Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists

Updated on 2024-09-02

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Mogera uchidai
センカクモグラ		VU—✓✓✓No———0070/10 (0.0%)6/106 (5.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pteropus dasymallus daitoensis
ダイトウオオコウモリ		——✓✓✓No———05175/60 (8.3%)14/184 (7.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pteropus dasymallus dasymallus
エラブオオコウモリ		——✓✓✓No———05175/60 (8.3%)14/184 (7.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Myotis formosus
クロアカコウモリ		NT✓✓✓—No———0174612/375 (3.2%)28/889 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Myotis yanbarensis
ヤンバルホオヒゲコウモリ		CR✓✓✓—No———0174612/375 (3.2%)28/889 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Apodemus agrarius
セスジネズミ		LC✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		2.61 Gbp
70.0x		242
35.2 Mbp		151383/36 (8.3%)37/1166 (3.2%)2024-04-12
CR
絶滅危惧IA類		Tokudaia muenninki
オキナワトゲネズミ		CR✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		2.66 Gbp
100.0x		1,777
19.7 Mbp		251383/3 (100.0%)37/1166 (3.2%)2023-09-08
CR
絶滅危惧IA類		Prionailurus bengalensis euptilurus
ツシマヤマネコ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
—		2.42 Gbp
100.0x		319,281
20.4 kbp		37563/5 (60.0%)22/54 (40.7%)2020-09-15
CR
絶滅危惧IA類		Prionailurus bengalensis iriomotensis
イリオモテヤマネコ		CR✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		2.38 Gbp
87.0x		194,533
27.8 kbp		17563/5 (60.0%)22/54 (40.7%)2021-03-31
CR
絶滅危惧IA類		Enhydra lutris
ラッコ		EN✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		2.46 Gbp
110.0x		29,591
245 kbp		22631/1 (100.0%)20/70 (28.6%)2017-09-11
CR
絶滅危惧IA類		Zalophus japonicus
ニホンアシカ		EX✓✓✓✓No———04131/3 (33.3%)5/16 (31.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dugong dugon
ジュゴン		VU✓✓✓✓Yes (5)Chromosome,
Representative		3.16 Gbp
32.0x		294
57.6 Mbp		5561/1 (100.0%)2/2 (100.0%)2020-08-31

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Anser caerulescens caerulescens
ハクガン		—✓✓✓✓No———0141114/15 (26.7%)59/199 (29.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Branta hutchinsii leucopareia
シジュウカラガン		——✓✓✓No———121112/9 (22.2%)59/199 (29.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Columba janthina nitens
アカガシラカラスバト		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.08 Gbp
60.0x		32,051
110 kbp		110223/39 (7.7%)9/353 (2.5%)2020-08-22
CR
絶滅危惧IA類		Puffinus bryani
オガサワラヒメミズナギドリ		CR✓✓✓✓No———0161/33 (3.0%)4/114 (3.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oceanodroma castro
クロコシジロウミツバメ		LC✓✓✓✓No———0202/16 (12.5%)0—
CR
絶滅危惧IA類		Ciconia boyciana
コウノトリ		EN✓✓✓✓Yes (3)Chromosome,
Representative		1.24 Gbp
81.0x		429
35.8 Mbp		312167/8 (87.5%)11/66 (16.7%)2019-05-08
CR
絶滅危惧IA類		Phalacrocorax urile
チシマウガラス		LC✓✓✓✓No———0996/21 (28.6%)6/43 (14.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ixobrychus eurhythmus
オオヨシゴイ		LC✓✓✓✓No———0070/9 (0.0%)6/66 (9.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nipponia nippon
トキ		EN✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		1.22 Gbp
105.0x		130,029
29.1 kbp		2281/1 (100.0%)6/29 (20.7%)2014-06-16
CR
絶滅危惧IA類		Gallirallus okinawae
ヤンバルクイナ		EN✓✓✓✓Yes (2)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
100.0x		440
20.7 Mbp		23172/7 (28.6%)12/141 (8.5%)2019-05-11
CR
絶滅危惧IA類		Eurynorhynchus pygmeus
ヘラシギ		CR✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.18 Gbp
38.0x		44,335
189 kbp		19346/24 (25.0%)30/87 (34.5%)2018-10-30
CR
絶滅危惧IA類		Tringa guttifer
カラフトアオアシシギ		EN✓✓✓✓No———02342/16 (12.5%)30/87 (34.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Fratercula cirrhata
エトピリカ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.11 Gbp
85.0x		111,227
19.7 kbp		14112/3 (66.7%)6/23 (26.1%)2020-08-22
CR
絶滅危惧IA類		Synthliboramphus antiquus
ウミスズメ		LC✓✓✓✓No———00110/4 (0.0%)6/23 (26.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Uria aalge inornata
ウミガラス		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
—		1.04 Gbp
74.0x		104,657
19.4 kbp		23112/2 (100.0%)6/23 (26.1%)2020-08-22
CR
絶滅危惧IA類		Spilornis cheela perplexus
カンムリワシ		—✓✓✓✓No———011631/13 (7.7%)134/274 (48.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aegolius funereus magnus
キンメフクロウ		——✓✓✓No———00280/4 (0.0%)25/183 (13.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Bubo bubo
ワシミミズク		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.26 Gbp
104.0x		133,317
37.1 kbp		13283/18 (16.7%)25/183 (13.7%)2020-02-04
CR
絶滅危惧IA類		Ketupa blakistoni blakistoni
シマフクロウ		——✓——No———13283/18 (16.7%)25/183 (13.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Picoides tridactylus inouyei
ミユビゲラ		———✓✓No———00120/5 (0.0%)8/222 (3.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sapheopipo noguchii
ノグチゲラ		CR✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.13 Gbp
74.0x		179,014
18.5 kbp		11121/13 (7.7%)8/222 (3.6%)2019-02-16
CR
絶滅危惧IA類		Lanius tigrinus
チゴモズ		LC✓✓✓✓No———0222/30 (6.7%)2/34 (5.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chloris sinica kittlitzi
オガサワラカワラヒワ		—✓✓✓✓No———00450/5 (0.0%)38/288 (13.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Emberiza aureola ornata
シマアオジ		—✓✓✓✓No———03452/44 (4.5%)38/288 (13.2%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Goniurosaurus kuroiwae orientalis
マダラトカゲモドキ		EN✓✓✓✓No———0010/27 (0.0%)1/47 (2.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Goniurosaurus kuroiwae toyamai
イヘヤトカゲモドキ		CR✓✓✓✓No———0010/27 (0.0%)1/47 (2.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Goniurosaurus kuroiwae yamashinae
クメトカゲモドキ		CR✓✓✓✓No———0010/27 (0.0%)1/47 (2.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Takydromus toyamai
ミヤコカナヘビ		EN✓✓✓✓No———00330/23 (0.0%)18/401 (4.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Opisthotropis kikuzatoi
キクザトサワヘビ		CR—✓✓✓No———00360/21 (0.0%)25/1005 (2.5%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Hynobius abei
アベサンショウウオ		EN✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hynobius amakusaensis
アマクササンショウウオ		CR✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hynobius mikawaensis
ミカワサンショウウオ		CR—✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hynobius tosashimizuensis
トサシミズサンショウウオ		CR✓✓✓✓No———0000/87 (0.0%)0/131 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Onychodactylus tsukubaensis
ツクバハコネサンショウウオ		CR—✓✓✓No———0000/13 (0.0%)0/131 (0.0%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Echidna rhodochilus
ナミダカワウツボ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)2/189 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Uropterygius concolor
コゲウツボ		LC✓✓✓✓No———0020/14 (0.0%)2/189 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acheilognathus cyanostigma
イチモンジタナゴ		EN✓✓✓✓No———0010/48 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acheilognathus longipinnis
イタセンパラ		EN✓✓✓✓No———0010/48 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acheilognathus tabira jordani
ミナミアカヒレタビラ		—✓—✓✓No———0010/48 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acheilognathus tabira nakamurae
セボシタビラ		—✓—✓✓No———0010/48 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acheilognathus typus
ゼニタナゴ		VU✓✓✓✓No———0010/48 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aphyocypris chinensis
ヒナモロコ		LC✓✓✓✓No———00320/9 (0.0%)16/205 (7.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carassius sp.
フナ属の１種（琉球列島）		—✓———No———012793/46 (6.5%)51/2321 (2.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gnathopogon caerulescens
ホンモロコ		EN✓✓✓✓No———00150/13 (0.0%)9/349 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ischikauia steenackeri
ワタカ		EN✓✓✓✓No———00320/1 (0.0%)16/205 (7.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pseudorasbora pugnax
ウシモツゴ		VU✓✓✓✓No———02151/7 (14.3%)9/349 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pseudorasbora pumila
シナイモツゴ		EN✓✓✓✓No———02151/7 (14.3%)9/349 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhodeus atremius suigensis
スイゲンゼニタナゴ		DD✓✓✓✓No———0111/50 (2.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhodeus ocellatus kurumeus
ニッポンバラタナゴ		—✓—✓✓No———0111/50 (2.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sarcocheilichthys biwaensis
アブラヒガイ		EN✓✓✓✓No———00150/15 (0.0%)9/349 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tanakia tanago
ミヤコタナゴ		EN✓—✓✓No———0010/8 (0.0%)1/109 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cobitis minamorii minamorii
サンヨウコガタスジシマドジョウ		—✓———No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cobitis minamorii yodoensis
ヨドコガタスジシマドジョウ		———✓✓No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cobitis striata hakataensis
ハカタスジシマドジョウ		—✓—✓✓No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cobitis takenoi
タンゴスジシマドジョウ		CR✓✓✓—No———0262/233 (0.9%)5/454 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Parabotia curtus
アユモドキ		CR✓✓✓✓No———0070/7 (0.0%)6/64 (9.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Plecoglossus altivelis ryukyuensis
リュウキュウアユ		EN✓✓✓✓No———4441/1 (100.0%)1/1 (100.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Neosalanx reganius
アリアケヒメシラウオ		EN✓✓✓✓No———0141/30 (3.3%)3/56 (5.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Salanx ariakensis
アリアケシラウオ		—✓✓✓✓No———0040/5 (0.0%)3/56 (5.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oncorhynchus nerka
ベニザケ（ヒメマス）		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		2.65 Gbp
23.0x		15,727
2.84 Mbp		220577/41 (17.1%)22/676 (3.3%)2019-06-07
CR
絶滅危惧IA類		Monopterus sp.
タウナギ属の１種（琉球列島）		—————No———0111/8 (12.5%)1/71 (1.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gasterosteus aculeatus subsp. 2
ハリヨ		—————No———78142/9 (22.2%)4/57 (7.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pungitius sp. 3
トミヨ属雄物型		—————No———05141/45 (2.2%)4/57 (7.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pungitius sp. 4
ムサシトミヨ		—————No———05141/45 (2.2%)4/57 (7.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Microphis argulus
ホシイッセンヨウジ		LC✓—✓✓No———010395/29 (17.2%)24/603 (4.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Microphis jagorii
ヒメテングヨウジ		DD✓✓✓✓No———01391/3 (33.3%)24/603 (4.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Microphis retzii
タニヨウジ		LC✓✓✓✓No———00390/13 (0.0%)24/603 (4.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cestraeus plicatilis
カワボラ		DD✓✓✓✓No———0090/3 (0.0%)6/365 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tetraroge barbata
アゴヒゲオコゼ		LC✓✓✓✓No———0000/1 (0.0%)0/27 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tetraroge nigra
ヒゲソリオコゼ		LC—✓✓—No———0000/1 (0.0%)0/27 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Yarica hyalosoma
カガミテンジクダイ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.03 Gbp
135.0x		168,358
10.6 kbp		13173/121 (2.5%)16/583 (2.7%)2024-03-19
CR
絶滅危惧IA類		Lutjanus goldiei
ウラウチフエダイ		—✓✓✓✓No———0343/122 (2.5%)4/330 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sillago parvisquamis
アオギス		EN✓✓✓✓No———0000/106 (0.0%)0/113 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Toxotes jaculatrix
テッポウウオ		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		622 Mbp
60.0x		194
15.6 Mbp		2553/7 (42.9%)3/7 (42.9%)2021-04-15
CR
絶滅危惧IA類		Mesopristes argenteus
ニセシマイサキ		LC✓✓✓✓No———0070/3 (0.0%)6/56 (10.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Mesopristes cancellatus
ヨコシマイサキ		LC✓✓✓✓No———0070/3 (0.0%)6/56 (10.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Mesopristes iravi
シミズシマイサキ		DD✓✓✓✓No———0070/3 (0.0%)6/56 (10.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Enneapterygius cheni
ウラウチヘビギンポ		LC✓✓✓✓No———0000/101 (0.0%)0/256 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Omobranchus ferox
カワギンポ		LC✓✓✓✓No———0070/45 (0.0%)4/459 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Omox biporos
ヒルギギンポ		LC—✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Rhyacichthys aspro
ツバサハゼ		DD✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		607 Mbp
28.0x		4,396
1.56 Mbp		1111/2 (50.0%)1/3 (33.3%)2024-02-26
CR
絶滅危惧IA類		Butis amboinensis
ヤエヤマノコギリハゼ		LC✓✓✓✓No———00140/9 (0.0%)12/282 (4.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Bathygobius sp.
カワクモハゼ		—✓———No———00300/34 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callogobius sp.
ミスジハゼ		—✓———No———00300/23 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cristatogobius aurimaculatus
ヒメトサカハゼ		——✓✓✓No———00300/2 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cristatogobius nonatoae
クロトサカハゼ		—✓✓✓✓No———00300/2 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eviota ocellifer
ウラウチイソハゼ		CR✓✓✓✓No———00300/188 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glossogobius aureus
コンジキハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/74 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glossogobius bicirrhosus
アゴヒゲハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/74 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gymnogobius isaza
イサザ		EN✓✓✓✓No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gymnogobius nakamurae
コシノハゼ		—————No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gymnogobius sp. 2
ホクリクジュズカケハゼ		—————No———00300/24 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lentipes armatus
ヨロイボウズハゼ		—✓✓✓✓No———00300/14 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Luciogobius albus
ドウクツミミズハゼ		CR—✓✓✓No———00300/42 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oxyurichthys takagi
シマサルハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/22 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhinogobius sp. BB
アオバラヨシノボリ		—✓———No———01301/122 (0.8%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Scartelaos histophorus
トカゲハゼ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		695 Mbp
72.0x		209,353
8.81 kbp		11301/7 (14.3%)20/2511 (0.8%)2014-12-02
CR
絶滅危惧IA類		Sicyopus zosterophorus
アカボウズハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/9 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Smilosicyopus leprurus
カエルハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/6 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stiphodon alcedo
ヒスイボウズハゼ		—✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stiphodon atropurpureus
コンテリボウズハゼ		LC✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stiphodon imperiorientis
ハヤセボウズハゼ		VU✓✓✓✓No———00300/29 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Parioglossus interruptus
ヒメサツキハゼ		——✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Parioglossus taeniatus
コマチハゼ		LC—✓✓✓No———00300/11 (0.0%)20/2511 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Macropodus opercularis
タイワンキンギョ		LC✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		483 Mbp
150.0x		151
19.2 Mbp		2281/7 (14.3%)3/168 (1.8%)2023-05-15

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Erythromma humerale
アカメイトトンボ		—✓✓✓✓No———0070/4 (0.0%)3/883 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Indolestes boninensis
オガサワラアオイトトンボ		CR✓✓✓✓No———0000/6 (0.0%)0/85 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hemicordulia ogasawarensis
オガサワラトンボ		EN✓✓✓✓No———0000/7 (0.0%)0/176 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Libellula angelina
ベッコウトンボ		CR✓✓✓✓No———0070/21 (0.0%)5/628 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Orthetrum poecilops
ミヤジマトンボ		VU✓✓✓✓No———0070/35 (0.0%)5/628 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Celes akitanus
アカハネバッタ		—✓✓✓✓No———00100/3 (0.0%)8/1839 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ogasawaracris gloriosus
マボロシオオバッタ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Oxya ogasawarensis
オガサワライナゴ		——✓✓✓No———00100/17 (0.0%)8/1839 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platypleura albivannata
イシガキニイニイ		——✓✓✓No———0040/63 (0.0%)3/1186 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplonychus rusticus
タイワンコオイムシ		—✓✓✓✓No———0010/10 (0.0%)1/232 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lethocerus indicus
タイワンタガメ		—✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		427 Mbp
60.0x		502
5.90 Mbp		1111/16 (6.2%)1/232 (0.4%)2021-09-01
CR
絶滅危惧IA類		Laccotrephes grossus
タイワンタイコウチ		—✓✓✓—No———0010/10 (0.0%)1/52 (1.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aphelocheirus kawamurae
カワムラナベブタムシ		——✓✓—No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carabus arrowianus kirimurai
ミカワオサムシ御浜町亜種		—✓✓✓✓No———02341/430 (0.2%)20/6388 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chlaenius praefectus
アオヘリアオゴミムシ		—✓✓✓—No———00340/46 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cylindera bonina
オガサワラハンミョウ		—✓✓✓—No———00340/67 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oodes virens
オオヒラタトックリゴミムシ		——✓✓✓No———00340/5 (0.0%)20/6388 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pterostichus yokohamae
ヨコハマナガゴミムシ		———✓—No———04342/288 (0.7%)20/6388 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Copelatus parallelus
コセスジゲンゴロウ		———✓✓No———0020/468 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cybister lewisianus
マルコガタノゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cybister limbatus
フチトリゲンゴロウ		—✓✓✓—No———0020/40 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dytiscus sharpi
シャープゲンゴロウモドキ		—✓✓✓✓No———0020/29 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hydaticus thermonectoides
マダラシマゲンゴロウ		——✓✓—No———0020/30 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hyphydrus orientalis
ニセコケシゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/28 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhantaticus congestus
マダラゲンゴロウ		—✓✓✓✓No———0020/1 (0.0%)1/2948 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gyrinus ryukyuensis
リュウキュウヒメミズスマシ		——✓——No———0000/73 (0.0%)0/283 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Quedius kiuchii
リュウノイワヤツヤムネハネカクシ		———✓—No———00660/288 (0.0%)49/6919 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Neolucanus insulicola donan
ヨナグニマルバネクワガタ		——✓✓✓No———0050/24 (0.0%)4/380 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oryctes hisamatsui
ヒサマツサイカブト		——✓✓—No———07582/14 (14.3%)39/4671 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chrysobothris boninensis suzukii
オガサワラムツボシタマムシ母島亜種		———✓✓No———0060/34 (0.0%)4/628 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tamamushia virida fujitai
ツマベニタマムシ聟島亜種		———✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Luciola owadai
クメジマボタル		—✓✓✓✓No———0080/2 (0.0%)7/611 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glipa asahinai
キンモンオビハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glipa kurosawai
クロサワオビハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glipa ogasawarensis
オガサワラオビハナノミ		—————No———0000/2 (0.0%)0/431 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hoshihananomia katoi boninensis
ニセキボシハナノミ小笠原亜種		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hoshihananomia kusuii
クスイキボシハナノミ		—————No———0000/4 (0.0%)0/431 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Agapanthia japonica
フサヒゲルリカミキリ		———✓✓No———00250/14 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Boninella anoplos
ケズネオガサワラカミキリ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Boninella hirsuta
アラゲオガサワラカミキリ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Boninella igai
ヒメオガサワラカミキリ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Boninella satoi masatakai
サトウオガサワラカミキリ母島亜種		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Bonipogonius fujitai
ヒゲシロアラゲカミキリ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Phytoecia coeruleomicans
アオキクスイカミキリ		———✓✓No———00250/18 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Xylotrechus takakuwai
ミイロトラカミキリ		———✓✓No———00250/60 (0.0%)16/2935 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Donacia frontalis
アオノネクイハムシ		——✓✓—No———00940/62 (0.0%)52/6796 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ogasawarazo daitoensis
ダイトウスジヒメカタゾウムシ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Ogasawarazo rugosicephalus hahajimaensis
ヒメカタゾウムシ母島亜種		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Orussus boninensis
オガサワラヤドリキバチ		—————No———0111/7 (14.3%)1/12 (8.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chrysis boninensis
オガサワラセイボウ		—————No———0020/214 (0.0%)1/485 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aphaenogaster gamagumayaa
ガマアシナガアリ		———✓—No———071176/280 (2.1%)89/16964 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pison tosawai
チチジマピソン		———✓✓No———00170/20 (0.0%)10/1454 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Anopheles yatsushiroensis
ヤツシロハマダラカ		—✓✓✓✓No———09613641/1138 (3.6%)58/3727 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Simulium yonakuniense
ヨナクニウォレスブユ		—✓—✓✓No———0000/1845 (0.0%)0/2190 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carterocephalus palaemon akaishianus
タカネキマダラセセリ赤石山脈亜種		—✓—✓✓No———234462/15 (13.3%)396/2855 (13.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pyrgus malvae unomasahiroi
ヒメチャマダラセセリ		—✓✓——No———224461/40 (2.5%)396/2855 (13.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pieris canidia kaolicola
タイワンモンシロチョウ対馬・朝鮮半島亜種		—✓✓✓—No———016556/56 (10.7%)25/904 (2.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Antigius butleri kurinodakensis
ウスイロオナガシジミ鹿児島県栗野岳亜種		——✓——No———00420/2 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Celastrina ogasawaraensis
オガサワラシジミ		—✓✓——No———02421/19 (5.3%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Everes lacturnus lacturnus
タイワンツバメシジミ名義タイプ亜種, 琉球亜種		———✓—No———00420/16 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Japonica onoi mizobei
カシワアカシジミ（キタアカシジミ）冠高原亜種		—✓✓——No———00420/5 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Phengaris teleius kazamoto
ゴマシジミ関東・中部亜種		—✓———No———03422/11 (18.2%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pithecops fulgens tsushimanus
ツシマウラボシシジミ		—✓———No———00420/4 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Plebejus subsolanus iburiensis
アサマシジミ北海道亜種		—————No———06424/65 (6.2%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Shijimia moorei moorei
ゴイシツバメシジミ		—✓✓✓—No———00420/1 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Shijimiaeoides divinus barine
オオルリシジミ本州亜種		——✓——No———00420/1 (0.0%)23/2639 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Coenonympha oedippus annulifer
ヒメヒカゲ長野県・群馬県亜種		——✓——No———025792/36 (5.6%)134/5171 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Fabriciana nerippe
オオウラギンヒョウモン		—✓✓✓✓No———025791/10 (10.0%)134/5171 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Melitaea protomedia
ウスイロヒョウモンモドキ		—✓✓✓✓No———035791/137 (0.7%)134/5171 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Melitaea scotosia
ヒョウモンモドキ		—✓✓✓✓No———035791/137 (0.7%)134/5171 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oeneis norna sugitanii
タカネヒカゲ八ヶ岳亜種		—✓✓——No———025791/39 (2.6%)134/5171 (2.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sebastosema bubonaria
カバシタムクゲエダシャク		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Oxytrypia orbiculosa
ミヨタトラヨトウ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Sideridis incommoda
アサギリヨトウ（キシダムラサキヨトウ）		—✓✓✓—No———003120/18 (0.0%)149/7125 (2.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sinocharis korbae
ノシメコヤガ		—✓✓✓✓No———003120/1 (0.0%)149/7125 (2.1%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Ogasawarana obtusa
ミガキヤマキサゴ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Chamalycaeus okinawaensis
オキナワムシオイ		—✓—✓✓No———0000/8 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chamalycaeus sp.
イリオモテムシオイ		—————No———0000/2 (0.0%)0/261 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nobuea sp.
ゴトウノブエガイ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Pirenella cancellata
ヌノメヘナタリ		——✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/48 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angustassiminea sp. A
ヘドクリイロカワザンショウ		—————No———0000/6 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angustassiminea sp. B
ティンダハナタクリイロカワザンショウ		—————No———0000/6 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angustassiminea sp. C
ウフアガリクリイロカワザンショウ		—————No———0000/6 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cavernacmella sp. A
ナラオゴマオカチグサ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Cavernacmella sp. B
コシキゴマオカチグサ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Cavernacmella sp. C
ウフアガリゴマオカチグサ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Paludinellassiminea daitoensis
ダイトウオカチグサ (ダイトウヘソカド)		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Paludinellassiminea miyakoinsularis
ミヤコオカチグサ		———✓✓No———0000/1 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Paludinellassiminea sp. A
タマグスクオカチグサ		—————No———0000/1 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Paludinellassiminea sp. B
ドナンオカチグサ		—————No———0000/1 (0.0%)0/63 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Parafossarulus manchouricus japonicus
マメタニシ		—✓———No———0000/4 (0.0%)0/32 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gammatricula shini
ヨナグニカタヤマガイ		—✓✓✓✓No———0010/5 (0.0%)1/89 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Truncatella oagariensis
オカクビキレ		———✓✓No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Truncatella sp. B
アソブイトクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Truncatella sp. C
カガヨイクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Truncatella sp. D
キザハシクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Truncatella sp. E
ロウタキクビキレ		—————No———0000/11 (0.0%)0/15 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Marginellidae gen. &. sp.
オカトリノコガイ		—————No———0000/44 (0.0%)0/44 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Mathilda sinensis
タクミニナ		———✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Camptoceras hirasei
カワネジガイ		DD✓✓✓✓No———00160/1 (0.0%)6/665 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ferrissia nipponica
カワコザラ		—✓—✓—No———0000/23 (0.0%)0/216 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Succinea sp.
ダイトウオカモノアラガイ		—✓———No———0000/88 (0.0%)0/177 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Luchuena sp.
クメジマキセルモドキ		—————No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Megalophaedusa fukudainadai
ナルトギセル		—✓—✓✓No———0000/56 (0.0%)0/611 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stereophaedusa sp. (Sm)
ナタマメギセル（小型）		—————No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stereophaedusa striatella
ミヤコオキナワギセル		—————No———0000/40 (0.0%)0/611 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Zaptyx daitojimana
ダイトウノミギセル		———✓✓No———0000/37 (0.0%)0/611 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cipangocharax ananensis
アナンムシオイ		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Nesiohelix omphalina bipyramidalis
オオアガリマイマイ		—————No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nesiohelix omphalina omphalina
ヘソアキアツマイマイ		—————No———0040/7 (0.0%)4/1482 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sinohyriopsis schlegelii
イケチョウガイ		—✓✓✓✓No———0171/4 (25.0%)7/856 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Apolymetis meyeri
チリメンジュロウジン		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Cyclina sp.
ダテオキシジミ		—————No———01121/1 (100.0%)8/278 (2.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Borniopsis sp．
ヨコヅナケボリ		—————No———0000/3 (0.0%)0/65 (0.0%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Chenopodium bryoniifolium
ミドリアカザ		—✓✓✓✓No———0263656/117 (5.1%)17/1278 (1.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chenopodium gracilispicum
イワアカザ		—✓✓✓✓No———003650/7 (0.0%)17/1278 (1.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Salix nummularia
エゾマメヤナギ		—✓✓✓✓No———0275911/443 (2.5%)27/853 (3.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Betula apoiensis
アポイカンバ		LC✓✓✓✓No———02132/82 (2.4%)9/207 (4.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Celtis biondii var. insularis
サキシマエノキ		—✓—✓✓No———00220/72 (0.0%)4/125 (3.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ficus iidaiana
オオヤマイチジク		—✓✓✓✓No———08206/784 (0.8%)13/1208 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Morus boninensis
オガサワラグワ		—✓✓✓✓No———04203/29 (10.3%)13/1208 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elatostema oshimense
アマミサンショウソウ		——✓✓✓No———00100/206 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elatostema yakushimense
ヒメトキホコリ		—✓✓✓✓No———00100/206 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elatostema yonakuniense
ヨナクニトキホコリ		—✓—✓✓No———00100/206 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nanocnide pilosa
トウカテンソウ		—✓—✓✓No———00100/7 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Procris boninensis
セキモンウライソウ		—✓✓✓✓No———00100/12 (0.0%)4/1099 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Bistorta hayachinensis
ナンブトラノオ		——✓✓✓No———00210/19 (0.0%)11/975 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Persicaria japonica var. taitoinsularis
ダイトウサクラタデ		—————No———03212/87 (2.3%)11/975 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Minuartia arctica var. arctica
エゾタカネツメクサ		—————No———00260/18 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sagina saginoides
チシマツメクサ		—✓✓✓✓No———00260/30 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Silene repens var. apoiensis
アポイマンテマ		———✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Silene tokachiensis
トカチビランジ		——✓✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Silene uralensis
タカネマンテマ		—✓✓✓✓No———09267/598 (1.2%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stellaria calycantha
カンチヤチハコベ		LC✓✓✓✓No———00260/163 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Stellaria nipponica var. yezoensis
オオイワツメクサ		———✓✓No———00260/163 (0.0%)19/2065 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deeringia polysperma
インドヒモカズラ		—✓✓✓✓No———0080/4 (0.0%)5/615 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polyalthia liukiuensis
クロボウモドキ		—✓✓✓✓No———0030/29 (0.0%)2/1610 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cassytha glabella
イトスナヅル		—✓✓✓✓No———00160/11 (0.0%)7/1492 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Illigera luzonensis
テングノハナ		—✓✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/46 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum iidemontanum
イイデトリカブト		—✓✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum jaluense subsp. jaluense
コウライブシ		—✓—✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum japonicum subsp. maritimum var. iyariense
イヤリトリカブト		——✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum kitadakense
キタダケトリカブト		—✓✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum metajaponicum
オンタケブシ		——✓✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aconitum senanense subsp. senanense var. isidzukae
オオサワトリカブト		—✓—✓✓No———00110/226 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callianthemum kirigishiense
キリギシソウ		—✓✓✓✓No———00110/15 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callianthemum miyabeanum
ヒダカソウ		—✓✓✓✓No———00110/15 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Clematis obvallata var. obvallata
コウヤハンショウヅル		—✓—✓—No———00110/204 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ranunculus pygmaeus
クモマキンポウゲ		—✓✓✓✓No———00110/432 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ranunculus ternatus var. lutchuensis
リュウキュウヒキノカサ		———✓—No———00110/432 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ranunculus yatsugatakensis
ヤツガタケキンポウゲ		——✓✓✓No———00110/432 (0.0%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thalictrum minus var. chionophyllum
ミョウギカラマツ		———✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thalictrum ujiinsulare
ウジカラマツ		——✓✓✓No———03111/131 (0.8%)7/1847 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Photinia serratifolia
オオカナメモチ		—✓✓✓✓No———001950/44 (0.0%)75/3777 (2.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Prunus tamaclivorum
ホシザクラ		———✓—No———04519516/385 (4.2%)75/3777 (2.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rubus amamianus var. minor
コバノアマミフユイチゴ		———✓✓No———071955/738 (0.7%)75/3777 (2.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rubus arcticus
チシマイチゴ		LC✓✓✓✓No———071955/738 (0.7%)75/3777 (2.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rubus nakaii
チチジマイチゴ		—✓—✓—No———071955/738 (0.7%)75/3777 (2.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cocculus orbiculatus
ホウザンツヅラフジ		—✓—✓✓No———0050/3 (0.0%)5/289 (1.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pericampylus formosanus
ホウライツヅラフジ		———✓✓No———0050/3 (0.0%)5/289 (1.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nuphar submersa
シモツケコウホネ		—✓✓✓✓No———0141/22 (4.5%)3/155 (1.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Piper postelsianum
タイヨウフウトウカズラ		—✓✓✓✓No———0222/650 (0.3%)2/1056 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum caudigerum
オナガサイシン		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum dilatatum
スエヒロアオイ		——✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum gusk
グスクカンアオイ		CR✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum hexalobum var. controversum
シシキカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum kinoshitae
ジュロウカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum minamitanianum
オナガカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum mitoanum
フクエジマカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum monodoriflorum
モノドラカンアオイ		CR✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum muramatsui var. shimodanum
シモダカンアオイ		—————No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum okinawense
ヒナカンアオイ		CR✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum pellucidum
トリガミネカンアオイ		CR✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum satsumense
サツマアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum senkakuinsulare
センカクカンアオイ		—✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asarum tabatanum
アサトカンアオイ		CR✓✓✓✓No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eurya zigzag
クニガミヒサカキ		CR✓✓✓✓No———0010/72 (0.0%)1/225 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hypericum senkakuinsulare
センカクオトギリ		——✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hypericum tosaense
トサオトギリ		—✓✓✓✓No———0884/360 (1.1%)4/430 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aldrovanda vesiculosa
ムジナモ		EN✓✓✓✓No———0040/1 (0.0%)4/90 (4.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arabis ligulifolia
ヘラハタザオ		—✓—✓✓No———004840/2 (0.0%)105/3391 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Berteroella maximowiczii
ハナナズナ		—✓✓✓✓No———004840/7 (0.0%)105/3391 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dontostemon dentatus
ハナハタザオ		—✓✓✓✓No———004840/12 (0.0%)105/3391 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Draba igarashii
シリベシナズナ		—✓✓✓✓No———034842/326 (0.6%)105/3391 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Draba nakaiana
ソウウンナズナ		———✓✓No———034842/326 (0.6%)105/3391 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Isatis tinctoria
ハマタイセイ		—✓✓✓✓Yes (3)Chromosome,
Representative		294 Mbp
142.7x		1,198
1.18 Mbp		344842/38 (5.3%)105/3391 (3.1%)2019-06-15
CR
絶滅危惧IA類		Corylopsis gotoana var. pubescens
ヒゴミズキ		———✓✓No———0030/21 (0.0%)3/100 (3.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sedum drymarioides
ナナツガママンネングサ		—✓✓✓✓No———0191/255 (0.4%)6/1202 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Mitella amamiana
アマミチャルメルソウ		—✓✓✓✓No———0010/11 (0.0%)1/829 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saxifraga bracteata
キヨシソウ		—✓✓✓✓No———0111/503 (0.2%)1/829 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saxifraga nishidae
エゾノクモマグサ		—✓✓✓✓No———0111/503 (0.2%)1/829 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saxifraga yuparensis
ユウバリクモマグサ		—✓—✓✓No———0111/503 (0.2%)1/829 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deutzia hatusimae
コミノヒメウツギ		——✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deutzia naseana var. amanoi
オキナワヒメウツギ		——✓✓✓No———0060/73 (0.0%)1/258 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hydrangea involucrata var. tokarensis
トカラタマアジサイ		——✓✓✓No———0661/136 (0.7%)1/258 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ribes horridum
クロミノハリスグリ		—✓✓✓✓No———0000/137 (0.0%)0/137 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pittosporum parvifolium
コバトベラ		—✓✓✓✓No———0111/111 (0.9%)1/137 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Astragalus japonicus
エゾモメンヅル		——✓✓✓No———052943/1579 (0.2%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crotalaria calycina
ガクタヌキマメ		—✓✓✓✓No———012941/462 (0.2%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crotalaria montana var. angustifolia
ヤエヤマタヌキマメ		——✓✓✓No———012941/462 (0.2%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crotalaria uncinella
エダウチタヌキマメ		LC✓✓✓✓No———012941/462 (0.2%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Entada tonkinensis
モダマ		—✓✓✓✓No———002940/25 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euchresta formosana
タイワンミヤマトベラ		—✓✓✓✓No———002940/4 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glycine max subsp. formosana
ホソバツルマメ		——✓✓✓No———22292944/50 (8.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Glycine tabacina
ボウコツルマメ		LC✓✓✓✓No———0292944/50 (8.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Indigofera kirilowii
チョウセンニワフジ		—✓✓✓✓No———002940/505 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Intsia bijuga
タシロマメ		NT✓✓✓✓No———002940/7 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pterocarpus vidalianus
ヤエヤマシタン		——✓✓✓No———022942/51 (3.9%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sophora franchetiana
ツクシムレスズメ		—✓✓✓✓No———022941/66 (1.5%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tadehagi triquetrum
タデハギ		—✓✓✓✓No———002940/7 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Uraria picta
ホソバフジボグサ		LC✓✓✓✓No———002940/9 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vigna vexillata var. vexillata
サクヤアカササゲ		—✓✓✓✓No———0332949/92 (9.8%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Zornia cantoniensis
スナジマメ		—✓—✓✓No———002940/54 (0.0%)134/16030 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cladopus fukienensis
タシロカワゴケソウ		—✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/388 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hydrobryum koribanum
オオヨドカワゴロモ		—✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/388 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oxalis amamiana
アマミカタバミ		——✓✓✓No———0111/426 (0.2%)1/449 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Geranium shikokianum var. yoshiianum
ヤクシマフウロ		—✓✓✓✓No———08287/184 (3.8%)26/529 (4.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Linum stelleroides
マツバニンジン		—✓✓✓✓No———027275/116 (4.3%)5/167 (3.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chamaesyce liukiuensis
リュウキュウタイゲキ		———✓✓No———0474/42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Claoxylon centinarium
セキモンノキ		—————No———00740/10 (0.0%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Croton sp.
コバノクスドイゲ		—✓———No———03742/677 (0.3%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Discocleidion ulmifolium
エノキフジ		——✓✓✓No———00740/1 (0.0%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euphorbia octoradiata
ハギクソウ		—✓—✓✓No———0187412/1293 (0.9%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euphorbia sp.
アマミナツトウダイ		—————No———0187412/1293 (0.9%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euphorbia watanabei subsp. minamitanii
ヒュウガタイゲキ		——✓✓✓No———0187412/1293 (0.9%)42/3644 (1.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Margaritaria indica
アカハダコバンノキ		—✓✓✓✓No———0040/8 (0.0%)3/871 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Phyllanthus oligospermus subsp. donanensis
ドナンコバンノキ		—✓✓✓✓No———0040/18 (0.0%)3/871 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Citrus nippokoreana
コウライタチバナ		—✓—✓—No———0567121/198 (10.6%)32/1478 (2.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tetradium glabrifolium
ホソバハマセンダン		—✓✓✓✓No———00710/15 (0.0%)32/1478 (2.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ryssopterys timoriensis
ササキカズラ		—✓—✓✓No———0000/6 (0.0%)0/666 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polygala longifolia
リュウキュウヒメハギ		——✓✓✓No———0000/315 (0.0%)0/677 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polygala polifolia
シンチクヒメハギ		——✓——No———0000/315 (0.0%)0/677 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhus javanica var. javanica
タイワンフシノキ		—————No———0020/7 (0.0%)1/120 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acer amamiense
アマミカジカエデ		CR✓✓✓✓No———07184/173 (2.3%)11/1118 (1.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ilex dimorphophylla
アマミヒイラギモチ		CR✓✓✓✓No———0553/342 (0.9%)3/346 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ilex macrocarpa
ヒロハタマミズキ		—✓✓✓✓No———0553/342 (0.9%)3/346 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euonymus oblongifolius
ナガバヒゼンマユミ		LC✓✓✓✓No———0241/87 (1.1%)2/730 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euonymus oligospermus
アンドンマユミ		———✓✓No———0241/87 (1.1%)2/730 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Buxus sinica var. sinica
タイワンアサマツゲ		———✓—No———0231/105 (1.0%)2/141 (1.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nothapodytes amamianus
ワダツミノキ		—✓—✓✓No———0111/6 (16.7%)1/117 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhamnus kanagusukui
ヒメクロウメモドキ		—————No———00160/121 (0.0%)5/891 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vitis romanetii
クマガワブドウ		—✓—✓✓No———013013220/239 (8.4%)22/829 (2.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Grewia rhombifolia
ヒシバウオトリギ		——✓✓✓No———001190/109 (0.0%)57/2408 (2.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tilia mandshurica var. chugokuensis
チュウゴクボダイジュ		—————No———011191/42 (2.4%)57/2408 (2.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tilia mandshurica var. mandshurica
マンシュウボダイジュ		———✓—No———011191/42 (2.4%)57/2408 (2.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Triumfetta procumbens var. glaberrima
ケナシハテルマカズラ		———✓✓No———001190/30 (0.0%)57/2408 (2.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Abelmoschus moschatus var. betulifolius
センカクトロロアオイ		——✓✓✓No———011191/12 (8.3%)57/2408 (2.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplomorpha phymatoglossa
オオシマガンピ		—✓—✓✓No———0070/4 (0.0%)6/558 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elaeagnus arakiana
タンゴグミ		——✓✓✓No———0252/78 (2.6%)5/93 (5.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elaeagnus epitricha
クマヤマグミ		—✓✓✓✓No———0252/78 (2.6%)5/93 (5.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Viola amamiana
アマミスミレ		CR✓✓✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Viola lactiflora
シロコスミレ		—✓✓✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Viola okinawensis
シマジリスミレ		———✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Viola sp.
テリハオリヅルスミレ		—————No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Viola tashiroi var. tairae
イシガキスミレ		———✓✓No———0332/402 (0.5%)2/638 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Trichosanthes homophylla var. ishigakiensis
イシガキカラスウリ		———✓✓No———021272/107 (1.9%)35/968 (3.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Zehneria perpusilla var. deltifrons
サツマスズメウリ		———✓✓No———001270/56 (0.0%)35/968 (3.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rotala elatinomorpha
ヒメキカシグサ		———✓✓No———00190/20 (0.0%)8/345 (2.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rotala hippuris
ミズスギナ		—✓✓✓✓No———00190/20 (0.0%)8/345 (2.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Barringtonia asiatica
ゴバンノアシ		LC✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/268 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Melastoma tetramerum var. tetramerum
ムニンノボタン		—✓———No———0554/58 (6.9%)4/3236 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lumnitzera racemosa
ヒルギモドキ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		1.32 Gbp
124.0x		2,239
37.2 Mbp		1242/3 (66.7%)4/293 (1.4%)2022-07-05
CR
絶滅危惧IA類		Terminalia nitens
テリハモモタマナ		VU✓✓✓✓No———0040/124 (0.0%)4/293 (1.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Epilobium fastigiatoramosum
エダウチアカバナ		——✓✓✓No———0040/106 (0.0%)3/465 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cornus kousa var. chinensis
ヤエヤマヤマボウシ		—✓✓✓✓No———1664/77 (5.2%)4/103 (3.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angelica cryptotaeniifolia var. cryptotaeniifolia
ミヤマノダケ		———✓—No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angelica minamitanii
ヒュウガセンキュウ		—✓✓✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angelica mukabakiensis
オオウバタケニンジン		———✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angelica saxicola
イシヅチボウフウ		——✓✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angelica sinanomontana
シナノノダケ		——✓✓✓No———00140/110 (0.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Heracleum lanatum subsp. akasimontanum
ホソバハナウド		—✓—✓✓No———01141/96 (1.0%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sanicula lamelligera var. wakayamensis
キイウマノミツバ		———✓✓No———01141/45 (2.2%)12/3077 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Shortia rotundifolia var. amamiana
アマミイワウチワ		———✓—No———0000/6 (0.0%)0/17 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Moneses uniflora
イチゲイチヤクソウ		—✓✓✓✓No———00350/1 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Menziesia goyozanense
ゴヨウザンヨウラク		—————No———00350/1 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pieris koidzumiana
リュウキュウアセビ		—✓✓✓✓No———00350/9 (0.0%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhododendron boninense
ムニンツツジ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhododendron dilatatum var. satsumense
ハヤトミツバツツジ		——✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhododendron eriocarpum var. tawadae
センカクツツジ		—✓—✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhododendron keiskei var. hypoglaucum
ウラジロヒカゲツツジ		——✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhododendron latoucheae var. amamiense
アマミセイシカ		—✓✓✓✓No———0143511/792 (1.4%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vaccinium amamianum
ヤドリコケモモ		—✓—✓✓No———011356/230 (2.6%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vaccinium sieboldii
ナガボナツハゼ		—✓✓✓✓No———011356/230 (2.6%)24/3009 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Myrsine okabeana
マルバタイミンタチバナ		—✓✓✓✓No———00100/85 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lysimachia liukiuensis
ヒメミヤマコナスビ		CR✓✓✓✓No———00100/150 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lysimachia ohsumiensis
ヘツカコナスビ		—✓✓✓✓No———00100/150 (0.0%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Primula kisoana var. kisoana
カッコソウ		—✓✓——No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Primula macrocarpa
ヒメコザクラ		——✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Primula reinii var. myogiensis
ミョウギイワザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Primula reinii var. rhodotricha
チチブイワザクラ		—✓✓✓✓No———07102/365 (0.5%)4/1434 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Limonium senkakuense
センカクハマサジ		——✓✓✓No———0111/292 (0.3%)1/624 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Limonium sinense
タイワンハマサジ		—✓✓✓✓No———0111/292 (0.3%)1/624 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Symplocos boninensis
ムニンクロキ		—✓✓✓✓No———0111/209 (0.5%)1/210 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Symplocos kawakamii
ウチダシクロキ		—✓✓✓✓No———0111/209 (0.5%)1/210 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ligustrum tamakii
トゲイボタ		——✓✓✓No———02461/44 (2.3%)32/557 (5.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gardneria liukiuensis
リュウキュウホウライカズラ		———✓✓No———0000/4 (0.0%)0/251 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gardneria shimadai
タイワンチトセカズラ		———✓—No———0000/4 (0.0%)0/251 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gentiana aquatica
ヒナリンドウ		—✓✓✓✓No———0343/282 (1.1%)4/1134 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gentiana takushii
ミヤココケリンドウ		——✓✓✓No———0343/282 (1.1%)4/1134 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Excavatia hexandra
ホソバヤロード		———✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Ochrosia iwasakiana
シマソケイ		—✓✓✓✓No———00220/21 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Urceola micrantha
ゴムカズラ		—✓✓✓✓No———00220/6 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cynanchum boudieri
アマミイケマ		—✓✓✓✓No———01221/147 (0.7%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dischidia formosana
マメヅタカズラ		—✓✓✓✓No———00220/31 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vincetoxicum inamoenum
エゾノクサタチバナ		—✓✓✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vincetoxicum yonakuniense
ヨナグニカモメヅル		—✓✓✓✓No———00220/140 (0.0%)17/3251 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Galium triflorum
ヤツガタケムグラ		LC✓✓✓✓No———04333/252 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hedyotis auricularia
ヤエヤマハシカグサ		—✓✓✓✓No———00330/8 (0.0%)24/6100 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Knoxia sumatrensis
シソノミグサ		—✓✓✓✓No———01331/5 (20.0%)24/6100 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ophiorrhiza yamashitae
アマミアワゴケ		CR—✓✓✓No———01331/86 (1.2%)24/6100 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polemonium kiushianum
ハナシノブ		—✓✓✓✓No———0020/31 (0.0%)1/419 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aniseia martinicensis
ナガバアサガオ		LC✓✓✓✓No———00160/4 (0.0%)11/1176 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cuscuta australis
マメダオシ		—✓✓✓✓Yes (1)Contig,
Representative		263 Mbp
97.6x		218
3.63 Mbp		14164/186 (2.2%)11/1176 (0.9%)2018-06-22
CR
絶滅危惧IA類		Cuscuta europaea
クシロネナシカズラ		—✓✓✓✓Yes (1)Contig,
Representative		976 Mbp
41.0x		475
17.9 Mbp		14164/186 (2.2%)11/1176 (0.9%)2022-11-27
CR
絶滅危惧IA類		Lepistemon binectariferum var. trichocarpum
オオバケアサガオ		———✓—No———00160/011/1176 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cordia aspera subsp. kanehirae
トゲミノイヌチシャ		—✓✓✓✓No———0111/144 (0.7%)1/168 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cynoglossum lanceolatum var. formosanum
タイワンルリソウ		———✓✓No———0060/40 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ehretia philippinensis
リュウキュウチシャノキ		—✓✓✓✓No———0221/39 (2.6%)1/126 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eritrichium nipponicum var. albiflorum
エゾルリムラサキ		——✓✓✓No———0060/18 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hackelia deflexa
イワムラサキ		—✓✓✓✓No———0060/15 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Mertensia pterocarpa var. yezoensis
エゾルリソウ		——✓✓✓No———0060/63 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Omphalodes prolifera
ハイルリソウ		———✓✓No———0060/10 (0.0%)3/1290 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callicarpa formosana
ホウライムラサキ		LC✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callicarpa glabra
シマムラサキ		—✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callicarpa longissima
タカクマムラサキ		LC✓✓✓✓No———00570/74 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vitex bicolor
ヤエヤマハマゴウ		—✓✓✓✓No———00570/83 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Vitex quinata
オオニンジンボク		LC✓✓✓✓No———00570/83 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Amethystea caerulea
ルリハッカ		—✓✓✓✓No———00570/1 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Coleus formosanus
ケサヤバナ		—✓✓✓✓No———00570/66 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Teucrium veronicoides var. brachytrichum
イヌニガクサ		—————No———00570/114 (0.0%)38/4275 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Solanum miyakojimense
イラブナスビ		——✓✓✓No———020227258/1059 (5.5%)89/2442 (3.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euphrasia multifolia var. inaensis
イナコゴメグサ		—✓—✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Euphrasia pectinata var. obtusiserrata
エゾノダッタンコゴメグサ		———✓✓No———0382/111 (1.8%)7/1379 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pedicularis koidzumiana
ベニシオガマ		——✓✓✓No———0080/408 (0.0%)7/1379 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rehmannia japonica
センリゴマ		—✓✓✓✓No———0181/11 (9.1%)7/1379 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Veronicastrum liukiuense
リュウキュウスズカケ		CR✓✓✓✓No———00400/16 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Veronicastrum villosulum
スズカケソウ		—✓✓✓✓No———00400/16 (0.0%)32/1679 (1.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hemigraphis okamotoi
ミヤコジマソウ		—✓—✓✓No———0080/23 (0.0%)4/1910 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aeschynanthus acuminatus
ナガミカズラ		—✓✓✓✓No———0060/64 (0.0%)6/2371 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lysionotus apicidens
タイワンシシンラン		—✓—✓✓No———0060/23 (0.0%)6/2371 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Titanotrichum oldhamii
マツムラソウ		—✓✓✓✓No———0060/1 (0.0%)6/2371 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Orobanche boninsimae
シマウツボ		—✓✓✓✓No———0181/82 (1.2%)7/1379 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Abelia chinensis var. ionandra
タイワンツクバネウツギ		—✓—✓✓No———0020/10 (0.0%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Abelia serrata var. tomentosa
オニツクバネウツギ		—✓✓✓✓No———0020/5 (0.0%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lonicera japonica var. miyagusukiana
ヒメスイカズラ		——✓✓✓No———1222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lonicera kurobushiensis
クロブシヒョウタンボク		—✓✓✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lonicera uzenensis
ウゼンベニバナヒョウタンボク		—✓✓✓✓No———0222/166 (1.2%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Triosteum pinnatifidum
ホザキツキヌキソウ		—✓✓✓✓No———0020/8 (0.0%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Weigela florida
オオベニウツギ		—✓✓✓✓No———0020/11 (0.0%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Patrinia triloba var. kozushimensis
シマキンレイカ		———✓✓No———0020/13 (0.0%)2/655 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Adenophora hatsushimae
ツクシイワシャジン		——✓✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Adenophora palustris
ヤチシャジン		—✓✓✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Adenophora pereskiifolia var. yamadae
ユウバリシャジン		———✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Adenophora stricta
トウシャジン		—✓✓✓✓No———01101/67 (1.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lobelia chevalieri
タチミゾカクシ		——✓✓✓No———01101/187 (0.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lobelia zeylanica
マルバミゾカクシ		LC✓✓✓✓No———01101/187 (0.5%)8/1478 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ainsliaea oblonga var. latifolia
オオナガバハグマ		———✓✓No———001060/38 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Anaphalis sinica var. yakusimensis
ヤクシマウスユキソウ		———✓✓No———001060/74 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Antennaria dioica
エゾノチチコグサ		—✓✓✓✓No———001060/40 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aster ujiinsularis
オオイソノギク		—————No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aster yakushimensis
ヤクシマノギク		——✓✓✓No———001060/129 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium aidzuense
アイズヒメアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium akimotoi
シライワアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium apoense
アポイアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium japonicum var. australe
タカサゴアザミ		—✓✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium katoanum
ウゼンヒメアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium lucens var. bracteosum
ヘイケモリアザミ		———✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium masami-saitoanum
ヒュウガアザミ		——✓✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cirsium nippoense
ニッポウアザミ		———✓✓No———001060/204 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Conyza aegyptiaca
キクバイズハハコ		—✓—✓✓No———001060/32 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crepidiastrum grandicollum
コヘラナレン		—✓✓✓✓No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crepidiastrum lanceolatum var. daitoense
ダイトウワダン		—————No———001060/13 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Erigeron miyabeanus
ミヤマノギク		—✓✓✓✓No———041063/178 (1.7%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lagenophora lanata
コケセンボンギク		—✓✓✓✓No———001060/16 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ligularia angusta
ヤマタバコ		——✓✓✓No———001060/97 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Parasenecio hastatus subsp. orientalis var. nantaicus
ニッコウコウモリ		—✓—✓✓No———001060/52 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saussurea insularis
シマトウヒレン		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saussurea mikurasimensis
ミクラジマトウヒレン		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Saussurea yakusimensis
ヤクシマヒゴタイ		———✓✓No———011061/358 (0.3%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Scorzonera rebunensis
フタナミソウ		———✓✓No———001060/41 (0.0%)65/15843 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Alisma canaliculatum var. harimense
ホソバヘラオモダカ		———✓✓No———0221/11 (9.1%)1/143 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sagittaria natans
カラフトグワイ		—✓✓✓✓No———0020/44 (0.0%)1/143 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Potamogeton lucens var. teganumensis
ガシャモク		—✓—✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Potamogeton obtusifolius
イヌイトモ		LC✓✓✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Potamogeton praelongus
ナガバエビモ		LC✓✓✓✓No———0000/127 (0.0%)0/171 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ruppia occidentalis
ヤハズカワツルモ		—✓—✓✓No———0030/22 (0.0%)2/39 (5.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Najas tenuicaulis
ヒメイバラモ		——✓✓✓No———0030/30 (0.0%)2/213 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sciaphila multiflora
イシガキソウ		——✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sciaphila sugimotoi
オモトソウ		——✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sciaphila yakushimensis
ヤクシマソウ		—✓✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Anticlea sibirica
リシリソウ		—✓✓✓✓No———0010/6 (0.0%)1/204 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chionographis koidzumiana var. kurokamiana
クロカミシライトソウ		———✓✓No———0111/4 (25.0%)1/204 (0.5%)—
CR
絶滅危惧IA類		Disporum uniflorum
キバナホウチャクソウ		—✓✓✓✓No———0000/18 (0.0%)0/296 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lilium alexandrae
ウケユリ		CR✓—✓✓No———0111/151 (0.7%)1/747 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lilium callosum var. flaviflorum
キバナスゲユリ		—✓✓✓✓No———0111/151 (0.7%)1/747 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lilium nobilissimum
タモトユリ		—✓✓✓✓No———0111/151 (0.7%)1/747 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ophiopogon reversus
ヨナグニノシラン		—✓✓✓✓No———00170/50 (0.0%)13/1447 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rohdea japonica var. latifolia
サツマオモト		——✓✓✓No———00170/14 (0.0%)13/1447 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tofieldia coccinea var. kiusiana
ナガエチャボゼキショウ		—✓—✓✓No———0000/14 (0.0%)0/24 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tricyrtis formosana
タイワンホトトギス		—✓✓✓✓No———0010/35 (0.0%)1/747 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tricyrtis hitra var. masamunei
サツマホトトギス		—————No———0010/35 (0.0%)1/747 (0.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dioscorea luzonensis
ルゾンヤマノイモ		—✓—✓✓No———011125/343 (1.5%)6/348 (1.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dioscorea tabatae
ユワンオニドコロ		CR✓✓✓✓No———011125/343 (1.5%)6/348 (1.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dioscorea zentaroana
アマミタチドコロ		—✓✓✓✓No———011125/343 (1.5%)6/348 (1.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Iris setosa var. nasuensis
ナスヒオウギアヤメ		———✓✓No———0785/291 (1.7%)6/1433 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oxygyne hyodoi
ヒナノボンボリ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/62 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oxygyne shinzatoi
ホシザキシャクジョウ		CR✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/62 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oxygyne yamashitae
ヤクノヒナホシ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/62 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Juncus decipiens f. filiformis
オキナワイ		—————No———0682/162 (1.2%)3/279 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Juncus potaninii
エゾイトイ		—✓✓✓✓No———0682/162 (1.2%)3/279 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Juncus yakeisidakensis
ミヤマゼキショウ		———✓✓No———0682/162 (1.2%)3/279 (1.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eriocaulon amanoanum
アマノホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eriocaulon perplexum
エゾイヌノヒゲ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eriocaulon seticuspe
ヒュウガホシクサ		———✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eriocaulon truncatum
スイシャホシクサ		LC✓✓✓✓No———0000/153 (0.0%)0/482 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calamagrostis autumnalis
キリシマノガリヤス		——✓✓✓No———008480/101 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Digitaria mollicoma
ビロードメヒシバ		—✓✓✓✓No———068483/81 (3.7%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elymus koryoensis
タイシャクカモジ		—————No———018481/157 (0.6%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elymus sibiricus
エゾムギ		—✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		6.90 Gbp
30.4x		418
49.5 Mbp		118481/157 (0.6%)134/8485 (1.6%)2024-05-20
CR
絶滅危惧IA類		Elymus tsukushiensis var. tsukushiensis
オニカモジ		———✓—No———008480/10 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Isachne lutchuensis
ケナシハイチゴザサ		——✓✓✓No———008480/18 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Isachne myosotis
ヒメハイチゴザサ		——✓✓✓No———008480/18 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ischaemum indicum
ヒメカモノハシ		LC✓—✓✓No———008480/26 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Panicum paludosum
オオヌカキビ		—✓✓✓—No———0408483/182 (1.6%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Piptatherum kuoi
イネガヤ		—✓—✓✓No———008480/34 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Poa glauca var. kitadakensis
キタダケイチゴツナギ		———✓✓No———068485/368 (1.4%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sacciolepis myosuroides
ハラヌメリ		LC✓✓✓✓No———008480/13 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Schizachne purpurascens subsp. callosa
フォーリーガヤ		—✓✓✓✓No———008480/2 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sorghum nitidum
コモロコシガヤ		—✓✓✓✓No———0248481/39 (2.6%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Sporobolus hancei
ヒメネズミノオ		——✓✓✓No———018481/172 (0.6%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thaumastochloa cochinchinensis
ヒメウシノシッペイ		———✓✓No———008480/2 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Torreyochloa natans
ホソバドジョウツナギ		———✓✓No———008480/2 (0.0%)134/8485 (1.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Nypa fruticans
ニッパヤシ		LC✓✓✓✓No———00190/1 (0.0%)8/2170 (0.4%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema aprile
オドリコテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema cucullatum
ホロテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema heterocephalum subsp. majus
オオアマミテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema heterocephalum subsp. okinawense
オキナワテンナンショウ		—————No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema inaense
イナヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema ishizuchiense subsp. ishizuchiense
イシヅチテンナンショウ		———✓—No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema kawashimae
トクノシマテンナンショウ		CR✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema kuratae
アマギテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema longipedunculatum var. yakumontanum
ヤクシマヒロハテンナンショウ		———✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema minamitanii
ヒュウガヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema nagiense
ナギヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema ogatae
オガタテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arisaema seppikoense
セッピコテンナンショウ		—✓✓✓✓No———00220/147 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pothos chinensis
ユズノハカズラ		—✓✓✓✓No———00220/8 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhaphidophora kortharthii
サキシマハブカズラ		—————No———00220/46 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Rhaphidophora liukiuensis
ヒメハブカズラ		——✓✓✓No———00220/46 (0.0%)10/1749 (0.6%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pandanus daitoensis
ホソミアダン		——✓✓✓No———0000/183 (0.0%)0/277 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex aequialta
トダスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex arisanensis
アリサンタマツリスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex collifera
リュウキュウヒエスゲ		CR——✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex disperma
ホソスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex filipes var. kuzakaiensis
オクタマツリスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex globularis
トナカイスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex hoozanensis
ホウザンスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex kabanovii
ヤリスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex kagoshimensis
セトウチスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex laevissima
ヒメミコシガヤ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex lehmannii
センジョウスゲ		—✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex longistipes
タイワンカンスゲ		———✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex omiana var. yakushimana
チャボカワズスゲ		———✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex planiculmis var. urasawae
チチブシラスゲ		———✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex rhynchachaenium
トックリスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex rostrata var. borealis
ヌマスゲ		—✓—✓✓No———2223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex rotundata
コヌマスゲ		LC✓✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex scita var. parvisquama
ダイセンアシボソスゲ		———✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Carex yasuii
ムニンヒョウタンスゲ		——✓✓✓No———0223614/1628 (0.9%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyperus digitatus
オオホウキガヤツリ		LC✓✓✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyperus distans
ホウキガヤツリ		LC✓✓✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyperus niigatensis
ニイガタガヤツリ		———✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyperus nutans var. subprolixus
ヒメホウキガヤツリ		——✓✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyperus unioloides
ムギガラガヤツリ		LC✓✓✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eleocharis atropurpurea
クロミノハリイ		LC✓✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eleocharis retroflexa subsp. chaetaria
カヤツリマツバイ		—✓✓✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eleocharis tetraquetra var. tsurumachii
カドハリイ		———✓✓No———03362/180 (1.1%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eriophorum scheuchzeri var. tenuifolium
エゾワタスゲ		———✓✓No———00360/15 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Fimbristylis fimbristyloides
トモエバテンツキ		——✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Fimbristylis kadzusana
イッスンテンツキ		——✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Fimbristylis nutans
ウナヅキテンツキ		LC✓✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Isolepis crassiuscula
ビャッコイ		—✓✓✓✓No———00360/67 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Remirea maritima
コウシュンスゲ		—✓✓✓✓No———01361/355 (0.3%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Schoenus calostachyus
イヘヤヒゲクサ		—✓✓✓✓No———00360/134 (0.0%)25/3487 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acanthephippium pictum
エンレイショウキラン		———✓—No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acanthephippium sylhetense
タイワンショウキラン		—✓✓✓✓No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Androcorys pusillus
ミスズラン		—✓✓✓✓No———00280/51 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Anoectochilus formosanus
キバナシュスラン		—✓✓✓✓No———00280/39 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Anoectochilus koshunensis
コウシュンシュスラン		DD✓✓✓✓No———00280/39 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Bulbophyllum affine
クスクスラン		—✓✓✓✓No———00280/695 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Bulbophyllum macraei var. tanegashimense
タネガシマシコウラン		—————No———00280/695 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe alpina var. schlechteri
キソエビネ		———✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe amamiana
アマミエビネ		———✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe davidii
タガネラン		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe densiflora
タマザキエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe hoshii
ホシツルラン		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calanthe mannii
サクラジマエビネ		—✓✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cheirostylis takeoi
アリサンムヨウラン		—✓✓✓✓No———00280/18 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cremastra aphylla
モイワラン		—✓✓✓✓No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Crepidium purpureum
オキナワヒメラン		—✓✓✓✓No———00280/28 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cryptostylis arachnites
オオスズムシラン		—✓✓✓✓No———00280/6 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cryptostylis taiwaniana
タカオオオスズムシラン		——✓✓✓No———00280/6 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cymbidium dayanum var. leachianum
ヘツカラン		———✓—No———01281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cymbidium ensifolium
スルガラン		—✓✓✓✓No———01281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cymbidium koran
コラン		———✓✓No———01281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cymbidium sinense
ホウサイラン		—✓✓✓✓Yes (1)Chromosome,
Representative		3.53 Gbp
121.0x		8,496
1.11 Mbp		11281/110 (0.9%)22/11545 (0.2%)2022-01-12
CR
絶滅危惧IA類		Cypripedium guttatum
チョウセンキバナアツモリソウ		LC✓✓✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cypripedium macranthos var. macranthos
ホテイアツモリ		—✓———No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cypripedium shanxiense
ドウトウアツモリソウ		NT✓✓✓✓No———00280/62 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Didymoplexiella siamensis
コカゲラン		——✓✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Dienia ophrydis
ホザキヒメラン		—✓✓✓✓No———00280/6 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diploprora championii
サガリラン		—✓✓✓✓No———00280/2 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Disperis neilgherrensis
ジョウロウラン		—✓✓✓✓No———00280/32 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Epipogium japonicum
アオキラン		——✓✓✓No———00280/2 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Erythrodes blumei
ホソフデラン		LC✓✓✓✓No———00280/8 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Erythrorchis altissima
タカツルラン		LC✓✓✓✓No———00280/2 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eulophia taiwanensis
タカサゴヤガラ		EN—✓✓✓No———00280/76 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gastrochilus ciliaris
マツゲカヤラン		—✓✓✓✓No———00280/59 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gastrodia albida
ヤクシマヤツシロラン		——✓✓✓No———02281/25 (4.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gastrodia elata var. pallens
シロテンマ		———✓✓No———22281/25 (4.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Gastrodia shimizuana
ナンゴクヤツシロラン		—✓✓✓✓No———02281/25 (4.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Goodyera fumata
ヤブミョウガラン		—✓✓✓✓No———00280/61 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hancockia uniflora
ヒメクリソラン		—✓✓✓✓No———00280/1 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Herminium monorchis
クシロチドリ		—✓✓✓✓No———00280/51 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hetaeria oblongifolia
オオカゲロウラン		—✓✓✓✓No———00280/10 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Heterozeuxine nervosa
オオキヌラン		———✓✓No———00000—
CR
絶滅危惧IA類		Lecanorchis flavicans var. flavicans
サキシマスケロクラン		—✓———No———00280/15 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lecanorchis japonica var. tubiformis
ヤエヤマスケロクラン		———✓✓No———00280/15 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lecanorchis nigricans var. yakusimensis
ヤクムヨウラン		—✓—✓✓No———00280/15 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lecanorchis trachycaula
アワムヨウラン		—✓—✓✓No———00280/15 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lecanorchis virella
ミドリムヨウラン		—✓✓✓✓No———00280/15 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Liparis hostifolia
シマクモキリソウ		—✓✓✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Liparis nigra var. sootenzanensis
キバナコクラン		———✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Liparis nikkoensis
ヒメスズムシソウ		———✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Liparis truncata
クモイジガバチ		—✓—✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Liparis viridiflora
コゴメキノエラン		—✓✓✓✓No———00280/140 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Macodes petola
ナンバンカモメラン		—✓✓✓✓No———00280/4 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Malaxis boninensis
シマホザキラン		—✓—✓✓No———00280/38 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Myrmechis tsukusiana
ツクシアリドオシラン		———✓✓No———00280/5 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Neottia furusei
カイサカネラン		——✓✓✓No———00280/41 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oberonia makinoi
オオバヨウラクラン		—✓—✓✓No———00280/64 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Odontochilus hatusimanus
ハツシマラン		—✓✓✓✓No———00280/13 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Orchis graminifolia var. kurokamiana
クロカミラン		———✓✓No———00280/30 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Orchis graminifolia var. suzukiana
アワチドリ		———✓✓No———00280/30 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oreorchis itoana
コハクラン		———✓✓No———00280/11 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Peristylus calcaratus
ヒゲナガトンボ		—✓✓✓✓No———00280/29 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Peristylus lacertifer
タコガタサギソウ		—✓✓✓✓No———00280/29 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Phaius mishmensis
ヒメカクラン		—✓✓✓✓No———00280/21 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platanthera hondoensis
オオバナオオヤマサギソウ		——✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platanthera mandarinorum subsp. hachijoensis var. masamunei
ヤクシマトンボ		———✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platanthera okuboi
ハチジョウツレサギ		——✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platanthera sonoharae
クニガミトンボソウ		——✓✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Platanthera stenoglossa subsp. hottae
ソハヤキトンボソウ		———✓✓No———02282/117 (1.7%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pristiglottis rubricentra
ヒメシラヒゲラン		—————No———00280/3 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thrixspermum fantasticum
ハガクレナガミラン		—✓✓✓✓No———00280/52 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thrixspermum saruwatarii
ケイタオフウラン		—✓✓✓✓No———00280/52 (0.0%)22/11545 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium carolinianum
イヌヤチスギラン		—✓✓✓✓No———0010/3 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium fargesii
ヒモスギラン		—✓✓✓✓No———0010/190 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium laxum
ボウカズラ		———✓✓No———0010/12 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium salvinioides
ヒメヨウラクヒバ		———✓✓No———0010/12 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium sieboldii var. christensenianum
リュウキュウヒモラン		—✓———No———0010/190 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lycopodium somae
コスギトウゲシバ		—✓✓✓✓No———0010/67 (0.0%)1/328 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Equisetum variegatum
チシマヒメドクサ		—✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/36 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Botrychium lanceolatum
ミヤマハナワラビ		—✓✓✓✓No———0000/66 (0.0%)0/142 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Botrychium microphyllum
イブリハナワラビ		—✓—✓✓No———0000/66 (0.0%)0/142 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Angiopteris fokiensis
ヒノタニリュウビンタイ		—✓✓✓✓No———0000/38 (0.0%)0/153 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Callistopteris apiifolia
キクモバホラゴケ		—✓✓✓✓No———0000/2 (0.0%)0/417 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cephalomanes atrovirens
サキシマホラゴケ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/417 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Didymoglossum bimarginatum
マルバコケシダ		—✓✓✓✓No———0000/35 (0.0%)0/417 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Plagiogyria stenoptera
シマヤマソテツ		—✓✓✓✓No———0000/16 (0.0%)0/16 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lindsaea ensifolia
イヌイノモトソウ		—✓✓✓✓No———0000/149 (0.0%)0/195 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lindsaea kawabatae
シノブホングウシダ		—✓✓✓✓No———0000/149 (0.0%)0/195 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Odontosoria minutula
コビトホラシノブ		CR✓✓✓✓No———0000/23 (0.0%)0/195 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Odontosoria yaeyamensis
ヤエヤマホラシノブ		——✓✓✓No———0000/23 (0.0%)0/195 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Antrophyum formosanum
シマタキミシダ		—✓✓✓✓No———0050/38 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Coniogramme gracilis
ホソバイワガネソウ		—✓✓✓✓No———0050/27 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Haplopteris forrestiana
オオバシシラン		—✓—✓✓No———0050/46 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Haplopteris mediosora
イトシシラン		—✓✓✓✓No———0050/46 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pteris formosana
タイワンアマクサシダ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pteris grevilleana
アシガタシダ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pteris kawabatae
カワバタハチジョウシダ		—✓✓✓✓No———0050/253 (0.0%)3/1172 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Microlepia obtusiloba var. angustata
ホソバコウシュンシダ		—✓—✓✓No———0000/42 (0.0%)0/167 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Acystopteris tenuisecta
ホウライウスヒメワラビ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/35 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asplenium castaneoviride
ヤマドリトラノオ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asplenium ensiforme
ホコガタシダ		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Asplenium griffithianum
フササジラン		—✓✓✓✓No———0000/429 (0.0%)0/472 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hymenasplenium cardiophyllum
ヒメタニワタリ		—✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/472 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hymenasplenium subnormale
ウスイロホウビシダ		—✓✓✓✓No———0000/41 (0.0%)0/472 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Woodsia subcordata
キタダケデンダ		—✓✓✓✓No———0000/25 (0.0%)0/41 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium arisanense
タイワンアリサンイヌワラビ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium kenzo-satakei
シビイヌワラビ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium masamunei
ヤクイヌワラビ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium neglectum subsp. australe
シイバサトメシダ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium otophorum var. okanum
ヤマグチタニイヌワラビ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium silvicola
タカサゴイヌワラビ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium spinescens
トゲヤマイヌワラビ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium tozanense
シマイヌワラビ		—✓—✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Athyrium yakusimense
ヤクシマタニイヌワラビ		—✓✓✓✓No———0000/116 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deparia formosana
ジャコウシダ		—✓✓✓✓No———0000/70 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deparia minamitanii
ヒュウガシケシダ		—✓—✓✓No———0000/70 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplazium kawakamii
アオイガワラビ		—✓✓✓✓No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplazium megaphyllum
ムシャシダ		—✓✓✓✓No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplazium pin-faense
フクレギシダ		—✓✓——No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Diplazium subtripinnatum
ムニンミドリシダ		—✓✓✓✓No———0000/172 (0.0%)0/366 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thelypteris erubescens
タイヨウシダ		—✓✓✓✓No———0000/3 (0.0%)0/617 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thelypteris gracilescens
シマヤワラシダ		—✓✓✓✓No———0000/10 (0.0%)0/617 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Hypodematium fordii
リュウキュウキンモウワラビ		—✓✓✓✓No———0000/27 (0.0%)0/30 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arachniodes cantilenae
イツキカナワラビ		—✓—✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arachniodes chinensis
ツルダカナワラビ		—✓✓✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arachniodes hiugana
ヒュウガカナワラビ		—✓✓✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arachniodes oohorae
アタシカカナワラビ		—✓—✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arachniodes simulans
ヒゴカナワラビ		—✓✓✓✓No———0030/100 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Cyrtomium macrophyllum var. microindusium
クマヤブソテツ		—✓—✓✓No———0030/21 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris anadroma (in schedule)
ムカシベニシダ		—✓—✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris anthracinisquama
クマイワヘゴ		—✓—✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris ebinoensis
エビノオオクジャク		—✓———No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris gymnosora var. angustata
ホソバヌカイタチシダ		———✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris hangchowensis
キリシマイワヘゴ		—✓✓✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris labordei var. purpurascens
ムラサキベニシダ		—✓—✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris lunanensis
オオミネイワヘゴ		—✓✓✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris tsugiwoi
マルバヌカイタチシダモドキ		—✓✓✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris tsutsuiana
ツツイイワヘゴ		—✓—✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Dryopteris wallichiana
オオヤグルマシダ		—✓✓✓✓No———0131/355 (0.3%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Elaphoglossum callifolium
オキナワアツイタ		—✓✓✓✓No———0030/247 (0.0%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum fibrillosopaleaceum var. marginale
スルガイノデ		—✓—✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum grandifrons
キュウシュウイノデ		—✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum lachenense
タカネシダ		—✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum obae
アマミデンダ		CR✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum piceopaleaceum
サクラジマイノデ		—✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Polystichum shimurae
シムライノデ		—✓✓✓✓No———0131/241 (0.4%)3/1310 (0.2%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lomariopsis spectabilis
ツルキジノオ		—✓✓✓✓No———0000/66 (0.0%)0/72 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Arthropteris palisotii
ワラビツナギ		—✓✓✓✓No———0000/14 (0.0%)0/198 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tectaria fauriei
コモチナナバケシダ		—✓✓✓✓No———0000/156 (0.0%)0/198 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Tectaria kusukusensis
ナガバウスバシダ		—✓✓✓✓No———0000/156 (0.0%)0/198 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Aglaomorpha coronans
カザリシダ		—✓—✓✓No———0000/28 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Drynaria roosii
ハカマウラボシ		—✓✓✓✓No———0000/28 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Goniophlebium amamianum
アマミアオネカズラ		——✓✓✓No———0000/15 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lemmaphyllum pyriforme
オニマメヅタ		—✓—✓✓No———0000/9 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Lepisorus oligolepidus
ウロコノキシノブ		—✓✓✓✓No———0000/81 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Leptochilus decurrens
オキノクリハラン		LC✓✓✓✓No———0000/74 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Oreogrammitis nipponica
ヒロハヒメウラボシ		——✓✓✓No———0000/78 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pyrrosia adnascens
ヒトツバマメヅタ		—✓✓✓✓No———0000/74 (0.0%)0/1263 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Pyrrosia linearifolia var. heterolepis
タイワンビロードシダ		—✓—✓✓No———0000/74 (0.0%)0/1263 (0.0%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Flavopunctelia flaventior (Stirt.) Hale
ハクテンヒメキウメノキゴケ		—✓✓✓✓No———00160/6 (0.0%)11/1662 (0.7%)—
CR
絶滅危惧IA類		Ramalina yokotae Kashiw. & K.H.Moon
ヨコタカラタチゴケ		———✓✓No———0363/168 (1.8%)6/619 (1.0%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Heteroconger polyzona
ゼブラアナゴ		LC✓✓✓✓No———0030/6 (0.0%)1/295 (0.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Thryssa baelama
オオイワシ		LC✓✓✓✓Yes (1)Scaffold,
Representative		884 Mbp
60.0x		617,217
2.34 kbp		1171/33 (3.0%)6/237 (2.5%)2024-08-05
CR
絶滅危惧IA類		Plectropomus areolatus
オオアオノメアラ		VU✓✓✓✓No———03261/9 (11.1%)21/681 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Epinephelus lanceolatus
タマカイ		DD✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		1.09 Gbp
133.0x		22,225
160 kbp		210268/133 (6.0%)21/681 (3.1%)2019-05-13
CR
絶滅危惧IA類		Epinephelus tukula
カスリハタ		LC✓✓✓✓No———010268/133 (6.0%)21/681 (3.1%)—
CR
絶滅危惧IA類		Chromileptes altivelis
サラサハタ		—✓✓✓✓Yes (2)Chromosome,
Representative		1.01 Gbp
114.3x		283
18.3 Mbp		22261/1 (100.0%)21/681 (3.1%)2020-05-21
CR
絶滅危惧IA類		Eleutherochir opercularis
オオクチヌメリ		—✓✓✓✓No———0050/2 (0.0%)3/129 (2.3%)—
CR
絶滅危惧IA類		Eleutherochir mccaddeni
クシヒゲヌメリ		—✓—✓—No———0050/2 (0.0%)3/129 (2.3%)—

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Octolasmis unguisiformis
メナガオサガニハサミエボシ		—✓—✓—No———0000/10 (0.0%)0/27 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Halosbaena daitoensis
ダイトウコオイエビ		—✓—✓✓No———0000/8 (0.0%)0/8 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Alpheus hoplocheles
フタツトゲテッポウエビ		—✓✓✓✓No———0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Calliasmata pholidota
イラウモエビ		—✓✓✓—No———0000/2 (0.0%)0/10 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Catoptrus iejima
イエジマガマガザミ		———✓✓No———0090/3 (0.0%)4/524 (0.8%)—
CR
絶滅危惧IA類		Neoeriocheir leptognathus
ヒメモクズガニ		—✓✓✓✓No———0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)—
CR
絶滅危惧IA類		Deiratonotus kaoriae
クマノエミオスジガニ		—✓—✓✓No———0000/3 (0.0%)0/12 (0.0%)—
CR
絶滅危惧IA類		Paraleptuca boninensis
オガサワラベニシオマネキ		—✓✓✓✓No———0000/4 (0.0%)0/120 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
CR
絶滅危惧IA類		Lingula adamsi
オオシャミセンガイ		—✓✓✓✓No———0111/19 (5.3%)1/41 (2.4%)—