Genome sequence data availability
for the Japanese Red List

Updated on 2025-07-01

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Mammals
哺乳類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crocidura orii
オリイジネズミ		EN✓✓✓✓—/——/—No———02142/287 (0.7%)9/516 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mogera etigo
エチゴモグラ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0090/10 (0.0%)8/106 (7.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteropus pselaphon
オガサワラオオコウモリ		EN✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.93 Gbp
119		16,738
395 kbp		15174/59 (6.8%)13/186 (7.0%)2020-08-23
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhinolophus cornutus orii
オリイコキクガシラコウモリ		———✓✓—/——/—No———019198/169 (4.7%)8/173 (4.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhinolophus pumilus pumilus
オキナワコキクガシラコウモリ		——————/——/—No———019198/169 (4.7%)8/173 (4.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Murina ryukyuana
リュウキュウテングコウモリ		EN✓✓✓✓—/——/—No———01571/74 (1.4%)32/893 (3.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nyctalus furvus
コヤマコウモリ		EN—✓✓✓—/——/—No———03572/7 (28.6%)32/893 (3.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Miniopterus fuscus
リュウキュウユビナガコウモリ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0442/73 (2.7%)2/73 (2.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diplothrix legata
ケナガネズミ		EN✓✓✓✓—/——/✓No———001520/1 (0.0%)38/1186 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tokudaia osimensis
アマミトゲネズミ		EN✓✓✓✓—/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.44 Gbp
170		111,287
52.4 kbp		161523/3 (100.0%)38/1186 (3.2%)2022-11-01
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tokudaia tokunoshimensis
トクノシマトゲネズミ		EN✓✓✓——/——/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		2.48 Gbp
135		569
13.6 Mbp		261523/3 (100.0%)38/1186 (3.2%)2023-09-08
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pentalagus furnessi
アマミノクロウサギ		EN✓✓✓✓—/——/✓No———00210/1 (0.0%)10/140 (7.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mustela sibirica
シベリアイタチ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		2.51 Gbp
31		695,250
37.9 kbp		138718/18 (44.4%)23/72 (31.9%)2025-02-28

Birds
鳥類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lagopus muta japonica
ライチョウ		—✓✓✓✓—/——/✓Yes (1)Scaffold,
—		1.00 Gbp
71		72,306
56.2 kbp		34912/6 (33.3%)31/206 (15.0%)2019-02-15
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Anser erythropus
カリガネ		VU✓✓✓✓✓/——/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		1.34 Gbp
61		1,845
2.38 Mbp		2211657/16 (43.8%)83/213 (39.0%)2025-05-03
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phaethon rubricauda rothschildi
アカオネッタイチョウ		——✓✓✓—/——/—No———0332/3 (66.7%)2/3 (66.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chalcophaps indica yamashinai
キンバト		—✓————/——/—No———00260/3 (0.0%)11/354 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Columba janthina stejnegeri
ヨナグニカラスバト		——✓✓✓—/——/—No———112264/38 (10.5%)11/354 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Streptopelia decaocto decaocto
シラコバト		—✓—✓✓✓/——/✓No———24262/15 (13.3%)11/354 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phoebastria immutabilis
コアホウドリ		NT✓✓✓✓✓/9✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.21 Gbp
55		24,439
107 kbp		1584/6 (66.7%)7/27 (25.9%)2024-01-11
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Puffinus lherminieri bannermani
セグロミズナギドリ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0282/32 (6.2%)6/113 (5.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sula sula rubripes
アカアシカツオドリ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———17145/6 (83.3%)9/11 (81.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phalacrocorax pelagicus pelagicus
ヒメウ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———1996/21 (28.6%)6/43 (14.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Botaurus stellaris stellaris
サンカノゴイ		—✓✓✓✓—/——/—No———12122/4 (50.0%)9/67 (13.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platalea minor
クロツラヘラサギ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.24 Gbp
19		1,460
8.68 Mbp		13122/6 (33.3%)8/30 (26.7%)2024-04-05
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Coturnicops exquisitus
シマクイナ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00230/3 (0.0%)15/145 (10.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rallina eurizonoides sepiaria
オオクイナ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00230/3 (0.0%)15/145 (10.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Numenius minutus
コシャクシギ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———04562/9 (22.2%)44/89 (49.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Accipiter gularis iwasakii
リュウキュウツミ		—✓—✓✓✓/——/✓No———22417922/43 (51.2%)145/275 (52.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aquila chrysaetos japonica
イヌワシ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (2)Scaffold,
—		1.19 Gbp
100		348
16.9 Mbp		8151798/13 (61.5%)145/275 (52.7%)2020-04-03
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Buteo buteo toyoshimai
オガサワラノスリ		—✓✓✓✓—/——/—No———12117916/29 (55.2%)145/275 (52.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Circus spilonotus spilonotus
チュウヒ		—✓—✓✓—/——/✓No———0101799/17 (52.9%)145/275 (52.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nisaetus nipalensis orientalis
クマタカ		—✓✓✓✓—/——/—No———251794/11 (36.4%)145/275 (52.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eurystomus orientalis calonyx
ブッポウソウ		——✓✓✓—/——/—No———0242/4 (50.0%)4/12 (33.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pitta nympha
ヤイロチョウ		VU✓✓✓✓✓/10—/✓No———0111/15 (6.7%)1/47 (2.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lanius cristatus superciliosus
アカモズ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0444/30 (13.3%)4/34 (11.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Poecile varius namiyei
ナミエヤマガラ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———00170/5 (0.0%)9/83 (10.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Poecile varius owstoni
オーストンヤマガラ		EN✓✓✓✓—/——/—No———00170/5 (0.0%)9/83 (10.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Apalopteron familiare hahasima
ハハジマメグロ		—✓✓✓✓—/——/—No———0090/1 (0.0%)7/129 (5.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Locustella pleskei
ウチヤマセンニュウ		VU✓✓✓✓✓/—✓/✓No———0121/4 (25.0%)2/62 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Locustella pryeri pryeri
オオセッカ		—✓✓✓✓—/——/✓No———0121/22 (4.5%)2/62 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Troglodytes troglodytes mosukei
モスケミソサザイ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———0070/17 (0.0%)7/121 (5.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Luscinia komadori namiyei
ホントウアカヒゲ		—✓————/——/—No———01351/6 (16.7%)33/295 (11.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Turdus celaenops
アカコッコ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———07276/86 (7.0%)21/216 (9.7%)—

Reptiles
爬虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Caretta caretta
アカウミガメ		VU✓✓✓✓✓/12—/✓Yes (4)Chromosome,
Reference		2.13 Gbp
109		2,751
18.2 Mbp		44161/1 (100.0%)6/14 (42.9%)2022-06-07
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eretmochelys imbricata
タイマイ		CR✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		2.30 Gbp
81		303
82.0 Mbp		33161/1 (100.0%)6/14 (42.9%)2023-05-15
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Goniurosaurus kuroiwae sengokui
ケラマトカゲモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0030/28 (0.0%)2/48 (4.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Goniurosaurus splendens
オビトカゲモドキ		EN✓✓✓✓✓/——/✓No———0030/28 (0.0%)2/48 (4.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Plestiodon takarai
センカクトカゲ		DD✓✓✓✓—/——/—No———02191/50 (2.0%)16/1568 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calamaria pfefferi
ミヤコヒメヘビ		EN—✓✓✓—/——/—No———01731/18 (5.6%)59/1043 (5.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaphe carinata carinata
シュウダ		——✓✓✓—/——/—No———01731/20 (5.0%)59/1043 (5.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaphe carinata yonaguniensis
ヨナグニシュウダ		—✓✓✓✓✓/——/—No———01731/20 (5.0%)59/1043 (5.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hebius concelarus
ミヤコヒバァ		EN—✓✓✓—/——/—No———00730/42 (0.0%)59/1043 (5.7%)—

Amphibians
両生類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius abuensis
アブサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius akiensis
アキサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius hidamontanus
ハクバサンショウウオ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius iwami
イワミサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius katoi
アカイシサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius naevius
ブチサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius osumiensis
オオスミサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius setoi
サンインサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius shinichisatoi
ソボサンショウウオ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius takedai
ホクリクサンショウウオ		EN✓✓✓✓✓/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hynobius tsurugiensis
ツルギサンショウウオ		EN✓✓✓——/——/—No———0000/88 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Salamandrella keyserlingii
キタサンショウウオ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/2 (0.0%)0/132 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Babina holsti
ホルストガエル		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00230/3 (0.0%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Babina subaspera
オットンガエル		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00230/3 (0.0%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Glandirana susurra
サドガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———01231/6 (16.7%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Odorrana ishikawae
オキナワイシカワガエル		EN✓✓✓✓✓/10✓/—No———00230/98 (0.0%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Odorrana splendida
アマミイシカワガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———00230/98 (0.0%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Odorrana utsunomiyaorum
コガタハナサキガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———00230/98 (0.0%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pelophylax porosus brevipodus
ナゴヤダルマガエル		—✓✓———/——/—No———02231/118 (0.8%)14/751 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Limnonectes namiyei
ナミエガエル		EN✓✓✓✓—/——/—No———0030/182 (0.0%)3/892 (0.3%)—

Brackish and freshwater fishes
汽水・淡水魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Anguilla japonica
ニホンウナギ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (9)Chromosome,
Reference		1.03 Gbp
234		811
21.5 Mbp		920208/22 (36.4%)8/22 (36.4%)2014-03-18
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nematalosa japonica
ドロクイ		DD✓✓✓✓✓/10✓/✓No———02691/10 (10.0%)22/450 (4.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Coilia nasus
エツ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		852 Mbp
43		149
26.6 Mbp		26123/13 (23.1%)9/245 (3.7%)2019-08-16
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Abbottina rivularis
ツチフキ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00170/5 (0.0%)11/349 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acheilognathus melanogaster
タナゴ		VU✓✓✓✓✓/——/✓No———0121/49 (2.0%)2/111 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acheilognathus tabira erythropterus
アカヒレタビラ		—✓—✓✓—/——/✓No———0121/49 (2.0%)2/111 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acheilognathus tabira tabira
シロヒレタビラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0121/49 (2.0%)2/111 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acheilognathus tabira tohokuensis
キタノアカヒレタビラ		—✓—✓✓—/——/✓No———0121/49 (2.0%)2/111 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Biwia yodoensis
ヨドゼゼラ		EN✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00170/3 (0.0%)11/349 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carassius buergeri grandoculis
ニゴロブナ		—✓—✓✓—/——/—No———6151014/49 (8.2%)59/2388 (2.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carassius cuvieri
ゲンゴロウブナ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (1)Chromosome,
Reference		1.60 Gbp
29		1,018
9.29 Mbp		1151014/49 (8.2%)59/2388 (2.5%)2025-04-05
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hemigrammocypris neglectus
カワバタモロコ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00420/1 (0.0%)21/210 (10.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhodeus atremius atremius
カゼトゲタナゴ		—✓———✓/——/✓No———0121/50 (2.0%)2/111 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tribolodon nakamurai
ウケクチウグイ		EN✓✓✓✓✓/10✓/✓No———01831/8 (12.5%)43/1260 (3.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis kaibarai
アリアケスジシマドジョウ		VU✓✓✓✓—/——/✓No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis magnostriata
オオガタスジシマドジョウ		EN✓✓✓✓—/——/—No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis minamorii oumiensis
ビワコガタスジシマドジョウ		—✓—✓✓—/——/—No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis minamorii saninensis
サンインコガタスジシマドジョウ		—✓—✓✓—/——/✓No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis minamorii tokaiensis
トウカイコガタスジシマドジョウ		—✓—✓✓✓/——/✓No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis sakahoko
オオヨドシマドジョウ		EN✓✓✓✓—/——/—No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis shikokuensis
ヒナイシドジョウ		VU✓✓✓✓—/——/—No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis striata fuchigamii
オンガスジシマドジョウ		—✓—✓✓—/——/✓No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cobitis takatsuensis
イシドジョウ		NT✓✓✓✓✓/10✓/✓No———02112/239 (0.8%)5/458 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lefua costata nikkonis
エゾホトケドジョウ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00150/15 (0.0%)12/1076 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lefua echigonia
ホトケドジョウ		LC✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00150/15 (0.0%)12/1076 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lefua tokaiensis
トウカイナガレホトケドジョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00150/15 (0.0%)12/1076 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lefua torrentis
ナガレホトケドジョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00150/15 (0.0%)12/1076 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tachysurus ichikawai
ネコギギ		VU✓✓✓✓—/——/—No———06143/37 (8.1%)10/253 (4.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hucho perryi
イトウ		CR✓✓✓✓✓/10✓/✓No———00700/1 (0.0%)26/679 (3.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hippichthys heptagonus
アミメカワヨウジ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———00430/12 (0.0%)26/605 (4.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crenimugil heterocheilos
ナガレフウライボラ		LC——✓✓—/——/—No———0090/55 (0.0%)6/368 (1.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lates japonicus
アカメ		VU✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		838 Mbp
56		18,353
286 kbp		2662/19 (10.5%)2/40 (5.0%)2023-06-29
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Coreoperca kawamebari
オヤニラミ		—✓✓✓✓✓/10✓/✓No———01131/4 (25.0%)7/18 (38.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sillaginops macrolepis
アトクギス		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/119 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Kuhlia munda
トゲナガユゴイ		DD✓✓✓✓✓/——/—No———0000/13 (0.0%)0/13 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cottus reinii
カジカ小卵型		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0392/154 (1.3%)6/353 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cottus sp.
カジカ中卵型		—✓———✓/——/—No———0392/154 (1.3%)6/353 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trachidermus fasciatus
ヤマノカミ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0090/1 (0.0%)6/353 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Bostrychus sinensis
ジャノメハゼ		LC✓✓✓✓✓/10✓/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		886 Mbp
447.8		348
28.3 Mbp		22161/4 (25.0%)13/290 (4.5%)2021-06-03
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Giuris sp. 1
タメトモハゼ		——————/——/—No———00160/56 (0.0%)13/290 (4.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Giuris sp. 2
ゴシキタメトモハゼ		——————/——/—No———00160/56 (0.0%)13/290 (4.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hypseleotris cyprinoides
タナゴモドキ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———06165/53 (9.4%)13/290 (4.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Boleophthalmus pectinirostris
ムツゴロウ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓Yes (2)Scaffold,
Reference		941 Mbp
100		3,222
835 kbp		22371/17 (5.9%)26/2564 (1.0%)2014-12-02
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cristatogobius lophius
トサカハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00370/3 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gymnogobius cylindricus
キセルハゼ		NT✓✓✓✓—/——/—No———00370/25 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gymnogobius scrobiculatus
クボハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00370/25 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gymnogobius sp. 1
ムサシノジュズカケハゼ		——————/——/—No———00370/25 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mugilogobius cavifrons
ホホグロハゼ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———04371/32 (3.1%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhinogobius ogasawaraensis
オガサワラヨシノボリ		VU✓✓✓✓✓/——/—No———01371/127 (0.8%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhinogobius sp. YB
キバラヨシノボリ		—✓————/——/—No———01371/127 (0.8%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schismatogobius ampluvinculus
シマエソハゼ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00370/12 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schismatogobius roxasi
エソハゼ		EN✓—✓✓—/——/—No———00370/12 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taenioides cirratus
チワラスボ		DD✓✓✓✓✓/—✓/✓No———01371/22 (4.5%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parioglossus rainfordi
コビトハゼ		LC—✓✓✓—/——/—No———00370/11 (0.0%)26/2564 (1.0%)—

Insects
昆虫類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mortonagrion hirosei
ヒヌマイトトンボ		NT✓✓✓✓✓/——/—No———0090/7 (0.0%)4/977 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Paracercion plagiosum
オオセスジイトトンボ		NT✓✓✓✓✓/1—/—No———0090/9 (0.0%)4/977 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Copera tokyoensis
オオモノサシトンボ		NT✓✓✓✓—/——/—No———0020/3 (0.0%)1/166 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lestes japonicus
コバネアオイトトンボ		NT✓✓✓✓✓/1—/—No———0000/58 (0.0%)0/85 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhinocypha ogasawarensis
ハナダカトンボ		EN✓✓✓✓✓/1—/—No———0111/9 (11.1%)1/49 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Anaciaeschna jaspidea
トビイロヤンマ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0000/4 (0.0%)0/250 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhyothemis severini
ハネナガチョウトンボ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0070/7 (0.0%)5/631 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sympetrum flaveolum flaveolum
エゾアカネ		——————/——/—No———0472/113 (1.8%)5/631 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sympetrum maculatum
マダラナニワトンボ		EN✓✓✓✓✓/1—/—No———0472/113 (1.8%)5/631 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sympetrum uniforme
オオキトンボ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0472/113 (1.8%)5/631 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Zyxomma obtusum
コフキオオメトンボ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0070/3 (0.0%)5/631 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Galloisiana notabilis
イシイムシ		——✓✓✓—/——/—No———0000/27 (0.0%)0/170 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ilyocoris cimicoides exclamationis
コバンムシ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/1 (0.0%)0/260 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Abroscelis anchoralis
イカリモンハンミョウ		—✓✓✓✓—/—✓/✓No———00500/1 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Awatrechus hygrobius
リュウノメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Bembidion nakamurai
サツマキバナガミズギワゴミムシ		—✓—✓——/——/—No———00500/512 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carabus kolbei hanatanii
アイヌキンオサムシ利尻島亜種		——✓✓✓—/——/—No———05504/455 (0.9%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chaetodera laetescripta
カワラハンミョウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00500/3 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chaetotrechiama procerus
ケバネメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chlaenius ikedai
オガサワラアオゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00500/50 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cicindela lewisi
ルイスハンミョウ		—✓✓——✓/1—/—No———00500/312 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Colpodes laetus
オガサワラモリヒラタゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00500/10 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Colpodes yamaguchii
ハハジマモリヒラタゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00500/10 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Drypta fulveola
キイロホソゴミムシ		——✓✓——/——/—No———00500/3 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaphrus punctatus
コハンミョウモドキ		——✓✓——/——/—No———00500/15 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaphrus sugai
ワタラセハンミョウモドキ		——✓✓——/——/—No———00500/15 (0.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eochlaenius suvorovi
チビアオゴミムシ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Haplochlaenius insularis
アマミスジアオゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nebria livida angulata
キベリマルクビゴミムシ		——✓✓✓—/——/—No———05503/199 (1.5%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nebria pulcherrima
フタモンマルクビゴミムシ		——✓✓——/——/—No———05503/199 (1.5%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pterostichus plesiomorphs
アマミナガゴミムシ		——————/——/—No———06503/290 (1.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rakantrechus lallum
ツヅラセメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rakantrechus mirabilis
ウスケメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stygiotrechus kadanus
タカモリメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stygiotrechus kitayamai
キタヤマメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Suzuka masuzoi
マスゾウメクラチビゴミムシ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trechiama abcuma
アブクマナガチビゴミムシ		———✓——/——/—No———01501/2 (50.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trechiama morii
カダメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———01501/2 (50.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trechiama nakaoi
ナカオメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———01501/2 (50.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trechiama oopterus
スリカミメクラチビゴミムシ		———✓——/——/—No———01501/2 (50.0%)32/6510 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Haliplus kamiyai
カミヤコガシラミズムシ		—✓✓✓—✓/——/—No———0000/56 (0.0%)0/83 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neohydrocoptus bivittis
キボシチビコツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/7 (0.0%)0/124 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phreatodytes elongatus
ギフムカシゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/124 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phreatodytes latiusculus
カガミムカシゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/124 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phreatodytes sublimbatus
トサムカシゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/124 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acilius kishii
ヤシャゲンゴロウ		—✓✓✓—✓/1—/—No———0020/14 (0.0%)1/2978 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydaticus pacificus conspersus
オオイチモンジシマゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/32 (0.0%)1/2978 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Laccophilus vagelineatus
キタノツブゲンゴロウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0020/62 (0.0%)1/2978 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Morimotoa gigantea
オオメクラゲンゴロウ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Morimotoa morimotoi
トサメクラゲンゴロウ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gyrinus curtus
コミズスマシ		—✓✓✓——/——/—No———0000/75 (0.0%)0/288 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gyrinus gestroi
ヒメミズスマシ		—✓✓✓——/——/—No———0000/75 (0.0%)0/288 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydrochus aequalis
ホソガムシ		——✓✓✓—/——/—No———0111/36 (2.8%)1/36 (2.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Helophorus auriculatus
セスジガムシ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/51 (0.0%)0/53 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Laccobius bedeli
シジミガムシ		——✓✓✓—/——/—No———0060/35 (0.0%)6/1292 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Liparocephalus tokunagai
オオズウミハネカクシ		———✓✓—/——/—No———00660/3 (0.0%)52/7214 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neolucanus protogenetivus hamaii
ウケジママルバネクワガタ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/37 (0.0%)6/403 (1.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cheirotonus jambar
ヤンバルテナガコガネ		EN—✓✓✓—/——/—No———00630/3 (0.0%)41/4905 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Graphelmis shirahatai
アヤスジミゾドロムシ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0020/12 (0.0%)1/538 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Optioservus hagai
ハガマルヒメドロムシ		—✓—✓✓—/1—/—No———0020/8 (0.0%)1/538 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Zaitzevia rufa
アカツヤドロムシ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0020/15 (0.0%)1/538 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lucidina okadai
コクロオバボタル		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/7 (0.0%)7/642 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhagophthalmus ohbai
イリオモテボタル		—✓✓✓—✓/11✓/✓No———0111/9 (11.1%)1/22 (4.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tomoxia relicta
オガサワラモンハナノミ		——————/——/—No———0000/7 (0.0%)0/434 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Variimorda inomatai
オガサワラキンオビハナノミ		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/434 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Variimorda maiae shoui
マイキンオビハナノミ母島亜種		——————/——/—No———0000/4 (0.0%)0/434 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Boninella karubei
ムコジマオガサワラカミキリ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chlorophorus kusamai
ムコジマトラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00310/44 (0.0%)20/3142 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chlorophorus masatakai
ムコジマキイロトラカミキリ		———✓✓—/——/—No———00310/44 (0.0%)20/3142 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peblephaeus nobuoi
ノブオフトカミキリ		———✓✓—/——/—No———00310/3 (0.0%)20/3142 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pseudiphra bicolor nigripennis
フタモンアメイロカミキリ母島列島亜種		———✓✓—/——/—No———00310/1 (0.0%)20/3142 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stenygrinum quadrinotatum
ヨツボシカミキリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———00310/1 (0.0%)20/3142 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Simulium satsumense
サツマツノマユブユ		———✓✓—/——/—No———0000/1865 (0.0%)0/2210 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Symmerus akikoae
ヒメケヅメカ		——✓✓✓—/——/—No———0171/34 (2.9%)6/6776 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydrotaea glabricula
イソメマトイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———04342/65 (3.1%)16/5706 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sarcophaga yonahaensis
ヨナハニクバエ		—✓—✓——/——/—No———014198/481 (1.7%)12/1536 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scalarignathia montis
ミスジコスカシバ		——————/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aeromachus inachus inachus
ホシチャバネセセリ		—✓—✓——/——/—No———014781/11 (9.1%)408/3131 (13.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hesperia florinda florinda
アカセセリ		——————/——/—No———034782/29 (6.9%)408/3131 (13.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parnara ogasawarensis
オガサワラセセリ		—✓✓✓✓✓/——/—No———014781/11 (9.1%)408/3131 (13.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyrgus maculatus maculatus
チャマダラセセリ		—✓—✓——/——/—No———0184789/39 (23.1%)408/3131 (13.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aporia hippia japonica
ミヤマシロチョウ		—✓✓———/——/—No———02851/42 (2.4%)40/907 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eurema laeta betheseba
ツマグロキチョウ		—✓✓✓—✓/——/—No———04853/48 (6.2%)40/907 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gonepteryx maxima maxima
ヤマキチョウ		—✓—✓——/——/—No———02851/12 (8.3%)40/907 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leptidea amurensis
ヒメシロチョウ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———014853/11 (27.3%)40/907 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Everes lacturnus kawaii
タイワンツバメシジミ日本本土亜種		——✓———/——/—No———081034/16 (25.0%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Niphanda fusca
クロシジミ		—✓✓✓✓✓/——/—No———001030/3 (0.0%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phengaris teleius daisensis
ゴマシジミ中国地方・九州亜種		——✓———/——/—No———031032/11 (18.2%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Plebejus argyrognomon praeterinsularis
ミヤマシジミ		—✓✓———/——/—No———061034/65 (6.2%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Plebejus subsolanus yaginus
アサマシジミ本州亜種		——————/——/—No———061034/65 (6.2%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Shijimiaeoides divinus asonis
オオルリシジミ九州亜種		——✓———/——/—No———001030/1 (0.0%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Zizina emelina
シルビアシジミ		—✓✓✓—✓/——/—No———001030/3 (0.0%)53/2706 (2.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Coenonympha oedippus arothius
ヒメヒカゲ本州中部・近畿・中国地方亜種		——✓✓✓—/——/—No———1117716/36 (16.7%)220/5385 (4.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lethe marginalis
クロヒカゲモドキ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———007710/41 (0.0%)220/5385 (4.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Melitaea ambigua niphona
コヒョウモンモドキ		—✓✓——✓/——/—No———02877113/150 (8.7%)220/5385 (4.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Brabira kasaii
チャホシホソバナミシャク		——✓✓✓—/——/—No———003100/1 (0.0%)156/11844 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Epirrhoe hastulata echigoensis
ヒトスジシロナミシャク本州亜種		———✓✓—/——/—No———043102/15 (13.3%)156/11844 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Heterophleps endoi
サキシマウスクモナミシャク		——✓✓✓—/——/—No———003100/5 (0.0%)156/11844 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Isturgia arenacearia
ソトオビエダシャク		—✓✓✓✓✓/——/—No———023101/22 (4.5%)156/11844 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chersotis deplanata
ヒメカクモンヤガ		——✓✓✓✓/——/—No———004360/14 (0.0%)211/7151 (3.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Condica illustrata
ヘリグロヒメヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———004360/55 (0.0%)211/7151 (3.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cymatophoropsis trimaculata
ミツモンケンモン		—✓✓✓✓✓/——/—No———001210/3 (0.0%)60/8426 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dasypolia fani
オガサワラヒゲヨトウ		——✓✓✓✓/——/—No———024361/6 (16.7%)211/7151 (3.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lacanobia aliena
オイワケクロヨトウ		—✓✓✓✓✓/—✓/✓No———084364/24 (16.7%)211/7151 (3.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leucapamea hikosana
クロコシロヨトウ		——✓✓✓—/——/—No———004360/1 (0.0%)211/7151 (3.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Paraphyllophila confusa
ミスズコヤガ		——✓—✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Staurophora celsia
コンゴウミドリヨトウ		—✓✓✓✓✓/——/—No———004360/1 (0.0%)211/7151 (3.0%)—

Molluscs
貝類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Awalycaeus yanoshokoae
サルダアツブタムシオイ		———✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platyrhaphe hirasei hirasei
ヒラセアツブタガイ		———✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/263 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diplommatina nishii
ハンミガキゴマガイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/56 (0.0%)0/160 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cantharus cecillei
オガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0030/3 (0.0%)2/361 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gyrineum natator
ウネボラ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0010/8 (0.0%)1/54 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gyraulus sp.
ヒメヒラマキミズマイマイ		—✓———✓/——/✓No———00200/205 (0.0%)7/669 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Luchuena luchuana
リュウキュウキセルモドキ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Luchuena reticulata
キカイキセルモドキ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/1 (0.0%)0/72 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereophaedusa azumai
アズマギセル		—✓—✓✓—/——/—No———0010/39 (0.0%)1/634 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereophaedusa caudata
トクネニヤダマシギセル		——————/——/—No———0010/39 (0.0%)1/634 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereophaedusa sp. (NL)
ナタマメギセル（北部大型）		——————/——/—No———0010/39 (0.0%)1/634 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereophaedusa sp. (SL)
ナタマメギセル（南部大型）		——————/——/—No———0010/39 (0.0%)1/634 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Bekkochlamys sp.
オキナワテラマチベッコウ		——————/——/—No———0000/5 (0.0%)0/169 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euconulidae gen. & sp.
ヨナグニシロベッコウ		——————/——/—No———0000/43 (0.0%)0/43 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Meghimatium sp.
ダンジョナメクジ		—✓————/——/—No———0111/17 (5.9%)1/38 (2.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chosenelix sp.
ツシマウスカワマイマイモドキ		—✓————/——/—No———0050/2 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Moellendorffia tokunoensis
トクノシマケハダシワクチマイマイ		—✓—✓——/——/—No———0050/3 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nipponochloritis obscura
トクノシマビロウドマイマイ		——————/——/—No———0050/5 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Satsuma akiratadai
アキラマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Satsuma caliginosa picta
ヨナクニマイマイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Satsuma largillierti
シラユキヤマタカマイマイ		—✓✓✓✓✓/1—/—No———0050/76 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Satsuma sp. A
サンエンマイマイ		——————/——/—No———0050/76 (0.0%)5/1508 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mesocibota bistrigata
ヒメエガイ		——✓✓✓—/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Margaritifera laevis
カワシンジュガイ		DD✓✓✓✓✓/2✓/✓No———0221/8 (12.5%)1/18 (5.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Margaritifera togakushiensis
コガタカワシンジュガイ		LC✓✓✓✓✓/1—/—No———0221/8 (12.5%)1/18 (5.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cristaria plicata
カラスガイ		LC✓✓✓✓✓/11✓/✓No———0080/6 (0.0%)8/880 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lanceolaria kihirai
キュウシュウササノハガイ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0080/9 (0.0%)8/880 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sinanodonta tumens
オグラヌマガイ		—✓✓✓✓✓/——/✓No———0181/44 (2.3%)8/880 (0.9%)—

Other invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Haemaphy salispentalagi
クロウサギチマダニ		—✓—✓✓—/——/—No———05511/134 (0.7%)21/827 (2.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyatakovestia boninensis
オガサワラホソハマトビムシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/3 (0.0%)4/326 (1.2%)—

Vascular plants
維管束植物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lycopodium alpinum
チシマヒカゲノカズラ		—✓✓✓✓—/6—/✓Yes (2)Chromosome,
Reference		3.08 Gbp
45		6,242
1.14 Mbp		2332/32 (6.2%)2/328 (0.6%)2025-03-28
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phlegmariurus phlegmaria
ヨウラクヒバ		—✓✓✓✓—/——/—No———0030/189 (0.0%)2/328 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phlegmariurus sieboldii
ヒモラン		—✓✓✓✓—/——/—No———0030/189 (0.0%)2/328 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Isoetes coreana
オオバシナミズニラ		—✓—✓✓—/2—/—No———0222/204 (1.0%)2/204 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Botrychium microphyllum
イブリハナワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/143 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Helminthostachys zeylanica
ミヤコジマハナワラビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/1 (0.0%)0/143 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ophioglossum kawamurae
サクラジマハナヤスリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/50 (0.0%)0/143 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ophioglossum pendulum
コブラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/5 (0.0%)0/143 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidomanes bonincola
ムニンホラゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/32 (0.0%)0/449 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hymenophyllum mikawanum
ミカワコケシノブ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/182 (0.0%)0/449 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vandenboschia maxima
シノブホラゴケ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———0000/139 (0.0%)0/449 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schizaea dichotoma
カンザシワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/18 (0.0%)0/28 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Azolla japonica
オオアカウキクサ		—✓—✓✓—/——/—No———010107/20 (35.0%)7/43 (16.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Azolla pinnata subsp. asiatica
アカウキクサ		—✓——✓—/2—/—No———110107/20 (35.0%)7/43 (16.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Marsilea minuta
ナンゴクデンジソウ		LC✓✓✓✓—/2—/—No———0000/40 (0.0%)0/46 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cyathea ogurae
メヘゴ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/34 (0.0%)0/480 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lindsaea simulans
ウチワホングウシダ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/151 (0.0%)0/200 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acrostichum aureum
ミミモチシダ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———0050/5 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Adiantum capillus-junonis
ホウライクジャク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0252/235 (0.9%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Adiantum edgeworthii
オトメクジャク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0252/235 (0.9%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteris formosana
タイワンアマクサシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/258 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteris maclurei
ヒノタニシダ		——————/——/—No———0050/258 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteris setulosocostulata
トゲハチジョウシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/258 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteris tokioi
ヒカゲアマクサシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/258 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pteris yamatensis
ヒメイノモトソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/258 (0.0%)3/1175 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Monachosorum x arakii
ヒメムカゴシダ		——————/——/—No———0000/6 (0.0%)0/173 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asplenium formosae
マキノシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/453 (0.0%)0/503 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Athyrium nudum
ホソバシケチシダ		———✓✓—/——/—No———0000/127 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Athyrium strigillosum
コモチイヌワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/127 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Athyrium subrigescens
ホウライイヌワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/127 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Athyrium tozanense
シマイヌワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/127 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Athyrium viridescentipes
アオグキイヌワラビ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/127 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Deparia otomasui
アソシケシダ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/70 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diplazium okudairae
イヨクジャク		——✓✓✓—/1—/—No———0000/241 (0.0%)0/445 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thelypteris uraiensis
タイワンハリガネワラビ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/8 (0.0%)0/637 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ctenitis microlepigera
コキンモウイノデ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/68 (0.0%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dryopteris hendersonii
ホウライヒメワラビ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/418 (0.2%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dryopteris insularis
ムニンベニシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0141/418 (0.2%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dryopteris polita
タイトウベニシダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/418 (0.2%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dryopteris purpurella
ムラサキベニシダ		—✓—✓✓—/——/—No———0141/418 (0.2%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dryopteris tsushimensis
ツシマミサキカグマ		—✓—✓✓—/——/—No———0141/418 (0.2%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polystichum atkinsonii
センジョウデンダ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0141/252 (0.4%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polystichum lonchitis
ヒイラギデンダ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0141/252 (0.4%)4/1409 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Goniophlebium formosanum
タイワンアオネカズラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/17 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lepisorus fortunei
オオクリハラン		——————/——/—No———0000/86 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lepisorus miyoshianus
クラガリシダ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/86 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Microsorum rubidum
タカウラボシ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/32 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oreogrammitis dorsipila
ヒメウラボシ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/41 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polypodium vulgare
オオエゾデンダ		—✓✓✓✓—/7—/—No———0000/56 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Selliguea yakuinsularis
ヤクシマウラボシ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/72 (0.0%)0/1339 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Picea koyamae
ヤツガタケトウヒ		CR✓✓✓✓—/3—/—No———08375/55 (9.1%)16/324 (4.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pinus amamiana
ヤクタネゴヨウ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———06376/152 (3.9%)16/324 (4.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nuphar oguraensis var. oguraensis
オグラコウホネ		——————/——/—No———0141/22 (4.5%)3/156 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peperomia japonica var. okinawensis
オキナワスナゴショウ		—✓——✓—/——/—No———0030/383 (0.0%)3/1099 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum celsum
ミヤビカンアオイ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum curvistigma
カギガタアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum dilatatum
スエヒロアオイ		——✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum hatsushimae
ハツシマカンアオイ		EN✓✓✓——/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum kooyanum
コウヤカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum kumageanum var. satakeanum
ムラクモアオイ		—✓————/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum kurosawae
イワタカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum majale
コトウカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum misandrum
アソサイシン		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum sakawanum var. stellatum
ホシザキカンアオイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum subglobosum
マルミカンアオイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum trigynum
サンコカンアオイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum trinacriforme
カケロマカンアオイ		EN✓✓✓✓—/1—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asarum yaeyamense
ヤエヤマカンアオイ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/165 (0.0%)0/166 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cassytha pergracilis
イトスナヅル		—✓✓✓✓—/——/—No———00180/11 (0.0%)9/1584 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Machilus pseudokobu
テリハコブガシ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———00180/91 (0.0%)9/1584 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neolitsea sericea var. argentea
ダイトウシロダモ		———✓✓—/——/—No———00180/81 (0.0%)9/1584 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema abei
ツルギテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema heterocephalum subsp. heterocephalum
アマミテンナンショウ		EN✓✓✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema iyoanum subsp. nakaianum
シコクテンナンショウ		—✓—✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema longipedunculatum var. yakumontanum
ヤクシマヒロハテンナンショウ		———✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema minus
ハリママムシグサ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema nikoense subsp. australe
オオミネテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema nikoense subsp. brevicollum
カミコウチテンナンショウ		—✓——✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arisaema sachalinense
カラフトヒロハテンナンショウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/150 (0.0%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lemna trisulca
ヒンジモ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———03261/21 (4.8%)12/1772 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tofieldia coccinea var. akkana
アッカゼキショウ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/13 (0.0%)0/22 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tofieldia coccinea var. geibiensis
ゲイビゼキショウ		———✓✓—/——/—No———0000/13 (0.0%)0/22 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Alisma rariflorum
トウゴクヘラオモダカ		—✓—✓✓—/1—/—No———0221/11 (9.1%)1/142 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Enhalus acoroides
ウミショウブ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0040/1 (0.0%)3/218 (1.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Najas ancistrocarpa
ムサシモ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/30 (0.0%)3/218 (1.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Petrosavia sakuraii
サクライソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/5 (0.0%)0/6 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dioscorea asclepiadea
ツクシタチドコロ		—✓✓✓✓—/——/—No———011125/344 (1.5%)6/349 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sciaphila megastyla
タナカソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/18 (0.0%)0/29 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Freycinetia williamsii
ヒメツルアダン		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/37 (0.0%)1/292 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chionographis hisauchiana subsp. minoensis
ミノシライトソウ		—✓—✓✓—/——/—No———0121/4 (25.0%)2/203 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trillium channellii
カワユエンレイソウ		——✓✓✓—/——/—No———0020/53 (0.0%)2/203 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Smilax bracteata var. verruculosa
アラガタオオサンキライ		————✓—/——/—No———0111/197 (0.5%)1/200 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Fritillaria kaiensis
カイコバイモ		EN✓✓✓✓—/1—/—No———0060/140 (0.0%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gagea japonica
ヒメアマナ		——✓✓✓—/——/—No———0060/158 (0.0%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lilium concolor
ヒメユリ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0161/152 (0.7%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lilium japonicum var. abeanum
ジンリョウユリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0161/152 (0.7%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tricyrtis ishiiana var. ishiiana
サガミジョウロウホトトギス		———✓——/——/—No———0060/35 (0.0%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tricyrtis ishiiana var. surugensis
スルガジョウロウホトトギス		—✓—✓✓—/——/—No———0060/35 (0.0%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tricyrtis perfoliata
キバナノツキヌキホトトギス		—✓✓✓✓—/——/—No———0060/35 (0.0%)6/755 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aphyllorchis montana
タネガシマムヨウラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00300/7 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Apostasia nipponica
ヤクシマラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02302/16 (12.5%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arundina graminifolia
ナリヤラン		—✓✓✓✓—/5—/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calanthe aristulifera
キリシマエビネ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00300/77 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calanthe formosana
タイワンエビネ		——✓✓✓—/——/—No———00300/77 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calanthe izuinsularis
オオキリシマエビネ		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/77 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calanthe tokunoshimensis
トクノシマエビネ		———✓✓—/——/—No———00300/77 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calypso bulbosa var. speciosa
ホテイラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/1 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidium hahajimense
ハハジマホザキラン		—✓—✓✓—/——/—No———00300/28 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidium kandae
カンダヒメラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/28 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dendrobium okinawense
オキナワセッコク		—✓✓✓✓—/3—/—No———07307/513 (1.4%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Didymoplexis micradenia
ヒメヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Didymoplexis siamensis
コカゲラン		———✓✓—/——/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ephippianthus sawadanus
ハコネラン		—✓—✓✓—/1—/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Epipogium aphyllum
トラキチラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Epipogium japonicum
アオキラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/2 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrochilus ciliaris
マツゲカヤラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/58 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia albida
ヤクシマヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia amamiana
アマミヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia boninensis
ムニンヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia clausa
ツボミヤツシロラン		——✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia elata var. pallens
シロテンマ		———✓✓—/——/—No———22301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia foetida
フユザキヤツシロラン		—✓—✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia fontinalis
トカラヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia gracilis
ナヨテンマ		——✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gastrodia uraiensis
タブガワヤツシロラン		—✓✓✓✓—/——/—No———02301/27 (3.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Geodorum densiflorum
トサカメオトラン		—✓—✓✓—/4—/—No———00300/6 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Goodyera pendula f. brachyphylla
ヒロハツリシュスラン		——————/——/—No———00300/61 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria dentata
ダイサギソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria iyoensis
イヨトンボ		—✓—✓✓—/3—/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria linearifolia var. linearifolia
オオミズトンボ		——————/——/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria pantlingiana
リュウキュウサギソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria radiata
ヤチラン		—✓—✓✓—/3—/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Habenaria stenopetala
テツオサギソウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00300/319 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hemipilia fujisanensis
フジチドリ		——✓✓✓—/——/—No———00300/20 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hemipilia keiskei
イワチドリ		——✓✓✓—/——/—No———00300/20 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lecanorchis taiwaniana
ムロトムヨウラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/14 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Liparis koreojaponica
オオフガクスズムシソウ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00300/141 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Liparis krameri var. shichitoana
ヒメジガバチソウ		——————/——/—No———00300/141 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Luisia boninensis
ムニンボウラン		———✓✓—/——/—No———00300/20 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neottia inagakii
タンザワサカネラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/42 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oberonia anthropophora var. arisanensis
クスクスヨウラクラン		———✓✓—/——/—No———00300/64 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oberonia makinoi
オオバヨウラクラン		—✓—✓✓—/——/—No———00300/64 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Odontochilus hatusimanus
ハツシマラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/17 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peristylus densus
ムカゴトンボ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00300/30 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pinalia ovata var. ovata
リュウキュウセッコク		——————/——/—No———00300/27 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platanthera boninensis
シマツレサギソウ		EN—✓✓✓—/——/—No———02302/117 (1.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platanthera iinumae
イイヌマムカゴ		——✓✓✓—/——/—No———02302/117 (1.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platanthera stenoglossa subsp. iriomotensis
イリオモテトンボソウ		———✓✓—/——/—No———02302/117 (1.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Platanthera takedae subsp. uzenensis
ガッサンチドリ		——✓✓✓—/——/—No———02302/117 (1.7%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sedirea japonica
ナゴラン		—✓✓✓✓—/2—/—No———04303/90 (3.3%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tropidia nipponica var. hachijoensis
ハチジョウネッタイラン		—✓—✓✓—/——/—No———00300/11 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tropidia nipponica var. nipponica
ヤクシマネッタイラン		——————/——/—No———00300/11 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tropidia somae
アコウネッタイラン		——✓✓✓—/——/—No———00300/11 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vrydagzynea nuda
ミソボシラン		—✓✓✓✓—/——/—No———00300/10 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Yoania amagiensis
キバナノショウキラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00300/5 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Yoania flava
シナノショウキラン		—✓✓✓✓—/1—/—No———00300/5 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Zeuxine affinis
アオジクキヌラン		—✓✓✓✓—/4—/—No———00300/16 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Zeuxine odorata
ジャコウキヌラン		NT✓✓✓✓—/1—/—No———00300/16 (0.0%)23/11651 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Iris setosa var. hondoensis
キリガミネヒオウギアヤメ		——✓✓✓—/——/—No———07105/304 (1.6%)8/1506 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Iris setosa var. nasuensis
ナスヒオウギアヤメ		———✓✓—/——/—No———07105/304 (1.6%)8/1506 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Allium togashii
カンカケイニラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0793/659 (0.5%)5/1512 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Allium virgunculae var. koshikiense
コシキイトラッキョウ		——✓✓✓—/——/—No———0793/659 (0.5%)5/1512 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Allium virgunculae var. yakushimense
ヤクシマイトラッキョウ		———✓✓—/——/—No———0793/659 (0.5%)5/1512 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Asparagus oligoclonos
タマボウキ		DD✓✓✓✓—/3—/—No———07184/269 (1.5%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hosta alata
ブンゴギボウシ		—✓—✓——/——/—No———00180/47 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hosta hypoleuca
ウラジロギボウシ		—✓✓✓✓—/——/—No———00180/47 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hosta minazukiflora
ミナズキギボウシ		—✓————/——/—No———00180/47 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hosta pulchella
ウバタケギボウシ		—✓✓✓✓—/——/—No———00180/47 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hosta pycnophylla
セトウチギボウシ		——✓✓✓—/——/—No———00180/47 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ophiopogon reversus
ヨナグニノシラン		—✓✓✓✓—/3—/—No———00180/51 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polygonatum cryptanthum
ウスギワニグチソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00180/68 (0.0%)14/1532 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon mikawanum var. azumianum
アズミイヌノヒゲ		———✓✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon mikawanum var. mikawanum
ミカワイヌノヒゲ		——————/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon miquelianum var. lutchuense
オキナワホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon miquelianum var. ozense
ユキイヌノヒゲ		————✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon omuranum
オオムラホシクサ		———✓✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon ozense
ハライヌノヒゲ		———✓✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eriocaulon taquetii var. zyotanii
イズノシマホシクサ		————✓—/——/—No———0111/153 (0.7%)1/501 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Juncus hizenensis
ヒゼンコウガイゼキショウ		———✓✓—/——/—No———08123/164 (1.8%)5/283 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Juncus mertensianus
エゾノミクリゼキショウ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———08123/164 (1.8%)5/283 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Juncus tokubuchii
ホロムイコウガイ		———✓✓—/——/—No———08123/164 (1.8%)5/283 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex aphyllopus var. impura
ヒルゼンスゲ		—✓——✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex arisanensis
アリサンタマツリスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex bigelowii
オハグロスゲ		—✓✓✓✓—/10—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex bohemica
カヤツリスゲ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex chichijimensis
チチジマナキリスゲ		——✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex collifera
リュウキュウヒエスゲ		CR——✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex cruciata
ハナビスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex fuscidula
タカネシバスゲ		—✓—✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex genkaiensis
ゲンカイモエギスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex gynocrates
カンチスゲ		LC✓—✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex laevissima
ヒメミコシガヤ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex latisquamea
ハタベスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex longistipes
タイワンカンスゲ		———✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex mackenziei
ノルゲスゲ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex melanocarpa
タカネヒメスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex paxii
キビノミノボロスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex peiktusani
マンシュウクロカワスゲ		—✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex pseudocyperus
クグスゲ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex pseudololiacea
ヒロハイッポンスゲ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex ramenskii
ウシオスゲ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex rupestris
カラフトイワスゲ		—✓✓✓✓—/10—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex stylosa
ラウススゲ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex subcernua
ツクシナルコ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex tsushimensis
ツシマスゲ		DD✓✓✓✓—/——/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex uda
エゾハリスゲ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carex vaginata
サヤスゲ		LC✓✓✓✓—/7—/—No———0406823/1654 (1.4%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cyperus rotundus var. yoshinagae
トサノハマスゲ		—✓————/——/—No———05683/386 (0.8%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cyperus unioloides
ムギガラガヤツリ		LC✓✓✓✓—/——/—No———05683/386 (0.8%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eleocharis acutangula
ミスミイ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———03682/184 (1.1%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Fimbristylis longispica var. hahajimensis
ハハジマテンツキ		—✓—✓✓—/1—/—No———00680/66 (0.0%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Fimbristylis stauntonii
ハタケテンツキ		—✓—✓✓—/2—/—No———00680/66 (0.0%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Fimbristylis umbellaris
ハナシテンツキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00680/66 (0.0%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhynchospora japonica var. curvoaristata
ムニンイヌノハナヒゲ		————✓—/——/—No———03683/171 (1.8%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schoenoplectiella mucronata var. ishizawae
ロッカクイ		————✓—/——/—No———00680/37 (0.0%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schoenoplectus subulatus
イヌフトイ		LC—✓✓✓—/——/—No———07683/21 (14.3%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schoenus calostachyus
イヘヤヒゲクサ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00680/131 (0.0%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scirpus karuisawensis
ヒメマツカサススキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———02681/36 (2.8%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scirpus rosthornii var. kiushuensis
ツクシアブラガヤ		———✓✓—/——/—No———02681/36 (2.8%)40/3562 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Anthoxanthum pluriflorum var. pluriflorum
エゾコウボウ		————✓—/——/—No———0010230/43 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arundinella hirta var. livens
シロケトダシバ		————✓—/——/—No———0010230/28 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calamagrostis onibitoana
オニビトノガリヤス		———✓✓—/——/—No———0010230/100 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calamagrostis purpurea subsp. amurensis
アムールイワノガリヤス		————✓—/——/—No———0010230/100 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calamagrostis tashiroi subsp. tashiroi
タシロノガリヤス		————✓—/——/—No———0010230/100 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Deschampsia cespitosa var. levis
ユウバリカニツリ		———✓——/——/—No———0010230/40 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Digitaria platycarpha
シマギョウギシバ		——✓✓✓—/——/—No———0510233/82 (3.7%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dupontiopsis hayachinensis
ナンブソモソモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010230/1 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elymus gmelinii var. tenuisetus
イヌカモジグサ		———✓✓—/——/—No———0110231/155 (0.6%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Festuca hondoensis
ヤマオオウシノケグサ		———✓✓—/——/—No———0010230/333 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Glyceria spiculosa
ヌマドジョウツナギ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0010230/32 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ischaemum ischaemoides
シマカモノハシ		———✓✓—/——/—No———0010230/26 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Poa nemoralis
タチイチゴツナギ		—✓✓✓✓—/10—/—No———0710236/373 (1.6%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ptilagrostis alpina
ヒゲナガコメススキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010230/12 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schizachne purpurascens subsp. callosa
フォーリーガヤ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0010230/2 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Torreyochloa natans
ホソバドジョウツナギ		———✓✓—/——/—No———0010230/1 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tripogon longearistatus
フクロダガヤ		—✓————/1—/—No———0010230/14 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trisetum spicatum subsp. molle
キタダケカニツリ		———✓✓—/——/—No———0010230/31 (0.0%)163/8712 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Corydalis ochotensis
ツルキケマン		—✓✓✓✓—/2—/—No———01161/318 (0.3%)12/672 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Papaver fauriei
リシリヒナゲシ		—✓—✓✓—/——/—No———08166/80 (7.5%)12/672 (1.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aconitum ciliare
ハナカズラ		—✓—✓✓—/2—/—No———00240/227 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aconitum misaoanum
シレトコトリカブト		—✓————/1—/—No———00240/227 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aconitum yamazakii
ダイセツトリカブト		—✓—✓✓—/1—/—No———00240/227 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Anemone sikokiana
シコクイチゲ		———✓——/——/—No———00240/142 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Clematis obvallata var. shikokiana
シコクハンショウヅル		———✓✓—/——/—No———00240/236 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Coptis minamitaniana
ヒュウガオウレン		—✓✓✓✓—/——/—No———04243/19 (15.8%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dichocarpum numajirianum
コウヤシロカネソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00240/28 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pulsatilla nipponica
ツクモグサ		—✓✓✓✓—/——/—No———00240/142 (0.0%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus altaicus subsp. shinanoalpinus
タカネキンポウゲ		——————/——/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus kadzusensis
ヒメバイカモ		—✓✓✓✓—/1—/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus kitadakeanus
キタダケキンポウゲ		—✓—✓✓—/——/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus nipponicus var. major
オオイチョウバイカモ		——✓✓✓—/——/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus pygmaeus
クモマキンポウゲ		—✓✓✓✓—/4—/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ranunculus yezoensis
チトセバイカモ		—✓—✓✓—/——/—No———06244/436 (0.9%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thalictrum filamentosum
オオミヤマカラマツ		—✓✓✓✓—/1—/—No———05242/139 (1.4%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thalictrum toyamae
ヒレフリカラマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———05242/139 (1.4%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thalictrum watanabei
タマカラマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———05242/139 (1.4%)15/1938 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sabia japonica
アオカズラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/21 (0.0%)0/100 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Astilbe platyphylla
モミジバショウマ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/31 (0.0%)4/824 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Micranthes laciniata
クモマユキノシタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/74 (0.0%)4/824 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Micranthes nelsoniana var. reniformis
チシマイワブキ		————✓—/——/—No———0050/74 (0.0%)4/824 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Saxifraga acerifolia
エチゼンダイモンジソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0352/498 (0.4%)4/824 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hylotelephium pallescens
ムラサキベンケイソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00100/26 (0.0%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hylotelephium sieboldii var. ettyuense
エッチュウミセバヤ		—✓✓✓✓—/——/—No———00100/26 (0.0%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hylotelephium sieboldii var. sieboldii
ミセバヤ		—✓—✓——/——/—No———00100/26 (0.0%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sedum boninense
ムニンタイトゴメ		—✓—✓✓—/1—/—No———01101/259 (0.4%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sedum kawaraense
カワラマンネングサ		—✓—✓✓—/——/—No———01101/259 (0.4%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sedum zentaro-tashiroi
ヒメマンネングサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01101/259 (0.4%)8/1216 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gonocarpus chinensis
ナガバアリノトウグサ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0030/36 (0.0%)2/143 (1.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vitis kiusiana
クマガワブドウ		——✓✓✓—/——/—No———028028238/247 (15.4%)40/845 (4.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vitis shiragae
シラガブドウ		—✓—✓✓—/——/—No———028028238/247 (15.4%)40/845 (4.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tribulus terrestris
ハマビシ		LC✓✓✓✓—/8—/✓No———0000/33 (0.0%)0/269 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Albizia kalkora
オオバネムノキ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———013751/131 (0.8%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Albizia retusa
ヤエヤマネムノキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———013751/131 (0.8%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Astragalus schelichovii
カラフトモメンヅル		——————/——/—No———063753/1617 (0.2%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Astragalus tokachiensis
トカチオウギ		——✓✓✓—/——/—No———063753/1617 (0.2%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Astragalus yamamotoi
カリバオウギ		—✓✓✓✓—/——/—No———063753/1617 (0.2%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hedysarum hedysaroides
カラフトゲンゲ		—✓✓✓✓—/4—/—No———003750/157 (0.0%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Indigofera kirilowii
チョウセンニワフジ		—✓✓✓✓—/1—/—No———003750/505 (0.0%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lespedeza argyrophylla
コシキジマハギ		———✓✓—/——/—No———013751/65 (1.5%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oxytropis japonica var. sericea
エゾオヤマノエンドウ		——✓✓✓—/——/—No———013751/274 (0.4%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oxytropis shokanbetsuensis
マシケゲンゲ		———✓✓—/——/—No———013751/274 (0.4%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Uraria lagopodoides
オオバフジボグサ		—✓—✓——/2—/—No———003750/9 (0.0%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vigna minima var. minima
ヒメツルアズキ		——————/——/—No———0353759/96 (9.4%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vigna vexillata var. tsusimensis
アカササゲ		—✓—✓✓—/——/—No———0353759/96 (9.4%)157/16195 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cerasus sargentii var. akimotoi
キリタチヤマザクラ		————✓—/——/—No———06033321/387 (5.4%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crataegus chlorosarca
クロミサンザシ		—✓✓✓✓—/6—/—No———033332/249 (0.8%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Fragaria nipponica var. yakusimensis
ヤクシマシロバナヘビイチゴ		—✓—✓✓—/——/—No———1253338/36 (22.2%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Malus spontanea
ノカイドウ		CR✓✓✓✓—/2—/—No———014033335/94 (37.2%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Potentilla matsumurae var. yuparensis
ユウバリキンバイ		——✓✓✓—/——/—No———043332/384 (0.5%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Prunus hisauchiana
ヤブザクラ		———✓——/——/—No———06033321/387 (5.4%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Prunus incisa var. bukosanensis
ブコウマメザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———06033321/387 (5.4%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Prunus tamaclivorum
ホシザクラ		———✓——/——/—No———06033321/387 (5.4%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyrus calleryana
マメナシ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0183338/74 (10.8%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyrus ussuriensis var. ussuriensis
ミチノクナシ		—✓✓✓——/2—/—No———0183338/74 (10.8%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhodotypos scandens
シロヤマブキ		—✓✓✓✓—/6—/—No———003330/1 (0.0%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rubus chingii
ゴショイチゴ		—✓✓✓✓—/4✓/✓No———0133336/753 (0.8%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sanguisorba japonensis
エゾノトウウチソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———003330/24 (0.0%)118/3846 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaeagnus takeshitae
カツラギグミ		——✓✓✓—/——/—No———0262/77 (2.6%)6/92 (6.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaeagnus yakusimensis
ヤクシマグミ		—✓—✓✓—/2—/—No———0262/77 (2.6%)6/92 (6.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhamnus ishidae
ミヤマハンモドキ		———✓✓—/——/—No———00180/120 (0.0%)6/928 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elatostema lineolatum var. majus
ホソバノキミズ		—✓—✓✓—/——/—No———00120/211 (0.0%)4/1111 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elatostema platyphyllum
ランダイミズ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00120/211 (0.0%)4/1111 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lecanthus peduncularis
チョクザキミズ		—✓✓✓✓—/4—/—No———00120/2 (0.0%)4/1111 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nanocnide pilosa
トウカテンソウ		—✓—✓✓—/——/—No———00120/8 (0.0%)4/1111 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Betula apoiensis
アポイカンバ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———03232/83 (2.4%)13/211 (6.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trichosanthes ovigera var. boninensis
ムニンカラスウリ		———✓✓—/——/—No———021892/107 (1.9%)87/970 (9.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Elaeocarpus multiflorus
ナガバコバンモチ		LC—✓✓✓—/3—/—No———0141/136 (0.7%)2/262 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Discocleidion ulmifolium
エノキフジ		—✓✓✓✓—/——/—No———00820/2 (0.0%)46/3658 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphorbia hirta var. glaberrima
テリハニシキソウ		————✓—/——/—No———0228215/1295 (1.2%)46/3658 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphorbia pekinensis subsp. asoensis
アソタイゲキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0228215/1295 (1.2%)46/3658 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphorbia sparrmannii
ボロジノニシキソウ		——————/——/—No———0228215/1295 (1.2%)46/3658 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phyllanthus liukiuensis
ハナコミカンボク		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/23 (0.0%)3/887 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Salix nakamurana subsp. yezoalpina
エゾノタカネヤナギ		—✓✓✓✓—/——/—No———0336613/462 (2.8%)30/888 (3.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viola epipsiloides
タニマスミレ		——✓✓✓—/——/—No———0774/413 (1.0%)4/650 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viola sacchalinensis f. alpina
アポイタチツボスミレ		————✓—/——/—No———0774/413 (1.0%)4/650 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viola thibaudieri
タデスミレ		——✓✓✓—/——/—No———0774/413 (1.0%)4/650 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viola utchinensis
オキナワスミレ		CR—✓✓✓—/——/—No———0774/413 (1.0%)4/650 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydrobryum puncticulatum
ヤクシマカワゴロモ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0000/41 (0.0%)0/404 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hypericum ascyron subsp. ascyron var. longistylum
コウライトモエソウ		——————/——/—No———010105/364 (1.4%)5/435 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hypericum oliganthum
アゼオトギリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———010105/364 (1.4%)5/435 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Geranium shikokianum var. kaimontanum
カイフウロ		—✓✓———/——/—No———011359/185 (4.9%)29/531 (5.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Geranium shikokianum var. yoshiianum
ヤクシマフウロ		—✓✓✓✓—/——/—No———011359/185 (4.9%)29/531 (5.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lumnitzera racemosa
ヒルギモドキ		LC✓✓✓✓—/4—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		1.32 Gbp
124		2,239
37.2 Mbp		1252/3 (66.7%)5/293 (1.7%)2022-07-05
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rotala rotundifolia
ホザキキカシグサ		LC✓✓✓✓—/4—/—No———00230/20 (0.0%)10/411 (2.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Melastoma tetramerum var. pentapetalum
ハハジマノボタン		—✓—✓✓—/2—/—No———0554/60 (6.7%)4/3333 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Choerospondias axillaris
チャンチンモドキ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———00130/1 (0.0%)6/577 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acer miyabei f. shibatae
シバタカエデ		—✓——✓—/——/—No———07264/170 (2.4%)12/1133 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acer pictum subsp. taishakuense
タイシャクイタヤ		—✓✓✓✓—/3—/—No———07264/170 (2.4%)12/1133 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Melicope grisea var. crassifolia
アツバシロテツ		—✓—✓✓—/3—/—No———001010/146 (0.0%)36/1481 (2.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tilia mandshurica var. rufovillosa
ツクシボダイジュ		———✓✓—/——/—No———011401/41 (2.4%)65/2547 (2.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Daphnimorpha capitellata
ツチビノキ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/2 (0.0%)6/563 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arabidopsis halleri subsp. gemmifera var. umezawana
リシリハタザオ		——————/——/—No———63145506/27 (22.2%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardamine arakiana
オオマルバコンロンソウ		——✓✓✓—/——/—No———0125507/226 (3.1%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardamine kiusiana
タカチホガラシ		—✓—✓✓—/——/—No———0125507/226 (3.1%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardamine pratensis
ハナタネツケバナ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0125507/226 (3.1%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardamine schinziana
エゾノジャニンジン		—✓✓✓✓—/——/—No———0125507/226 (3.1%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardamine trifida
ミヤウチソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0125507/226 (3.1%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cochlearia oblongifolia
トモシリソウ		—✓—✓✓—/——/—No———035503/21 (14.3%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba japonica
ナンブイヌナズナ		—✓✓✓✓—/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba kitadakensis
キタダケナズナ		—✓✓✓✓—/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba oiana
ヤツガタケナズナ		———✓✓—/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba sachalinensis var. sachalinensis
モイワナズナ		——————/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba sakuraii var. sakuraii
トガクシナズナ		——————/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Draba shiroumana
シロウマナズナ		—✓✓✓✓—/——/—No———045502/330 (0.6%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Isatis tinctoria var. tinctoria
ハマタイセイ		——————/——/—No———345502/40 (5.0%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Noccaea cochleariformis
タカネグンバイ		—✓✓✓——/2—/—No———045503/85 (3.5%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Subularia aquatica
ハリナズナ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———005500/2 (0.0%)111/3430 (3.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Santalum boninense
ムニンビャクダン		—✓✓✓✓—/3—/—No———0551/21 (4.8%)1/46 (2.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Persicaria pulchra
アラゲタデ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———04272/138 (1.4%)15/984 (1.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rumex nepalensis subsp. andreaeanus
キブネダイオウ		————✓—/——/—No———03273/124 (2.4%)15/984 (1.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rumex trisetifer
ニセコガネギシギシ		—✓✓✓✓—/4—/—No———03273/124 (2.4%)15/984 (1.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arenaria katoana var. lanceolata
アポイツメクサ		————✓—/——/—No———02361/103 (1.0%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Minuartia biflora
ハイツメクサ		—✓✓✓✓✓/5—/—No———00360/18 (0.0%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Silene hidaka-alpina
カムイビランジ		——✓✓✓—/——/—No———010367/598 (1.2%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Silene repens var. latifolia
チシママンテマ		———✓✓—/——/—No———010367/598 (1.2%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Silene repens var. repens
カラフトマンテマ		———✓——/——/—No———010367/598 (1.2%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stellaria diandra var. yakumontana
ヤクシマサワハコベ		————✓—/——/—No———00360/1 (0.0%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stellaria humifusa
エゾハコベ		LC✓✓✓✓—/5—/—No———00360/167 (0.0%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stellaria pterosperma
エゾイワツメクサ		—✓✓✓✓—/——/—No———00360/167 (0.0%)23/2100 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cardiandra amamiohsimensis
アマミクサアジサイ		EN✓✓✓✓—/2—/—No———0661/136 (0.7%)1/262 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Deutzia yaeyamensis
ヤエヤマヒメウツギ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0060/74 (0.0%)1/262 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydrangea acuminata subsp. yakushimensis
ヤクシマルリアジサイ		—✓——✓—/——/—No———0661/136 (0.7%)1/262 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hydrangea marunoi
キモツキクサアジサイ		—✓✓✓✓—/——/—No———0661/136 (0.7%)1/262 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polemonium caeruleum subsp. laxiflorum
カラフトハナシノブ		————✓—/——/—No———0020/30 (0.0%)1/416 (0.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eurya boninensis
ムニンヒサカキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0010/73 (0.0%)1/227 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Planchonella boninensis
ムニンノキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0070/121 (0.0%)4/1060 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diospyros eriantha
ヤワラケガキ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———0772/434 (0.5%)2/468 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Androsace chamaejasme subsp. lehmanniana
トチナイソウ		—✓—✓✓—/3—/—No———02171/97 (1.0%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ardisia cymosa
シナヤブコウジ		—✓—✓✓—/4—/—No———00170/243 (0.0%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ardisia walkeri
オオツルコウジ		—✓—✓——/——/—No———00170/243 (0.0%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cortusa matthioli subsp. pekinensis var. sachalinensis
サクラソウモドキ		———✓✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lysimachia candida
トウサワトラノオ		—✓✓✓✓—/5—/—No———02171/169 (0.6%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lysimachia tashiroi
オニコナスビ		——✓✓✓—/——/—No———02171/169 (0.6%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula hidakana f. kamuiana
カムイコザクラ		————✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula kisoana var. kisoana
カッコソウ		—✓✓———/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula kisoana var. shikokiana
シコクカッコソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula macrocarpa
ヒメコザクラ		——✓✓✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula reinii var. myogiensis
ミョウギイワザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Primula yuparensis
ユウバリコザクラ		—✓✓✓✓—/——/—No———08173/375 (0.8%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stimpsonia chamaedryoides
ホザキザクラ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00170/1 (0.0%)8/1493 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Symplocos boninensis
ムニンクロキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0111/210 (0.5%)1/211 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Symplocos konishii
コニシハイノキ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0111/210 (0.5%)1/211 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Symplocos pergracilis
チチジマクロキ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/210 (0.5%)1/211 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chamaedaphne calyculata
ヤチツツジ		LC✓✓✓✓—/7—/—No———00550/1 (0.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyrola minor
エゾイチヤクソウ		—✓✓✓✓—/6—/—No———00550/32 (0.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron amagianum
アマギツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron amakusaense
アマクサミツバツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron dilatatum var. boreale
ヒダカミツバツツジ		—✓—✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron keiskei var. hypoglaucum
ウラジロヒカゲツツジ		——✓✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron lasiophyllum var. lasiophyllum
ムラサキツリガネツツジ		——————/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron latoucheae var. amamiense
アマミセイシカ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron mayebarae var. ohsumiense
オオスミミツバツツジ		——✓✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron uwaense
トキワバイカツツジ		—✓✓✓✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron viscistylum
タカクマミツバツツジ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron yakushimense
ヤクシマヨウラクツツジ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhododendron yedoense var. hallaisanense
チョウセンヤマツツジ		————✓—/——/—No———0225516/793 (2.0%)36/3023 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nothapodytes nimmonianus
クサミズキ		——————/——/—No———0111/6 (16.7%)1/117 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Benkara sinensis
ヒジハリノキ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00460/7 (0.0%)29/6195 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Exallage chrysotricha
コバンムグラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00460/8 (0.0%)29/6195 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Galium triflorum
ヤツガタケムグラ		LC✓✓✓✓—/6—/—No———07465/270 (1.9%)29/6195 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Comastoma pulmonarium subsp. sectum
サンプクリンドウ		———✓✓—/——/—No———0040/11 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentiana laeviuscula
コヒナリンドウ		———✓✓—/——/—No———0343/280 (1.1%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentiana yakushimensis
ヤクシマリンドウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0343/280 (1.1%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentianella amarella subsp. takedae
オノエリンドウ		———✓✓—/——/—No———0040/99 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentianella amarella subsp. yuparensis
ユウバリリンドウ		———✓✓—/——/—No———0040/99 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentianopsis contorta
チチブリンドウ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0040/19 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gentianopsis yabei var. akaisiensis
アカイシリンドウ		——✓✓✓—/——/—No———0040/19 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lomatogonium carinthiacum
ヒメセンブリ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0040/16 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tripterospermum distylum
ハナヤマツルリンドウ		—✓✓✓✓—/——/—No———0040/34 (0.0%)4/1132 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Urceola micrantha
ゴムカズラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———00260/7 (0.0%)19/3270 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vincetoxicum austrokiusianum
ナンゴクカモメヅル		—✓—✓✓—/1—/—No———00260/139 (0.0%)19/3270 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vincetoxicum izuense
イズカモメヅル		—✓—✓✓—/1—/—No———00260/139 (0.0%)19/3270 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Vincetoxicum matsumurae
ヒメイヨカズラ		—✓✓✓✓—/——/—No———00260/139 (0.0%)19/3270 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lithospermum erythrorhizon
ムラサキ		—✓✓✓✓—/1—/—Yes (3)Contig,
Reference		367 Mbp
100		2,451
316 kbp		3381/64 (1.6%)5/1321 (0.4%)2021-08-12
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trigonotis iinumae
ツルカメバソウ		—✓————/——/—No———0080/37 (0.0%)5/1321 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trigonotis radicans var. sericea
チョウセンカメバソウ		—✓✓✓——/——/—No———0080/37 (0.0%)5/1321 (0.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cuscuta australis
マメダオシ		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Contig,
Reference		263 Mbp
97.6		218
3.63 Mbp		14174/190 (2.1%)11/1198 (0.9%)2018-06-22
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cuscuta chinensis
ハマネナシカズラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———04174/190 (2.1%)11/1198 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Evolvulus alsinoides var. rotundifolius
マルバアサガオガラクサ		—✓—✓✓—/——/—No———00170/14 (0.0%)11/1198 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lepistemon binectariferum var. trichocarpum
オオバケアサガオ		———✓——/——/—No———00170/011/1198 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Forsythia togashii
ショウドシマレンギョウ		——✓✓✓—/——/—No———05663/21 (14.3%)40/595 (6.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Osmanthus insularis var. okinawensis
ヤナギバモクセイ		———✓✓—/——/—No———01661/42 (2.4%)40/595 (6.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Osmanthus rigidus
オオモクセイ		—✓✓✓✓—/1—/—No———01661/42 (2.4%)40/595 (6.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lagotis takedana
ユウバリソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———00530/27 (0.0%)39/1680 (2.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lagotis yesoensis
ホソバウルップソウ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00530/27 (0.0%)39/1680 (2.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Limnophila fragrans
エナシシソクサ		——✓✓✓—/——/—No———00530/10 (0.0%)39/1680 (2.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trapella sinensis
ヒシモドキ		—✓✓✓✓—/——/—No———00130/1 (0.0%)8/59 (13.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Veronica linariifolia var. linariifolia
ホソバヒメトラノオ		——————/——/—No———014537/388 (1.8%)39/1680 (2.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Veronicastrum noguchii
イスミスズカケ		—✓✓✓✓—/——/—No———00530/16 (0.0%)39/1680 (2.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scrophularia kakudensis var. toyamae
ツシマヒナノウスツボ		————✓—/——/—No———0060/210 (0.0%)3/1032 (0.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Callicarpa longissima
タカクマムラサキ		LC✓✓✓✓—/1—/—No———01841/74 (1.4%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Callicarpa parvifolia
ウラジロコムラサキ		—✓✓✓✓—/3—/—No———01841/74 (1.4%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Matsumurella chinensis
オオヒメキセワタ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00840/5 (0.0%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Salvia pygmaea var. simplicior
アマミタムラソウ		—✓—✓✓—/1—/—No———014848/723 (1.1%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scutellaria longituba
ムニンタツナミソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———06844/278 (1.4%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scutellaria shikokiana var. pubicaulis
ケミヤマナミキ		———✓✓—/——/—No———06844/278 (1.4%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Teucrium veronicoides var. veronicoides
エゾニガクサ		——————/——/—No———02841/115 (0.9%)52/4363 (1.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mazus goodenifolius
ヒメサギゴケ		—✓✓———/1—/—No———0000/37 (0.0%)0/38 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphrasia insignis subsp. iinumae var. idzuensis
イズコゴメグサ		—✓—✓✓—/——/—No———05183/110 (2.7%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphrasia microphylla
ナヨナヨコゴメグサ		——✓✓✓—/——/—No———05183/110 (2.7%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphrasia multifolia var. multifolia
ツクシコゴメグサ		———✓——/——/—No———05183/110 (2.7%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Monochasma savatieri
ウスユキクチナシグサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———00180/2 (0.0%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Orobanche boninsimae
シマウツボ		—✓✓✓✓—/1—/—No———04184/88 (4.5%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pedicularis oederi
キバナシオガマ		—✓✓✓✓—/5—/—No———00180/422 (0.0%)14/1421 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Utricularia exoleta
ミカワタヌキモ		LC✓—✓✓—/——/—No———1252/210 (1.0%)5/348 (1.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ilex mertensii var. beecheyi
ムニンモチ		—✓—✓✓—/3—/—No———0553/342 (0.9%)3/345 (0.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Adenophora palustris
ヤチシャジン		—✓✓✓✓—/1—/—No———01151/67 (1.5%)11/1545 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Adenophora takedae var. howozana
ホウオウシャジン		———✓✓—/——/—No———01151/67 (1.5%)11/1545 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Adenophora tashiroi
シマシャジン		—✓✓✓✓—/——/—No———01151/67 (1.5%)11/1545 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Campanula glomerata subsp. speciosa
ヤツシロソウ		—✓——✓—/——/—No———02152/461 (0.4%)11/1545 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lobelia zeylanica
マルバミゾカクシ		LC✓✓✓✓—/3—/—No———05153/196 (1.5%)11/1545 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Achillea ptarmica subsp. macrocephala var. yezoensis
ホソバエゾノコギリ		———✓✓—/——/—No———001880/83 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Arnica sachalinensis
オオウサギギク		—✓✓✓✓—/1—/—No———021881/32 (3.1%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Artemisia gilvescens
ワタヨモギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0121886/509 (1.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Artemisia kitadakensis
キタダケヨモギ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0121886/509 (1.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Artemisia koidzumii var. megaphylla
オオバヨモギ		———✓✓—/——/—No———0121886/509 (1.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Artemisia momiyamae
ユキヨモギ		—✓—✓✓—/1—/—No———0121886/509 (1.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aster asagrayi var. asagrayi
イソノギク		—✓————/——/—No———001880/159 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aster asagrayi var. walkeri
ヨナクニイソノギク		——————/——/—No———001880/159 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aster kantoensis
カワラノギク		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/159 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aster rugulosus var. shibukawaensis
シブカワシロギク		—✓—✓✓—/——/—No———001880/159 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Aster tenuipes
クルマギク		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/159 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chrysanthemum zawadskii subsp. naktongense
チョウセンノギク		—✓————/1—/—No———041883/46 (6.5%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium aidzuense
アイズヒメアザミ		—✓✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium ashinokuraense
アシノクラアザミ		——✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium chikabumiense
チカブミアザミ		———✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium confertissimum
コイブキアザミ		—✓✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium ganjuense
ガンジュアザミ		———✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium happoense
ハッポウアザミ		——✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium opacum
カツラカワアザミ		——✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium pseudosuffultum
ニセツクシアザミ		—✓—✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium tanegashimense
タネガシマアザミ		——✓✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium tashiroi var. tashiroi
ワタムキアザミ		———✓——/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cirsium tenue
ウスバアザミ		———✓✓—/——/—No———041882/240 (0.8%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidiastrum ameristophyllum
ユズリハワダン		—✓✓✓✓—/3—/—No———001880/14 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidiastrum lanceolatum var. daitoense
ダイトウワダン		——————/——/—No———001880/14 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Crepidiastrum linguifolium
ヘラナレン		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/14 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dendrocacalia crepidifolia
ワダンノキ		—✓✓✓✓—/4—/—No———001880/1 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Erigeron thunbergii subsp. glabratus var. angustifolius
アポイアズマギク		—✓✓✓✓—/——/—No———041883/185 (1.6%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Eschenbachia leucantha
ネバリイズハハコ		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/4 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hypochaeris crepidioides
エゾコウゾリナ		———✓✓—/——/—No———001880/49 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ixeridium beauverdianum
ホソバニガナ		—✓—✓✓—/2—/—No———001880/12 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ixeridium dentatum subsp. nipponicum
イソニガナ		—✓✓✓✓—/1—/—No———001880/12 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leontopodium discolor
エゾウスユキソウ		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/48 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leontopodium hayachinense
ハヤチネウスユキソウ		——✓✓✓—/——/—No———001880/48 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leucanthemella linearis
ミコシギク		—✓✓✓✓—/1—/—No———001880/2 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ligularia angusta
ヤマタバコ		——✓✓✓—/——/—No———001880/97 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Myriactis japonensis
ヒメキクタビラコ		——✓✓✓—/——/—No———001880/5 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parasenecio farfarifolius var. acerinus
ミヤマコウモリソウ		———✓✓—/——/—No———001880/52 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parasenecio shikokianus
ヒメコウモリソウ		——————/——/—No———001880/52 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pseudognaphalium hypoleucum
アキノハハコグサ		—✓✓✓✓—/1—/—No———021881/100 (1.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Saussurea kenjihorieana
カムイトウヒレン		——————/——/—No———021882/370 (0.5%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Saussurea modesta
ネコヤマヒゴタイ		——✓✓✓—/——/—No———021882/370 (0.5%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Saussurea nipponica subsp. savatieri var. higomontana
ツクシトウヒレン		——————/——/—No———021882/370 (0.5%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Saussurea yanagisawae var. yanagisawae
ウスユキトウヒレン		——————/——/—No———021882/370 (0.5%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Senecio argunensis
コウリンギク		—✓—✓✓—/——/—No———041882/39 (5.1%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Solidago horieana
ソラチアオヤギバナ		——✓✓✓—/——/—No———021882/138 (1.4%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Syneilesis tagawae var. tagawae
ヤブレガサモドキ		——————/——/—No———001880/4 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taimingasa amagiensis
イズカニコウモリ		—✓✓✓✓—/1—/—No———001880/3 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taraxacum ceratophorum
クモマタンポポ		—✓✓✓✓✓/6—/—No———011881/476 (0.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taraxacum kuzakaiense
クザカイタンポポ		———✓✓—/——/—No———011881/476 (0.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taraxacum yuparense var. yuparense
タカネタンポポ		——————/——/—No———011881/476 (0.2%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tephroseris flammea subsp. flammea
タカネコウリンギク		———✓——/——/—No———001880/34 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tephroseris furusei
キバナコウリンカ		—✓✓✓✓—/——/—No———001880/34 (0.0%)107/16313 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viburnum carlesii var. carlesii
オオチョウジガマズミ		—✓✓✓——/——/—No———0020/175 (0.0%)1/206 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Viburnum koreanum
ヒロハガマズミ		—✓—✓✓—/2—/—No———0020/175 (0.0%)1/206 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lonicera alpigena subsp. glehnii var. watanabeana
スルガヒョウタンボク		———✓✓—/——/—No———0272/175 (1.1%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lonicera kurobushiensis
クロブシヒョウタンボク		—✓✓✓✓—/——/—No———0272/175 (1.1%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lonicera linderifolia var. konoi
コゴメヒョウタンボク		—✓✓✓——/2—/—No———0272/175 (1.1%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lonicera linderifolia var. linderifolia
ヤブヒョウタンボク		———✓——/——/—No———0272/175 (1.1%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lonicera ramosissima var. kinkiensis
キンキヒョウタンボク		———✓✓—/——/—No———0272/175 (1.1%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Patrinia sibirica
チシマキンレイカ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0070/13 (0.0%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Patrinia triloba var. takeuchiana
オオキンレイカ		—✓✓✓✓—/——/—No———0070/13 (0.0%)5/684 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pittosporum boninense var. chichijimense
オオミノトベラ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/109 (0.9%)1/135 (0.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica minamitanii
ヒュウガセンキュウ		—✓✓✓✓—/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica saxicola
イシヅチボウフウ		——✓✓✓—/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica shikokiana var. mayebarana
クマノダケ		———✓✓—/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica stenoloba var. valens
トカチトウキ		——————/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica ubatakensis
ウバタケニンジン		—✓✓✓——/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Angelica yoshinagae
トサボウフウ		———✓✓—/——/—No———01281/110 (0.9%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Bupleurum ajanense
レブンサイコ		———✓✓—/——/—No———00280/99 (0.0%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chamaele decumbens var. micrantha
ヤクシマセントウソウ		———✓✓—/——/—No———00280/10 (0.0%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Heracleum sphondylium var. turugisanense
ツルギハナウド		—✓————/——/—No———03282/100 (2.0%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pimpinella thellungiana var. gustavohegiana
ツクシボウフウ		———✓✓—/——/—No———00280/89 (0.0%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sanicula kaiensis
ヤマナシウマノミツバ		———✓✓—/——/—No———02282/47 (4.3%)19/3109 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sanicula tuberculata
フキヤミツバ		——✓✓✓—/——/—No———02282/47 (4.3%)19/3109 (0.6%)—

Algae
藻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara altaica
タカホコシャジクモ		—✓✓✓——/1—/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara corallina var. corallina
オウシャジクモ		——————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara fibrosa subsp. gymnopitys
イトシャジクモ		——————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara leptospora
ソデマクリシャジクモ		—✓—✓——/1—/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara vulgaris var. nitelloides
レイセンジシャジクモ		——————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chara vulgaris var. vulgaris
クサシャジクモ		——————/——/—No———0111/68 (1.5%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lamprothamnium succinctum
シラタマモ		—✓—✓——/1—/—No———0010/7 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella acuminata var. subglomerata
トガリフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella allenii var. allenii
アレンフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella comptonii
ジュズフサフラスコモ		—✓—✓——/1—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella flexilis var. bifurcata
チュウゼンジフラスコモ		—✓————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella furcata var. furcata
フタマタフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella gracilis
キヌイトフラスコモ		—✓✓✓——/2—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella megacarpa
アメリカフラスコモ		———✓——/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella megaspora
セイロンフラスコモ		—✓————/1—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella microcarpa var. microcarpa
チリフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella mirabilis var. inokasiraensis
イノカシラフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella mirabilis var. mirabilis
ミノリノフラスコモ		——————/——/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella moriokae
モリオカフラスコモ		—✓————/1—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella mucronata
サキボソフラスコモ		LC✓✓✓——/2—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella opaca
カラスフラスコモ		—✓✓✓——/3—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella pulchella
ハデフラスコモ		—✓—✓——/2—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitella spiciformis
ナガホノフラスコモ		—✓—✓——/2—/—No———0010/64 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nitellopsis obtusa
ホシツリモ		—✓✓✓——/2—/✓No———0010/1 (0.0%)1/194 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Caulerpa fastigiata
ケイワズタ		—✓✓✓——/——/—No———0111/93 (1.1%)1/95 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dichotomosiphon tuberosus
チョウチンミドロ		—✓✓✓——/1—/—No———0000/1 (0.0%)0/52 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dasycladus vermicularis
ケブカフデモ		—✓✓✓——/——/—No———0000/2 (0.0%)0/14 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Blidingia ramifera
カワアオノリ		—✓—✓——/1—/—No———0060/30 (0.0%)4/748 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ulva limnetica
ウムトゥチュラノリ		—✓—✓——/2—/—No———0664/701 (0.6%)4/748 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyropia kuniedae
マルバアサクサノリ		—✓————/——/—No———0453/138 (2.2%)4/356 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyropia tenera
アサクサノリ		—✓✓✓—✓/1✓/✓No———0453/138 (2.2%)4/356 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pyropia tenuipedalis
カイガラアマノリ		—✓————/——/—No———0453/138 (2.2%)4/356 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Batrachospermum gelatinosum f. spermatoinvolucrum
ミョウテンジカワモズク		——————/——/—No———0000/18 (0.0%)0/168 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Kumanoa gracillima
ミナミイトカワモズク		—✓—✓—✓/1—/—No———0000/43 (0.0%)0/168 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Kumanoa virgato-decaisneana
ニシノカワモズク		———✓——/——/—No———0000/43 (0.0%)0/168 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sirodotia suecica
セイヨウユタカカワモズク		—✓✓✓—✓/1—/✓No———0000/18 (0.0%)0/168 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Torularia atra
イシカワモズク		—✓✓✓——/——/—No———0000/3 (0.0%)0/168 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mimica amakusaensis
アマクサキリンサイ		——————/——/—No———0030/1 (0.0%)3/121 (2.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nemalionopsis shawii
オキチモズク		—✓✓——✓/1—/—No———0000/8 (0.0%)0/24 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thorea okadae
チスジノリ		—✓———✓/1—/—No———0000/16 (0.0%)0/24 (0.0%)—

Bryophytes
蘚苔類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Haplomitrium hookeri
キレハコマチゴケ		—✓✓✓✓—/1✓/✓No———0111/7 (14.3%)1/7 (14.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mannia triandra
イワゼニゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0030/12 (0.0%)2/59 (3.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peltolepis quadrata
リシリゼニゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0000/1 (0.0%)0/8 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sauteria spongiosa
ジンチョウゴケ		LC✓✓✓✓—/——/—No———0000/3 (0.0%)0/8 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sandeothallus japonicus
ヤマトヤハズゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/00/0—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pleurozia purpurea
ミズゴケモドキ		—✓✓✓✓✓/7✓/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		1.06 Gbp
58		105
22.2 Mbp		1111/7 (14.3%)1/8 (12.5%)2025-04-29
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Barbilophozia hatcheri
ヒメモミジゴケ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0020/6 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hattoria yakushimensis
ヤクシマアミバゴケ		VU✓✓✓✓—/——/—No———0020/1 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neoorthocaulis floerkei
ミツデモミジゴケ		—✓✓✓✓—/6—/—No———0020/3 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schizophyllopsis bidens
マエバラアミバゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0020/2 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sphenolobopsis pearsonii
キノボリヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0020/1 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sphenolobus saxicola
カラフトイチョウゴケ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0020/2 (0.0%)2/54 (3.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nowellia aciliata
フクレヤバネゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0010/4 (0.0%)1/60 (1.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cephaloziella elachista
ケスジヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/38 (0.0%)0/62 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scapania cuspiduligera
ミゾゴケモドキ		—✓✓✓✓—/5—/—No———0111/71 (1.4%)1/104 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Scapania verrucosa
イボヒシャクゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0111/71 (1.4%)1/104 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cryptocoleopsis imbricata
エゾヒメソロイゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/76 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Marsupella boeckii
イトミゾゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0000/35 (0.0%)0/76 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Marsupella vermiformis
ミジンコミゾゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/35 (0.0%)0/76 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nardia breidleri
キレハウロコゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/10 (0.0%)0/76 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Jungermannia borealis
ヤツガタケツボミゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0010/16 (0.0%)1/46 (2.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Mesoptychia collaris
オオイチョウゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0111/19 (5.3%)1/46 (2.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neolepidozia mamillosa
ヤエヤマスギバゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0020/12 (0.0%)2/193 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Plagiochila shangaica
シャンハイハネゴケ		———✓✓—/——/—No———0222/244 (0.8%)2/265 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pseudolepicolea andoi
サトミヨツデゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/6 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Trichocolea japonica
イボイボムクムクゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/24 (0.0%)0/29 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schistochila nuda
ケナシオヤコゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schistochila sciurea
ヤクシマオヤコゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/63 (0.0%)0/63 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Frullania iriomotensis
イリオモテヤスデゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0111/192 (0.5%)1/192 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Frullania repandistipula
イボヤスデゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0111/192 (0.5%)1/192 (0.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Archilejeunea amakawana
アマカワヒメゴヘイゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/6 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cheilolejeunea ryukyuensis
リュウキュウシゲリゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0010/74 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cololejeunea ceratilobula
キララヨウジョウゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0010/84 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cololejeunea sintenisii
ホソバイトクズゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/84 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cololejeunea subminutilobula
オガサワラキララゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/84 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Drepanolejeunea obtusifolia
マルバサンカクゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/32 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lejeunea apiculata
ツメクサリゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/152 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lejeunea sordida
オオハラバクサリゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/152 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stictolejeunea iwatsukii
ゴマダラクサリゴケ		———✓✓—/——/—No———0010/1 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thysananthus retusus
ヒメゴヘイゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0010/26 (0.0%)1/715 (0.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diphyscium perminutum
コバノイクビゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0111/11 (9.1%)1/14 (7.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Diphyscium suzukii
スズキイクビゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0111/11 (9.1%)1/14 (7.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Luisierella barbula
クロコゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0050/1 (0.0%)5/611 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Schistidium maritimum
ウシオギボウシゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0131/96 (1.0%)3/223 (1.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Seligeria tristichoides
エゾキヌシッポゴケ		—✓✓✓✓—/4—/—No———0000/13 (0.0%)0/28 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Syrrhopodon kiiensis
キイアミゴケ		————✓—/——/—No———0000/40 (0.0%)0/156 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Syrrhopodon yakushimensis
ヤクシマアミゴケ		———✓✓—/——/—No———0000/40 (0.0%)0/156 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Campylopodium medium
ヘビゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0040/3 (0.0%)4/159 (2.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pachyneuropsis perinvoluta
フチドリコゴケ		———✓✓—/——/—No———0050/1 (0.0%)5/611 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Syntrichia gemmascens
ムカゴネジレゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0252/90 (2.2%)5/611 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Splachnum ampullaceum
オオツボゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		252 Mbp
362		54,927
19.1 kbp		1121/9 (11.1%)2/55 (3.6%)2025-04-29
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Splachnum melanocaulon
ヒメハナガサゴケ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0121/9 (11.1%)2/55 (3.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Breutelia arundinifolia
ウワバミゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0030/11 (0.0%)3/79 (3.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Distichophyllum obtusifolium
マルバツガゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0111/43 (2.3%)1/102 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Podperaea krylovii
ヒメコガネハイゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0030/1 (0.0%)3/56 (5.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taxiphyllopsis iwatsukii
キャラハゴケモドキ		—✓—✓✓—/1—/—No———0030/1 (0.0%)3/56 (5.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Haplohymenium flagelliforme
ムチエダイトゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0000/5 (0.0%)0/16 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Limnohypnum mizushimae
オニシメリゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0040/1 (0.0%)3/109 (2.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Macrothamnium macrocarpum
フウチョウゴケ		—✓✓✓✓—/3—/—No———0050/4 (0.0%)4/29 (13.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Neodolichomitra yunnanensis
オオシカゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0050/1 (0.0%)4/29 (13.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Leucodon alpinus
ツヤダシタカネイタチゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0010/19 (0.0%)1/26 (3.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Taiwanobryum anacamptolepis
モミノキゴケ		——✓✓✓—/——/—No———0000/8 (0.0%)0/29 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Plagiothecium obtusissimum
マッカリタケナガゴケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0141/48 (2.1%)4/86 (4.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Calyptothecium philippinense
ミミヒラゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/6 (0.0%)0/48 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gollania japonica
サジバラッコゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/9 (0.0%)1/131 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gollania splendens
オオカギイトゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———0010/9 (0.0%)1/131 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Clastobryellina ceylonensis
ヒロハコモチイトゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/4 (0.0%)0/128 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Clastobryum cuculligerum
イボミスジヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/128 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Clastobryum glabrescens
ミスジヤバネゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/6 (0.0%)0/128 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Acroporium secundum
シマフデノホゴケ		—✓—✓✓—/2—/—No———0000/18 (0.0%)0/101 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Meiothecium microcarpum
マムシゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—No———0000/4 (0.0%)0/101 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Radulina borbonica
リュウキュウカギホソエゴケ		—✓✓✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/101 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Filibryum yakoushimae
ヤクシマヒラツボゴケ		———✓✓—/——/—No———0030/2 (0.0%)3/56 (5.4%)—

Lichen
地衣類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dermatocarpon tuzibei
ミヤマウロコゴケ		—✓—✓——/1—/—No———0272/32 (6.2%)5/522 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Dermatocarpon vellereum
クロウラカワイワタケ		—✓✓✓——/——/—No———0272/32 (6.2%)5/522 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cladonia koyaënsis
コウヤハナゴケ		———✓——/——/—No———0363726/362 (7.2%)27/400 (6.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gymnoderma coccocarpum
オオツブミゴケ		—✓—✓✓—/1—/—No———00370/1 (0.0%)27/400 (6.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Gymnoderma insulare
ツブミゴケ		EN—✓✓——/——/—No———00370/1 (0.0%)27/400 (6.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cetraria aculeata
タチクリイロトゲキノリ		—✓✓✓✓—/2—/—No———00900/24 (0.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cetrelia alaskana
タカネトコブシゴケ		—✓✓✓——/——/—No———02902/12 (16.7%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Cornicularia normoerica
ミヤマヒジキゴケ		—✓✓✓✓—/1—/—Yes (1)Scaffold,
Reference		25.7 Mbp
116		453
78.8 kbp		11901/1 (100.0%)75/1689 (4.4%)2024-09-21
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Lethariella togashii
ナヨナヨサガリゴケ		VU✓✓✓✓—/1—/—No———00900/9 (0.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Myelochroa amagiensis
アマギウメノキゴケ		——————/——/—No———00900/16 (0.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Oropogon orientalis
ヨシノミヤマクグラ		—✓—✓——/——/—No———00900/40 (0.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parmelia erumpens
アワフキカラクサゴケ		—✓—✓✓—/——/—No———02902/54 (3.7%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Usnea dasopoga
ナガヒゲサルオガセ		—✓✓✓——/——/—No———0139012/239 (5.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Usnea glabrescens
オニヒゲサルオガセ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0139012/239 (5.0%)75/1689 (4.4%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Usnea subgracilis
ニセヨコワサルオガセ		—✓✓✓——/——/✓Yes (1)Scaffold,
Reference		31.2 Mbp
18		2,787
14.8 kbp		1139012/239 (5.0%)75/1689 (4.4%)2024-09-21
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Byssoloma discordans var. flavescens
リュウキュウワタヘリゴケ		———✓✓—/——/—No———0222/20 (10.0%)2/69 (2.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereocaulon curtatoides
ニセミヤマキゴケ		———✓——/——/—No———0373/79 (3.8%)7/175 (4.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Stereocaulon wrightii
ヒロハキゴケモドキ		———✓——/——/—No———0373/79 (3.8%)7/175 (4.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sticta arctica
タカネヨロイゴケ		—✓✓✓——/——/—No———0262/322 (0.6%)6/595 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Ramalodium japonicum
ヒメキノリ		———✓——/——/—No———0050/2 (0.0%)4/351 (1.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peltigera lepidophora
ハナビラツメゴケ		—✓✓✓✓—/1—/✓No———0787/234 (3.0%)8/245 (3.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Peltigera venosa
ヒメツメゴケ		—✓✓✓✓—/1—/✓No———0787/234 (3.0%)8/245 (3.3%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Solorina crocea
アカウラヤイトゴケ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Scaffold,
Reference		93.7 Mbp
54		3,612
45.9 kbp		1181/3 (33.3%)8/245 (3.3%)2024-09-21
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pertusaria boninensis
オガサワラトリハダゴケ		——————/——/—No———06136/90 (6.7%)12/141 (8.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Umbilicaria deusta
トゲイワタケ		—✓✓✓✓—/2—/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		40.8 Mbp
47		125
1.35 Mbp		3146411/91 (12.1%)13/108 (12.0%)2022-04-29
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Umbilicaria muehlenbergii
オオウラヒダイワタケ		———✓——/1—/—No———0146411/91 (12.1%)13/108 (12.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Paulia japonica
ヤブレガサゴケ		———✓✓—/——/—No———0020/5 (0.0%)2/64 (3.1%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Thyrea latissima
オオバキセガワノリ		———✓——/——/—No———0040/6 (0.0%)3/47 (6.4%)—

Fungi
菌類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Baeospora myriadophylla
フジイロアマタケ		VU✓✓✓✓—/1—/—No———0141/6 (16.7%)3/46 (6.5%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Desarmillaria ectypa
ヤチヒロヒダタケ		—✓✓✓✓—/——/—Yes (1)Contig,
Reference		40.6 Mbp
155.54		33
4.05 Mbp		12522/4 (50.0%)28/512 (5.5%)2023-07-05
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhizopogon togasawarius
トガサワラショウロ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0333311/397 (2.8%)11/403 (2.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Rhizopogon yakushimensis
ヤクタネショウロ		EN✓✓✓✓—/——/—No———0333311/397 (2.8%)11/403 (2.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phallus hadriani
アカダマスッポンタケ		—✓✓✓✓—/2—/—No———0342/52 (3.8%)3/138 (2.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phallus rubicundus
アカダマノオオタイマツ		—✓✓✓✓—/——/—No———0342/52 (3.8%)3/138 (2.2%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Microporus ochrotinctus
ワニスタケ		—✓✓✓——/1—/—No———00850/26 (0.0%)51/1866 (2.7%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Echinodontiellum japonicum
コウヤクマンネンハリタケ		—✓—✓✓—/——/—No———0000/1 (0.0%)0/6 (0.0%)—

Saltwater fishes
海産魚類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Carcharias taurus
シロワニ		CR✓✓✓✓✓/10✓/✓No———0000/1 (0.0%)0/3 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Epinephelusmiliaris
ホウセキハタモドキ		LC✓✓✓✓✓/——/—No———0174112/135 (8.9%)29/495 (5.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Nibea albiflora
コイチ		LC✓✓✓✓✓/11✓/✓Yes (3)Chromosome,
Reference		628 Mbp
114.67		1,212
4.42 Mbp		35293/12 (25.0%)12/333 (3.6%)2018-12-05
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Bolbometoponmuricatum
カンムリブダイ		VU✓✓✓✓✓/—✓/✓No———00300/1 (0.0%)19/1018 (1.9%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Barbuligobius boehlkei
イトヒゲモジャハゼ		LC✓✓✓✓—/——/—No———00370/1 (0.0%)26/2564 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Takifugu chinensis
カラス		CR✓—✓✓✓/10✓/✓No———08124/43 (9.3%)8/204 (3.9%)—

Corals
サンゴ類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Euphyllia paraglabrescens
ハナサンゴモドキ		LC✓✓✓✓—/——/✓No———0030/4 (0.0%)3/107 (2.8%)—

Crustaceans
甲殻類

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Parabrachiella brevicapita
フタコブナガクビムシ		———✓✓—/——/—No———0000/14 (0.0%)0/72 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Phyllodurus sp.
アナジャコノハラヤドリ		——————/——/—No———0000/1 (0.0%)0/59 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Progebiophilus villosus
和名なし		———✓✓—/——/—No———0000/2 (0.0%)0/59 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Atyidae gen. sp.
ウミヌマエビ		——————/——/—No———0333/532 (0.6%)3/532 (0.6%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Upogebia carinicauda
ミナミアナジャコ		—✓✓✓✓✓/——/—No———0000/27 (0.0%)0/40 (0.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Novorostrumdecorocrus
イボテカニダマシ		——————/——/—No———00000—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Polyonyx utinomii
ウチノミカニダマシ		—✓—✓✓—/——/—No———0020/5 (0.0%)2/242 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Atoportunus dolichopus
クメジマドウクツガザミ		——✓✓✓—/——/—No———00110/1 (0.0%)5/522 (1.0%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Sestrostoma sp.
シタゴコロガニ		——————/——/—No———0050/2 (0.0%)1/119 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Tritodynamia rathbuni
オオヨコナガピンノ		——✓✓✓—/——/—No———0050/2 (0.0%)1/119 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Pinnixa banzu
バンズマメガニ		———✓✓—/——/—No———0000/27 (0.0%)0/170 (0.0%)—

Other marine invertebrates
その他無脊椎動物

Conservation
Status
in the
Japanese
Red List		Taxon Name
分類群の和名		Status
in the
IUCN
Red
List		Taxonomy
entry		Has
bacrode
sequence
in BOLD
database:
COI/other		Has
complete
mitochondrial
genome
in NCBI
Organelle
/ NCBI
Nucleotide		Genome
sequenced
and
assembled?
(number of
assemblies)		Selected assemblyNumber of
sequenced genomes
ゲノムの数		Number of species
with sequenced genomes		Earliest
sequenced
genome
release
date
NCBIiNatGBIFCOLAssembly
level,
RefSeq
category		Genome
length,
coverage		Number
of
contigs,
contig
N50		Species
種		Genus
属		Family
科		Genus
属		Family
科
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Hediste japonica
アリアケカワゴカイ		—✓✓✓✓✓/1✓/✓No———0070/16 (0.0%)5/660 (0.8%)—
EN
絶滅危惧ⅠB類（EN）		Chaetopterus cautus
ツバサゴカイ		—✓—✓✓✓/1—/—No———0000/54 (0.0%)0/197 (0.0%)—