Genome sequence data availability
for the Japanese Red Lists

Updated on 2024-10-01

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Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List
Taxon Name
分類群の和名
Status
in the
IUCN
Red
List
Taxonomy
entry
Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)
Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数
Number of species
with sequenced genomes
Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category
Genome
length,
coverage
Number
of
contigs,
contig
N50
Species
Genus
Family
Genus
Family
CR
絶滅危惧IA類
Octolasmis unguisiformis
メナガオサガニハサミエボシ
No0000/10 (0.0%)0/27 (0.0%)
CR
絶滅危惧IA類
Halosbaena daitoensis
ダイトウコオイエビ
No0000/9 (0.0%)0/9 (0.0%)
CR
絶滅危惧IA類
Alpheus hoplocheles
フタツトゲテッポウエビ
No0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)
CR
絶滅危惧IA類
Calliasmata pholidota
イラウモエビ
No0000/2 (0.0%)0/10 (0.0%)
CR
絶滅危惧IA類
Catoptrus iejima
イエジマガマガザミ
No0090/3 (0.0%)4/525 (0.8%)
CR
絶滅危惧IA類
Neoeriocheir leptognathus
ヒメモクズガニ
No0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)
CR
絶滅危惧IA類
Deiratonotus kaoriae
クマノエミオスジガニ
No0000/3 (0.0%)0/12 (0.0%)
CR
絶滅危惧IA類
Paraleptuca boninensis
オガサワラベニシオマネキ
No0000/4 (0.0%)0/120 (0.0%)
EN
絶滅危惧IB類
Parabrachiella brevicapita
フタコブナガクビムシ
No0000/14 (0.0%)0/72 (0.0%)
EN
絶滅危惧IB類
Phyllodurus sp.
アナジャコノハラヤドリ
No0000/1 (0.0%)0/55 (0.0%)
EN
絶滅危惧IB類
Progebiophilus villosus
和名なし
No0000/2 (0.0%)0/55 (0.0%)
EN
絶滅危惧IB類
Atyidae gen. sp.
ウミヌマエビ
No0333/507 (0.6%)3/507 (0.6%)
EN
絶滅危惧IB類
Upogebia carinicauda
ミナミアナジャコ
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
EN
絶滅危惧IB類
Novorostrumdecorocrus
イボテカニダマシ
No00000
EN
絶滅危惧IB類
Polyonyx utinomii
ウチノミカニダマシ
No0020/4 (0.0%)2/232 (0.9%)
EN
絶滅危惧IB類
Atoportunus dolichopus
クメジマドウクツガザミ
No0090/1 (0.0%)4/525 (0.8%)
EN
絶滅危惧IB類
Sestrostoma sp.
シタゴコロガニ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
EN
絶滅危惧IB類
Tritodynamia rathbuni
オオヨコナガピンノ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
EN
絶滅危惧IB類
Pinnixa banzu
バンズマメガニ
No0000/29 (0.0%)0/172 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Alpheus fujitai
フジタアシボソテッポウエビ
No0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Upogebia sakaii
コブシアナジャコ
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Lissoporcellana flagellicola
ムチヤギカクレカニダマシ
No00000
VU
絶滅危惧II類
Neoliomera cerasinus
クラヤミヒラオウギガニ
No0000/6 (0.0%)0/606 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Clistocoeloma sinense
ウモレベンケイガニ
No0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Pseudopinnixa carinata
ウモレマメガニ
No0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)
VU
絶滅危惧II類
Sestrostoma balssi
オオヒメアカイソガニ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
VU
絶滅危惧II類
Cleistostoma dilatatum
アリアケガニ
No0000/1 (0.0%)0/12 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Pinnixa balanoglossana
ギボシマメガニ
No0000/29 (0.0%)0/172 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Pinnotheres bidentatus
フタハピンノ
No0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)
VU
絶滅危惧II類
Pinnotheres cyclinus
マルピンノ
No0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Sacculina upogebiae
アナジャコフクロムシ
No0331/32 (3.1%)1/58 (1.7%)
NT
準絶滅危惧
Amphibalanus reticulatus
サラサフジツボ
No03101/19 (5.3%)6/406 (1.5%)
NT
準絶滅危惧
Eudactylinamusteli
和名なし
No00000
NT
準絶滅危惧
Eudactylina squatini
和名なし
No0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Kroyeria elongata
和名なし
No0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Kroyeria sublineata
和名なし
No0000/6 (0.0%)0/7 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Lernaeopoda oviformis
ダンゴナガクビムシ
No0000/12 (0.0%)0/72 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Driocephalus cerebrinoxius
サメノハナヤドリ
No00000
NT
準絶滅危惧
Trebius shiinoi
和名なし
No00000
NT
準絶滅危惧
Procepon insolitum
アナジャコヤドリムシ
No00000
NT
準絶滅危惧
pogebione bidigitatus
和名なしU
No00000
NT
準絶滅危惧
Parapenaeopsis cornuta
チクゴエビ
No00160/10 (0.0%)5/232 (2.2%)
NT
準絶滅危惧
Alpheus dolichodactylus
ハシボソテッポウエビ
No0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Alpheus sp.
マングローブテッポウエビ
No0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Stenalpheus anacanthus
クボミテッポウエビ
No00000
NT
準絶滅危惧
Merguia oligodon
キノボリエビ
No0000/2 (0.0%)0/376 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Polyonyx sinensis
ヤドリカニダマシ
No0020/4 (0.0%)2/232 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Pagurus nigrofascia
ヨモギホンヤドカリ
No0444/106 (3.8%)4/268 (1.5%)
NT
準絶滅危惧
Mariaplax chenae
ヒメムツアシガニ
No00000
NT
準絶滅危惧
Atoportunus gustavi
モモイロドウクツガザミ
No0090/1 (0.0%)4/525 (0.8%)
NT
準絶滅危惧
Clistocoeloma villosum
フジテガニ
No0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Parasesarma affine
クシテガニ
No0000/56 (0.0%)0/273 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Parasesarma tripectinis
ユビアカベンケイガニ
No0000/56 (0.0%)0/273 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Sesarmops intermedium
ベンケイガニ
No0000/6 (0.0%)0/273 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Asthenognathus inaequipes
ヨコナガモドキ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Chasmagnathus convexus
ハマガニ
No0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Helicana japonica
ヒメアシハラガニ
No0050/3 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Hemigrapsus sinensis
ヒメケフサイソガニ
No0050/13 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Pseudohelice subquadrata
ミナミアシハラガニ
No0050/4 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Ptychognathus altimanus
アゴヒロカワガニ
No0050/23 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Ptychognathus capillidigitatus
ヒメヒライソモドキ
No0050/23 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Ptychognathus ishii
タイワンヒライソモドキ
No0050/23 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Sestrostoma toriumii
トリウミアカイソモドキ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Thalassograpsus harpax
ミナミヒライソモドキ
No0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)
NT
準絶滅危惧
Camptandriumsexdentatum
ムツハアリアケガニ
No0000/1 (0.0%)0/12 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Chaenostoma crassimanus
ヒメカクオサガニ
No0000/2 (0.0%)0
NT
準絶滅危惧
Macrophthalmus abbreviatus
オサガニ
No0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Macrophthalmus banzai
ヒメヤマトオサガニ
No0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Macrophthalmus holthuisi
ホルトハウスオサガニ
No0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Austruca triangularis
シモフリシオマネキ
No0000/13 (0.0%)0/120 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Tubuca coarctata
リュウキュウシオマネキ
No0000/20 (0.0%)0/120 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Pinnixa haematosticta
アカホシマメガニ
No0000/3 (0.0%)0/172 (0.0%)
NT
準絶滅危惧
Xenophthalmus pinnotheroides
メナシピンノ
No0000/1 (0.0%)0/2 (0.0%)
DD
情報不足
Sandersiella acuminata
カシラエビ
No00000
DD
情報不足
Ommatogaster nana
和名なし
No0000/1 (0.0%)0/33 (0.0%)
DD
情報不足
Peltogasterella sensuru
和名なし
No0000/4 (0.0%)0/33 (0.0%)
DD
情報不足
Polyascus gregaria
モクズガニフクロムシ
No0030/11 (0.0%)1/58 (1.7%)
DD
情報不足
Polyascus polygenea
イソガニフクロムシ
No0030/11 (0.0%)1/58 (1.7%)
DD
情報不足
Cryptolepas rhachianecti
ハイザラフジツボ
No0000/1 (0.0%)0/18 (0.0%)
DD
情報不足
Goidelia japonica
和名なし
No00000
DD
情報不足
Splanchnotrophus imagawai
ウズヒマワリウミウシヤドリ
No0000/2 (0.0%)0/12 (0.0%)
DD
情報不足
Eudactylina gymnuri
和名なし
No0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)
DD
情報不足
Eudactylina taeniuri
和名なし
No0000/1 (0.0%)0/10 (0.0%)
DD
情報不足
Mihbaicola sakamakii
カクレエラノミ
No00000
DD
情報不足
Pseudocharopinus pteroplateae
ツバクロエイナガクビムシ
No0000/4 (0.0%)0/72 (0.0%)
DD
情報不足
Dinemoleus indeprensus
メガマウスザメジラミ
No00000
DD
情報不足
Echthrogaleusmitsukurinae
和名なし
No00000
DD
情報不足
Cardiodectes shini
シンノカンザシ
No0000/1 (0.0%)0/96 (0.0%)
DD
情報不足
Nagasawanus snufkini
シンノワキザシ
No00000
DD
情報不足
Trebius longicaudatus
和名なし
No00000
DD
情報不足
Thetispelecaris kumejimensis
和名なし
No0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)
DD
情報不足
Aoroidesmyojinensis
ミョウジンブラブラソコエビ
No00000
DD
情報不足
Grandidierella osakaensis
オオサカドロソコエビ
No0000/11 (0.0%)0/65 (0.0%)
DD
情報不足
Grandidierella sp.
サンリクドロソコエビ
No0000/11 (0.0%)0/65 (0.0%)
DD
情報不足
Heterokamaka isahayae
イサハヤカマカモドキ
No00000
DD
情報不足
Mucrocalliope shimantoensis
シマントヨコエビ
No00000
DD
情報不足
Gnathia limicola
ドロホリウミクワガタ
No0000/66 (0.0%)0/77 (0.0%)
DD
情報不足
Lipomera sp.
ドウクツヒレオミズムシ
No0020/4 (0.0%)2/478 (0.4%)
DD
情報不足
Pseudione compressa
和名なし
No0000/7 (0.0%)0/55 (0.0%)
DD
情報不足
Crinoniscus sp.
Crinoniscus 属の一種
No00000
DD
情報不足
Littorophiloscia nipponensis
ニッポンヒイロワラジムシ
No0000/7 (0.0%)0/78 (0.0%)
DD
情報不足
Armadilloniscus japonicus
ニホンハマワラジムシ
No0000/2 (0.0%)0/82 (0.0%)
DD
情報不足
Sicyonella antennata
イソサクラエビ
No0000/3 (0.0%)0/61 (0.0%)
DD
情報不足
Sicyonella inermis
和名なし
No0000/3 (0.0%)0/61 (0.0%)
DD
情報不足
Sicyonellamaldivensis
和名なし
No00000
DD
情報不足
Odontozona fasciata
アカオビスベスベオトヒメエビ
No0000/9 (0.0%)0/23 (0.0%)
DD
情報不足
Stenopus pyrsonotus
クメジマオトヒメエビ
No0000/8 (0.0%)0/23 (0.0%)
DD
情報不足
Bresilia gibbosa
マンザセキヨウエビ
No0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)
DD
情報不足
Bresilia rufioculus
メヒカリセキヨウエビ
No0000/2 (0.0%)0/3 (0.0%)
DD
情報不足
Neostylodactylus liroralis
オリヅルエビ
No0000/1 (0.0%)0/13 (0.0%)
DD
情報不足
Phyllognathia ceratophthalma
トゲツノメエビ
No0060/1 (0.0%)3/1019 (0.3%)
DD
情報不足
Phyllognathia simplex
サガミツノメエビ
No0060/1 (0.0%)3/1019 (0.3%)
DD
情報不足
Alpheus ikedosoma
ユメユムシテッポウエビ
No0000/317 (0.0%)0/893 (0.0%)
DD
情報不足
Betaeus gelasinifer
エクボテッポウエビモドキ
No0000/14 (0.0%)0/893 (0.0%)
DD
情報不足
Richalpheus palmeri
和名なし
No0000/2 (0.0%)0/893 (0.0%)
DD
情報不足
Salmoneus brucei
和名なし
No0000/25 (0.0%)0/893 (0.0%)
DD
情報不足
Barbouriidae gen. sp.
ガマモエビ
No0000/10 (0.0%)0/10 (0.0%)
DD
情報不足
Lysmata lipkei
和名なし
No0000/56 (0.0%)0/376 (0.0%)
DD
情報不足
Pandalopsis pacifica
ミツクリエビ
No0222/29 (6.9%)2/139 (1.4%)
DD
情報不足
Enoplometopus chacei
クミショウグンエビ
DDNo0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)
DD
情報不足
Enoplometopus occidentalis
ショウグンエビ
LCNo0000/12 (0.0%)0/12 (0.0%)
DD
情報不足
Corallianassa borradailei
モバホソスナモグリ
No0000/10 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Corallianassamartensi
ホソスナモグリ
No0000/10 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Glypturus armatus
トゲスナモグリ
No0000/6 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Lepidophthalmus rosae
和名なし
No0000/16 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Neocallichirus calmani
和名なし
No0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Neocallichirus vaugelasi
和名なし
No0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Neocallichirus vigilax
ノコバスナモグリ
No0000/17 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Paratrypaea bouvieri
ブビエスナモグリ
No0000/4 (0.0%)0/173 (0.0%)
DD
情報不足
Naushonia carinata
和名なし
No0000/7 (0.0%)0/11 (0.0%)
DD
情報不足
Naushonia lactoalbida
和名なし
No0000/7 (0.0%)0/11 (0.0%)
DD
情報不足
Upogebia iriomotensis
和名なし
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
DD
情報不足
Upogebiamiyakei
和名なし
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
DD
情報不足
Upogebia rupicola
イワホリアナジャコ
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
DD
情報不足
Upogebia snelliusi
ナンヨウトゲアナジャコ
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
DD
情報不足
Upogebia spinidactylus
和名なし
No0000/26 (0.0%)0/39 (0.0%)
DD
情報不足
Justitia longimanus
カギテリョウマエビ
DDNo00150/1 (0.0%)13/64 (20.3%)
DD
情報不足
Neopetrolisthes spinatus
ムシャカニダマシ
No0020/1 (0.0%)2/232 (0.9%)
DD
情報不足
Petrolisthes bifidus
ドロイワカニダマシ
No0222/62 (3.2%)2/232 (0.9%)
DD
情報不足
Aniculus sibogae
クロシマオニヤドカリ
No0000/4 (0.0%)0/322 (0.0%)
DD
情報不足
Clibanarius ambonensis
ヒルギノボリヨコバサミ
No0000/45 (0.0%)0/322 (0.0%)
DD
情報不足
Diogenes nitidimanus
テナガツノヤドカリ
No0000/54 (0.0%)0/322 (0.0%)
DD
情報不足
Catapaguroides longior
マンザガマヒメヤドカリ
No0040/1 (0.0%)4/268 (1.5%)
DD
情報不足
Kumepagurus cavernicolus
クメジマドウクツヤドカリ
No00000
DD
情報不足
Pagurus angustus
キカイホンヤドカリ
No0444/106 (3.8%)4/268 (1.5%)
DD
情報不足
Calappa clypeata
ヒメカラッパ
No0000/33 (0.0%)0/61 (0.0%)
DD
情報不足
Calappa quadrimaculata
ヨツモンカラッパ
No0000/33 (0.0%)0/61 (0.0%)
DD
情報不足
Notonyx kumi
リュウキュウカクエンコウガニ
No0000/1 (0.0%)0/16 (0.0%)
DD
情報不足
Hexapinus simplex
ヤドリムツアシガニ
No0000/1 (0.0%)0/1 (0.0%)
DD
情報不足
Arcania novemspinosa
ニシヒラトゲコブシ
No0000/13 (0.0%)0/95 (0.0%)
DD
情報不足
Philyra nishihirai
マンガルマメコブシガニ
No00000
DD
情報不足
Scylla olivacea
アカテノコギリガザミ
No0291/21 (4.8%)4/525 (0.8%)
DD
情報不足
Geograpsus stormi
アカカクレイワガニ
No0000/4 (0.0%)0/52 (0.0%)
DD
情報不足
Pachygrapsus fakaravensis
ヨコスジイワガニ
No0000/13 (0.0%)0/52 (0.0%)
DD
情報不足
Chiromantes leptomerus
ハワイベンケイガニ
No0000/5 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Neosarmatiumfourmanoiri
オオアシハラガニモドキ
No0000/14 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Neosarmatiumlaeve
ヒナアシハラモドキ
No00000
DD
情報不足
Neosarmatiummeinerti
シロテアシハラガニモドキ
No0000/14 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Sarmatiumgermaini
ギザテアシハラガニ
No0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Sesarmoides kraussi
アシナガベンケイガニ
No0000/3 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Stelgistra stormi
スマトライワベンケイガニ
No0000/1 (0.0%)0/273 (0.0%)
DD
情報不足
Cyclograpsus pumilio
マメアカイソガニ
No0050/7 (0.0%)1/116 (0.9%)
DD
情報不足
Scutumara enodis
オキナワヒライソモドキ
No00000
DD
情報不足
Sestrostoma depressum
ヒメアカイソモドキ
No0050/2 (0.0%)1/116 (0.9%)
DD
情報不足
Mortensenella forceps
ハサミカクレガニ
No00000
DD
情報不足
Takedellus ambonense
ミナミムツバアリアケガニ
No00000
DD
情報不足
Macrophthalmus barnesi
ヒメノコハオサガニ
No0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)
DD
情報不足
Macrophthalmus quadratus
ナカグスクオサガニ
No0000/32 (0.0%)0/43 (0.0%)
DD
情報不足
Uruma ourana
オオウラコユビピンノ
No00000
DD
情報不足
Nepinnotheres cardii
カワラピンノ
No0000/8 (0.0%)0/172 (0.0%)
DD
情報不足
Pinnixa sp.
ホンコンマメガニ
No0000/29 (0.0%)0/172 (0.0%)
LP
絶滅のおそれの
ある地域個体群
Acmaeopleura parvula
小笠原諸島のヒメアカイソガニ
No0050/1 (0.0%)1/116 (0.9%)
LP
絶滅のおそれの
ある地域個体群
Ptychognathus barbatus
八丈島のケフサヒライソモドキ
No0050/23 (0.0%)1/116 (0.9%)