✓✓✓No———0241/87 (1.1%)2/730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euonymus fortunei var. austroliukiuensis (in schedule)
リュウキュウツルマサキ		—————No———0241/87 (1.1%)2/730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Euonymus yakushimensis
アオツリバナ		—✓—✓✓No———0241/87 (1.1%)2/730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Tripterygium doianum
コバノクロヅル		—✓✓✓✓No———0241/6 (16.7%)2/730 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Buxus liukiuensis
オキナワツゲ		—✓✓✓✓No———0231/105 (1.0%)2/141 (1.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Paliurus ramosissimus
ハマナツメ		—✓✓✓✓No———00160/9 (0.0%)5/891 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhamnella franguloides var. inaequilatera
ヤエヤマネコノチチ		——✓✓✓No———01161/12 (8.3%)5/891 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhamnus yoshinoi
キビノクロウメモドキ		—✓✓✓✓No———00160/121 (0.0%)5/891 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Daphne koreana
チョウセンナニワズ		—✓✓✓✓No———0171/54 (1.9%)6/558 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Daphnimorpha kudoi
シャクナンガンピ		—✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)6/558 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplomorpha albiflora
ミヤマガンピ		———✓✓No———0070/4 (0.0%)6/558 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplomorpha pauciflora
サクラガンピ		—✓—✓✓No———0070/4 (0.0%)6/558 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaeagnus matsunoana
ハコネグミ		—✓—✓✓No———0252/78 (2.6%)5/93 (5.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola grayi
イソスミレ		—✓✓✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola hultenii
チシマウスバスミレ		——✓✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola patrinii var. angustifolia
ホソバシロスミレ		———✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola raddeana
タチスミレ		—✓✓✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola sacchalinensis f. alpina
アポイタチツボスミレ		————✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viola yubariana
シソバキスミレ		—✓—✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Begonia fenicis
コウトウシュウカイドウ		—✓✓✓✓No———0555/1032 (0.5%)5/1033 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Rotala mexicana
ミズマツバ		LC✓✓✓✓No———00190/20 (0.0%)8/345 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Rotala rosea
ミズキカシグサ		LC✓✓✓✓No———00190/20 (0.0%)8/345 (2.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Trapa incisa
ヒメビシ		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		473 Mbp
43.2x		262
13.8 Mbp		24193/24 (12.5%)8/345 (2.3%)2023-05-24
VU
絶滅危惧II類		Syzygium cleyerifolium
ヒメフトモモ		—✓✓✓✓No———08767/451 (1.6%)62/2947 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Blastus cochinchinensis
ミヤマハシカンボク		—✓✓✓✓No———0050/13 (0.0%)4/3236 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Bredia okinawensis
コバノミヤマノボタン		—✓✓✓✓No———0050/9 (0.0%)4/3236 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Melastoma candidum var. alessandrense
イオウノボタン		—✓—✓✓No———2554/58 (6.9%)4/3236 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Osbeckia chinensis
ヒメノボタン		—✓✓✓✓No———0050/16 (0.0%)4/3236 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Circaea lutetiana subsp. quadrisulcata
エゾミズタマソウ		———✓✓No———0040/10 (0.0%)3/465 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Epilobium hirsutum
オオアカバナ		LC✓✓✓✓No———0040/106 (0.0%)3/465 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Epilobium platystigmatosum
トダイアカバナ		——✓✓✓No———0040/106 (0.0%)3/465 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Ludwigia adscendens
ケミズキンバイ		LC✓✓✓✓No———0040/65 (0.0%)3/465 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Ludwigia peploides subsp. stipulacea
ミズキンバイ		——✓✓✓No———0040/65 (0.0%)3/465 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Myriophyllum oguraense
オグラノフサモ		—✓✓✓✓No———0000/70 (0.0%)0/143 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hippuris tetraphylla
ヒロハスギナモ		LC✓✓✓✓No———00400/4 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Fatsia oligocarpella
ムニンヤツデ		—✓✓✓✓No———00120/3 (0.0%)9/957 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica boninensis
ムニンハマウド		———✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica pseudoshikokiana
ツクシトウキ		———✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica shikokiana var. shikokiana
イヌトウキ		—————No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica stenoloba
ホソバトウキ		—✓—✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica tenuisecta var. furcijuga
ヒュウガトウキ		———✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica tenuisecta var. tenuisecta
カワゼンゴ		———✓—No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica yakusimensis
ヤクシマノダケ		—✓—✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Angelica yoshinagae
トサボウフウ		———✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Bupleurum scorzonerifolium var. stenophyllum
ミシマサイコ		———✓✓No———00140/97 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pterygopleurum neurophyllum
シムラニンジン		—✓✓✓✓No———00140/1 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Sanicula tuberculata
フキヤミツバ		——✓✓✓No———01141/45 (2.2%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Sium suave var. nipponicum
ヌマゼリ		——✓✓✓No———00140/15 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pyrola faurieana
カラフトイチヤクソウ		—✓✓✓✓No———00350/31 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Bryanthus gmelinii
チシマツガザクラ		—✓✓✓✓No———00350/2 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Menziesia lasiophylla
ムラサキツリガネツツジ		—✓—✓✓No———00350/1 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Menziesia purpurea
ヨウラクツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron dauricum
エゾムラサキツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron japonoheptamerum var. kyomaruense
キョウマルシャクナゲ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron komiyamae
アシタカツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron lapponicum subsp. parvifolium
サカイツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron makinoi
ホソバシャクナゲ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron mayebarae var. mayebarae
ナンゴクミツバツツジ		——✓✓—No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron nudipes var. kirishimense
キリシマミツバツツジ		——✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron osuzuyamense
ウラジロミツバツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron sanctum var. lasiogynum
シブカワツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron sanctum var. sanctum
ジングウツツジ		—————No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron scabrum
ケラマツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron tsusiophyllum
ハコネコメツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron yakuinsulare
ヤクシマヤマツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhododendron yakumontanum
ヤクシマミツバツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Vaccinium boninense
ムニンシャシャンボ		—✓✓✓✓No———011356/230 (2.6%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Vaccinium microcarpum
ヒメツルコケモモ		—✓✓✓✓No———011356/230 (2.6%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Vaccinium yakushimense
アクシバモドキ		—✓✓✓✓No———011356/230 (2.6%)24/3009 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Ardisia chinensis
シナヤブコウジ		—✓✓✓✓No———00100/232 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Myrsine maximowiczii
シマタイミンタチバナ		—✓—✓✓No———00100/85 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lysimachia barystachys
ノジトラノオ		—✓✓✓✓No———00100/150 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula cuneifolia var. heterodonta
ミチノクコザクラ		——✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula hidakana var. hidakana
ヒダカイワザクラ		———✓—No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula kisoana var. shikokiana
シコクカッコソウ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula modesta var. matsumurae
レブンコザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula reinii var. kitadakensis
クモイコザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula reinii var. reinii
コイワザクラ		——✓✓—No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula sorachiana
ソラチコザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Primula takedana
テシオコザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Limonium wrightii var. luteum
キバナイソマツ		———✓✓No———0111/292 (0.3%)1/624 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Limonium wrightii var. wrightii
イソマツ		——✓✓—No———0111/292 (0.3%)1/624 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Planchonella obovata var. dubia
コバノアカテツ		—✓—✓✓No———0040/121 (0.0%)4/1033 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Styrax japonica var. tomentosa
オオバケエゴノキ		—————No———0000/88 (0.0%)0/122 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Symplocos sonoharae
ミヤマシロバイ		—✓✓✓✓No———0111/209 (0.5%)1/210 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Chionanthus retusus
ヒトツバタゴ		—✓✓✓✓No———00460/50 (0.0%)32/557 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Jasminum sinense
オキナワソケイ		—✓✓✓✓No———01461/85 (1.2%)32/557 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Osmanthus enervius
ナンゴクモクセイ		—✓✓✓✓No———01461/41 (2.4%)32/557 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Gardneria multiflora
チトセカズラ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/251 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Geniostoma glabrum
オガサワラモクレイシ		—✓—✓✓No———0000/11 (0.0%)0/251 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Mitrasacme indica
ヒメナエ		———✓✓No———0000/19 (0.0%)0/251 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gentiana jamesii var. jamesii
リシリリンドウ		—————No———0343/282 (1.1%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Gentiana jamesii var. robusta
イイデリンドウ		—————No———0343/282 (1.1%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Gentiana satsunanensis
リュウキュウコケリンドウ		———✓✓No———0343/282 (1.1%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Pterygocalyx volubilis
ホソバツルリンドウ		—✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Swertia makinoana
シマアケボノソウ		———✓✓No———0040/96 (0.0%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Swertia noguchiana
ソナレセンブリ		——✓✓✓No———0040/96 (0.0%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Swertia swertopsis
シノノメソウ		——✓✓✓No———0040/96 (0.0%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Swertia tosaensis
イヌセンブリ		—✓✓✓✓No———0040/96 (0.0%)4/1134 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Nymphoides coreana
ヒメシロアサザ		—✓✓✓✓No———0000/40 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Apocynum venetum var. basikurumon
バシクルモン		——✓✓✓No———12222/9 (22.2%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum amplexicaule
ロクオンソウ		—✓✓✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum atratum
フナバラソウ		—✓✓✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum calcareum
イシダテクサタチバナ		—✓—✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum hoyoense
ホウヨカモメヅル		—✓—✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum izuense
イズカモメヅル		—✓—✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum katoi
クサナギオゴケ		—✓—✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vincetoxicum yamanakae
ヤマワキオゴケ		—✓—✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Galium boreale var. kamtschaticum
エゾキヌタソウ		———✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Galium manshuricum
エゾムグラ		———✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Galium niewerthii
ヤブムグラ		———✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Galium pogonanthum var. yakumontanum
ヤクシマヤマムグラ		—✓—✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Galium tokyoense
ハナムグラ		—✓✓✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Gardenia boninensis
オガサワラクチナシ		—✓✓✓✓No———01331/67 (1.5%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hedyotis hookeri
マルバシマザクラ		—✓—✓✓No———00330/151 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Hedyotis verticillata
ヒロハケニオイグサ		—✓—✓✓No———00330/151 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Morinda citrifolia
ヤエヤマアオキ		—✓✓✓✓No———00330/33 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Psychotria homalosperma
オガサワラボチョウジ		—✓✓✓✓No———00330/530 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Tarenna subsessilis
シマギョクシンカ		—✓✓✓✓No———00330/57 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Polemonium caeruleum subsp. laxiflorum var. paludosum
クシロハナシノブ		———✓✓No———0020/31 (0.0%)1/419 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Polemonium caeruleum subsp. yezoense var. nipponicum
ミヤマハナシノブ		—✓✓✓✓No———0020/31 (0.0%)1/419 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Polemonium caeruleum subsp. yezoense var. yezoense
エゾハナシノブ		—✓✓✓✓No———0020/31 (0.0%)1/419 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cuscuta chinensis
ハマネナシカズラ		—✓✓✓✓No———04164/186 (2.2%)11/1176 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Trigonotis radicans var. radicans
ケルリソウ		—✓—✓—No———0060/35 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Avicennia marina
ヒルギダマシ		LC✓✓✓✓Yes (4)Chromosome,
Representative		457 Mbp
248.0x		331
3.01 Mbp		4481/9 (11.1%)4/1910 (0.2%)2020-03-09
VU
絶滅危惧II類		Callicarpa kochiana
ビロードムラサキ		—✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Callicarpa oshimensis var. okinawensis
オキナワヤブムラサキ		—✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Callicarpa shikokiana
トサムラサキ		—✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Caryopteris incana
ダンギク		—✓✓✓✓No———02571/10 (10.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Callitriche hermaphroditica
チシマミズハコベ		LC✓✓✓✓No———00400/48 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ajuga ciliata var. villosior
カイジンドウ		——✓✓✓No———03572/41 (4.9%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ajuga shikotanensis
ツルカコソウ		—✓✓✓✓No———03572/41 (4.9%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Dracocephalum argunense
ムシャリンドウ		—✓✓✓✓No———01571/73 (1.4%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Lamium tuberiferum
ヒメキセワタ		———✓✓No———02571/27 (3.7%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Leonurus macranthus
キセワタ		—✓✓✓✓No———01571/10 (10.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Meehania montis-koyae
オチフジ		—✓✓✓✓No———00570/9 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Mosla chinensis
ホソバヤマジソ		—✓✓✓✓No———00570/14 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pogostemon yatabeanus
ミズトラノオ		—✓✓✓✓No———02571/47 (2.1%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvia isensis
シマジタムラソウ		—✓✓✓✓No———013577/708 (1.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvia koyamae
シナノアキギリ		—✓✓✓✓No———013577/708 (1.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvia omerocalyx
タジマタムラソウ		—✓✓✓✓No———013577/708 (1.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Scutellaria guilielmii
コナミキ		—✓———No———06574/278 (1.4%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Scutellaria kuromidakensis
ヤクシマシソバタツナミ		——✓✓✓No———06574/278 (1.4%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Scutellaria yezoensis
エゾナミキ		—✓✓✓✓No———06574/278 (1.4%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Suzukia luchuensis
ヤエヤマスズコウジュ		—✓✓✓✓No———00570/2 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Physaliastrum japonicum
アオホオズキ		—✓✓✓✓No———012721/23 (4.3%)89/2442 (3.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Centranthera cochinchinensis subsp. lutea
ゴマクサ		———✓✓No———0080/2 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Deinostema adenocaulum
マルバノサワトウガラシ		—————No———00400/1 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphrasia hachijoensis
ハチジョウコゴメグサ		———✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphrasia insignis subsp. iinumae var. iinumae
イブキコゴメグサ		——✓✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphrasia insignis subsp. insignis var. nummularia
マルバコゴメグサ		———✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphrasia kisoalpina
コケコゴメグサ		——✓✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Euphrasia microphylla
ナヨナヨコゴメグサ		——✓✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Gratiola japonica
オオアブノメ		——✓✓✓No———00400/17 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Limnophila indica
コキクモ		LC✓✓✓✓No———00400/9 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Limosella aquatica
キタミソウ		LC✓✓✓✓No———0040/11 (0.0%)2/1028 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Melampyrum laxum var. arcuatum
タカネママコナ		——✓✓✓No———0080/18 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Microcarpaea minima
スズメハコベ		LC✓✓✓✓No———00400/1 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Pedicularis ochiaiana
ヤクシマシオガマ		—✓✓✓✓No———0080/408 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pedicularis resupinata subsp. oppositifolia var. microphylla
ミカワシオガマ		—✓✓✓—No———0080/408 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pedicularis schistostegia
ネムロシオガマ		—✓✓✓✓No———0080/408 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Pedicularis spicata
ホザキシオガマ		—✓✓✓✓No———0080/408 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Scrophularia buergeriana
ゴマノハグサ		—✓✓✓✓No———0040/210 (0.0%)2/1028 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Siphonostegia laeta
オオヒキヨモギ		—✓✓✓✓No———0080/3 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica javanica
ハマクワガタ		—✓✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica kiusiana var. kitadakemontana
キタダケトラノオ		———✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica kiusiana var. kiusiana
ツクシトラノオ		—————No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica ogurae
サンイントラノオ		———✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica onoei
グンバイヅル		——✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica ornata
トウテイラン		—✓✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica polita subsp. lilacina
イヌノフグリ		——✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica schmidtiana subsp. senanensis var. yezoalpina
エゾミヤマクワガタ		———✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica sieboldiana
ハマトラノオ		——✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica stelleri var. longistyla
エゾヒメクワガタ		—✓—✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronica subsessilis
ルリトラノオ		——✓✓✓No———08404/386 (1.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronicastrum japonicum var. australe
ナンゴククガイソウ		——✓✓✓No———00400/16 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronicastrum sibiricum var. zuccarinii
ツクシクガイソウ		—✓—✓✓No———00400/16 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Veronicastrum tagawae
キノクニスズカケ		—✓✓✓✓No———00400/16 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Lysionotus pauciflorus
シシンラン		—✓✓✓✓No———0060/23 (0.0%)6/2371 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Opithandra primuloides
イワギリソウ		—✓✓✓✓No———0060/129 (0.0%)6/2371 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Orobanche coerulescens
ハマウツボ		—✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		3.65 Gbp
97.0x		2,775
8.30 Mbp		1181/82 (1.2%)7/1379 (0.5%)2023-11-07
VU
絶滅危惧II類		Pinguicula ramosa
コウシンソウ		—✓✓✓✓No———0252/104 (1.9%)5/340 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Utricularia aurea
ノタヌキモ		LC✓✓✓✓No———0252/205 (1.0%)5/340 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Utricularia exoleta
ミカワタヌキモ		LC✓—✓✓No———1252/205 (1.0%)5/340 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Utricularia ochroleuca
ヤチコタヌキモ		LC✓✓✓—No———0252/205 (1.0%)5/340 (1.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Myoporum bontioides
ハマジンチョウ		—✓✓✓✓No———0040/27 (0.0%)2/1028 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera alpigena subsp. glehnii var. glehnii
エゾヒョウタンボク		———✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera cerasina
ウスバヒョウタンボク		—✓✓✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera chamissoi
チシマヒョウタンボク		—✓✓✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera chrysantha var. crassipes
ネムロブシダマ		—✓—✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera maackii
ハナヒョウタンボク		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
—		793 Mbp
110.0x		233,951
10.6 kbp		1222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)2022-05-20
VU
絶滅危惧II類		Lonicera sachalinensis
ベニバナヒョウタンボク		—✓—✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lonicera vidalii
オニヒョウタンボク		—✓✓✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Triosteum sinuatum
ツキヌキソウ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Viburnum brachyandrum
シマガマズミ		—✓✓✓✓No———0020/175 (0.0%)1/206 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Viburnum tashiroi
オオシマガマズミ		VU✓✓✓✓No———0020/175 (0.0%)1/206 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Zabelia integrifolia
イワツクバネウツギ		—✓✓✓✓No———0020/11 (0.0%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Scabiosa japonica var. lasiophylla
ソナレマツムシソウ		—✓———No———0020/31 (0.0%)2/655 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Adenophora maximowicziana
ヒナシャジン		—✓✓✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Adenophora nikoensis var. teramotoi
シライワシャジン		———✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Adenophora uryuensis
シラトリシャジン		—✓✓✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Campanumoea javanica var. japonica
ツルギキョウ		—✓✓✓✓No———02102/46 (4.3%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Codonopsis ussuriensis
バアソブ		—✓✓✓✓No———02102/46 (4.3%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Lobelia boninensis
オオハマギキョウ		—✓✓✓✓No———01101/187 (0.5%)8/1478 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Platycodon grandiflorus
キキョウ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		575 Mbp
49.1x		1,175
1.52 Mbp		22101/1 (100.0%)8/1478 (0.5%)2019-04-05
VU
絶滅危惧II類		Achillea alpina subsp. japonica
キタノコギリソウ		—✓✓✓✓No———001060/79 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ainsliaea fragrans
マルバテイショウソウ		—✓✓✓✓No———001060/38 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ainsliaea oblonga var. oblonga
ナガバハグマ		———✓—No———001060/38 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anaphalis sinica var. pernivea
トダイハハコ		——✓✓✓No———001060/74 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Anaphalis sinica var. viscosissima
クリヤマハハコ		———✓✓No———001060/74 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Artemisia congesta
オニオトコヨモギ		———✓✓No———0121066/460 (1.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Artemisia glomerata
ハハコヨモギ		—✓✓✓✓No———0121066/460 (1.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Artemisia rubripes
ヤブヨモギ		—✓✓✓✓No———0121066/460 (1.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Artemisia sacrorum
イワヨモギ		—✓—✓✓No———0121066/460 (1.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Artemisia tanacetifolia
シコタンヨモギ		—✓✓✓✓No———0121066/460 (1.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster hispidus var. leptocladus
ヤナギノギク		—✓✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster kantoensis
カワラノギク		——✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster koshikiensis
コシキギク		—✓✓——No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster maackii
ヒゴシオン		—✓✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster miyagii
オキナワギク		VU—✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster sohayakiensis
ホソバノギク		——✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Aster tataricus
シオン		—✓✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Bidens cernua
ヤナギタウコギ		LC✓✓✓✓No———021061/121 (0.8%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Carpesium faberi
コバナガンクビソウ		—✓✓✓✓No———001060/24 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysanthemum arcticum subsp. yezoense
チシマコハマギク		——✓✓✓No———001060/1 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysanthemum crassum
オオシマノジギク		—✓—✓✓No———041063/48 (6.2%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysanthemum pallasianum
オオイワインチン		—✓✓✓✓No———001060/28 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysanthemum weyrichii
ピレオギク		—✓—✓✓No———041063/48 (6.2%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Chrysanthemum zawadskii var. zawadskii
イワギク		———✓—No———041063/48 (6.2%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium confertissimum
コイブキアザミ		—✓✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium homolepis
オゼヌマアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium horiianum
オガアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium magofukui
イナベアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium nipponicum var. sadoense
サドアザミ		———✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium sieboldii subsp. austrokiushianum
サツママアザミ		———✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium tashiroi var. hidaense
ヒダアザミ		———✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Cirsium tashiroi var. tashiroi
ワタムキアザミ		———✓—No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Conyza japonica
イズハハコ		—✓—✓✓No———001060/32 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Crepidiastrum chelidoniifolium
クサノオウバノギク		—✓✓✓✓No———001060/4 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Crepidiastrum linguifolium
ヘラナレン		—✓✓✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Crepis gymnopus
エゾタカネニガナ		———✓✓No———001060/109 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Crossostephium chinense
モクビャクコウ		—✓✓✓✓No———001060/1 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Dendrocacalia crepidifolia
ワダンノキ		—✓✓✓✓No———001060/1 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Echinops setifer
ヒゴタイ		—✓✓✓✓No———001060/149 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Erigeron acer var. linearifolius
ホソバムカシヨモギ		———✓—No———041063/178 (1.7%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Eupatorium lindleyanum var. yasushii
ハマサワヒヨドリ		———✓✓No———001060/47 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Eupatorium yakushimense
ヤクシマヒヨドリ		———✓✓No———001060/47 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Inula linariifolia
ホソバオグルマ		—✓✓✓✓No———001060/56 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeridium dentatum subsp. kitayamense
ドロニガナ		—✓✓✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeridium dentatum subsp. nipponicum
イソニガナ		—✓✓✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeridium laevigatum
ヤナギニガナ		—✓✓✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeridium yakuinsulare
コスギニガナ		———✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeris chinensis subsp. strigosa
タカサゴソウ		——✓✓✓No———001060/8 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ixeris longirostra
ツルワダン		———✓—No———001060/8 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Leontopodium fauriei var. angustifolium
ホソバヒナウスユキソウ		——✓✓✓No———001060/48 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Leontopodium japonicum var. perniveum
カワラウスユキソウ		——✓✓✓No———001060/48 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Leontopodium miyabeanum
オオヒラウスユキソウ		—————No———001060/48 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Leucanthemella linearis
ミコシギク		—✓✓✓✓No———001060/2 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ligularia sibirica
アソタカラコウ		—✓✓✓✓No———001060/97 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Parasenecio amagiensis
イズカニコウモリ		—✓✓✓✓No———001060/3 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Parasenecio ogamontanus
オガコウモリ		———✓✓No———001060/52 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Parasenecio shikokianus
ヒメコウモリソウ		—————No———001060/52 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea acuminata var. sachalinensis
カラフトアザミ		——✓✓—No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea chionophylla
ユキバヒゴタイ		——✓✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea fauriei
フォーリーアザミ		—✓—✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea franchetii
ミヤマキタアザミ		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea inaensis
イナトウヒレン		——✓✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea kudoana
ヒダカトウヒレン		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea modesta
ネコヤマヒゴタイ		——✓✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea pulchella
ヒメヒゴタイ		—✓✓✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Saussurea yoshinagae
トサトウヒレン		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Solenogyne mikadoi
コケタンポポ		VU✓—✓✓No———001060/5 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Tanacetum vulgare
エゾヨモギギク		—✓✓✓✓No———031062/79 (2.5%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Taraxacum kiushianum
ツクシタンポポ		———✓✓No———001060/467 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Tephroseris flammea subsp. glabrifolia
コウリンカ		—✓—✓✓No———001060/33 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Xanthium strumarium
オナモミ		—✓✓✓✓No———001060/14 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Alisma rariflorum
トウゴクヘラオモダカ		—✓—✓✓No———0221/11 (9.1%)1/143 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Caldesia parnassiifolia
マルバオモダカ		—————No———0020/2 (0.0%)1/143 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Blyxa aubertii
マルミスブタ		LC✓✓✓✓No———0030/3 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Blyxa echinosperma
スブタ		—✓✓✓✓No———0030/3 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Enhalus acoroides
ウミショウブ		LC✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Halophila decipiens
トゲウミヒルモ		LC✓✓✓✓No———0030/50 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Ottelia alismoides
ミズオオバコ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		6.46 Gbp
10.0x		13,319
699 kbp		1131/39 (2.6%)2/213 (0.9%)2024-03-19
VU
絶滅危惧II類		Vallisneria natans var. higoensis
ヒラモ		—✓—✓✓No———0030/65 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Triglochin palustris
ホソバノシバナ		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		437 Mbp
32.0x		301
4.41 Mbp		2442/22 (9.1%)2/27 (7.4%)2024-07-05
VU
絶滅危惧II類		Potamogeton alpinus
ホソバヒルムシロ		LC✓✓✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potamogeton cristatus
コバノヒルムシロ		—✓✓✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potamogeton nitens
ササエビモ		—✓—✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Potamogeton pusillus
ツツイトモ		LC✓✓✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zannichellia palustris var. indica
イトクズモ		———✓✓No———0000/11 (0.0%)0/171 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zostera asiatica
オオアマモ		NT✓✓✓✓No———0222/18 (11.1%)2/24 (8.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Zostera caulescens
タチアマモ		NT✓✓✓✓No———0222/18 (11.1%)2/24 (8.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Najas chinensis
サガミトリゲモ		—✓✓✓✓No———0030/30 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Najas minor
トリゲモ		LC✓✓✓✓No———0030/30 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Najas yezoensis
イトイバラモ		———✓✓No———0030/30 (0.0%)2/213 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Sciaphila nana
ホンゴウソウ		—✓✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sciaphila ramosa
スズフリホンゴウソウ		——✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sciaphila secundiflora
ウエマツソウ		——✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Allium kiiense
キイイトラッキョウ		———✓✓No———0793/619 (0.5%)5/1468 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Amana erythronioides
ヒロハノアマナ		—✓✓✓✓No———0010/22 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Caloscordum inutile
ステゴビル		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Chionographis hisauchiana subsp. hisauchiana
アズマシライトソウ		———✓—No———0111/4 (25.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Chionographis hisauchiana subsp. kurohimensis
クロヒメシライトソウ		———✓✓No———0111/4 (25.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Chionographis japonica var. yakusimensis
ヤクシマシライトソウ		———✓✓No———1111/4 (25.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Chionographis koidzumiana var. koidzumiana
チャボシライトソウ		———✓—No———0111/4 (25.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Fritillaria ayakoana
イズモコバイモ		—✓✓✓✓No———0010/137 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Fritillaria japonica
ミノコバイモ		—✓✓✓✓No———0010/137 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Fritillaria muraiana
アワコバイモ		—✓✓✓✓No———0010/137 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Fritillaria shikokiana
トサコバイモ		—✓✓✓✓No———0010/137 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Gagea vaginata
エゾヒメアマナ		——✓✓✓No———0010/154 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Helonias kawanoi
コショウジョウバカマ		VU✓—✓✓No———0010/7 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Helonias leucantha
オオシロショウジョウバカマ		VU✓—✓✓No———0010/7 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Hosta kikutii var. scabrinervia
ザラツキギボウシ		—✓✓✓—No———00170/46 (0.0%)13/1447 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Hosta tsushimensis var. tibae
ナガサキギボウシ		—✓✓✓✓No———00170/46 (0.0%)13/1447 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Japonolirion osense
オゼソウ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lilium speciosum var. clivorum
タキユリ		—✓✓✓✓No———0111/151 (0.7%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Lilium speciosum var. speciosum
カノコユリ		—✓✓✓✓No———0111/151 (0.7%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tricyrtis flava subsp. flava
キバナノホトトギス		—————No———0010/35 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tricyrtis macrantha
ジョウロウホトトギス		—✓✓✓✓No———0010/35 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tricyrtis macranthopsis
キイジョウロウホトトギス		—✓✓✓✓No———0010/35 (0.0%)1/747 (0.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Trillium hagae
シラオイエンレイソウ		———✓—No———0010/53 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Trillium smallii
コジマエンレイソウ		—✓✓✓✓No———0010/53 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Veratrum stamineum var. micranthum
ミカワバイケイソウ		—✓✓✓✓No———0010/35 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Dioscorea izuensis
イズドコロ		—✓—✓✓No———011125/343 (1.5%)6/348 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Iris rossii
エヒメアヤメ		—✓✓✓✓No———0785/291 (1.7%)6/1433 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Burmannia liukiuensis
キリシマシャクジョウ		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/72 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Juncus castaneus
クロコウガイゼキショウ		—✓✓✓✓No———0682/162 (1.2%)3/279 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Juncus covillei var. covillei
セキショウイ		—✓✓✓—No———0682/162 (1.2%)3/279 (1.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pollia secundiflora
サルゾコミョウガ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/273 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Streptolirion lineare
アオイカズラ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/273 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon atroides
クロイヌノヒゲモドキ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon glaberrimum
ネムロホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon japonicum
ヤマトホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon kiusianum
ツクシクロイヌノヒゲ		—✓✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon kusiroense
クシロホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon mikawanum var. mikawanum
ミカワイヌノヒゲ		—————No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon nudicuspe
シラタマホシクサ		—✓✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon pallescens
シロエゾホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon parvum
クロホシクサ		—✓✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon sachalinense
カラフトホシクサ		——✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eriocaulon takae
アズマホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anthoxanthum nipponicum
ミヤマハルガヤ		—✓—✓✓No———008480/42 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Aristida boninensis
マツバシバ		——✓✓✓No———008480/133 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arundinella riparia
ミギワトダシバ		—✓✓✓✓No———008480/25 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Calamagrostis masamunei
ヤクシマノガリヤス		———✓✓No———008480/101 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Chikusichloa aquatica
ツクシガヤ		—✓—✓✓No———008480/2 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Chikusichloa brachyanthera
イリオモテガヤ		—————No———008480/2 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Elymus humidus
ミズタカモジ		—✓—✓✓No———018481/157 (0.6%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Eulalia speciosa
ウンヌケ		—✓✓✓✓No———008480/8 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Festuca chiisanensis
チイサンウシノケグサ		———✓✓No———008480/307 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Festuca parvigluma var. breviaristata
イブキトボシガラ		———✓✓No———008480/307 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Festuca takedana
タカネソモソモ		———✓✓No———008480/307 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Garnotia acutigluma
アオシバ		—✓—✓✓No———008480/7 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Glyceria spiculosa
ヌマドジョウツナギ		—✓✓✓✓No———008480/31 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Poa acroleuca var. ryukyuensis
オキナワミゾイチゴツナギ		———✓✓No———068485/368 (1.4%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Poa glauca var. glauca
タカネタチイチゴツナギ		——✓✓—No———068485/368 (1.4%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Trisetum koidzumianum
ミヤマカニツリ		———✓✓No———008480/14 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Trisetum spicatum subsp. alascanum
リシリカニツリ		———✓—No———008480/30 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Clinostigma savoryanum
ノヤシ		DD✓✓✓✓No———00190/4 (0.0%)8/2170 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Amorphophallus kiusianus
ヤマコンニャク		—✓✓✓✓No———02222/176 (1.1%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arisaema heterophyllum
マイヅルテンナンショウ		LC✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arisaema ishizuchiense subsp. brevicollum
カミコウチテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arisaema minus
ハリママムシグサ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Arisaema sikokianum
ユキモチソウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Symplocarpus nabekuraensis
ナベクラザゼンソウ		—✓✓✓✓No———00220/5 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Lemna trisulca
ヒンジモ		LC✓✓✓✓No———01221/17 (5.9%)10/1749 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Sparganium angustifolium
ホソバウキミクリ		LC✓✓✓✓No———0020/47 (0.0%)1/77 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Sparganium eurycarpum subsp. coreanum
オオミクリ		—✓✓✓✓No———0020/47 (0.0%)1/77 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Sparganium gramineum
ウキミクリ		—✓✓✓✓No———0020/47 (0.0%)1/77 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Sparganium subglobosum
ヒメミクリ		LC✓✓✓✓No———0020/47 (0.0%)1/77 (1.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Actinoscirpus grossus
オオサンカクイ		LC✓✓✓✓No———00360/1 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex angustealata (in schedule)
ホザキマスクサ		————✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex apoiensis
アポイタヌキラン		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex argyi
ワンドスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex buxbaumii
タルマイスゲ		LC✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex capricornis
ジョウロウスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex cinerascens
ヌマアゼスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex conica var. scabrocaudata
トカラカンスゲ		———✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex cruciata
ハナビスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex diandra
クリイロスゲ		LC✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex eleusinoides
ヒメアゼスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex formosensis
タイワンスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex hashimotoi
サヤマスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex impura
ヒルゼンスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex laxa
イトナルコスゲ		DD✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex livida
ムセンスゲ		LC✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex meyeriana
ヌマクロボスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex nachiana
キシュウナキリスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex odontostoma
ミヤマイワスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex paupercula
ダケスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex phaeodon
ハシナガカンスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex poculisquama
アカネスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex polyschoena
シロホンモンジスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex quadriflora
アカスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex remotiuscula
イトヒキスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex rostrata var. rostrata
カラフトカサスゲ		——✓✓✓No———2223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex scita var. scabrinervia
シコタンスゲ		—✓—✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex siroumensis
タカネナルコ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex subumbellata
ミヤケスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex taihokuensis
タイホクスゲ		—✓—✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tashiroana
ノスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tenuiformis
オノエスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tokarensis
フサカンスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex toyoshimae
セキモンスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tsuishikarensis
ホロムイクグ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tsushimensis
ツシマスゲ		DD✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex tumidula
イワヤスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Carex vanheurckii
ヌイオスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Cyperus exaltatus var. iwasakii
カンエンガヤツリ		———✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplacrum caricinum
カガシラ		LC✓✓✓✓No———00360/5 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Eleocharis acicularis var. acicularis
チシママツバイ		——✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Eleocharis equisetiformis
スジヌマハリイ		———✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Eleocharis margaritacea
シロミノハリイ		—✓✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Eleocharis parvinux
コツブヌマハリイ		——✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Eleocharis parvula
チャボイ		—✓✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbristylis dichotoma subsp. podocarpa
ツクシテンツキ		——✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbristylis fusca
オノエテンツキ		——✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbristylis longispica var. boninensis
ムニンテンツキ		—✓—✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbristylis pierotii
ノハラテンツキ		—✓✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Fimbristylis stauntonii var. tonensis
トネテンツキ		———✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhynchospora boninensis
シマイガクサ		———✓✓No———03363/168 (1.8%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhynchospora chinensis var. curvoaristata
ムニンイヌノハナヒゲ		———✓✓No———03363/168 (1.8%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Schoenoplectus gemmifer
ハタベカンガレイ		—✓—✓✓No———00360/27 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Schoenoplectus littoralis subsp. subulatus
イヌフトイ		———✓—No———05363/30 (10.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Schoenoplectus mucronatus var. mucronatus
ヒメカンガレイ		———✓—No———00360/27 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Scirpus karuisawensis
ヒメマツカサススキ		—✓✓✓✓No———00360/38 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Scirpus maximowiczii
タカネクロスゲ		—✓✓✓✓No———00360/38 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Scleria mikawana
ミカワシンジュガヤ		LC✓✓✓✓No———00360/152 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Scleria sumatrensis
クロミノシンジュガヤ		LC✓✓✓✓No———00360/152 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Alpinia boninsimensis
シマクマタケラン		—✓✓✓✓No———01141/163 (0.6%)13/1392 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Amitostigma kinoshitae
コアニチドリ		—✓✓✓✓No———00280/53 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Amitostigma lepidum
オキナワチドリ		—✓✓✓✓No———00280/53 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Bulbophyllum boninense
オガサワラシコウラン		——✓✓✓No———00280/695 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe alismifolia
ダルマエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe hattorii
アサヒエビネ		———✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe lyroglossa
レンギョウエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe masuca
オナガエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe nipponica
キンセイラン		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe puberula var. puberula
ナツエビネ		———✓—No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe tricarinata
サルメンエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calanthe triplicata
ツルラン		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Calypso bulbosa var. bulbosa
ヒメホテイラン		——✓✓✓No———00280/1 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cephalanthera erecta var. subaphylla
ユウシュンラン		—✓—✓✓No———00280/20 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cephalanthera falcata
キンラン		—✓✓✓✓No———00280/20 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cephalanthera longifolia
クゲヌマラン		—✓✓✓✓No———00280/20 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Chamaegastrodia sikokiana
ヒメノヤガラ		—————No———00280/8 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cheirostylis liukiuensis
アカバシュスラン		—✓✓✓✓No———00280/18 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cleisostoma scolopendrifolium
ムカデラン		—✓✓✓✓No———00280/6 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Corymborkis veratrifolia
バイケイラン		—✓✓✓✓No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cremastra unguiculata
トケンラン		—✓✓✓✓No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cymbidium macrorhizon
マヤラン		—✓✓✓✓No———01281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cymbidium nagifolium
ナギラン		—✓—✓✓No———01281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cypripedium japonicum
クマガイソウ		EN✓✓✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cypripedium macranthos var. speciosum
アツモリソウ		—✓—✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cypripedium yatabeanum
キバナノアツモリソウ		NT✓✓✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Ephippianthus sawadanus
ハコネラン		—✓—✓✓No———00280/2 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Epipactis papillosa var. sayekiana
ハマカキラン		———✓✓No———00280/38 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Eria japonica
オサラン		———✓✓No———00280/43 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastrochilus japonicus
カシノキラン		—✓✓✓✓No———00280/59 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastrochilus matsuran
マツラン		—✓✓✓✓No———00280/59 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastrochilus toramanus
モミラン		——✓✓✓No———00280/59 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastrodia javanica
コンジキヤガラ		—✓✓✓✓No———02281/25 (4.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Gastrodia nipponica
ハルザキヤツシロラン		—✓✓✓✓No———02281/25 (4.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Goodyera grandis
ナンバンキンギンソウ		———✓✓No———00280/61 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Goodyera viridiflora
シマシュスラン		—✓✓✓✓No———00280/2 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Habenaria linearifolia var. brachycentra
ヒメミズトンボ		———✓✓No———00280/320 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Habenaria sagittifera
ミズトンボ		——✓✓✓No———00280/320 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Hetaeria yakusimensis
ヤクシマアカシュスラン		———✓✓No———00280/10 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Kuhlhasseltia nakaiana var. fissa (in schedule)
オオハクウンラン		—————No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Liparis bootanensis
チケイラン		—✓✓✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Liparis formosana var. hachijoensis
シマササバラン		—————No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Liparis fujisanensis
フガクスズムシソウ		—✓—✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Neofinetia falcata
フウラン		—✓✓✓✓No———00280/69 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Neottia acuminata
ヒメムヨウラン		LC✓✓✓✓No———00280/41 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Neottia nidus-avis var. mandshurica
サカネラン		—————No———00280/41 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Nervilia aragoana
ヤエヤマヒトツボクロ		—✓—✓✓No———00280/36 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Orchis chidori
ヒナチドリ		———✓✓No———00280/30 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Orchis graminifolia var. graminifolia
ウチョウラン		—————No———00280/30 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Phaius flavus
ガンゼキラン		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Phaius tankervilleae
カクチョウラン		—✓✓✓✓No———00280/21 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Platanthera chorisiana
タカネトンボ		LC✓✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Platanthera fuscescens
ヒロハトンボソウ		—✓✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Platanthera hyperborea
シロウマチドリ		LC✓✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. amamiana
アマミトンボ		———✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Platanthera tipuloides subsp. linearifolia
ナガバトンボソウ		———✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Spathoglottis plicata
コウトウシラン		—✓✓✓✓No———00280/18 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Stereosandra javanica
イリオモテムヨウラン		——✓✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Stigmatodactylus sikokianus
コオロギラン		—✓✓✓✓No———00280/11 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Tainia laxiflora
ヒメトケンラン		——✓✓✓No———00280/11 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Zeuxine gracilis var. sakagutii
イシガキキヌラン		———✓✓No———00280/16 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Picea maximowiczii
ヒメバラモミ		EN✓✓✓✓No———08365/54 (9.3%)15/323 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudotsuga japonica
トガサワラ		EN✓✓✓✓No———01361/6 (16.7%)15/323 (4.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Juniperus communis var. montana
リシリビャクシン		—✓✓✓✓No———0080/79 (0.0%)7/209 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Juniperus taxifolia var. taxifolia
シマムロ		——✓✓✓No———0080/79 (0.0%)7/209 (3.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lycopodium casuarinoides
ヒモヅル		—✓✓✓✓No———0010/1 (0.0%)1/328 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Lycopodium cryptomerinum
スギラン		—✓✓✓✓No———0010/190 (0.0%)1/328 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Isoetes pseudojaponica
ミズニラモドキ		—✓✓✓✓No———0222/208 (1.0%)2/208 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Isoetes sinensis var. sinensis
シナミズニラ		——✓——No———0222/208 (1.0%)2/208 (1.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Selaginella leptophylla
コケカタヒバ		—✓✓✓✓No———0333/379 (0.8%)3/387 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Selaginella limbata
アマミクラマゴケ		—✓✓✓✓No———0333/379 (0.8%)3/387 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Selaginella moellendorffii
イヌカタヒバ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		212 Mbp
7.0x		5,152
120 kbp		1333/379 (0.8%)3/387 (0.8%)2010-07-06
VU
絶滅危惧II類		Selaginella sibirica
エゾノヒモカズラ		—✓✓✓✓No———0333/379 (0.8%)3/387 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Equisetum pratense
ヤチスギナ		—✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/36 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Equisetum scirpoides
ヒメドクサ		LC✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/36 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Equisetum sylvaticum
フサスギナ		—✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/36 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Botrychium lunaria
ヒメハナワラビ		—✓✓✓✓No———0000/66 (0.0%)0/142 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Botrychium triangularifolium
ミドリハナワラビ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/142 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophioglossum namegatae
トネハナヤスリ		—✓✓✓✓No———0000/49 (0.0%)0/142 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophioglossum parvum
チャボハナヤスリ		—✓✓✓✓No———0000/49 (0.0%)0/142 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Abrodictyum boninense
ハハジマホラゴケ		—✓✓✓✓No———0000/20 (0.0%)0/417 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Didymoglossum motleyi
マメゴケシダ		—✓—✓✓No———0000/35 (0.0%)0/417 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gleichenia laevissima
カネコシダ		—✓—✓✓No———0000/13 (0.0%)0/112 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Salvinia natans
サンショウモ		LC✓✓✓✓No———0080/22 (0.0%)7/43 (16.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Marsilea quadrifolia
デンジソウ		LC✓✓✓✓No———0000/40 (0.0%)0/46 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lindsaea cambodgensis
ヒメホングウシダ		—✓✓✓✓No———0000/149 (0.0%)0/195 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lindsaea repanda
ムニンエダウチホングウシダ		—✓✓✓✓No———0000/149 (0.0%)0/195 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Adiantum ogasawarense
イワホウライシダ		—✓✓✓✓No———0252/234 (0.9%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cheilanthes argentea
ヒメウラジロ		—✓—✓✓No———0050/86 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Cheilanthes chusana
エビガラシダ		—✓✓✓✓No———0050/86 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Haplopteris ensiformis
ヒメシシラン		—✓✓✓✓No———0050/46 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pteris cadieri
カワリバアマクサシダ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pteris kidoi
キドイノモトソウ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pteris satsumana
サツマハチジョウシダ		—✓—✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Pteris yakuinsularis
ヤクシマハチジョウシダ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Microlepia obtusiloba var. obtusiloba
コウシュンシダ		—✓———No———0000/42 (0.0%)0/167 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Microlepia speluncae
オオイシカグマ		—✓✓✓✓No———0000/42 (0.0%)0/167 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium antiquum
オオタニワタリ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium coenobiale
クロガネシダ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium micantifrons
ナンカイシダ		—✓—✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium polyodon
ムニンシダ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium pseudowilfordii
オクタマシダ		—✓—✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium shimurae
テンリュウヌリトラノオ		—✓—✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asplenium tenerum
オトメシダ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Woodwardia harlandii
オオギミシダ		—✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/193 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Athyrium atkinsonii
テバコワラビ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Athyrium eremicola
ヘイケイヌワラビ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Athyrium nakanoi
ヒメホウビシダ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Athyrium palustre
サカバサトメシダ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cornopteris opaca
ナンゴクシケチシダ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Deparia coreana
コウライイヌワラビ		—✓✓✓✓No———0000/70 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Deparia longipes
ウスバシケシダ		—✓✓✓✓No———0000/70 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplazium longicarpum
シマクジャク		—✓✓✓✓No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Diplazium taiwanense
ニセシロヤマシダ		—✓✓✓✓No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thelypteris castanea
タイワンハシゴシダ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/617 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thelypteris flexilis
トサノミゾシダモドキ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/617 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypodematium crenatum subsp. fauriei
キンモウワラビ		—✓—✓✓No———0000/27 (0.0%)0/30 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acrophorus nodosus
タイワンヒメワラビ		———✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Arachniodes cavalerii
ヤクシマカナワラビ		—✓✓✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Arachniodes hekiana
シビカナワラビ		—✓✓✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Arachniodes yasu-inouei var. yasu-inouei
ハガクレカナワラビ		—————No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Ctenitis iriomotensis
コミダケシダ		VU✓✓✓✓No———0030/65 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Dryopteris insularis
ムニンベニシダ		—✓✓✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Dryopteris laeta
イワカゲワラビ		—✓—✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaphoglossum tosaense
ヒロハアツイタ		—✓✓✓✓No———0030/247 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaphoglossum yoshinagae
アツイタ		—✓✓✓✓No———0030/247 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Polystichum anomalum
コモチイノデ		—✓—✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Polystichum rigens
オニイノデ		—✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Lomariopsis boninensis
オガサワラツルキジノオ		—✓✓✓✓No———0000/66 (0.0%)0/72 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Humata repens
キクシノブ		—✓✓✓✓No———0000/66 (0.0%)0/66 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Colysis hemionitidea
タイワンクリハラン		—✓✓✓✓No———0000/74 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Loxogramme boninensis
ムニンサジラン		———✓✓No———0000/13 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neolepisorus fortunei
オオクリハラン		—✓———No———0000/7 (0.0%)0/1263 (0.0%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Alaria angusta Kjellm.
ホソバワカメ		———✓—No———0272/17 (11.8%)6/26 (23.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Avrainvillea riukiuensis Yamada
テングノハウチワ		—✓—✓—No———0000/48 (0.0%)0/52 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Batrachospermum gelatinosum (L.) DC.
カワモズク		—✓✓✓—No———0000/19 (0.0%)0/164 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Batrachospermum japonicum M.Mori
ニホンカワモズク		———✓—No———0000/19 (0.0%)0/164 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Batrachospermum turfosum Bory
ホソカワモズク　　　　　　　		—✓✓✓—No———0000/12 (0.0%)0/164 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Batrachospermum turgidum Kumano
タニガワカワモズク		—————No———0000/19 (0.0%)0/164 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Caulerpa parvifolia Harv.
ヒナイワズタ 		—✓✓✓—No———0000/90 (0.0%)0/92 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Caulerpa subserrata Okamura
キザミズタ 		—✓———No———0000/90 (0.0%)0/92 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Caulerpa taxifolia (Vahl) C.Agardh
イチイズタ 		—✓✓✓—No———0000/90 (0.0%)0/92 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Chara braunii C.C.Gmel.
シャジクモ		—✓✓✓—Yes (1)Scaffold,
Representative		1.75 Gbp
50.0x		208,426
11.8 kbp		1111/69 (1.4%)1/191 (0.5%)2018-07-13
VU
絶滅危惧II類		Chondria armata (K?tz.) Okamura
ハナヤナギ 		—✓✓✓—Yes (1)Scaffold,
—		508 Mbp
80.0x		3,185
514 kbp		1131/48 (2.1%)3/804 (0.4%)2022-01-27
VU
絶滅危惧II類		Compsopogon caeruleus (Balbis) Mont.
オオイシソウ		—✓✓✓—No———0000/2 (0.0%)0/4 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cymopolia vanbosseae Solms-Laubach
ウスガサネ 		—✓✓✓—No———0000/2 (0.0%)0/14 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Dichotomosiphon tuberosus (A.Braun ex K?tz.) Ernst
チョウチンミドロ		—✓✓✓—No———0000/1 (0.0%)0/52 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ganonema farinosum (J.V.Lamour.) K.C.Fan & Y.C.Wang
ケコナハダ 		—✓✓✓—No———0000/6 (0.0%)0/81 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Prasiola japonica Yatabe
カワノリ		—✓———No———0111/41 (2.4%)1/64 (1.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Sargassum pinnatifidum Harv.
カラクサモク		—————No———0000/190 (0.0%)0/319 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Sargassum polycystum C.Agardh
コバモク 		—✓✓✓—No———0000/190 (0.0%)0/319 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thorea okadae Yamada
チスジノリ		—✓———No———0000/16 (0.0%)0/24 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Udotea argentea Zanardini
オオハゴロモ		—✓✓✓—No———0010/30 (0.0%)1/204 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Vaucheria longicaulis Hoppaugh
ウミフシナシミドロ		—✓✓✓—No———0111/37 (2.7%)1/38 (2.6%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Acrobolbus ciliatus (Mitt.) Schiffn.
チチブイチョウゴケ		—✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/47 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Acroporium secundum (Reinw. & Hornsch.) M.Fleisch.
シマフデノホゴケ		—✓—✓✓No———0000/19 (0.0%)0/100 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aerobryopsis parisii (Cardot) Broth.
ヒカゲノカズラモドキ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Anastrepta orcadensis (Hook.) Schiffn.
タチクモマゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/54 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Andreaea nivalis Hook.
ガッサンクロゴケ		—✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/25 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Aneura hirsuta Furuki
ケミドリゼニゴケ		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/110 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Archilejeunea amakawana Inoue
アマカワヒメゴヘイゴケ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Asterella cruciata (Steph.) Horik.
オオサイハイゴケ		—✓—✓✓No———0111/32 (3.1%)1/59 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Bazzania ovistipula (Steph.) Abeyw.
カネマルムチゴケ		—✓—✓✓No———0000/39 (0.0%)0/191 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Brachydontium trichodes (F.Weber) Milde
キヌシッポゴケモドキ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/28 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Bryochenea vestitissima (Besch.) Touw
スギバシノブゴケ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Callicostella papillata (Müll.Hal.) Mitt.
サオヒメゴケ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/49 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Calycularia laxa Lindb. & Arnell
ミヤマミズゼニゴケ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Calymperes boninense Z.Iwats.
オガサワラカタシロゴケ		——✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/156 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Calypogeia aeruginosa Mitt.
マルバホラゴケモドキ		—✓—✓✓No———0000/39 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Calyptothecium philippinense Broth.
ミミヒラゴケ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/42 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Campylopodium medium (Duby) Giese & J.-P.Frahm
ヘビゴケ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/156 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Campylopus fragilis (Brid.) Bruch & Schimp.
マユハケゴケ		—✓✓✓✓No———0000/81 (0.0%)0/147 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Campylostelium brachycarpum (Nog.) Z.Iwats., Yuk.Tateishi & Tad.Suzuki
ヤマトハクチョウゴケ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/24 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cephaloziella elachista (Gottsche & Rabenh.) Schiffn.
ケスジヤバネゴケ		—✓✓✓✓No———0000/32 (0.0%)0/57 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cheilolejeunea ryukyuensis Mizut.
リュウキュウシゲリゴケ		—✓—✓✓No———0000/73 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clastobryopsis robusta (Broth.) M.Fleisch.
オオタマコモチイトゴケ		—✓—✓—No———0000/19 (0.0%)0/127 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clastobryum glabrescens (Z.Iwats.) B.C.Tan, Z.Iwats. & D.H.Norris
ミスジヤバネゴケ		—✓—✓✓No———0000/7 (0.0%)0/127 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clevea pusilla (Steph.) Rubasinghe & D.G.Long
チチブゼニゴケ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/8 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cololejeunea inflata Steph.
オオシマヨウジョウゴケ		———✓✓No———0000/84 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cololejeunea schmidtii Steph.
ヤマトケクサリゴケ		—✓—✓✓No———0000/84 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cololejeunea subfloccosa Mizut.
カギヨウジョウゴケ		———✓✓No———0000/84 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cololejeunea subminutilobula Mizut.
オガサワラキララゴケ		———✓✓No———0000/84 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Colura inuii Horik.
イヌイムシトリゴケ		———✓✓No———0000/31 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Colura meijeri Jovet-Ast
ボウズムシトリゴケ		—✓—✓✓No———0000/31 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cryptocoleopsis imbricata Amakawa
エゾヒメソロイゴケ		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/77 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cylindrocolea tagawae (N.Kitag) R.M.Schust.
タガワヤバネゴケ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/57 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cyrtomnium hymenophylloides (Huebener) T.J.Kop.
シノブチョウチンゴケ		—✓✓✓✓No———0010/2 (0.0%)1/134 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Dendrocyathophorum decolyi (M.Fleisch.) Kruijer
キダチクジャクゴケ		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Desmatodon latifolius (Hedw.) Brid.
ハリエゾネジレゴケ		—✓—✓✓No———0020/31 (0.0%)2/585 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Diphyscium kashmirense (H.Rob.) Magombo
カシミールクマノゴケ		———✓✓No———0000/11 (0.0%)0/14 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Distichophyllum osterwaldii M.Fleisch.
フチナシツガゴケ		—✓✓✓✓No———0000/43 (0.0%)0/102 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Echinophyllum sachalinense (Lindb.) T.J.O'Brien
カラフトシノブゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/4 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Entodon conchophyllus Cardot
オオミツヤゴケ		——✓✓✓No———0000/23 (0.0%)0/30 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eocalypogeia quelpaertensis (S.Hatt. & Inoue) R.M.Schust.
サイシュウホラゴケモドキ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/44 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Erpodium glaucum (Wilson) I.G.Stone var. trichophyllum (Ångstr.) I.G.Stone
アオシマヒメシワゴケ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Eucladium verticillatum (With.) Bruch & Schimp.
ダンダンゴケ		—✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)2/585 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Exostratum blumii (Hampe) L.T.Ellis
シラガゴケモドキ		—✓✓——No———0000/1 (0.0%)0/156 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Fissidens geppii M.Fleisch.
ジョウレンホウオウゴケ		—✓—✓✓No———0000/126 (0.0%)0/126 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Fissidens javanicus Dozy & Molk.
ジャバホウオウゴケ		—✓✓✓✓No———0000/126 (0.0%)0/126 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Folioceros appendiculatus (Steph.) J.Haseg.
ミドリツノゴケ		—✓—✓✓No———0010/8 (0.0%)1/48 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Fontinalis antipyretica Hedw.
クロカワゴケ		—✓✓✓✓No———0000/17 (0.0%)0/22 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Fontinalis hypnoides Hartm.
カワゴケ		—✓✓✓✓No———0000/17 (0.0%)0/22 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Frullania gaudichaudii (Nees & Mont.) Nees & Mont.
キヤスデゴケ		—✓—✓✓No———0000/189 (0.0%)0/189 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Frullania iriomotensis S.Hatt.
イリオモテヤスデゴケ		—✓—✓✓No———0000/189 (0.0%)0/189 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Frullania repandistipula Sande Lac.
イボヤスデゴケ		—✓—✓✓No———0000/189 (0.0%)0/189 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Frullania sackawana Steph.
サカワヤスデゴケ		———✓✓No———0000/189 (0.0%)0/189 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gammiella ceylonensis (Broth.) B.C.Tan & W.R.Buck
ヒロハコモチイトゴケ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/127 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Garovaglia elegans (Dozy & Molk.) Bosch & Sande Lac.
カクレゴケ		—✓✓✓✓No———0000/11 (0.0%)0/35 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gollania japonica (Cardot) Ando & Higuchi
サジバラッコゴケ		—✓—✓✓No———0000/9 (0.0%)0/129 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Gymnostomiella longinervis Broth.
フガゴケ		—✓—✓✓No———0020/3 (0.0%)2/585 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Haplohymenium flagelliforme L.I.Savicz　
ムチエダイトゴケ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/18 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Heteroscyphus aselliformis (Reinw., Blume & Nees) Schiffn.
アマノウロコゴケ		—✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/110 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypnodendron vitiense Mitt.
キダチゴケ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/27 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Iwatsukia jishibae (Steph.) N.Kitag.
イイシバヤバネゴケ		—✓—✓✓No———0000/21 (0.0%)0/60 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Leiocolea igiana (S.Hatt.) Inoue
イギイチョウゴケ		———✓✓No———0000/00/47 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lejeunea sordida (Nees) Nees
オオハラバクサリゴケ		—✓✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Leucophanes angustifolium Renauld & Cardot
ニセハブタエゴケ		—✓✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/156 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Marsupidium knightii Mitt.
ケハネゴケモドキ		—✓—✓✓No———0000/25 (0.0%)0/47 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Mastigophora diclados (F.Weber) Nees
オオサワラゴケ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Mielichhoferia japonica Besch.
ホソバゴケ		—✓✓✓✓No———0010/8 (0.0%)1/134 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Mielichhoferia sasaokae Broth.
コシノシンジゴケ		———✓✓No———0010/8 (0.0%)1/134 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Moerckia blyttii (Mørck) Brockm.
チヂレヤハズゴケ		—✓—✓✓No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Monosolenium tenerum Griff.
ヤワラゼニゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Myurella sibirica (Müll.Hal.) Reimers
レイシゴケ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/84 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Nardia compressa (Hook.) Gray
ヒラウロコゴケ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/76 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Neobarbella comes (Griff.) Nog.
イヌコクサゴケ		—✓—✓✓No———0010/1 (0.0%)1/40 (2.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Neoorthocaulis floerkei (F.Weber & D.Mohr) L.Söderstr., De Roo & Hedd.
ミツデモミジゴケ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/54 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Nowellia aciliata (P.C.Chen & P.C.Wu) Mizut.
フクレヤバネゴケ		——✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/60 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oedicladium fragile Cardot
カタナワゴケ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/21 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oedicladium rufescens (Reinw. & Hornsch.) Mitt. var. yakushimense (Sakurai) Z.Iwats.
ヤクシマナワゴケ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/21 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Oedipodium griffithianum (Dicks.) Schwägr.
イシヅチゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Orthothecium rufescens (Brid.) Schimp.
ホソバツヤゴケ（タチミツヤゴケ）		—✓✓✓✓No———0000/12 (0.0%)0/84 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Papillidiopsis macrosticta (Broth. & Paris) W.R.Buck & B.C.Tan
ハシボソゴケ		—✓—✓✓No———0000/5 (0.0%)0/100 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinnatella anacamptolepis (Müll.Hal.) Broth.
モミノキゴケ		—✓—✓✓No———0010/13 (0.0%)1/140 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Plagiobryum japonicum Nog.
ヒョウタンハリガネゴケ		———✓✓No———0010/8 (0.0%)1/131 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Plagiochila fordiana Steph.
サケバキハネゴケ（ムニンハネゴケ）		——✓✓✓No———0000/242 (0.0%)0/263 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Plagiochilion theriotanum (Steph.) Inoue
ハットリムカイバハネゴケ		———✓—No———0000/00/263 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Plagiomnium tezukae (Sakurai) T.J.Kop.
テヅカチョウチンゴケ（アズミチョウチンゴケ）		—✓✓✓✓No———0010/38 (0.0%)1/134 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Plagiothecium neckeroideum Bruch & Schimp.
オオサナダゴケ		—✓✓✓✓No———0000/45 (0.0%)0/84 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudobarbella laosiensis (Broth. & Paris) Nog.
トサノタスキゴケ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/62 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Rhodobryum ontariense (Kindb.) Kindb.
カサゴケモドキ		—✓✓✓✓No———0010/7 (0.0%)1/131 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sauteria spongiosa (Kashyap) S.Hatt.
ジンチョウゴケ（タカネゼニゴケ，ヤツガタケジンチョウゴケ）		LC✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/8 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Scapania crassiretis Bryhn
ツバサヒシャクゴケ		—✓✓✓✓No———0000/71 (0.0%)0/104 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Scapania ornithopoides (With.) Waddell
ムカシヒシャクゴケ		——✓✓✓No———0000/71 (0.0%)0/104 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Seligeria donniana (Sm.) Müll.Hal.
ハナシキヌシッポゴケ		—✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/28 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Solenostoma handelii (Schiffn.) Müll.Frib.
ハンデルソロイゴケ		—✓—✓✓No———0000/70 (0.0%)0/77 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Stenolejeunea apiculata (Sande Lac.) R.M.Schust.
ツメクサリゴケ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Symphyodon perrottetii Mont.
シダレウニゴケ		———✓✓No———0000/19 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Syrrhopodon tosaensis Cardot
イサワゴケ		—✓—✓✓No———0000/40 (0.0%)0/156 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Taiwanobryum speciosum Nog.
タイワントラノオゴケ		—✓✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/29 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Targionia hypophylla L.
ハマグリゼニゴケ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Thysananthus flavescens (S.Hatt.) Gradst.
ヒメゴヘイゴケ		———✓✓No———0000/26 (0.0%)0/716 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Timmia megapolitana Hedw.
ミヤマクサスギゴケ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/6 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Ulota eurystoma Nog.
ヒログチキンモウゴケ		———✓✓No———0111/36 (2.8%)1/291 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Ulota perbreviseta Dixon & Sakurai
イブキキンモウゴケ		———✓✓No———0111/36 (2.8%)1/291 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Zoopsis liukiuensis Horik.
ミジンコゴケ		—✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/191 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Zygodon viridissimus (Dicks.) Brid.
カメゴケモドキ		—✓✓✓✓No———0010/22 (0.0%)1/291 (0.3%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Brigantiaea nipponica (M.Satô) Hafellner
オオサビイボゴケ		—✓—✓—No———0000/11 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Flavocetraria cucullata (Bellardi) Kärnefelt & A.Thell
ウスキエイランタイ		—✓✓✓✓No———00160/4 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Flavopunctelia soredica (Nyl.) Hale
ヒメキウメノキゴケ		—✓✓✓—No———00160/6 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Leioderma sorediatum D.J.Galloway & P.M.Jørg.
コフキニセハナビラゴケ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/144 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Leiorreuma yakushimense (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw.
ヤクシマモジゴケ		———✓✓No———0030/3 (0.0%)3/838 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Leptogium palmatum (Huds.) Mont
テガタアオキノリ 		—✓—✓✓No———0000/266 (0.0%)0/352 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lobaria kazawaënsis (Asahina) Yoshim.
トゲカブトゴケ		—✓—✓—No———0131/77 (1.3%)3/586 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Menegazzia squamatica K.H.Moon et al.
ウスキクダチイ		———✓✓No———00160/18 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Oropogon orientalis (Gyeln.) Essl.
ヨシノミヤマクグラ		—✓—✓—No———00160/40 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Parmelia erumpens Kurok.
アワフキカラクサゴケ		—✓—✓✓No———01161/52 (1.9%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Parmotrema eciliatum (Nyl.) Hale
トゲナシウメノキゴケ		——✓✓✓No———00160/126 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Peltigera nigripunctata Bitter
コヒラミツメゴケ		—✓—✓—No———0111/240 (0.4%)1/247 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Peltigera venosa (L.) Hoffm.
ヒメツメゴケ		—✓✓✓✓No———0111/240 (0.4%)1/247 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Platygramme platyloma (Müll.Arg.) M.Nakan. & Kashiw.
フチヒロモジゴケ		———✓✓No———0030/10 (0.0%)3/838 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Platygramme pseudomontagnei (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw.
ニセユモジゴケ		———✓✓No———0030/10 (0.0%)3/838 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Platygramme pudica (Mont. & Bosch) M.Nakan. & Kashiw.
ウスカワフチヒロモジゴケ		———✓✓No———0030/10 (0.0%)3/838 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Sticta limbata (Sm.) Ach.
コフキセンスゴケ		—✓✓✓✓No———0131/319 (0.3%)3/586 (0.5%)—
VU
絶滅危惧II類		Umbilicaria deusta (L.) Baumg.
トゲイワタケ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		40.9 Mbp
353.0x		48
1.67 Mbp		110589/88 (10.2%)10/104 (9.6%)2022-04-29
VU
絶滅危惧II類		Usnea dasopoga (Ach.) Nyl.
ナガヒゲサルオガセ		—✓✓✓—No———01161/234 (0.4%)11/1662 (0.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Usnocetraria kurokawae (Shibuichi & Yoshida) M.J. Lai & J.C. Wei
クロカワアワビゴケ		———✓✓No———00160/1 (0.0%)11/1662 (0.7%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Albatrellus yasudae (Lloyd) Pouzar
ヌメリアイタケ		——✓✓✓No———0222/32 (6.2%)2/48 (4.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Allescheriella crocea (Mont.) S.Hughes
タブノキキハダカビ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Chorioactis geaster (Peck) Kupfer ex Eckblad
キリノミタケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/9 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Cordyceps atrovirens Kobayasi & Shimizu
ミドリクチキムシタケ		—✓—✓✓No———03221411/237 (4.6%)85/1177 (7.2%)—
VU
絶滅危惧II類		Cordyceps pleuricapitata Kobayasi & Shimizu
ウスキタンポセミタケ		—✓✓✓✓No———0614489/239 (3.8%)43/911 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Cordyceps ramosipulvinata Kobayasi & Shimizu
トビシマセミタケ		—————No———0614489/239 (3.8%)43/911 (4.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Desarmillaria ectypa (Fr.) R.A. Koch & Aime
ヤチヒロヒダタケ		—✓✓✓✓Yes (1)Contig,
Representative		40.6 Mbp
155.5x		33
4.05 Mbp		12442/3 (66.7%)28/479 (5.8%)2023-07-05
VU
絶滅危惧II類		Elaphocordyceps jezoënsis (S.Imai) G.H.Sung, J.M.Sung & Spatafora
エゾハナヤスリタケ		—✓—✓✓No———0297817/127 (13.4%)38/667 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Elaphocordyceps subsessilis (Petch) G.H.Sung, J.M.Sung & Spatafora
クビナガクチキムシタケ		—✓—✓✓Yes (8)Contig,
Representative		31.7 Mbp
92.3x		15
5.29 Mbp		8297817/127 (13.4%)38/667 (5.7%)2013-07-10
VU
絶滅危惧II類		Elaphocordyceps valvatistipitata (Kobayasi) G.H.Sung, J.M.Sung & Spatafora
エリアシタンポタケ		———✓✓No———0297817/127 (13.4%)38/667 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Galiella japonica (Yasuda) Y.Otani
キツネノサカズキ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/142 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Hypocrea cerebriformis Berk.
オオボタンタケ		—✓—✓✓No———014716443/2358 (1.8%)56/2881 (1.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Inonotus cuticularis (Bull.) P.Karst.
アラゲカワウソタケ		—✓✓✓✓No———08403/77 (3.9%)20/1188 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Inonotus pachyphloeus (Pat.) T. Wagner & M. Fisch.
ヤエヤマキコブタケ		—✓✓✓✓No———08403/77 (3.9%)20/1188 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Inonotus patouillardii (Rick) Imazeki
ナンバンオオカワウソタケ		—✓✓✓✓No———08403/77 (3.9%)20/1188 (1.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Lycoperdon yasudae (Lloyd) Kreisel
トゲホコリタケ		———✓✓No———0020/106 (0.0%)1/251 (0.4%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophiocordyceps coccidiicola (Kobayasi) G.H.Sung, J.M.Sung, Hywel-Jones & Spatafora
カイガラムシツブタケ		—✓—✓✓No———0187811/265 (4.2%)38/667 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Ophiocordyceps odonatae (Kobayasi) G.H.Sung, J.M.Sung, Hywel-Jones & Spatafora
タンポヤンマタケ		—✓✓✓✓No———0187811/265 (4.2%)38/667 (5.7%)—
VU
絶滅危惧II類		Phallus rubicundus (Bosc) Fr.
アカダマノオオタイマツ		—✓✓✓✓No———0131/49 (2.0%)3/140 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Pyrofomes albomarginatus (Zipp. ex Lev.) Ryvarden
ダイダイサルノコシカケ		—✓✓✓✓No———00740/8 (0.0%)47/1830 (2.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Ramaria campestris (K. Yokoy. & Sagara) R.H.Petersen
ササナバ		—✓—✓✓No———0050/59 (0.0%)5/631 (0.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Sarcodon imbricatus (L.) P.Karst.
シシタケ		—✓✓✓✓No———0252/67 (3.0%)5/1555 (0.3%)—
VU
絶滅危惧II類		Simblum sphaerocephalum Schltdl.
コナガエノアカカゴタケ		—✓—✓✓No———0030/7 (0.0%)3/140 (2.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Tulostoma squamosum Pers.
ウロコケシボウズタケ		—✓✓✓✓No———00410/124 (0.0%)27/2765 (1.0%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Plectropomus laevis
コクハンアラ		LC✓✓✓✓No———03261/9 (11.1%)21/681 (3.1%)—
VU
絶滅危惧II類		Acanthopagrus chinshira
オキナワキチヌ		NT✓✓✓✓No———04151/26 (3.8%)8/164 (4.9%)—

Corals
サンゴ類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Acropora pruinosa
エダミドリイシ		DD✓✓✓✓No———0324520/380 (5.3%)29/517 (5.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Porites okinawensis
オキナワハマサンゴ		VU✓✓✓✓No———014148/387 (2.1%)8/450 (1.8%)—
VU
絶滅危惧II類		Leptoseris amitoriensis
アミトリセンベイサンゴ		NT✓✓✓✓No———0010/49 (0.0%)1/161 (0.6%)—
VU
絶滅危惧II類		Trachyphyllia geoffroyi
ヒユサンゴ		NT✓✓✓✓No———0080/1 (0.0%)5/171 (2.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Catalaphyllia jardinei
オオナガレハナサンゴ		VU✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		651 Mbp
78.9x		70,828
20.6 kbp		1121/1 (100.0%)2/104 (1.9%)2022-06-07

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Alpheus fujitai
フジタアシボソテッポウエビ		—✓—✓✓No———0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Upogebia sakaii
コブシアナジャコ		—✓—✓✓No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Lissoporcellana flagellicola
ムチヤギカクレカニダマシ		———✓✓No———00000—
VU
絶滅危惧II類		Neoliomera cerasinus
クラヤミヒラオウギガニ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/606 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Clistocoeloma sinense
ウモレベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/272 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pseudopinnixa carinata
ウモレマメガニ		—✓—✓✓No———0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Sestrostoma balssi
オオヒメアカイソガニ		———✓✓No———0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)—
VU
絶滅危惧II類		Cleistostoma dilatatum
アリアケガニ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/12 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinnixa balanoglossana
ギボシマメガニ		———✓✓No———0000/29 (0.0%)0/172 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinnotheres bidentatus
フタハピンノ		———✓✓No———0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)—
VU
絶滅危惧II類		Pinnotheres cyclinus
マルピンノ		———✓✓No———0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
VU
絶滅危惧II類		Branchiostoma japonicum
ヒガシナメクジウオ		—✓✓✓✓No———016175/20 (25.0%)6/26 (23.1%)—