Genome sequence data availability
for the Japanese Red List

Updated on 2026-01-05

This page shows only entries with the "NT" conservation status. This table is also available in TSV format.

Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Crocidura shantungensis
コジネズミ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———02182/293 (0.7%)11/528 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Crocidura watasei
ワタセジネズミ		LC✓✓✓✓—/——/—No———02182/293 (0.7%)11/528 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Sorex hosonoi
アズミトガリネズミ		LC✓✓✓✓—/——/—No———011186/76 (7.9%)11/528 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Sorex shinto shikokensis
シコクトガリネズミ		——✓✓✓—/——/—No———011186/76 (7.9%)11/528 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Euroscaptor mizura
ミズラモグラ		LC✓—✓✓—/——/—No———00100/1 (0.0%)8/107 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Mogera tokudae
サドモグラ		NT✓✓✓✓—/——/—No———00100/10 (0.0%)8/107 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Myodes rex montanus
ミヤマムクゲネズミ		——————/——/—No———00950/3 (0.0%)48/1133 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Myodes rex rex
リシリムクゲネズミ		——————/——/—No———00950/3 (0.0%)48/1133 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Ochotona hyperborea yesoensis
エゾナキウサギ		——✓✓✓—/——/—No———0773/68 (4.4%)3/69 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Lepus brachyurus lyoni
サドノウサギ		——✓✓✓—/——/—No———013238/98 (8.2%)11/141 (7.8%)—
NT
準絶滅危惧		Martes melampus tsuensis
ツシマテン		—✓✓✓✓—/——/—No———09734/9 (44.4%)23/73 (31.5%)—
NT
準絶滅危惧		Martes zibellina brachyura
エゾクロテン		——✓✓✓—/——/—No———29734/9 (44.4%)23/73 (31.5%)—
NT
準絶滅危惧		Mustela erminea nippon
ホンドオコジョ		——✓✓✓—/——/—No———440738/18 (44.4%)23/73 (31.5%)—
NT
準絶滅危惧		Mustela erminea orientalis
エゾオコジョ		——✓✓✓—/——/—No———440738/18 (44.4%)23/73 (31.5%)—
NT
準絶滅危惧		Mustela nivalis namiyei
ニホンイイズナ（本州亜種）		——✓✓✓—/——/—No———540738/18 (44.4%)23/73 (31.5%)—
NT
準絶滅危惧		Phoca vitulina
ゼニガタアザラシ		LC✓✓✓✓✓/12✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.36 Gbp
45		21,601
284 kbp		11201/4 (25.0%)13/20 (65.0%)2019-02-11
NT
準絶滅危惧		Eumetopias jubatus
トド		NT✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (3)Scaffold,
Reference		2.42 Gbp
34.65		24,746
242 kbp		33131/1 (100.0%)5/16 (31.2%)2019-01-15

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Syrmaticus soemmerringii ijimae
コシジロヤマドリ		—✓✓✓✓✓/10✓/—No———02962/5 (40.0%)31/207 (15.0%)—
NT
準絶滅危惧		Syrmaticus soemmerringii soemmerringii
アカヤマドリ		——✓✓✓—/——/—No———02962/5 (40.0%)31/207 (15.0%)—
NT
準絶滅危惧		Anser albifrons albifrons
マガン		—✓✓✓✓—/——/—No———32722610/16 (62.5%)118/213 (55.4%)—
NT
準絶滅危惧		Anser fabalis middendorffii
オオヒシクイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———22722610/16 (62.5%)118/213 (55.4%)—
NT
準絶滅危惧		Columba janthina janthina
カラスバト		—✓✓✓✓—/——/—No———125404/38 (10.5%)12/354 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Oceanodroma matsudairae
クロウミツバメ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———0202/16 (12.5%)0—
NT
準絶滅危惧		Oceanodroma tristrami
オーストンウミツバメ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0202/16 (12.5%)0—
NT
準絶滅危惧		Egretta eulophotes
カラシラサギ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———01121/12 (8.3%)9/68 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Egretta intermedia intermedia
チュウサギ		———✓✓—/——/—No———01121/12 (8.3%)9/68 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Ixobrychus sinensis sinensis
ヨシゴイ		——————/——/—No———00120/10 (0.0%)9/68 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Porzana fusca erythrothorax
ヒクイナ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———02232/9 (22.2%)15/145 (10.3%)—
NT
準絶滅危惧		Caprimulgus indicus jotaka
ヨタカ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0361/30 (3.3%)4/74 (5.4%)—
NT
準絶滅危惧		Calidris alpina
ハマシギ		NT✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.27 Gbp
48		98,812
98.5 kbp		1205714/24 (58.3%)44/89 (49.4%)2023-11-14
NT
準絶滅危惧		Gallinago hardwickii
オオジシギ		NT✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.14 Gbp
105		119,495
25.4 kbp		1115711/13 (84.6%)44/89 (49.4%)2022-11-10
NT
準絶滅危惧		Larus schistisagus
オオセグロカモメ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0224211/29 (37.9%)26/105 (24.8%)—
NT
準絶滅危惧		Pandion haliaetus haliaetus
ミサゴ		—✓✓✓✓—/——/—No———2221/2 (50.0%)1/2 (50.0%)—
NT
準絶滅危惧		Accipiter gentilis fujiyamae
オオタカ		—✓—✓✓✓/——/—No———561792/3 (66.7%)145/275 (52.7%)—
NT
準絶滅危惧		Accipiter nisus nisosimilis
ハイタカ		—✓✓✓✓—/——/—No———22417922/43 (51.2%)145/275 (52.7%)—
NT
準絶滅危惧		Pernis ptilorhynchus orientalis
ハチクマ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———021792/5 (40.0%)145/275 (52.7%)—
NT
準絶滅危惧		Poecile varius olivaceus
オリイヤマガラ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00190/5 (0.0%)9/83 (10.8%)—
NT
準絶滅危惧		Locustella lanceolata
マキノセンニュウ		LC✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.19 Gbp
215		97,266
134 kbp		1121/22 (4.5%)2/62 (3.2%)2024-12-06
NT
準絶滅危惧		Emberiza sulphurata
ノジコ		LC✓✓✓✓✓/1—/✓No———08977/44 (15.9%)53/291 (18.2%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Mauremys japonica
ニホンイシガメ		NT✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0382/20 (10.0%)6/107 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Gekko shibatai
タカラヤモリ		VU✓✓✓✓—/——/—No———03133/99 (3.0%)11/1836 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Gekko sp. 1
オキナワヤモリ		——————/——/—No———03133/99 (3.0%)11/1836 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Gekko tawaensis
タワヤモリ		LC✓✓✓✓—/——/—No———03133/99 (3.0%)11/1836 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Diploderma polygonatum ishigakiense
サキシマキノボリトカゲ		——✓✓✓—/——/—No———00210/46 (0.0%)17/590 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Cryptoblepharus nigropunctatus
オガサワラトカゲ		NT✓✓✓✓—/——/—No———01191/53 (1.9%)16/1613 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Plestiodon oshimensis
オオシマトカゲ		NT✓✓✓✓—/——/—No———02191/53 (1.9%)16/1613 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Plestiodon stimpsonii
イシガキトカゲ		NT✓✓✓✓—/——/—No———02191/53 (1.9%)16/1613 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Takydromus amurensis
アムールカナヘビ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00480/24 (0.0%)25/410 (6.1%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclophiops herminae
サキシマアオヘビ		LC—✓✓✓—/——/—No———00750/059/1049 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Dinodon rufozonatum rufozonatum
アカマダラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———02752/71 (2.8%)59/1049 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Lycodon ruhstrati multifasciatus
サキシマバイカダ		LC—✓✓✓—/——/—No———02752/71 (2.8%)59/1049 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pareas iwasakii
イワサキセダカヘビ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0111/41 (2.4%)1/48 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Achalinus werneri
アマミタカチホヘビ		NT—✓✓✓—/——/—No———0000/36 (0.0%)0/46 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sinomicrurus japonicus boettgeri
ハイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00340/15 (0.0%)26/349 (7.4%)—
NT
準絶滅危惧		Sinomicrurus japonicus japonicus
ヒャン		—✓—✓——/——/—No———00340/15 (0.0%)26/349 (7.4%)—
NT
準絶滅危惧		Protobothrops tokarensis
トカラハブ		VU✓✓✓✓✓/—✓/✓No———02492/17 (11.8%)37/421 (8.8%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Hynobius hirosei
イシヅチサンショウウオ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hynobius kimurae
ヒダサンショウウオ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hynobius lichenatus
トウホクサンショウウオ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hynobius nigrescens
クロサンショウウオ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hynobius tsuensis
ツシマサンショウウオ		NT✓✓✓✓✓/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Onychodactylus fuscus
タダミハコネサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/13 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Onychodactylus intermedius
バンダイハコネサンショウウオ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0000/13 (0.0%)0/132 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cynops ensicauda
シリケンイモリ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———00100/6 (0.0%)5/171 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Cynops pyrrhogaster
アカハライモリ		NT✓✓✓✓✓/1—/—No———00100/6 (0.0%)5/171 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Bufo gargarizans miyakonis
ミヤコヒキガエル		—✓✓✓✓—/——/—No———13172/37 (5.4%)13/871 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Odorrana supranarina
オオハナサキガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———00240/100 (0.0%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pelophylax nigromaculatus
トノサマガエル		LC✓✓✓✓✓/1✓/✓No———02241/118 (0.8%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pelophylax porosus porosus
トウキョウダルマガエル		—✓✓———/——/—No———02241/118 (0.8%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana kobai
アマミアカガエル		NT✓✓✓✓—/——/—No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana tagoi okiensis
オキタゴガエル		—✓—✓✓—/——/—No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana tagoi yakushimensis
ヤクシマタゴガエル		—✓—✓✓—/——/—No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana tsushimensis
ツシマアカガエル		NT✓✓✓✓—/——/—No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana uenoi
チョウセンヤマアカガエル		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rana ulma
リュウキュウアカガエル		VU✓✓✓✓—/——/—No———06244/90 (4.4%)15/766 (2.0%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Lethenteron kessleri
シベリアヤツメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———03232/14 (14.3%)9/481 (1.9%)—
NT
準絶滅危惧		Phoxinus perenurus sachalinensis
ヤチウグイ		—✓—✓—✓/10✓/✓No———03851/6 (16.7%)44/1268 (3.5%)—
NT
準絶滅危惧		Sarcocheilichthys variegatus variegatus
カワヒガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00220/16 (0.0%)13/353 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tanakia lanceolata
ヤリタナゴ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0030/7 (0.0%)3/111 (2.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tanakia limbata
アブラボテ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0030/7 (0.0%)3/111 (2.7%)—
NT
準絶滅危惧		Misgurnus anguillicaudatus
ドジョウ		LC✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (7)Chromosome,
Reference		1.12 Gbp
30		170
41.5 Mbp		78122/48 (4.2%)6/464 (1.3%)2024-01-25
NT
準絶滅危惧		Silurus lithophilus
イワトコナマズ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———08115/18 (27.8%)7/75 (9.3%)—
NT
準絶滅危惧		Hypomesus olidus
イシカリワカサギ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———03112/6 (33.3%)6/14 (42.9%)—
NT
準絶滅危惧		Oncorhynchus masou ishikawae
サツキマス（アマゴ）		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
—		2.42 Gbp
18		70,318
128 kbp		427789/47 (19.1%)28/691 (4.1%)2023-09-10
NT
準絶滅危惧		Oncorhynchus masou masou
サクラマス（ヤマメ）		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		2.66 Gbp
33		21,300
2.47 Mbp		427789/47 (19.1%)28/691 (4.1%)2024-03-01
NT
準絶滅危惧		Oncorhynchus sp.
ビワマス		—✓———✓/——/—No———027789/47 (19.1%)28/691 (4.1%)—
NT
準絶滅危惧		Pungitius sp. 2
トミヨ属汽水型		——————/——/—No———05202/46 (4.3%)6/59 (10.2%)—
NT
準絶滅危惧		Hyporhamphus intermedius
クルメサヨリ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		883 Mbp
32.87		887
3.98 Mbp		1342/50 (4.0%)3/79 (3.8%)2025-05-08
NT
準絶滅危惧		Zenarchopterus dunckeri
コモチサヨリ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0111/20 (5.0%)1/89 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Cottus pollux
カジカ大卵型		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———03102/155 (1.3%)6/354 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Acentrogobius audax
ニセツムギハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/5 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Acentrogobius caninus
ホクロハゼ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00440/23 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Acentrogobius suluensis
ホホグロスジハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/23 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Amblygobius linki
ワカケサラサハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00440/15 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bunaka gyrinoides
オウギハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00190/2 (0.0%)14/291 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Eugnathogobius mindora
カブキハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00440/10 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Eutaeniichthys gilli
ヒモハゼ		—✓✓✓✓—/——/—No———00440/1 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Glossogobius circumspectus
スダレウロハゼ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00440/77 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnogobius castaneus
ジュズカケハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/25 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Luciogobius fluvialis
ナガレミミズハゼ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00440/43 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Luciogobius fonticola
ユウスイミミズハゼ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00440/43 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Luciogobius pallidus
イドミミズハゼ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00440/43 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Periophthalmus modestus
トビハゼ		—✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		854 Mbp
95		4,142
576 kbp		16443/20 (15.0%)31/2626 (1.2%)2021-08-13
NT
準絶滅危惧		Rhinogobius telma
トウカイヨシノボリ		—✓✓✓✓—/——/—No———03442/138 (1.4%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Rhinogobius tyoni
シマヒレヨシノボリ		—✓✓✓✓—/——/—No———03442/138 (1.4%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Silhouettea dotui
シラヌイハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00440/6 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Silhouettea sp.
ニセシラヌイハゼ		—✓————/——/—No———00440/6 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Tridentiger barbatus
ショウキハゼ		—✓—✓✓✓/10✓/✓No———00440/9 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Tridentiger nudicervicus
シロチチブ		—✓—✓✓✓/——/—No———00440/9 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobitrichinotus radiocularis
ナミノコハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00000—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Oligoneuriella rhenana
ヒトリガカゲロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/3 (0.0%)0/47 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chiusanophlebia asahinai
リュウキュウトビイロカゲロウ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Ephoron eophilum
アカツキシロカゲロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/13 (0.0%)0/21 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ephoron limnobium
ビワコシロカゲロウ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/13 (0.0%)0/21 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Agriocnemis pygmaea
ヒメイトトンボ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0090/26 (0.0%)4/1103 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ceriagrion nipponicum
ベニイトトンボ		LC✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0291/31 (3.2%)4/1103 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ischnura aurora aurora
キバライトトンボ		——✓———/——/—No———0592/111 (1.8%)4/1103 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Mortonagrion selenion
モートンイトトンボ		NT✓✓✓✓✓/——/—No———0090/10 (0.0%)4/1103 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Platycnemis foliacea sasakii
グンバイトンボ		—✓—✓✓—/1—/—No———0221/9 (11.1%)1/178 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Calopteryx japonica
アオハダトンボ		LC✓✓✓✓✓/2—/—No———0161/57 (1.8%)4/182 (2.2%)—
NT
準絶滅危惧		Asiagomphus amamiensis amamiensis
アマミサナエ		——✓✓——/——/—No———0060/9 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Asiagomphus amamiensis okinawanus
オキナワサナエ		——✓✓——/——/—No———0060/9 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Asiagomphus pryeri
キイロサナエ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0060/9 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Asiagomphus yayeyamensis
ヤエヤマサナエ		EN✓✓✓✓✓/1—/—No———0060/9 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Trigomphus citimus tabei
タベサナエ		——✓———/——/—No———0000/9 (0.0%)0/534 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trigomphus interruptus
フタスジサナエ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/9 (0.0%)0/534 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trigomphus ogumai
オグマサナエ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/9 (0.0%)0/534 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chlorogomphus iriomotensis
イリオモテミナミヤンマ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/25 (0.0%)0/31 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Aeschna mixta soneharai
マダラヤンマ		—✓————/——/—No———0262/73 (2.7%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Aeschna subarctica subarctica
イイジマルリボシヤンマ		——————/——/—No———0262/73 (2.7%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Aeschnophlebia anisoptera
ネアカヨシヤンマ		—✓—✓—✓/——/—No———0060/2 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Aeschnophlebia longistigma
アオヤンマ		LC✓—✓✓✓/1—/—No———0060/2 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Planaeschna ishigakiana ishigakiana
イシガキヤンマ		———✓——/——/—No———0060/17 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Planaeschna ishigakiana nagaminei
アマミヤンマ		———✓✓—/——/—No———0060/17 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Sarasaeschna kunigamiensis
オキナワサラサヤンマ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0060/4 (0.0%)4/262 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Macromia daimoji
キイロヤマトンボ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/39 (0.0%)0/46 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macromia kubokaiya
オキナワコヤマトンボ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0000/39 (0.0%)0/46 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macromia urania
ヒナヤマトンボ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/39 (0.0%)0/46 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplacodes bipunctatus
ベニヒメトンボ		——————/——/—No———0090/6 (0.0%)6/680 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Leucorrhinia intermedia ijimai
エゾカオジロトンボ		——✓✓✓—/——/—No———0090/55 (0.0%)6/680 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Orthetrum internum
タイワンシオヤトンボ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0291/35 (2.9%)6/680 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Perlodes frisonanus
フライソンアミメカワゲラ		——✓✓✓—/——/—No———0030/13 (0.0%)1/316 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Miniperla japonica
コカワゲラ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Velarifictorus politus
ムニンツヅレサセコオロギ		——✓✓✓—/——/—No———00210/17 (0.0%)9/764 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gampsocleis ryukyuensis
オキナワキリギリス		——✓✓✓—/——/—No———0080/8 (0.0%)4/1494 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Tanna ishigakiana
イシガキヒグラシ		——✓✓✓—/——/—No———0040/9 (0.0%)3/1267 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Hiraphora longiceps
オガサワラハナダカアワフキ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Batracomorphus ogasawarensis
オガサワラアオズキンヨコバイ		———✓✓—/——/—No———00340/39 (0.0%)19/12228 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Glossocratus fukuroki
フクロクヨコバイ		———✓✓—/——/—No———00340/5 (0.0%)19/12228 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Psammotettix kurilensis
スナヨコバイ		———✓✓—/——/—No———00340/154 (0.0%)19/12228 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Celtisaspis japonica
エノキカイガラキジラミ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/2 (0.0%)1/305 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Xiphovelia japonica
オヨギカタビロアメンボ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Gerris babai
ババアメンボ		—✓✓✓——/——/—No———0342/43 (4.7%)3/372 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Limnogonus nitidus
ツヤセスジアメンボ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0040/19 (0.0%)3/372 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Limnoporus esakii
エサキアメンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/7 (0.0%)3/372 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Neogerris boninensis
オガサワラアメンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/9 (0.0%)3/372 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hermatobates weddi
サンゴアメンボ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/5 (20.0%)1/5 (20.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macrosaldula shikokuana
オモゴミズギワカメムシ		——✓✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/196 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Micracanthia boninana
オガサワラミズギワカメムシ		——✓———/——/—No———0000/7 (0.0%)0/196 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Micracanthia hasegawai
ヒメミズギワカメムシ		——✓———/——/—No———0000/7 (0.0%)0/196 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Appasus japonicus
コオイムシ		—✓✓✓✓✓/2—/✓No———0010/3 (0.0%)1/235 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Laccotrephes maculatus
エサキタイコウチ		—✓✓✓—✓/——/—No———0020/11 (0.0%)2/55 (3.6%)—
NT
準絶滅危惧		Ranatra longipes
マダラアシミズカマキリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0121/27 (3.7%)2/55 (3.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cymatia apparens
ミゾナシミズムシ		——✓✓✓—/——/—No———0020/4 (0.0%)2/238 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hesperocorixa distanti hokkensis
ホッケミズムシ		—✓————/——/—No———0020/21 (0.0%)2/238 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hesperocorixa kolthoffi
オオミズムシ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/21 (0.0%)2/238 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hesperocorixa mandshurica
ナガミズムシ		——✓✓✓—/——/—No———0020/21 (0.0%)2/238 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Xenocorisa vittipennis
ミヤケミズムシ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Notonecta montandoni
オキナワマツモムシ		—✓✓✓——/—✓/✓No———0000/31 (0.0%)0/110 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Lygocorias boninensis
オガサワラチャイロカスミカメ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Miyamotoa rubicunda
ミヤモトベニカスミカメ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Pseudoloxops miyamotoi
クヌギヒイロカスミカメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00240/27 (0.0%)16/3428 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudophylus flavipes
リンゴクロカスミカメ		——✓———/——/—No———00240/2 (0.0%)16/3428 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Stenonabis extremus
ツマグロマキバサシガメ		——✓———/——/—No———0000/8 (0.0%)0/282 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Elatophilus nipponensis
ヒラタハナカメムシ		——✓———/——/—No———0060/3 (0.0%)5/205 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Kitocoris omura
オオムラハナカメムシ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Lyctocoris beneficus
ズイムシハナカメムシ		—✓✓———/——/—No———0000/8 (0.0%)0/9 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Xylocoris hiurai
クロアシブトハナカメムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0060/7 (0.0%)5/205 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Acanthaspis cincticrus
ハリサシガメ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00110/26 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Caunus noctulus
アシボソトビイロサシガメ		—✓—✓✓✓/——/—No———00110/1 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Coranus spiniscutis
ハイイロイボサシガメ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00110/18 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Elongicoris takarai
タカラサシガメ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Gardena boninensis
ムニンアシナガサシガメ		—✓—✓✓—/——/—No———00110/10 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Gardena melinarthrum
オオアシナガサシガメ		—✓✓✓✓—/——/—No———00110/10 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Polytoxus vagans
トゲナガユミアシサシガメ		———✓✓—/——/—No———00110/8 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Sphedanolestes albipilosus
ヒメシマサシガメ		——✓✓✓—/——/—No———00110/24 (0.0%)6/1716 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aradus herculeanus
オオカバヒラタカメムシ		——————/——/—No———0442/33 (6.1%)2/358 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Glochocoris infantulus
ケシヒラタカメムシ		——✓———/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Mezira tremulae
ヤセオオヒラタカメムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0040/13 (0.0%)2/358 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Clerada apicicornis
ミナミナガカメムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/1 (0.0%)2/399 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Peritrechus femoralis
ハマベナガカメムシ		——✓✓✓—/——/—No———0040/7 (0.0%)2/399 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Poeantius lineatus
アシナガナガカメムシ		——✓✓✓—/——/—No———0040/1 (0.0%)2/399 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Scolopostethus odoriko
オドリコナガカメムシ		———✓✓—/——/—No———0040/7 (0.0%)2/399 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Canthophorus niveimarginatus
シロヘリツチカメムシ		—✓✓✓——/——/—No———0000/3 (0.0%)0/130 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Brachymna tenuis
ヒラタトガリカメムシ		—✓✓✓——/—✓/✓No———00210/1 (0.0%)12/810 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Dalpada cinctipes
ツシマキボシカメムシ		—✓✓✓—✓/—✓/✓No———00210/12 (0.0%)12/810 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Plautia cyanoviridis
ルリカメムシ		——————/——/—No———00210/9 (0.0%)12/810 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Rhynchocoris humeralis
ミカントゲカメムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———00210/1 (0.0%)12/810 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Bembidion tsutsuii
ツツイキバナガミズギワゴミムシ		—✓—✓——/——/—No———00680/508 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Bembidion umi
ウミミズギワゴミムシ		—✓—✓✓—/——/—No———00680/508 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Callytron yuasai okinawensis
オキナワシロヘリハンミョウ		——————/——/—No———00680/3 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Callytron yuasai yuasai
シロヘリハンミョウ		———✓✓—/——/—No———00680/3 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Carabus arboreus ohminensis
コクロナガオサムシ大峰山脈亜種		——✓✓✓—/——/—No———06685/455 (1.1%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Carabus tuberculosus
セアカオサムシ		—✓✓✓✓✓/——/—No———06685/455 (1.1%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Ceratoderus venustus
クロオビヒゲブトオサムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———00680/2 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Chlaenius deliciolus
ヒトツメアオゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00680/51 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Chlaenius sulcicollis
クマガイクロアオゴミムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———00680/51 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cicindela gemmata aino
アイヌハンミョウ		——✓✓✓—/——/—No———00680/312 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Diplocheila macromandibularis
フトキバスナハラゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00680/6 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Oodes echigonus
エチゴトックリゴミムシ		——✓✓✓—/——/—No———00680/6 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Oodes vicarius
オオトックリゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00680/6 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Perileptus morimotoi
ウミホソチビゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00680/7 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Peronomerus auripilis
イグチケブカゴミムシ		——✓✓✓—/——/—No———00680/1 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pogonus itoshimaensis
ドウイロハマベゴミムシ		———✓——/——/—No———01681/11 (9.1%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pogonus japonicus
ハマベゴミムシ		——✓✓——/——/—No———01681/11 (9.1%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Scarites sulcatus
オオヒョウタンゴミムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———00680/17 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Thalassoduvalius masidai kurosai
ナンカイイソチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00680/1 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Thalassoduvalius masidai masidai
イソチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00680/1 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Thalassoduvalius masidai pacificus
イズイソチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00680/1 (0.0%)42/6555 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Haliplus kotoshonis
コウトウコガシラミズムシ		——✓✓——/——/—No———0000/57 (0.0%)0/84 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Agabus affinis
オクエゾクロマメゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0020/137 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Allopachria bimaculata
フタキボシケシゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/2 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cybister brevis
クロゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/1✓/✓No———0020/42 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Graphoderus zonatus
カラフトマルガタゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/15 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydaticus conspersus sakishimanus
リュウキュウオオイチモンジシマゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———0020/33 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus acuminatus
コマルケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus bonvouloiri
オオマルケシゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus pumilus
チビマルケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus seminarius
アマミマルケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus subtilis
マルケシゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrovatus yagii
ヤギマルケシゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hyphydrus japonicus
ケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hyphydrus laeviventris tsugaru
アラメケシゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/29 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ilybius apicalis
キベリクロヒメゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/81 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japanolaccophilus nipponensis
キボシツブゲンゴロウ		——————/——/—No———0020/1 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Laccophilus kobensis
コウベツブゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/64 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Laccophilus sharpi
シャープツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/64 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Leiodytes frontalis
マルチビゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/17 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Platambus fimbriatus
キベリマメゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/20 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Prodaticus bowringii
シマゲンゴロウ		—✓————/——/—No———0020/43 (0.0%)1/3020 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Dineutus australis
ツマキレオオミズスマシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/62 (0.0%)0/289 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Dineutus mellyi mellyi
タイワンオオミズスマシ		—✓✓———/——/—No———0000/62 (0.0%)0/289 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Dineutus orientalis
オオミズスマシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/62 (0.0%)0/289 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Orectochilus villosus
エゾコオナガミズスマシ		—✓✓✓—✓/2—/—No———0000/15 (0.0%)0/289 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydraena iheya
イヘヤダルマガムシ		——✓✓——/——/—No———0000/255 (0.0%)0/824 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydraena yonaguniensis
ヨナグニダルマガムシ		——✓✓——/——/—No———0000/255 (0.0%)0/824 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ochthebius amami
アマミセスジダルマガムシ		—✓✓✓——/——/—No———0000/279 (0.0%)0/824 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrochus japonicus
ヤマトホソガムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/39 (2.6%)1/39 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Enochrus subsignatus
マルヒラタガムシ		—✓✓✓——/——/—No———01101/64 (1.6%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Helochares nipponicus
スジヒラタガムシ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———01101/90 (1.1%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Horelophopsis hanseni
クロシオガムシ		—✓—✓✓—/——/—No———00100/1 (0.0%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrochara libera
エゾコガムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00100/17 (0.0%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrophilus acuminatus
ガムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00100/26 (0.0%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrophilus dauricus
エゾガムシ		——✓✓✓—/——/—No———00100/26 (0.0%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Laccobius inopinus
ミユキシジミガムシ		—✓✓✓——/——/—No———02101/36 (2.8%)8/1317 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nicrophorus japonicus
ヤマトモンシデムシ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0583/61 (4.9%)5/139 (3.6%)—
NT
準絶滅危惧		Lucanus gamunus
ミクラミヤマクワガタ		——✓✓✓—/——/—No———0171/82 (1.2%)6/437 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Neolucanus insulicola insulicola
ヤエヤママルバネクワガタ		——✓✓✓—/——/—No———0070/37 (0.0%)6/437 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Prismognathus dauricus
キンオニクワガタ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0070/7 (0.0%)6/437 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Trox mitis
マルコブスジコガネ		———✓——/——/—No———0000/35 (0.0%)0/99 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Aphodius kiuchii
ダイセツマグソコガネ		———✓——/——/—No———07734/232 (1.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Aphodius languidulus
キバネマグソコガネ		———✓✓—/——/—No———07734/232 (1.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Aphodius sturmi
ヒメキイロマグソコガネ		—✓—✓✓—/——/—No———07734/232 (1.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Aphodius variabilis
クロモンマグソコガネ		—✓—✓✓—/——/—No———07734/232 (1.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Onthophagus japonicus
ヤマトエンマコガネ		—✓✓✓——/——/—No———04732/307 (0.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Onthophagus ocellatopunctatus
アラメエンマコガネ		———✓——/——/—No———04732/307 (0.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Osmoderma opicum
オオチャイロハナムグリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———01731/13 (7.7%)45/5036 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponeubria yoshitomii
ヒゲナガヒラタドロムシ		——✓———/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Kurosawaia yanoi
ツヤヒメマルタマムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Campsosternus nobuoi
ノブオオオアオコメツキ		—✓✓✓—✓/——/—No———00400/14 (0.0%)21/1706 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Pyrocoelia miyako
ミヤコマドボタル		—✓✓✓✓—/1—/—No———0181/33 (3.0%)8/674 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Variimorda ihai boninensis
ヨツモンハナノミ小笠原亜種		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/437 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Blaps japonensis
ヤマトオサムシダマシ		——✓———/——/—No———01511/98 (1.0%)24/2485 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Acalolepta boninensis
オガサワラビロウドカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00420/21 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Acalolepta degener
ヒメビロウドカミキリ		—✓—✓✓—/——/—No———00420/21 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Ceresium signaticolle
クロモンヒメカミキリ		———✓✓—/——/—No———00420/9 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Chlorophorus boninensis
オガサワラトラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00420/44 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Chlorophorus kobayashii
オガサワラキイロトラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00420/44 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Merionoeda tosawai
オガサワラモモブトコバネカミキリ		———✓✓—/——/—No———00420/4 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Mesosa rufa
オガサワラゴマフカミキリ		———✓——/——/—No———00420/17 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Nobuosciades lanata
ケズネケシカミキリ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Plagionotus pulcher
コトラカミキリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00420/6 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Psephactus scabripennis chichijimensis
オガサワラコバネカミキリ父島亜種		———✓✓—/——/—No———00420/1 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Psephactus scabripennis scabripennis
オガサワラコバネカミキリ母島亜種		———✓✓—/——/—No———00420/1 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Pterolophia kubokii
ススキサビカミキリ		—✓—✓✓✓/——/—No———00420/25 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Ropalopus signaticollis
クロヒラタカミキリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00420/7 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Xylotrechus ogasawarensis
オガサワライカリモントラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00420/60 (0.0%)29/3224 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysolina virgata
オオルリハムシ		—✓✓✓—✓/1—/—No———081284/84 (4.8%)70/6966 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Donacia hirtihumeralis
アカガネネクイハムシ		—✓✓———/1—/—No———011281/61 (1.6%)70/6966 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Donacia japana
キンイロネクイハムシ		—✓✓✓——/1—/—No———011281/61 (1.6%)70/6966 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pyrrhalta nigromarginata
クロヘリウスチャハムシ		——✓———/——/—No———001280/16 (0.0%)70/6966 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ogasawarazo lineatus
スジヒメカタゾウムシ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Ogasawarazo rugosicephalus rugosicephalus
ヒメカタゾウムシ父島列島亜種		———✓——/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Neocolochelyna itoi
イトウハバチ		—✓✓✓——/——/—No———00240/1 (0.0%)15/4364 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Selandria konoi
コウノハバチ		——————/——/—No———02241/2 (50.0%)15/4364 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euurobracon yokahamae
ウマノオバチ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00630/4 (0.0%)41/24951 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Pristaulacus boninensis
オガサワラセダカヤセバチ		———✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/38 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gasteruption ogasawarensis
オガサワラコンボウヤセバチ		——————/——/—No———0221/166 (0.6%)1/189 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Proconura yamamotoi
ヤマモトアシブトコバチ		———✓✓—/——/—No———0040/6 (0.0%)3/547 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Elampus musashinus
ムサシトゲセイボウ		—✓—✓—✓/——/—No———0040/9 (0.0%)2/490 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Omalus grandis
オオツヤセイボウ		——————/——/—No———0040/16 (0.0%)2/490 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Liacos melanogaster
ナガセクロツチバチ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/111 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Amblyopone fulvida
ケシノコギリハリアリ		———✓✓—/——/—No———002920/13 (0.0%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Anochetus shohki
ヒメアギトアリ		——✓—✓—/——/—No———012921/139 (0.7%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Aphaenogaster edentula
トゲナシアシナガアリ		————✓—/——/—No———0102929/287 (3.1%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lasius orientalis
テラニシケアリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0182928/534 (1.5%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Leptanilla tanakai
ヤクシマムカシアリ		——✓✓✓—/——/—No———012921/65 (1.5%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Probolomyrmex longinodus
ホソハナナガアリ		——✓✓✓—/——/—No———012921/15 (6.7%)229/18712 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Anoplius viaticus
ムツボシベッコウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0251/29 (3.4%)3/1001 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Machaerothrix tsushimensis
キマダラズアカベッコウ		——✓✓✓—/——/—No———0050/2 (0.0%)3/1001 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Parabatozonus hakodadi
フタモンベッコウ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Euodynerus convergens
チチジマドロバチ		———✓✓—/——/—No———00360/43 (0.0%)23/1109 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Pararrhynchium tsunekii
アマミカバフドロバチ		———✓✓—/——/—No———00360/7 (0.0%)23/1109 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Stenodynerus ogasawaraensis
オガサワラチビドロバチ		———✓✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)23/1109 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Ammophila atripes japonica
フジジガバチ		———✓✓—/——/—No———0331/65 (1.5%)1/241 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Bembecinus anthracinus ogasawaraensis
オガサワラスナハキバチ		———✓✓—/——/—No———00260/23 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bembix formosana
タイワンハナダカバチ		——✓✓✓—/——/—No———00260/40 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ceratocrabro shimoyamai
シモヤマギングチ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Cerceris amamiensis tokunosimana
トクノシマツチスガリ		———✓✓—/——/—No———05263/58 (5.2%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cerceris pedetes
マエダテツチスガリ		———✓✓—/——/—No———05263/58 (5.2%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cerceris tomiyamai
エラブツチスガリ		———✓✓—/——/—No———05263/58 (5.2%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ectemnius furuichii
ササキリギングチ		———✓✓—/——/—No———05263/32 (9.4%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gorytes ishigakiensis
ババアワフキバチ		———✓✓—/——/—No———00260/14 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Harpactus tumidus japonensis
カワラアワフキバチ		——————/——/—No———00260/22 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Larra amplipennis
アカオビケラトリ		——✓✓✓—/——/—No———00260/8 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Liris subtessellatus ogasawarae
オガサワラコオロギバチ		——✓✓✓—/——/—No———00260/36 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Psen boninensis
オガサワラヨコバイバチ		———✓✓—/——/—No———00260/3 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Psenulus ogasawaranus
オガサワラマエダテバチ		———✓✓—/——/—No———00260/30 (0.0%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sphex inusitatus fukuianus
フクイアナバチ		———✓✓—/——/—No———0030/40 (0.0%)1/241 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Trypoxylon chichidzimaense
チチジマジガバチモドキ		———✓——/——/—No———04262/71 (2.8%)15/1467 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Heriades fulvohispida
オガサワラコハキリバチ		———✓✓—/——/—No———00230/14 (0.0%)13/1138 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Megachile xanthothrix
キバラハキリバチ		——✓✓✓—/——/—No———012237/307 (2.3%)13/1138 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Bombus florilegus
ノサップマルハナバチ		—✓—✓✓✓/——/✓No———07416752/444 (11.7%)110/3848 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Bombus ignitus
クロマルハナバチ		—✓✓✓✓✓/11—/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		243 Mbp
100		4,026
714 kbp		17416752/444 (11.7%)110/3848 (2.9%)2020-10-02
NT
準絶滅危惧		Xylocopa ogasawarensis
オガサワラクマバチ		—✓✓✓✓—/1—/—No———061674/217 (1.8%)110/3848 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Neohapalothrix manshukuensis
シロウズギンモンアミカ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Anopheles saperoi
オオハマハマダラカ		—✓✓✓—✓/——/—No———011717247/1151 (4.1%)70/3818 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Trichothaumalea japonica
ケバネユスリカバエ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/81 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ragas circinata
トビグチオドリバエ		———✓✓—/——/—No———0080/1 (0.0%)4/4156 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Rhamphomyia mirabilis
ハマナスクシオオドリバエ		———✓✓—/——/—No———0281/1579 (0.1%)4/4156 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Symballophthalmus speciosus
フタテンアシホソハシリバエ		———✓✓—/——/—No———0040/3 (0.0%)2/4093 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diostracus nakanishii
タカネキアシナガレアシナガバエ		———✓✓—/——/—No———00160/9 (0.0%)9/9844 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Thalassophorus spinipennis
トゲバネイソネジレオバエ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Himalopsyche japonica
オオナガレトビケラ		—✓—✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		547 Mbp
250		850
2.15 Mbp		16115/21 (23.8%)9/376 (2.4%)2023-02-08
NT
準絶滅危惧		Macrostemum okinawanum
オキナワホシシマトビケラ （オキナワオオシマトビケラ）		———✓✓—/——/—No———0070/37 (0.0%)6/1955 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Ganonema inouei
クチキトビケラ（クロアシエダトビケラ）		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/150 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Georgium japonicum
ビワアシエダトビケラ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Setodes turbatus
ギンボシツツトビケラ		——————/——/—No———00110/42 (0.0%)6/970 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Setodes ujiensis
ウジヒメセトトビケラ（ウジセトトビケラ）		——✓✓✓—/——/—No———00110/42 (0.0%)6/970 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Goera ogasawaraensis
オガサワラニンギョウトビケラ		———✓——/——/—No———0000/39 (0.0%)0/61 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phragmataecia castaneae
ハイイロボクトウ		—✓✓✓✓✓/1—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		591 Mbp
53		217
6.05 Mbp		2271/1 (100.0%)4/335 (1.2%)2024-10-25
NT
準絶滅危惧		Balataea octomaculata
ヤホシホソマダラ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Eterusia watanabei
ツシマキモンチラシ		——✓✓✓—/——/—No———00260/6 (0.0%)13/434 (3.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rhagades pruni
ルリハダホソクロバ		—✓✓✓—✓/1—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.08 Gbp
26		818
3.03 Mbp		22261/5 (20.0%)13/434 (3.0%)2024-09-29
NT
準絶滅危惧		Zygaena niphona niphona
ベニモンマダラ本土亜種		—✓—✓——/——/—No———019269/97 (9.3%)13/434 (3.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chilo pulveratus
ゴマフツトガ		——————/——/—No———041801/57 (1.8%)86/4333 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysoteuchia moriokensis
モリオカツトガ		——✓✓✓—/——/—No———021801/7 (14.3%)86/4333 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Paracymoriza vagalis
カワゴケミズメイガ		——✓✓✓✓/——/—No———001800/4 (0.0%)86/4333 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parapoynx ussuriensis
ムナカタミズメイガ		——✓———/——/—No———021801/26 (3.8%)86/4333 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Carterocephalus palaemon satakei
タカネキマダラセセリ飛騨山脈亜種		—✓—✓✓—/——/—No———254873/15 (20.0%)410/3510 (11.7%)—
NT
準絶滅危惧		Leptalina unicolor
ギンイチモンジセセリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———004870/1 (0.0%)410/3510 (11.7%)—
NT
準絶滅危惧		Thymelicus leoninus hamadakohi
スジグロチャバネセセリ愛媛亜種		——✓———/——/—No———084873/8 (37.5%)410/3510 (11.7%)—
NT
準絶滅危惧		Thymelicus leoninus leoninus
スジグロチャバネセセリ名義タイプ亜種		—✓✓✓——/——/—No———084873/8 (37.5%)410/3510 (11.7%)—
NT
準絶滅危惧		Luehdorfia puziloi inexpecta
ヒメギフチョウ本州亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———031182/5 (40.0%)81/612 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Luehdorfia puziloi yessoensis
ヒメギフチョウ北海道亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———031182/5 (40.0%)81/612 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Parnassius eversmanni daisetsuzanus
ウスバキチョウ		——✓———/——/—No———0111187/58 (12.1%)81/612 (13.2%)—
NT
準絶滅危惧		Anthocharis cardamines isshikii
クモマツマキチョウ北アルプス・戸隠亜種		—✓✓———/——/—No———24982/17 (11.8%)45/947 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Colias palaeno aias
ミヤマモンキチョウ浅間連山亜種		—✓✓———/——/—No———2259811/105 (10.5%)45/947 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Colias palaeno sugitanii
ミヤマモンキチョウ北アルプス亜種		—✓————/——/—No———2259811/105 (10.5%)45/947 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Artipe eryx okinawana
イワカワシジミ		———✓✓—/——/—No———001090/1 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Fixsenia iyonis iyonis
ベニモンカラスシジミ名義タイプ亜種, 四国亜種		———✓——/——/—No———051093/48 (6.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Fixsenia iyonis kibiensis
ベニモンカラスシジミ中国地方亜種		———✓✓—/——/—No———051093/48 (6.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Fixsenia iyonis surugaensis
ベニモンカラスシジミ中部地方亜種		——————/——/—No———051093/48 (6.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Glaucopsyche lycormas　
カバイロシジミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———051093/10 (30.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phengaris arionides takamukui
オオゴマシジミ		——————/——/—No———051092/11 (18.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phengaris teleius ogumae
ゴマシジミ北海道・東北亜種		—✓————/——/—No———051092/11 (18.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pithecops corvus ryukyuensis
リュウキュウウラボシシジミ		—✓—✓✓—/——/—No———001090/4 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Plebejus argus micrargus
ヒメシジミ本州・九州亜種		—✓—✓✓✓/——/—No———281094/65 (6.2%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Spindasis takanonis
キマダラルリツバメ		—✓—✓✓✓/10—/✓No———001090/25 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Tongeia fischeri caudalis
クロツバメシジミ九州沿岸・朝鮮半島亜種		———✓✓—/——/—No———001090/7 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Tongeia fischeri japonica
クロツバメシジミ東日本亜種		——✓———/——/—No———001090/7 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Tongeia fischeri shojii
クロツバメシジミ中国地方・四国・九州内陸亜種		——————/——/—No———001090/7 (0.0%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Vacciniina optilete daisetsuzana
カラフトルリシジミ		———✓✓—/——/—No———221091/9 (11.1%)55/2745 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Brenthis daphne iwatensis
ヒョウモンチョウ北海道・本州北部亜種		——✓———/——/—No———148013/4 (75.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Clossiana freija asahidakeana
アサヒヒョウモン		—✓————/——/—No———22480112/50 (24.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Clossiana iphigenia
カラフトヒョウモン		—✓—✓✓—/——/—No———02480112/50 (24.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Coenonympha hero neoperseis
シロオビヒメヒカゲ北海道西部亜種		——✓———/——/—No———0138016/41 (14.6%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Erebia ligea rishirizana
クモマベニヒカゲ北海道亜種		—✓✓——✓/——/—No———45680127/113 (23.9%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Erebia ligea takanonis
クモマベニヒカゲ本州亜種		—✓✓——✓/——/—No———45680127/113 (23.9%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Erebia neriene niphonica
ベニヒカゲ本州亜種		—✓—✓—✓/1—/—No———05680127/113 (23.9%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Hestina assimilis shirakii
アカボシゴマダラ奄美亜種		——✓✓✓—/——/—No———228011/7 (14.3%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Kallima inachus eucerca
コノハチョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———008010/5 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Kirinia fentoni
キマダラモドキ		—✓✓———/——/—No———008010/2 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lethe europa pavida
シロオビヒカゲ		—✓✓✓——/——/—No———008010/42 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Oeneis melissa daisetsuzana
ダイセツタカネヒカゲ		—✓✓——✓/——/—No———068013/32 (9.4%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Oeneis norna asamana
タカネヒカゲ飛騨山脈亜種		—✓✓——✓/——/—No———268013/32 (9.4%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Polyura eudamippus weismanni
フタオチョウ		—✓—✓✓✓/——/—No———008010/132 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sasakia charonda charonda
オオムラサキ		—✓—✓——/——/—No———008010/2 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Ypthima masakii
マサキウラナミジャノメ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———008010/50 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Ypthima riukiuana
リュウキュウウラナミジャノメ		—✓✓✓—✓/1—/—No———008010/50 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Ypthima yayeyamana
ヤエヤマウラナミジャノメ		—✓✓✓—✓/1—/—No———008010/50 (0.0%)229/5428 (4.2%)—
NT
準絶滅危惧		Apochima excavata
クワトゲエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———003650/1 (0.0%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Boninnadagara crinomorpha
マルバエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Eupithecia extensaria
シロマダラカバナミシャク		—✓✓✓✓✓/——/—No———04036520/556 (3.6%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnoscelis boninensis
オガサワラチビナミシャク		——✓✓✓—/——/—No———023651/18 (5.6%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnoscelis melaninfra
ウラグロチビナミシャク		——✓✓✓—/——/—No———023651/18 (5.6%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnoscelis montgomeryi
ウラジロチビナミシャク		——✓✓✓—/——/—No———023651/18 (5.6%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pelagodes ogasawarensis
チビサザナミシロアオシャク		——✓✓✓—/——/—No———003650/7 (0.0%)182/11862 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudonadagara hepatica
カギバエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Warreniplema fumicosta islandica
アトキフタオ小笠原亜種		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/133 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Actias gnoma
オナガミズアオ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———03142/33 (6.1%)11/1947 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Attacus atlas
ヨナグニサン		—✓✓✓✓✓/11✓/✓No———00140/15 (0.0%)11/1947 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Loepa sakaei
ハグルマヤママユ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00140/41 (0.0%)11/1947 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Deilephila askoldensis
ヒメスズメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———04322/4 (50.0%)19/1406 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Polyptychus chinensis
ハガタスズメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00320/32 (0.0%)19/1406 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ptilodon kuwayamae
クワヤマエグリシャチホコ		—✓———✓/——/—No———04462/9 (22.2%)24/1822 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Ramesa tosta
カバイロシャチホコ		—✓✓✓✓—/——/—No———00460/3 (0.0%)24/1822 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Calliteara virginea
ウスジロドクガ		——✓———/——/—No———021501/23 (4.3%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Kidokuga torasan
トラサンドクガ		——✓———/——/—No———001500/2 (0.0%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Laelia coenosa
スゲドクガ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.11 Gbp
75		149
25.8 Mbp		221501/13 (7.7%)74/8606 (0.9%)2025-10-14
NT
準絶滅危惧		Laelia kunigamiensis
クニガミスゲドクガ		——✓———/——/—No———021501/13 (7.7%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Aloa lactinea
マエアカヒトリ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———001500/5 (0.0%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Amata flava aritai
ツマキカノコ		———✓✓—/——/—No———001500/66 (0.0%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Eilema degenerella
シロホソバ		——✓✓✓—/——/—No———0101505/31 (16.1%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Eilema fuscodorsalis
ヤネホソバ		———✓✓—/——/—No———0101505/31 (16.1%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Grammia quenseli daisetsuzana
ダイセツヒトリ		——————/——/—No———011501/52 (1.9%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Nikaea matsumurai
トラガモドキ		——✓✓——/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Rhyparia purpurata
ゴマベニシタヒトリ		—✓—✓——/——/—No———021501/6 (16.7%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Meganola mikabo
ミカボコブガ		——✓✓✓—/——/—No———04142/150 (1.3%)7/680 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nola umetsui
チョウカイシロコブガ		——✓✓✓—/——/—No———02141/142 (0.7%)7/680 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Acronicta carbonaria
ウスズミケンモン		——✓✓✓—/——/—No———0104925/129 (3.9%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Acronicta digna
クビグロケンモン		——✓✓✓✓/——/—No———0104925/129 (3.9%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Acronicta lutea
ウスジロケンモン		——✓✓✓—/——/—No———0104925/129 (3.9%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Adisura atkinsoni
アカヘリヤガ		——✓✓✓—/——/—No———004920/43 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Agrotis desertorum
ハマヤガ		——✓✓✓✓/——/—No———0134927/134 (5.2%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Amphipyra okinawensis
クロシマカラスヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———044922/19 (10.5%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Anarta melanopa
コイズミヨトウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———024921/23 (4.3%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Callopistria ogasawaraensis
ムニンツマキリヨトウ		——✓———/——/—No———044921/25 (4.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Catocala actaea
コシロシタバ		—✓✓✓✓✓/——/—No———091505/269 (1.9%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Catocala ella
ミヤマキシタバ		—✓✓✓✓✓/——/—No———091505/269 (1.9%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Catocala koreana
アズミキシタバ		—✓✓✓✓✓/——/—No———091505/269 (1.9%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Catocala nagioides
ヒメシロシタバ		—✓✓✓✓✓/——/—No———091505/269 (1.9%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Cidariplura signata
カギモンハナオイアツバ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Coranarta carbonaria
ダイセツキシタヨトウ		——✓———/——/—No———004920/3 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Cucullia argentea
アオモンギンセダカモクメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———004920/58 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Cucullia fraudatrix
ホシヒメセダカモクメ		—✓✓✓✓✓/——/—No———004920/58 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Cucullia jankowskii
ギンモンセダカモクメ		——✓✓✓—/——/—No———004920/58 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Cucullia mandschuriae
ダイセンセダカモクメ		——✓✓✓—/——/—No———004920/58 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Eupsilia contracta
ウスミミモンキリガ		——✓✓✓—/——/—No———024921/14 (7.1%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Eupsilia hidakaensis
ヒダカミツボシキリガ		——✓✓✓—/——/—No———024921/14 (7.1%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Hadena compta
シロオビヨトウ		—✓✓✓—✓/——/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		687 Mbp
60		238
7.47 Mbp		244922/29 (6.9%)236/7008 (3.4%)2025-03-13
NT
準絶滅危惧		Helicoverpa sugii
クロタバコガ		——✓———/——/—No———0174924/81 (4.9%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Heliothis bivittata
ギンスジアカヤガ		——✓———/——/—No———064924/19 (21.1%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Hypena claripennis
キシタアツバ		—✓✓✓✓—/——/—No———001500/6 (0.0%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Jodia sericea
ミスジキリガ		——✓✓✓—/——/—No———004920/1 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Sarbanissa yunnana
ツリフネソウトラガ		——✓✓✓—/——/—No———004920/4 (0.0%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Sideridis kitti
フジシロミャクヨトウ		—✓✓✓—✓/——/—No———024921/19 (5.3%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Speiredonia inocellata
ホラズミクチバ		——✓———/——/—No———001500/3 (0.0%)74/8606 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Sympistis funebris kurodakeana
クロダケタカネヨトウ		——————/——/—No———024921/74 (1.4%)236/7008 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Virgo confusa
ニセトガリヨトウ		——✓———/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Xestia descripta
アサマウスモンヤガ		——✓✓——/——/—No———0144927/104 (6.7%)236/7008 (3.4%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Patelloida conulus
ツボミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00110/35 (0.0%)9/189 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Macroschisma cuspidatum
ヤジリスカシガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/208 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Umbonium moniliferum
イボキサゴ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0080/5 (0.0%)5/285 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Umbonium suturale
タイワンキサゴ		——✓✓✓—/——/—No———0080/5 (0.0%)5/285 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Neritilia rubida
コハクカノコ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritilia vulgaris
ツブコハクカノコ		LC—✓✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Georissa hukudai
フクダゴマオカタニシ		——✓✓✓—/——/—No———0111/64 (1.6%)1/65 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Georissa japonica
ゴマオカタニシ		——✓✓✓—/——/—No———0111/64 (1.6%)1/65 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Georissa luchuana
リュウキュウゴマオカタニシ		——————/——/—No———0111/64 (1.6%)1/65 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Clithon pauluccianus
レモンカノコ		——————/——/—No———0020/14 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Clithon sp.
ヒメカノコ		——————/——/—No———0020/14 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Clithon squarrosus
ウロコイシマキ		—✓✓✓✓—/—✓/✓No———0020/14 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neripteron auriculata
コウモリカノコ		——————/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neripteron sp. A
ヒロクチカノコ		——————/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neripteron sp. B
フリソデカノコ		——————/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neripteron spiralis
キジビキカノコ		——————/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neripteron subauriculata
ツバサカノコ		——————/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nerita planospira
ヒラマキアマオブネ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/61 (1.6%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina asperulata
アラハダカノコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/29 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina petiti
アカグチカノコ		——————/——/—No———0020/29 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina siquijorensis
ニセヒロクチカノコ		——————/——/—No———0020/29 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina sp. A
クロズミアカグチカノコ		——————/——/—No———0020/29 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina sp. B
ウスベニツバサカノコ		——————/——/—No———0020/29 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Neritina turrita
シマカノコ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Septaria lineata
ベッコウフネアマガイ		LC✓—✓✓—/—✓/✓No———0020/5 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Smaragdia rangiana
クサイロカノコ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/3 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Smaragdia souverbiana
キンランカノコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0020/3 (0.0%)2/198 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phenacolepas pulchella
ミヤコドリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/50 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phenacolepas sp.
ヒナユキスズメ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/50 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Phenacolepas tenuisculpta
タオヤメユキスズメ（ヌノメミヤコドリ）		—✓—✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/50 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chamalycaeus expanstoma
クチビラキムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chamalycaeus satsumanus satsumanus
サツマムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chamalycaeus satsumanus tanegashimae
タネガシマムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chamalycaeus tadai
タダムシオイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chamalycaeus vinctus
クビマキムシオイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclophorus hirasei
オオヤマタニシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/58 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclophorus turgidus miyakoensis
ミヤコヤマタニシ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/58 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclophorus turgidus radians
ヤエヤマヤマタニシ		—✓—✓✓✓/1—/—No———0000/58 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclotus campanulatus tanegashimanus
タネガシマアツブタガイ		———✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyclotus taivanus peraffinis
ヤエヤマアツブタガイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/5 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonia gouldi
ケハダヤマトガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/9 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonia hispida
ケブカヤマトガイ		DD—✓✓✓—/——/—No———0000/9 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonia sadoensis
サドヤマトガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/9 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonia striatula
イトマキヤマトガイ		DD—✓✓✓—/——/—No———0000/9 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Leptopoma nitidum
アオミオカタニシ		—✓—✓✓✓/——/—No———0000/7 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Platyrhaphe hirasei nudus
ハダカアツブタガイ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Platyrhaphe hirasei yaeyamaensis
ヤエヤマヒラセアツブタガイ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Platyrhaphe hirasei yonakunijimanus
ヨナクニアツブタガイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/266 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina ampla
オオコベルトゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina circumstomata
マルクチゴマガイ		DD—✓✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina danzyonarum
ダンジョゴマガイ		——————/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina gotoensis
ゴトウゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina immersidens
ミヤコゴマガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina nesiotica
ニヨリゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina saginata
ハラブトゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina turris turris
トウガタゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina ujiinsularis
ウジグントウゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplommatina yakushimae
ヤクシマゴマガイ		———✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Heterogen japonica
オオタニシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/3 (0.0%)3/271 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Heterogen longispira
ナガタニシ		EN✓✓✓✓✓/1—/—No———0040/3 (0.0%)3/271 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Batillaria multiformis
ウミニナ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0111/8 (12.5%)1/8 (12.5%)—
NT
準絶滅危惧		Clypeomorus bifasciata
カヤノミカニモリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/95 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira arenicola
ホソマキカワニナ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira decipiens
タテヒダカワニナ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira morii
モリカワニナ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira multigranosa
イボカワニナ		—✓—✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira niponica
ヤマトカワニナ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira reticulata
カゴメカワニナ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira shiraishiensis
シライシカワニナ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira takeshimensis
タケシマカワニナ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Semisulcospira kurodai
クロダカワニナ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0111/78 (1.3%)1/179 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cerithidea moerchii
フトヘナタリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/49 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pirenella nipponica
ヘナタリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/49 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Terebralia palustris
キバウミニナ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/3 (0.0%)0/49 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Melanoides tuberculatus
ヌノメカワニナ		LC✓✓✓✓✓/1—/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		971 Mbp
80		974,018
1.06 kbp		1111/30 (3.3%)1/120 (0.8%)2023-06-01
NT
準絶滅危惧		Sermyla riqueti
ネジヒダカワニナ		LC✓————/——/—No———0010/3 (0.0%)1/120 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Tarebia granifera
イボアヤカワニナ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0010/2 (0.0%)1/120 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Thiara scabra pagoda
トゲカワニナ		——————/——/—No———0010/1 (0.0%)1/120 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lacuna carinifera
モロハタマキビ（セトウチヘソカドタマキビ）		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/6 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Littoraria conica
イロタマキビ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0080/38 (0.0%)4/214 (1.9%)—
NT
準絶滅危惧		Cryptonatica adamsiana
アダムスタマガイ		—✓—✓✓—/——/—No———0030/9 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Eunaticina papilla
ネコガイ		—✓✓✓✓—/—✓/✓No———0030/1 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Mammilla melanostmoides
ヒロクチリスガイ		——————/——/—No———0030/8 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Natica buriasensis
カスミコダマ		——————/——/—No———0030/5 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Notocochlis robillardi
テンセイタマガイ		——————/——/—No———0030/4 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Gennaeosinum bathyraphe
オリイレシラタマ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Sinum incisum
ツガイ		——✓✓✓—/——/—No———0030/3 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Sinum planulatum
ツツミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0030/3 (0.0%)3/81 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Angustassiminea castanea
クリイロカワザンショウ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea estuarina
ツブカワザンショウ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea parasitologica
ムシヤドリカワザンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea sp. A
テシオカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea sp. B
イヨカワザンショウ（ヤミカワザンショウ）		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea sp. C
アッケシカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assiminea sp. J
ヒナタムシヤドリカワザンショウ		——————/——/—No———0000/25 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assimineidae gen. A yoshidayukioi
ヨシダカワザンショウ		——————/——/—No———0000/75 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Assimineidae gen. A & sp.
オイランカワザンショウ		——————/——/—No———0000/75 (0.0%)0/75 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rugapedia sp.
アシヒダツボ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Bithynia moltschanovi
エゾマメタニシ		——————/——/—No———0221/15 (6.7%)1/38 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Falsicingula kurilensis
ナタネツボ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chevallieria sp.
ジーコンボツボ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Fluviocingula elegantula
カワグチツボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/19 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Iravadia quadrasi
マンガルツボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/19 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nozeba ziczac
サザナミツボ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pellamora reflecta
ニセゴマツボ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/19 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Blanfordia japonica
イツマデガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/112 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Blanfordia simplex
ヒメオカマメタニシ		———✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/112 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Cecina manchurica
クビキレガイモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/112 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Fukuia kurodai
ニクイロシブキツボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/112 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Rissoina pura
ヌノメチョウジガイ		———✓——/——/—No———0000/18 (0.0%)0/1003 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Voorwindia sp.
タニシツボ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/126 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Stenothyra basiangulata
オキナワミズゴマツボ		——✓✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Stenothyra edogawensis
エドガワミズゴマツボ（ウミゴマツボ）		——✓✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudoliotia pulchella
シラギク		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Vitrinella sp.
ナギツボ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Strombus gibbosus
ネジマガキ		——————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/94 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Strombus labiatus
ヒダトリガイ		—✓—✓—✓/—✓/✓No———0000/7 (0.0%)0/94 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Strombus robustus
フドロ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/11 (0.0%)0/94 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Strombus urceus urceus
オハグロガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/12 (0.0%)0/94 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Velutina pusio
ハナヅトガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/169 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Depressiscala aurita
オダマキ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Papyriscala clementia
クレハガイ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Papyriscala lyra
ハブタエセキモリ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Papyriscala yokoyamai
セキモリ		———✓——/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Hypermastus peronellicola
カシパンヤドリニナ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Hypermastus tokunagai
トクナガヤドリニナ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Hemifusus tuba
テングニシ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0000/4 (0.0%)0/21 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius corticatus
カタムシロ		——————/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius horridus
イガムシロ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius stoliczkanus
ヒメオリイレムシロ		——————/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius livescens
ムシロガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius venustus
キツネノムシロ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius bellulus
カニノテムシロ		—✓—✓✓—/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius bimaculosus
フタホシカニノテムシロ		—✓—✓✓✓/2—/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius globosus
コブムシロ		—✓✓✓✓—/——/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius luridus
マタヨフバイ		—✓✓✓✓✓/3—/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nassarius olivaceus
クリイロムシロ（クリイロヨフバイ）		—✓✓✓✓✓/4—/—No———0121/179 (0.6%)2/348 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Babylonia japonica
バイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0231/13 (7.7%)2/356 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Vexillum gruneri
ハイイロミノムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/140 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Vexillum sanguisuga
カノコミノムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/140 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chicoreus asianus
オニサザエ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———00120/21 (0.0%)8/972 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Oliva mustelina
マクラガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/16 (0.0%)0/142 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Conus figulinus
スジイモ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0666/416 (1.4%)6/589 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Conus loroisii
コゲスジイモ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0666/416 (1.4%)6/589 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Etremopa gainesii
チャイロフタナシシャジク		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Eucithara marginelloides
コトツブ		———✓✓—/——/—No———0060/3 (0.0%)6/589 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudodaphnella leuckarti
クリイロマンジ		——✓✓✓—/——/—No———0020/21 (0.0%)1/346 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Turris crispa
クダボラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/20 (0.0%)0/493 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hastula rufopunctata
シチクガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/338 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Biwakovalvata biwaensis
ビワコミズシタダミ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Valvata hokkaidoensis
ミズシタダミ		—✓—✓✓✓/——/✓No———0000/64 (0.0%)0/66 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonactaeon sieboldii
オオシイノミガイ		———✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Japonactaeon nipponensis
ムラクモキジビキガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/3 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pupa sulcata
カヤノミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Limulatys ooformis
ホソタマゴガイ		———✓✓—/——/—No———0020/3 (0.0%)1/93 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Acteocina koyasensis
コヤスツララ		——✓✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/24 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Siphonacmea oblongata
キタノカラマツガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Bacteridium vittatum
イトカケゴウナ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Evalea suoana
スオウクチキレ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Syrnola hanzawai
アンパルクチキレ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Syrnola aciculata
ククリクチキレ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Pyrgulina shigeyasui
シゲヤスイトカケギリ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Leucotina digitalis
チビマキギヌ（ササクレマキモノガイ）		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Leucotina sp.
ニライカナイゴウナ		—✓————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pyramidella ventricosa
オオシイノミクチキレ		—✓—✓——/——/—No———0000/2 (0.0%)0/74 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Monotygma eximia
ヒメゴウナ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Tiberia dunkeri
ドウンケルクチキレ（エバラクチキレ）		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Turbonilla scrobiculata
ウネイトカケギリ		———✓✓—/——/—No———0000/14 (0.0%)0/74 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pyramidellidae gen. A. & sp. A
ヌカルミクチキレ		——————/——/—No———0000/74 (0.0%)0/74 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Turbonilla teganumana
エドイトカケギリ		———✓✓—/——/—No———0000/14 (0.0%)0/74 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Turbonilla kuraenohamana
クラエノハマイトカケギリ		———✓✓—/——/—No———0000/14 (0.0%)0/74 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Radix auricularia japonica
モノアラガイ		——————/——/—No———1161/252 (0.4%)4/423 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Choanomphalodes perstriatulus
カドヒラマキガイ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Polypylis hemisphaerula
ヒラマキガイモドキ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———00200/5 (0.0%)7/682 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Polypylis usta
リュウキュウヒラマキガイモドキ		———✓——/——/—No———00200/2 (0.0%)7/682 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Carychium cymatoplax
ナガケシガイ		———✓✓—/——/—No———0010/28 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Carychium pessimum
ケシガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/28 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cassidula crassiuscula
カタシイノミミミガイ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cassidula mustelina
ウラシマミミガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cassidula plecotrematoides plecotrematoides
ヒゲマキシイノミミミガイ		———✓——/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Cassidula vespertilionis
コウモリミミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Laemodonta exaratoides
ウスコミミガイ		DD✓✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Laemodonta monilifera
マキスジコミミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Laemodonta sp. A
シュジュコミミガイ		——————/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Laemodonta typica
ヘソアキコミミガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/12 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Melampus phaeostylus
コメツブハマシイノミ		———✓✓—/——/—No———0010/22 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Melampus sulculosus
キヌメハマシイノミ（トリコハマシイノミ）		LC——✓——/——/—No———0010/22 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Microtralia sp.
コデマリナギサノシタタリ		——————/——/—No———0010/2 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pedipes jouani
ヒヅメガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/4 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pythia nana
ヒメヒラシイノミ		———✓✓—/——/—No———0010/11 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pythia pachyodon
クロヒラシイノミ		——✓✓✓—/——/—No———0010/11 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pythia pantherina
マダラヒラシイノミ		——✓✓✓—/——/—No———0010/11 (0.0%)1/159 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Platevindex sp. B
ゴマセンベイアワモチ		——————/——/—No———0060/19 (0.0%)5/135 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Granulilimax fuscicornis
イボイボナメクジ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/2 (0.0%)1/38 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Oxyloma hirasei
ナガオカモノアラガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/52 (0.0%)0/185 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pacificella rucuana
リュウキュウノミガイ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Tornatellides tryoni
トライオンノミガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/53 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pyramidula conica
ナタネガイモドキ		——✓✓✓—/——/—No———0000/27 (0.0%)0/27 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Eostrobilops nipponica reikoae
ナニワクチミゾガイ		———✓——/——/—No———0000/1 (0.0%)0/4 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gastrocopta armigerella armigerella
スナガイ		———✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/68 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gastrocopta armigerella daitojimana
ダイトウジマスナガイ		———✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/68 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gastrocopta boninensis
ボニンスナガイ		VU—✓✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/68 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Truncatellina insulivaga
ミジンサナギガイ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/37 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Vertigo kushiroensis
クシロキバサナギガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/115 (0.0%)0/153 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Luchuena oshimana
オオシマキセルモドキ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Mirus andersonianus
クリイロキセルモドキ		——✓✓✓✓/——/—No———0000/4 (0.0%)0/87 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Mirus rugulosus
ホソキセルモドキ		——✓✓✓✓/——/—No———0000/4 (0.0%)0/87 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Euphaedusa aculus mesimana
メシマコギセル		———✓✓—/——/—No———0010/6 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa aulacophora
クロチビギセル		———✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa decapitata
シリオレトノサマギセル		——✓✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa dorcas
オクガタギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa ducalis
トノサマギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa hosayaka
ホソヤカギセル		—✓—✓✓✓/4—/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa iotaptyx
シリボソギセル		—✓✓✓✓✓/5—/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa kawasakii
ハチノコギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa kuninoae
クニノギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa martensi
オオギセル		—✓✓✓✓✓/5—/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa mikado
ミカドギセル		—✓✓✓✓✓/6—/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa morisakii
モリサキギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa nankaidoensis nankaidoensis
コシボソギセル		———✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa pilsbryana
ピルスブリギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa pinguis pinguis
キイツムガタギセル		———✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa plicilabris
コスジギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa rex
オオトノサマギセル		—✓—✓✓✓/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa rhopalia
ツメギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa schmackeri
シマケルギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa sericina
チュウゼンジギセル		———✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa stenospira
シロバリギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa sugimotonis misaki
ミサキギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa sugimotonis sugimotonis
スギモトギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa surugensis
スルガギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa tanegashimae
タネガシマギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Megalophaedusa tosaensis
トサシリボソギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Reinia arborea
ムコウジマコギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/13 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa addisoni plagioptyx
ハスヒダギセル		———✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa hickonis mikawa
ミカワギセル		——————/——/—No———0010/55 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa hooyoensis
ホウヨギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa interlamellaris
カタギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa jacobiella
ヒメヤコビギセル		—✓—✓✓✓/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa koshikijimana
コシキジマギセル		———✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa nesiothauma
ヒルグチギセル		—✓—✓✓✓/6—/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa nugax
コハラブトギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa okimodoki
オキモドキギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa oshimae oshimae
オオシマギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa tosana
トサギセル		———✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa tripleuroptyx
クロシマギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/14 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa ujiguntoensis
ウジグントウギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa una
ナカダチギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Stereophaedusa vasta moriyai
モリヤギセル		——————/——/—No———0010/39 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Tauphaedusa stearnsii iriomotensis
イリオモテコギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/5 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Tauphaedusa stearnsii stearnsii
スタアンズギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/5 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx adulta
サキシマノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx asperata
アラハダノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx deminuta
ヨワノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx hachijoensis
ハチジョウノミギセル		—✓—✓✓✓/6—/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx kusakakiensis
クサカキノミギセル		———✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx nakanoshimana
ナカノシマノミギセル		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx polita
ツヤノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx ptychocyma
ハラブトノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx stimpsoni sadoensis
サドギセル		———✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx tantilla
チイサギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx thaumatopoma
ニセノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zaptyx yukitai
ユキタノミギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/635 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sinoennea insularis
ツヤダワラ		———✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/5 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Videnoida cathcartae
ツヤカサマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/28 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Videnoida gouldiana
タカカサマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/28 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Videnoida horiomphala
オオカサマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/28 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bekkochlamys serena
スカシベッコウ		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/182 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bekkochlamys teramachii
テラマチベッコウ		———✓✓—/——/—No———0000/5 (0.0%)0/182 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ceratochlamys hiraseana
コシダカヒメベッコウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Danjochlamys meshimaensis
メシマベッコウ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Japanochlamys awaensis
アワクリイロベッコウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Liardetia boninensis
ボニンキビ		VU—✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/45 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Otesiopsis kawaguchii
カワグチレンズガイ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Otesiopsis yamamotoaizoi
ダンジョレンズガイ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Parakaliella hizenensis
ヒゼンキビ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parakaliella pagoduloides
ヒメハリマキビ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parakaliella ruida
スジキビ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sitalina insignis
カサネシタラ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Sitalina japonica
ウメムラシタラ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Takemasaia gudei
グゥドベッコウ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Trochochlamys labilis persubtilis
ヒラオオキビ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trochochlamys lioconus
オオタキキビ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trochochlamys longissima
ツシマナガキビ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trochochlamys praealta
タカキビ		——✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trochochlamys subcrenulata subcrenulata
ヒメカサキビ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Yamatochlamys circumdata
ハチジョウヒメベッコウ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponarion carinatus
オオコウラナメクジ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Deroceras monticola
ヤマコウラナメクジ		——✓✓✓—/——/—No———0222/261 (0.8%)2/265 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista aemula hadaka
ハダカケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/17 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista aemula shikokuensis
シコクケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/17 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista caerulea
ミズイロオオベソマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista carinata
カドバリオトメマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista cavicollis
クチマガリマイマイ		———✓—✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista caviconus
ヤギヅノマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista collinsoni collinsoni
タシナミオトメマイマイ		——————/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista collinsoni lischkeana
リシケオトメマイマイ		——————/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista conella
コウニケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista conomphala
ヘソカドケマイマイ		——✓✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista elegantissima
シュリケマイマイ		—✓✓✓——/——/—No———0050/17 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista esakii
エサキケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista friedeliana humerosa
コシキフリイデルマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista hatakedai hatakedai
ハタケダマイマイ		———✓——/——/—No———0050/17 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista hilgendorfi hilgendorfi
ヒルゲンドルフマイマイ		——————/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista itoi
イトウケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista kiusiuensis oshimana
オオシマケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista kobensis discus
ヒラコウベマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista kobensis gotoensis
ゴトウコウベマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista kobensis koshikijimana
コシキコウベマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista latizona
クロオビオトメマイマイ		——✓———/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista meiacoshimensis
ナガシリマルホソマイマイ		——————/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista mikuriyensis
コケラマイマイ		—✓—✓—✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista omma
オマオオベソマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista pallens
シロマイマイ		——✓———/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista pressa
ヒラケマイマイ		———✓——/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista proba goniosoma
カドコオオベソマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista tokyoensis
トウキョウコオオベソマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista trochula
ツシマケマイマイ		—✓—✓—✓/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista tumida cavata
キイオオベソマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aegista tumida tumida
フチマルオオベソマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/46 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Ainohelix io
アケボノマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Bradybaena circulus hiroshihorii
ホリマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0151/24 (4.2%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Bradybaena phaeogramma iheyaensis
イヘヤタメトモマイマイ		—✓—✓—✓/——/—No———0151/24 (4.2%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra brandtii sapporo
サッポロマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra decorata diminuta
ナンブマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra dixoni okicola
オキマイマイ		———✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra grata gratoides
ミチノクマイマイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra latispira yagurai
コウロマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra quaesita heguraensis
ヘグラマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra tokarainsula tokarainsula
クロマイマイ		———✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euhadra tokarainsula ujiensis
ウジグントウマイマイ		———✓✓—/——/—No———0151/26 (3.8%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Moellendorffia diminuta
コケハダシワクチマイマイ		—✓—✓——/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis borealis
キタノビロウドマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis bracteata bracteata
ウロコビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis fragilis
ケハダビロウドマイマイ		——✓✓✓✓/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis kawanai
カワナビロウドマイマイ		———✓✓✓/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis osumiensis
オオスミビロウドマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponochloritis pumila
キヌビロウドマイマイ		——✓✓✓✓/——/—No———0050/4 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma ammiralis
ハンミガキマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma caliginosa caliginosa
イッシキマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma cristata
アナナシマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma danzyoensis
ダンジョマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma fusca
コシタカコベソマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma mercatoria iejimana
イエジママイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma myomphala fukashimana
フカシマコベソマイマイ		——✓✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma okiensis
オキシメクチマイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma omphalodes
サンインコベソマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma pagodula
ヒメタマゴマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma papilliformis
ヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma tadai
タダマイマイ		———✓✓—/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma tanegashimae
タネガシママイマイ		—✓—✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Satsuma yaeyamensis
クロイワヒダリマキマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1543 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Solemya pusilla
キヌタレガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0131/19 (5.3%)2/57 (3.5%)—
NT
準絶滅危惧		Arcuatula japonica
ヤマホトトギス		——✓✓✓—/——/—No———02491/3 (33.3%)22/1506 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Modiolatus flavidus
サザナミマクラ		——✓✓✓—/——/—No———00490/1 (0.0%)22/1506 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Modiolus modulaides
コケガラス		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———01491/29 (3.4%)22/1506 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Modiolus philippinarum
ホソスジヒバリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.63 Gbp
209		301,873
18.4 kbp		11491/29 (3.4%)22/1506 (1.5%)2017-04-05
NT
準絶滅危惧		Arenifodiens vagina
イシワリマクラ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Magallana sikamea
シカメガキ		—✓✓✓✓✓/12—/—No———017346/13 (46.2%)16/338 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Atrina japonica
ズベタイラギ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Contig,
Reference		835 Mbp
260		3,391
911 kbp		1252/57 (3.5%)4/72 (5.6%)2023-02-20
NT
準絶滅危惧		Atrina lischkeana
タイラギ（リシケタイラギ）		—✓✓✓✓✓/——/—No———0252/57 (3.5%)4/72 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Pinna attenuata
ハボウキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0352/13 (15.4%)4/72 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Mimachlamys cloacata
ヒナノヒオウギの1種		—✓✓✓✓—/——/—No———02141/13 (7.7%)8/159 (5.0%)—
NT
準絶滅危惧		Inversiunio jokohamensis
ヨコハマシジラガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0080/6 (0.0%)8/890 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Pronodularia japanensis
マツカサガイ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0080/2 (0.0%)8/890 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Pegophysema philippiana
ショウゴインツキガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00230/2 (0.0%)12/189 (6.3%)—
NT
準絶滅危惧		Austriella corrugata
シワツキガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00230/1 (0.0%)12/189 (6.3%)—
NT
準絶滅危惧		Fragum loochooanum
オキナワヒシガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———06283/12 (25.0%)15/212 (7.1%)—
NT
準絶滅危惧		Fragum unedo
カワラガイ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———06283/12 (25.0%)15/212 (7.1%)—
NT
準絶滅危惧		Chion semigranosus
フジノハナガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Donax faba
リュウキュウナミノコ		—✓—✓✓✓/1—/—No———0333/44 (6.8%)3/48 (6.2%)—
NT
準絶滅危惧		Donax kiusiuensis
キュウシュウナミノコ		—✓—✓✓—/——/—No———0333/44 (6.8%)3/48 (6.2%)—
NT
準絶滅危惧		Latona cuneata
ナミノコ		—✓✓✓✓—/——/—No———0333/44 (6.8%)3/48 (6.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gari elongata
マスオガイ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Gari maculosa
アシガイ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Gari minor
ハザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Gari squamosa
ハスメヨシガイ		——✓✓✓—/——/—No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Gari chinensis
オチバ（コムラサキガイ）		——✓✓✓—/——/—No———0342/14 (14.3%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Psammotaea togata
ウラジロマスオ		——————/——/—No———0040/1 (0.0%)3/34 (8.8%)—
NT
準絶滅危惧		Semelangulus lacrimadugongi
ザンノナミダ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Thyellisca trigonalis
シロナノハナガイ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Solecurtus divaricatus
キヌタアゲマキ		—✓✓✓✓✓/12✓/✓No———0040/2 (0.0%)2/15 (13.3%)—
NT
準絶滅危惧		Solecurtus philippinarum
ミナミキヌタアゲマキ		——✓✓✓—/——/—No———0040/2 (0.0%)2/15 (13.3%)—
NT
準絶滅危惧		Clathrotellina carnicolor
ヒラセザクラ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Jactellina compta
ミクニシボリザクラ		——————/——/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Jactellina transcalpta
ハスメザクラ		———✓✓—/——/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Limecola contabulata
サビシラトリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Praetextellina praetexta
オオモモノハナ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Rexithaerus sectior
サギガイ		——✓✓✓—/——/—No———0070/1 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Jitlada juvenilis
トガリユウシオガイ		——✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Moerella hilaris
モモノハナ（エドザクラ）		——✓✓✓—/——/—No———0070/5 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Jitlada philippinarum
リュウキュウザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Jitlada culter
ユウシオガイ		—✓✓✓✓—/——/✓No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Nitidotellina hokkaidoensis
サクラガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/5 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Nitidotellina minuta
ウズザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/5 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Tonganaella perna
ダイミョウガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pharaonella sieboldii
ベニガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pinguitellina robusta
ウラキヒメザラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/5 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Serratina capsoides
ヌノメイチョウシラトリ		—✓✓✓✓✓/1—/✓No———0070/4 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Tellinella crucigera
ヒノデガイの1種		—✓✓✓✓✓/——/—No———0070/4 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Tellinides striatus
ヒラザクラ		——✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/91 (5.5%)—
NT
準絶滅危惧		Trapezium liratum
ウネナシトマヤガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/2 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Trapezium sublaevigatum
タガソデモドキ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/2 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Corbicula japonica
ヤマトシジミ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.07 Gbp
59		3,723
617 kbp		1333/489 (0.6%)3/511 (0.6%)2024-04-29
NT
準絶滅危惧		Lutraria arcuata
カモジガイ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———03122/8 (25.0%)7/49 (14.3%)—
NT
準絶滅危惧		Lutraria maxima
オオトリガイ		—✓—✓✓✓/—✓/✓No———03122/8 (25.0%)7/49 (14.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mactrotoma angulifera
ワカミルガイ		——✓✓✓—/——/—No———00120/1 (0.0%)7/49 (14.3%)—
NT
準絶滅危惧		Meropesta nicobarica
ユキガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00120/1 (0.0%)7/49 (14.3%)—
NT
準絶滅危惧		Atactodea striata
イソハマグリ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Coecella chinensis
クチバガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Anomalodiscus squamosus
シオヤガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00260/1 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Bonartemis histrio
オイノカガミ		—✓—✓——/——/—No———00260/1 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Callista erycina
フジイロハマグリ		—✓—✓✓✓/2—/—No———00260/2 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Circe undatina
シラオガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/8 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Clementia papyracea
カミブスマ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00260/1 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Gafrarium divaricatum
ケマンガイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———00260/19 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Katelysia japonica
スダレハマグリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00260/5 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Pitar lineolatus
ガンギハマグリ		——✓✓✓—/——/—No———00260/9 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Pitar pellucidus
オミナエシハマグリ		——✓✓✓—/——/—No———00260/9 (0.0%)16/283 (5.7%)—
NT
準絶滅危惧		Eufistulana grandis
コヅツガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Anisodevonia ohshimai
ヒノマルズキン		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/39 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Galeomma ambigua
コハクマメアゲマキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/1 (0.0%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Galeomma rosea
バライロマメアゲマキ		——————/——/—No———0010/4 (0.0%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Galeomma sp.
ニッポンマメアゲマキ		——————/——/—No———0010/4 (0.0%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lepirodes layardi
ミナミウロコガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lepirodes takii
ウロコガイ		——✓✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Litigiella pacifica
ユンタクシジミ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/39 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nipponomysella subtruncata
スジホシムシモドキヤドリガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/39 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Paraborniola matsumotoi
マツモトウロコガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/66 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Peregrinamor ohshimai
マゴコロガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/7 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudopythina macrophthalmensis
オサガニヤドリガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/66 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudopythina ochetostoma
ナタマメケボリガイ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/66 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pythina deshayesiana
セワケハチミツガイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/66 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Scintilla anomala
ツマベニマメアゲマキ		——✓✓✓—/——/—No———0111/17 (5.9%)1/56 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Scintilla philippinensis
ベッコウマメアゲマキ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Contig,
Reference		1.65 Gbp
55		6,132
491 kbp		1111/17 (5.9%)1/56 (1.8%)2024-12-04
NT
準絶滅危惧		Cryptomya elliptica
クシケマスオ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Mya japonica
オオノガイ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0221/9 (11.1%)1/13 (7.7%)—
NT
準絶滅危惧		Laternula truncata
ヒロクチソトオリガイ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0111/18 (5.6%)1/18 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Solen roseomaculatus
バラフマテ		——✓✓✓—/——/—No———0221/19 (5.3%)1/19 (5.3%)—
NT
準絶滅危惧		Solen sloanii
リュウキュウマテ		—✓✓✓✓—/——/—No———0221/19 (5.3%)1/19 (5.3%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Stratospongilla clementis
ヤワカイメン		——✓✓✓—/——/—No———00100/2 (0.0%)3/114 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Drawida hattamimizu
ハッタミミズ		LC✓—✓—✓/——/—No———0000/39 (0.0%)0/62 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Psathyropus tenuipes
ヒトハリザトウムシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/3 (0.0%)2/270 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Antrodiaetus roretzii
カネコトタテグモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/20 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Calommata signata
ワスレナグモ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0010/5 (0.0%)1/41 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Conothele fragaria
キノボリトタテグモ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/89 (0.0%)0/249 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Latouchia typica
キシノウエトタテグモ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/12 (0.0%)0/249 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Xysticus daisetsuzanus
ダイセツカニグモ		——✓✓——/——/—No———0221/151 (0.7%)1/723 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Eurydice akiyamai
ヒガタスナホリムシ		———✓✓—/——/—No———0010/3 (0.0%)1/103 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Jesogammarus annandalei
アナンデールヨコエビ		—✓✓✓——/1—/—No———0000/20 (0.0%)0/47 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Jesogammarus naritai
ナリタヨコエビ		—✓—✓—✓/1—/—No———0000/20 (0.0%)0/47 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Paracalliope dichotomus
シオカワヨコエビ		———✓✓—/——/—No———0000/7 (0.0%)0/14 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Atyoida pilipes
ミナミオニヌマエビ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———0030/4 (0.0%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Candidiopotamon okinawense
オキナワミナミサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/✓No———0000/5 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cardisoma rotundum
ヘリトリオカガニ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Caridina prashadi
サキシマヌマエビ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0131/333 (0.3%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Caridina propinqua
マングローブヌマエビ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0131/333 (0.3%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Caridina rubella
アシナガヌマエビ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0131/333 (0.3%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Coenobita brevimanus
オオナキオカヤドカリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		4.73 Gbp
69		10,080
1.76 Mbp		1121/18 (5.6%)2/20 (10.0%)2024-11-04
NT
準絶滅危惧		Coenobita violascens
コムラサキオカヤドカリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/18 (5.6%)2/20 (10.0%)—
NT
準絶滅危惧		Deiratonotus japonicus
カワスナガニ		—✓✓—✓✓/1—/✓No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Epigrapsus notatus
ヒメオカガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/2 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gaetice ungulatus
オキナワヒライソガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/3 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Gecarcoidea lalandii
ムラサキオカガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/2 (0.0%)0/20 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa exigua
ミカゲサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa marginata fulva
カッショクサワガニ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa marginata marginata
ムラサキサワガニ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa minei
ミネイサワガニ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa obtusipes
リュウキュウサワガニ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Geothelphusa sakamotoana
サカモトサワガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/72 (0.0%)0/515 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Halocaridinides trigonophthalma
チカヌマエビ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0030/2 (0.0%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Ilyoplax deschampsi
ハラグクレチゴガニ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/21 (0.0%)0/49 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macrobrachium gracilirostre
ツブテナガエビ		LC✓✓✓✓✓/6—/—No———0793/281 (1.1%)4/1040 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Macrobrachium latidactylus
ヒラアシテナガエビ		LC✓✓✓✓✓/6—/—No———0793/281 (1.1%)4/1040 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Macrobrachium shokitai
ショキタテナガエビ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0793/281 (1.1%)4/1040 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Metabetaeus minutus
オハグロテッポウエビ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/5 (0.0%)0/1002 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Moguai elongatum
コウナガカワスナガニ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Neocaridina iriomotensis
イリオモテヌマエビ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0131/32 (3.1%)3/531 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Neorhynchoplax yaeyamaensis
ヤエヤマヤワラガニ		——✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/29 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Paramoguai pyriforme
ヨウナシカワスナガニ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Ptychognathus takahashii
ヨツハヒライソモドキ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/27 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ryukyum yaeyamense
ヤエヤマヤマガニ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/1 (0.0%)0/515 (0.0%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Isoetes asiatica
ヒメミズニラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0222/205 (1.0%)2/205 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Isoetes japonica
ミズニラ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0222/205 (1.0%)2/205 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Selaginella doederleinii var. opaca
コウヅシマクラマゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0333/398 (0.8%)3/407 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Selaginella flagellifera
ツルカタヒバ		———✓✓—/——/—No———0333/398 (0.8%)3/407 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Psilotum nudum
マツバラン		LC✓✓✓✓—/4✓/—No———0000/2 (0.0%)0/14 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Botrychium formosanum
ホウライハナワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/143 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ophioglossum namegatae
トネハナヤスリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/50 (0.0%)0/143 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ptisana boninensis
リュウビンタイモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/22 (0.0%)0/159 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Crepidomanes makinoi
コケホラゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/32 (0.0%)0/453 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Salvinia natans
サンショウモ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———00100/22 (0.0%)7/43 (16.3%)—
NT
準絶滅危惧		Marsilea quadrifolia
デンジソウ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0000/40 (0.0%)0/46 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Lindsaea heterophylla
エダウチクジャク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/151 (0.0%)0/200 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Lindsaea orbiculata var. orbiculata
マルバホングウシダ		—✓✓✓——/1—/—No———0000/151 (0.0%)0/200 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Lindsaea repanda
ムニンエダウチホングウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/151 (0.0%)0/200 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Adiantum diaphanum
スキヤクジャク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0252/235 (0.9%)3/1210 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cheilanthes argentea
ヒメウラジロ		—✓—✓✓—/1—/—No———0050/40 (0.0%)3/1210 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cryptogramma crispa
リシリシノブ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0050/10 (0.0%)3/1210 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cryptogramma stelleri
ヤツガタケシノブ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0050/10 (0.0%)3/1210 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Pteris deltodon
クマガワイノモトソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/258 (0.0%)3/1210 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Microlepia hookeriana
ヤンバルフモトシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/44 (0.0%)0/173 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Microlepia substrigosa
ウスバイシカグマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/44 (0.0%)0/173 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asplenium antiquum
オオタニワタリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/454 (0.0%)0/514 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asplenium ruta-muraria
イチョウシダ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0000/454 (0.0%)0/514 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asplenium varians
イノウエトラノオ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/454 (0.0%)0/514 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hymenasplenium apogamum
タイワンホウビシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/58 (0.0%)0/514 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Woodsia ilvensis
ミヤマイワデンダ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0000/25 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Woodsia intermedia
イヌイワデンダ		—✓✓✓——/——/—No———0000/25 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Woodwardia kempii
ホソバオオカグマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/15 (0.0%)2/195 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Deparia bonincola
オオシケシダ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/445 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplazium crassiusculum
イブダケキノボリシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/241 (0.0%)0/445 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplazium okinawaense
オキナワコクモウクジャク		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/241 (0.0%)0/445 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplazium pullingeri
ハンコクシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/241 (0.0%)0/445 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Diplazium wichurae var. amabile
ヒメノコギリシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/241 (0.0%)0/445 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Thelypteris boninensis
オオホシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/113 (0.0%)0/637 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Thelypteris gymnocarpa subsp. amabilis
ヒメミゾシダ		————✓—/——/—No———0000/113 (0.0%)0/637 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hypodematium fauriei
キンモウワラビ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/28 (0.0%)0/31 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Arachniodes davalliiformis
ハチジョウカナワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0040/99 (0.0%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Ctenitis sinii
サツマシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/68 (0.0%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Dryopteris formosana
タカサゴシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/424 (0.2%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Dryopteris hadanoi
ニセヨゴレイタチシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0141/424 (0.2%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Dryopteris shiroumensis
シロウマイタチシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0141/424 (0.2%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Dryopteris yakusilvicola
コスギイタチシダ		—✓✓✓——/1—/—No———0141/424 (0.2%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Polystichum capillipes
イナデンダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Polystichum otomasui
ナンピイノデ		—✓—✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1418 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Lepisorus boninensis
ホソバクリハラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/86 (0.0%)0/1352 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum costatum
トサノアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum dimidiatum
クロフネサイシン		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum dissitum
オモロカンアオイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum hexalobum var. perfectum
キンチャクアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum lutchuense
オオバカンアオイ		EN✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum megacalyx
コシノカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum savatieri subsp. pseudosavatieri var. pseudosavatieri
ズソウカンアオイ		—✓✓✓——/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum savatieri subsp. savatieri
オトメアオイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asarum tokarense
トカラカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Magnolia stellata
シデコブシ		EN✓✓✓✓—/4—/—No———010119/282 (3.2%)10/289 (3.5%)—
NT
準絶滅危惧		Beilschmiedia erythrophloia
アカハダクスノキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00210/103 (0.0%)11/1589 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cassytha filiformis var. duripraticola
ケスナヅル		—✓————/——/—No———00210/11 (0.0%)11/1589 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cinnamomum daphnoides
マルバニッケイ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———03213/141 (2.1%)11/1589 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cinnamomum sieboldii
ニッケイ		DD✓✓✓✓—/——/—No———03213/141 (2.1%)11/1589 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Arisaema heterophyllum
マイヅルテンナンショウ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———00270/150 (0.0%)12/1781 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Arisaema iyoanum subsp. iyoanum
オモゴウテンナンショウ		—✓————/——/—No———00270/150 (0.0%)12/1781 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Arisaema sikokianum
ユキモチソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00270/150 (0.0%)12/1781 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Calla palustris
ヒメカイウ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00270/1 (0.0%)12/1781 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Sagittaria aginashi
アギナシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/44 (0.0%)1/142 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Halophila ovalis
ウミヒルモ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0141/51 (2.0%)3/219 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrocharis dubia
トチカガミ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0040/3 (0.0%)3/219 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Najas chinensis
サガミトリゲモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/30 (0.0%)3/219 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Najas gracillima
イトトリゲモ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0040/30 (0.0%)3/219 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ottelia alismoides
ミズオオバコ		LC✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		6.46 Gbp
10		13,319
699 kbp		1141/39 (2.6%)3/219 (1.4%)2024-03-19
NT
準絶滅危惧		Thalassia hemprichii
リュウキュウスガモ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0241/2 (50.0%)3/219 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Triglochin maritima
オオシバナ		LC✓✓✓✓—/6—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.06 Gbp
143		358
20.9 Mbp		2442/23 (8.7%)2/28 (7.1%)2023-12-07
NT
準絶滅危惧		Triglochin maritima subsp. asiatica
シバナ		—✓——✓—/1—/—No———2442/23 (8.7%)2/28 (7.1%)—
NT
準絶滅危惧		Phyllospadix japonicus
エビアマモ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———0351/5 (20.0%)3/26 (11.5%)—
NT
準絶滅危惧		Zostera caespitosa
スゲアマモ		VU✓✓✓✓—/2—/✓No———0252/20 (10.0%)3/26 (11.5%)—
NT
準絶滅危惧		Potamogeton berchtoldii
イトモ		LC✓✓✓✓—/8—/—No———019219/127 (7.1%)10/173 (5.8%)—
NT
準絶滅危惧		Potamogeton pectinatus
リュウノヒゲモ		LC✓✓✓✓—/6—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		881 Mbp
27		1,810
3.98 Mbp		22211/19 (5.3%)10/173 (5.8%)2025-10-26
NT
準絶滅危惧		Ruppia maritima
カワツルモ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0050/23 (0.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Cymodocea rotundata
ベニアマモ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0351/4 (25.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Cymodocea serrulata
リュウキュウアマモ		LC✓—✓✓—/2—/—No———0351/4 (25.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Halodule pinifolia
マツバウミジグサ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0050/5 (0.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Halodule uninervis
ウミジグサ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0050/5 (0.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Syringodium isoetifolium
シオニラ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0151/2 (50.0%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Sciaphila nana
ホンゴウソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Smilax biflora var. biflora
ヒメカカラ		——————/——/—No———0111/197 (0.5%)1/200 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Fritillaria amabilis
ホソバナコバイモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0090/140 (0.0%)9/763 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Fritillaria shikokiana
トサコバイモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0090/140 (0.0%)9/763 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lilium maculatum var. monticola
ヤマスカシユリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0191/155 (0.6%)9/763 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lilium rubellum
ヒメサユリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0191/155 (0.6%)9/763 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Tricyrtis ohsumiensis
タカクマホトトギス		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/35 (0.0%)9/763 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bletilla striata var. striata
シラン		——————/——/—No———01351/5 (20.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bulbophyllum drymoglossum
マメヅタラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/700 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bulbophyllum inconspicuum
ムギラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/700 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bulbophyllum japonicum
ミヤマムギラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00350/700 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Calanthe discolor var. discolor
エビネ		————✓—/——/—No———00350/78 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cephalanthera erecta var. subaphylla
ユウシュンラン		—✓—✓✓—/——/—No———00350/20 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cephalanthera falcata
キンラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/20 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cephalantheropsis obcordata
トクサラン		—✓—✓✓—/2—/—No———00350/5 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cymbidium nipponicum
サガミラン		———✓✓—/——/—No———03352/111 (1.8%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cypripedium debile
コアツモリソウ		VU✓✓✓✓—/3—/—No———00350/67 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cypripedium macranthos var. rebunense
レブンアツモリソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———00350/67 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Didymoplexis pallens
ユウレイラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00350/2 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Epipogium roseum
タシロラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00350/2 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Galearis cyclochila
カモメラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/9 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Habenaria sagittifera
ミズトンボ		——✓✓✓—/——/—No———00350/322 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Hemipilia graminifolia var. graminifolia
ウチョウラン		————✓—/——/—No———00350/20 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Hemipilia joo-iokiana
ニョホウチドリ		——✓✓✓—/——/—No———00350/20 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lecanorchis kiusiana
ウスギムヨウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00350/14 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lecanorchis triloba
オキナワムヨウラン		———✓✓—/——/—No———00350/14 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lecanorchis vietnamica
シラヒゲムヨウラン		——✓✓✓—/——/—No———00350/14 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Luisia teres
ボウラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00350/20 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Neofinetia falcata
フウラン		—✓✓✓✓—/5—/—No———00350/69 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Nervilia aragoana
ヤエヤマヒトツボクロ		—✓—✓✓—/——/—No———00350/60 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Nervilia nipponica
ムカゴサイシン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/60 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Odontochilus yakushimensis
ヤクシマヒメアリドオシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00350/17 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Pecteilis radiata
サギソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00350/5 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Pogonia japonica
トキソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00350/5 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zeuxine agyokuana
カゲロウラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00350/16 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Zeuxine leucochila
ヤンバルキヌラン		———✓✓—/——/—No———00350/16 (0.0%)24/11722 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Iris gracilipes
ヒメシャガ		—✓✓✓✓—/1—/—No———07225/305 (1.6%)19/1511 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Iris laevigata
カキツバタ		—✓✓✓✓—/4—/—No———07225/305 (1.6%)19/1511 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Allium schoenoprasum var. shibutuense
シブツアサツキ		——————/——/—No———0793/663 (0.5%)5/1545 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Allium virgunculae var. virgunculae
イトラッキョウ		———✓✓—/——/—No———0793/663 (0.5%)5/1545 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Hosta polyneuronoides
オクスダレギボウシ		—✓——✓—/——/—No———00190/47 (0.0%)15/1629 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Polygonatum x desoulavyi
コウライワニグチソウ		—✓————/2—/—No———00190/73 (0.0%)15/1629 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Satakentia liukiuensis
ヤエヤマヤシ		DD✓✓✓✓—/2—/—No———00250/1 (0.0%)11/2327 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Monochoria korsakowii
ミズアオイ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0222/29 (6.9%)2/45 (4.4%)—
NT
準絶滅危惧		Sparganium erectum var. erectum
ミクリ		——————/——/—No———2593/47 (6.4%)6/77 (7.8%)—
NT
準絶滅危惧		Sparganium fallax
ヤマトミクリ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———0593/47 (6.4%)6/77 (7.8%)—
NT
準絶滅危惧		Sparganium glomeratum var. glomeratum
タマミクリ		——————/——/—No———0593/47 (6.4%)6/77 (7.8%)—
NT
準絶滅危惧		Sparganium japonicum
ナガエミクリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0593/47 (6.4%)6/77 (7.8%)—
NT
準絶滅危惧		Eriocaulon atrum
クロイヌノヒゲ		——✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/530 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Eriocaulon parvum
クロホシクサ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/530 (0.2%)—
NT
準絶滅危惧		Juncus beringensis
ミヤマイ		——✓✓✓—/——/—No———012164/164 (2.4%)6/286 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Juncus triglumis
タカネイ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———012164/164 (2.4%)6/286 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Luzula arcuata subsp. unalaschkensis
クモマスズメノヒエ		—✓✓✓✓—/1—/—No———04162/95 (2.1%)6/286 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Luzula piperi
コゴメヌカボシ		—✓✓✓✓—/2—/—No———04162/95 (2.1%)6/286 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Bulbostylis densa var. capitata
イトテンツキ		———✓✓—/——/—No———00790/77 (0.0%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex diandra
クリイロスゲ		LC✓✓✓✓—/8—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex gmelinii
ネムロスゲ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex hymenodon
ヤマクボスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex kujuzana
クジュウツリスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex lachenalii
タカネヤガミスゲ		LC✓✓✓✓—/10—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex lithophila
アサマスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex matsumurae
キノクニスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex morrowii var. laxa
ヤクシマカンスゲ		———✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex myosuroides
ヒゲハリスゲ		—✓✓✓✓—/10—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		413 Mbp
56		262
12.0 Mbp		1447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)2023-01-31
NT
準絶滅危惧		Carex nemurensis
ホソバオゼヌマスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex okuboi
シマタヌキラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex pauciflora
タカネハリスゲ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex rugulosa
オオクグ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex sacrosancta
ジングウスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex sakonis
サコスゲ		———✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex scita var. tenuiseta
アシボソスゲ		————✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex subspathacea
ヒメウシオスゲ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex tamakii
オキナワヒメナキリ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex traiziscana
ヒロハオゼヌマスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex viridula
エゾサワスゲ		—✓—✓——/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Carex yakushimensis
コケハリガネスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0447926/1667 (1.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Fimbristylis ovata
ヤリテンツキ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00790/3 (0.0%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Trichophorum alpinum
ヒメワタスゲ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———02791/18 (5.6%)47/3597 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Agrostis valvata
ヒメコヌカグサ		——✓✓✓—/——/—No———0412373/107 (2.8%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Arundinella riparia
ミギワトダシバ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0012370/30 (0.0%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Coelachne japonica
ヒナザサ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0012370/4 (0.0%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Eulalia quadrinervis
ウンヌケモドキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0012370/8 (0.0%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Festuca parvigluma var. breviaristata
イブキトボシガラ		———✓✓—/——/—No———0312373/355 (0.8%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Leersia hexandra
タイワンアシカキ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0312372/11 (18.2%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Setaria distans
コゴメビエ		—✓✓✓✓—/——/—No———01212372/104 (1.9%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Tripogon chinensis
ネズミシバ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0012370/14 (0.0%)204/8832 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Corydalis raddeana
ナガミノツルキケマン		—✓✓✓✓—/——/—No———02192/319 (0.6%)14/673 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Epimedium grandiflorum var. grandiflorum
ヤチマタイカリソウ		———✓——/——/—No———0060/82 (0.0%)4/463 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Epimedium trifoliatobinatum subsp. maritimum
シオミイカリソウ		———✓✓—/——/—No———0060/82 (0.0%)4/463 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Ranzania japonica
トガクシソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0060/1 (0.0%)4/463 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Aconitum chrysopilum
イブキレイジンソウ		—✓—✓——/——/—No———00270/229 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Adonis multiflora
ミチノクフクジュソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———02271/26 (3.8%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Anemone dichotoma
フタマタイチゲ		—✓—✓✓—/——/—No———00270/7 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Clematis patens
カザグルマ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00270/239 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Dichocarpum hakonense
ハコネシロカネソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00270/29 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Eranthis pinnatifida
セツブンソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00270/14 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hepatica nobilis var. japonica
ミスミソウ		—✓—✓✓—/2—/—No———00270/10 (0.0%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Pulsatilla cernua
オキナグサ		—✓✓✓✓—/4✓/✓No———01271/37 (2.7%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ranunculus grandis var. austrokurilensis
シコタンキンポウゲ		———✓✓—/——/—No———06274/440 (0.9%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ranunculus reptans
イトキンポウゲ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———06274/440 (0.9%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ranunculus silerifolius var. yaegatakensis
ヒメキツネノボタン		——✓✓✓—/——/—No———06274/440 (0.9%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Thalictrum aquilegiifolium var. sibiricum
マンセンカラマツ		—✓✓✓✓—/2—/—No———05272/139 (1.4%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Thalictrum kubotae
タイシャクカラマツ		——✓✓✓—/——/—No———05272/139 (1.4%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Thalictrum nakamurae
ヒメミヤマカラマツ		——✓✓✓—/——/—No———05272/139 (1.4%)16/1965 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Buxus microphylla var. insularis
チョウセンヒメツゲ		—✓————/——/—No———0231/105 (1.0%)2/140 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Paeonia japonica
ヤマシャクヤク		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/67 (1.5%)1/67 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Corylopsis glabrescens
キリシマミズキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0030/21 (0.0%)3/103 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Corylopsis spicata
トサミズキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0030/21 (0.0%)3/103 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Hamamelis japonica var. bitchuensis
アテツマンサク		—✓✓✓✓—/3—/—No———0131/9 (11.1%)3/103 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Ribes ambiguum var. ambiguum
ヤシャビシャク		—✓————/2—/—No———0994/142 (2.8%)4/142 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Asimitellaria acerina
モミジチャルメルソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/11 (0.0%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Asimitellaria kiusiana
ツクシチャルメルソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/11 (0.0%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Asimitellaria stylosa
タキミチャルメルソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/11 (0.0%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Astilbe odontophylla var. okuyamae
ミカワショウマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0080/31 (0.0%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Astilbe thunbergii var. longipedicellata
ツクシアカショウマ		———✓✓—/——/—No———0080/31 (0.0%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysosplenium album var. flavum
キバナハナネコノメ		—✓✓✓✓—/——/—No———0181/74 (1.4%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysosplenium maximowiczii
ムカゴネコノメ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0181/74 (1.4%)7/826 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Crassula aquatica
アズマツメクサ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00200/159 (0.0%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Orostachys japonica
ツメレンゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00200/18 (0.0%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sedum formosanum
ハママンネングサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———03202/265 (0.8%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sedum hakonense
マツノハマンネングサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———03202/265 (0.8%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sedum rupifragum
オオメノマンネングサ		—✓—✓✓—/——/—No———03202/265 (0.8%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sedum satumense
サツママンネングサ		—✓—✓——/——/—No———03202/265 (0.8%)16/1291 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Penthorum chinense
タコノアシ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Myriophyllum ussuriense
タチモ		LC✓✓✓✓—/4—/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		305 Mbp
150		203
42.7 Mbp		1664/74 (5.4%)4/146 (2.7%)2024-11-04
NT
準絶滅危惧		Entada phaseoloides
コウシュンモダマ		—✓✓✓✓—/4—/—No———004120/25 (0.0%)174/16327 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Lespedeza thunbergii subsp. satsumensis
サツマハギ		—✓—✓✓—/——/—No———014121/65 (1.5%)174/16327 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Lespedeza tomentosa
イヌハギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———014121/65 (1.5%)174/16327 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Mucuna gigantea
ワニグチモダマ		—✓✓✓✓—/4—/—No———034121/58 (1.7%)174/16327 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Polygala tatarinowii
ヒナノキンチャク		—✓✓✓✓—/2—/—No———0221/154 (0.6%)1/702 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Alchemilla japonica
ハゴロモグサ		—✓✓✓✓—/2—/—No———014011/258 (0.4%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Osteomeles anthyllidifolia var. subrotunda
テンノウメ		——✓✓✓—/——/—No———004010/5 (0.0%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Photinia wrightiana
シマカナメモチ		—✓✓✓✓—/3—/—No———004010/44 (0.0%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Rosa hirtula
サンショウバラ		—✓✓✓✓—/——/—No———02840114/294 (4.8%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Rubus peltatus
ハスノハイチゴ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0144017/753 (0.9%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Rubus pseudoacer
ミヤマモミジイチゴ		—✓✓✓✓—/——/—No———0144017/753 (0.9%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Rubus pungens var. oldhamii
サナギイチゴ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0144017/753 (0.9%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Sanguisorba canadensis subsp. latifolia var. riishirensis
リシリトウウチソウ		——————/——/—No———004010/24 (0.0%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Spiraea nipponica var. ogawae
キイシモツケ		—✓—✓✓—/——/—No———024012/109 (1.8%)129/3873 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Elaeagnus matsunoana
ハコネグミ		—✓—✓✓—/——/—No———0393/79 (3.8%)8/94 (8.5%)—
NT
準絶滅危惧		Paliurus ramosissimus
ハマナツメ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00240/9 (0.0%)9/930 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rhamnella franguloides var. inaequilatera
ヤエヤマネコノチチ		——✓✓✓—/——/—No———01241/12 (8.3%)9/930 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rhamnus yoshinoi
キビノクロウメモドキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00240/120 (0.0%)9/930 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ficus nishimurae
オオトキワイヌビワ		—✓✓✓✓—/4—/—No———013267/787 (0.9%)15/1214 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Boehmeria formosana
タイワントリアシ		—✓✓✓✓—/——/—No———04121/71 (1.4%)4/1114 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Boehmeria yaeyamensis
ヤエヤマラセイタソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———04121/71 (1.4%)4/1114 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Elatostema densiflorum
トキホコリ		———✓✓—/——/—No———00120/211 (0.0%)4/1114 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Elatostema suzukii
クニガミサンショウヅル		—✓✓✓✓—/1—/—No———00120/211 (0.0%)4/1114 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Alnus trabeculosa
サクラバハンノキ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———08324/33 (12.1%)14/215 (6.5%)—
NT
準絶滅危惧		Betula davurica var. davurica
ヤエガワカンバ		—✓————/3—/—No———04322/87 (2.3%)14/215 (6.5%)—
NT
準絶滅危惧		Begonia formosana
マルヤマシュウカイドウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0666/1035 (0.6%)6/1036 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Euonymus boninensis
ヒメマサキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0241/94 (1.1%)2/745 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnosporia diversifolia
ハリツルマサキ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0040/46 (0.0%)2/745 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Tripterygium doianum
コバノクロヅル		—✓✓✓✓—/1—/—No———0241/6 (16.7%)2/745 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euphorbia adenochlora
ノウルシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0249417/1306 (1.3%)48/3687 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euphorbia ebracteolata
マルミノウルシ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0249417/1306 (1.3%)48/3687 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Euphorbia sendaica
センダイタイゲキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0249417/1306 (1.3%)48/3687 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Tristellateia australasiae
コウシュンカズラ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/16 (0.0%)0/739 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Salix fuscescens
ミヤマヤチヤナギ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0438217/464 (3.7%)36/888 (4.1%)—
NT
準絶滅危惧		Salix hukaoana
ユビソヤナギ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0438217/464 (3.7%)36/888 (4.1%)—
NT
準絶滅危惧		Salix taraikensis
タライカヤナギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0438217/464 (3.7%)36/888 (4.1%)—
NT
準絶滅危惧		Viola awagatakensis
アワガタケスミレ		———✓——/——/—No———0995/414 (1.2%)5/651 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Viola crassa subsp. crassa
タカネスミレ		————✓—/——/—No———0995/414 (1.2%)5/651 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Viola hultenii
チシマウスバスミレ		——✓✓✓—/——/—No———0995/414 (1.2%)5/651 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Viola langsdorfii subsp. sachalinensis
オオバタチツボスミレ		———✓✓—/——/—No———0995/414 (1.2%)5/651 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hypericum hakonense
ハコネオトギリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———013136/369 (1.6%)6/440 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Geranium shikokianum var. shikokianum
イヨフウロ		——✓✓——/——/—No———0133710/185 (5.4%)30/531 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Geranium soboliferum var. hakusanense
アサマフウロ		—✓—✓✓—/——/—No———0133710/185 (5.4%)30/531 (5.6%)—
NT
準絶滅危惧		Lagerstroemia subcostata var. fauriei
ヤクシマサルスベリ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		481 Mbp
90		274,516
2.36 kbp		13243/38 (7.9%)11/421 (2.6%)2022-10-23
NT
準絶滅危惧		Lagerstroemia subcostata var. subcostata
シマサルスベリ		—✓—✓——/2—/—No———03243/38 (7.9%)11/421 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Rotala mexicana
ミズマツバ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———00240/27 (0.0%)11/421 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Rotala rosea
ミズキカシグサ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———00240/27 (0.0%)11/421 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Sonneratia alba
マヤプシギ		LC✓✓✓✓—/5—/—Yes (2)Scaffold,
Reference		207 Mbp
497		151
4.01 Mbp		23242/12 (16.7%)11/421 (2.6%)2020-02-19
NT
準絶滅危惧		Ludwigia epilobioides subsp. greatrexii
ウスゲチョウジタデ		———✓✓—/——/—No———0090/67 (0.0%)6/476 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Blastus cochinchinensis
ミヤマハシカンボク		—✓✓✓✓—/4—/—No———0050/13 (0.0%)4/3334 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Osbeckia chinensis
ヒメノボタン		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/15 (0.0%)4/3334 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Citrus tachibana
タチバナ		—✓—✓——/5—/—No———09611228/205 (13.7%)39/1536 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Zanthoxylum schinifolium var. okinawense
シマイヌザンショウ		————✓—/——/—No———051123/215 (1.4%)39/1536 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Wikstroemia pseudoretusa
ムニンアオガンピ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0181/35 (2.9%)7/568 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Cardamine kokaiensis
コカイタネツケバナ		—✓✓✓✓—/——/—No———0137758/231 (3.5%)117/3514 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Rorippa cantoniensis
コイヌガラシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———007750/67 (0.0%)117/3514 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Balanophora yakushimensis
ヤクシマツチトリモチ		—✓✓✓✓—/1—/—Yes (1)Contig,
Reference		1.24 Gbp
46.7		4,730
645 kbp		1111/27 (3.7%)1/47 (2.1%)2024-08-20
NT
準絶滅危惧		Taxillus nigrans
ニンドウバノヤドリギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0121/25 (4.0%)2/381 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Limonium tetragonum
ハマサジ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0232/295 (0.7%)3/632 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Persicaria foliosa var. nikaii
サイコクヌカボ		———✓✓—/——/—No———07374/85 (4.7%)20/993 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Persicaria foliosa var. paludicola
ヤナギヌカボ		———✓✓—/——/—No———07374/85 (4.7%)20/993 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Persicaria hastatosagittata
ナガバノウナギツカミ		—✓✓✓✓—/1—/—No———07374/85 (4.7%)20/993 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Persicaria trigonocarpa
ホソバイヌタデ		——✓✓✓—/——/—No———07374/85 (4.7%)20/993 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rumex dentatus subsp. klotzschianus
コギシギシ		—✓——✓—/——/—No———06375/128 (3.9%)20/993 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Drosera peltata var. nipponica
イシモチソウ		———✓✓—/——/—No———0343/91 (3.3%)4/93 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Cerastium fischerianum var. molle
ゲンカイミミナグサ		———✓✓—/——/—No———00370/120 (0.0%)24/2137 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Silene keiskei var. keiskei
オオビランジ		——————/——/—No———010377/618 (1.1%)24/2137 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Cornus suecica
エゾゴゼンタチバナ		—✓✓✓✓—/5—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		849 Mbp
52		593
2.79 Mbp		2664/79 (5.1%)4/104 (3.8%)2024-01-15
NT
準絶滅危惧		Hydrangea liukiuensis
リュウキュウコンテリギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0661/136 (0.7%)1/262 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Hydrangea luteovenosa var. yakusimensis
ヤクシマガクウツギ		———✓✓—/——/—No———0661/136 (0.7%)1/262 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Diospyros egbertwalkeri
ヤエヤマコクタン		——————/——/—No———0772/434 (0.5%)2/467 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Lysimachia decurrens
シマギンレイカ		—✓✓✓✓—/5—/—No———05253/174 (1.7%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Myrsine stolonifera
ツルマンリョウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———01251/88 (1.1%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Primula sieboldii
サクラソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———010255/378 (1.3%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Primula tosaensis var. brachycarpa
シナノコザクラ		—✓—✓✓—/——/—No———010255/378 (1.3%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Primula tosaensis var. tosaensis
イワザクラ		———✓——/——/—No———010255/378 (1.3%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Samolus parviflorus
ハイハマボッス		—✓✓✓✓—/3—/—No———02251/13 (7.7%)14/1503 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Shortia rotundifolia
シマイワウチワ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/17 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chimaphila umbellata
オオウメガサソウ		—✓✓✓✓—/9—/—No———00660/5 (0.0%)42/3032 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Rhododendron mucronulatum var. ciliatum
ゲンカイツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———1256618/796 (2.3%)42/3032 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Rhododendron pentaphyllum var. pentaphyllum
ツクシアケボノツツジ		———✓——/——/—No———0256618/796 (2.3%)42/3032 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Lasianthus hispidulus
ニコゲルリミノキ		——✓✓✓—/——/—No———00510/65 (0.0%)34/6206 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Leptodermis pulchella
シチョウゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———01511/47 (2.1%)34/6206 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Leptopetalum biflorum
シマソナレムグラ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00510/7 (0.0%)34/6206 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Leptopetalum grayi
シマザクラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00510/7 (0.0%)34/6206 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Gentiana glauca
ヨコヤマリンドウ		—✓✓✓✓—/4—/—No———04104/282 (1.4%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Gentianella auriculata
チシマリンドウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———02101/99 (1.0%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Gentianopsis yabei var. yabei
シロウマリンドウ		——————/——/—No———00100/19 (0.0%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Swertia pseudochinensis
ムラサキセンブリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00100/99 (0.0%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Swertia tosaensis
イヌセンブリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00100/99 (0.0%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tripterospermum japonicum var. involubile
テングノコヅチ		———✓✓—/——/—No———00100/34 (0.0%)8/1138 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Amsonia elliptica
チョウジソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00280/16 (0.0%)20/3319 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Vincetoxicum acuminatum
クサタチバナ		—✓—✓✓—/1—/—No———00280/139 (0.0%)20/3319 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Vincetoxicum atratum
フナバラソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00280/139 (0.0%)20/3319 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Vincetoxicum pycnostelma
スズサイコ		—✓—✓✓—/2—/—No———00280/139 (0.0%)20/3319 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Vincetoxicum tanakae var. glabrescens
ケナシツルモウリンカ		————✓—/——/—No———00280/139 (0.0%)20/3319 (0.6%)—
NT
準絶滅危惧		Forsythia japonica
ヤマトレンギョウ		—✓—✓✓—/3—/—No———05793/21 (14.3%)43/597 (7.2%)—
NT
準絶滅危惧		Jasminum superfluum
オキナワソケイ		—✓✓✓✓—/——/—No———01791/114 (0.9%)43/597 (7.2%)—
NT
準絶滅危惧		Osmanthus fragrans var. aurantiacus f. thunbergii
ウスギモクセイ		——————/——/—No———11791/40 (2.5%)43/597 (7.2%)—
NT
準絶滅危惧		Deinostema adenocaulum
マルバノサワトウガラシ		——————/——/—No———00540/1 (0.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ellisiophyllum pinnatum var. reptans
キクガラクサ		———✓✓—/——/—No———00540/1 (0.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Lagotis glauca
ウルップソウ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00540/27 (0.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Veronica javanica
ハマクワガタ		—✓✓✓✓—/3—/—No———015548/392 (2.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Veronica polita subsp. lilacina
イヌノフグリ		——✓✓✓—/——/—No———015548/392 (2.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Veronica undulata
カワヂシャ		—✓✓✓✓—/4—/—No———015548/392 (2.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Scrophularia buergeriana
ゴマノハグサ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0080/211 (0.0%)4/1034 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Scrophularia grayanoides
ハマヒナノウスツボ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0080/211 (0.0%)4/1034 (0.4%)—
NT
準絶滅危惧		Ajuga makinoi
タチキランソウ		——✓✓✓—/——/—No———05972/43 (4.7%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Chelonopsis longipes
タニジャコウソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00970/13 (0.0%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Clinopodium multicaule var. yakusimense
コケトウバナ		—✓✓✓✓—/——/—No———01971/84 (1.2%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Lamium album var. kitadakense
キタダケオドリコソウ		—✓—✓✓—/——/—No———04972/28 (7.1%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Loxocalyx ambiguus
マネキグサ		—✓✓✓✓—/——/—No———00970/3 (0.0%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mentha japonica
ヒメハッカ		—✓✓✓✓—/——/—No———07974/51 (7.8%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mosla japonica var. hadae
オオヤマジソ		———✓✓—/——/—No———00970/14 (0.0%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mosla japonica var. japonica
ヤマジソ		——————/——/—No———00970/14 (0.0%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Pogostemon stellatus
ミズネコノオ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———02971/49 (2.0%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Salvia plebeia
ミゾコウジュ		—✓✓✓✓—/5—/✓No———014978/726 (1.1%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Scutellaria tsusimensis
アツバタツナミソウ		—✓—✓✓—/——/—No———06974/278 (1.4%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Teucrium teinense
テイネニガクサ		———✓✓—/——/—No———04972/122 (1.6%)59/4416 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Centranthera cochinchinensis subsp. lutea
ゴマクサ		———✓✓—/——/—No———00220/2 (0.0%)16/1424 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Microcarpaea minima
スズメハコベ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———00540/1 (0.0%)40/1691 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Siphonostegia laeta
オオヒキヨモギ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00220/3 (0.0%)16/1424 (1.1%)—
NT
準絶滅危惧		Utricularia australis
イヌタヌキモ		LC✓✓✓——/5—/—No———0252/213 (0.9%)5/352 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Utricularia macrorhiza
オオタヌキモ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0252/213 (0.9%)5/352 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Utricularia minor
ヒメタヌキモ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0252/213 (0.9%)5/352 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Utricularia uliginosa
ムラサキミミカキグサ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0252/213 (0.9%)5/352 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Utricularia ｘ japonica
タヌキモ		—✓—✓——/——/—No———0252/213 (0.9%)5/352 (1.4%)—
NT
準絶滅危惧		Staurogyne concinnula
タイワンサギゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00110/28 (0.0%)6/1928 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Helwingia japonica subsp. liukiuensis
リュウキュウハナイカダ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/7 (14.3%)1/7 (14.3%)—
NT
準絶滅危惧		Ilex matanoana
ムニンイヌツゲ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0553/343 (0.9%)3/346 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Ilex mertensii var. mertensii
シマモチ		—✓————/3—/—No———0553/343 (0.9%)3/346 (0.9%)—
NT
準絶滅危惧		Platycodon grandiflorus
キキョウ		—✓✓✓✓—/5✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		575 Mbp
49.1		1,175
1.52 Mbp		22151/1 (100.0%)11/1556 (0.7%)2019-04-05
NT
準絶滅危惧		Nymphoides indica
ガガブタ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0221/40 (2.5%)1/63 (1.6%)—
NT
準絶滅危惧		Nymphoides peltata
アサザ		LC✓✓✓✓—/4—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		722 Mbp
50		393
10.5 Mbp		2221/40 (2.5%)1/63 (1.6%)2025-07-07
NT
準絶滅危惧		Achillea alpina subsp. subcartilaginea
アソノコギリソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———002120/83 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Artemisia fukudo
フクド		—✓✓✓✓—/——/—No———0132126/509 (1.2%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Artemisia stolonifera
ヒロハヤマヨモギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0132126/509 (1.2%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Aster dimorphophyllus
タテヤマギク		—✓✓✓✓—/——/—No———002120/141 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Aster hispidus var. koidzumianus
ブゼンノギク		———✓✓—/——/—No———002120/141 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysanthemum crassum
オオシマノジギク		—✓—✓✓—/——/—No———042123/46 (6.5%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysanthemum ornatum var. tokarense
トカラノギク		——✓✓✓—/——/—No———042123/46 (6.5%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysanthemum seticuspe f. boreale
キクタニギク		—✓——✓—/——/—No———042123/46 (6.5%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysanthemum wakasaense
ワカサハマギク		—✓—✓✓—/——/—No———042123/46 (6.5%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Chrysanthemum yoshinaganthum
ナカガワノギク		—✓—✓✓—/——/—No———042123/46 (6.5%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium austrokiushianum
サツママアザミ		———✓✓—/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium boninense
オガサワラアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium chokaiense
チョウカイアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium japonicum var. ibukiense
ミヤマコアザミ		———✓——/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium lucens
テリハアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cirsium yakusimense
ヤクシマアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042122/246 (0.8%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Crossostephium chinense
モクビャクコウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002120/2 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Eschenbachia japonica
イズハハコ		—✓✓✓✓—/——/—No———032122/30 (6.7%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Eupatorium japonicum
フジバカマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002120/49 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Farfugium japonicum var. luchuense
リュウキュウツワブキ		——✓✓✓—/——/—No———002120/2 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Hololeion maximowiczii
マンシュウスイラン		——✓✓✓—/——/—No———002120/3 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Ixeridium dentatum subsp. kitayamense
ドロニガナ		—✓✓✓✓—/——/—No———002120/12 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Ixeridium yakuinsulare
コスギニガナ		———✓✓—/——/—No———002120/12 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Ixeris tamagawaensis
カワラニガナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002120/8 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Japonicalia kiusiana
モミジコウモリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———002120/3 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Leontopodium shinanense
ヒメウスユキソウ		——✓✓✓—/——/—No———002120/48 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Parasenecio auriculata var. bulbifera
コモチミミコウモリ		————✓—/——/—No———002120/55 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Parasenecio yakusimensis
ヤクシマコウモリ		———✓✓—/——/—No———002120/55 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Senecio scandens
タイキンギク		LC✓✓✓✓—/4—/—No———082124/579 (0.7%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Taraxacum arakii
ヤマザトタンポポ		———✓✓—/——/—No———012121/477 (0.2%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tephroseris takedana
タカネコウリンカ		—✓✓✓✓—/——/—No———002120/34 (0.0%)120/16593 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tripolium pannonicum
ウラギク		—✓✓✓✓—/6—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		8.35 Gbp
32		10,862
1.98 Mbp		222121/2 (50.0%)120/16593 (0.7%)2025-01-24
NT
準絶滅危惧		Viburnum carlesii var. bitchiuense
チョウジガマズミ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0131/175 (0.6%)2/206 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pittosporum illicioides
コヤスノキ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0111/109 (0.9%)1/135 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Apodicarpum ikenoi
エキサイゼリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)24/3148 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Sium suave var. nipponicum
ヌマゼリ		——✓✓✓—/——/—No———00360/16 (0.0%)24/3148 (0.8%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Heribaudiella fluviatilis
イズミイシノカワ		—✓✓✓——/1—/—No———0000/1 (0.0%)0—
NT
準絶滅危惧		Sphacelaria nipponica
ナガグンセンクロガシラ		—✓————/——/—No———0111/33 (3.0%)1/41 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Vaucheria longicaulis
ウミフシナシミドロ		—✓✓✓——/——/—No———0111/38 (2.6%)1/39 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Boodleopsis pusilla
モツレチョウチン		—✓✓✓——/1—/—No———0030/4 (0.0%)2/204 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Halimeda borneensis
フササボテングサ		—✓✓✓——/2—/—No———0131/67 (1.5%)2/204 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Halimeda distorta
ソリハサボテングサ		—✓✓✓——/2—/—No———0131/67 (1.5%)2/204 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Halimeda macroloba
ヒロハサボテングサ		—✓✓✓——/2—/—No———0131/67 (1.5%)2/204 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bornetella nitida
ナガミズタマ		—✓✓✓——/1—/—No———0000/2 (0.0%)0/15 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bornetella oligospora
カタミズタマ		——✓✓——/——/—No———0000/2 (0.0%)0/15 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Acetabularia caliculus
ホソエガサ		—✓—✓——/——/—No———0661/15 (6.7%)1/23 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Compsopogon caeruleus
オオイシソウ		—✓✓✓—✓/1✓/✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Batrachospermum gelatinosum f. gelatinosum
カワモズク		——————/——/—No———0000/17 (0.0%)0/168 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Paludicola turfosa
ホソカワモズク		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/12 (0.0%)0/168 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sheathia abscondita
コウゼンジカワモズク		—✓————/——/—No———0000/27 (0.0%)0/168 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sheathia arcuata
チャイロカワモズク		—✓—✓—✓/2✓/✓No———0000/27 (0.0%)0/168 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Virescentia helminthosa
アオカワモズク		—✓✓✓—✓/1—/—No———0000/7 (0.0%)0/168 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Caloglossa adhaerens
ヒロハアヤギヌ		—✓————/——/—No———0010/26 (0.0%)1/313 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Caloglossa continua
アヤギヌ		—✓—✓——/1—/—No———0010/26 (0.0%)1/313 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Caloglossa leprieurii
セイヨウアヤギヌ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0010/26 (0.0%)1/313 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Caloglossa ogasawaraensis
ホソアヤギヌ		—✓—✓——/1—/—No———0010/26 (0.0%)1/313 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Bostrychia simpliciuscula
タニコケモドキ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0161/26 (3.8%)6/830 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Catenella caespitosa
イソモッカ		—✓✓✓—✓/2—/—No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Catenella impudica
シオカワモッカ		———✓——/——/—No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gracilaria eucheumatoides
リュウキュウオゴノリ		———✓——/1—/✓No———06106/173 (3.5%)9/243 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Ganonema farinosum
ケコナハダ		—✓✓✓—✓/2—/—No———0000/6 (0.0%)0/81 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Yamadaella caenomyce
ハイコナハダ		—✓—✓—✓/——/—No———0000/4 (0.0%)0/81 (0.0%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Dendroceros japonicus
キノボリツノゴケ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/19 (0.0%)0/81 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asterella wallichiana
オキナワサイハイゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0131/32 (3.1%)2/59 (3.4%)—
NT
準絶滅危惧		Monosolenium tenerum
ヤワラゼニゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		288 Mbp
200		31
19.9 Mbp		1111/1 (100.0%)1/1 (100.0%)2024-09-03
NT
準絶滅危惧		Ricciocarpos natans
イチョウウキゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		221 Mbp
70		65
13.4 Mbp		1151/1 (100.0%)4/75 (5.3%)2025-05-01
NT
準絶滅危惧		Anastrepta orcadensis
タチクモマゴケ		—✓✓✓✓—/5—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		602 Mbp
37		425
8.29 Mbp		1151/1 (100.0%)5/56 (8.9%)2025-07-09
NT
準絶滅危惧		Odontoschisma jishibae
イイシバヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/21 (4.8%)1/60 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cephaloziella massalongii
キレハヤバネゴケ		——————/——/—No———0000/39 (0.0%)0/63 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Acrobolbus ciliatus
チチブイチョウゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/25 (4.0%)1/48 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Nardia compressa
ヒラウロコゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0010/10 (0.0%)1/76 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mesoptychia igiana
イギイチョウゴケ		———✓✓—/——/—No———0111/19 (5.3%)1/46 (2.2%)—
NT
準絶滅危惧		Solenostoma handelii
ハンデルソロイゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0111/70 (1.4%)1/76 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Plagiochila fordiana
サケバキハネゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0222/244 (0.8%)2/265 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Cololejeunea trichomanis
ヨウジョウゴケ		—✓—✓✓—/3—/—No———0010/84 (0.0%)1/715 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Leptolejeunea elliptica
カビゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0010/38 (0.0%)1/715 (0.1%)—
NT
準絶滅危惧		Takakia lepidozioides
ナンジャモンジャゴケ		—✓✓✓✓—/2—/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		325 Mbp
200		974
1.17 Mbp		1111/3 (33.3%)1/3 (33.3%)2023-08-14
NT
準絶滅危惧		Sphagnum junghuhnianum
ホソベリミズゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0202014/285 (4.9%)14/285 (4.9%)—
NT
準絶滅危惧		Sphagnum palustre
オオミズゴケ		—✓✓✓✓✓/7✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		843 Mbp
30		2,267
597 kbp		2202014/285 (4.9%)14/285 (4.9%)2025-04-29
NT
準絶滅危惧		Andreaea nivalis
ガッサンクロゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		253 Mbp
46		1,708
237 kbp		1777/26 (26.9%)7/26 (26.9%)2025-07-27
NT
準絶滅危惧		Pogonatum camusii
ヒメハミズゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———03163/46 (6.5%)14/152 (9.2%)—
NT
準絶滅危惧		Campylostelium brachycarpum
ヤマトハクチョウゴケ		———✓✓—/——/—No———0020/5 (0.0%)2/24 (8.3%)—
NT
準絶滅危惧		Syrrhopodon tosaensis
イサワゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/40 (0.0%)0/156 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Hypnodontopsis apiculata
キサゴゴケ		VU—✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/9 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Eucladium verticillatum
ダンダンゴケ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00120/3 (0.0%)12/611 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnostomiella longinervis
フガゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———00120/3 (0.0%)12/611 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Aulacopilum glaucum subsp. trichophyllum
アオシマヒメシワゴケ		————✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/9 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Rhodobryum ontariense
カサゴケモドキ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0040/7 (0.0%)4/148 (2.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cyathophorum adiantum
キジノオゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/4 (0.0%)2/29 (6.9%)—
NT
準絶滅危惧		Sasaokaea aomoriensis
ササオカゴケ（アオモリカギハイゴケ）		—✓—✓✓—/1—/—No———0050/1 (0.0%)4/108 (3.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cryphaea obovatocarpa
イトヒバゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/18 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Cyptodontopsis leveillei
カワブチゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/18 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Entodon conchophyllus
オオミツヤゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0111/25 (4.0%)1/32 (3.1%)—
NT
準絶滅危惧		Dichelyma japonicum
コシノヤバネゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/4 (0.0%)1/23 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Fontinalis antipyretica
クロカワゴケ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0111/18 (5.6%)1/23 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Fontinalis hypnoides
カワゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0111/18 (5.6%)1/23 (4.3%)—
NT
準絶滅危惧		Neobarbella comes
イヌコクサゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/1 (0.0%)1/39 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Trachycladiella aurea
ヒロハシノブイトゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/67 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Homaliadelphus targionianus var. rotundatus
ヒメタチヒラゴケ		————✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/4 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Palisadula katoi
カトウゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/23 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Circulifolium microdendron
ホウライハゴロモゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0040/2 (0.0%)4/139 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Pinnatella makinoi
キブリハネゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0040/13 (0.0%)4/139 (2.9%)—
NT
準絶滅危惧		Taiwanobryum speciosum
タイワントラノオゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/8 (0.0%)0/29 (0.0%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Chiodecton congestulum
ヒョウモンメダイゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/182 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pyxine cocoës
ヒイロクロボシゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———01101/30 (3.3%)9/258 (3.5%)—
NT
準絶滅危惧		Flavocetraria cucullata
ウスキエイランタイ		—✓✓✓✓—/2—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		38.0 Mbp
89		420
147 kbp		111141/3 (33.3%)78/1752 (4.5%)2024-09-21
NT
準絶滅危惧		Flavopunctelia flaventior
ハクテンヒメキウメノキゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		33.4 Mbp
23		2,554
18.5 kbp		111141/6 (16.7%)78/1752 (4.5%)2024-09-21
NT
準絶滅危惧		Flavopunctelia soredica
ヒメキウメノキゴケ		—✓✓✓——/1—/—No———011141/6 (16.7%)78/1752 (4.5%)—
NT
準絶滅危惧		Usnea longissima
ナガサルオガセ		—✓✓✓✓—/——/—No———001140/3 (0.0%)78/1752 (4.5%)—
NT
準絶滅危惧		Usnea nipparensis
ニッパラサルオガセ		—✓—✓——/2—/—No———01411413/249 (5.2%)78/1752 (4.5%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudocyphellaria argyracea
ハクテンヨロイゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0161/100 (1.0%)6/622 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Peltigera nigripunctata
コヒラミツメゴケ		—✓—✓——/——/—No———0787/234 (3.0%)8/245 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Solorina platycarpa
ヒラミヤイトゴケ		—✓————/——/—No———0181/3 (33.3%)8/245 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Catolechia wahlenbergii
キイロスミイボゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0020/1 (0.0%)2/105 (1.9%)—
NT
準絶滅危惧		Letrouitia bifera
キンカンゴケ		———✓✓—/——/—No———0554/18 (22.2%)4/18 (22.2%)—
NT
準絶滅危惧		Icmadophila japonicum
ヘラゴケ		——————/——/—No———0241/6 (16.7%)3/40 (7.5%)—
NT
準絶滅危惧		Orphniospora moriopsis
チャイロヘリトリゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/1 (0.0%)0/25 (0.0%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Diplocarpa irregularis
クロムラサキハナビラタケ		——✓✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/58 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Tricholoma matsutake
マツタケ		VU✓✓✓✓✓/2✓/✓Yes (6)Chromosome,
Reference		161 Mbp
64		16
12.0 Mbp		6202111/490 (2.2%)12/898 (1.3%)2016-05-03
NT
準絶滅危惧		Inonotus obliquus
カバノアナタケ		—✓✓✓✓✓/2✓/✓Yes (4)Contig,
Reference		36.1 Mbp
64.1		32
3.09 Mbp		412523/80 (3.8%)24/1305 (1.8%)2022-04-25
NT
準絶滅危惧		Sanghuangporus sanghuang
メシマコブ		—✓—✓✓—/—✓/✓Yes (4)Contig,
Reference		36.2 Mbp
124		13
3.02 Mbp		413525/22 (22.7%)24/1305 (1.8%)2019-12-27
NT
準絶滅危惧		Albatrellus ovinus
ニンギョウタケモドキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0222/45 (4.4%)2/60 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Neoalbatrellus yasudae
ヌメリアイタケ		—✓—✓✓—/——/—No———0222/45 (4.4%)2/60 (3.3%)—
NT
準絶滅危惧		Boletopsis grisea
クロカワ		NT✓✓✓✓—/1—/—No———0050/20 (0.0%)5/1660 (0.3%)—
NT
準絶滅危惧		Phellodon fuligineoalbus
マツバハリタケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/59 (0.0%)5/1660 (0.3%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Eptatretus atami
クロヌタウナギ		DD✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Chromosome,
Reference		2.52 Gbp
250		712,472
12.7 kbp		1473/47 (6.4%)4/78 (5.1%)2024-01-09
NT
準絶滅危惧		Mustelusmanazo
ホシザメ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0261/41 (2.4%)2/77 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Mustelus griseus
シロザメ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0261/41 (2.4%)2/77 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Hemitriakis japanica
エイラクブカ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0060/6 (0.0%)2/77 (2.6%)—
NT
準絶滅危惧		Carcharhinus tjutjot
スミツキザメ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0362/54 (3.7%)5/121 (4.1%)—
NT
準絶滅危惧		Squalusmitsukurii
フトツノザメ		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———0442/79 (2.5%)2/82 (2.4%)—
NT
準絶滅危惧		Squatina japonica
カスザメ		CR✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0111/28 (3.6%)1/28 (3.6%)—
NT
準絶滅危惧		Rhinobatos hynnicephalus
コモンサカタザメ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/30 (0.0%)0/53 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Platyrhina tangi
ウチワザメ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/5 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bathyraja smirnovi
ドブカスベ		NT✓—✓✓✓/——/—No———0010/2 (0.0%)1/83 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Raja pulchra
メガネカスベ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00140/2 (0.0%)7/148 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Dipturus kwangtungensis
ガンギエイ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00140/49 (0.0%)7/148 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Okamejei meerdervoortii
メダマカスベ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———02141/15 (6.7%)7/148 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Okamejei boesemani
イサゴガンギエイ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———02141/15 (6.7%)7/148 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Okamejei acutispina
モヨウカスベ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———02141/15 (6.7%)7/148 (4.7%)—
NT
準絶滅危惧		Dasyatis acutirostra
ヤジリエイ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0060/5 (0.0%)5/219 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Aetobatus narutobiei
ナルトビエイ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0171/17 (5.9%)6/72 (8.3%)—
NT
準絶滅危惧		Robinsia catherinae
カワリアナゴ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/3 (0.0%)0/22 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Gymnothorax richardsonii
モバウツボ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0333/124 (2.4%)3/200 (1.5%)—
NT
準絶滅危惧		Aulichthys japonicus
クダヤガラ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Bulbonaricus brauni
チンヨウジウオ		LC—✓✓✓—/——/—No———00500/1 (0.0%)31/607 (5.1%)—
NT
準絶滅危惧		Urocampus carinirostris
ミナミオクヨウジ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/2 (0.0%)31/607 (5.1%)—
NT
準絶滅危惧		Oxyporhamphusmicropterusmicropterus
サヨリトビウオ		—✓—✓✓✓/——/—No———0040/4 (0.0%)3/79 (3.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hozukius guyotensis
ベニメヌケ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		836 Mbp
23		95,030
27.2 kbp		121232/2 (100.0%)89/432 (20.6%)2021-10-09
NT
準絶滅危惧		Sebastesmelanostictus
アラメヌケ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———011312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)—
NT
準絶滅危惧		Sebastes borealis
ヒレグロメヌケ		—✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		466 Mbp
33		56,433
9.55 kbp		111312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)2021-11-12
NT
準絶滅危惧		Sebastes baramenuke
バラメヌケ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		809 Mbp
23		68,561
41.6 kbp		111312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)2021-11-12
NT
準絶滅危惧		Sebastes flammeus
サンコウメヌケ		—✓✓✓✓—/——/—No———011312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)—
NT
準絶滅危惧		Sebastes iracundus
オオサガ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		813 Mbp
25		83,383
31.4 kbp		111312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)2021-10-09
NT
準絶滅危惧		Sebastes oblongus
タケノコメバル		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		776 Mbp
24		37,397
62.1 kbp		111312380/407 (19.7%)89/432 (20.6%)2021-11-13
NT
準絶滅危惧		Sebastapistes tinkhami
ニラミカサゴ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0060/50 (0.0%)5/249 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sebastapistes cyanostigma
カスリフサカサゴ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0060/50 (0.0%)5/249 (2.0%)—
NT
準絶滅危惧		Caracanthusmaculatus
ダンゴオコゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Caracanthus unipinna
ワタゲダンゴオコゼ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parabembras curtus
ウバゴチ		———✓✓✓/——/✓No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Psammoperca waigiensis
アカメモドキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0070/1 (0.0%)2/40 (5.0%)—
NT
準絶滅危惧		Epinephelus tauvina
ヒトミハタ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0204712/135 (8.9%)31/497 (6.2%)—
NT
準絶滅危惧		Sphaeramia nematoptera
マンジュウイシモチ		LC✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.10 Gbp
60		333,699
5.13 kbp		14282/2 (100.0%)26/600 (4.3%)2025-11-24
NT
準絶滅危惧		Gnathanodon speciosus
コガネシマアジ		LC✓✓✓✓✓/2✓/✓No———00290/8 (0.0%)15/309 (4.9%)—
NT
準絶滅危惧		Lutjanus sebae
センネンダイ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0152411/122 (9.0%)17/333 (5.1%)—
NT
準絶滅危惧		Symphorichthys spilurus
イレズミフエダイ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00240/1 (0.0%)17/333 (5.1%)—
NT
準絶滅危惧		Symphorus nematophorus
イトヒキフエダイ		LC✓✓✓✓✓/——/—Yes (2)Chromosome,
Reference		1.08 Gbp
26.38		132
38.4 Mbp		22241/1 (100.0%)17/333 (5.1%)2025-02-28
NT
準絶滅危惧		Gerres ryukyuensis
ヤンバルサギ		——✓✓✓—/——/—No———0333/93 (3.2%)3/143 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Nemipterus peronii
シャムイトヨリ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0111/30 (3.3%)1/84 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Lethrinus erythracanthus
アマクチビ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0453/112 (2.7%)4/141 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lethrinusminiatus
アマミフエフキ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0453/112 (2.7%)4/141 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lethrinusmicrodon
オオフエフキ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0453/112 (2.7%)4/141 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Lethrinus reticulatus
ヤエヤマフエフキ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0453/112 (2.7%)4/141 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Chaetodon reticulatus
ハクテンカタギ		DD✓✓✓✓✓/2—/✓No———010155/100 (5.0%)7/142 (4.9%)—
NT
準絶滅危惧		Chaetodon oxycephalus
ヒメフウライチョウチョウウオ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———010155/100 (5.0%)7/142 (4.9%)—
NT
準絶滅危惧		Amphiprion sandaracinos
セジロクマノミ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———05173/35 (8.6%)14/505 (2.8%)—
NT
準絶滅危惧		Choerodon schoenleinii
シロクラベラ		NT✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		866 Mbp
100		54
37.5 Mbp		11401/28 (3.6%)26/1028 (2.5%)2025-01-30
NT
準絶滅危惧		Labrichthys unilineatus
クロベラ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00400/1 (0.0%)26/1028 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Cheilinus undulatus
メガネモチノウオ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.17 Gbp
77		329
16.5 Mbp		23402/13 (15.4%)26/1028 (2.5%)2021-05-12
NT
準絶滅危惧		Zoarchiasmacrocephalus
シンジュカズナギ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Paratrypauchen sp. (wakae-type)
アカウオ（wakae 型）		——————/——/—No———01441/3 (33.3%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paratrypauchen sp. (microcephalus-type)
アカウオ（microcephalus 型）		——————/——/—No———01441/3 (33.3%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Amblychaeturichthys sciistius
コモチジャコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00440/2 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Amblychaeturichthys hexanema
アカハゼ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00440/2 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Siphonogobius nue
ヌエハゼ		—✓✓✓✓—/——/—No———00440/1 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gnatholepis yoshinoi
ヒシヒレオオモンハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00440/22 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon okinawae
キイロサンゴハゼ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon axillaris
セアカコバンハゼ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon histrio
ベニサシコバンハゼ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon erythrospilus
シュオビコバンハゼ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon aoyagii
アカテンコバンハゼ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon sp. 2
イレズミコバンハゼ		——————/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon sp. 3
コバンハゼ		——————/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon sp.
アイコバンハゼ		—✓———✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon heterospilos
イチモンジコバンハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon rivulatus
タスジコバンハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon quinquestrigatus
フタイロサンゴハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon prolixus
アワイロコバンハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon oculolineatus
クマドリコバンハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon fuscoruber
ムジコバンハゼ（ヒトスジコバンハゼ）		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon winterbottomi
オオヒレコバンハゼ		DD—✓✓✓—/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Gobiodon ater
ヒメクロコバンハゼ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00440/51 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Bathygobius peterophilus
シジミハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00440/34 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Drombus simulus
イッテンクロコハゼ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00440/14 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodon lacunicolus
パンダダルマハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodon kasaii
カサイダルマハゼ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodonmodestus
ヨゴレダルマハゼ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodonmelanosomus
クロダルマハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodon xanthosomus
アカネダルマハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Paragobiodon echinocephalus
ダルマハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00440/16 (0.0%)31/2626 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Verasper variegatus
ホシガレイ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		564 Mbp
100		79
22.8 Mbp		33261/2 (50.0%)13/82 (15.9%)2020-04-16
NT
準絶滅危惧		Cynoglossus abbreviatus
コウライアカシタビラメ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0252/118 (1.7%)4/174 (2.3%)—
NT
準絶滅危惧		Takifugu porphyreus
マフグ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———08184/43 (9.3%)10/204 (4.9%)—

Corals
サンゴ類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Acropora echinata
トゲヅツミドリイシ		EN✓✓✓✓—/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		401 Mbp
211		28,820
24.4 kbp		1496726/406 (6.4%)37/543 (6.8%)2020-09-04
NT
準絶滅危惧		Acropora grandis
クロマツミドリイシ		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———0496726/406 (6.4%)37/543 (6.8%)—
NT
準絶滅危惧		Alveopora japonica
ニホンアワサンゴ		CR✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00160/18 (0.0%)8/470 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Stylaraea punctata
ヒメサンゴ		LC✓✓✓✓✓/2—/✓No———00160/1 (0.0%)8/470 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Cycloseris hexagonalis
ムツカドマンジュウイシ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0010/1 (0.0%)1/82 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Heliofungia actiniformis
パラオクサビライシ		LC✓✓✓✓—/——/✓No———0010/3 (0.0%)1/82 (1.2%)—
NT
準絶滅危惧		Galaxea horrescens
エダアザミサンゴ		LC✓✓✓✓—/——/✓No———0221/14 (7.1%)1/18 (5.6%)—

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Sacculina upogebiae
アナジャコフクロムシ		—✓—✓——/——/—No———0331/32 (3.1%)1/58 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Amphibalanus reticulatus
サラサフジツボ		—✓✓✓—✓/—✓/✓No———06162/20 (10.0%)8/415 (1.9%)—
NT
準絶滅危惧		Eudactylinamusteli
和名なし		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Eudactylina squatini
和名なし		——✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Kroyeria elongata
和名なし		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Kroyeria sublineata
和名なし		———✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Lernaeopoda oviformis
ダンゴナガクビムシ		———✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/81 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Driocephalus cerebrinoxius
サメノハナヤドリ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Trebius shiinoi
和名なし		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Procepon insolitum
アナジャコヤドリムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		pogebione bidigitatus
和名なしU		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Parapenaeopsis cornuta
チクゴエビ		—✓—✓✓✓/——/—No———00180/10 (0.0%)5/236 (2.1%)—
NT
準絶滅危惧		Alpheus dolichodactylus
ハシボソテッポウエビ		———✓✓—/——/—No———0000/364 (0.0%)0/1002 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Alpheus sp.
マングローブテッポウエビ		—✓———✓/1—/✓No———0000/364 (0.0%)0/1002 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Stenalpheus anacanthus
クボミテッポウエビ		——————/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Merguia oligodon
キノボリエビ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/2 (0.0%)0/394 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Polyonyx sinensis
ヤドリカニダマシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/10 (0.0%)2/252 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Pagurus nigrofascia
ヨモギホンヤドカリ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0444/133 (3.0%)4/306 (1.3%)—
NT
準絶滅危惧		Mariaplax chenae
ヒメムツアシガニ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/8 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Atoportunus gustavi
モモイロドウクツガザミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00110/1 (0.0%)5/525 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Clistocoeloma villosum
フジテガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/3 (0.0%)0/277 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parasesarma affine
クシテガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/57 (0.0%)0/277 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Parasesarma tripectinis
ユビアカベンケイガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/57 (0.0%)0/277 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Sesarmops intermedium
ベンケイガニ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/6 (0.0%)0/277 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Asthenognathus inaequipes
ヨコナガモドキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0050/2 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Chasmagnathus convexus
ハマガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0050/1 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Helicana japonica
ヒメアシハラガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0050/3 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Hemigrapsus sinensis
ヒメケフサイソガニ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0050/13 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Pseudohelice subquadrata
ミナミアシハラガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0050/4 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ptychognathus altimanus
アゴヒロカワガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/27 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ptychognathus capillidigitatus
ヒメヒライソモドキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/27 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Ptychognathus ishii
タイワンヒライソモドキ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0050/27 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Sestrostoma toriumii
トリウミアカイソモドキ		—✓—✓✓—/——/—No———0050/2 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Thalassograpsus harpax
ミナミヒライソモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)1/125 (0.8%)—
NT
準絶滅危惧		Camptandriumsexdentatum
ムツハアリアケガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chaenostoma crassimanus
ヒメカクオサガニ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0—
NT
準絶滅危惧		Macrophthalmus abbreviatus
オサガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/30 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macrophthalmus banzai
ヒメヤマトオサガニ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———0000/30 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Macrophthalmus holthuisi
ホルトハウスオサガニ		—✓—✓——/——/—No———0000/30 (0.0%)0/41 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Austruca triangularis
シモフリシオマネキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/13 (0.0%)0/133 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Tubuca coarctata
リュウキュウシオマネキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/20 (0.0%)0/133 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pinnixa haematosticta
アカホシマメガニ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/171 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Xenophthalmus pinnotheroides
メナシピンノ		—✓✓✓✓✓/2✓/✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—

Cephalopods
軟体動物（頭足類）

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Loliolus beka
ベイカ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0070/10 (0.0%)4/222 (1.8%)—
NT
準絶滅危惧		Octopus incella
ナギサアナダコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———011239/136 (6.6%)19/483 (3.9%)—
NT
準絶滅危惧		Octopus wolfi
コツブハナダコ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———011239/136 (6.6%)19/483 (3.9%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
NT
準絶滅危惧		Coralliumjaponicum
アカサンゴ		—✓—✓✓✓/10—/—No———0241/29 (3.4%)3/301 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pleurocoralliumelatius
モモイロサンゴ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0040/27 (0.0%)3/301 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Pleurocoralliumkonojoi
シロサンゴ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0040/27 (0.0%)3/301 (1.0%)—
NT
準絶滅危惧		Nectoneanthes uchiwa
ウチワゴカイ		—✓—✓✓✓/—✓/✓No———0070/23 (0.0%)5/669 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Tylorrhynchus osawai
イトメ		———✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)5/669 (0.7%)—
NT
準絶滅危惧		Halla okudai
アカムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/28 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Chaetopterus kagosimensis
和名なし		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0221/54 (1.9%)1/197 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Mesochaetopterus japonicus
ムギワラムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/30 (0.0%)1/197 (0.5%)—
NT
準絶滅危惧		Siphonosoma cumanense
スジホシムシモドキ		—✓✓✓✓✓/2✓/✓No———0010/15 (0.0%)1/59 (1.7%)—
NT
準絶滅危惧		Sipunculus nudus
スジホシムシ		—✓✓✓✓✓/13✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.42 Gbp
73		306
28.5 Mbp		1111/37 (2.7%)1/59 (1.7%)2022-12-14
NT
準絶滅危惧		Anelassorhyncus sabinus
サビネミドリユムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
NT
準絶滅危惧		Arhynchite hayaoi
セトウチドチクチユムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/4 (0.0%)1/40 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Ikeda taenioides
サナダユムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/13 (0.0%)—
NT
準絶滅危惧		Ikedosoma elegans
ユメユムシ		—✓—✓✓✓/——/—No———0010/2 (0.0%)1/40 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Ikedosoma gogoshimense
ゴゴシマユムシ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/2 (0.0%)1/40 (2.5%)—
NT
準絶滅危惧		Urechis unicinctus
ユムシ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.19 Gbp
370		7,414
547 kbp		1111/6 (16.7%)1/6 (16.7%)2023-12-20
NT
準絶滅危惧		Balanoglossus carnosus
ワダツミギボシムシ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0020/8 (0.0%)1/21 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Balanoglossusmisakiensis
ミサキギボシムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/8 (0.0%)1/21 (4.8%)—
NT
準絶滅危惧		Asymmetron sp. 1
オナガナメクジウオ種1		——————/——/—No———01221/4 (25.0%)6/28 (21.4%)—
NT
準絶滅危惧		Asymmetron sp. 2
オナガナメクジウオ種2		——————/——/—No———01221/4 (25.0%)6/28 (21.4%)—