Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists

Updated on 2024-10-01

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Hypsugo alaschanicus
オオアブラコウモリ		LC✓✓✓✓No———00480/25 (0.0%)29/892 (3.3%)—
DD
情報不足		Murina tenebrosa
クチバテングコウモリ		CR—✓✓✓No———01481/69 (1.4%)29/892 (3.3%)—
DD
情報不足		Vespertilio murinus
ヒメヒナコウモリ		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.93 Gbp
44.0x		1,157
3.32 Mbp		22481/2 (50.0%)29/892 (3.3%)2024-01-29
DD
情報不足		Tadarida latouchei
スミイロオヒキコウモリ		EN✓✓✓✓No———03101/8 (12.5%)4/145 (2.8%)—
DD
情報不足		Tamias sibiricus lineatus
エゾシマリス		——✓✓✓No———11311/26 (3.8%)17/310 (5.5%)—

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Tetrastes bonasia vicinitas
エゾライチョウ		—✓✓✓✓No———00840/2 (0.0%)28/203 (13.8%)—
DD
情報不足		Aix galericulata
オシドリ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.08 Gbp
230.0x		34,019
77.4 kbp		121112/3 (66.7%)59/199 (29.6%)2022-08-16
DD
情報不足		Anser cygnoides
サカツラガン		VU✓✓✓✓Yes (7)Chromosome,
Reference		1.22 Gbp
70.0x		116
39.7 Mbp		7141114/15 (26.7%)59/199 (29.6%)2015-04-08
DD
情報不足		Aythya baeri
アカハジロ		CR✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.14 Gbp
162.1x		227
29.1 Mbp		161114/11 (36.4%)59/199 (29.6%)2022-11-27
DD
情報不足		Tadorna ferruginea
アカツクシガモ		LC✓✓✓✓No———001110/6 (0.0%)59/199 (29.6%)—
DD
情報不足		Pterodroma hypoleuca
シロハラミズナギドリ		LC✓✓✓✓No———0060/37 (0.0%)4/114 (3.5%)—
DD
情報不足		Platalea leucorodia leucorodia
ヘラサギ		——✓✓✓No———0181/6 (16.7%)6/29 (20.7%)—
DD
情報不足		Threskiornis melanocephalus
クロトキ		NT✓✓✓✓No———0181/4 (25.0%)6/29 (20.7%)—
DD
情報不足		Grus grus lilfordi
クロヅル		—✓—✓✓No———29145/9 (55.6%)7/16 (43.8%)—
DD
情報不足		Vanellus cinereus
ケリ		LC✓✓✓✓No———0191/11 (9.1%)8/84 (9.5%)—
DD
情報不足		Calidris ptilocnemis quarta
チシマシギ		——✓✓✓No———09346/24 (25.0%)30/87 (34.5%)—
DD
情報不足		Limnodromus semipalmatus
シベリアオオハシシギ		NT✓✓✓✓No———01341/4 (25.0%)30/87 (34.5%)—
DD
情報不足		Brachyramphus perdix
マダラウミスズメ		NT✓✓✓✓No———00110/3 (0.0%)6/23 (26.1%)—
DD
情報不足		Cettia diphone restricta
ダイトウウグイス		——✓✓✓No———0111/15 (6.7%)1/19 (5.3%)—
DD
情報不足		Phylloscopus examinandus
オオムシクイ		LC✓✓✓✓No———0895/86 (5.8%)6/88 (6.8%)—
DD
情報不足		Ficedula narcissina owstoni
リュウキュウキビタキ		LC✓✓✓✓No———03242/34 (5.9%)23/291 (7.9%)—
DD
情報不足		Zoothera dauma iriomotensis
コトラツグミ		——✓✓✓No———00190/19 (0.0%)14/216 (6.5%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Pelodiscus sinensis
ニホンスッポン		VU✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.20 Gbp
105.0x		205,379
22.0 kbp		1151/19 (5.3%)4/51 (7.8%)2012-07-24
DD
情報不足		Plestiodon kuchinoshimensis
クチノシマトカゲ		VU✓✓✓✓No———0281/50 (2.0%)6/1536 (0.4%)—
DD
情報不足		Hebius vibakari danjoensis
ダンジョヒバカリ		——✓✓✓No———00360/42 (0.0%)25/1007 (2.5%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Hynobius retardatus
エゾサンショウウオ		LC✓✓✓✓No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Anguilla bicolor pacifica
ニューギニアウナギ		—✓—✓✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.09 Gbp
92.0x		404
16.9 Mbp		119198/22 (36.4%)8/22 (36.4%)2024-06-14
DD
情報不足		Carassius buergeri subsp. 1
ナガブナ		—————No———012793/46 (6.5%)51/2339 (2.2%)—
DD
情報不足		Phoxinus lagowskii yamamotis
ヤマナカハヤ		—————No———00730/6 (0.0%)37/1258 (2.9%)—
DD
情報不足		Misgurnus sp. (Clade A)
キタドジョウ		—————No———07112/47 (4.3%)5/454 (1.1%)—
DD
情報不足		Misgurnus sp. IR
シノビドジョウ		—✓———No———07112/47 (4.3%)5/454 (1.1%)—
DD
情報不足		Misgurnus sp. OK
ヒョウモンドジョウ		—✓———No———07112/47 (4.3%)5/454 (1.1%)—
DD
情報不足		Salvelinus leucomaenis pluvius
ニッコウイワナ		—✓✓✓✓No———05594/59 (6.8%)22/678 (3.2%)—
DD
情報不足		Chelon subviridis
アンピンボラ		LC✓✓✓✓No———0191/137 (0.7%)6/366 (1.6%)—
DD
情報不足		Ellochelon vaigiensis
オニボラ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		647 Mbp
60.0x		137,715
24.2 kbp		1191/4 (25.0%)6/366 (1.6%)2024-08-08
DD
情報不足		Moolgarda engeli
モンナシボラ		LC✓✓✓✓No———0090/58 (0.0%)6/366 (1.6%)—
DD
情報不足		Moolgarda pedaraki
カマヒレボラ		—✓—✓✓No———0090/8 (0.0%)6/366 (1.6%)—
DD
情報不足		Atherinomorus duodecimalis
ネッタイイソイワシ		LC✓✓✓✓No———01111/33 (3.0%)9/118 (7.6%)—
DD
情報不足		Hypoatherina temminckii
ミナミギンイソイワシ		—✓✓✓✓No———00110/17 (0.0%)9/118 (7.6%)—
DD
情報不足		Ambassis interrupta
ナンヨウタカサゴイシモチ		LC✓✓✓✓No———0141/46 (2.2%)2/71 (2.8%)—
DD
情報不足		Ambassis macracanthus
ハナダカタカサゴイシモチ		DD✓✓✓✓No———0141/46 (2.2%)2/71 (2.8%)—
DD
情報不足		Epinephelus bontoides
シラヌイハタ		LC✓✓✓✓No———012299/133 (6.8%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Fibramia lateralis
ワキイシモチ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.16 Gbp
60.0x		464,460
4.68 kbp		11171/3 (33.3%)16/583 (2.7%)2024-08-15
DD
情報不足		Pseudamia amblyuroptera
ヒルギヌメリテンジクダイ		—✓✓✓✓No———01171/6 (16.7%)16/583 (2.7%)—
DD
情報不足		Plectorhinchus albovittatus
ダイダイコショウダイ		—✓✓✓✓No———0010/31 (0.0%)1/185 (0.5%)—
DD
情報不足		Omobranchus elongatus
ゴマクモギンポ		LC✓✓✓✓No———0070/45 (0.0%)4/459 (0.9%)—
DD
情報不足		Pseudocalliurichthys ikedai
ナリタイトヒキヌメリ		——✓✓✓No———0050/1 (0.0%)3/129 (2.3%)—
DD
情報不足		Belobranchus belobranchus
エリトゲハゼ		LC✓✓✓✓No———00150/3 (0.0%)12/282 (4.3%)—
DD
情報不足		Glossogobius sp.
フタゴハゼ		—————No———00300/74 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Gymnogobius mororanus
ヘビハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Luciogobius dormitoris
ネムリミミズハゼ		DD—✓✓✓No———00300/42 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Mugilogobius fuscus
フタホシハゼ		LC—✓—✓No———03301/32 (3.1%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Pseudogobius gastrospilos
コクチスナゴハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/55 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Redigobius balteatus
タスキヒナハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/10 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Rhinogobius biwaensis
ビワヨシノボリ		EN✓✓✓✓No———01301/126 (0.8%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Sicyopus auxilimentus
ヒノコロモボウズハゼ		DD✓✓✓✓No———00300/9 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Stenogobius ophthalmoporus
ドウケハゼ		LC—✓✓✓No———00300/12 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Stiphodon multisquamus
トラフボウズハゼ		DD✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Stiphodon niraikanaiensis
ニライカナイボウズハゼ		—✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Stiphodon surrufus
カキイロヒメボウズハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Kraemeria tongaensis
トンガスナハゼ		LC—✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
DD
情報不足		Parioglossus caeruleolineatus
クジャクハゼ		DD—✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Parioglossus lineatus
マイコハゼ		DD—✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2517 (0.8%)—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Amphinemura kawaii
カワイオナシカワゲラ		——✓✓✓No———0181/49 (2.0%)5/338 (1.5%)—
DD
情報不足		Nocticola uenoi kikaiensis
キカイホラアナゴキブリ		——✓✓—No———0000/42 (0.0%)0/74 (0.0%)—
DD
情報不足		Symploce miyakoensis
ミヤコモリゴキブリ		——✓✓—No———0020/36 (0.0%)1/236 (0.4%)—
DD
情報不足		Symploce okinoerabuensis
エラブモリゴキブリ		———✓—No———0020/36 (0.0%)1/236 (0.4%)—
DD
情報不足		Mantis religiosa
ウスバカマキリ		LC✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Reference		3.68 Gbp
48.0x		5,789
1.41 Mbp		1161/4 (25.0%)3/318 (0.9%)2023-08-17
DD
情報不足		Parasongella japonica
オチバコオロギ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Taiwanemobius ryukyuensis
リュウキュウハマコオロギ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Conocephalus halophilus
イズササキリ		——✓✓✓No———0060/39 (0.0%)2/1384 (0.1%)—
DD
情報不足		Boninoxya anijimensis
アニジマイナゴ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Austrohancockia amamiensis
アマミヒラタヒシバッタ		———✓—No———0020/4 (0.0%)2/161 (1.2%)—
DD
情報不足		Megacrania tsudai adan
ヤエヤマツダナナフシ		—————No———0050/4 (0.0%)3/276 (1.1%)—
DD
情報不足		Galloisiana chujoi
チュウジョウムシ（メギシマガロアムシ）		——✓✓✓No———0000/27 (0.0%)0/170 (0.0%)—
DD
情報不足		Tinocallis insularis
ムクロジヒゲマダラアブラムシ		——✓✓✓No———00680/12 (0.0%)36/5088 (0.7%)—
DD
情報不足		Hypselosoma hirashimai
アマミオオメノミカメムシ		———✓✓No———0000/16 (0.0%)0/367 (0.0%)—
DD
情報不足		Hypselosoma matsumurae
オオメノミカメムシ		—✓—✓✓No———0000/16 (0.0%)0/367 (0.0%)—
DD
情報不足		Arctocorisa kurilensis
チシマミズムシ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/233 (0.0%)—
DD
情報不足		Glaenocorisa cavifrons
オオメミズムシ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/233 (0.0%)—
DD
情報不足		Physatocheila distinguenda
コリヤナギグンバイ		——✓✓✓No———0010/4 (0.0%)1/366 (0.3%)—
DD
情報不足		Ectomocoris elegans
ヤエヤマサシガメ		——✓✓✓No———0080/20 (0.0%)6/1670 (0.4%)—
DD
情報不足		Empicoris brachystigma
フタオビマダラカモドキサシガメ		——✓✓✓No———0080/14 (0.0%)6/1670 (0.4%)—
DD
情報不足		Haematoloecha rufithorax
ツシマアカサシガメ		——✓✓✓No———0080/4 (0.0%)6/1670 (0.4%)—
DD
情報不足		Aradus betulae
カバヒラタカメムシ		—✓✓✓—No———0221/33 (3.0%)1/344 (0.3%)—
DD
情報不足		Sialis yamatoensis
ヤマトセンブリ		——✓✓✓No———0442/41 (4.9%)2/56 (3.6%)—
DD
情報不足		Orientispa shirozui
ツシマカマキリモドキ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/79 (0.0%)—
DD
情報不足		Chlaenius pericallus
オオサカアオゴミムシ		——✓✓—No———00340/46 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
DD
情報不足		Chlaenius prostenus
クビナガキベリアオゴミムシ		——✓✓—No———00340/46 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
DD
情報不足		Harpalomimetes orbicollis
タナカツヤハネゴミムシ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Lachnoderma asperum
アリスアトキリゴミムシ		——✓✓✓No———00340/1 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
DD
情報不足		Odacantha hagai
ハガクビナガゴミムシ		———✓—No———00340/1 (0.0%)20/6394 (0.3%)—
DD
情報不足		Tinoderus singularis
クビナガヨツボシゴミムシ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Haliplus japonicus
クビボソコガシラミズムシ		—✓✓✓—No———0000/56 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Notomicrus tenellus
ホソコツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0000/39 (0.0%)0/123 (0.0%)—
DD
情報不足		Phreatodytes haibaraensis
ハイバラムカシゲンゴロウ		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/123 (0.0%)—
DD
情報不足		Phreatodytes relictus
ムカシゲンゴロウ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/123 (0.0%)—
DD
情報不足		Allopachria flavomaculata
キボシケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
DD
情報不足		Copelatus minutissimus
チビセスジゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/468 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
DD
情報不足		Dimitshydrus typhlops
メクラケシゲンゴロウ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Hydroglyphus flammulatus
アンピンチビゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/22 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
DD
情報不足		Hydroglyphus kifunei
キオビチビゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/22 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
DD
情報不足		Leiodytes miyamotoi
ホソマルチビゲンゴロウ		——✓✓✓No———0020/17 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
DD
情報不足		Morimotoa phreatica phreatica
メクラゲンゴロウ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Gyrinus niponicus
ニッポンミズスマシ		—————No———0000/73 (0.0%)0/283 (0.0%)—
DD
情報不足		Orectochilus teranishii
テラニシオナガミズスマシ		——✓——No———0000/15 (0.0%)0/283 (0.0%)—
DD
情報不足		Ochthebius danjo
シオダマリセスジダルマガムシ		——✓✓✓No———0000/274 (0.0%)0/815 (0.0%)—
DD
情報不足		Ochthebius nipponicus
ニッポンセスジダルマガムシ		—✓✓✓—No———0000/274 (0.0%)0/815 (0.0%)—
DD
情報不足		Hydrochus laferi
キタホソガムシ		——✓✓✓No———0111/36 (2.8%)1/36 (2.8%)—
DD
情報不足		Hydrochara affinis
コガムシ		—✓✓✓✓No———0060/17 (0.0%)6/1280 (0.5%)—
DD
情報不足		Pelthydrus okinawanus
オキナワマルチビガムシ		——✓✓✓No———0060/7 (0.0%)6/1280 (0.5%)—
DD
情報不足		Adinopsis nippon
ヤチハネカクシ		———✓✓No———01661/4 (25.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Apharinodes papageno
オオウロコアリヅカムシ		—✓—✓✓No———00660/1 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Bledius salsus
オオツノハネカクシ		—✓✓✓—No———00660/56 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Deinopsis minor
ヒメヌレチハネカクシ		——✓✓✓No———01661/4 (25.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Deinopsis modesta
ヌレチハネカクシ		———✓✓No———01661/4 (25.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Gymnusa miyashitai
トマムハネカクシ		———✓✓No———01661/6 (16.7%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Halorhadinus aequalis
クロイソハネカクシ		—✓—✓✓No———00660/2 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Halorhadinus inaequalis
ワカサイソハネカクシ		—✓—✓✓No———00660/2 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Halorhadinus sawadai
ウマヅライソハネカクシ		———✓✓No———00660/2 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Liparocephalus litoralis
ホテイウミハネカクシ		—✓—✓✓No———00660/3 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Pselaphus lewisi
ルイスアリヅカムシ		—————No———00660/2 (0.0%)49/6921 (0.7%)—
DD
情報不足		Trox kyotensis
キョウトチビコブスジコガネ		———✓—No———0000/33 (0.0%)0/96 (0.0%)—
DD
情報不足		Aphodius brachysomus
セマルオオマグソコガネ		———✓—No———07584/195 (2.1%)39/4672 (0.8%)—
DD
情報不足		Copris tripartitus
ヒメダイコクコガネ		—✓✓✓—No———01581/30 (3.3%)39/4672 (0.8%)—
DD
情報不足		Mimela sakishimana
サキシマチビコガネ		———✓✓No———00580/8 (0.0%)39/4672 (0.8%)—
DD
情報不足		Mozartius testaceus
ダルママグソコガネ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Poecilophilides rusticola
アカマダラハナムグリ		——✓——No———00000—
DD
情報不足		Trypoxyius dichotomus takarai
オキナワカブトムシ		—————No———00000—
DD
情報不足		Dryopomorphus amami
アマミハバビロドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)1/522 (0.2%)—
DD
情報不足		Urumaelmis uenoi tokarana
トカラツヤドロムシ		—✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)1/522 (0.2%)—
DD
情報不足		Agrilus boninensis
オガサワラナガタマムシ		———✓✓No———0664/168 (2.4%)4/628 (0.6%)—
DD
情報不足		Agrilus suzukii
シラフオガサワラナガタマムシ		———✓✓No———0664/168 (2.4%)4/628 (0.6%)—
DD
情報不足		Laius asahinai
イソジョウカイモドキ		——✓✓—No———0040/2 (0.0%)2/441 (0.5%)—
DD
情報不足		Ermischiella hahajimana
ハハジマヒメハナノミ		—————No———00000—
DD
情報不足		Derosphaerus foveolatus
アラメゴミムシダマシ		——✓——No———00350/3 (0.0%)17/2299 (0.7%)—
DD
情報不足		Amamiclytus nobuoi
ケズネチビトラカミキリ		——✓✓✓No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Boninoleiops kitajimai
キタジマモモブトカミキリ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Obrium cantharinum shimomurai
アカオニアメイロカミキリ		———✓✓No———00260/8 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Olenecamptus fukutomii
オガサワラオオシロカミキリ		——✓✓✓No———00260/7 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Ostedes inermis densepunctata
アマミハリムネモモブトカミキリ		———✓—No———00260/1 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Parastrangalis ishigakiensis
ヤエヤマクロスジホソハナカミキリ		—✓—✓✓No———00260/3 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Rondibilis femorata
シロスジトゲバカミキリ		——✓✓✓No———00260/4 (0.0%)17/3045 (0.6%)—
DD
情報不足		Donacia akiyamai
セラネクイハムシ		—✓✓——No———00960/62 (0.0%)53/6796 (0.8%)—
DD
情報不足		Baryrhynchus yaeyamensis
ヤエヤマミツギリゾウムシ		———✓—No———0020/2 (0.0%)1/149 (0.7%)—
DD
情報不足		Cyphagogus iwatensis
チャバネホソミツギリゾウムシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Xyelecia japonica
チャイロナギナタハバチ		—————No———00000—
DD
情報不足		Chrysolyda leucocephala
シロズヒラタハバチ		———✓—No———0000/1 (0.0%)0/180 (0.0%)—
DD
情報不足		Agenocimbex jucunda
ホシアシブトハバチ		—————No———0010/1 (0.0%)1/185 (0.5%)—
DD
情報不足		Nipponorhynchus bimaculatus
ヒダクチナガハバチ		—✓—✓—No———00200/2 (0.0%)12/4263 (0.3%)—
DD
情報不足		Nipponorhynchus mirabilis
クチナガハバチ		———✓—No———00200/2 (0.0%)12/4263 (0.3%)—
DD
情報不足		Siobla metallica
ルリコシアカハバチ		———✓—No———00200/36 (0.0%)12/4263 (0.3%)—
DD
情報不足		Stiricorsia tosensis
トサヤドリキバチ		—————No———00000—
DD
情報不足		Agriotypus gracilis
ミズバチ		—✓—✓✓No———00910/6 (0.0%)65/24751 (0.3%)—
DD
情報不足		Philoctetes monticola
ミヤマツヤセイボウ		—————No———0020/13 (0.0%)1/485 (0.2%)—
DD
情報不足		Stilbum cyanurum pacificum
オオセイボウ本土亜種		—————No———0020/3 (0.0%)1/485 (0.2%)—
DD
情報不足		Trichrysis sudai
スダセイボウ		—————No———0020/6 (0.0%)1/485 (0.2%)—
DD
情報不足		Caenosclerogibba japonica
シロアリモドキヤドリバチ		—————No———0000/1 (0.0%)0/35 (0.0%)—
DD
情報不足		Camponotus amamianus
ツヤミカドオオアリ		——✓✓✓No———071205/1026 (0.5%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Camponotus nipponensis
ケブカツヤオオアリ		—✓✓✓✓No———071205/1026 (0.5%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Formica fukaii
ツノアカヤマアリ		—✓✓✓✓No———041204/3057 (0.1%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Lasius hikosanus
ミヤマアメイロケアリ		———✓✓No———091204/528 (0.8%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Leptanilla oceanica
オガサワラムカシアリ		——✓✓✓No———001200/45 (0.0%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Ponera swezeyi
オガサワラハリアリ		—✓✓✓✓No———001200/95 (0.0%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Probolomyrmex okinawensis
ハナナガアリ		——✓✓✓No———001200/12 (0.0%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Temnothorax haira
オガサワラムネボソアリ		—————No———081207/240 (2.9%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Temnothorax santra
シワムネボソアリ		—————No———081207/240 (2.9%)90/16980 (0.5%)—
DD
情報不足		Anoplius eous
アケボノベッコウ		——✓✓✓No———0251/29 (3.4%)3/996 (0.3%)—
DD
情報不足		Cryptocheilus sugiharai
スギハラベッコウ		———✓✓No———0151/28 (3.6%)3/996 (0.3%)—
DD
情報不足		Dipogon ogasawarensis
オガサワラヒゲベッコウ		———✓—No———0050/23 (0.0%)3/996 (0.3%)—
DD
情報不足		Paracyphononyx alienus
アオスジベッコウ		———✓✓No———0050/3 (0.0%)3/996 (0.3%)—
DD
情報不足		Dolichovespula adulterina montivaga
ヤドリホオナガスズメバチ		———✓✓No———04293/33 (9.1%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Dolichovespula media sugare
キオビホオナガスズメバチ本州亜種		—————No———24293/33 (9.1%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Dolichovespula saxonica nipponica
ニッポンホオナガスズメバチ		—————No———14293/33 (9.1%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Polistes japonicus japonicus
ヤマトアシナガバチ		———✓—No———06296/154 (3.9%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Symmorphus captivus
オオハムシドロバチ		———✓✓No———00290/17 (0.0%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Vespa crabro flavofasciata
モンスズメバチ		—✓✓✓—No———37293/29 (10.3%)19/1063 (1.8%)—
DD
情報不足		Argogorytes nipponis
ニッポンアワフキバチ		———✓✓No———00190/3 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Bembecinus hungaricus japonicus
ヤマトスナハキバチ		——✓✓✓No———00190/23 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Crossocerus heydeni nipponis
ガロアギングチ		———✓✓No———02191/72 (1.4%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Crossocerus pusillus
タイセツギングチ		———✓✓No———02191/72 (1.4%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Ectemnius martjanowii
アギトギングチ		—————No———05193/32 (9.4%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Passaloecus koreanus
カラトイスカバチ		———✓✓No———00190/78 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Pison argentatum hanedai
ハネダピソン		———✓✓No———00190/20 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Pison koreense
コウライピソン		——✓✓✓No———00190/20 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Pison oakleyi boninense
オガサワラピソン		———✓✓No———00190/20 (0.0%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Spadicocrabro nitobei
ニトベギングチ		—————No———00000—
DD
情報不足		Towada flavitarsus
キユビギングチ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Trypoxylon ambiguum
フクイジガバチモドキ		———✓—No———02191/71 (1.4%)11/1454 (0.8%)—
DD
情報不足		Andrena yasumatsui
ヤスマツヒメハナバチ		——✓✓✓No———0303115/719 (2.1%)16/1015 (1.6%)—
DD
情報不足		Megachile lagopoda furukawai
フルカワフトハキリバチ		———✓✓No———19185/294 (1.7%)10/1119 (0.9%)—
DD
情報不足		Megachile pseudomonticola
クズハキリバチ		—✓✓✓✓No———09185/294 (1.7%)10/1119 (0.9%)—
DD
情報不足		Osmia orientalis
マイマイツツハナバチ		——✓✓✓No———04182/200 (1.0%)10/1119 (0.9%)—
DD
情報不足		Bombus consobrinus wittenburgi
ナガマルハナバチ		—✓✓✓✓No———15411941/439 (9.3%)81/3614 (2.2%)—
DD
情報不足		Bombus ussurensis
ウスリーマルハナバチ		—✓✓✓✓No———05411941/439 (9.3%)81/3614 (2.2%)—
DD
情報不足		Thyreus decorus
ルリモンハナバチ		—✓✓✓✓No———001190/25 (0.0%)81/3614 (2.2%)—
DD
情報不足		Neopanorpa subreticulata
イシガキシリアゲ		———✓✓No———0030/84 (0.0%)2/245 (0.8%)—
DD
情報不足		Panorpa amamiensis
アマミシリアゲ		——✓✓✓No———0332/89 (2.2%)2/245 (0.8%)—
DD
情報不足		Panorpa globulifera
シコクミスジシリアゲ		—✓✓✓✓No———0332/89 (2.2%)2/245 (0.8%)—
DD
情報不足		Panorpa hiurai
ヒウラシリアゲ		——✓✓✓No———0332/89 (2.2%)2/245 (0.8%)—
DD
情報不足		Bittacus sinensis
ホシガガンボモドキ		—✓—✓✓No———0000/19 (0.0%)0/27 (0.0%)—
DD
情報不足		Nymphomyia alba
カスミハネカ		—✓—✓✓No———0000/7 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Nymphomyia rohdendorfi
キョクトウハネカ		—✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Protoplasa alexanderi
アルプスニセヒメガガンボ		—————No———0000/2 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Protoplasa esakii
エサキニセヒメガガンボ		—————No———0000/2 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Pachyneura fasciata
モイワエゾカ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)—
DD
情報不足		Axymyia japonica
ヤマトクチキカ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Haruka elegans
ハマダラハルカ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Coenomyia basalis
ネグロクサアブ		——✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/70 (1.4%)—
DD
情報不足		Odontosabula decora
キンシマクサアブ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Odontosabula fulvipilosa
ヒメシマクサアブ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Odontosabula gloriosa
シマクサアブ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Glutops itoi
イトウタマユラアブ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/14 (0.0%)—
DD
情報不足		Lucilia chini
カエルキンバエ		—✓—✓✓No———06262/216 (0.9%)12/719 (1.7%)—
DD
情報不足		Neopithecops zalmora zalmora
ヒメウラボシシジミ		—✓✓✓—No———00520/1 (0.0%)27/2641 (1.0%)—
DD
情報不足		Catocala naganoi mahoroba
マホロバキシタバ		—————No———06773/268 (1.1%)37/8291 (0.4%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Semisulcospira dilatata
フトマキカワニナ		VU✓✓✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
DD
情報不足		Semisulcospira fluvialis
ナンゴウカワニナ		—✓✓✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
DD
情報不足		Semisulcospira ourensis
オオウラカワニナ		—✓✓✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
DD
情報不足		Semisulcospira rugosa
タテジワカワニナ		—✓—✓✓No———0111/74 (1.4%)1/162 (0.6%)—
DD
情報不足		Akiyoshia akka
アッカミジンツボ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Akiyoshia cylindrica
ホソミジンツボ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Akiyoshia kawanensis
カワネミジンツボ		—————No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Akiyoshia kishiiana
サガノミジンツボ		DD—✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Akiyoshia morimotoi
コウチミジンツボ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Akiyoshia scalaris
クルイミジンツボ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/968 (0.0%)—
DD
情報不足		Dolicrossea sp.
ウズツボ		—————No———00000—
DD
情報不足		Ceratia sp.
サンビャッケンツボ		—————No———0000/1 (0.0%)0/19 (0.0%)—
DD
情報不足		Tornidae gen. & sp. A
トゲトゲツボ		—————No———0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)—
DD
情報不足		Tornidae gen. & sp. B
チクチクツボ		—————No———0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)—
DD
情報不足		Cornirostra sp.
ヤマトカクメイ		—————No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Xenoskenea sp.
シンジュノナミダ		—————No———00000—
DD
情報不足		Cingulina sp.
ヒガタヨコイトカケギリ		—————No———0000/2 (0.0%)0/70 (0.0%)—
DD
情報不足		Pyramidellidae gen. B & sp.
カサガタガイ		—————No———0000/70 (0.0%)0/70 (0.0%)—
DD
情報不足		Galba sp.
コシダカヒメモノアラガイ		—————No———0060/22 (0.0%)4/415 (1.0%)—
DD
情報不足		Radix auricularia auricularia
イグチモノアラガイ		———✓—No———1161/250 (0.4%)4/415 (1.0%)—
DD
情報不足		Radix auricularia swinhoei
タイワンモノアラガイ		—————No———1161/250 (0.4%)4/415 (1.0%)—
DD
情報不足		Gyraulus chinensis
ヒラマキミズマイマイ		LC✓✓✓✓No———00200/204 (0.0%)7/665 (1.1%)—
DD
情報不足		Gyraulus gredleri
クロヒラマキガイ		—————No———00200/204 (0.0%)7/665 (1.1%)—
DD
情報不足		Gyraulus illibatus
ハブタエヒラマキガイ		——✓✓✓No———00200/204 (0.0%)7/665 (1.1%)—
DD
情報不足		Gyraulus tokyoensis
トウキョウヒラマキガイ		——✓✓✓No———00200/204 (0.0%)7/665 (1.1%)—
DD
情報不足		Laemodonta octanfracta
イササコミミガイ		—✓✓✓✓No———0010/10 (0.0%)1/146 (0.7%)—
DD
情報不足		Lamellidea hataiana
ハタイノミガイ		———✓—No———00000—
DD
情報不足		Lamellidea monodonta
ヒトハノミガイ		EX—✓✓—No———00000—
DD
情報不足		Lamellidea nakadai
ナカダノミガイ		EX—✓✓—No———00000—
DD
情報不足		Vallonia patens
エゾミジンマイマイ		———✓✓No———0000/12 (0.0%)0/17 (0.0%)—
DD
情報不足		Gastrocopta ogasawarana
オガサワラスナガイ		EX—✓✓—No———0000/22 (0.0%)0/54 (0.0%)—
DD
情報不足		Vertigo ovata stagnalis
ミズギワキバサナギガイ		—————No———0000/114 (0.0%)0/150 (0.0%)—
DD
情報不足		Megalophaedusa aurantiaca moellendorffi
エルベリギセル		—————No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
DD
情報不足		Megalophaedusa micropeas hokkaidoensis
エゾヒメギセル		——✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
DD
情報不足		Stereophaedusa sp. (pSL)
ナタマメギセル（偽南部大型）		—————No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys danjoensis
ダンジョベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys depressa
コウベヒラベッコウ		—————No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys dulcis
オオヒラベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys kagaensis
ミドリベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys koshikijimana
コシキオオヒラベッコウ		—————No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys kurodai
ミヤコベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys kuroshimana
クロシマベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys micrograpta
ヒラベッコウ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys nikkoensis
ニッコウヒラベッコウ		——✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys perfragilis
ベッコウマイマイ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys sakui
ヤクシマベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys septentrionalis
カントウベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Bekkochlamys shikokuensis
シコクベッコウ		———✓✓No———0000/5 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Japanochlamys cerasina
クリイロベッコウ		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Japanochlamys decens
カズマキベッコウ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Japanochlamys hakonensis
ハコネヒメベッコウ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Japanochlamys shinanoensis
エナクリイロベッコウ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Luchuconulus acuta
カドヒメベッコウ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Nipponochlamys hakusana
ハクサンベッコウ		—————No———00000—
DD
情報不足		Nipponochlamys hokkaidonis
エゾヒメベッコウ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Nipponochlamys izushichitojimana
シチトウベッコウ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Nipponochlamys semisericata
キヌツヤベッコウ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Ovachlamys kandai
カンダベッコウ		——✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/171 (0.0%)—
DD
情報不足		Parakaliella acutanguloides
トガリキビ		—————No———00000—
DD
情報不足		Parakaliella affinis
エゾキビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Parakaliella bimaris
マルキビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Parakaliella hachijoensis
ハチジョウキビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Parakaliella higashiyamana
アワキビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Parakaliella okiana
オキキビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Trochochlamys crenulata basistriata
ソコスジカサキビ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys fraterna
オオウエキビ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys goniozona
ヒメオオタキキビ		—————No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys humiliconus
イセキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys kiiensis
キイキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys monticola
イヤヤマキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys okiensis
オキノクニキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys okinoshimana
オキノシマキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys sororcula
トサキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys subcrenulata satsumana
サツマヒメカサキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys tanzawaensis
タンザワキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Trochochlamys xenica
サドタカキビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Aegista hatakedai kawamurai
カワムラマイマイ		———✓—No———0040/17 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Aegista kobensis tsumiyamai
ツミヤママイマイ		———✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Aegista kunimiensis
ササミケマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/46 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Nipponochloritis echizenensis
エチゼンビロウドマイマイ		——✓✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Nipponochloritis occidentalis
サイコクビロウドマイマイ		———✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Nipponochloritis oscitans
ビロウドマイマイ		—✓✓✓✓No———0040/5 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
DD
情報不足		Talonostrea talonata
ネコノアシガキ		DD✓✓✓✓No———08286/82 (7.3%)15/326 (4.6%)—
DD
情報不足		Hiatula petalina
アシベマスオ		—✓✓✓✓No———0030/6 (0.0%)2/28 (7.1%)—
DD
情報不足		Meropesta sp.
ハブタエユキガイ		—————No———00100/1 (0.0%)6/49 (12.2%)—
DD
情報不足		Diplodonta sp.
フタバシラガイの1種		—————No———0000/5 (0.0%)0/9 (0.0%)—
DD
情報不足		Arthritica reikoae
ガタヅキ（コハギガイ）		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/65 (0.0%)—
DD
情報不足		Melliteryx puncticulata
ハチミツガイ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—
DD
情報不足		Mya uzenensis
キタノオオノガイ		—✓—✓✓No———0221/9 (11.1%)1/14 (7.1%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Pectispongilla subspinosa
ハケカイメン		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Radiospongilla hozawai
ホウザワカイメン		———✓✓No———0070/5 (0.0%)3/109 (2.8%)—
DD
情報不足		Spongilla inarmata
オオツカイメン		———✓✓No———0271/11 (9.1%)3/109 (2.8%)—
DD
情報不足		Stratospongilla akanensis
アカンコカイメン		———✓✓No———0070/2 (0.0%)3/109 (2.8%)—
DD
情報不足		Craspedacusta iseana
イセマミズクラゲ		———✓✓No———0121/8 (12.5%)2/216 (0.9%)—
DD
情報不足		Ancyrobdella biwae
イカリビル		———✓—No———00000—
DD
情報不足		Ancyrobdella smaragdina
ミドリビル		—————No———00000—
DD
情報不足		Hemiclepsis japonica
イボビル		—————No———0010/9 (0.0%)1/293 (0.3%)—
DD
情報不足		Oligobdella orientalis
スクナビル		———✓—No———0010/1 (0.0%)1/293 (0.3%)—
DD
情報不足		Oligobdella tagoi
タゴビル		—✓———No———0010/2 (0.0%)1/293 (0.3%)—
DD
情報不足		Ozobranchus jantseanus
ヌマエラビル		—✓✓✓—No———0000/3 (0.0%)0/4 (0.0%)—
DD
情報不足		Orobdella yamaneae
ヤマネクガビル		—✓—✓—No———0000/24 (0.0%)0/24 (0.0%)—
DD
情報不足		Metagoniochernes tomiyamai
テナガカニムシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Acropsopilio boopis
アワマメザトウムシ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Himalphalangium spinulatum
ゴホントゲザトウムシ		——✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/107 (1.9%)—
DD
情報不足		Hologagrella minatoi
ミナトザトウムシ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Leiobunum rubrum
アカスベザトウムシ		—✓✓✓✓No———0111/155 (0.6%)1/263 (0.4%)—
DD
情報不足		Leiobunum simplum
シロウマスベザトウムシ		——✓✓✓No———0111/155 (0.6%)1/263 (0.4%)—
DD
情報不足		Pygobunus okadai
テングザトウムシ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Sabacon distinctus
フセブラシザトウムシ		——✓✓✓No———0000/30 (0.0%)0/36 (0.0%)—
DD
情報不足		Verpulus boninensis
ムニンザトウムシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Verpulus similis
ムニンセグロザトウムシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Liacarus latilamellatus
アシュウタマゴダニ		———✓—No———0232/40 (5.0%)3/159 (1.9%)—
DD
情報不足		Alopecosa hokkaidensis
アシマダラコモリグモ		——✓✓✓No———0020/43 (0.0%)1/584 (0.2%)—
DD
情報不足		Cladothela boninensis
エダイボグモ		——✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/287 (0.0%)—
DD
情報不足		Desis japonica
ヤマトウシオグモ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/62 (0.0%)—
DD
情報不足		Doosia japonica
ドウシグモ		———✓—No———00000—
DD
情報不足		Filistata longibentris
ハラナガカヤシマグモ		——✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/95 (0.0%)—
DD
情報不足		Eubranchipus uchidai
キタホウネンエビ		—✓✓✓—No———0000/4 (0.0%)0/37 (0.0%)—
DD
情報不足		Gnorimosphaeroma pulchellum
ヒメコツブムシ		———✓✓No———0000/24 (0.0%)0/366 (0.0%)—
DD
情報不足		Elamenopsis ariakensis
アリアケヤワラガニ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Gopkittisak angustum
マメイソガニ		—✓—✓✓No———0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)—
DD
情報不足		Karstarma boholano
ドウクツベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Lithoselatium pulchrum
カスリベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Orcovita miruku
ドウクツモクズガニ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Philyra iriomotensis
イリオモテマメコブシガニ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/95 (0.0%)—
DD
情報不足		Philyra kanekoi
カネココブシガニ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/95 (0.0%)—
DD
情報不足		Philyra taekoae
アマミマメコブシガニ		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/95 (0.0%)—
DD
情報不足		Tetrias sp.
イリオモテヨコナガピンノ		—————No———0000/2 (0.0%)0/172 (0.0%)—
DD
情報不足		Varuna yui
タイワンオオヒライソガニ		—✓✓✓✓No———0050/3 (0.0%)1/116 (0.9%)—
DD
情報不足		Xiphonectes brockii
ツノナシイボガザミ		—✓✓✓✓No———0090/3 (0.0%)4/525 (0.8%)—
DD
情報不足		Epanerchodus acuticlivus
リュウオビヤスデ		——✓✓✓No———0020/11 (0.0%)2/82 (2.4%)—
DD
情報不足		Epanerchodus aster
ホシオビヤスデ		——✓✓✓No———0020/11 (0.0%)2/82 (2.4%)—
DD
情報不足		Cristatella mucedo
アユミコケムシ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		574 Mbp
170.0x		986
4.12 Mbp		1111/1 (100.0%)1/1 (100.0%)2020-10-23

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Gonostegia pentandra var. hypericifolia
オトギリマオ		———✓✓No———00100/2 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
DD
情報不足		Helicia formosana
タイワンヤマモガシ		LC✓✓✓✓No———0050/21 (0.0%)5/965 (0.5%)—
DD
情報不足		Rumex trisetifer
ニセコガネギシギシ		—✓✓✓✓No———01231/118 (0.8%)12/973 (1.2%)—
DD
情報不足		Silene fulgens
エゾセンノウ		——✓✓✓No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
DD
情報不足		Silene harae
エゾヤママンテマ		———✓—No———09287/598 (1.2%)20/2064 (1.0%)—
DD
情報不足		Michelia compressa var. macrantha
オオバナオガタマノキ		———✓✓No———0676/269 (2.2%)7/278 (2.5%)—
DD
情報不足		Crataegus maximowiczii
オオバサンザシ		—✓✓✓✓No———022021/244 (0.4%)78/3788 (2.1%)—
DD
情報不足		Asarum maruyamae
イズモサイシン		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
DD
情報不足		Hypericum iwatelittorale
シオカゼオトギリ		—————No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
DD
情報不足		Hypericum kitamense
キタミオトギリ		——✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
DD
情報不足		Hylotelephium cauticola f. montana
アポイミセバヤ		—————No———0090/25 (0.0%)6/1204 (0.5%)—
DD
情報不足		Smithia ciliata
シバネム		—✓✓✓✓No———002950/15 (0.0%)134/16039 (0.8%)—
DD
情報不足		Glochidion puberum
ツシマカンコノキ		—✓✓✓✓No———0040/52 (0.0%)3/871 (0.3%)—
DD
情報不足		Tilia mandshurica var. toriiana
エチゴボダイジュ		———✓✓No———011211/42 (2.4%)58/2412 (2.4%)—
DD
情報不足		Kleinhovia hospita
フウセンアカメガシワ		LC✓✓✓✓No———001210/1 (0.0%)58/2412 (2.4%)—
DD
情報不足		Gymnema sylvestre
ホウライアオカズラ		—✓✓✓✓No———00220/18 (0.0%)17/3259 (0.5%)—
DD
情報不足		Marsdenia formosana
タイワンキジョラン		—✓✓✓✓No———01221/46 (2.2%)17/3259 (0.5%)—
DD
情報不足		Vincetoxicum doianum
サツマビャクゼン		———✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3259 (0.5%)—
DD
情報不足		Xeromphis spinosa
ハリザクロ		LC——✓✓No———00000—
DD
情報不足		Lindernia tenuifolia
ヒメクチバシグサ		LC✓—✓✓No———0131/55 (1.8%)3/147 (2.0%)—
DD
情報不足		Artemisia tsuneoi
マシュウヨモギ		—————No———0121126/461 (1.3%)68/15892 (0.4%)—
DD
情報不足		Ixeris chinensis subsp. chinensis
ウサギソウ		———✓✓No———001120/8 (0.0%)68/15892 (0.4%)—
DD
情報不足		Syneilesis aconitifolia var. longilepis
タンバヤブレガサ		———✓✓No———001120/4 (0.0%)68/15892 (0.4%)—
DD
情報不足		Polygonatum falcatum var. trichosanthum
マルバオウセイ		——✓✓✓No———00170/68 (0.0%)13/1450 (0.9%)—
DD
情報不足		Luzula kjellmanniana
チシマスズメノヒエ		—✓✓✓✓No———0281/91 (1.1%)3/279 (1.1%)—
DD
情報不足		Paepalanthus kanaii
オクトネホシクサ		—————No———0000/202 (0.0%)0/482 (0.0%)—
DD
情報不足		Calamagrostis nana subsp. ohminensis
オオミネヒナノガリヤス		———✓✓No———008530/101 (0.0%)135/8492 (1.6%)—
DD
情報不足		Deschampsia cespitosa var. macrothyrsa
オニコメススキ		———✓✓No———008530/37 (0.0%)135/8492 (1.6%)—
DD
情報不足		Hystrix komarovii
アイヌムギ		—✓✓✓✓No———008530/47 (0.0%)135/8492 (1.6%)—
DD
情報不足		Isachne globosa var. brevispicula
コツブチゴザサ		———✓✓No———008530/18 (0.0%)135/8492 (1.6%)—
DD
情報不足		Poa yatsugatakensis
タニイチゴツナギ		———✓✓No———068535/368 (1.4%)135/8492 (1.6%)—
DD
情報不足		Carpha aristata
イヌノグサ		———✓✓No———00370/10 (0.0%)25/3492 (0.7%)—
DD
情報不足		Calanthe puberula var. okushirensis
オクシリエビネ		———✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11568 (0.2%)—
DD
情報不足		Cymbidium sp.
ツシマニオイシュンラン		—————No———01281/110 (0.9%)22/11568 (0.2%)—
DD
情報不足		Cypripedium calceolus
カラフトアツモリソウ		LC✓✓✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11568 (0.2%)—
DD
情報不足		Lecanorchis purpurea
ムラサキムヨウラン		——✓✓✓No———00280/15 (0.0%)22/11568 (0.2%)—
DD
情報不足		Blechnum hancockii
ハクウンシダ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/193 (0.0%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Akalaphycus liagoroides (Yamada) Huisman et al.
コナハダモドキ 		—✓—✓—No———0000/2 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Akalaphycus setchelliae (Yamada) Huisman et al.
ナンバンガラガラモドキ 		—✓—✓—No———0000/2 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Akkesiphycus lubricus Yamada & Tak.Tanaka
コンブモドキ		—✓———No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Batrachospermum longiarticulatum Necchi
和名なし		———✓—No———0000/19 (0.0%)0/164 (0.0%)—
DD
情報不足		Betaphycus gelatinus (Esper) Doty ex P.C.Silva
カタメンキリンサイ		—✓—✓—No———0020/3 (0.0%)2/114 (1.8%)—
DD
情報不足		Caulerpa lentillifera J.Agardh
クビレズタ		—✓✓✓—No———0000/90 (0.0%)0/92 (0.0%)—
DD
情報不足		Chara altaica A.Braun
タカホコシャジクモ		—✓✓✓—No———0111/69 (1.4%)1/192 (0.5%)—
DD
情報不足		Chara fibrosa C.Agardh ex Bruzelius var. longicorollata Kasaki
エリナガシャジクモ		—————No———0111/69 (1.4%)1/192 (0.5%)—
DD
情報不足		Chara vulgaris L. var. vulgaris
クサシャジクモ		——✓✓—No———0111/69 (1.4%)1/192 (0.5%)—
DD
情報不足		Crassiphycus firmus (C.F.Chang & B.-M.Xia) Gurgel, J.N.Norris & Fredericq
ナンカイオゴノリ		—✓———No———0474/160 (2.5%)7/239 (2.9%)—
DD
情報不足		Dictyopteris repens (Okamura) Boergesen
ヒメヤハズ		—✓✓✓—No———0010/44 (0.0%)1/609 (0.2%)—
DD
情報不足		Eucheuma arnoldii Weber Bosse
ビャクシンキリンサイ 		—✓✓✓—No———0020/1 (0.0%)2/114 (1.8%)—
DD
情報不足		Eucheuma okamurae Yamada
オカムラキリンサイ		———✓—No———0020/14 (0.0%)2/114 (1.8%)—
DD
情報不足		Eucheuma serra (J.Agardh) J.Agardh
トゲキリンサイ 		—✓✓✓—No———0020/14 (0.0%)2/114 (1.8%)—
DD
情報不足		Halimeda tuna (J.Ellis & Solander) J.V.Lamour.
ツナサボテングサ 		—✓✓✓—No———0111/72 (1.4%)1/204 (0.5%)—
DD
情報不足		Haloplegma duperreyi Mont.
ベニゴウシ 		—✓✓✓—No———0000/3 (0.0%)0/15 (0.0%)—
DD
情報不足		Halymenia dilatata Zanardini
フイリグサ 		—✓✓✓—No———0000/31 (0.0%)0/288 (0.0%)—
DD
情報不足		Kappaphycus striatus (F.Schmitz) Doty ex P.C.Silva
オオキリンサイ 		—✓—✓—No———0121/29 (3.4%)2/114 (1.8%)—
DD
情報不足		Laurencia mariannensis Yamada
フクレソゾ 		———✓—No———0030/84 (0.0%)3/806 (0.4%)—
DD
情報不足		Lychaete dotyana (W.J.Gilbert) M.J.Wynne
ミナミシオグサ		—✓—✓—No———0000/17 (0.0%)0/454 (0.0%)—
DD
情報不足		Martensia flabelliformis Harvey ex J.Agardh
エツキアヤニシキ 		—✓✓✓—No———0010/28 (0.0%)1/285 (0.4%)—
DD
情報不足		Nitella allenii Imahori f. mikawaensis R.D.Wood
ミカワフラスコモ		—————No———0010/61 (0.0%)1/192 (0.5%)—
DD
情報不足		Palisada robusta Nam
タカサゴソゾ 		———✓—No———0030/26 (0.0%)3/806 (0.4%)—
DD
情報不足		Pseudobryopsis hainanensis C.K.Tseng
ハネモモドキ 		—✓—✓—No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Pseudothrix borealis Hanic & S.C.Lindstrom
ヒモヒトエグサ		—————No———0010/1 (0.0%)1/67 (1.5%)—
DD
情報不足		Pterosiphonia tanakae Uwai & Masuda
セトウチハネグサ		—✓—✓—No———0030/14 (0.0%)3/806 (0.4%)—
DD
情報不足		Pyropia kinositae (Yamada & Tak.Tanaka) N.Kikuchi et al.
ウタスツノリ		—✓———No———0040/119 (0.0%)3/355 (0.8%)—
DD
情報不足		Pyropia moriensis (Ohmi) N.Kikuchi & Miyata
カヤベノリ		—✓———No———0040/119 (0.0%)3/355 (0.8%)—
DD
情報不足		Pyropia tanegashimensis (Shinmura) N.Kikuchi & E.Fujiyoshi
タネガシマアマノリ		—✓—✓—No———0040/3 (0.0%)3/355 (0.8%)—
DD
情報不足		Sarcodia ceylanica Harv. ex K?tz.
アツバノリ		—✓—✓—No———0000/14 (0.0%)0/20 (0.0%)—
DD
情報不足		Sargassum segii T.Yoshida
ナガシマモク		—————No———0111/190 (0.5%)1/319 (0.3%)—
DD
情報不足		Sargassum wakayamaense T.Yoshida
ナンキモク		—————No———0111/190 (0.5%)1/319 (0.3%)—
DD
情報不足		Schimmelmannia plumosa (Setch.) I.A.Abbott
ナガオバネ		—✓✓✓—No———0000/4 (0.0%)0/4 (0.0%)—
DD
情報不足		Stenopeltis gracilis (Yamada & Tak.Tanaka) Itono & Yoshiz.
ホソバノガラガラモドキ 		—✓—✓—No———0000/1 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Trichogloea requienii (Mont.) K?tz.
アケボノモズク 		—✓✓✓—No———0000/4 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Trichogloeopsis mucosissima (Yamada) I.A.Abbott & Doty
ヌルハダ		—✓—✓—No———0000/2 (0.0%)0/81 (0.0%)—
DD
情報不足		Tydemania expeditionis Weber Bosse
スズカケモ 		—✓✓✓—No———0010/2 (0.0%)1/204 (0.5%)—
DD
情報不足		Vanvoorstia spectabilis Harv.
ヒメカラゴロモ 		—✓—✓—No———0010/2 (0.0%)1/285 (0.4%)—
DD
情報不足		Wildemania amplissima (Kjellm.) Foslie
ベニタサ		—✓✓✓—No———0040/14 (0.0%)3/355 (0.8%)—
DD
情報不足		Wildemania occidentalis (Setchell & Hus) Lindstrom
キイロタサ		—✓✓✓—No———0040/14 (0.0%)3/355 (0.8%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Bruchia microspora Nog.
ヒトヨシゴケ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Cephaloziella crispata N.Kitag.
ムカシヤバネゴケ		—✓—✓✓No———0000/32 (0.0%)0/57 (0.0%)—
DD
情報不足		Cololejeunea aequabilis (Sande Lac.) Schiffn.
ユーレンキララゴケ		—✓—✓✓No———0000/84 (0.0%)0/716 (0.0%)—
DD
情報不足		Distichophyllum mittenii Bosch & Sande Lac.
タカサゴツガゴケ		———✓✓No———0000/43 (0.0%)0/102 (0.0%)—
DD
情報不足		Distichophyllum nigricaule Bosch & Sande Lac.
クロジクツガゴケ		—✓—✓✓No———0000/43 (0.0%)0/102 (0.0%)—
DD
情報不足		Drepanolejeunea spicata (Steph.) Grolle & R.L.Zhu
ヤエヤマサンカクゴケ		—✓—✓✓No———0000/32 (0.0%)0/716 (0.0%)—
DD
情報不足		Frullania okinawensis Kamim.
オキナワヤスデゴケ		———✓✓No———0000/189 (0.0%)0/189 (0.0%)—
DD
情報不足		Gymnomitrion laceratum (Steph.) Horik.
コサキジロゴケ		——✓✓✓No———0000/28 (0.0%)0/76 (0.0%)—
DD
情報不足		Lejeunea syoshii Inoue
オノクサリゴケ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/716 (0.0%)—
DD
情報不足		Leucodon sciuroides (Hedw.) Schwägr.
キタイタチゴケ		—✓✓✓✓No———0010/19 (0.0%)1/26 (3.8%)—
DD
情報不足		Marsupella boeckii (Austin) Kaal.
イトミゾゴケ		—✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/76 (0.0%)—
DD
情報不足		Nardia breidleri (Limpr.) Lindb.
キレハウロコゴケ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/76 (0.0%)—
DD
情報不足		Nardia unispiralis Amakawa
ヒトスジウロコゴケ		———✓✓No———0000/10 (0.0%)0/76 (0.0%)—
DD
情報不足		Obtusifolium obtusum (Lindb.) S.W.Arnell
マルバイチョウゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Orthotrichum ibukiense Toyama
イブキタチヒダゴケ		——✓✓✓No———0010/70 (0.0%)1/291 (0.3%)—
DD
情報不足		Porella acutifolia (Lehm. & Lindenb.) Trevis. subsp. acutifolia
トガリバクラマゴケモドキ		———✓✓No———0000/48 (0.0%)0/49 (0.0%)—
DD
情報不足		Rhachithecium perpusillum (Thwaites & Mitt.) Broth.
マゴメゴケ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/9 (0.0%)—
DD
情報不足		Riccardia pumila Furuki
イトスジゴケ		———✓✓No———0000/77 (0.0%)0/110 (0.0%)—
DD
情報不足		Scapania ciliatospinosa Horik.
タニガワヒシャクゴケ		—✓✓✓✓No———0000/71 (0.0%)0/104 (0.0%)—
DD
情報不足		Solenostoma hokkaidense (Váňa) Váňa, Hentschel & J. Heinrichs
リシリツボミゴケ		———✓✓No———0000/70 (0.0%)0/77 (0.0%)—
DD
情報不足		Sphagnum junghuhnianum Dozy & Molk.
ホソベリミズゴケ		—✓✓✓✓No———0886/282 (2.1%)6/282 (2.1%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Aderkomyces albostrigosus (R.Sant.) Lücking et al.
ヨウジョウシロヒゲ		—✓✓✓✓No———00130/8 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Badimia pallidula (Kremp.) Vĕzda
ヨツハシゴケ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/21 (0.0%)—
DD
情報不足		Baeomyces sanguineus Asahina
チゾメセンニンゴケ		———✓—No———0000/6 (0.0%)0/14 (0.0%)—
DD
情報不足		Bapalmuia palmularis (Müll.Arg.) Sérus.
ナガミイボゴケ		—✓—✓✓No———0020/1 (0.0%)2/66 (3.0%)—
DD
情報不足		Barubria fuscorubra (Vĕzda) Vĕzda
ツエミハシゴケ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Carbacanthographis marcescens (Fée) Staiger & Kalb
ウチグロシロコナモジゴケ		——✓✓✓No———00130/4 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Chroodiscus mirificus (Kremp.) R.Sant.
コゲボシゴケモドキ		——✓✓✓No———00130/9 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Cladonia inobeana Asahina
イノベハナゴケ		—————No———0333424/359 (6.7%)25/397 (6.3%)—
DD
情報不足		Collema coccophyllum Nyl.
コツブイワノリ		———✓✓No———0151/25 (4.0%)4/353 (1.1%)—
DD
情報不足		Collema nipponicum Degel.
アツバイワノリ		———✓✓No———0151/25 (4.0%)4/353 (1.1%)—
DD
情報不足		Collema peregrinum Degel.
ツノイワノリ		———✓—No———0151/25 (4.0%)4/353 (1.1%)—
DD
情報不足		Collema shiroumanum var. kiusianum (Asahina) Degel.
サツマ(ツクシ)イワノリ		—————No———0151/25 (4.0%)4/353 (1.1%)—
DD
情報不足		Collema substipitatum Zahlbr.
シオバラノリ		——✓✓✓No———0151/25 (4.0%)4/353 (1.1%)—
DD
情報不足		Gyalectidium radiatum Lücking et al.
ツブクボミサラゴケ		———✓✓No———00130/10 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Hemithecium endofuscum (M.Nakan.) M.Nakan. & Kashiw.
ナカチャシロモジゴケ		———✓✓No———00130/4 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Heterodermia pacifica (Kurok.) Kurok.
ムニンゲジゲジゴケ		———✓—No———08227/45 (15.6%)20/340 (5.9%)—
DD
情報不足		Hyperphyscia adglutinata (Flörke) H.Mayrhofer & Poelt
コナムカデゴケモドキ		—✓✓✓✓No———00220/3 (0.0%)20/340 (5.9%)—
DD
情報不足		Hypotrachyna imbricatula (Zahlbr.) Hale
ヒュウガウメノキゴケ		—✓✓✓✓No———04894/89 (4.5%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Lobothallia alphoplaca (Wahlenb.) Hafellner
ウロコクボミゴケ		—✓✓✓✓No———0010/26 (0.0%)1/227 (0.4%)—
DD
情報不足		Loxospora glaucomiza (Nyl.) Kalb & Straiger
コフキザクロゴケ		———✓✓No———0222/4 (50.0%)2/8 (25.0%)—
DD
情報不足		Malcolmiella aurigera (Fée) Aptroot
ミナミノヘリトリゴケモドキ		———✓✓No———0020/13 (0.0%)2/66 (3.0%)—
DD
情報不足		Maronea constans (Nyl.) Hepp
アオチャゴケ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/23 (0.0%)—
DD
情報不足		Melanelixia fuliginosa (Duby) O.Blanco et al.
トゲオリーブゴケモドキ		—✓✓✓✓No———00890/24 (0.0%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Microtheliopsis uleana Müll.Arg.
シズクゴケ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Montanelia sorediata (Ach.) Divakar et al.
コナタカネゴケ		—✓✓✓✓No———00890/9 (0.0%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Orphniospora moriopsis (A.Massal.) D.Hawksw.
チャイロヘリトリゴケ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/23 (0.0%)—
DD
情報不足		Parmelia sulcata Taylor
コフキカラクサゴケ		—✓✓✓✓No———02892/52 (3.8%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Porina chrysophora (Stirt.) R.Sant.
キイロホルトノキゴケ		——✓✓✓No———0111/93 (1.1%)1/99 (1.0%)—
DD
情報不足		Porina virescens (Kremp.) Müll.Arg.
ミドリホルトノキゴケ		—✓✓✓✓No———0111/93 (1.1%)1/99 (1.0%)—
DD
情報不足		Psoroma boninense Kurok.
ムニンゴケ		———✓✓No———0040/17 (0.0%)4/144 (2.8%)—
DD
情報不足		Pyxine cocois (Sw.) Nyl.
ヒイロクロボシゴケ		—————No———0191/27 (3.7%)8/231 (3.5%)—
DD
情報不足		Pyxine meissneriana Nyl.
ミナミクロボシゴケ		—————No———0191/27 (3.7%)8/231 (3.5%)—
DD
情報不足		Relicina sydneyensis (Gyeln.) Hale
キフトネゴケモドキ		—✓✓✓✓No———00890/11 (0.0%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Sclerophora amabilis (Tibell) Tibell
サビクギゴケ		—✓✓✓—Yes (1)Scaffold,
Reference		25.0 Mbp
911.0x		293
134 kbp		1121/6 (16.7%)2/36 (5.6%)2022-11-07
DD
情報不足		Sclerophora coniophaea (Norman) Mattsson & Middelb.
コフキサビクギゴケ		—✓✓✓✓No———0121/6 (16.7%)2/36 (5.6%)—
DD
情報不足		Strigula nemathora Mont.
ツブマンジュウゴケ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/54 (0.0%)—
DD
情報不足		Strigula obducta (Müll.Arg.) R.C.Harris
コミノマンジュウゴケ		——✓✓✓No———0000/29 (0.0%)0/54 (0.0%)—
DD
情報不足		Strigula subelegans Vain.
クロミアオバゴケ		——✓✓✓No———0000/29 (0.0%)0/54 (0.0%)—
DD
情報不足		Thyrea confusa Henssen
イシバイキノリ		—✓✓✓✓No———0050/4 (0.0%)5/57 (8.8%)—
DD
情報不足		Tricharia kashiwadanii G.Thor et al.
ヨウジョウクロヒゲモドキ		—✓—✓✓No———00130/19 (0.0%)11/840 (1.3%)—
DD
情報不足		Trypetheliopsis boninensis Asahina
アカチクビゴケ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/22 (0.0%)—
DD
情報不足		Trypetheliopsis epiphylla (R. Sant.) Aptroot
バショウゴケ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/22 (0.0%)—
DD
情報不足		Usnea fuscorubens Motyka
ハナサルオガセモドキ		——✓✓—No———0138912/234 (5.1%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Usnea glabrescens (Vain.) Vain.
オニヒゲサルオガセ		—✓✓✓✓No———0138912/234 (5.1%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Usnea himantodes Stirt.
シコクサルオガセ		———✓✓No———0138912/234 (5.1%)74/1665 (4.4%)—
DD
情報不足		Usnea schadenbergiana Göpp & Stein
ニセヨコワサルオガセ		——✓✓—No———0138912/234 (5.1%)74/1665 (4.4%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Albatrellus confluens (Alb. & Schwein.) Kotl. & Pouzar
ニンギョウタケ		LC✓—✓✓No———0020/5 (0.0%)2/48 (4.2%)—
DD
情報不足		Amanita squarrosa Nagas. & Hongo
コササクレシロオニタケ		———✓✓No———0181816/1575 (1.0%)16/1636 (1.0%)—
DD
情報不足		Ascosparassis shimizuensis Kobayasi
アカハナビラタケ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Asterophora parasitica (Bull.) Singer
ナガエノヤグラタケ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		34.1 Mbp
20.0x		9,352
29.8 kbp		12772/4 (50.0%)67/652 (10.3%)2021-05-05
DD
情報不足		Bankera fuligineoalba (J.C.Schmidt) Coker & Beers ex Pouzar
マツバハリタケ		—✓—✓✓No———0050/46 (0.0%)5/1556 (0.3%)—
DD
情報不足		Boletellus longicollis (Ces.) Pegler & T.W.K.Young
アキノアシナガイグチ		—✓—✓✓No———023862/76 (2.6%)343/2616 (13.1%)—
DD
情報不足		Boletopsis leucomelaena (Pers.) Fayod
クロカワ		—✓✓✓✓No———0050/20 (0.0%)5/1556 (0.3%)—
DD
情報不足		Boletus edulis Bull.
ヤマドリタケ		LC✓✓✓✓Yes (6)Contig,
Reference		66.5 Mbp
593
421 kbp		68038667/471 (14.2%)343/2616 (13.1%)2018-07-13
DD
情報不足		Bovista dryina (Morgan) Demoulin
ハマベダンゴタケ		——✓✓✓No———0020/49 (0.0%)1/251 (0.4%)—
DD
情報不足		Clitocybe vittatipes S.Ito & S.Imai
ハチマキイヌシメジ		———✓✓No———01101/137 (0.7%)5/246 (2.0%)—
DD
情報不足		Cordyceps minuta Kobayasi
コゴメセミタケ		———✓✓No———0614499/239 (3.8%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Cordyceps nanatakiensis Kobayasi & Shimizu
チチブクチキムシタケ		———✓✓No———0614499/239 (3.8%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Cordyceps olivacea Rick
オグラムシタケ		———✓✓No———0614499/239 (3.8%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Cordyceps pallidiolivacea Kobayasi & Shimizu
シロヒメサナギタケ		———✓✓No———0614499/239 (3.8%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Cyathus badius Kobayasi
カバイロチャダイゴケ		—✓✓✓✓No———04123/63 (4.8%)11/96 (11.5%)—
DD
情報不足		Dendrosphaera eberhardtii Pat.
エダウチホコリタケモドキ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Echinodontium tsugicola (Henn. & Shirai) Imazeki
マンネンハリタケ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Elaphocordyceps delicatistipitata (Kobayasi) G.H.Sung, J.M.Sung & Spatafora
ヒメタンポタケ		———✓✓No———0297817/127 (13.4%)38/671 (5.7%)—
DD
情報不足		Entoloma incanum (Fr.) Hesler
ワカクサウラベニタケ		—✓✓✓✓No———0351/1064 (0.1%)3/1516 (0.2%)—
DD
情報不足		Hydnochaete tabacina (Berk. & M.A.Curtis ex Fr.) Ryvarden
エヒメウスバタケ		—✓✓✓✓No———00400/4 (0.0%)20/1192 (1.7%)—
DD
情報不足		Hygrocybe hahashimensis (Hongo) Hongo
クロゲキヤマタケ		———✓✓No———0593/292 (1.0%)6/1196 (0.5%)—
DD
情報不足		Hygrocybe hypohaemacta var. boninensis (Hongo) Hongo
ネッタイアカヌメリガサ		——✓✓✓No———0593/292 (1.0%)6/1196 (0.5%)—
DD
情報不足		Hypsizygus ulmarius (Bull.) Redhead
シロタモギタケ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		40.1 Mbp
20.0x		16,042
10.2 kbp		15772/5 (40.0%)67/652 (10.3%)2021-06-11
DD
情報不足		Leptocorticium cyatheae (S.Ito & S.Imai) Hjortstam & Ryvarden
ヘゴノコウヤクタケ		——✓✓✓No———0060/2 (0.0%)2/571 (0.4%)—
DD
情報不足		Limacella olivaceobrunnea Hongo
ムニンヌメリカラカサタケ		———✓✓No———00180/25 (0.0%)16/1636 (1.0%)—
DD
情報不足		Lysurus gardneri Berk.
ツクシタケ		——✓✓✓No———0030/7 (0.0%)3/140 (2.1%)—
DD
情報不足		Metacordyceps kusanagiensis (Kobayasi & Shimizu) Kepler, G.H.Sung & Spatafora
クサナギヒメタンポタケ		———✓✓No———03221511/239 (4.6%)85/1182 (7.2%)—
DD
情報不足		Metacordyceps pseudoatrovirens (Kobayasi & Shimizu) Kepler, G-.H.Sung & Spatafora
トワダミドリクチキムシタケ		—✓—✓✓No———03221511/239 (4.6%)85/1182 (7.2%)—
DD
情報不足		Morchella patula var. semilibera (DC.) S.Imai
トガリフカアミガサタケ		—✓—✓✓No———0303723/274 (8.4%)25/312 (8.0%)—
DD
情報不足		Mutinus elegans (Mont.) E.Fisch.
タヌキノベニエフデ		—✓✓✓✓No———0030/17 (0.0%)3/140 (2.1%)—
DD
情報不足		Oligoporus obductus (Berk.) Gilb. & Ryvarden
ツガマイタケ		———✓✓No———0040/9 (0.0%)2/155 (1.3%)—
DD
情報不足		"Ophiocordyceps asyuënsis (Kobayasi & Shimizu) G.H.Sung, J.M.Sung, Hywel-Jones & Spatafora"
キイロクビオレタケ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Ophiocordyceps carabidicola (Kobayasi & Shimizu) G.H.Sung, J.M.Sung, Hywel-Jones & Spatafora
ウスイロヒメフトバリタケ		———✓✓No———0187811/266 (4.1%)38/671 (5.7%)—
DD
情報不足		Ophiocordyceps gryllotalpae Petch
ケラタケ		———✓✓No———0187811/266 (4.1%)38/671 (5.7%)—
DD
情報不足		Phallus luteus (Liou & L. Hwang) T. Kasuya
ウスキキヌガサタケ		—✓✓✓✓No———0131/49 (2.0%)3/140 (2.1%)—
DD
情報不足		Phillipsia dochmia (Berk. & M.A.Curtis) Seaver
ヒュウガサラタケ		———✓✓No———0000/14 (0.0%)0/101 (0.0%)—
DD
情報不足		Pleurotus dryinus (Pers.) P.Kumm.
ツバヒラタケ		—✓✓✓✓No———0404114/220 (6.4%)15/324 (4.6%)—
DD
情報不足		Protuberella borealis (S.Imai) S.Imai & Kawam.
ニカワショウロ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Pseudotulostoma japonicum (Kawam.) I.Asai, H.Sato & Nara
コウボウフデ		—✓✓✓✓No———0121/2 (50.0%)2/107 (1.9%)—
DD
情報不足		Ptychoverpa bohemica (Krombh.) Boud.
オオズキンカブリ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Rhizopogon luteolus Fr.
ホンショウロ		—✓✓✓✓No———0333311/389 (2.8%)11/395 (2.8%)—
DD
情報不足		Scleroderma polyrhizum (J.F.Gmel.) Pers.
ツチグリカタカワタケ		—✓✓✓✓No———0332/122 (1.6%)2/136 (1.5%)—
DD
情報不足		Shimizuomyces kibianus Kobayasi & Shimizu
キビノムシタケモドキ		———✓✓No———002150/2 (0.0%)85/1182 (7.2%)—
DD
情報不足		Strobilomyces mirandus Corner
トライグチ		—✓—✓✓No———043864/179 (2.2%)343/2616 (13.1%)—
DD
情報不足		Torrubiella albolanata Petch
オガサワラクモタケ		——✓✓✓No———004490/20 (0.0%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Torrubiella farinacea Kobayasi & Shimizu
シロトガリクモタケ		———✓✓No———004490/20 (0.0%)43/912 (4.7%)—
DD
情報不足		Tulostoma brumale Pers.
ケシボウズタケ		—✓✓✓✓No———00420/126 (0.0%)27/2774 (1.0%)—
DD
情報不足		Tulostoma fimbriatum Fr. var. fimbriatum
アラナミケシボウズタケ		——✓——No———00420/126 (0.0%)27/2774 (1.0%)—
DD
情報不足		Tulostoma fimbriatum var. campestre (Morgan) G.Moreno
ナガエノホコリタケ		—✓✓✓✓No———00420/126 (0.0%)27/2774 (1.0%)—
DD
情報不足		Tulostoma striatum G.Cunn.
ウネミケシボウズタケ		—✓✓✓✓No———00420/126 (0.0%)27/2774 (1.0%)—
DD
情報不足		Volvariella bombycina (Schaeff.) Singer
キヌオオフクロタケ		—✓✓✓✓No———0562/72 (2.8%)3/686 (0.4%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Myxine garmani
ホソヌタウナギ		VU✓✓✓✓No———0371/24 (4.2%)4/77 (5.2%)—
DD
情報不足		Myxine paucidens
オキナホソヌタウナギ		EN✓✓✓✓No———0371/24 (4.2%)4/77 (5.2%)—
DD
情報不足		Chimaera phantasma
ギンザメ		VU✓✓✓✓No———0030/26 (0.0%)2/53 (3.8%)—
DD
情報不足		Hydrolagus barbouri
ココノホシギンザメ		DD✓✓✓✓No———0332/27 (7.4%)2/53 (3.8%)—
DD
情報不足		Harriotta raleighana
アズマギンザメ		LC✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Rhinochimaera africana
クロテングギンザメ		DD✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Rhinochimaera pacifica
テングギンザメ		LC✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Heterodontus japonicus
ネコザメ		LC✓✓✓✓No———0221/11 (9.1%)1/11 (9.1%)—
DD
情報不足		Heterodontus zebra
シマネコザメ		LC✓✓✓✓No———0221/11 (9.1%)1/11 (9.1%)—
DD
情報不足		Orectolobus japonicus
オオセ		LC✓✓✓✓No———0000/29 (0.0%)0/31 (0.0%)—
DD
情報不足		Chiloscylliumpunctatum
イヌザメ		NT✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		3.38 Gbp
45.0x		461,670
21.3 kbp		1682/11 (18.2%)3/20 (15.0%)2018-08-02
DD
情報不足		Stegostoma fasciatum
トラフザメ		EN✓✓✓✓Yes (3)Chromosome,
Reference		3.20 Gbp
48.7x		1,994
6.16 Mbp		3331/1 (100.0%)1/1 (100.0%)2022-02-17
DD
情報不足		Nebrius ferrugineus
オオテンジクザメ		VU✓✓✓✓No———0010/1 (0.0%)1/4 (25.0%)—
DD
情報不足		Mitsukurina owstoni
ミツクリザメ		LC✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Odontaspis ferox
オオワニザメ		VU✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Megachasma pelagios
メガマウスザメ		LC✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Cephaloscylliumumbratile
ナヌカザメ		NT✓✓✓✓No———0040/14 (0.0%)2/147 (1.4%)—
DD
情報不足		Galeocerdo cuvier
イタチザメ		NT✓✓✓✓No———0040/2 (0.0%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus albimarginatus
ツマジロ		VU✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus brachyurus
クロヘリメジロザメ		VU✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus brevipinna
ハナザメ		VU✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus plumbeus
メジロザメ（ヤジブカ）		EN✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus galapagensis
ガラパゴスザメ		LC✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Carcharhinus obscurus
ドタブカ		EN✓✓✓✓No———0141/54 (1.9%)4/120 (3.3%)—
DD
情報不足		Chlamydoselachus anguineus
ラブカ		LC✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Heptranchias perlo
エドアブラザメ		NT✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		3.25 Gbp
60.0x		3,713
4.91 Mbp		2221/1 (100.0%)1/4 (25.0%)2024-01-05
DD
情報不足		Hexanchus griseus
カグラザメ		NT✓✓✓✓No———0020/2 (0.0%)1/4 (25.0%)—
DD
情報不足		Notorynchus cepedianus
エビスザメ		VU✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/4 (25.0%)—
DD
情報不足		Echinorhinus cookei
コギクザメ		DD✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/5 (0.0%)—
DD
情報不足		Somniosus (Somniosus) pacificus
オンデンザメ		NT✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/13 (0.0%)—
DD
情報不足		Oxynotus japonicus
オロシザメ		VU—✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Centrophorus acus
タロウザメ		EN✓✓✓✓No———0000/30 (0.0%)0/43 (0.0%)—
DD
情報不足		Centrophorus squamosus
モミジザメ		EN✓✓✓✓No———0000/30 (0.0%)0/43 (0.0%)—
DD
情報不足		Centrophorus tessellatus
ゲンロクザメ		EN✓✓✓✓No———0000/30 (0.0%)0/43 (0.0%)—
DD
情報不足		Squatina nebulosa
コロザメ		EN✓✓✓✓No———0111/28 (3.6%)1/28 (3.6%)—
DD
情報不足		Squatina formosa
タイワンコロザメ		EN✓✓✓✓No———0111/28 (3.6%)1/28 (3.6%)—
DD
情報不足		Pristiophorus japonicus
ノコギリザメ		LC✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/7 (0.0%)—
DD
情報不足		Rhina ancylostoma
シノノメサカタザメ		CR✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.21 Gbp
85.0x		642,157
4.39 kbp		1111/1 (100.0%)1/1 (100.0%)2023-06-13
DD
情報不足		Rhynchobatus djiddensis
トンガリサカタザメ		CR✓✓✓✓No———0111/45 (2.2%)1/45 (2.2%)—
DD
情報不足		Okamejei kenojei
コモンカスベ		VU✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		2.76 Gbp
247.8x		5,426
1.74 Mbp		22131/17 (5.9%)6/148 (4.1%)2024-01-12
DD
情報不足		Okamejei schmidti
ツマリカスベ		VU✓✓✓✓No———02131/17 (5.9%)6/148 (4.1%)—
DD
情報不足		Urogymnus asperrimus
イバラエイ		VU✓✓✓✓No———0030/7 (0.0%)2/213 (0.9%)—
DD
情報不足		Taeniurameyeni
マダラエイ		VU✓✓✓✓No———0030/1 (0.0%)2/213 (0.9%)—
DD
情報不足		Himantura uarnak
ヒョウモンオトメエイ		EN✓✓✓✓No———0030/26 (0.0%)2/213 (0.9%)—
DD
情報不足		Dasyatis sp.
アリアケアカエイ		—————No———0030/64 (0.0%)2/213 (0.9%)—
DD
情報不足		Gymnura japonica
ツバクロエイ		VU✓✓✓✓No———0000/31 (0.0%)0/32 (0.0%)—
DD
情報不足		Rhinoptera javanica
ウシバナトビエイ		EN✓✓✓✓No———0030/14 (0.0%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Myliobatis tobijei
トビエイ		VU✓✓✓✓No———0030/12 (0.0%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Aetobatus narinari
マダラトビエイ		EN✓✓✓✓No———0030/16 (0.0%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Mobula japanica
イトマキエイ		EN✓✓✓✓No———0332/14 (14.3%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Mobula tarapacana
タイワンイトマキエイ		EN✓✓✓✓No———0332/14 (14.3%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Mobula thurstoni
ヒメイトマキエイ		EN✓✓✓✓No———0332/14 (14.3%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Manta birostris
オニイトマキエイ		EN✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Reference		3.63 Gbp
32.0x		3,300
8.61 Mbp		2332/14 (14.3%)2/69 (2.9%)2023-05-22
DD
情報不足		Manta alfredi
ナンヨウマンタ		VU✓✓✓✓No———0332/14 (14.3%)2/69 (2.9%)—
DD
情報不足		Kaupichthys japonicus
イワアナゴ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/22 (0.0%)—
DD
情報不足		Kaupichthys atronasus
クロヒゲイワアナゴ		—✓✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/22 (0.0%)—
DD
情報不足		Gorgasia japonica
シンジュアナゴ		LC—✓✓✓No———0030/5 (0.0%)1/297 (0.3%)—
DD
情報不足		Gorgasia taiwanensis
アキアナゴ		LC✓✓✓✓No———0030/5 (0.0%)1/297 (0.3%)—
DD
情報不足		Stolephorus commersonnii
ヤエヤマアイノコイワシ		LC✓✓✓✓No———0070/43 (0.0%)6/238 (2.5%)—
DD
情報不足		Pseudotrichonotus altivelis
ホタテエソ		DD✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/2 (0.0%)—
DD
情報不足		Maroubra yasudai
ダイダイヨウジ		DD—✓✓✓No———00370/1 (0.0%)23/603 (3.8%)—
DD
情報不足		Hippichthys (Hippichthys) cyanospilos
ハクテンヨウジ		LC✓✓✓✓No———00370/12 (0.0%)23/603 (3.8%)—
DD
情報不足		Hozukius emblemarius
ホウズキ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		834 Mbp
21.0x		105,283
23.4 kbp		121162/2 (100.0%)89/431 (20.6%)2021-10-09
DD
情報不足		Sebastesmatsubarae
アコウダイ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		809 Mbp
27.0x		66,692
39.2 kbp		110611680/407 (19.7%)89/431 (20.6%)2021-11-13
DD
情報不足		Sebastes alutus
アラスカメヌケ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		794 Mbp
35.0x		80,805
29.8 kbp		110611680/407 (19.7%)89/431 (20.6%)2021-10-09
DD
情報不足		Ursinoscorpaenopsis kitai
クマカサゴ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Luzonichthys whitleyi
ソメワケミナミハナダイ		LC—✓✓✓No———00290/6 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Rabaulichthys suzukii
ホカケハナダイ		—✓✓✓✓No———00290/1 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Plectranthias altipinnatus
チゴハナダイ		——✓✓✓No———00290/26 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Tosanoides filamentosus
イトヒキハナダイ		——✓✓✓No———00290/2 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Meganthias kingyo
イトマンオオキンギョ		—✓✓✓✓No———00290/2 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Odontanthias flagris
ハタタテハナダイ		—✓✓✓✓No———00290/13 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Pseudanthias taira
リュウキュウハナダイ		——✓✓✓No———00290/93 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Pseudanthias venator
クマソハナダイ		——✓✓✓No———00290/93 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Pseudanthias leucozonus
シロオビハナダイ		—✓✓✓✓No———00290/93 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Aethaloperca rogaa
クロハタ		LC✓✓✓✓No———00290/1 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Gracila albomarginata
タテスジハタ		LC✓✓✓✓No———00290/1 (0.0%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Epinephelus latifasciatus
オオスジハタ		LC✓✓✓✓No———012299/133 (6.8%)23/682 (3.4%)—
DD
情報不足		Congrogadus subducens
センニンガジ		LC✓✓✓✓No———0010/2 (0.0%)1/144 (0.7%)—
DD
情報不足		Neamia octospina
ヤツトゲテンジクダイ		—✓✓✓✓No———00170/3 (0.0%)16/583 (2.7%)—
DD
情報不足		Carangoides armatus
ヨロイアジ		LC✓✓✓✓No———00230/5 (0.0%)12/311 (3.9%)—
DD
情報不足		Pentaprion longimanus
タイワンサギ		LC✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/142 (0.0%)—
DD
情報不足		Gerresmicrophthalmus
ヤマトイトヒキサギ		—✓✓✓✓No———0000/93 (0.0%)0/142 (0.0%)—
DD
情報不足		Gerres akazakii
セダカダイミョウサギ		—✓✓✓✓No———0000/93 (0.0%)0/142 (0.0%)—
DD
情報不足		Plectorhinchus chrysotaenia
ニジコショウダイ		—✓✓✓✓No———0010/31 (0.0%)1/185 (0.5%)—
DD
情報不足		Plectorhinchus flavomaculatus
オシャレコショウダイ		—✓✓✓✓No———0010/31 (0.0%)1/185 (0.5%)—
DD
情報不足		Nemipterus tambuloides
ジャバイトヨリ		—✓✓✓✓No———0000/30 (0.0%)0/82 (0.0%)—
DD
情報不足		Chaetodon octofasciatus
ヤスジチョウチョウウオ		LC✓✓✓✓No———0594/98 (4.1%)6/136 (4.4%)—
DD
情報不足		Chaetodon daedalma
ユウゼン		LC✓✓✓✓No———0594/98 (4.1%)6/136 (4.4%)—
DD
情報不足		Genicanthus takeuchii
ミズタマヤッコ		LC—✓✓✓No———0020/7 (0.0%)2/93 (2.2%)—
DD
情報不足		Amblycirrhitus bimaculus
フタホシゴンベ		LC✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/27 (0.0%)—
DD
情報不足		Amphiprion polymnus
トウアカクマノミ		LC✓✓✓✓No———0493/34 (8.8%)7/494 (1.4%)—
DD
情報不足		Amblyglyphidodon ternatensis
ニセクラカオスズメダイ		VU✓✓✓✓No———0090/30 (0.0%)7/494 (1.4%)—
DD
情報不足		Halichoeres leucurus
アミトリキュウセン		LC✓✓✓✓No———01231/155 (0.6%)13/985 (1.3%)—
DD
情報不足		Halichoeres richmondi
ゴシキキュウセン		LC✓✓✓✓No———01231/155 (0.6%)13/985 (1.3%)—
DD
情報不足		Iniistius verrens
バラヒラベラ		LC✓✓✓✓No———00230/19 (0.0%)13/985 (1.3%)—
DD
情報不足		Chlorurus oedema
コブブダイ		LC✓✓✓✓No———00230/19 (0.0%)13/985 (1.3%)—
DD
情報不足		Scarus obishime
オビシメ		DD✓✓✓✓No———01231/91 (1.1%)13/985 (1.3%)—
DD
情報不足		Myoxocephalus polyacanthocephalus
トゲカジカ		—✓✓✓✓No———0292/16 (12.5%)6/352 (1.7%)—
DD
情報不足		Porocottus coronatus
カンムリフサカジカ		—✓✓✓✓No———0090/9 (0.0%)6/352 (1.7%)—
DD
情報不足		Podothecus sachi
トクビレ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/48 (0.0%)—
DD
情報不足		Aptocyclus ventricosus
ホテイウオ		—✓✓✓✓No———0070/1 (0.0%)2/24 (8.3%)—
DD
情報不足		Zoarchias hosoyai
ノトカズナギ		——✓✓✓No———0060/5 (0.0%)4/202 (2.0%)—
DD
情報不足		Zoarchias neglectus
コモンイトギンポ		DD✓✓✓✓No———0060/5 (0.0%)4/202 (2.0%)—
DD
情報不足		Stanulus talboti
ツマリギンポ		LC✓✓✓✓No———0070/6 (0.0%)4/459 (0.9%)—
DD
情報不足		Andamia reyi
カンムリヨダレカケ		DD✓✓✓✓No———0070/2 (0.0%)4/459 (0.9%)—
DD
情報不足		Enchelyurus kraussii
クロギンポ		LC✓✓✓✓No———0070/11 (0.0%)4/459 (0.9%)—
DD
情報不足		Parenchelyurus hepburni
カラスギンポ		LC—✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Pseudapocryptes elongatus
ホコハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/3 (0.0%)20/2517 (0.8%)—
DD
情報不足		Acanthurus achilles
アカツキハギ		LC✓✓✓✓No———08168/52 (15.4%)16/109 (14.7%)—
DD
情報不足		Veraspermoseri
マツカワ		VU✓✓✓✓No———03201/2 (50.0%)11/81 (13.6%)—
DD
情報不足		Torquigener albomaculosus
アマミホシゾラフグ		—✓✓✓✓No———00120/13 (0.0%)8/203 (3.9%)—

Corals
サンゴ類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Rhizotrochus typus
ウチウラタコアシサンゴ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/52 (0.0%)—

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Sandersiella acuminata
カシラエビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Ommatogaster nana
和名なし		—✓—✓—No———0000/1 (0.0%)0/33 (0.0%)—
DD
情報不足		Peltogasterella sensuru
和名なし		—✓✓✓—No———0000/4 (0.0%)0/33 (0.0%)—
DD
情報不足		Polyascus gregaria
モクズガニフクロムシ		—✓———No———0030/11 (0.0%)1/58 (1.7%)—
DD
情報不足		Polyascus polygenea
イソガニフクロムシ		—✓———No———0030/11 (0.0%)1/58 (1.7%)—
DD
情報不足		Cryptolepas rhachianecti
ハイザラフジツボ		—✓✓✓—No———0000/1 (0.0%)0/18 (0.0%)—
DD
情報不足		Goidelia japonica
和名なし		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Splanchnotrophus imagawai
ウズヒマワリウミウシヤドリ		——✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)—
DD
情報不足		Eudactylina gymnuri
和名なし		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)—
DD
情報不足		Eudactylina taeniuri
和名なし		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)—
DD
情報不足		Mihbaicola sakamakii
カクレエラノミ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Pseudocharopinus pteroplateae
ツバクロエイナガクビムシ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/72 (0.0%)—
DD
情報不足		Dinemoleus indeprensus
メガマウスザメジラミ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Echthrogaleusmitsukurinae
和名なし		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Cardiodectes shini
シンノカンザシ		——✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/96 (0.0%)—
DD
情報不足		Nagasawanus snufkini
シンノワキザシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Trebius longicaudatus
和名なし		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Thetispelecaris kumejimensis
和名なし		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Aoroidesmyojinensis
ミョウジンブラブラソコエビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Grandidierella osakaensis
オオサカドロソコエビ		—✓—✓✓No———0000/11 (0.0%)0/65 (0.0%)—
DD
情報不足		Grandidierella sp.
サンリクドロソコエビ		—✓———No———0000/11 (0.0%)0/65 (0.0%)—
DD
情報不足		Heterokamaka isahayae
イサハヤカマカモドキ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Mucrocalliope shimantoensis
シマントヨコエビ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Gnathia limicola
ドロホリウミクワガタ		—✓—✓✓No———0000/66 (0.0%)0/77 (0.0%)—
DD
情報不足		Lipomera sp.
ドウクツヒレオミズムシ		—————No———0020/4 (0.0%)2/478 (0.4%)—
DD
情報不足		Pseudione compressa
和名なし		———✓✓No———0000/7 (0.0%)0/55 (0.0%)—
DD
情報不足		Crinoniscus sp.
Crinoniscus 属の一種		—————No———00000—
DD
情報不足		Littorophiloscia nipponensis
ニッポンヒイロワラジムシ		—✓—✓✓No———0000/7 (0.0%)0/78 (0.0%)—
DD
情報不足		Armadilloniscus japonicus
ニホンハマワラジムシ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/82 (0.0%)—
DD
情報不足		Sicyonella antennata
イソサクラエビ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/61 (0.0%)—
DD
情報不足		Sicyonella inermis
和名なし		———✓✓No———0000/3 (0.0%)0/61 (0.0%)—
DD
情報不足		Sicyonellamaldivensis
和名なし		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Odontozona fasciata
アカオビスベスベオトヒメエビ		——✓✓✓No———0000/9 (0.0%)0/23 (0.0%)—
DD
情報不足		Stenopus pyrsonotus
クメジマオトヒメエビ		—✓✓✓✓No———0000/8 (0.0%)0/23 (0.0%)—
DD
情報不足		Bresilia gibbosa
マンザセキヨウエビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Bresilia rufioculus
メヒカリセキヨウエビ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)—
DD
情報不足		Neostylodactylus liroralis
オリヅルエビ		—————No———0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)—
DD
情報不足		Phyllognathia ceratophthalma
トゲツノメエビ		—✓✓✓✓No———0060/1 (0.0%)3/1019 (0.3%)—
DD
情報不足		Phyllognathia simplex
サガミツノメエビ		——✓✓✓No———0060/1 (0.0%)3/1019 (0.3%)—
DD
情報不足		Alpheus ikedosoma
ユメユムシテッポウエビ		—✓—✓✓No———0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)—
DD
情報不足		Betaeus gelasinifer
エクボテッポウエビモドキ		———✓✓No———0000/14 (0.0%)0/893 (0.0%)—
DD
情報不足		Richalpheus palmeri
和名なし		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/893 (0.0%)—
DD
情報不足		Salmoneus brucei
和名なし		—✓—✓✓No———0000/25 (0.0%)0/893 (0.0%)—
DD
情報不足		Barbouriidae gen. sp.
ガマモエビ		—————No———0000/10 (0.0%)0/10 (0.0%)—
DD
情報不足		Lysmata lipkei
和名なし		—✓✓✓✓No———0000/56 (0.0%)0/376 (0.0%)—
DD
情報不足		Pandalopsis pacifica
ミツクリエビ		———✓✓No———0222/29 (6.9%)2/139 (1.4%)—
DD
情報不足		Enoplometopus chacei
クミショウグンエビ		DD✓✓✓✓No———0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)—
DD
情報不足		Enoplometopus occidentalis
ショウグンエビ		LC✓✓✓✓No———0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)—
DD
情報不足		Corallianassa borradailei
モバホソスナモグリ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Corallianassamartensi
ホソスナモグリ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Glypturus armatus
トゲスナモグリ		—✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Lepidophthalmus rosae
和名なし		—✓✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Neocallichirus calmani
和名なし		—✓—✓✓No———0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Neocallichirus vaugelasi
和名なし		———✓✓No———0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Neocallichirus vigilax
ノコバスナモグリ		—✓✓✓✓No———0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Paratrypaea bouvieri
ブビエスナモグリ		—✓—✓✓No———0000/4 (0.0%)0/173 (0.0%)—
DD
情報不足		Naushonia carinata
和名なし		—✓—✓✓No———0000/7 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Naushonia lactoalbida
和名なし		—✓—✓✓No———0000/7 (0.0%)0/11 (0.0%)—
DD
情報不足		Upogebia iriomotensis
和名なし		—✓—✓✓No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Upogebiamiyakei
和名なし		—✓—✓✓No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Upogebia rupicola
イワホリアナジャコ		———✓—No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Upogebia snelliusi
ナンヨウトゲアナジャコ		—✓—✓✓No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Upogebia spinidactylus
和名なし		—✓—✓✓No———0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Justitia longimanus
カギテリョウマエビ		DD——✓✓No———00150/1 (0.0%)13/64 (20.3%)—
DD
情報不足		Neopetrolisthes spinatus
ムシャカニダマシ		——✓✓✓No———0020/1 (0.0%)2/232 (0.9%)—
DD
情報不足		Petrolisthes bifidus
ドロイワカニダマシ		———✓✓No———0222/62 (3.2%)2/232 (0.9%)—
DD
情報不足		Aniculus sibogae
クロシマオニヤドカリ		——✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/322 (0.0%)—
DD
情報不足		Clibanarius ambonensis
ヒルギノボリヨコバサミ		—✓✓✓✓No———0000/45 (0.0%)0/322 (0.0%)—
DD
情報不足		Diogenes nitidimanus
テナガツノヤドカリ		—✓✓✓✓No———0000/54 (0.0%)0/322 (0.0%)—
DD
情報不足		Catapaguroides longior
マンザガマヒメヤドカリ		———✓✓No———0040/1 (0.0%)4/268 (1.5%)—
DD
情報不足		Kumepagurus cavernicolus
クメジマドウクツヤドカリ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Pagurus angustus
キカイホンヤドカリ		—✓✓✓✓No———0444/106 (3.8%)4/268 (1.5%)—
DD
情報不足		Calappa clypeata
ヒメカラッパ		—✓—✓✓No———0000/33 (0.0%)0/61 (0.0%)—
DD
情報不足		Calappa quadrimaculata
ヨツモンカラッパ		—✓—✓✓No———0000/33 (0.0%)0/61 (0.0%)—
DD
情報不足		Notonyx kumi
リュウキュウカクエンコウガニ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)—
DD
情報不足		Hexapinus simplex
ヤドリムツアシガニ		—✓—✓✓No———0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)—
DD
情報不足		Arcania novemspinosa
ニシヒラトゲコブシ		—✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/95 (0.0%)—
DD
情報不足		Philyra nishihirai
マンガルマメコブシガニ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Scylla olivacea
アカテノコギリガザミ		—✓✓✓✓No———0291/21 (4.8%)4/525 (0.8%)—
DD
情報不足		Geograpsus stormi
アカカクレイワガニ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/52 (0.0%)—
DD
情報不足		Pachygrapsus fakaravensis
ヨコスジイワガニ		—✓✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/52 (0.0%)—
DD
情報不足		Chiromantes leptomerus
ハワイベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/5 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Neosarmatiumfourmanoiri
オオアシハラガニモドキ		—✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Neosarmatiumlaeve
ヒナアシハラモドキ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Neosarmatiummeinerti
シロテアシハラガニモドキ		—✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Sarmatiumgermaini
ギザテアシハラガニ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Sesarmoides kraussi
アシナガベンケイガニ		——✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Stelgistra stormi
スマトライワベンケイガニ		—✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/273 (0.0%)—
DD
情報不足		Cyclograpsus pumilio
マメアカイソガニ		———✓✓No———0050/7 (0.0%)1/116 (0.9%)—
DD
情報不足		Scutumara enodis
オキナワヒライソモドキ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Sestrostoma depressum
ヒメアカイソモドキ		—✓—✓✓No———0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)—
DD
情報不足		Mortensenella forceps
ハサミカクレガニ		——✓✓✓No———00000—
DD
情報不足		Takedellus ambonense
ミナミムツバアリアケガニ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Macrophthalmus barnesi
ヒメノコハオサガニ		———✓—No———0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)—
DD
情報不足		Macrophthalmus quadratus
ナカグスクオサガニ		—✓✓✓✓No———0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)—
DD
情報不足		Uruma ourana
オオウラコユビピンノ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Nepinnotheres cardii
カワラピンノ		———✓✓No———0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)—
DD
情報不足		Pinnixa sp.
ホンコンマメガニ		—————No———0000/29 (0.0%)0/172 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
DD
情報不足		Lingula nipponica
ムツシャミセンガイ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Reference		406 Mbp
226.0x		13,877
56.1 kbp		1111/19 (5.3%)1/41 (2.4%)2018-01-26
DD
情報不足		Lingula sp. 1
ミドリシャミセンガイ種1（奄美大島笠利湾など）		—————No———0111/19 (5.3%)1/41 (2.4%)—
DD
情報不足		Lingula sp. 2
ミドリシャミセンガイ種2（有明海など）		—————No———0111/19 (5.3%)1/41 (2.4%)—
DD
情報不足		Lingula sp. 3
ミドリシャミセンガイ種3（下田沖など）		—————No———0111/19 (5.3%)1/41 (2.4%)—
DD
情報不足		Hesperonoe hwanghaiensis
アナジャコウロコムシ		———✓✓No———00100/2 (0.0%)6/619 (1.0%)—
DD
情報不足		Natsushima graciliceps
サツマフタカギヤドリ		———✓✓No———0000/2 (0.0%)0/6 (0.0%)—
DD
情報不足		Marphysa tamurai
ビクニイワムシ		—✓✓✓✓No———0000/81 (0.0%)0/226 (0.0%)—
DD
情報不足		Siphonosoma funafuti
アマミスジホシムシモドキ		—✓—✓✓No———0010/15 (0.0%)1/58 (1.7%)—
DD
情報不足		Anelassorhyncusmucosus
ミドリユムシ		———✓✓No———00000—
DD
情報不足		Arhynchite arhynchite
ドチクチユムシ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/39 (0.0%)—
DD
情報不足		Balanoglossus simodensis
シモダギボシムシ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)1/21 (4.8%)—
DD
情報不足		Saccoglossus borealis
キタギボシムシ		——✓✓✓No———0332/10 (20.0%)2/33 (6.1%)—
DD
情報不足		Epigonichthysmaldivensis
カタナメクジウオ		—✓✓✓✓No———00170/2 (0.0%)6/26 (23.1%)—