Genome sequence data availability
for the Japanese Red List

Updated on 2026-05-08

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mogera uchidai
センカクモグラ		VU—✓✓✓—/——/—No———01111/10 (10.0%)9/108 (8.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pteropus dasymallus daitoensis
ダイトウオオコウモリ		——✓✓✓—/——/—No———08235/59 (8.5%)14/187 (7.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pteropus dasymallus dasymallus
エラブオオコウモリ		——✓✓✓—/——/—No———08235/59 (8.5%)14/187 (7.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Myotis formosus
クロアカコウモリ		NT✓✓✓—✓/10✓/✓No———0337822/379 (5.8%)44/913 (4.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Myotis yanbarensis
ヤンバルホオヒゲコウモリ		CR✓✓✓——/——/—No———0337822/379 (5.8%)44/913 (4.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Apodemus agrarius
セスジネズミ		LC✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		2.61 Gbp
70		242
35.2 Mbp		161563/36 (8.3%)38/1209 (3.1%)2024-04-12
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tokudaia muenninki
オキナワトゲネズミ		CR✓✓✓✓—/——/✓Yes (3)Scaffold,
Reference		3.67 Gbp
100		53
138 Mbp		361563/3 (100.0%)38/1209 (3.1%)2023-09-08
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Prionailurus bengalensis euptilurus
ツシマヤマネコ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
—		2.42 Gbp
100		319,281
20.4 kbp		38693/5 (60.0%)23/59 (39.0%)2020-09-15
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Prionailurus bengalensis iriomotensis
イリオモテヤマネコ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (2)Scaffold,
Reference		2.38 Gbp
100		6,107
1.16 Mbp		28693/5 (60.0%)23/59 (39.0%)2021-03-31
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Enhydra lutris
ラッコ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (4)Scaffold,
Reference		2.46 Gbp
110		29,591
245 kbp		44761/1 (100.0%)23/73 (31.5%)2017-09-11
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Zalophus japonicus
ニホンアシカ		EX✓✓✓✓—/—✓/✓No———04131/3 (33.3%)5/16 (31.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dugong dugon
ジュゴン		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (5)Chromosome,
Reference		3.16 Gbp
32		294
57.6 Mbp		5561/1 (100.0%)2/2 (100.0%)2020-08-31

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anser caerulescens caerulescens
ハクガン		—✓✓✓✓—/——/—No———23632510/16 (62.5%)135/213 (63.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Branta hutchinsii leucopareia
シジュウカラガン		—✓✓✓✓—/——/—No———3183256/10 (60.0%)135/213 (63.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Columba janthina nitens
アカガシラカラスバト		—✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.08 Gbp
60		32,051
110 kbp		130646/38 (15.8%)24/355 (6.8%)2020-08-22
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Puffinus bryani
オガサワラヒメミズナギドリ		CR✓✓✓✓—/——/—No———07235/32 (15.6%)15/113 (13.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oceanodroma castro
クロコシジロウミツバメ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0101/2 (50.0%)0—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ciconia boyciana
コウノトリ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		1.24 Gbp
81		429
35.8 Mbp		316237/8 (87.5%)12/66 (18.2%)2019-05-08
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phalacrocorax urile
チシマウガラス		LC✓✓✓✓✓/——/—No———011116/21 (28.6%)6/44 (13.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ixobrychus eurhythmus
オオヨシゴイ		LC✓✓✓✓✓/9✓/✓No———00230/10 (0.0%)14/68 (20.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nipponia nippon
トキ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Scaffold,
Reference		1.22 Gbp
105		130,029
29.1 kbp		33151/1 (100.0%)8/31 (25.8%)2014-06-16
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gallirallus okinawae
ヤンバルクイナ		EN✓✓✓✓✓/10—/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
100		440
20.7 Mbp		24313/10 (30.0%)19/145 (13.1%)2019-05-11
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eurynorhynchus pygmeus
ヘラシギ		CR✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.18 Gbp
38		44,335
189 kbp		13610518/24 (75.0%)58/89 (65.2%)2018-10-30
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tringa guttifer
カラフトアオアシシギ		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———01910511/16 (68.8%)58/89 (65.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fratercula cirrhata
エトピリカ		LC✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.11 Gbp
85		111,227
19.7 kbp		16172/3 (66.7%)9/23 (39.1%)2020-08-22
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Synthliboramphus antiquus
ウミスズメ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———01171/4 (25.0%)9/23 (39.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Uria aalge inornata
ウミガラス		—✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
—		1.04 Gbp
74		104,657
19.4 kbp		23172/2 (100.0%)9/23 (39.1%)2020-08-22
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Spilornis cheela perplexus
カンムリワシ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.23 Gbp
100		824
19.5 Mbp		122172/13 (15.4%)151/276 (54.7%)2025-06-26
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aegolius funereus magnus
キンメフクロウ		——✓✓✓—/——/—No———22651/4 (25.0%)43/188 (22.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bubo bubo
ワシミミズク		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.26 Gbp
104		133,317
37.1 kbp		111654/18 (22.2%)43/188 (22.9%)2020-02-04
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ketupa blakistoni blakistoni
シマフクロウ		——✓—✓—/——/—No———111654/18 (22.2%)43/188 (22.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Picoides tridactylus inouyei
ミユビゲラ		———✓✓—/——/—No———22351/6 (16.7%)21/227 (9.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sapheopipo noguchii
ノグチゲラ		EN✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.13 Gbp
74		179,014
18.5 kbp		12352/14 (14.3%)21/227 (9.3%)2019-02-16
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lanius tigrinus
チゴモズ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———012158/30 (26.7%)9/34 (26.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chloris sinica kittlitzi
オガサワラカワラヒワ		—✓✓✓✓—/——/✓No———021491/6 (16.7%)74/297 (24.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Emberiza aureola ornata
シマアオジ		—✓✓✓✓✓/——/—No———22814918/44 (40.9%)74/297 (24.9%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Goniurosaurus kuroiwae orientalis
マダラトカゲモドキ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0030/29 (0.0%)2/49 (4.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Goniurosaurus kuroiwae toyamai
イヘヤトカゲモドキ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0030/29 (0.0%)2/49 (4.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Goniurosaurus kuroiwae yamashinae
クメトカゲモドキ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0030/29 (0.0%)2/49 (4.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Takydromus toyamai
ミヤコカナヘビ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———00490/24 (0.0%)26/416 (6.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Opisthotropis kikuzatoi
キクザトサワヘビ		CR✓✓✓✓—/——/—No———00800/23 (0.0%)63/1077 (5.8%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hynobius abei
アベサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hynobius amakusaensis
アマクササンショウウオ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hynobius mikawaensis
ミカワサンショウウオ		CR—✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hynobius tosashimizuensis
トサシミズサンショウウオ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0000/91 (0.0%)0/137 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Onychodactylus tsukubaensis
ツクバハコネサンショウウオ		CR—✓✓✓—/——/—No———0000/15 (0.0%)0/137 (0.0%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Echidna rhodochilus
ナミダカワウツボ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0050/9 (0.0%)5/204 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Uropterygius concolor
コゲウツボ		LC✓✓✓✓✓/——/✓No———0050/18 (0.0%)5/204 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acheilognathus cyanostigma
イチモンジタナゴ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0131/51 (2.0%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acheilognathus longipinnis
イタセンパラ		EN✓✓✓✓—/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		814 Mbp
65		73,939
20.7 kbp		1131/51 (2.0%)3/116 (2.6%)2024-05-30
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acheilognathus tabira jordani
ミナミアカヒレタビラ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———0131/51 (2.0%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acheilognathus tabira nakamurae
セボシタビラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0131/51 (2.0%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acheilognathus typus
ゼニタナゴ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0131/51 (2.0%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aphyocypris chinensis
ヒナモロコ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00540/9 (0.0%)26/222 (11.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carassius sp.
フナ属の１種（琉球列島）		—✓———✓/——/—No———0161535/50 (10.0%)87/2457 (3.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gnathopogon caerulescens
ホンモロコ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———00250/13 (0.0%)14/358 (3.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ischikauia steenackeri
ワタカ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00540/1 (0.0%)26/222 (11.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pseudorasbora pugnax
ウシモツゴ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———04252/7 (28.6%)14/358 (3.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pseudorasbora pumila
シナイモツゴ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———04252/7 (28.6%)14/358 (3.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhodeus atremius suigensis
スイゲンゼニタナゴ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0232/53 (3.8%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhodeus ocellatus kurumeus
ニッポンバラタナゴ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———1232/53 (3.8%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sarcocheilichthys biwaensis
アブラヒガイ		EN✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00250/16 (0.0%)14/358 (3.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tanakia tanago
ミヤコタナゴ		EN✓—✓✓✓/10—/✓No———0030/1 (0.0%)3/116 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cobitis minamorii minamorii
サンヨウコガタスジシマドジョウ		—✓✓——✓/——/✓No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cobitis minamorii yodoensis
ヨドコガタスジシマドジョウ		——✓✓✓—/——/—No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cobitis striata hakataensis
ハカタスジシマドジョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cobitis takenoi
タンゴスジシマドジョウ		CR✓✓✓✓—/——/—No———06156/249 (2.4%)9/477 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Parabotia curtus
アユモドキ		CR✓✓✓✓✓/——/✓No———0181/8 (12.5%)7/66 (10.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Plecoglossus altivelis ryukyuensis
リュウキュウアユ		—✓✓✓✓—/——/—No———4441/1 (100.0%)1/1 (100.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Neosalanx reganius
アリアケヒメシラウオ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———05185/30 (16.7%)14/57 (24.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Salanx ariakensis
アリアケシラウオ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		522 Mbp
24		366,279
3.18 kbp		13183/5 (60.0%)14/57 (24.6%)2025-06-26
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oncorhynchus nerka
ベニザケ（ヒメマス）		LC✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		2.65 Gbp
23		15,727
2.84 Mbp		228799/47 (19.1%)28/698 (4.0%)2019-06-07
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Monopterus sp.
タウナギ属の１種（琉球列島）		—————✓/——/—No———0221/9 (11.1%)1/83 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gasterosteus aculeatus subsp. 2
ハリヨ		——————/——/—No———1011212/10 (20.0%)6/60 (10.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pungitius sp. 3
トミヨ属雄物型		——————/——/—No———06212/47 (4.3%)6/60 (10.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pungitius sp. 4
ムサシトミヨ		——————/——/—No———06212/47 (4.3%)6/60 (10.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Microphis argulus
ホシイッセンヨウジ		LC✓—✓✓—/——/—No———00540/3 (0.0%)34/615 (5.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Microphis jagorii
ヒメテングヨウジ		DD✓✓✓✓✓/——/—No———01541/3 (33.3%)34/615 (5.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Microphis retzii
タニヨウジ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00540/14 (0.0%)34/615 (5.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cestraeus plicatilis
カワボラ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00110/3 (0.0%)6/369 (1.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tetraroge barbata
アゴヒゲオコゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0010/2 (0.0%)1/29 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tetraroge nigra
ヒゲソリオコゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0010/2 (0.0%)1/29 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Yarica hyalosoma
カガミテンジクダイ		LC✓✓✓✓✓/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.03 Gbp
135		168,358
10.6 kbp		14304/122 (3.3%)26/607 (4.3%)2024-03-19
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lutjanus goldiei
ウラウチフエダイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0172611/123 (8.9%)17/337 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sillago parvisquamis
アオギス		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———0121/110 (0.9%)2/119 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Toxotes jaculatrix
テッポウウオ		LC✓✓✓✓✓/——/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		622 Mbp
60		194
15.6 Mbp		2553/7 (42.9%)3/7 (42.9%)2021-04-15
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mesopristes argenteus
ニセシマイサキ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0080/4 (0.0%)7/59 (11.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mesopristes cancellatus
ヨコシマイサキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0080/4 (0.0%)7/59 (11.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mesopristes iravi
シミズシマイサキ		DD✓✓✓✓—/——/—No———0080/4 (0.0%)7/59 (11.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Enneapterygius cheni
ウラウチヘビギンポ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0020/104 (0.0%)2/264 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Omobranchus ferox
カワギンポ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———01141/45 (2.2%)11/489 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Omox biporos
ヒルギギンポ		LC—✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhyacichthys aspro
ツバサハゼ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		595 Mbp
28		3,182
1.67 Mbp		1111/2 (50.0%)1/3 (33.3%)2024-11-08
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Butis amboinensis
ヤエヤマノコギリハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00190/12 (0.0%)14/292 (4.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bathygobius sp.
カワクモハゼ		—✓———✓/——/—No———00500/34 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callogobius sp.
ミスジハゼ		—✓————/——/—No———00500/23 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cristatogobius aurimaculatus
ヒメトサカハゼ		—✓✓✓✓—/——/—No———00500/3 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cristatogobius nonatoae
クロトサカハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00500/3 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eviota ocellifer
ウラウチイソハゼ		CR✓✓✓✓✓/——/✓No———00500/199 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glossogobius aureus
コンジキハゼ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00500/79 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glossogobius bicirrhosus
アゴヒゲハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/79 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gymnogobius isaza
イサザ		EN✓✓✓✓✓/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		729 Mbp
72		36,765
44.7 kbp		11501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)2024-05-03
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gymnogobius nakamurae
コシノハゼ		——✓———/——/—No———01501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gymnogobius sp. 2
ホクリクジュズカケハゼ		——————/——/—No———01501/26 (3.8%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lentipes armatus
ヨロイボウズハゼ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00500/14 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Luciogobius albus
ドウクツミミズハゼ		CR—✓✓✓—/——/—No———00500/43 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oxyurichthys takagi
シマサルハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00500/24 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhinogobius sp. BB
アオバラヨシノボリ		—✓————/——/—No———03502/140 (1.4%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Scartelaos histophorus
トカゲハゼ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		695 Mbp
72		209,353
8.81 kbp		11501/8 (12.5%)37/2671 (1.4%)2014-12-02
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sicyopus zosterophorus
アカボウズハゼ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00500/9 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Smilosicyopus leprurus
カエルハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/6 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stiphodon alcedo
ヒスイボウズハゼ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00500/29 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stiphodon atropurpureus
コンテリボウズハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00500/29 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stiphodon imperiorientis
ハヤセボウズハゼ		VU✓✓✓✓—/——/—No———00500/29 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Parioglossus interruptus
ヒメサツキハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00500/11 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Parioglossus taeniatus
コマチハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00500/11 (0.0%)37/2671 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Macropodus opercularis
タイワンキンギョ		LC✓✓✓✓✓/8✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		483 Mbp
150		151
19.2 Mbp		22111/8 (12.5%)6/171 (3.5%)2023-05-15

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Erythromma humerale
アカメイトトンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/4 (0.0%)4/1131 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Indolestes boninensis
オガサワラアオイトトンボ		CR✓✓✓✓✓/——/—No———0020/7 (0.0%)1/91 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hemicordulia ogasawarensis
オガサワラトンボ		EN✓✓✓✓✓/1—/—No———0030/9 (0.0%)2/213 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Libellula angelina
ベッコウトンボ		CR✓✓✓✓✓/2✓/✓No———0090/21 (0.0%)6/683 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Orthetrum poecilops
ミヤジマトンボ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———0291/35 (2.9%)6/683 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Celes akitanus
アカハネバッタ		—✓✓✓✓—/——/—No———00160/3 (0.0%)12/2024 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ogasawaracris gloriosus
マボロシオオバッタ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oxya ogasawarensis
オガサワライナゴ		——✓✓✓—/——/—No———00160/20 (0.0%)12/2024 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platypleura albivannata
イシガキニイニイ		———✓✓—/——/—No———0070/64 (0.0%)5/1314 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplonychus rusticus
タイワンコオイムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0010/12 (0.0%)1/237 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lethocerus indicus
タイワンタガメ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		427 Mbp
60		502
5.90 Mbp		1111/17 (5.9%)1/237 (0.4%)2021-09-01
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Laccotrephes grossus
タイワンタイコウチ		—✓✓✓——/——/—No———0020/11 (0.0%)2/59 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aphelocheirus kawamurae
カワムラナベブタムシ		——✓✓——/——/—No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carabus arrowianus kirimurai
ミカワオサムシ御浜町亜種		—✓✓✓✓—/——/—No———09947/457 (1.5%)56/6793 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chlaenius praefectus
アオヘリアオゴミムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———00940/51 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cylindera bonina
オガサワラハンミョウ		—✓✓✓——/1—/—No———00940/68 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oodes virens
オオヒラタトックリゴミムシ		——✓✓✓—/——/—No———00940/6 (0.0%)56/6793 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pterostichus yokohamae
ヨコハマナガゴミムシ		———✓——/——/—No———08944/302 (1.3%)56/6793 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Copelatus parallelus
コセスジゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———0020/475 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cybister lewisianus
マルコガタノゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0020/42 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cybister limbatus
フチトリゲンゴロウ		—✓✓✓——/1—/—No———0020/42 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dytiscus sharpi
シャープゲンゴロウモドキ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0020/28 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hydaticus thermonectoides
マダラシマゲンゴロウ		——✓✓——/——/—No———0020/33 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hyphydrus orientalis
ニセコケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/30 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhantaticus congestus
マダラゲンゴロウ		—✓✓✓✓✓/2—/—No———0020/1 (0.0%)1/3122 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gyrinus ryukyuensis
リュウキュウヒメミズスマシ		——✓———/——/—No———0000/77 (0.0%)0/294 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Quedius kiuchii
リュウノイワヤツヤムネハネカクシ		———✓——/——/—No———02841/304 (0.3%)60/7592 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Neolucanus insulicola donan
ヨナグニマルバネクワガタ		—✓✓✓✓—/——/—No———0080/74 (0.0%)7/1622 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oryctes hisamatsui
ヒサマツサイカブト		——✓✓——/——/—No———07802/16 (12.5%)50/5288 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chrysobothris boninensis suzukii
オガサワラムツボシタマムシ母島亜種		———✓✓—/——/—No———0080/36 (0.0%)5/803 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tamamushia virida fujitai
ツマベニタマムシ聟島亜種		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Luciola owadai
クメジマボタル		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/2 (0.0%)9/679 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glipa asahinai
キンモンオビハナノミ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/439 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glipa kurosawai
クロサワオビハナノミ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/439 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glipa ogasawarensis
オガサワラオビハナノミ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/439 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hoshihananomia katoi boninensis
ニセキボシハナノミ小笠原亜種		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/439 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hoshihananomia kusuii
クスイキボシハナノミ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/439 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Agapanthia japonica
フサヒゲルリカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00520/17 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Boninella anoplos
ケズネオガサワラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Boninella hirsuta
アラゲオガサワラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Boninella igai
ヒメオガサワラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Boninella satoi masatakai
サトウオガサワラカミキリ母島亜種		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bonipogonius fujitai
ヒゲシロアラゲカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00520/035/3267 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phytoecia coeruleomicans
アオキクスイカミキリ		———✓✓—/——/—No———02521/20 (5.0%)35/3267 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Xylotrechus takakuwai
ミイロトラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00520/60 (0.0%)35/3267 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Donacia frontalis
アオノネクイハムシ		——✓✓——/——/—No———011461/62 (1.6%)78/7057 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ogasawarazo daitoensis
ダイトウスジヒメカタゾウムシ		————✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ogasawarazo rugosicephalus hahajimaensis
ヒメカタゾウムシ母島亜種		——————/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Orussus boninensis
オガサワラヤドリキバチ		——————/——/—No———0111/7 (14.3%)1/12 (8.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chrysis boninensis
オガサワラセイボウ		——————/——/—No———0261/219 (0.5%)4/498 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aphaenogaster gamagumayaa
ガマアシナガアリ		———✓✓—/——/—No———0103099/369 (2.4%)237/25962 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pison tosawai
チチジマピソン		———✓✓—/——/—No———00330/21 (0.0%)20/1472 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anopheles yatsushiroensis
ヤツシロハマダラカ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———012318049/1158 (4.2%)73/3869 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Simulium yonakuniense
ヨナクニウォレスブユ		—✓—✓—✓/——/—No———0000/1884 (0.0%)0/2238 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carterocephalus palaemon akaishianus
タカネキマダラセセリ赤石山脈亜種		—✓—✓✓—/——/—No———254903/16 (18.8%)411/3582 (11.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pyrgus malvae unomasahiroi
ヒメチャマダラセセリ		—✓✓———/——/—No———22049010/39 (25.6%)411/3582 (11.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pieris canidia kaolicola
タイワンモンシロチョウ対馬・朝鮮半島亜種		—✓✓✓—✓/——/—No———022989/59 (15.3%)45/954 (4.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Antigius butleri kurinodakensis
ウスイロオナガシジミ鹿児島県栗野岳亜種		——✓———/——/—No———001130/3 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Celastrina ogasawaraensis
オガサワラシジミ		—✓✓———/——/—No———021131/22 (4.5%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Everes lacturnus lacturnus
タイワンツバメシジミ名義タイプ亜種, 琉球亜種		———✓—✓/——/—No———081134/16 (25.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Japonica onoi mizobei
カシワアカシジミ（キタアカシジミ）冠高原亜種		—✓✓———/1—/—No———001130/5 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phengaris teleius kazamoto
ゴマシジミ関東・中部亜種		—✓————/——/—No———051132/11 (18.2%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pithecops fulgens tsushimanus
ツシマウラボシシジミ		—✓————/——/—No———001130/4 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Plebejus subsolanus iburiensis
アサマシジミ北海道亜種		——————/——/—No———091134/66 (6.1%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Shijimia moorei moorei
ゴイシツバメシジミ		—✓✓✓——/——/—No———001130/1 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Shijimiaeoides divinus barine
オオルリシジミ本州亜種		——✓———/——/—No———001130/1 (0.0%)56/2816 (2.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Coenonympha oedippus annulifer
ヒメヒカゲ長野県・群馬県亜種		——✓———/——/—No———1148256/41 (14.6%)238/5597 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fabriciana nerippe
オオウラギンヒョウモン		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———028251/11 (9.1%)238/5597 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Melitaea protomedia
ウスイロヒョウモンモドキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———03082514/171 (8.2%)238/5597 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Melitaea scotosia
ヒョウモンモドキ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———03082514/171 (8.2%)238/5597 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oeneis norna sugitanii
タカネヒカゲ八ヶ岳亜種		—✓✓——✓/——/—No———268253/32 (9.4%)238/5597 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sebastosema bubonaria
カバシタムクゲエダシャク		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oxytrypia orbiculosa
ミヨタトラヨトウ		——✓✓✓✓/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sideridis incommoda
アサギリヨトウ（キシダムラサキヨトウ）		—✓✓✓—✓/——/—No———025511/19 (5.3%)247/7092 (3.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sinocharis korbae
ノシメコヤガ		—✓✓✓✓✓/——/—No———005510/1 (0.0%)247/7092 (3.5%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ogasawarana obtusa
ミガキヤマキサゴ		——————/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chamalycaeus okinawaensis
オキナワムシオイ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/21 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chamalycaeus sp.
イリオモテムシオイ		——————/——/—No———0000/2 (0.0%)0/270 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nobuea sp.
ゴトウノブエガイ		——————/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pirenella cancellata
ヌノメヘナタリ		——✓✓✓—/——/—No———0000/10 (0.0%)0/49 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angustassiminea sp. A
ヘドクリイロカワザンショウ		——————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angustassiminea sp. B
ティンダハナタクリイロカワザンショウ		——————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angustassiminea sp. C
ウフアガリクリイロカワザンショウ		——————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cavernacmella sp. A
ナラオゴマオカチグサ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cavernacmella sp. B
コシキゴマオカチグサ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cavernacmella sp. C
ウフアガリゴマオカチグサ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paludinellassiminea daitoensis
ダイトウオカチグサ (ダイトウヘソカド)		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paludinellassiminea miyakoinsularis
ミヤコオカチグサ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paludinellassiminea sp. A
タマグスクオカチグサ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paludinellassiminea sp. B
ドナンオカチグサ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/80 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Parafossarulus manchouricus japonicus
マメタニシ		—✓————/——/—No———0020/4 (0.0%)1/42 (2.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gammatricula shini
ヨナグニカタヤマガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/5 (0.0%)1/129 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Truncatella oagariensis
オカクビキレ		———✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Truncatella sp. B
アソブイトクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Truncatella sp. C
カガヨイクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Truncatella sp. D
キザハシクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Truncatella sp. E
ロウタキクビキレ		——————/——/—No———0000/12 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Marginellidae gen. &. sp.
オカトリノコガイ		——————/——/—No———0000/59 (0.0%)0/59 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mathilda sinensis
タクミニナ		———✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Camptoceras hirasei
カワネジガイ		DD✓✓✓✓—/——/—No———00210/1 (0.0%)8/688 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ferrissia nipponica
カワコザラ		—✓—✓—✓/——/—No———0000/22 (0.0%)0/223 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Succinea sp.
ダイトウオカモノアラガイ		—✓———✓/——/—No———0000/94 (0.0%)0/186 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Luchuena sp.
クメジマキセルモドキ		——————/——/—No———0000/00/87 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Megalophaedusa fukudainadai
ナルトギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/56 (0.0%)1/648 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stereophaedusa sp. (Sm)
ナタマメギセル（小型）		——————/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stereophaedusa striatella
ミヤコオキナワギセル		—✓————/——/—No———0010/40 (0.0%)1/648 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Zaptyx daitojimana
ダイトウノミギセル		———✓✓—/——/—No———0010/41 (0.0%)1/648 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cipangocharax ananensis
アナンムシオイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nesiohelix omphalina bipyramidalis
オオアガリマイマイ		——————/——/—No———0050/7 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nesiohelix omphalina omphalina
ヘソアキアツマイマイ		——————/——/—No———0050/7 (0.0%)5/1601 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sinohyriopsis schlegelii
イケチョウガイ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———01101/4 (25.0%)10/895 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Apolymetis meyeri
チリメンジュロウジン		——✓✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyclina sp.
ダテオキシジミ		——————/——/—No———01351/1 (100.0%)19/287 (6.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Borniopsis sp．
ヨコヅナケボリ		——————/——/—No———0020/4 (0.0%)1/68 (1.5%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Huperzia somae
コスギトウゲシバ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/71 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lycopodiella caroliniana
イヌヤチスギラン		—✓—✓✓—/1—/—No———0040/4 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lycopodium sieboldii var. christensenianum
リュウキュウヒモラン		—✓————/——/—No———0040/189 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phlegmariurus carinatus
ボウカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/189 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phlegmariurus fargesii
ヒモスギラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/189 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phlegmariurus salvinioides
ヒメヨウラクヒバ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/189 (0.0%)3/332 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Equisetum variegatum
チシマヒメドクサ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0000/36 (0.0%)0/37 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Botrychium lanceolatum
ミヤマハナワラビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/66 (0.0%)0/143 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Botrychium triangularifolium
ミドリハナワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/143 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angiopteris fokiensis
ヒノタニリュウビンタイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/45 (0.0%)0/162 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callistopteris apiifolia
キクモバホラゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/2 (0.0%)0/454 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cephalomanes atrovirens
サキシマホラゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/454 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Didymoglossum bimarginatum
マルバコケシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/39 (0.0%)0/454 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hymenophyllum digitatum
ユビコケシノブ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/184 (0.0%)0/454 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hymenophyllum pilosissimum
ムクゲコケシノブ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/184 (0.0%)0/454 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Plagiogyria stenoptera
シマヤマソテツ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/19 (0.0%)0/19 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lindsaea ensifolia
イヌイノモトソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/155 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lindsaea kawabatae
シノブホングウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/155 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontosoria minutula
コビトホラシノブ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0000/24 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontosoria yaeyamensis
ヤエヤマホラシノブ		——✓✓✓—/——/—No———0000/24 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Antrophyum formosanum
シマタキミシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/37 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cheilanthes krameri
イワウラジロ		—✓—✓✓—/1—/—No———0050/29 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Coniogramme gracilis
ホソバイワガネソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/27 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Haplopteris mediosora
イトシシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/55 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Haplopteris yakushimensis
オオバシシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/55 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pteris grevilleana
アシガタシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pteris kawabatae
カワバタハチジョウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/261 (0.0%)3/1233 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Microlepia obtusiloba var. angustata
ホソバコウシュンシダ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/44 (0.0%)0/174 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acystopteris tenuisecta
ホウライウスヒメワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/3 (0.0%)0/38 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asplenium castaneoviride
ヤマドリトラノオ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asplenium ensiforme
ホコガタシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asplenium griffithianum
フササジラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asplenium oligophlebium var. iezimaense
イエジマチャセンシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/456 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hymenasplenium cardiophyllum
ヒメタニワタリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/58 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hymenasplenium subnormale
ウスイロホウビシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/58 (0.0%)0/516 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Woodsia subcordata
キタダケデンダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/25 (0.0%)0/41 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium arisanense var. arisanense
タイワンアリサンイヌワラビ		——————/——/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium arisanense var. kenzo-satakei
シビイヌワラビ		————✓—/——/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium masamunei
ヤクイヌワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium neglectum subsp. australe
シイバサトメシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium opacum f. glabrescens
ナンゴクシケチシダ		————✓—/——/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium reflexipinnum
サカバイヌワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium silvicola
タカサゴイヌワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium spinescens
トゲヤマイヌワラビ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Athyrium yakusimense
ヤクシマタニイヌワラビ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/128 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deparia formosana
ジャコウシダ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deparia henryi
コウライイヌワラビモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/70 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deparia minamitanii
ヒュウガシケシダ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplazium kawabatae
モッチョムシダ		———✓——/——/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplazium kawakamii
アオイガワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplazium megaphylum
ムシャシダ		——————/——/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplazium pinfaense
フクレギシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplazium subtripinnatum
ムニンミドリシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/242 (0.0%)0/447 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thelypteris erubescens
タイヨウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/4 (0.0%)0/653 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thelypteris gracilescens
シマヤワラシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/8 (0.0%)0/653 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hypodematium fordii
リュウキュウキンモウワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/28 (0.0%)0/31 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes cantilenae
イツキカナワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes exilis f. oohorae
アタシカカナワラビ		————✓—/——/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes hiugana
ヒュウガカナワラビ		—✓✓✓——/1—/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes quadripinnata subsp. fimbriata
ヒロハナライシダ		———✓✓—/——/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes simulans
ヒゴカナワラビ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arachniodes yaoshanensis
ツルダカナワラビ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/103 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyrtomium anomophyllum
クマヤブソテツ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/23 (0.0%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris anthracinisquama
クマイワヘゴ		—✓—✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris dickinsii x D. polylepis
エビノオオクジャク		——————/——/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris gymnosora x D. koidzumiana
ホソバヌカイタチシダ		——————/——/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris hangchowensis
キリシマイワヘゴ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris lunanensis
オオミネイワヘゴ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris subtsushimensis
アラゲミサキカグマ		—✓✓✓✓—/——/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris tsugiwoi
マルバヌカイタチシダモドキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris tsutsuiana
ツツイイワヘゴ		—✓—✓✓—/1—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dryopteris wallichiana
オオヤグルマシダ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0141/427 (0.2%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elaphoglossum callifolium
オキナワアツイタ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0141/320 (0.3%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum grandifrons
キュウシュウイノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum lachenense
タカネシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum neolobatum
ヤシャイノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum obae
アマミデンダ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum piceopaleaceum
サクラジマイノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polystichum shimurae
シムライノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/255 (0.4%)4/1496 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arthropteris palisotii
ワラビツナギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/14 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tectaria fauriei
コモチナナバケシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/164 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tectaria kusukusensis
ナガバウスバシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/164 (0.0%)0/204 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aglaomorpha coronans
カザリシダ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/14 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Drynaria roosii
ハカマウラボシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/22 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Goniophlebium amamianum
アマミアオネカズラ		——✓✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lepisorus clathratus
トヨグチウラボシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/88 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lepisorus oligolepidus
ウロコノキシノブ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/88 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lepisorus pyriformis
オニマメヅタ		———✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Leptochilus decurrens
オキノクリハラン		LC✓✓✓✓—/1—/—No———0000/101 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oreogrammitis nipponica
ヒロハヒメウラボシ		——✓✓✓—/——/—No———0000/74 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pyrrosia adnascens
ヒトツバマメヅタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/76 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pyrrosia linearifolia var. heterolepis
タイワンビロードシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/76 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tomophyllum sakaguchianum
キレハオオクボシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/13 (0.0%)0/1369 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nuphar subintegerrima
ヒメコウホネ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/22 (4.5%)4/157 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nuphar submersa
シモツケコウホネ		—✓✓✓✓—/——/—No———0151/22 (4.5%)4/157 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Piper postelsianum
タイヨウフウトウカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———0555/724 (0.7%)5/1145 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum caudigerum
オナガサイシン		—✓✓✓✓—/4—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum gusk
グスクカンアオイ		CR✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum hexalobum var. controversum
シジキカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum kinoshitae
ジュロウカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum leucosepalum
タニムラアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum minamitanianum
オナガカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum mitoanum
フクエジマカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum monodoriflorum
モノドラカンアオイ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum nazeanum
ナゼカンアオイ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum okinawense
ヒナカンアオイ		CR✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum pellucidum
トリガミネカンアオイ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum satsumense
サツマアオイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum senkakuinsulare
センカクカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asarum tabatanum
アサトカンアオイ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Heterotropa muramatsui var. shimodana
シモダカンアオイ		————✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Monoon liukiuense
クロボウモドキ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0050/52 (0.0%)4/2625 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Illigera luzonensis
テングノハナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/48 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema aprile
オドリコテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema cucullatum
ホロテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema heterocephalum subsp. majus
オオアマミテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema heterocephalum subsp. okinawense
オキナワテンナンショウ		——————/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema inaense
イナヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema ishizuchiense
イシヅチテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema kawashimae
トクノシマテンナンショウ		CR✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema kuratae
アマギテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema longipedunculatum var. longipedunculatum
シコクヒロハテンナンショウ		——————/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema minamitanii
ヒュウガヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema nagiense
ナギヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema ogatae
ツクシテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Arisaema seppikoense
セッピコテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———03313/152 (2.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pothos chinensis
ユズノハカズラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00310/9 (0.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhaphidophora korthalsii
サキシマハブカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———00310/46 (0.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhaphidophora liukiuensis
ヒメハブカズラ		——✓✓✓—/——/—No———00310/46 (0.0%)15/1831 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tofieldia coccinea var. kiusiana
ナガエチャボゼキショウ		—✓—✓✓—/1—/—No———0241/13 (7.7%)2/22 (9.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tofieldia yoshiiana var. hyugaensis
ヒュウガハナゼキショウ		—✓——✓—/1—/—No———0241/13 (7.7%)2/22 (9.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Alisma canaliculatum var. azuminoense
アズミノヘラオモダカ		———✓✓—/——/—No———0221/12 (8.3%)1/145 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Alisma canaliculatum var. harimense
ホソバヘラオモダカ		———✓✓—/——/—No———0221/12 (8.3%)1/145 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sagittaria natans
カラフトグワイ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0020/44 (0.0%)1/145 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Blyxa alternifolia
セトヤナギスブタ		———✓✓—/——/—No———0040/3 (0.0%)3/220 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Najas tenuicaulis
ヒメイバラモ		——✓✓✓—/——/—No———0040/30 (0.0%)3/220 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Potamogeton lucens subsp. sinicus var. teganumensis
ガシャモク		——————/——/—No———219219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Potamogeton obtusifolius
イヌイトモ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———019219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Potamogeton praelongus
ナガバエビモ		LC✓✓✓✓—/7—/—No———019219/153 (5.9%)10/200 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ruppia megacarpa
ネジリカワツルモ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0050/23 (0.0%)3/41 (7.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ruppia x truncatifolia
ヤハズカワツルモ		——————/——/—No———0050/23 (0.0%)3/41 (7.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saionia hyodoi
ヒナノボンボリ		———✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saionia shinzatoi
ホシザキシャクジョウ		CR✓—✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/74 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saionia yamashitae
ヤクノヒナホシ		———✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thismia abei
タヌキノショクダイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/70 (0.0%)0/74 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thismia kobensis
コウベタヌキノショクダイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/70 (0.0%)0/74 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dioscorea luzonensis
ルゾンヤマノイモ		—✓—✓✓—/——/—No———016177/353 (2.0%)8/358 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dioscorea tabatae
ユワンオニドコロ		CR✓✓✓✓—/——/—No———016177/353 (2.0%)8/358 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dioscorea zentaroana
アマミタチドコロ		—✓✓✓✓—/——/—No———016177/353 (2.0%)8/358 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sciaphila kozushimensis
コウヅシマソウ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sciaphila multiflora
イシガキソウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sciaphila sugimotoi
オモトソウ		——✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sciaphila tenella
タカクマソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sciaphila yakushimensis
ヤクシマソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pandanus daitoensis
ホソミアダン		——✓✓✓—/——/—No———0111/200 (0.5%)1/296 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chionographis koidzumiana var. kurokamiana
クロカミシライトソウ		———✓✓—/——/—No———0121/4 (25.0%)2/204 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lilium alexandrae
ウケユリ		CR✓—✓✓—/——/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lilium callosum var. flaviflorum
キバナスゲユリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lilium nobilissimum
タモトユリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0191/156 (0.6%)9/782 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tricyrtis hirta var. masamunei
サツマホトトギス		————✓—/——/—No———0090/35 (0.0%)9/782 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acanthephippium pictum
エンレイショウキラン		———✓——/——/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acanthephippium sylhetense
タイワンショウキラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anoectochilus formosanus
キバナシュスラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———05361/41 (2.4%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anoectochilus koshunensis
コウシュンシュスラン		DD✓✓✓✓—/2—/—No———05361/41 (2.4%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bulbophyllum affine
クスクスラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/717 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bulbophyllum macraei var. macraei
シコウラン		——————/——/—No———00360/717 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bulbophyllum macraei var. tanegashimense
タネガシマシコウラン		——————/——/—No———00360/717 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe alpina
キソエビネ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe amamiana
アマミエビネ		———✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe davidii var. bungoana
タガネラン		LC———✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe densiflora
タマザキエビネ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe hoshii
ホシツルラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calanthe mannii
サクラジマエビネ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cheirostylis takeoi
アリサンムヨウラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/25 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cremastra aphylla
モイワラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crepidium boninense
シマホザキラン		———✓✓—/——/—No———00360/29 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crepidium purpureum
オキナワヒメラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/29 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cryptostylis arachnites
オオスズムシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/6 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cryptostylis taiwaniana
タカオオオスズムシラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/6 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium dayanum
ヘツカラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium ensifolium
スルガラン		—✓✓✓✓—/5—/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium kanran
カンラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium koran
コラン		———✓✓—/——/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium lancifolium
アキザキナギラン		—✓✓✓✓—/3✓/✓No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium sinense
ホウサイラン		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (2)Chromosome,
Reference		3.53 Gbp
121		8,496
1.11 Mbp		23362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)2022-01-12
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cymbidium syunitianum
オオナギラン		———✓✓—/——/—No———03362/113 (1.8%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cypripedium guttatum
チョウセンキバナアツモリソウ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cypripedium macranthos var. macranthos
ホテイアツモリ		—✓————/——/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cypripedium shanxiense
ドウトウアツモリソウ		NT✓✓✓✓—/3—/—No———00360/67 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dienia ophrydis
ホザキヒメラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00360/6 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diploprora championii
サガリラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/2 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Disperis neilgherrensis
ジョウロウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/32 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eria scabrilinguis
オオオサラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/43 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Erythrodes blumei
ホソフデラン		LC✓✓✓✓—/4—/—No———00360/8 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Erythrorchis altissima
タカツルラン		LC✓✓✓✓—/2—/—No———00360/2 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eulophia dentata
タカサゴヤガラ		——✓✓✓—/——/—No———00360/79 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gastrodia kuroshimensis
クロシマヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gastrodia okinawensis
ツツザキヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gastrodia shimizuana
ナンゴクヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02361/30 (3.3%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Goodyera fumata
ヤブミョウガラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/61 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hancockia uniflora
ヒメクリソラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hemipilia graminifolia var. suzukiana
アワチドリ		————✓—/——/—No———00360/20 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Herminium monorchis
クシロチドリ		—✓✓✓✓—/6—/—No———00360/53 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Herminium pusillum
ミスズラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/53 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hetaeria oblongifolia
オオカゲロウラン		—✓✓✓✓—/4—/—No———00360/10 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lecanorchis moritae
アマミムヨウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lecanorchis nigricans var. yakusimensis
ヤクムヨウラン		—✓—✓✓—/1—/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lecanorchis purpurea
アワムヨウラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lecanorchis tabugawaensis
タブガワムヨウラン		———✓✓—/——/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lecanorchis virella
ミドリムヨウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/14 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Liparis elliptica
コゴメキノエラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Liparis hostifolia
シマクモキリソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Liparis krameri var. nikkoensis
ヒメスズムシソウ		————✓—/——/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Liparis sootenzanensis
キバナコクラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Liparis truncata
クモイジガバチ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00360/143 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Macodes petola
ナンバンカモメラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/4 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Neottia furusei
カイサカネラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/42 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Neottia nidus-avis
エゾサカネラン		LC✓✓✓✓—/3—/—No———00360/42 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontochilus fissus
オオハクウンラン		—✓—✓✓—/——/—No———00360/17 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontochilus nanlingensis
ヒメシラヒゲラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/17 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontochilus tashiroi
オオギミラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/17 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontochilus tsukusianus
ツクシアリドオシラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/17 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oreorchis coreana
コケイランモドキ		—✓—✓✓—/——/—No———00360/11 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oreorchis indica
コハクラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/11 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Peristylus calcaratus
ヒゲナガトンボ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/31 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Peristylus lacertifer var. triangularis
タコガタサギソウ		——————/——/—No———00360/31 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phaius mishmensis
ヒメカクラン		—✓—✓✓—/2—/—No———00360/22 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera amabilis
ヤクシマチドリ		——✓✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera brevicalcarata subsp. yakumontana
ツクシチドリ		———✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera hondoensis
オオバナオオヤマサギソウ		——✓✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. amamiana
アマミトンボ		———✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. masamunei
ヤクシマトンボ		———✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera okuboi
ハチジョウツレサギ		——✓✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera sonoharae
クニガミトンボソウ		——✓✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Platanthera stenoglossa subsp. hottae
ソハヤキトンボソウ		———✓✓—/——/—No———02362/119 (1.7%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ponerorchis graminifolia var. kurokamiana
クロカミラン		————✓—/——/—No———00360/51 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ponerorchis graminifolia var. nigropunctata
サツマチドリ		——————/——/—No———00360/51 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Staurochilus luchuensis
イリオモテラン		—✓—✓✓—/——/—No———00360/3 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thrixspermum annamense
イリオモテカヤラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/52 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thrixspermum fantasticum
ハガクレナガミラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/52 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thrixspermum pygmaeum
アマミカヤラン		——✓✓✓—/——/—No———00360/52 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Zeuxine nervosa
オオキヌラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00360/16 (0.0%)25/12039 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lycoris sanguinea var. koreana
ムジナノカミソリ		—✓✓✓✓—/——/—No———00100/35 (0.0%)6/1591 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hosta takiminazukiflora subsp. grandis
セトガワギボウシ		—✓——✓—/——/—No———00210/47 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rohdea japonica var. latifolia
サツマオモト		——✓✓✓—/——/—No———00210/17 (0.0%)17/2537 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nypa fruticans
ニッパヤシ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———00490/1 (0.0%)12/2370 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sparganium hyperboreum
チシマミクリ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———05103/47 (6.4%)7/77 (9.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eriocaulon amanoanum
アマノホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eriocaulon echinulatum
ヒュウガホシクサ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eriocaulon perplexum
エゾイヌノヒゲ		———✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eriocaulon truncatum
スイシャホシクサ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0111/182 (0.5%)1/539 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Juncus potaninii
エゾイトイ		—✓✓✓✓—/——/—No———012164/192 (2.1%)6/315 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Juncus yakeisidakensis
ミヤマゼキショウ		———✓✓—/——/—No———012164/192 (2.1%)6/315 (1.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex aequialta
トダスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex albidibasis
ザラツキシラスゲ		———✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex disperma
ホソスゲ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex globularis
トナカイスゲ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex hoozanensis
ホウザンスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex kabanovii
ヤリスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex lehmannii
センジョウスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex omiana var. yakushimana
チャボカワズスゲ		———✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex rhynchachaenium
トックリスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex rotundata
コヌマスゲ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex scita var. parvisquama
ダイセンアシボソスゲ		———✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Carex yasuii
ムニンヒョウタンスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0458127/1697 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyperus digitatus
オオホウキガヤツリ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyperus niigatensis
ニイガタガヤツリ		———✓✓—/——/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyperus nutans var. subprolixus
ヒメホウキガヤツリ		——✓✓✓—/——/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyperus pedunculatus
コウシュンスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———09815/392 (1.3%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleocharis atropurpurea
クロミノハリイ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleocharis retroflexa subsp. chaetaria
カヤツリマツバイ		—✓✓✓✓—/——/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleocharis tetraquetra var. tsurumachii
カドハリイ		———✓✓—/——/—No———05813/191 (1.6%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eriophorum scheuchzeri var. tenuifolium
エゾワタスゲ		——✓✓✓—/——/—No———04812/15 (13.3%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fimbristylis fimbristyloides
トモエバテンツキ		——✓✓✓—/——/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fimbristylis kadzusana
イッスンテンツキ		——✓✓✓—/——/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fimbristylis nutans
ウナヅキテンツキ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———00810/70 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Isolepis crassiuscula
ビャッコイ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00810/66 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhynchospora malasica
ミクリガヤ		—✓✓✓✓—/——/—No———03813/195 (1.5%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Scleria biflora
ホソバシンジュガヤ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00810/156 (0.0%)48/3662 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calamagrostis autumnalis subsp. autumnalis
キリシマノガリヤス		————✓—/——/—No———0012930/101 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Digitaria mollicoma
ビロードメヒシバ		—✓✓✓✓—/——/—No———0512933/89 (3.4%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elymus pendulinus var. pendulinus
タイシャクカモジ		—✓————/——/—No———0112931/158 (0.6%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elymus sibiricus
エゾムギ		—✓✓✓✓—/6—/—Yes (1)Chromosome,
Reference		6.90 Gbp
30.35		418
49.5 Mbp		1112931/158 (0.6%)211/9005 (2.3%)2024-05-20
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elymus yubaridakensis
タカネエゾムギ		———✓✓—/——/—No———0112931/158 (0.6%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Isachne lutchuensis
ケナシハイチゴザサ		——✓✓✓—/——/—No———0012930/18 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Isachne myosotis
ヒメハイチゴザサ		——✓✓✓—/——/—No———0012930/18 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ischaemum indicum
ヒメカモノハシ		LC✓—✓✓—/——/—No———0012930/1 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mnesithea laevis var. cochinchinensis
ヒメウシノシッペイ		————✓—/——/—No———0012930/11 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Panicum paludosum
オオヌカキビ		—✓✓✓——/2—/—No———04112934/165 (2.4%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Piptatherum kuoi
イネガヤ		—✓—✓✓—/2—/—No———0012930/36 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Poa glauca var. kitadakensis
キタダケイチゴツナギ		———✓✓—/——/—No———0712936/375 (1.6%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sacciolepis myosuroides
ハラヌメリ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0012930/13 (0.0%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sorghum nitidum var. nitidum
コモロコシガヤ		——————/——/—No———03012934/38 (10.5%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sporobolus hancei
ヒメネズミノオ		——✓✓✓—/——/—No———0312932/172 (1.2%)211/9005 (2.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Corydalis gigantea
エゾオオケマン		—✓✓✓✓—/——/—No———02212/325 (0.6%)16/680 (2.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cocculus orbiculatus
ホウザンツヅラフジ		—✓—✓✓—/4—/—No———00130/3 (0.0%)10/298 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pericampylus formosanus
ホウライツヅラフジ		———✓✓—/——/—No———00130/3 (0.0%)10/298 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum iidemontanum
イイデトリカブト		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum jaluense subsp. jaluense
コウライブシ		—✓—✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum japonicum subsp. maritimum var. iyariense
イヤリトリカブト		——✓✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum kitadakense
キタダケトリカブト		—✓✓✓✓—/1—/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum metajaponicum
オンタケブシ		——✓✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aconitum senanense subsp. senanense var. isidzukae
オオサワトリカブト		—✓—✓✓—/——/—No———00300/230 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callianthemum kirigishiense
キリギシソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/15 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callianthemum miyabeanum
ヒダカソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00300/15 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Clematis obvallata var. obvallata
コウヤハンショウヅル		—✓—✓——/——/—No———00300/245 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ranunculus ternatus var. lutchuensis
リュウキュウヒキノカサ		———✓✓—/——/—No———06304/444 (0.9%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ranunculus uryuensis
ウリュウキンポウゲ		———✓✓—/——/—No———06304/444 (0.9%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ranunculus yatsugatakensis
ヤツガタケキンポウゲ		——✓✓✓—/——/—No———06304/444 (0.9%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thalictrum minus var. chionophyllum
ミョウギカラマツ		———✓✓—/——/—No———27303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thalictrum uchiyamae
ムラサキカラマツ		—✓✓✓✓—/3—/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thalictrum ujiinsulare
ウジカラマツ		——✓✓✓—/——/—No———07303/140 (2.1%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Trollius rebunensis
レブンキンバイソウ		——✓✓✓—/——/—No———00300/31 (0.0%)17/1997 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Buxus microphylla subsp. sinica
タイワンアサマツゲ		—✓——✓—/——/—No———0231/107 (0.9%)2/142 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Corylopsis gotoana var. pubescens
ヒゴミズキ		———✓✓—/——/—No———0030/21 (0.0%)3/104 (2.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ribes horridum
クロミノハリスグリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0994/145 (2.8%)4/145 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Asimitellaria amamiana
アマミチャルメルソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/11 (0.0%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Astilbe chinensis
オオチダケサシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/31 (0.0%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Astilbe tsushimensis
ツシマアカショウマ		——✓✓✓—/——/—No———0090/31 (0.0%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saxifraga bracteata
キヨシソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0493/503 (0.6%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saxifraga bronchialis subsp. funstonii var. yuparensis
ユウバリクモマグサ		——————/——/—No———0493/503 (0.6%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saxifraga nishidae
エゾノクモマグサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0493/503 (0.6%)8/835 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hylotelephium sordidum var. oishii
オオチチッパベンケイ		—✓—✓✓—/——/—No———00230/26 (0.0%)19/1332 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sedum drymarioides
ナナツガママンネングサ		—✓✓✓✓—/——/—No———03232/269 (0.7%)19/1332 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Causonis maritima
ハマヤブガラシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———003190/20 (0.0%)44/881 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Astragalus japonicus
エゾモメンヅル		——✓✓✓—/——/—No———074563/1674 (0.2%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chamaecrista garambiensis
ガランピネムチャ		——✓✓✓—/——/—No———014561/291 (0.3%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crotalaria calycina
ガクタヌキマメ		—✓✓✓✓—/4—/—No———014561/467 (0.2%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crotalaria montana var. angustifolia
ヤエヤマタヌキマメ		——✓✓✓—/——/—No———014561/467 (0.2%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crotalaria uncinella
エダウチタヌキマメ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———014561/467 (0.2%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Entada tonkinensis
モダマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———004560/25 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euchresta formosana
タイワンミヤマトベラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———004560/4 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glycine max subsp. formosana
ホソバツルマメ		——✓✓✓—/——/—No———42524565/51 (9.8%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Glycine tabacina
ボウコツルマメ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0524565/51 (9.8%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Intsia bijuga
タシロマメ		NT✓✓✓✓—/3—/—No———004560/7 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oxytropis megalantha
レブンソウ		——✓✓✓—/——/—No———014561/293 (0.3%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phyllodium pulchellum
ウチワツナギ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———004560/9 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pterocarpus vidalianus
ヤエヤマシタン		——✓✓✓—/——/—No———024562/52 (3.8%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sophora franchetiana
ツクシムレスズメ		—✓✓✓✓—/——/—No———024561/64 (1.6%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tadehagi triquetrum subsp. triquetrum
タデハギ		——————/——/—No———004560/6 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Uraria picta
ホソバフジボグサ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———004560/9 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vigna vexillata var. vexillata
サクヤアカササゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0364569/97 (9.3%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Zornia cantoniensis
スナジマメ		—✓—✓✓—/——/—No———004560/54 (0.0%)196/16547 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polygala longifolia
リュウキュウヒメハギ		——✓✓✓—/——/—No———0221/156 (0.6%)1/706 (0.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polygala polifolia
シンチクヒメハギ		——✓———/——/—No———0221/156 (0.6%)1/706 (0.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Malus hupehensis
ツクシカイドウ		LC✓✓✓✓—/4—/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.17 Gbp
42.63		804
10.5 Mbp		118446735/100 (35.0%)141/3948 (3.6%)2025-01-27
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Padus nakatakei
モロツカウワミズザクラ		———✓✓—/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Photinia serratifolia
オオカナメモチ		LC✓✓✓✓—/3✓/✓No———004670/44 (0.0%)141/3948 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rubus amamianus var. minor
コバノアマミフユイチゴ		———✓✓—/——/—No———0164678/764 (1.0%)141/3948 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rubus arcticus
チシマイチゴ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0164678/764 (1.0%)141/3948 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rubus nakaii
チチジマイチゴ		—✓—✓——/——/—No———0164678/764 (1.0%)141/3948 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elaeagnus arakiana
タンゴグミ		——✓✓✓—/——/—No———03103/80 (3.8%)8/95 (8.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhamnus kanagusukii
ヒメクロウメモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———00270/121 (0.0%)11/939 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Celtis biondii var. insularis
サキシマエノキ		—✓—✓✓—/——/—No———00360/73 (0.0%)5/128 (3.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ficus iidaiana
オオヤマイチジク		—✓✓✓✓—/3—/—No———013297/811 (0.9%)18/1242 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Morus boninensis
オガサワラグワ		—✓✓✓✓—/3—/—No———06295/32 (15.6%)18/1242 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elatostema oshimense
アマミサンショウソウ		——✓✓✓—/——/—No———00140/213 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elatostema yakushimense
ヒメトキホコリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00140/213 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Elatostema yonakuniense
ヨナクニトキホコリ		—✓—✓✓—/——/—No———00140/213 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Procris boninensis
セキモンウライソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00140/12 (0.0%)4/1124 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Trichosanthes homophylla var. ishigakiensis
イシガキカラスウリ		———✓✓—/——/—No———053785/107 (4.7%)110/976 (11.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Zehneria perpusilla var. deltifrons
サツマスズメウリ		———✓✓—/——/—No———013781/55 (1.8%)110/976 (11.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euonymus oblongifolius
ナガバヒゼンマユミ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0241/96 (1.0%)2/760 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euonymus oligospermus
アンドンマユミ		———✓✓—/——/—No———0241/96 (1.0%)2/760 (0.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Oxalis exilis
アマミカタバミ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0553/453 (0.7%)3/477 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Claoxylon centinarium
セキモンノキ		——————/2—/—No———00940/11 (0.0%)48/3769 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euphorbia liukiuensis
リュウキュウタイゲキ		——✓✓✓—/——/—No———0249417/1341 (1.3%)48/3769 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euphorbia sieboldiana var. ohsumiensis
アマミナツトウダイ		————✓—/——/—No———0249417/1341 (1.3%)48/3769 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euphorbia watanabei subsp. minamitanii
ヒュウガタイゲキ		——✓✓✓—/——/—No———0249417/1341 (1.3%)48/3769 (1.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Margaritaria indica
アカハダコバンノキ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0050/8 (0.0%)4/941 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Phyllanthus oligospermus subsp. donanensis
ドナンコバンノキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0050/19 (0.0%)4/941 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ryssopterys timoriensis
ササキカズラ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/745 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Salix nummularia
エゾマメヤナギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0459518/489 (3.7%)44/926 (4.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Viola amamiana
アマミスミレ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Viola lactiflora
シロコスミレ		—✓✓✓✓—/2—/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Viola okinawensis
シマジリスミレ		———✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Viola tashiroi var. tairae
イシガキスミレ		———✓✓—/——/—No———010106/426 (1.4%)6/669 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Linum stelleroides
マツバニンジン		—✓✓✓✓—/2—/—No———050507/119 (5.9%)7/173 (4.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cladopus fukienensis
タシロカワゴケソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/14 (0.0%)0/420 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cladopus japonicus
カワゴケソウ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/14 (0.0%)0/420 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hydrobryum koribanum
オオヨドカワゴロモ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/41 (0.0%)0/420 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hypericum senkakuinsulare
センカクオトギリ		——✓✓✓—/——/—No———014147/372 (1.9%)7/448 (1.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hypericum tosaense
トサオトギリ		—✓✓✓✓—/——/—No———014147/372 (1.9%)7/448 (1.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Terminalia nitens
テリハモモタマナ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0151/128 (0.8%)5/298 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rotala hippuris
ミズスギナ		—✓✓✓✓—/——/—No———00250/27 (0.0%)11/425 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Epilobium fastigiatoramosum
エダウチアカバナ		——✓✓✓—/——/—No———04102/113 (1.8%)7/478 (1.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Metrosideros boninensis
ムニンフトモモ		—✓✓✓✓—/4—/—No———01831/61 (1.6%)65/2985 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Melastoma tetramerum var. tetramerum
ムニンノボタン		—✓————/3—/—No———0564/61 (6.6%)5/3654 (0.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stachyurus macrocarpus var. macrocarpus
ナガバキブシ		—✓————/3—/—No———0000/11 (0.0%)0/11 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stachyurus macrocarpus var. prunifolius
ハザクラキブシ		—✓—✓✓—/3—/—No———0000/11 (0.0%)0/11 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhus javanica var. javanica
タイワンフシノキ		——————/——/—No———0050/7 (0.0%)3/120 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Acer amamiense
アマミカジカエデ		CR✓✓✓✓—/2—/—No———010335/170 (2.9%)14/1242 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Citrus nippokoreana
コウライタチバナ		—✓—✓——/——/—No———010011828/210 (13.3%)40/1569 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tetradium taiwanense
ホソバハマセンダン		———✓✓—/——/—No———001180/15 (0.0%)40/1569 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Abelmoschus moschatus var. betulifolius
センカクトロロアオイ		——✓✓✓—/——/—No———011611/12 (8.3%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Grewia rhombifolia
ヒシバウオトリギ		——✓✓✓—/——/—No———001610/113 (0.0%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tilia chinensis var. intonsa
ブンゴボダイジュ		————✓—/——/—No———031612/42 (4.8%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tilia chugokuensis
チュウゴクボダイジュ		LC——✓✓—/——/—No———031612/42 (4.8%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tilia mandshurica var. mandshurica
マンシュウボダイジュ		———✓——/——/—No———031612/42 (4.8%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Triumfetta procumbens var. glaberrima
ケナシハテルマカズラ		———✓✓—/——/—No———001610/30 (0.0%)74/2611 (2.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diplomorpha phymatoglossa
オオシマガンピ		—✓—✓✓—/1—/—No———0080/4 (0.0%)7/578 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Berteroella maximowiczii
ハナナズナ		—✓✓✓✓—/2—/—No———008010/8 (0.0%)127/3552 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Catolobus ligulifolius
ヘラハタザオ		——————/——/—No———008010/2 (0.0%)127/3552 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dontostemon dentatus var. dentatus
ハナハタザオ		——————/——/—No———008010/12 (0.0%)127/3552 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Draba igarashii
シリベシナズナ		—✓✓✓✓—/——/—No———048012/379 (0.5%)127/3552 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Draba nakaiana
ソウウンナズナ		———✓✓—/——/—No———048012/379 (0.5%)127/3552 (3.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Limonium senkakuense
センカクハマサジ		——✓✓✓—/——/—No———0232/296 (0.7%)3/634 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Limonium sinense
タイワンハマサジ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0232/296 (0.7%)3/634 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bistorta hayachinensis
ナンブトラノオ		——✓✓✓—/——/—No———00470/22 (0.0%)26/1004 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Persicaria taitoinsularis
ダイトウサクラタデ		——✓✓✓—/——/—No———08475/87 (5.7%)26/1004 (2.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aldrovanda vesiculosa
ムジナモ		EN✓✓✓✓—/3—/—No———0070/1 (0.0%)5/94 (5.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cerastium furcatum var. ibukiense
コバノミミナグサ		—✓—✓✓—/——/—No———00410/121 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Minuartia arctica var. arctica
エゾタカネツメクサ		——————/——/—No———00410/18 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sagina saginoides
チシマツメクサ		—✓✓✓✓—/7—/—No———00410/30 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Silene repens var. apoiensis
アポイマンテマ		———✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Silene tokachiensis
トカチビランジ		——✓✓✓—/——/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Silene uralensis
タカネマンテマ		—✓✓✓✓—/5—/—No———013418/624 (1.3%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stellaria calycantha
カンチヤチハコベ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stellaria filicaulis
イトハコベ		—✓✓✓✓—/——/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Stellaria nipponica var. yezoensis
オオイワツメクサ		———✓✓—/——/—No———00410/171 (0.0%)26/2164 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chenopodium bryoniifolium
ミドリアカザ		—✓✓✓✓—/——/—No———03642113/120 (10.8%)41/1955 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chenopodium gracilispicum
イワアカザ		—✓✓✓✓—/——/—No———004210/7 (0.0%)41/1955 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deeringia polysperma
インドヒモカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———004210/6 (0.0%)41/1955 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cornus kousa var. chinensis
ヤエヤマヤマボウシ		—✓✓✓✓—/3—/—No———1664/79 (5.1%)4/104 (3.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deutzia hatusimae
コミノヒメウツギ		——✓✓✓—/——/—No———0060/75 (0.0%)1/263 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deutzia naseana var. amanoi
オキナワヒメウツギ		——✓✓✓—/——/—No———0060/75 (0.0%)1/263 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hydrangea involucrata var. tokarensis
トカラタマアジサイ		——✓✓✓—/——/—No———0661/136 (0.7%)1/263 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Impatiens hypophylla var. microhypophylla
エンシュウツリフネソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0774/704 (0.6%)4/705 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Polemonium caeruleum subsp. kiushianum
ハナシノブ		————✓—/——/—No———0020/30 (0.0%)1/420 (0.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Barringtonia asiatica
ゴバンノアシ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0010/27 (0.0%)1/273 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eurya zigzag
クニガミヒサカキ		CR✓✓✓✓—/——/—No———0010/76 (0.0%)1/233 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lysimachia liukiuensis
ヒメミヤマコナスビ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———05333/175 (1.7%)19/1535 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Myrsine okabeana
マルバタイミンタチバナ		—✓✓✓✓—/2—/—No———01331/92 (1.1%)19/1535 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Primula reinii var. rhodotricha
チチブイワザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———012336/385 (1.6%)19/1535 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Symplocos kawakamii
ウチダシクロキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/213 (0.5%)1/214 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Shortia rotundifolia f. amamiana
アマミイワウチワ		————✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/18 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Moneses uniflora
イチゲイチヤクソウ		—✓✓✓✓—/6—/—No———00690/1 (0.0%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Monotropastrum kirishimense
キリシマギンリョウソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00690/5 (0.0%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pieris koidzumiana
リュウキュウアセビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00690/9 (0.0%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhododendron boninense
ムニンツツジ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhododendron dilatatum var. satsumense
ハヤトミツバツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rhododendron eriocarpum var. tawadae
センカクツツジ		—✓—✓✓—/——/—No———0266919/805 (2.4%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vaccinium amamianum
ヤドリコケモモ		—✓—✓✓—/——/—No———0216912/234 (5.1%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vaccinium sieboldii
ナガボナツハゼ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0216912/234 (5.1%)44/3062 (1.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nothapodytes amamianus
ワダツミノキ		—✓—✓✓—/——/—No———0221/6 (16.7%)1/119 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Exallage auricularia
ヤエヤマハシカグサ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00570/8 (0.0%)36/6369 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Knoxia sumatrensis
シソノミグサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01571/5 (20.0%)36/6369 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ophiorrhiza yamashitae
アマミアワゴケ		CR—✓✓✓—/——/—No———02572/107 (1.9%)36/6369 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gentiana aquatica
ヒナリンドウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———04104/284 (1.4%)8/1169 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gardneria liukiuensis
リュウキュウホウライカズラ		———✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/255 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gardneria shimadai
タイワンチトセカズラ		———✓——/——/—No———0000/4 (0.0%)0/255 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cynanchum boudieri
アマミイケマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01281/151 (0.7%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Dischidia formosana
マメヅタカズラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/32 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ochrosia hexandra
ホソバヤロード		—✓✓✓✓—/——/—No———00280/22 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ochrosia iwasakiana
シマソケイ		—✓✓✓✓—/——/—No———00280/22 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vincetoxicum inamoenum
エゾノクサタチバナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vincetoxicum yonakuniense
ヨナグニカモメヅル		—✓✓✓✓—/1—/—No———00280/143 (0.0%)20/3410 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cordia aspera subsp. kanehirae
トゲミノイヌチシャ		—✓✓✓✓—/——/—No———0332/147 (1.4%)2/175 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cynoglossum lanceolatum var. formosanum
タイワンルリソウ		———✓✓—/——/—No———00170/39 (0.0%)11/1394 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ehretia philippinensis
リュウキュウチシャノキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0221/43 (2.3%)1/131 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eritrichium nipponicum var. albiflorum f. yesoense
エゾルリムラサキ		——————/——/—No———00170/21 (0.0%)11/1394 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hackelia deflexa
イワムラサキ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00170/16 (0.0%)11/1394 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mertensia pterocarpa var. yezoensis
エゾルリソウ		——✓✓✓—/——/—No———00170/62 (0.0%)11/1394 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aniseia martinicensis
ナガバアサガオ		LC✓✓✓✓—/8—/—No———00240/4 (0.0%)14/1217 (1.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cuscuta europaea
クシロネナシカズラ		—✓✓✓✓—/6—/✓Yes (1)Contig,
Reference		976 Mbp
41		475
17.9 Mbp		17244/195 (2.1%)14/1217 (1.2%)2022-11-27
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Solanum miyakojimense
イラブナスビ		——✓✓✓—/——/—No———033141672/1130 (6.4%)107/2563 (4.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ligustrum tamakii
トゲイボタ		——✓✓✓—/——/—No———02801/45 (2.2%)44/608 (7.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aeschynanthus acuminatus
ナガミカズラ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00100/67 (0.0%)10/2525 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lysionotus apicidens
タイワンシシンラン		—✓—✓✓—/——/—No———00100/36 (0.0%)10/2525 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Veronicastrum liukiuense
リュウキュウスズカケ		CR✓✓✓✓—/1—/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Veronicastrum villosulum
スズカケソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00590/16 (0.0%)43/1721 (2.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Torenia concolor
ツルウリクサ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0030/28 (0.0%)3/146 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ajuga boninsimae
シマカコソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———051242/43 (4.7%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Amethystea caerulea
ルリハッカ		—✓✓✓✓—/1—/—No———001240/1 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callicarpa formosana
ホウライムラサキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callicarpa glabra
シマムラサキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Callicarpa pilosissima
ホソバムラサキ		—✓✓✓✓—/——/—No———011241/75 (1.3%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Coleus formosanus
ケサヤバナ		—✓✓✓✓—/——/—No———001240/69 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Scutellaria kikai-insularis
ヒメタツナミソウ		——✓✓✓—/——/—No———061244/293 (1.4%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Teucrium veronicoides var. brachytrichum
イヌニガクサ		——————/——/—No———041242/123 (1.6%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vitex bicolor
ヤエヤマハマゴウ		—✓✓✓✓—/——/—No———001240/83 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Vitex quinata
オオニンジンボク		LC✓✓✓✓—/6—/—No———001240/83 (0.0%)83/4502 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euphrasia multifolia var. inaensis
イナコゴメグサ		—✓—✓✓—/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Euphrasia pectinata var. obtusiserrata
エゾノダッタンコゴメグサ		———✓✓—/——/—No———07594/109 (3.7%)50/1451 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pedicularis koidzumiana
ベニシオガマ		——✓✓✓—/——/—No———00590/427 (0.0%)50/1451 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pedicularis spicata
ホザキシオガマ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00590/427 (0.0%)50/1451 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Rehmannia japonica
センリゴマ		—✓✓✓✓—/——/—No———01591/11 (9.1%)50/1451 (3.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Utricularia minutissima
ヒメミミカキグサ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0363/213 (1.4%)6/352 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Hemigraphis reptans
ミヤコジマソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———00120/22 (0.0%)7/1959 (0.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ilex dimorphophylla
アマミヒイラギモチ		CR✓✓✓✓—/3—/—No———0553/348 (0.9%)3/351 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ilex macrocarpa
ヒロハタマミズキ		—✓✓✓✓—/3✓/✓No———0553/348 (0.9%)3/351 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Adenophora hatsushimae
ツクシイワシャジン		——✓✓✓—/——/—No———01161/69 (1.4%)12/1607 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Adenophora pereskiifolia var. yamadae
ユウバリシャジン		———✓✓—/——/—No———01161/69 (1.4%)12/1607 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lobelia dopatrioides var. cantonensis
タチミゾカクシ		————✓—/——/—No———05163/204 (1.5%)12/1607 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lobelia loochooensis
マルバハタケムシロ		EN✓✓✓✓—/1—/—No———05163/204 (1.5%)12/1607 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anaphalis sinica var. yakusimensis
ヤクシマウスユキソウ		———✓✓—/——/—No———002270/85 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Antennaria dioica
エゾノチチコグサ		—✓✓✓✓—/6—/—No———002270/39 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aster ujiinsularis
オオイソノギク		——————/——/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aster yakushimensis
ヤクシマノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———002270/141 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium akimotoi
シライワアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium apoense
アポイアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium japonicum var. australe
タカサゴアザミ		—✓✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium katoanum
ウゼンヒメアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium lucens var. bracteosum
ヘイケモリアザミ		———✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium magofukui
イナベアザミ		—✓✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium masami-saitoanum
ヒュウガアザミ		——✓✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium nippoense
ニッポウアザミ		———✓✓—/——/—No———042272/250 (0.8%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cirsium segetum
アレチアザミ		—✓—✓✓—/——/—No———002270/1 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crepidiastrum grandicollum
コヘラナレン		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/14 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crepis hokkaidoensis
フタマタタンポポ		——✓✓✓—/——/—No———022271/115 (0.9%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Erigeron miyabeanus
ミヤマノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———042273/190 (1.6%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eschenbachia aegyptiaca
キクバイズハハコ		———✓✓—/——/—No———002270/4 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lagenophora lanata
コケセンボンギク		—✓✓✓✓—/1—/—No———002270/14 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Parasenecio hastatus subsp. orientalis var. nantaicus
ニッコウコウモリ		—✓—✓✓—/——/—No———002270/55 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pertya yakushimensis
シマコウヤボウキ		——✓✓✓—/——/—No———002270/9 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saussurea insularis
シマトウヒレン		—✓—✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saussurea mikurasimensis
ミクラジマトウヒレン		———✓✓—/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Saussurea nipponica subsp. savatieri var. yakusimensis
ヤクシマヒゴタイ		——————/——/—No———032273/457 (0.7%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Scorzonera rebunensis
フタナミソウ		———✓✓—/——/—No———002270/42 (0.0%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Solidago yambaruensis
ヤンバルアオヤギバナ		———✓✓—/——/—No———042273/139 (2.2%)130/17025 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Abelia chinensis var. ionandra
タイワンツクバネウツギ		—✓—✓✓—/——/—No———00180/10 (0.0%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Diabelia serrata f. tomentosa
オニツクバネウツギ		—✓——✓—/——/—No———00180/5 (0.0%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lonicera fragrantissima
ツシマヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/4—/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lonicera japonica var. miyagusukiana
ヒメスイカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lonicera uzenensis
ウゼンベニバナヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/——/—No———05183/179 (1.7%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Patrinia triloba var. kozushimensis
シマキンレイカ		———✓✓—/——/—No———00180/13 (0.0%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Triosteum pinnatifidum
ホザキツキヌキソウ		—✓✓✓✓—/3✓/✓No———00180/10 (0.0%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Weigela florida
オオベニウツギ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00180/11 (0.0%)12/696 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pittosporum parvifolium
コバトベラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/112 (0.9%)1/138 (0.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleitherococcus trifoliatus
ミツバウコギ		——————/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angelica cryptotaeniifolia var. cryptotaeniifolia
ミヤマノダケ		———✓——/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angelica cryptotaeniifolia var. kyushiana
ツクシミヤマノダケ		————✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angelica pseudoshikokiana
ツクシトウキ		———✓✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Angelica sinanomontana
シナノノダケ		——✓✓✓—/——/—No———01431/111 (0.9%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Bupleurum quadriradiatum
フジワラサイコ		———✓✓—/——/—No———00430/105 (0.0%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Heracleum lanatum subsp. akasimontanum
ホソバハナウド		—✓—✓✓—/——/—No———05433/102 (2.9%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Peucedanum multivittatum var. linearilobum
エゾノハクサンボウフウ		————✓—/——/—No———00430/71 (0.0%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Sanicula lamelligera var. wakayamensis
キイウマノミツバ		———✓✓—/——/—No———02432/50 (4.0%)27/3222 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Tilingia tsusimensis
ツシマノダケ		———✓✓—/——/—No———00430/1 (0.0%)27/3222 (0.8%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aphanothece sacrum
スイゼンジノリ		—✓——✓—/——/—Yes (2)Contig,
Reference		4.49 Mbp
190		20
456 kbp		2201008/43 (18.6%)22/101 (21.8%)2018-11-30
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pseudodichotomosiphon constricta
クビレミドロ		——————/——/—No———00000—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chara fibrosa subsp. benthamii
ケナガシャジクモ		—✓————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chara fibrosa subsp. flaccida
コイトシャジクモ		—✓————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chara sejuncta
アメリカシャジクモ		——✓✓——/——/—No———0111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chara zeylanica
ハダシシャジクモ		LC✓✓✓——/1—/—No———0111/68 (1.5%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella acuminata var. capitulifera
チャボフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella dimorpha
ダイシフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella furcata var. zollingeri
ミキフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella graciliformis
ホソバフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella gracillima var. gracillima
ヒナフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella imahorii
フラスコモダマシ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella inversa
サカゴフラスコモ		—✓✓✓——/1—/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella japonica
ニッポンフラスコモ		—✓—✓——/2—/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella pseudoflabellata f. spinosa
トゲフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella pseudoflabellata var. mucosa
ミノフサフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Nitella tenuissima var. sanukensis
サヌキフラスコモ		——————/——/—No———0010/67 (0.0%)1/198 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aegagropila brownii
マリモ		——————/——/—No———0000/3 (0.0%)0/70 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Kumanoa iriomotensis
イリオモテカワモズク		—✓————/1—/—No———0000/43 (0.0%)0/174 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Kumanoa mahlacensis
ミナミクロカワモズク		—✓———✓/1✓/✓No———0000/43 (0.0%)0/174 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thorea gaudichaudii
シマチスジノリ		—✓———✓/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/24 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thorea hispida
フトチスジノリ		—✓✓✓—✓/3✓/✓No———0000/16 (0.0%)0/24 (0.0%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Folioceros glandulosus
ミドリツノゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0121/9 (11.1%)2/52 (3.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cyathodium cavernarum
ヒカリゼニゴケ		—✓✓✓✓—/1✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		268 Mbp
137		111
5.38 Mbp		1111/11 (9.1%)1/11 (9.1%)2025-05-01
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fossombronia pusilla
ヤツガタケウロコゼニゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/45 (2.2%)1/48 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Aneura hirsuta
ケミドリゼニゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/17 (0.0%)0/111 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Riccardia pumila
イトスジゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/78 (0.0%)0/111 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Anastrophyllum ellipticum
オノイチョウゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0151/15 (6.7%)5/56 (8.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Crossocalyx hellerianus
コダマイチョウゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0050/1 (0.0%)5/56 (8.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Odontoschisma francisci
ヒメウキヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0111/21 (4.8%)1/60 (1.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lethocolea naruto-toganensis
モグリゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/8 (0.0%)1/48 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eremonotus myriocarpus
ハッコウダゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0010/1 (0.0%)1/47 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Mesoptychia heterocolpos
ユキミイチョウゴケ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0111/19 (5.3%)1/47 (2.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Heteroscyphus wettsteinii
トゲバウロコゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/26 (0.0%)0/113 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chiastocaulon theriotanum
ハットリムカイバハネゴケ		—✓—✓——/——/—No———0030/12 (0.0%)3/265 (1.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Schistochila aligera
フィリピンオヤコゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Cololejeunea drepanolejeuneoides
サンカクヨウジョウゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/84 (0.0%)1/716 (0.1%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Radula boninensis
オガサワラケビラゴケ		———✓✓—/——/—No———0221/206 (0.5%)1/210 (0.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Brachydontium olympicum
オリンピックゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0121/2 (50.0%)2/29 (6.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calymperes strictifolium
イボイボカタシロゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/16 (0.0%)0/163 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paludella squarrosa
ヌマチゴケ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0010/1 (0.0%)1/20 (5.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Schizymenium sasaokae
コシノシンジゴケ		———✓✓—/——/—No———0080/1 (0.0%)7/142 (4.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Macromitrium holomitrioides
クチボソミノゴケ		———✓✓—/——/—No———00160/45 (0.0%)14/296 (4.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Daltonia carinata
オクヤマツガゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/16 (0.0%)1/102 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Distichophyllum yakumontanum
キノボリヒメツガゴケ		———✓✓—/——/—No———0111/43 (2.3%)1/102 (1.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pseudospiridentopsis horrida
オニゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/1 (0.0%)1/67 (1.5%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Pinnatella ambigua
マメハネゴケ		—✓—✓✓—/3—/—No———0040/13 (0.0%)4/140 (2.9%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Enterographa multiseptata
ヨウジョウクチナワゴケ		———✓——/——/—No———0000/17 (0.0%)0/188 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Montanelia sorediata
コナタカネゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———001140/9 (0.0%)78/1831 (4.3%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Loflammia epiphylla
ベニハシゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0020/1 (0.0%)2/93 (2.2%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Ramalina yokotae
ヨコタカラタチゴケ		———✓✓—/——/—No———09199/185 (4.9%)19/645 (2.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Erioderma sorediatum
アキハゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/8 (0.0%)4/169 (2.4%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Gibbosporina boninensis
ムニンゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0050/8 (0.0%)4/367 (1.1%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fulvifomes boninensis
オオメシマコブ		—✓✓✓✓—/——/—No———01521/75 (1.3%)24/1340 (1.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Fulvifomes imazekii
ヨコグラサルノコシカケ		—✓✓✓✓—/——/—No———01521/75 (1.3%)24/1340 (1.8%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Heteroconger polyzona
ゼブラアナゴ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0040/7 (0.0%)2/314 (0.6%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Thryssa baelama
オオイワシ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		884 Mbp
60		617,217
2.34 kbp		11131/41 (2.4%)9/253 (3.6%)2024-08-05
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Plectropomus areolatus
オオアオノメアラ		VU✓✓✓✓✓/10✓/✓No———03501/9 (11.1%)34/503 (6.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Epinephelus lanceolatus
タマカイ		DD✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (4)Chromosome,
Reference		1.09 Gbp
99.9		183
44.4 Mbp		4215013/136 (9.6%)34/503 (6.8%)2019-05-13
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Epinephelus tukula
カスリハタ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.10 Gbp
96		42
41.9 Mbp		2215013/136 (9.6%)34/503 (6.8%)2021-12-09
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Chromileptes altivelis
サラサハタ		DD✓✓✓✓—/——/—Yes (2)Chromosome,
Reference		1.01 Gbp
114.26		283
18.3 Mbp		22501/1 (100.0%)34/503 (6.8%)2020-05-21
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleutherochir opercularis
オオクチヌメリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00100/2 (0.0%)5/136 (3.7%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Eleutherochir mccaddeni
クシヒゲヌメリ		—✓—✓✓—/——/—No———00100/2 (0.0%)5/136 (3.7%)—

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Octolasmis unguisiformis
メナガオサガニハサミエボシ		—✓—✓——/——/—No———0000/10 (0.0%)0/30 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Halosbaena daitoensis
ダイトウコオイエビ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Alpheus hoplocheles
フタツトゲテッポウエビ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0000/373 (0.0%)0/1019 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Calliasmata pholidota
イラウモエビ		—✓✓✓——/——/—No———0000/2 (0.0%)0/10 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Catoptrus iejima
イエジマガマガザミ		———✓✓—/——/—No———00120/3 (0.0%)5/529 (0.9%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Neoeriocheir leptognathus
ヒメモクズガニ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0050/1 (0.0%)1/133 (0.8%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Deiratonotus kaoriae
クマノエミオスジガニ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/3 (0.0%)0/13 (0.0%)—
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Paraleptuca boninensis
オガサワラベニシオマネキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/4 (0.0%)0/145 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧ⅠＡ類（CR）		Lingula adamsi
オオシャミセンガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0221/22 (4.5%)1/44 (2.3%)—